Heatmap: Cluster_107 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.3 0.39 0.41 0.45 0.49 0.51 0.51 0.48 0.44 0.38 0.33 0.3 0.33 0.29 0.33 0.29 0.34 0.52 0.38 0.35 0.02 1.0 0.16 0.16 0.28 0.26
0.31 0.23 0.31 0.35 0.53 1.0 0.8 0.58 0.63 0.39 0.35 0.32 0.27 0.24 0.23 0.4 0.16 0.26 0.26 0.25 0.04 0.88 0.16 0.11 0.4 0.28
0.2 0.38 0.49 0.49 0.66 0.93 0.98 0.83 0.94 0.65 0.61 0.55 0.16 0.33 0.54 0.7 0.7 1.0 0.8 0.79 0.1 0.79 0.32 0.49 0.83 0.49
0.62 0.62 0.58 0.63 0.55 1.0 0.8 0.85 0.92 0.52 0.5 0.4 0.52 0.38 0.34 0.5 0.59 0.36 0.53 0.72 0.19 0.58 0.22 0.25 0.82 0.48
0.22 0.47 0.65 0.8 1.0 0.9 0.94 0.84 0.56 0.42 0.29 0.2 0.22 0.2 0.46 0.4 0.5 0.81 0.71 0.59 0.03 0.89 0.49 0.31 0.79 0.3
0.48 0.65 0.52 0.66 0.93 1.0 0.81 0.75 0.43 0.51 0.48 0.42 0.42 0.58 0.43 0.53 0.55 0.86 0.79 0.61 0.03 0.86 0.37 0.46 0.76 0.54
0.07 0.09 0.2 0.33 0.51 1.0 0.71 0.7 0.77 0.39 0.22 0.14 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.16 0.02 0.01 0.03
0.14 0.26 0.32 0.45 0.55 0.41 0.37 0.38 0.35 0.43 0.43 0.36 0.21 0.25 0.42 0.46 0.21 0.46 0.39 0.25 0.06 1.0 0.17 0.31 0.2 0.27
0.67 0.54 0.52 0.6 0.71 0.86 0.73 0.74 0.75 0.75 0.65 0.65 0.76 0.49 0.63 0.48 0.51 0.63 0.7 0.46 0.1 1.0 0.38 0.32 0.44 0.52
0.14 0.2 0.23 0.32 0.61 1.0 0.67 0.56 0.64 0.52 0.53 0.4 0.17 0.25 0.16 0.26 0.13 0.25 0.31 0.32 0.24 0.17 0.33 0.17 0.27 0.31
0.17 0.21 0.4 0.63 0.67 0.93 1.0 1.0 0.54 0.28 0.26 0.2 0.1 0.18 0.24 0.37 0.42 0.38 0.38 0.37 0.08 0.9 0.62 0.13 0.6 0.42
0.1 0.16 0.28 0.47 0.55 0.7 0.94 0.85 0.53 0.17 0.17 0.15 0.1 0.2 0.32 0.44 0.49 0.55 0.57 0.29 0.16 1.0 0.33 0.12 0.97 0.38
0.07 0.23 0.36 0.45 0.78 1.0 1.0 0.7 0.27 0.14 0.07 0.04 0.02 0.07 0.2 0.21 0.36 0.55 0.6 0.63 0.02 0.74 0.19 0.01 0.27 0.2
0.05 0.13 0.16 0.53 0.82 1.0 0.81 0.72 0.15 0.09 0.05 0.01 0.01 0.03 0.14 0.14 0.17 0.26 0.19 0.22 0.07 0.61 0.13 0.01 0.23 0.12
0.29 0.42 0.38 0.52 0.52 0.49 0.43 0.42 0.45 0.35 0.41 0.26 0.2 0.13 0.23 0.15 0.24 0.33 0.36 0.23 0.01 1.0 0.17 0.11 0.48 0.25
0.25 0.46 0.49 0.56 0.63 0.53 0.56 0.5 0.45 0.59 0.44 0.38 0.26 0.12 0.31 0.08 0.39 0.4 0.42 0.51 0.04 1.0 0.07 0.18 0.44 0.55
0.45 0.24 0.32 0.55 0.57 0.69 0.83 0.77 0.69 0.52 0.38 0.28 0.43 0.38 0.31 0.48 0.28 0.67 0.47 0.44 0.15 0.99 0.26 0.33 1.0 0.57
0.12 0.43 0.58 0.77 1.0 0.93 0.98 0.85 0.46 0.36 0.27 0.21 0.07 0.31 0.31 0.39 0.55 0.8 0.86 0.71 0.05 0.99 0.25 0.17 0.69 0.51
0.09 0.05 0.17 0.32 0.37 0.43 0.97 0.9 0.79 0.46 0.19 0.09 0.05 0.1 0.23 0.22 0.32 0.53 0.48 0.43 0.25 1.0 0.11 0.06 0.76 0.36
0.46 0.41 0.47 0.57 0.69 0.65 0.61 0.57 0.56 0.57 0.57 0.51 0.42 0.32 0.35 0.31 0.33 0.53 0.54 0.45 0.19 1.0 0.19 0.28 0.34 0.47
0.2 0.3 0.5 0.58 0.76 1.0 0.79 0.67 0.82 0.72 0.59 0.45 0.24 0.26 0.41 0.24 0.41 0.42 0.5 0.61 0.25 0.19 0.44 0.42 0.27 0.3
0.08 0.14 0.22 0.38 0.48 0.72 1.0 0.83 0.55 0.32 0.19 0.16 0.06 0.41 0.36 0.82 0.49 0.63 0.56 0.47 0.25 0.92 0.24 0.16 0.48 0.34
0.11 0.17 0.27 0.47 0.72 1.0 0.99 0.86 0.7 0.37 0.3 0.18 0.1 0.4 0.38 0.69 0.45 0.37 0.53 0.44 0.19 0.63 0.21 0.22 0.3 0.27
0.39 0.41 0.46 0.56 0.66 1.0 0.59 0.63 0.59 0.35 0.46 0.39 0.33 0.25 0.27 0.33 0.23 0.42 0.48 0.33 0.06 0.7 0.24 0.29 0.26 0.35
0.64 0.55 0.54 0.68 0.77 1.0 0.66 0.82 0.89 0.53 0.58 0.4 0.39 0.28 0.22 0.61 0.25 0.48 0.67 0.56 0.37 0.49 0.39 0.25 0.48 0.41
0.22 0.47 0.33 0.49 0.83 1.0 0.65 0.51 0.22 0.25 0.2 0.14 0.1 0.29 0.5 0.38 0.44 0.49 0.66 0.59 0.06 0.99 0.37 0.18 0.59 0.43
0.45 0.41 0.39 0.6 0.85 0.97 1.0 0.96 0.9 0.78 0.6 0.5 0.43 0.61 0.57 0.76 0.51 0.71 0.7 0.66 0.09 0.92 0.38 0.43 0.81 0.58
0.17 0.49 0.47 0.71 0.82 1.0 0.91 0.92 0.76 0.63 0.62 0.52 0.23 0.44 0.4 0.49 0.66 0.7 0.81 0.73 0.08 0.71 0.53 0.77 0.81 0.49
0.2 0.27 0.41 0.59 0.77 0.89 1.0 0.76 0.64 0.49 0.44 0.41 0.19 0.44 0.44 0.51 0.44 0.63 0.59 0.44 0.46 0.69 0.37 0.26 0.61 0.39
0.08 0.15 0.23 0.42 0.52 0.62 0.67 0.58 0.3 0.23 0.16 0.11 0.04 0.14 0.15 0.32 0.3 0.43 0.36 0.32 0.1 1.0 0.13 0.13 0.37 0.29
0.17 0.18 0.17 0.34 0.62 0.47 0.42 0.35 0.34 0.22 0.3 0.14 0.15 0.15 0.17 0.56 0.1 0.27 0.26 0.11 0.04 1.0 0.14 0.17 0.2 0.23
0.23 0.27 0.31 0.53 0.58 0.77 0.69 0.67 0.58 0.59 0.48 0.4 0.25 0.37 0.31 0.33 0.24 0.53 0.48 0.62 0.02 1.0 0.39 0.36 0.97 0.59
0.25 0.44 0.42 0.65 0.99 1.0 0.62 0.78 0.29 0.25 0.28 0.23 0.26 0.21 0.23 0.32 0.43 0.92 0.86 0.59 0.05 0.57 0.2 0.16 0.5 0.3
0.22 0.24 0.29 0.62 0.91 0.87 1.0 0.91 0.8 0.45 0.42 0.36 0.17 0.27 0.37 0.33 0.42 0.62 0.67 0.43 0.06 0.65 0.54 0.29 0.88 0.4
0.36 0.42 0.47 0.45 0.43 1.0 0.56 0.52 0.68 0.42 0.3 0.39 0.25 0.23 0.47 0.36 0.37 0.26 0.5 0.38 0.01 0.07 0.04 0.15 0.01 0.11
0.32 0.11 0.24 0.47 0.52 0.82 0.69 0.81 1.0 0.52 0.52 0.35 0.13 0.14 0.41 0.39 0.64 0.47 0.52 0.36 0.43 0.04 0.54 0.22 0.26 0.5
0.22 0.34 0.36 0.56 0.75 0.65 0.54 0.52 0.23 0.32 0.26 0.24 0.1 0.3 0.35 0.44 0.37 0.6 0.51 0.55 0.09 1.0 0.26 0.31 0.46 0.48
0.23 0.38 0.37 0.53 0.86 1.0 0.57 0.46 0.2 0.31 0.31 0.26 0.12 0.32 0.34 0.41 0.35 0.53 0.49 0.56 0.06 0.74 0.27 0.52 0.36 0.54
0.13 0.24 0.34 0.49 0.72 1.0 0.78 0.64 0.35 0.21 0.16 0.13 0.08 0.23 0.21 0.34 0.31 0.39 0.4 0.41 0.05 0.73 0.17 0.13 0.36 0.27
0.61 0.58 0.67 0.79 0.9 1.0 0.96 0.9 0.77 0.63 0.57 0.56 0.62 0.39 0.47 0.8 0.51 0.68 0.54 0.49 0.4 0.66 0.45 0.47 0.5 0.43
0.06 0.17 0.24 0.35 0.52 0.54 0.4 0.28 0.21 0.15 0.12 0.12 0.05 0.22 0.25 0.21 0.23 0.33 0.29 0.23 0.12 1.0 0.2 0.09 0.21 0.24
0.27 0.19 0.31 0.41 0.46 0.46 1.0 0.86 0.53 0.4 0.23 0.17 0.31 0.36 0.37 0.63 0.59 0.67 0.6 0.6 0.04 0.85 0.11 0.14 0.37 0.3
0.34 0.21 0.31 0.51 0.59 0.74 1.0 0.94 0.69 0.45 0.28 0.21 0.35 0.25 0.29 0.41 0.38 0.4 0.43 0.43 0.05 0.89 0.12 0.09 0.47 0.3
0.17 0.28 0.29 0.54 0.62 0.66 0.68 0.73 0.53 0.66 0.44 0.35 0.16 0.49 0.42 0.53 0.27 0.94 0.42 0.39 0.18 1.0 0.12 0.29 0.53 0.66
0.39 0.39 0.38 0.46 0.63 0.72 0.66 0.57 0.6 0.57 0.51 0.41 0.37 0.43 0.41 0.49 0.42 0.54 0.51 0.51 0.06 1.0 0.48 0.62 0.73 0.53
0.25 0.2 0.22 0.4 0.53 0.56 0.75 0.78 0.61 0.57 0.4 0.27 0.28 0.26 0.28 0.55 0.24 0.4 0.38 0.39 0.07 1.0 0.04 0.23 0.41 0.44
0.12 0.27 0.45 0.6 0.8 1.0 0.87 0.76 0.73 0.64 0.53 0.35 0.15 0.5 0.46 0.69 0.53 0.79 0.62 0.57 0.1 1.0 0.3 0.39 0.65 0.56
0.3 0.52 0.63 0.71 1.0 0.86 0.71 0.72 0.65 0.47 0.48 0.42 0.19 0.41 0.44 0.42 0.57 0.75 0.64 0.72 0.07 0.64 0.37 0.41 0.59 0.5
0.38 0.42 0.41 0.53 0.75 0.91 0.85 0.71 0.48 0.45 0.35 0.33 0.28 0.37 0.42 0.54 0.57 0.57 0.59 0.59 0.09 1.0 0.34 0.4 0.44 0.45
0.41 0.35 0.35 0.51 0.59 0.72 0.78 0.75 0.85 0.91 0.6 0.5 0.41 0.41 0.32 1.0 0.54 0.89 0.67 0.63 0.04 0.97 0.46 0.56 0.77 0.57
0.27 0.59 0.5 0.7 0.94 1.0 0.8 0.75 0.59 0.56 0.53 0.4 0.3 0.6 0.49 0.68 0.37 0.52 0.46 0.41 0.42 1.0 0.69 0.5 0.67 0.45
0.22 0.52 0.52 0.77 0.84 0.82 1.0 0.84 0.65 0.58 0.6 0.52 0.24 0.65 0.6 0.94 0.67 0.66 0.65 0.44 0.36 0.82 0.46 0.56 0.55 0.47
0.51 0.33 0.19 0.37 0.84 1.0 0.63 0.59 0.55 0.43 0.2 0.2 0.53 0.2 0.18 0.13 0.22 0.56 0.41 0.11 0.45 0.36 0.51 0.36 0.4 0.53
0.24 0.35 0.4 0.5 0.53 0.53 0.56 0.52 0.42 0.35 0.33 0.26 0.18 0.33 0.43 0.43 0.28 0.45 0.44 0.3 0.15 1.0 0.42 0.32 0.34 0.27
0.21 0.41 0.24 0.5 0.73 0.92 1.0 0.76 0.4 0.27 0.26 0.19 0.16 0.09 0.19 0.17 0.29 0.37 0.47 0.35 0.08 0.48 0.09 0.12 0.67 0.28
0.12 0.28 0.3 0.45 0.76 1.0 0.65 0.63 0.29 0.21 0.14 0.13 0.07 0.09 0.16 0.11 0.22 0.31 0.36 0.36 0.0 0.95 0.06 0.07 0.3 0.14
0.22 0.34 0.44 0.52 0.52 0.51 0.56 0.48 0.43 0.37 0.27 0.25 0.16 0.32 0.43 0.37 0.44 0.48 0.39 0.41 0.02 1.0 0.14 0.15 0.3 0.29
0.38 0.14 0.5 0.3 0.43 1.0 0.5 0.96 0.73 0.32 0.2 0.13 0.27 0.22 0.15 0.34 0.29 0.69 0.57 0.13 0.37 0.2 0.56 0.18 0.31 0.78
0.21 0.33 0.3 0.4 0.42 0.45 0.39 0.35 0.34 0.3 0.22 0.21 0.23 0.22 0.34 0.3 0.23 0.51 0.44 0.29 0.25 1.0 0.44 0.2 0.32 0.28
0.07 0.03 0.25 0.37 0.36 0.52 1.0 0.67 0.8 0.39 0.5 0.32 0.0 0.39 0.81 0.62 0.19 0.2 0.32 0.26 0.47 0.04 0.44 0.29 0.3 0.31
0.46 0.52 0.61 0.59 0.7 1.0 0.83 0.77 0.69 0.51 0.44 0.38 0.41 0.21 0.35 0.28 0.37 0.29 0.4 0.5 0.23 0.17 0.43 0.34 0.2 0.23
0.12 0.13 0.26 0.52 0.58 0.71 1.0 0.82 0.66 0.41 0.4 0.31 0.12 0.42 0.26 0.6 0.34 0.36 0.43 0.29 0.31 0.68 0.34 0.31 0.47 0.39
0.6 0.53 0.6 0.5 0.68 1.0 0.78 0.72 0.91 0.63 0.65 0.63 0.6 0.5 0.68 0.66 0.42 0.58 0.68 0.59 0.17 0.34 0.26 0.34 0.34 0.24
0.17 0.27 0.38 0.56 0.82 0.98 1.0 0.75 0.53 0.39 0.32 0.23 0.12 0.31 0.33 0.4 0.48 0.57 0.61 0.54 0.02 0.73 0.24 0.31 0.72 0.39
0.22 0.22 0.24 0.34 0.55 1.0 0.92 0.73 0.61 0.52 0.38 0.29 0.22 0.18 0.11 0.22 0.15 0.13 0.17 0.26 0.01 0.85 0.08 0.16 0.37 0.4
0.47 0.42 0.51 0.61 0.76 0.93 0.7 0.68 0.69 0.63 0.64 0.65 0.65 0.4 0.41 0.57 0.51 0.42 0.51 0.61 0.25 1.0 0.31 0.39 0.57 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)