Heatmap: Cluster_205 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-2.29 -0.42 -0.32 -0.26 0.14 0.37 0.88 0.56 0.72 0.18 -0.5 -0.98 -2.01 0.6 0.64 0.42 0.48 0.65 0.33 0.14 -5.7 -0.17 -1.07 -1.41 0.27 -0.41
-0.7 -0.15 0.06 0.09 0.43 0.12 0.34 0.14 -0.26 -0.19 -0.38 -0.58 -0.93 0.01 0.26 0.08 0.36 0.89 0.51 0.66 -2.94 -0.11 -0.08 -0.63 -0.09 -0.16
-1.46 -0.4 -0.18 -0.12 0.41 0.57 0.6 0.27 0.31 0.22 -0.19 -0.62 -2.16 -0.05 0.62 0.25 0.17 0.69 0.63 0.54 -1.88 -1.33 -0.38 -0.57 -0.36 0.09
-2.56 -0.31 0.14 0.29 0.34 0.1 0.43 0.29 0.24 0.23 -0.04 -0.28 -2.45 -0.1 0.47 0.05 0.39 1.02 0.63 0.32 -2.98 -0.74 -0.23 -0.71 -0.1 -0.24
-3.54 -0.79 -0.16 0.06 0.35 0.19 0.54 0.21 0.22 0.35 0.0 -0.22 -3.79 0.5 0.79 0.5 0.45 0.81 0.54 0.43 -2.05 -1.8 -0.69 -0.62 -0.39 -0.07
-2.25 -0.77 0.06 0.3 0.23 0.39 0.25 0.21 0.1 0.2 -0.09 -0.22 -2.53 0.25 0.52 0.57 0.45 0.92 0.68 0.6 -3.16 -0.02 -1.08 -0.95 -0.75 -0.42
-2.29 -0.73 -0.44 -0.07 -0.17 -0.74 0.31 0.2 0.25 0.54 0.35 0.16 -1.74 0.59 0.51 0.66 0.52 0.59 0.26 0.26 -2.13 -0.41 -0.13 -0.68 -0.16 0.04
-2.66 -0.83 -0.24 -0.24 -0.21 -0.62 0.23 0.05 0.17 0.37 0.28 0.17 -1.79 0.64 0.72 0.74 0.64 0.69 0.51 0.26 -1.76 -0.56 -0.76 -0.65 -0.26 0.13
-2.6 -0.89 -0.38 -0.2 -0.04 -0.17 0.22 -0.12 0.17 0.43 0.0 0.03 -1.98 0.67 0.79 0.71 0.59 0.57 0.75 0.24 -2.0 -0.71 -0.84 -0.36 -0.19 0.11
-1.65 -0.81 -0.17 -0.12 -0.24 -0.49 0.1 0.15 0.29 0.49 0.11 -0.29 -1.77 0.46 0.42 0.34 0.58 0.93 0.42 0.5 -1.36 -0.97 -0.09 -0.27 -0.21 0.14
-0.77 -0.38 -0.27 -0.11 0.03 -0.25 0.31 0.13 0.06 0.37 0.26 0.15 -0.93 0.02 0.13 -0.04 0.34 0.83 0.6 0.55 -2.16 -1.51 -0.05 -0.16 -0.02 0.0
-2.23 -0.62 0.07 0.27 0.54 0.63 0.69 0.48 -0.43 -0.56 -0.91 -1.45 -3.29 -0.35 -0.35 0.2 0.43 1.12 0.88 0.72 -1.22 -0.61 -0.64 -1.16 0.29 0.42
-0.51 0.32 0.22 0.13 -0.15 -0.08 0.01 0.2 0.13 0.22 -0.04 -0.07 -0.59 -0.32 0.4 0.0 0.07 1.0 0.62 0.24 -1.87 -1.28 0.03 -0.62 -0.25 -0.21
-3.16 -0.9 -0.08 0.18 0.24 0.3 0.51 0.15 0.22 0.01 -0.22 -0.28 -3.18 0.66 0.71 0.82 0.42 0.56 0.62 0.31 -2.91 -1.28 -0.73 -0.44 -0.29 0.15
-1.32 -0.71 -0.13 0.03 0.24 0.15 0.48 0.2 0.34 0.23 -0.17 -0.4 -1.24 0.59 0.49 0.63 0.51 0.46 0.12 0.48 -2.73 -0.07 -0.84 -0.86 -0.24 -0.12
-3.99 -1.15 -0.16 0.19 0.49 0.34 0.61 0.31 0.39 0.16 -0.15 -0.4 -3.56 0.19 0.3 0.25 0.36 0.8 0.49 0.35 -3.07 -0.04 -0.28 -0.34 -0.0 -0.17
-0.78 -0.56 -0.16 -0.02 0.14 0.38 0.52 0.32 0.34 -0.04 -0.3 -0.46 -0.8 0.48 0.33 0.7 0.15 0.57 0.32 0.2 -2.93 -0.97 -0.66 -0.37 0.15 0.01
-3.24 -0.36 0.04 -0.06 0.24 0.18 0.44 0.32 0.32 0.26 -0.26 -0.65 -3.02 -0.21 0.29 0.26 0.55 1.02 0.79 0.59 -3.27 -0.32 -0.77 -0.4 0.11 -0.25
-1.53 -1.14 -0.03 0.22 0.44 0.41 0.69 0.46 0.23 -0.06 -0.22 -0.06 -1.34 0.23 0.76 0.77 0.07 0.35 0.59 -0.01 -2.5 -0.0 -0.85 -1.17 -0.53 -0.34
-1.58 -0.09 0.13 0.18 0.27 0.42 0.29 0.19 0.02 -0.14 -0.45 -0.53 -1.57 0.05 0.51 0.14 0.34 0.99 0.49 0.32 -3.19 -0.22 -0.66 -0.72 0.26 0.04
-1.72 -0.68 -0.37 -0.28 0.08 0.17 0.32 0.08 0.46 0.32 -0.02 -0.24 -1.49 0.33 0.78 0.66 0.62 0.46 0.58 0.64 -5.3 -1.07 -0.73 -0.22 -0.16 -0.33
-0.51 -0.25 -0.29 -0.15 0.18 0.39 0.54 0.38 0.11 -0.19 -0.64 -1.14 -0.58 0.45 0.47 0.57 0.29 0.94 0.45 0.29 -3.84 -0.97 -1.23 -1.29 0.57 -0.09
-2.85 -0.27 -0.15 0.08 0.34 0.25 0.29 -0.12 0.02 0.22 -0.14 -0.62 -3.35 -0.37 0.33 -0.15 0.45 1.44 0.94 0.81 -4.43 -1.36 -1.0 -0.66 0.41 0.1
-0.68 -0.02 0.03 0.16 0.21 0.13 0.21 0.17 0.04 -0.04 -0.23 -0.31 -0.74 0.01 0.08 0.06 0.18 0.89 0.48 0.17 -2.23 0.12 -0.49 -0.42 0.04 0.07
-1.73 0.02 0.3 0.23 0.2 -0.02 0.21 0.09 -0.33 -0.47 -0.74 -0.92 -1.57 -0.08 0.41 0.29 0.03 1.36 0.87 0.27 -1.93 -0.3 -0.72 -0.65 0.25 0.4
-2.07 -0.18 0.2 0.5 0.41 0.16 0.19 0.16 0.06 -0.06 -0.27 -0.58 -2.47 0.09 0.53 0.19 0.57 0.68 0.7 0.69 -4.2 -0.47 -0.67 -0.79 -0.13 0.09
-0.55 -0.33 -0.14 -0.1 0.16 0.13 0.33 0.2 0.25 0.25 0.0 -0.09 -0.47 0.21 0.84 0.43 0.49 0.41 0.37 0.5 -3.76 -0.74 -1.08 -0.51 -0.5 -0.44
-0.55 -0.17 0.03 0.25 0.57 0.42 0.17 -0.06 0.08 0.02 -0.25 -0.31 -0.53 0.22 0.37 0.33 0.3 0.9 0.47 0.38 -3.15 -1.07 -0.41 -0.78 -0.51 -0.36
-0.56 -0.11 0.01 -0.03 0.35 0.28 0.32 0.09 -0.03 0.08 -0.32 -0.58 -0.92 -0.08 0.22 0.04 0.22 0.84 0.57 0.58 -4.56 -1.18 -0.11 -0.11 0.06 0.18
-0.83 0.11 0.07 0.05 0.0 -0.23 0.34 0.25 0.28 0.5 0.45 0.49 -0.88 -0.32 0.09 -0.26 0.14 0.86 0.47 0.34 -4.52 -2.24 -0.56 -0.46 -0.01 0.14
-1.08 0.05 -0.07 0.25 0.31 0.37 0.27 0.17 0.09 0.01 -0.15 -0.3 -1.26 -0.06 0.46 0.07 -0.08 1.0 0.59 -0.04 -2.16 -0.34 -0.7 -0.62 0.12 0.14
-0.4 -0.15 -0.09 -0.06 0.26 0.05 0.58 0.31 0.22 0.28 -0.18 -0.21 -0.44 0.12 0.19 0.22 0.1 0.52 0.26 0.18 -3.78 -0.31 -0.37 -0.02 -0.11 -0.3
-1.78 -1.11 -0.35 0.09 0.34 0.23 0.45 0.14 0.16 0.12 -0.42 -0.82 -1.57 0.52 1.25 0.82 0.26 0.69 0.36 0.32 -3.11 0.05 -0.88 -1.01 -0.16 -0.66
-2.12 -0.12 0.2 -0.02 -0.5 -0.59 0.02 0.12 0.18 0.33 0.32 0.29 -2.3 -0.09 0.31 -0.06 0.19 1.22 0.93 0.8 -4.92 -2.12 -0.11 -0.38 -0.15 0.07
-2.2 -0.71 -0.07 0.04 0.35 -0.08 0.57 0.25 0.25 0.45 0.2 -0.18 -2.1 -0.09 0.37 -0.01 0.23 1.09 0.97 0.73 -4.76 -1.97 -0.95 -0.28 -0.17 -0.28
-1.85 -1.15 -0.57 -0.3 0.37 0.39 0.57 0.16 0.5 0.32 -0.25 -0.58 -1.66 0.25 0.66 0.44 0.37 0.91 0.42 0.54 -4.16 -1.55 -0.14 -0.29 -0.04 -0.14
-0.71 -0.13 -0.01 0.12 0.29 0.31 0.22 0.04 0.11 0.18 0.04 -0.16 -1.03 0.11 0.08 0.26 0.29 0.56 0.47 0.63 -5.63 -1.06 -0.27 -0.39 -0.24 0.3
-0.91 -0.36 -0.13 -0.16 0.14 0.22 0.32 0.13 -0.02 -0.06 -0.31 -0.34 -0.66 0.11 0.25 0.4 0.09 1.06 0.65 0.12 -1.5 -0.14 -0.3 -0.5 0.02 -0.13
-1.25 0.06 0.26 0.41 0.54 0.15 0.51 0.21 -0.74 -0.46 -0.66 -1.23 -1.42 -0.49 0.44 0.31 0.43 1.27 0.75 0.75 -4.39 -1.77 -0.3 -1.55 0.36 -0.18
-1.16 -0.27 -0.11 0.21 0.65 0.56 0.37 0.2 0.2 0.08 -0.3 -0.64 -1.6 -0.34 0.32 -0.08 0.32 0.68 0.56 0.68 -2.21 -1.05 -0.5 -0.7 0.04 0.25
-1.02 -0.02 -0.1 -0.07 0.3 0.55 0.31 0.08 0.1 -0.04 -0.15 -0.37 -1.11 0.05 0.24 0.18 0.43 0.8 0.72 0.4 -2.5 -1.29 -0.37 -0.13 -0.18 -0.14
-0.88 -0.46 -0.08 0.12 0.25 0.08 0.22 -0.05 0.01 0.1 -0.13 -0.37 -0.77 0.56 0.36 0.77 0.15 0.72 0.56 0.24 -3.01 -0.27 -0.9 -0.39 -0.08 -0.11
-1.33 -1.12 -0.26 -0.06 0.52 0.26 0.79 0.62 0.69 0.57 0.17 -0.1 -1.29 0.41 0.4 0.48 0.17 0.63 0.29 0.04 -2.15 -1.06 -1.31 -1.4 -0.1 -0.97
-1.03 -0.28 -0.12 -0.18 0.27 0.51 0.42 0.13 0.31 0.21 -0.15 -0.22 -1.24 0.02 0.53 0.06 0.41 0.7 0.53 0.49 -4.56 -1.26 -0.53 -0.4 0.1 -0.09
-2.1 -0.37 -0.18 0.13 0.37 0.05 0.53 0.26 -0.49 -0.41 -1.13 -1.59 -2.63 -0.19 0.38 0.31 0.37 1.44 1.36 0.81 -2.01 -1.74 -0.87 -0.86 0.17 0.15
-0.95 0.04 0.1 0.25 0.37 0.33 0.42 0.33 0.31 0.24 -0.02 -0.23 -1.32 -0.42 0.34 -0.13 0.04 0.81 0.48 0.28 -5.76 -0.92 -0.14 0.03 -0.21 -0.43
-1.61 -0.35 -0.07 0.06 0.25 0.2 0.24 0.07 0.1 0.14 -0.2 -0.45 -1.6 0.23 0.68 0.43 0.23 1.05 0.56 0.23 -2.84 -0.51 -0.33 -0.49 -0.02 -0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.