Heatmap: Cluster_75 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.24 -0.51 -0.19 -0.13 0.07 0.4 0.37 0.03 -0.13 -0.65 -1.18 -1.41 -1.31 0.54 0.98 0.98 0.31 1.03 0.76 -0.04 -0.3 -1.25 -0.34 -0.63 -0.42 -0.22
-2.28 -1.16 -0.89 -0.55 0.03 0.43 0.21 -0.04 -0.57 -0.91 -1.27 -1.39 -2.09 0.45 0.88 1.17 0.32 0.79 0.94 0.3 -0.23 0.12 0.61 -0.39 -0.47 -0.22
-1.91 -0.38 -0.1 0.2 0.1 0.06 -0.12 0.03 0.16 -0.08 -0.15 -0.2 -1.97 0.24 0.01 0.26 -0.02 0.66 0.27 -0.15 -0.81 0.41 0.6 0.31 0.14 -0.12
-1.27 -0.95 -1.14 -0.63 -0.83 -1.18 -0.88 -0.49 -0.43 -0.66 -0.73 -1.2 -1.5 0.78 1.11 1.41 -0.02 1.61 0.82 -0.64 -0.47 -0.0 0.79 -0.27 -0.29 -0.21
-0.82 -0.38 -0.45 -0.32 -0.03 -0.07 -0.18 -0.45 -0.22 -0.3 -0.38 -0.41 -0.92 -0.11 0.07 1.11 -0.46 0.29 0.32 -0.51 -0.24 1.12 0.13 0.66 0.21 -0.02
-1.91 -1.27 -0.72 -0.29 -0.18 -0.23 0.02 -0.01 0.1 0.23 0.3 0.13 -1.66 -0.16 -0.36 1.57 -0.83 0.24 -0.03 -0.44 -1.22 1.25 0.57 -0.03 -0.06 -0.07
-1.9 -0.46 -0.23 0.18 0.31 0.22 0.13 0.2 0.06 0.02 -0.16 -0.34 -1.69 -0.19 -0.32 1.26 -0.4 -0.02 0.02 -0.3 -0.24 0.98 0.57 -0.35 -0.33 -0.37
-0.6 -0.13 0.28 0.33 0.02 -0.5 -0.0 -0.01 -0.91 -0.64 -0.7 -0.7 -1.46 0.18 -0.11 0.47 0.4 0.59 0.35 0.48 -0.75 0.39 -0.04 -0.23 0.38 0.59
-0.67 -0.43 -0.25 -0.04 -0.2 -0.77 -0.2 -0.07 -0.58 -0.43 -0.55 -0.7 -0.65 0.1 0.49 1.01 0.38 0.88 0.5 -0.09 -0.36 0.68 0.31 -0.2 -0.21 -0.27
-0.32 -0.23 -0.22 0.2 0.11 -0.41 -0.0 0.1 -0.2 -0.28 -0.26 -0.55 -0.33 -0.17 0.36 0.62 -0.09 0.37 0.35 -0.45 -0.39 0.75 0.39 -0.19 0.04 -0.26
-2.32 -1.14 -1.14 -1.03 -0.62 -0.57 -0.74 -0.52 -0.28 -0.67 -0.82 -0.75 -2.34 -0.09 0.25 1.87 -0.86 0.24 0.36 -0.62 -0.56 1.44 0.97 0.53 0.48 0.41
-0.2 -0.02 -0.26 -0.17 -0.11 -0.2 -0.23 -0.14 -0.22 -0.15 -0.18 -0.26 -0.19 0.28 0.55 0.64 -0.2 0.27 0.33 -0.14 -0.36 0.2 0.24 -0.15 0.07 -0.05
0.04 -0.16 -0.05 0.0 0.04 -0.21 0.19 0.07 -0.14 -0.27 -0.33 -0.39 0.09 -0.02 0.62 0.29 0.09 1.07 0.52 0.0 -0.78 -0.56 -0.18 -0.74 -0.31 -0.36
-0.96 -0.45 -0.15 -0.68 -0.16 -0.07 0.16 -0.08 -0.07 -0.72 -0.66 -1.22 -1.08 0.13 0.97 0.68 -0.22 1.36 0.87 -0.55 -2.15 1.04 -0.14 -1.44 0.23 -0.13
-2.15 -0.68 -0.3 -0.04 0.08 -0.04 -0.34 -0.21 -0.03 -0.22 -0.47 -0.77 -1.85 0.26 0.92 0.69 -0.07 0.67 0.59 -0.19 -0.14 0.66 0.35 -0.16 0.04 -0.08
-0.02 0.01 0.3 0.16 0.11 0.02 0.29 0.3 -0.14 -0.36 -0.7 -0.93 -0.27 -0.57 -0.06 0.13 0.01 0.67 0.33 0.17 0.04 -0.17 -0.25 -0.77 0.46 0.02
-1.11 -0.51 -0.13 0.16 0.32 0.3 -0.03 -0.19 -0.19 -0.43 -0.48 -0.65 -0.96 -0.59 -0.26 0.44 -0.28 0.29 0.47 0.05 0.42 0.85 -0.68 -0.72 0.78 0.65
-1.64 -1.2 -0.7 -0.29 -0.37 -0.51 -0.23 0.02 -0.28 -0.58 -0.57 -0.43 -2.0 0.06 1.0 0.99 0.02 1.59 1.52 -0.44 -1.42 0.62 0.02 -1.92 -0.3 -0.59
-2.15 -1.21 -0.95 -0.45 0.15 0.64 0.69 0.55 -0.27 -0.72 -0.89 -1.36 -2.66 -0.12 0.3 0.92 0.08 0.82 0.8 -0.05 -0.18 1.03 0.28 -0.38 -0.39 -0.79
-0.74 -0.29 -0.06 -0.03 0.26 0.25 0.28 0.13 0.01 0.09 -0.05 -0.22 -0.69 -0.1 0.02 0.13 -0.02 0.21 0.31 0.13 -0.11 0.41 -0.31 -0.34 -0.05 0.13
-0.07 0.06 0.13 0.08 0.08 0.05 0.08 -0.04 -0.24 -0.36 -0.61 -0.64 -0.08 0.03 0.41 0.51 0.41 0.39 0.13 -0.26 -0.07 -0.29 0.26 -0.51 0.15 -0.42
-1.58 -0.98 -0.58 -0.26 -0.12 -0.41 0.12 0.1 0.26 -0.07 -0.37 -0.77 -1.76 0.53 0.48 0.99 0.15 0.78 0.63 -0.34 -0.54 0.47 0.69 -0.23 -0.22 -0.68
-1.38 -0.64 -0.84 0.01 -0.07 -0.26 0.16 0.33 0.5 0.01 -0.07 -0.87 -2.02 -0.37 -0.41 -0.2 -0.58 0.84 0.47 0.14 -2.39 0.75 0.96 0.49 0.84 -0.49
-1.09 -0.37 -0.4 -0.34 -0.48 -0.56 -0.44 -0.4 -0.59 -0.54 -0.72 -0.79 -0.73 0.78 0.83 1.49 0.02 1.15 0.89 -0.37 0.39 -1.08 0.37 -0.78 -0.68 -0.42
-0.3 0.04 0.23 0.25 0.03 -0.43 -0.04 0.08 -0.2 -0.25 -0.48 -0.6 -0.5 0.25 0.49 0.65 0.06 0.63 0.22 -0.33 -0.47 0.25 -0.08 -0.39 0.08 -0.3
-0.75 -0.49 -0.01 0.09 0.24 -0.13 0.39 0.28 -0.27 -0.32 -0.54 -0.51 -0.53 -0.22 0.05 0.14 0.05 0.56 -0.08 0.08 0.29 0.61 -0.19 -0.25 0.43 -0.04
-0.64 -0.12 -0.06 0.2 0.34 0.34 0.47 0.26 0.14 -0.33 -0.57 -0.64 -0.62 -0.25 0.11 0.13 -0.04 0.51 0.39 -0.01 -0.11 0.45 -0.59 -0.47 0.04 -0.12
-1.22 -0.44 -0.43 -0.16 0.32 0.42 0.02 -0.35 -0.23 -0.2 -0.38 -0.8 -1.25 0.08 1.03 1.67 -0.11 0.92 0.54 -0.59 -1.22 -0.38 -0.01 -0.35 -0.83 -0.8
-1.98 -0.61 -0.46 0.02 0.27 0.46 0.38 0.27 -0.09 0.09 -0.14 -0.34 -2.32 -0.28 0.0 0.36 0.22 0.67 0.58 0.22 -0.35 0.28 0.04 -0.18 -0.17 0.04
-1.65 -0.75 -0.66 -0.63 -1.28 -1.1 -0.52 -0.75 -0.51 -0.81 -0.67 -0.74 -1.76 0.34 -0.53 1.64 -0.45 -0.02 -0.41 -0.93 -0.49 1.7 0.69 1.06 0.57 0.7
-2.03 -0.38 -0.36 -0.44 0.35 0.57 0.43 -0.37 -0.15 -1.28 -1.61 -1.71 -2.59 -0.07 1.36 1.47 0.6 0.55 0.7 0.58 -0.97 -0.26 -0.36 -1.04 -0.33 -0.54
-1.05 -0.96 -0.29 -0.49 -0.19 -0.1 0.4 0.25 0.47 0.24 0.32 0.0 -0.76 0.39 0.18 0.51 -0.29 0.37 0.22 -0.46 -1.3 0.65 0.57 0.04 -0.82 -0.28
-1.89 -1.26 -1.28 -1.31 -0.98 -0.93 -0.84 -1.13 -1.1 -1.05 -1.38 -1.66 -1.76 1.08 1.27 1.76 0.25 1.43 1.29 -0.34 0.09 -0.73 0.32 -0.09 -0.53 -0.11
-0.11 0.05 -0.07 -0.2 0.01 -0.0 0.16 0.08 0.08 -0.1 -0.53 -0.62 -0.06 0.11 0.5 0.51 0.24 0.9 0.45 0.27 -0.34 -0.81 -0.4 -0.68 -0.55 -0.35
-1.29 -0.93 -1.14 -1.01 -0.72 -0.73 -0.7 -0.9 -0.74 -0.7 -1.0 -1.15 -1.25 1.08 1.36 1.74 0.27 1.37 1.04 -0.28 -0.63 -0.27 -0.28 -0.27 -0.85 -0.28
-2.02 -1.13 -0.36 0.05 0.18 -0.23 0.1 0.06 -0.03 0.03 0.03 0.13 -2.05 0.18 0.52 0.48 0.03 0.7 0.69 -0.35 -0.24 0.86 -0.04 -0.51 -0.1 -0.38
-0.2 -0.34 -0.51 -0.46 -0.32 -0.31 -0.25 -0.24 -0.27 -0.39 -0.43 -0.53 -0.04 0.65 0.88 0.99 -0.05 0.42 0.54 -0.41 0.15 -0.48 0.42 -0.29 -0.44 -0.02
-1.99 -0.48 -0.07 -0.08 0.18 0.08 0.22 0.11 0.2 -0.05 -0.36 -0.51 -1.84 0.14 0.81 0.37 0.07 0.89 1.24 -0.32 -1.58 0.74 -0.36 -0.6 -0.66 -0.9
-0.76 -0.67 -0.54 -0.27 -0.03 -0.18 -0.2 -0.22 0.07 0.21 0.32 0.2 -0.4 -0.02 0.24 1.11 0.19 0.63 0.67 0.23 -0.76 -0.22 -0.03 -0.41 -0.41 -0.76
-1.23 -0.43 -0.34 -0.45 -0.18 -0.8 0.0 0.1 -0.49 -0.31 -0.21 -0.86 -1.64 0.38 0.18 0.69 -0.42 0.45 0.41 -0.5 -0.53 1.02 0.79 0.46 0.42 0.22
-2.91 -3.77 -2.49 -1.41 -0.75 -0.5 -0.07 -0.21 0.45 0.29 0.33 -0.11 -2.76 0.23 0.2 1.41 -0.02 0.57 0.12 -0.15 -0.24 1.13 0.65 0.32 -0.01 -0.13
0.38 0.1 0.03 -1.43 -0.53 0.75 1.09 0.34 0.52 0.42 0.08 -0.34 -0.98 -0.28 -0.34 -2.49 -1.56 0.32 1.03 0.04 0.92 -2.06 -0.83 -1.11 -0.17 -0.19
-0.46 -0.13 -0.25 0.08 0.19 0.4 0.31 0.32 0.43 -0.11 -0.5 -0.61 -0.41 -1.35 -0.79 -1.01 -0.62 0.73 0.16 -0.15 -0.19 1.21 0.39 -0.75 0.5 -0.31
-0.18 -0.28 -0.19 -0.2 -0.04 -0.08 -0.19 -0.27 -0.15 -0.26 -0.15 -0.04 0.02 0.42 0.53 1.04 -0.07 0.75 0.52 -0.33 -0.43 -0.74 0.15 -0.51 -0.32 -0.63
-2.47 -1.54 -0.98 -0.48 -0.06 0.06 0.44 0.13 -0.66 -0.61 -1.03 -1.39 -2.55 0.44 0.57 1.21 0.73 0.99 1.01 0.54 -1.02 -0.41 0.6 -0.19 -0.26 -0.47
-2.6 -0.69 -0.31 0.21 0.18 -0.33 -0.17 -0.0 -0.08 -0.15 -0.07 -0.23 -2.31 0.01 0.54 0.8 -0.46 0.87 0.39 -0.73 -0.26 0.68 0.64 -0.18 0.11 -0.09
-2.02 -1.6 -1.88 -1.54 -1.09 -2.14 -0.61 -0.87 -0.6 -0.49 -1.09 -0.7 -1.68 0.04 0.14 1.29 0.38 2.1 1.51 0.48 -1.31 1.22 -0.19 -0.86 -0.42 -0.28
-0.61 -0.13 -0.62 -0.49 -0.25 -0.24 -0.04 -0.03 0.17 -0.03 -0.14 -0.54 -0.37 0.45 0.82 1.14 0.08 0.93 0.65 0.14 -0.57 -0.28 -0.26 -0.66 -0.96 -0.97
-0.08 -0.2 -0.18 -0.17 0.16 0.13 -0.18 -0.61 -0.39 -0.46 -0.23 -0.16 -0.04 0.4 0.53 0.84 0.52 0.24 0.2 0.06 -0.39 -0.04 -0.2 -0.65 0.04 -0.3
-1.23 -1.1 -0.8 -0.64 -0.38 -0.24 -0.09 -0.13 0.29 0.35 0.4 0.37 -0.63 0.04 -0.14 1.07 0.31 0.86 0.49 -0.16 -0.45 -0.35 0.06 0.25 -0.15 -0.71
-1.24 -0.88 -0.94 -0.62 -0.43 -0.1 0.12 -0.04 -0.23 -0.14 -0.22 -0.4 -1.28 0.96 0.36 1.31 0.06 0.84 0.32 -0.49 -0.85 0.41 0.33 -0.85 0.59 -0.63
-0.41 -0.01 -0.15 0.06 0.2 0.47 0.49 0.55 0.36 -0.2 -0.5 -0.72 -0.21 -0.97 -0.16 -0.22 -0.65 0.66 0.61 -0.15 0.33 0.68 -0.05 -0.83 -0.43 -0.9
-0.7 0.14 0.2 0.18 0.31 0.37 0.29 0.15 0.05 -0.21 -0.45 -0.63 -0.86 -0.39 0.05 0.02 -0.02 0.64 0.31 0.01 0.07 0.02 0.09 -0.03 -0.22 -0.43
-0.69 -0.08 0.18 0.14 0.2 0.2 0.14 -0.01 -0.15 -0.32 -0.49 -0.64 -0.5 0.08 0.5 0.34 0.36 0.61 0.24 -0.05 0.49 -0.13 0.37 -0.42 -1.02 -0.98
0.22 0.11 0.0 0.08 0.24 0.18 0.43 0.44 0.17 -0.03 -0.31 -0.31 0.17 -0.39 0.02 -0.11 -0.22 0.32 0.26 -0.01 -0.2 -0.39 -0.22 -0.78 -0.03 -0.34
-0.89 -0.63 -0.59 -0.33 -0.14 -0.22 -0.09 -0.22 -0.13 -0.11 -0.2 -0.32 -0.99 0.35 0.43 1.12 -0.0 0.75 0.55 -0.16 -0.77 0.33 0.45 -0.25 -0.14 -0.04
-0.58 -0.18 -0.15 -0.28 -0.1 -0.69 -0.29 -0.3 -0.51 -0.19 -0.28 -0.62 -0.26 0.67 0.87 0.84 -0.41 1.28 0.83 -0.88 -1.17 -0.38 0.32 -0.37 -0.42 -0.04
-0.77 -0.38 -0.43 -0.34 -0.25 -0.29 -0.68 -0.68 -0.54 -0.63 -0.83 -0.91 -0.64 0.46 1.09 0.88 -0.26 0.96 0.97 -0.4 -0.57 0.33 0.75 -0.38 -0.41 0.22
-1.03 -0.9 -1.68 -1.31 -0.82 -0.82 -0.49 -0.6 -0.4 -0.38 -0.5 -0.75 -0.98 0.98 1.03 1.64 -0.12 0.97 0.79 -0.74 0.94 -0.42 0.42 -0.19 -1.01 -0.48
-0.78 -0.17 0.18 0.1 0.17 0.13 -0.1 -0.03 0.01 -0.14 -0.19 -0.15 -0.66 -0.14 0.57 0.29 -0.01 0.4 0.42 -0.08 0.34 -0.43 0.7 -0.23 -0.76 -0.76
-1.85 -0.76 -0.29 -0.17 0.07 0.12 0.16 0.09 0.28 0.17 0.02 -0.18 -1.57 -0.11 0.46 1.0 -0.27 0.05 0.27 -0.1 -0.44 0.93 0.39 -0.22 -0.35 -0.66
-0.49 -0.17 -0.21 -0.16 -0.06 -0.38 -0.06 -0.2 0.14 0.07 -0.02 -0.11 -0.34 0.66 0.39 0.65 0.16 0.19 0.59 -0.48 -0.53 0.16 0.16 -0.43 -0.4 -0.21
-1.48 -0.47 -0.22 0.05 0.25 0.11 0.44 0.16 0.08 -0.03 -0.38 -0.59 -1.98 0.24 -0.06 0.47 0.04 0.69 0.46 0.18 -0.34 0.3 -0.35 -0.72 0.35 0.25
-0.57 -0.36 -0.09 0.1 -0.26 -1.03 -0.07 0.02 -0.64 -0.35 -0.46 -0.66 -0.71 -0.02 0.54 1.2 -0.02 0.77 -0.01 -0.24 -0.29 0.51 -0.11 -0.48 0.44 0.41
-0.43 -0.28 0.04 0.1 -0.05 -0.34 -0.03 0.02 -0.44 -0.28 -0.48 -0.52 -0.43 -0.04 0.67 1.07 -0.05 0.69 0.28 -0.21 -0.67 0.14 -0.64 -0.66 0.29 0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.