Heatmap: Cluster_16 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-2.56 -1.75 -0.68 -0.35 -0.29 -0.61 0.14 0.1 -0.3 0.39 0.21 -0.35 -2.37 0.81 0.0 1.01 0.54 0.38 0.11 0.02 -2.25 0.56 0.89 -0.21 0.41 -0.18
-2.72 -1.62 -0.86 -0.71 -0.43 -0.84 0.19 0.16 -0.12 -0.02 -0.18 -0.4 -2.54 0.64 -0.3 0.85 0.52 1.33 0.04 -0.06 -1.13 -0.08 0.72 0.15 0.67 0.3
-0.57 -0.13 0.15 0.15 0.01 -0.52 0.02 -0.11 -0.39 -0.08 -0.17 -0.39 -0.41 0.53 -0.1 0.54 0.42 0.71 0.23 -0.03 -2.12 -0.75 0.36 -0.25 0.55 0.11
-0.94 -1.0 -0.27 -0.53 -0.12 -0.9 0.29 0.33 -0.52 0.51 0.28 -0.26 -0.96 0.53 -0.24 0.91 0.61 0.97 0.32 0.01 -0.9 -0.71 0.0 -0.58 0.34 -0.26
-0.93 -1.1 -0.85 -0.64 -0.76 -1.15 -0.14 0.06 -0.63 0.25 -0.16 -0.54 -1.74 0.7 0.42 1.14 0.9 1.29 0.32 0.29 -0.48 -1.6 0.4 -0.76 0.52 -0.37
-0.96 -0.9 -0.42 -0.23 -0.34 -0.8 0.36 0.37 -0.14 0.48 0.1 -0.2 -0.99 0.6 0.34 0.96 0.64 0.79 0.45 0.36 -1.35 -1.88 -0.06 -0.85 0.04 -0.36
-0.93 -0.94 -0.46 0.17 0.1 -0.33 0.44 0.4 0.15 0.41 0.12 -0.11 -0.89 0.27 -0.11 0.48 -0.31 0.59 0.69 0.66 -2.46 -0.57 -0.41 -0.81 0.24 0.23
-0.94 -1.39 -0.87 -0.11 -0.13 -0.78 0.0 0.23 -0.05 0.25 -0.07 -0.53 -1.47 0.42 -0.06 0.75 -0.36 1.11 0.73 0.34 -1.95 0.03 0.08 -0.44 0.68 0.36
-3.08 -1.63 -1.01 -0.54 -0.13 -0.78 0.41 0.31 -0.22 0.2 0.28 0.06 -2.74 0.7 -0.35 0.75 0.42 0.45 -0.01 0.0 -1.35 0.86 0.63 0.02 0.47 -0.08
-3.37 -1.81 -0.94 -0.17 -0.17 -0.67 0.29 0.38 -0.01 0.27 0.29 -0.0 -2.55 0.59 -0.1 0.95 0.6 0.47 -0.03 -0.15 -1.51 0.82 0.39 0.03 0.14 -0.2
-2.72 -1.33 -0.75 -0.15 -0.16 -0.62 0.3 0.37 0.02 0.29 0.36 -0.02 -2.13 0.72 0.15 0.93 0.55 0.29 0.04 0.03 -1.81 0.74 0.14 -0.29 -0.05 -0.15
-1.28 -1.45 -1.12 -0.46 -0.43 -0.99 -0.16 0.13 -0.42 0.36 0.01 -0.75 -1.52 0.58 -0.26 1.06 0.51 0.31 -0.09 -0.21 -1.69 1.0 0.69 0.32 0.68 0.22
-1.17 -1.18 -0.52 -0.28 -0.18 -0.69 0.1 0.35 -0.16 0.5 0.16 -0.02 -1.3 0.88 0.13 1.13 0.5 0.24 0.18 0.29 -2.61 -0.19 0.1 -0.3 0.1 -0.23
-1.24 -1.6 -0.84 -0.65 -0.22 -0.9 0.03 0.03 -0.36 0.36 -0.06 -0.46 -1.65 0.47 -0.13 0.97 0.56 1.04 0.42 -0.01 -0.85 0.02 0.63 0.37 0.29 -0.33
-1.11 -1.31 -0.78 -0.47 -0.35 -0.75 0.37 0.44 -0.2 0.55 0.1 -0.32 -1.32 0.6 0.16 1.12 0.8 0.87 0.48 0.23 -1.51 -0.67 0.25 -0.62 -0.25 -0.77
0.2 -0.19 -0.28 -0.3 -0.6 -0.97 0.02 0.14 -0.35 0.09 -0.02 -0.26 0.49 0.51 0.15 0.59 0.69 0.44 0.17 -0.29 -1.81 -0.6 0.1 -0.16 0.17 0.0
-0.63 -0.3 -0.11 0.13 0.14 -0.29 0.28 0.36 -0.2 0.21 0.09 -0.22 -0.89 -0.05 -0.48 -0.11 0.1 0.68 0.13 0.13 -3.52 0.28 0.39 -0.22 0.6 0.21
0.14 0.2 -0.27 -0.51 -1.41 -1.74 -0.37 -0.18 -0.53 -0.14 -0.09 -0.03 -0.19 0.67 0.11 0.85 0.36 0.51 0.42 0.12 -1.72 -0.28 0.73 0.38 -0.01 -0.35
0.05 0.1 -0.63 -0.57 -1.56 -2.03 -0.62 -0.48 -0.79 -0.09 -0.19 -0.42 -0.35 0.91 0.21 1.0 0.5 0.9 0.92 0.39 -1.64 -0.89 0.37 -0.24 0.07 0.17
0.47 0.3 -0.38 -0.6 -0.85 -1.61 -0.24 -0.11 -0.53 0.09 -0.22 0.15 0.04 0.7 0.38 0.52 0.44 0.58 0.59 0.14 -1.81 -1.04 0.14 -0.22 -0.13 0.09
-0.62 -0.7 -0.49 -0.21 -0.46 -0.7 -0.09 0.14 -0.2 0.19 0.12 0.12 -0.75 0.23 -0.35 0.41 0.14 0.17 -0.24 -0.14 -2.18 0.89 0.48 0.86 0.41 0.16
-0.52 -1.04 -0.67 -0.5 -0.29 -0.57 0.09 0.13 -0.53 0.3 0.31 0.04 -0.79 0.92 -0.1 0.91 0.44 0.39 0.07 -0.17 -1.24 0.03 0.56 -0.27 0.12 -0.11
-1.06 -1.15 -0.52 -0.29 -0.42 -0.66 0.42 0.47 -0.04 0.35 0.15 -0.14 -0.96 0.68 0.03 0.96 0.57 0.57 0.17 0.29 -1.53 0.14 0.09 -0.62 -0.11 -0.52
-1.25 -1.28 -0.82 -0.56 -0.62 -0.8 0.17 0.3 -0.27 0.22 -0.03 -0.47 -1.34 0.69 -0.03 1.06 0.69 0.9 0.22 0.24 -1.14 0.38 0.27 -0.47 0.3 -0.28
-0.27 -0.6 -0.41 -0.3 -0.87 -0.98 -0.16 -0.05 -0.46 -0.08 0.01 0.28 -0.51 0.68 0.26 0.67 0.34 0.14 0.29 -0.1 -2.25 0.35 0.64 0.59 0.22 -0.3
-0.36 -0.38 -0.56 -0.2 -0.72 -0.97 0.06 0.22 -0.25 -0.38 -0.14 0.2 -0.35 0.91 0.52 0.71 0.69 0.16 0.27 0.21 -2.33 -0.03 0.17 0.18 -0.08 -0.51
-0.67 -0.43 -0.53 -0.24 -1.03 -1.64 -0.23 -0.18 -0.67 -0.51 -0.1 0.03 -1.06 0.79 0.68 0.84 0.5 -0.06 0.2 0.01 -2.13 0.48 1.04 -0.52 1.12 -0.84
-0.46 -0.42 -0.2 -0.17 -0.14 -0.35 0.27 -0.12 -0.58 -0.08 -0.39 -0.43 -1.07 0.82 0.39 0.6 0.33 0.08 0.18 0.21 0.07 0.39 0.39 -0.28 -0.08 -0.53
-0.57 -0.61 -0.08 -0.34 -0.06 -0.52 0.13 -0.18 -0.66 0.13 -0.3 -0.67 -1.01 0.88 0.45 0.76 0.53 0.13 0.27 0.37 0.17 0.25 0.48 -0.81 -0.48 -0.51
-0.32 -0.21 -0.09 0.07 0.19 0.12 0.5 0.09 0.0 0.17 -0.06 -0.13 -0.53 0.16 -0.05 0.15 -0.17 -0.04 0.18 -0.03 0.08 -0.06 0.49 -0.68 -0.15 -0.28
-0.68 -1.17 -2.12 -1.26 -0.48 -0.76 -0.1 -0.11 -0.51 -0.1 0.74 0.32 -0.13 1.26 0.52 1.4 1.16 0.78 1.01 0.33 -3.24 -1.33 -4.04 -2.93 -0.34 -1.11
-0.83 -2.11 -2.22 -2.13 -1.11 -1.24 -0.95 -0.85 -1.21 -0.48 -0.07 -0.3 -0.7 1.29 0.92 1.62 1.43 1.42 1.24 0.28 -2.73 -0.83 -2.83 -1.19 -0.01 -0.65
-1.5 -1.89 -2.41 -2.33 -1.66 -1.29 -1.19 -1.14 -1.81 -0.75 -0.67 -0.68 -1.55 1.3 0.86 1.67 1.55 1.85 1.26 0.32 -2.22 0.14 -2.85 -1.86 -0.09 -0.73
0.01 -0.44 -0.66 0.4 0.56 0.34 0.27 0.3 -0.34 -0.45 -0.29 -0.85 -0.1 -0.2 -0.28 0.59 -0.56 0.46 -0.18 -0.5 -2.47 -0.29 0.51 0.1 0.96 0.02
-0.37 -0.98 -1.11 -0.76 -0.85 -0.68 0.41 0.35 0.26 0.07 -0.18 -0.55 -0.51 0.19 -0.3 0.26 0.11 1.07 0.23 0.07 -2.34 0.93 0.46 -0.04 0.48 -0.05
0.13 -0.13 -0.48 -0.15 -0.03 -0.54 -0.04 -0.04 -0.14 -0.27 0.03 -0.27 0.37 0.26 0.08 0.45 0.22 0.73 0.05 -0.19 -2.92 -0.29 -0.05 0.21 0.48 0.1
-0.28 -0.28 -0.13 0.15 -0.14 -0.54 0.46 0.49 -0.23 -0.07 -0.12 -0.42 -0.89 0.14 -0.32 0.59 0.34 0.57 -0.06 -0.04 -2.88 0.7 0.12 -0.55 0.47 -0.06
-0.59 -0.75 -0.83 -0.39 -0.08 -0.35 0.22 0.24 0.23 0.33 0.37 0.1 -0.25 0.44 0.09 0.27 -0.05 0.57 0.24 -0.2 -0.68 0.05 0.18 -0.1 -0.21 -0.02
-2.42 -0.74 -0.41 -0.33 -0.12 -0.72 -0.0 0.25 0.09 0.27 0.34 -0.33 -2.04 0.74 -0.41 0.62 0.81 0.55 0.01 -0.47 -2.43 0.64 0.35 0.1 0.36 0.14
-2.07 -2.37 -0.96 -0.71 -0.15 -0.44 0.54 0.75 -0.32 0.51 0.25 -0.52 -1.69 0.97 -0.42 1.16 0.74 0.88 -0.0 0.83 -2.64 -0.63 0.19 -1.23 -0.25 -0.32
-0.99 -0.79 -0.37 -0.15 -0.04 -0.36 0.13 -0.02 0.05 0.44 0.41 0.22 -0.71 0.27 -0.0 0.21 0.02 -0.07 0.14 -0.11 -2.98 0.72 0.42 0.25 0.38 -0.06
-1.04 -1.11 -0.51 -0.32 -0.2 -0.84 -0.11 -0.1 -0.33 0.31 0.31 0.03 -1.11 0.38 -0.14 0.35 0.14 0.36 0.17 -0.11 -2.38 1.12 0.55 0.14 0.72 0.0
-0.8 -0.97 -0.48 -0.33 -0.5 -0.87 -0.16 -0.09 -0.4 0.35 0.38 -0.04 -0.79 0.06 -0.06 0.31 0.29 0.43 0.11 0.11 -2.52 1.05 0.42 0.66 0.56 -0.29
-1.41 -1.07 -0.54 -0.26 -0.15 -0.42 0.19 0.34 -0.03 0.35 0.32 -0.03 -1.85 0.42 -0.08 0.92 0.43 0.54 0.05 0.33 -2.15 -0.59 0.91 -0.01 0.02 -0.36
-0.45 -0.53 -0.69 -0.3 -0.33 -0.3 0.08 0.11 0.09 0.32 0.08 0.23 -0.24 0.44 0.05 0.64 0.02 0.14 -0.28 -0.05 -2.15 0.4 0.34 0.45 0.16 -0.22
-0.63 -0.84 -0.77 -0.5 -0.4 -0.48 0.19 -0.13 -0.42 0.15 -0.05 -0.31 -0.66 0.72 0.2 0.85 0.42 0.37 0.05 -0.02 0.07 0.49 0.49 -0.47 -0.09 -0.12
-2.62 -0.9 -0.59 -0.28 -0.53 -0.79 0.26 0.29 -0.05 0.04 -0.27 -0.69 -3.69 0.37 0.24 0.65 0.28 1.12 0.35 0.4 -1.28 -0.22 0.44 -0.04 0.8 0.32
0.16 -0.25 -0.15 -0.28 -0.63 -1.08 -0.02 0.03 -0.26 0.18 0.08 0.05 0.14 0.59 0.4 0.66 0.74 0.6 0.22 0.38 -1.36 -0.6 -0.47 -0.79 -0.27 -0.32
-0.93 -1.14 -0.6 -0.37 -0.2 -0.68 0.19 0.29 -0.02 0.57 0.22 -0.13 -1.06 0.7 0.01 1.13 0.32 0.66 0.12 -0.02 -2.39 -0.11 0.23 -0.63 0.32 -0.33
-0.8 -0.83 -0.58 -0.11 -0.17 -0.2 0.46 0.32 0.13 0.25 0.21 0.15 -0.64 -0.16 -0.14 0.18 -0.18 0.25 0.4 -0.13 -3.15 1.22 0.3 -0.57 0.19 -0.05
0.39 -0.26 -0.69 -0.93 -0.71 -0.63 -0.09 0.11 -0.72 -0.54 -0.58 -0.75 0.34 0.11 0.74 0.01 0.06 0.49 0.5 -0.45 -0.07 0.02 0.69 0.03 0.48 0.34
-0.3 -0.41 -0.21 0.14 0.27 -0.07 0.36 0.3 -0.18 -0.05 -0.14 -0.22 -0.1 0.33 -0.35 0.24 0.08 0.14 -0.31 -0.41 -2.07 0.16 0.37 0.07 0.6 0.13
-0.57 -0.34 -0.16 -0.05 -0.05 -0.27 0.34 0.23 0.3 0.21 0.06 -0.21 -0.43 0.08 -0.29 0.24 -0.14 0.79 0.01 -0.2 -0.88 0.47 0.16 -0.25 0.01 -0.09
0.33 0.48 0.2 -0.1 -0.62 -0.94 -0.88 -0.57 -0.68 -0.71 -0.44 -0.14 0.5 0.4 0.34 0.48 -0.28 0.14 0.36 -0.39 -0.07 -0.88 0.94 0.21 -0.29 0.31
-2.64 -1.67 -0.55 -0.28 -0.63 -1.28 0.11 0.55 -0.06 0.37 -0.09 -0.44 -2.61 0.61 -0.29 1.07 0.45 1.23 0.17 0.35 -1.08 -0.57 0.43 -0.71 0.61 0.17
-0.14 -0.51 -0.24 0.29 0.45 -0.2 0.28 0.4 0.21 0.44 0.54 0.52 0.02 -0.08 -0.61 -0.46 -0.7 -0.11 0.19 -0.05 -1.09 -0.67 -0.04 0.04 0.22 -0.17
-0.33 -0.85 -0.46 0.01 0.15 -0.66 -0.08 0.19 -0.22 0.35 0.22 0.11 -0.54 0.25 -0.53 -0.01 -0.2 0.56 0.48 0.18 -0.66 -0.32 0.33 0.04 0.58 0.06
-0.53 -0.32 -0.32 -0.23 -0.34 -0.45 0.71 0.56 0.06 -0.24 -0.32 -0.69 -0.66 -0.25 -0.2 0.43 0.56 0.61 0.35 0.37 -1.9 0.4 0.13 -0.59 0.47 -0.13
-0.19 -0.89 -0.38 -0.1 -0.2 -0.58 0.34 0.42 0.04 0.43 0.17 0.05 -0.03 0.62 -0.03 0.94 0.45 0.37 0.05 0.12 -2.35 -0.36 -0.25 -0.99 -0.05 -0.49
0.33 0.0 -0.29 -0.23 -0.68 -0.93 -0.78 -0.75 -0.71 -0.51 -0.46 -0.32 0.4 0.39 0.36 0.78 0.53 0.59 0.56 -0.41 -0.84 -0.28 0.82 -0.13 -0.03 0.06
-1.23 -1.32 -0.7 -0.42 0.01 -0.49 -0.11 0.11 -0.47 -0.25 0.11 -0.28 -1.23 0.46 -0.14 0.69 0.16 0.64 0.14 -0.58 -0.02 0.9 0.74 -0.16 0.55 -0.08
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-1.02 -1.35 -0.92 -0.16 -0.2 -0.81 0.02 0.14 -0.32 -0.16 -0.14 -0.52 -1.62 0.5 0.15 0.6 0.25 0.03 0.24 -0.42 -0.11 0.88 0.8 0.06 0.75 0.15
-1.0 -1.17 -0.59 0.04 0.04 -0.33 0.31 0.19 0.04 0.1 0.0 -0.25 -1.07 0.67 0.35 0.73 0.38 0.07 0.44 -0.13 -0.8 0.17 0.22 -0.38 0.11 -0.2
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-0.78 -0.81 -0.4 -0.03 -0.21 -0.48 0.16 0.08 -0.38 -0.11 -0.31 -0.74 -1.12 0.39 0.11 0.35 0.34 1.17 0.44 0.17 -2.1 -0.57 0.57 0.31 0.56 0.03
0.59 -0.3 -0.34 -0.31 -1.0 -1.21 -0.37 -0.04 -0.78 0.02 0.16 0.05 0.06 0.71 -0.17 0.32 -0.62 -0.37 -0.39 -0.4 -2.03 1.0 0.3 0.93 0.27 0.39
-0.08 -0.48 -0.41 -0.31 -0.63 -1.31 -0.38 -0.48 -0.26 -0.05 -0.09 -0.25 -0.11 0.52 0.06 0.97 -0.0 0.69 0.35 -0.18 -1.49 0.16 0.49 -0.18 0.53 0.39
-0.67 -0.12 -0.47 0.21 0.04 -0.0 0.25 0.08 0.36 0.04 0.53 0.06 -0.72 0.1 -0.32 -0.18 -0.3 0.27 -0.45 -0.44 -2.21 0.32 0.7 0.21 0.38 0.13
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-0.15 -0.19 -0.57 -0.18 -0.14 -0.59 -0.31 0.02 -0.05 0.02 0.21 0.15 0.01 0.05 0.19 0.31 -0.26 0.64 0.3 -0.55 -1.67 0.33 -0.21 0.41 0.37 0.31
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.