Heatmap: Cluster_146 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.35 -0.57 -0.72 0.19 0.22 -0.26 -0.37 -0.52 -0.37 -0.06 0.57 0.13 0.54 -1.01 -0.9 -0.81 -0.88 -0.09 -0.76 -1.16 -0.79 0.14 0.04 0.6 1.65 0.67
-3.16 -0.89 -0.52 0.5 0.06 -0.37 0.07 0.17 0.1 0.15 0.49 -0.3 -3.34 -0.1 -0.93 -0.26 -1.35 -0.83 -1.31 -1.03 -1.3 0.03 0.16 1.39 1.77 1.03
-0.01 -0.69 -1.07 0.31 -0.28 -0.96 0.48 0.48 0.01 -0.37 -0.16 -0.94 -0.8 -0.9 -0.83 -0.56 -0.68 -0.18 -0.37 -0.88 -2.31 0.45 0.77 0.55 1.78 0.99
-1.27 -1.49 -2.46 -0.73 -0.51 -4.15 -0.41 -0.02 -0.33 0.01 0.95 0.41 -0.73 -0.48 -1.14 -1.28 -1.14 -1.13 -0.96 -0.58 -0.29 0.53 0.97 1.2 1.98 1.1
-0.46 -1.52 -1.05 -0.44 -0.59 -1.26 -0.71 -0.52 -0.41 0.16 0.19 0.03 -0.18 0.39 -0.54 0.58 -0.91 -0.74 -0.53 -0.94 -0.77 0.42 0.68 1.13 1.39 1.16
0.38 -0.21 -0.1 0.44 0.02 -0.63 -0.15 0.16 -0.03 0.4 0.46 0.2 -0.11 -0.78 -0.72 -1.37 -1.23 -0.62 -0.74 -0.79 -2.76 0.15 0.6 0.23 1.33 0.86
0.71 -0.42 -0.31 0.79 0.21 -0.86 -0.16 0.57 0.03 0.23 0.67 0.29 -0.09 -0.55 -1.4 -0.82 -1.8 -0.79 -1.48 -1.23 -1.88 0.49 0.45 -0.23 0.85 1.06
0.57 -1.43 -0.85 1.0 0.15 -1.26 -0.36 0.48 0.23 0.8 0.89 0.31 -0.59 -1.85 -3.91 -2.61 -3.44 -1.52 -2.41 -3.0 -1.88 0.87 0.4 -0.0 1.7 1.2
0.33 -0.49 -1.11 -0.4 -0.94 -1.1 -0.32 0.03 0.26 0.54 0.83 0.65 -0.03 -0.78 -1.5 -1.39 -1.11 -0.3 -0.45 -0.74 -0.11 1.1 0.39 0.57 0.8 0.56
-0.22 -0.44 -1.24 -0.18 0.28 0.43 0.75 0.11 -0.29 -0.27 -0.14 -0.19 0.35 -0.14 -0.89 -0.02 -0.5 -0.34 -1.51 -1.26 -1.05 -1.25 0.82 0.02 1.27 1.18
-0.14 -0.62 -0.65 -0.13 -0.24 -0.6 -0.09 0.01 0.12 0.39 0.7 0.59 0.23 -0.41 -0.94 -0.67 -0.79 -0.89 -1.17 -1.55 -0.05 0.94 0.82 0.66 0.6 0.25
0.79 -0.42 -0.62 0.37 -0.23 -1.16 -0.56 -0.3 -0.98 -0.69 0.12 0.23 0.56 -0.74 -1.99 -0.23 -1.87 -1.09 -1.76 -1.6 -0.23 1.42 0.4 0.09 1.49 1.09
-0.99 -2.25 -1.81 -0.71 -0.17 -0.14 0.35 0.11 0.79 0.25 -0.05 -0.83 -1.16 0.09 -0.66 -0.51 -0.62 -0.08 -0.81 -0.55 -0.31 0.37 0.67 0.84 1.38 1.01
0.56 -0.96 -1.2 0.59 0.33 -0.87 -0.36 0.18 -0.08 -0.19 0.35 -0.28 -0.26 -2.16 -2.43 -1.8 -2.1 -0.93 -1.63 -1.99 -2.03 1.75 0.58 0.21 1.88 0.72
-1.36 -1.63 -1.11 0.24 0.15 -0.36 0.5 0.75 0.76 0.83 0.71 0.03 -1.65 -1.97 -1.81 -0.91 -0.98 -0.32 -0.84 -1.11 -5.05 0.64 0.37 0.83 1.52 0.37
0.67 -0.32 -0.57 0.51 0.19 -0.6 -0.35 0.18 -0.35 -0.21 0.31 0.06 0.47 -0.33 -1.17 -0.62 -1.16 -0.87 -1.34 -1.3 -1.7 0.89 0.06 0.51 1.35 0.7
-0.92 -0.73 -0.37 0.97 0.48 -0.07 0.25 0.71 0.58 0.15 0.7 0.28 -1.11 -0.66 -1.37 -0.71 -1.68 -0.82 -1.08 -1.68 -2.35 -0.43 0.53 0.17 1.37 0.75
-1.17 -0.79 -1.01 -0.46 -0.65 -1.01 -0.38 -0.25 0.24 0.46 0.51 0.23 -1.5 -0.98 -1.21 -0.91 -1.83 0.04 -0.7 -1.18 -1.68 -2.31 0.56 1.76 1.8 1.49
-1.66 -2.09 -2.22 -1.68 -1.65 -1.64 -0.76 -0.41 0.04 0.53 0.73 -0.04 -1.35 0.29 -0.37 0.17 -0.5 -0.69 -1.16 -0.53 -1.36 -0.39 0.99 1.24 1.91 1.37
-1.79 -1.8 -2.07 -1.56 -1.53 -1.47 -0.65 -0.34 -0.11 0.25 0.45 0.28 -1.07 0.3 -0.33 0.11 -0.14 -0.44 -1.06 -0.66 -1.36 -0.77 0.57 1.6 2.02 1.09
-0.01 -1.07 -0.77 0.24 -0.26 -0.88 -0.11 0.14 0.01 0.15 0.23 -0.13 -0.32 -0.35 -1.3 -0.27 -0.83 -0.48 -1.43 -0.93 -0.56 0.11 0.67 0.54 1.54 1.28
-0.27 -0.42 -0.41 0.46 0.07 -0.32 -0.27 0.12 -0.03 0.04 0.34 -0.01 -0.86 -0.24 -0.79 -0.72 -1.9 -0.89 -1.14 -1.55 -2.78 1.26 0.45 -0.85 1.75 1.18
0.03 -0.51 -0.49 0.02 0.05 0.07 -0.03 -0.09 0.11 -0.09 -0.0 0.04 -0.19 -0.5 -0.51 0.36 -0.47 -0.18 0.05 -0.3 -1.23 0.42 0.41 0.61 0.68 0.35
-1.36 -0.89 -0.44 0.32 0.27 -0.67 -0.18 0.07 -0.26 -0.15 0.12 -0.48 -2.39 -0.07 -0.12 -0.12 -0.79 -0.04 -0.47 -0.46 -2.46 0.09 0.64 -0.09 1.9 1.21
0.94 -0.82 -1.28 0.82 0.4 -0.47 -0.58 0.24 -0.42 -0.47 -0.15 -0.45 0.56 -1.96 -2.42 -2.64 -3.22 -0.87 -1.75 -1.81 -1.72 0.83 0.67 0.31 2.0 1.07
-0.17 -0.91 -0.45 0.06 -0.34 -0.44 0.28 0.22 0.3 -0.07 0.18 0.16 -0.22 -0.02 -0.56 0.35 -0.56 0.01 -0.73 -0.92 -0.58 0.31 0.26 -0.31 1.25 0.65
-0.22 -0.42 -0.14 0.45 0.01 -0.4 0.05 0.64 0.24 0.13 0.39 0.05 -0.92 -0.21 -0.92 -0.52 -0.71 -0.18 -0.38 -0.62 -2.25 0.61 -0.03 0.0 1.06 0.86
-0.25 -0.96 -0.81 0.46 0.36 -0.19 0.34 0.63 0.38 0.21 0.52 -0.08 -0.92 -1.39 -1.45 -1.46 -1.86 -0.43 -1.07 -1.71 -1.79 0.58 0.76 0.83 1.42 0.6
-0.02 -0.6 -0.55 0.19 0.15 -0.47 -0.01 0.03 0.02 0.1 0.56 0.34 0.15 -1.0 -1.03 -1.25 -1.88 -1.05 -1.55 -1.94 -0.97 1.23 0.22 0.88 1.26 0.8
-0.07 -0.2 -0.19 0.25 -0.08 -0.47 -0.25 -0.15 0.06 0.24 0.42 0.54 -0.03 -0.19 -0.63 -0.36 -0.89 -0.1 -0.61 -0.97 -0.62 -0.49 0.77 0.31 0.89 0.67
0.19 -0.33 -0.38 0.44 -0.07 -0.59 -0.19 0.32 0.35 0.49 0.68 0.33 0.15 -0.58 -0.28 -0.74 -0.89 -0.52 -0.83 -0.71 -2.34 -0.01 -0.04 -0.13 1.18 0.76
0.38 -0.63 -0.93 0.17 0.14 -1.15 -0.62 -0.23 -0.66 -0.3 0.34 0.15 0.04 -0.99 -1.9 -1.19 -1.51 -1.0 -1.34 -1.35 -1.33 1.3 0.96 0.44 1.73 1.12
0.49 -0.77 -0.9 0.39 0.06 -0.73 -0.08 0.4 0.02 0.25 0.66 0.41 0.46 -0.65 -1.5 -0.81 -1.87 -1.17 -1.59 -1.76 -0.98 0.82 0.39 0.28 1.27 0.75
-1.88 -1.29 -0.35 0.61 0.15 0.21 0.01 -0.01 -0.41 -0.37 -0.26 -0.39 -1.84 -0.09 -0.74 -1.13 -1.64 -0.41 -0.4 -0.55 -0.51 -0.58 1.15 0.26 1.64 1.55
-0.22 -0.23 -0.23 0.24 0.19 -0.43 0.16 0.47 0.26 0.54 0.95 0.54 -0.4 -2.46 -1.75 -3.24 -0.99 -0.59 -1.1 -0.8 -4.9 0.38 0.26 0.5 1.37 0.81
0.36 -0.37 -0.46 0.29 0.14 -0.33 -0.02 0.24 0.33 0.37 0.72 0.35 0.07 -1.55 -1.48 -1.51 -0.81 -0.23 -1.16 -0.92 -1.61 0.59 0.36 0.37 1.14 0.42
-4.45 - -3.14 -0.78 -0.1 -2.55 -1.2 -1.12 -0.67 -0.32 -0.26 0.2 -2.98 0.84 -1.29 -0.15 -1.61 -0.61 -2.4 -1.44 0.5 -1.32 2.0 1.91 1.47 1.45
-1.72 -1.23 -0.68 0.61 0.19 -0.43 -0.43 -0.02 -0.39 -0.21 0.16 -0.7 -2.34 -1.96 -2.4 -1.61 -1.26 -0.19 -1.22 -0.99 -1.52 0.94 0.95 0.78 2.03 1.55
-0.42 -0.89 -0.7 -0.6 -0.64 -1.06 -0.2 -0.02 -0.06 0.21 0.3 0.27 0.1 -0.16 -0.72 -0.04 -0.96 -0.68 -0.82 -1.04 0.27 0.51 0.85 1.31 0.49 0.88
0.66 0.08 0.04 0.69 0.05 -0.63 -0.04 0.53 -0.26 -0.21 0.07 -0.15 -0.13 -1.11 -1.36 -1.31 -1.42 -0.67 -0.72 -1.13 -1.85 0.6 0.28 0.32 1.36 0.92
0.79 -0.47 -0.76 0.36 0.22 -0.36 0.25 0.46 0.16 -0.33 -0.02 -0.61 0.14 -1.14 -1.2 -0.86 -0.91 -0.27 -0.61 -1.12 -1.41 0.88 0.31 0.35 1.23 0.61
0.09 -0.21 -0.25 -0.15 -0.09 -0.47 -0.18 -0.12 -0.31 -0.1 -0.07 0.12 0.29 -0.05 -0.86 -0.64 -0.91 0.35 -0.28 -0.76 -0.86 0.39 -0.28 0.88 1.14 0.82
0.12 -0.15 -0.48 0.49 0.56 -0.01 0.19 0.22 -0.44 -0.47 -0.09 -0.52 -0.7 -1.48 -1.42 -1.85 -1.49 -0.48 -1.0 -1.06 -4.22 1.09 0.9 0.59 1.78 0.44
0.21 -0.81 -1.0 0.1 -0.26 -1.04 -0.3 -0.01 0.16 0.23 0.5 0.37 0.1 -0.28 -1.05 -0.26 -0.95 -0.5 -0.91 -0.69 -0.06 0.88 0.7 0.65 0.76 0.38
-0.86 -0.23 -0.3 -0.29 -0.31 -0.83 -0.21 -0.62 0.08 0.21 -0.21 -0.45 -0.65 -0.52 -0.92 -0.64 0.45 0.76 -0.27 -0.17 -0.22 -0.08 0.59 1.2 1.22 0.06
-0.5 -0.58 -0.61 -0.11 -0.22 -0.37 -0.21 -0.01 -0.28 -0.08 0.44 0.42 -0.68 0.14 -1.02 -0.19 -0.94 -0.51 -1.5 -1.06 -1.01 -1.85 0.58 1.34 1.35 1.37
0.53 -0.5 0.01 0.46 -0.76 -1.85 -0.63 0.11 -1.34 -1.07 -0.74 -1.13 0.17 0.23 -0.32 0.46 -0.89 0.19 -0.51 -0.76 -0.65 0.06 0.33 0.03 1.68 1.23
0.08 -0.2 0.12 0.8 -0.06 -1.84 -1.58 -0.78 -1.15 -0.62 0.15 0.28 -0.1 -1.35 -1.87 -2.12 -1.43 -1.21 -1.76 -0.86 0.45 1.48 -0.26 0.51 1.77 1.24
0.57 -0.47 -1.07 0.26 0.15 -0.76 -0.29 0.02 0.15 0.34 0.8 0.61 0.35 -1.13 -1.53 -0.51 -1.82 -0.99 -1.11 -2.05 -0.88 0.76 0.41 0.58 1.16 0.47
-0.08 -1.77 -1.76 -0.25 -0.56 -0.51 -0.1 -0.96 0.15 0.57 1.01 0.94 0.34 -1.55 -1.18 -1.48 -1.34 -0.92 -0.77 -1.61 -1.15 1.22 0.77 0.66 1.29 0.6
0.09 -1.24 -0.75 0.15 -0.13 -0.88 0.09 0.13 0.04 0.08 0.72 0.26 0.06 -0.63 -1.29 -0.73 -0.79 0.02 -0.71 -0.8 -2.31 0.56 0.42 0.85 1.4 0.42
1.25 -0.09 -0.83 0.21 0.01 -1.56 -0.58 -0.29 -0.7 -0.34 0.49 0.64 1.08 -0.92 -2.07 -1.11 -1.5 -1.36 -1.36 -1.79 -1.09 0.73 0.02 0.29 1.5 0.86
0.3 -0.7 -1.03 0.08 -0.23 -0.65 -0.26 0.16 0.08 0.56 0.73 0.32 0.62 -0.25 -1.89 -1.41 -2.66 -1.46 -1.46 -2.12 -0.01 0.34 0.47 1.12 0.99 0.84
-1.51 -0.72 -0.7 0.38 -0.01 -0.97 -0.0 0.63 0.87 0.78 1.08 0.36 -2.19 -1.28 -1.66 -1.33 -0.75 -0.72 -0.4 -0.6 -4.12 0.15 0.48 0.4 1.49 0.58
-0.1 -0.7 -0.82 0.13 0.11 -0.33 0.16 0.22 0.38 0.27 0.44 0.33 0.05 0.03 -0.77 -0.2 -0.72 -0.66 -0.66 -1.1 -0.42 0.64 0.38 0.36 0.62 0.32
-1.46 -0.8 -0.97 -1.23 -1.76 -1.17 -0.2 0.19 0.74 0.66 0.75 0.55 -3.11 -0.06 -0.72 -0.43 -0.87 -0.4 -0.92 -1.13 -2.06 0.02 0.7 0.64 1.83 1.19
0.15 -0.17 -1.15 -0.22 -0.78 -1.25 -0.54 -0.39 -0.09 -0.1 0.74 0.33 0.38 -0.8 -1.44 -1.14 -1.41 -0.82 -0.88 -1.61 -0.15 0.83 0.65 1.17 1.35 0.91
0.3 -0.67 -1.44 0.35 0.05 -0.68 -0.01 0.21 0.17 -0.05 0.36 -0.28 0.07 -1.62 -1.44 -1.39 -2.1 -0.59 -1.32 -1.75 -3.38 1.37 0.93 0.66 1.57 0.73
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-0.33 -0.69 -0.88 -0.09 -0.26 -0.82 -0.0 0.18 0.63 0.45 0.7 0.42 -0.02 -0.93 0.16 -1.12 -0.47 -1.27 -1.36 -1.51 -1.54 0.59 0.66 0.49 1.18 0.71
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-1.53 -1.92 -1.15 0.14 0.37 -0.36 0.08 -0.54 0.12 -0.08 0.45 -0.05 -1.15 0.21 -0.68 -0.34 -0.62 -1.12 -0.75 -1.1 -0.15 1.02 0.98 0.49 0.76 1.3
-0.25 -0.57 -1.74 0.14 0.33 -0.11 0.25 0.46 0.4 0.24 0.32 -0.46 -1.76 -1.37 -2.63 -1.93 -1.63 -1.11 -1.18 -2.05 -1.54 1.2 1.34 0.65 1.39 0.94
0.21 0.07 -0.39 0.98 0.52 -1.15 -1.14 -0.38 -0.67 -0.35 0.47 0.26 0.32 -1.94 -2.08 -1.95 -2.45 -0.85 -2.11 -1.63 -0.35 1.23 0.02 0.09 1.7 1.14
0.24 -1.63 -1.37 -0.71 -1.22 -1.11 0.39 0.76 0.4 0.58 1.02 0.45 0.4 -0.64 -1.19 -0.57 -1.08 -0.1 -1.35 -1.13 -0.77 1.0 0.07 -0.61 1.25 0.47
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-2.21 -1.84 -0.33 0.7 -0.14 -0.51 -0.15 0.44 0.2 0.26 0.82 0.55 -3.59 -1.24 -1.43 -1.24 -1.8 -1.29 -2.36 -1.28 -1.61 1.28 0.38 0.6 1.32 1.58
-1.63 -0.69 -0.3 -0.34 -0.09 -0.58 -0.56 -0.24 0.3 0.15 0.25 0.12 -1.76 0.1 -0.42 -0.19 -0.39 -0.04 -0.16 -0.38 -0.78 -0.82 0.86 0.88 1.16 1.17
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0.21 -0.54 -0.97 0.22 -0.16 -0.6 -0.1 0.06 -0.03 -0.04 0.4 0.38 -0.23 0.13 -1.2 -0.79 -0.95 -0.87 -0.9 -1.24 -0.42 1.01 0.33 0.66 1.05 0.77
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-0.13 -0.67 0.08 0.66 0.19 -0.57 0.33 0.46 0.09 -0.04 0.04 0.02 0.23 -0.89 -1.35 -0.88 -0.79 -0.24 -0.86 -0.56 -0.9 0.23 -0.34 -0.27 1.48 0.91
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-0.74 -0.99 -0.64 -0.14 -0.07 -0.57 -0.69 -0.53 -0.4 0.11 0.32 0.44 -0.26 0.39 0.29 0.23 -0.34 -0.65 -1.33 -0.86 0.19 0.69 0.83 0.53 0.58 0.64
-0.5 -0.86 -1.02 0.23 0.11 -0.72 0.12 0.1 -0.01 -0.13 0.31 -0.2 -0.93 -0.27 -0.34 -0.07 -0.94 -0.09 -0.91 -1.24 -1.61 1.06 0.81 1.04 1.03 0.51
-2.53 -0.41 -0.82 0.76 0.86 -0.1 0.19 0.54 0.16 0.19 0.73 0.11 -3.73 -1.84 -2.29 -2.15 -1.96 -0.76 -0.98 -1.29 -5.16 0.45 0.32 1.0 1.64 1.12
0.06 -0.61 -0.97 0.37 0.08 -0.33 -0.14 0.36 -0.03 0.13 0.58 0.25 0.36 -0.61 -1.85 -1.06 -1.27 -0.4 -1.53 -1.08 -1.18 0.49 -0.07 0.58 1.55 0.84
-2.53 -2.66 -0.98 0.51 0.31 -0.41 0.21 0.42 0.71 0.54 0.86 0.43 -1.39 -1.16 -1.26 -1.92 -0.62 -0.7 -0.95 -0.53 -5.32 -0.16 -0.2 0.79 1.98 0.62
-0.35 -1.35 -1.17 -0.74 -0.46 -0.86 -0.59 -0.35 -0.1 0.2 0.61 0.61 -0.21 0.32 -0.37 -0.31 -0.52 -0.27 -0.33 -1.03 -0.14 0.37 0.89 1.17 0.64 0.64
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-0.31 -0.82 -0.57 -0.22 -0.16 -0.43 0.24 0.31 0.12 0.36 0.37 0.1 -0.03 0.14 -0.7 -0.16 -1.05 -0.22 -0.39 -0.79 -1.33 -0.76 0.99 0.35 0.95 0.88
-0.7 -1.6 -1.06 0.21 0.1 -0.33 0.1 0.46 0.54 0.36 0.49 0.11 -0.85 -0.19 -0.66 -0.22 -0.42 -0.59 -0.48 -0.87 -1.91 -0.48 0.37 0.55 1.54 0.71
1.07 -0.16 -0.76 -0.06 -0.43 -1.55 -0.69 -0.09 -0.57 -0.53 0.2 -0.04 0.72 -1.25 -2.16 -1.46 -1.84 -0.43 -1.53 -1.78 -1.24 1.4 0.29 0.61 1.82 0.73
-0.62 -0.69 -0.3 0.65 0.63 0.06 0.43 0.33 0.47 0.34 0.52 0.37 -0.61 -0.49 -1.0 -0.43 -1.72 -0.89 -1.45 -1.61 -0.93 0.11 0.71 0.25 0.83 0.5
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-0.15 -0.31 0.04 0.95 0.17 -1.15 -0.45 0.29 0.19 0.44 0.5 0.29 -0.55 -0.93 -1.52 -1.16 -2.12 -0.86 -1.82 -1.65 -2.78 -0.02 0.87 0.36 1.62 0.96
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-0.23 -0.81 -2.27 -0.05 -0.45 -1.7 -0.08 -0.09 -1.64 -0.44 -0.13 -0.04 0.4 -2.46 -1.6 -1.97 -3.85 -1.63 -3.4 -2.59 0.82 1.46 0.65 1.45 1.9 1.17
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.