Heatmap: Cluster_187 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.58 0.22 0.26 -0.05 0.12 -0.05 0.21 0.14 0.29 0.33 0.24 0.31 -0.97 0.04 -0.44 -0.13 -0.02 0.41 0.61 0.53 -5.84 -0.39 -0.5 -0.8 0.19 0.15
-3.25 -0.84 -0.06 0.97 0.78 0.84 1.07 0.65 0.6 0.05 -0.14 -0.58 -3.26 -0.26 -0.49 0.1 -0.2 0.31 0.25 -0.04 -2.9 -2.31 -1.29 -0.71 0.57 0.37
-0.99 -0.49 0.23 0.21 0.46 0.72 0.51 0.2 0.19 0.03 -0.1 -0.28 -1.05 -0.11 -0.3 -0.35 -0.32 -0.15 0.43 0.47 -2.38 -0.01 -0.47 -0.62 0.49 0.63
-1.46 -0.92 0.28 0.66 0.85 0.83 0.81 0.66 0.47 0.28 -0.07 -0.43 -1.27 -1.12 -0.75 -1.16 0.13 -0.01 -0.14 0.41 -4.34 -0.57 -0.45 -0.94 0.55 0.49
0.03 -0.25 0.24 0.59 0.32 0.11 0.36 0.64 0.36 0.43 0.39 0.22 -0.21 -0.25 -0.65 -0.67 -0.41 -0.24 -0.41 0.05 -3.4 -0.7 -0.13 -0.41 0.16 0.39
-1.31 0.14 0.6 0.73 0.68 0.15 -0.17 0.04 0.15 0.2 0.11 -0.17 -1.31 -1.17 -0.27 -0.57 -0.4 0.31 0.26 0.13 -3.84 -0.8 0.73 0.19 0.29 0.2
-6.53 -0.97 0.3 0.63 1.03 1.28 0.45 -0.05 -0.42 -0.67 -1.25 -1.17 -4.48 0.04 -0.3 -0.02 -0.31 0.36 0.24 -0.36 -4.95 -0.04 -2.39 -1.46 1.61 1.09
-0.56 -0.16 -0.02 0.03 0.32 0.34 0.43 0.21 0.26 0.33 0.04 -0.26 -0.56 -0.23 0.01 -0.29 0.13 0.6 0.2 0.37 -2.86 -0.56 -0.78 -0.31 0.46 0.13
-2.09 -1.33 -0.27 0.18 0.44 0.76 0.96 0.94 0.47 0.2 -0.19 -0.47 -1.69 -0.51 -0.16 -0.53 0.49 0.37 0.36 0.36 -5.42 -0.3 -1.45 -0.74 0.78 -0.05
-0.3 0.2 0.11 0.67 0.77 0.75 0.9 0.87 0.57 0.14 0.07 -0.31 -0.87 -0.74 -0.96 -0.6 -0.6 -0.42 -0.37 -0.48 -4.93 -0.27 -1.07 -0.6 0.59 0.16
-0.36 -0.22 0.06 0.43 0.73 0.57 0.84 0.67 0.47 0.58 0.34 -0.15 -0.59 -1.0 -1.32 -2.64 -0.72 -0.2 -0.65 0.27 -2.45 0.12 -0.84 -0.53 0.69 0.3
-1.79 -0.2 0.44 0.73 0.92 0.58 0.72 0.91 0.68 0.41 0.42 0.33 -1.36 -0.84 -0.65 -0.85 -0.35 -0.46 -0.7 -0.04 -1.83 -0.6 -0.52 -1.26 0.19 -0.09
-0.98 -0.35 -0.18 0.24 0.61 0.78 0.61 0.24 0.64 0.24 0.31 0.02 -0.96 -0.2 0.01 0.14 -0.47 0.11 -0.05 -0.52 -2.88 -0.29 -0.27 -0.23 0.29 -0.19
-0.31 -0.06 0.23 0.45 0.78 1.06 0.6 0.42 0.33 -0.01 0.03 -0.03 -0.08 -0.41 -0.58 -0.77 -0.19 -0.13 -0.03 -0.05 -5.69 -0.18 -0.99 -0.58 0.21 -0.21
-0.64 -0.47 0.27 0.57 0.75 0.83 0.76 0.67 0.52 0.33 0.11 -0.13 -0.48 -1.68 -1.01 -1.52 -0.17 -0.09 -0.23 0.42 -4.19 -1.14 -0.0 -0.33 0.6 -0.28
-0.94 0.16 0.37 1.06 0.67 0.29 0.94 1.22 0.36 0.13 0.22 -0.17 -1.87 -1.16 -1.67 -1.7 -0.41 -0.0 -0.44 -0.44 -5.45 -1.35 -0.68 -1.35 1.1 0.43
-0.06 0.08 0.01 0.41 0.6 0.83 0.71 0.76 0.62 0.07 -0.08 -0.4 -0.27 -1.22 -0.89 -0.43 -0.07 -0.37 -0.27 -0.13 -5.92 -0.33 -0.33 -0.76 0.71 -0.14
-0.08 -0.35 -0.05 0.63 0.8 0.6 0.74 0.67 0.55 0.17 -0.06 -0.45 -0.47 -0.46 -0.73 -0.37 -0.45 -0.23 -0.37 -0.29 -2.87 -0.2 0.15 -0.57 0.37 -0.18
0.12 0.45 0.06 0.25 0.52 0.66 0.69 0.6 0.46 0.13 0.03 -0.02 0.03 -0.22 -0.41 -0.29 -0.34 -0.16 -0.05 -0.36 -7.45 -0.66 -0.61 -0.48 0.07 -0.42
-0.09 -0.13 -0.71 1.19 1.33 0.97 0.72 0.73 0.35 -0.28 -0.22 -0.47 -0.97 -0.96 -0.94 -1.19 -0.49 -0.13 -0.5 -0.09 -6.05 -0.59 -0.19 -0.63 0.51 -0.12
-0.67 -0.53 -0.22 0.08 0.13 0.15 0.46 0.59 0.42 0.3 -0.14 -0.54 -0.81 -0.54 -0.4 -0.37 -0.46 0.73 0.73 0.66 -3.21 0.5 -1.5 -0.8 0.55 0.27
-2.13 -0.71 0.47 0.56 0.51 0.57 0.33 0.57 0.39 0.32 -0.23 -0.89 -2.93 -0.01 -0.38 0.28 -0.22 1.0 0.55 0.34 -4.67 -2.6 -0.92 -1.29 0.65 0.36
-1.47 -0.24 -0.12 0.65 0.73 0.62 0.98 0.98 0.66 0.13 0.1 -0.42 -2.52 -1.09 -0.57 0.1 -0.65 -0.13 -0.55 -0.58 -2.15 -0.06 -0.44 -1.19 0.9 0.22
0.03 0.04 0.1 0.46 0.38 0.39 0.68 0.4 0.41 -0.6 0.03 -0.16 -0.42 -0.36 -0.56 0.1 -0.82 -0.37 -0.47 -0.64 -3.24 -0.92 0.02 0.69 0.4 0.61
-1.47 -0.16 0.59 0.81 0.85 0.87 0.4 0.63 0.38 0.18 0.35 0.26 -0.53 -1.58 -0.91 -1.41 -0.2 -0.13 0.06 0.09 -7.36 0.02 -1.46 -0.9 0.64 -0.42
-2.04 -0.23 0.78 0.88 0.83 0.82 0.5 0.32 -0.08 -0.68 -1.23 -1.41 -1.74 -0.13 -0.08 -0.03 0.24 0.12 0.19 0.55 -3.96 0.7 -1.89 -1.56 0.38 0.24
-2.52 -0.61 0.55 0.62 0.48 1.09 0.65 0.39 0.37 -0.29 -0.67 -0.83 -2.27 0.15 0.26 0.04 0.35 -0.21 0.36 0.57 -2.11 -0.27 -0.63 -0.4 -0.72 -0.1
-1.12 -0.66 -0.21 0.84 0.82 0.72 0.65 0.8 0.67 0.31 0.26 -0.17 -1.02 -1.1 -1.08 -0.56 -0.81 -0.08 0.06 0.25 -1.79 -0.3 -0.48 -1.21 0.57 0.05
-3.14 0.12 0.69 0.78 0.83 0.72 0.44 0.33 0.15 0.12 -0.1 -0.17 -2.12 -0.05 -0.07 0.13 -0.24 0.51 0.07 0.31 -4.22 -2.52 -0.66 -1.68 0.55 -0.06
-0.35 -0.17 0.37 0.53 0.49 0.48 0.37 0.42 0.07 -0.17 -0.3 -0.53 -0.6 0.04 -0.02 0.11 -0.23 0.2 0.01 -0.31 -1.49 -0.45 -0.09 -1.25 0.44 0.43
-0.14 -0.02 -0.01 -0.15 -0.03 0.34 0.7 0.64 0.25 0.16 -0.1 -0.45 -0.67 -0.53 0.04 -0.66 0.12 0.72 0.44 0.58 -5.92 -0.25 -1.16 -0.65 0.16 0.24
0.07 0.14 -0.02 -0.02 0.27 0.23 0.53 0.47 0.17 0.35 -0.1 -0.41 -0.24 -0.67 -0.6 -0.78 0.14 0.87 0.51 0.7 -4.81 -1.05 -1.01 -1.07 0.4 0.08
-4.51 -0.42 0.42 0.78 1.28 1.49 1.08 0.59 0.75 0.03 -0.35 -0.36 -5.43 -0.93 -1.12 -1.29 -1.09 -0.49 -0.68 -0.05 -1.14 -2.71 -0.89 -2.11 0.69 0.88
-0.26 -0.05 0.32 0.59 0.41 0.44 0.79 0.7 0.54 0.03 -0.01 0.04 -0.44 -0.19 -0.18 0.03 -0.47 -0.37 -0.19 -0.37 -4.73 -0.08 -0.53 -0.47 0.02 -0.28
-1.09 0.52 0.85 0.81 0.89 0.85 0.47 0.21 0.3 0.13 0.13 0.24 -1.37 -0.01 -1.23 -0.44 -0.64 -0.22 -0.03 0.08 -3.8 -0.5 -2.01 -0.86 0.17 -0.09
-0.4 -0.05 -0.11 0.05 0.38 0.37 0.45 0.25 0.19 0.19 -0.2 -0.32 -0.48 -0.51 0.02 -0.31 0.05 0.79 0.44 0.44 -4.69 -0.38 -0.47 -0.23 0.06 0.12
-0.68 -0.26 0.05 0.39 0.39 0.09 0.6 0.53 0.33 0.3 -0.1 -0.36 -1.06 -0.18 -0.25 -0.23 -0.07 0.8 0.42 0.36 -3.23 -0.52 -0.74 -0.72 0.16 0.21
-0.4 0.53 0.41 0.92 1.07 0.57 0.62 0.53 0.35 0.02 -0.21 -0.66 -1.1 -1.16 -0.2 -0.92 -0.78 0.11 -0.11 -0.11 -2.93 0.06 -0.28 -0.78 0.05 -0.37
-1.85 -1.09 0.22 0.79 0.74 0.73 0.45 0.68 0.57 0.14 0.1 -0.38 -1.59 0.19 0.07 0.51 -0.12 -0.05 0.06 0.13 -3.03 -0.7 -1.53 -0.95 -0.08 0.15
-0.03 -0.3 -0.01 0.41 0.55 0.58 0.78 0.83 0.55 0.03 -0.13 -0.25 -0.28 -0.27 -0.42 0.01 -0.57 -0.19 -0.07 -0.52 -4.04 -0.45 -0.54 -0.32 0.47 -0.13
-2.75 -0.33 0.4 0.66 0.94 0.83 0.73 0.46 0.74 0.28 0.03 -0.13 -1.78 0.01 -0.03 -0.16 0.08 -0.51 -0.67 -0.07 -4.56 -0.43 -0.53 -1.38 0.28 0.01
-0.35 0.28 0.47 0.57 0.13 0.47 0.35 0.67 0.21 0.43 -0.01 -0.1 -1.14 -2.27 -1.07 -2.26 -0.69 0.51 0.41 0.62 -3.93 -0.85 -0.44 -0.32 0.39 0.7
-0.74 -0.05 0.63 0.77 0.67 0.52 -0.09 -0.23 -0.36 -0.18 -0.39 -0.2 -0.6 -0.18 -0.1 0.1 -0.54 0.1 -0.04 -0.25 -1.97 -1.25 -0.06 -0.14 0.75 0.78
-1.62 -0.97 0.21 0.74 0.69 0.56 0.55 0.7 0.63 0.44 0.18 -0.18 -1.48 -1.12 -0.59 -0.96 -0.33 0.1 -0.3 0.36 -2.73 0.36 -0.73 -0.28 0.27 0.28
-0.33 0.17 0.28 0.38 0.1 0.42 0.62 0.74 0.69 0.49 0.42 0.01 -0.34 -0.97 -0.93 -0.74 -0.72 -0.28 -0.57 -0.26 -5.29 -0.01 -1.24 -0.43 0.59 0.62
-1.65 -1.82 0.08 0.68 1.03 0.96 0.68 0.47 0.45 0.75 0.54 0.13 -1.06 -1.75 -0.96 -1.62 -0.6 -0.04 0.48 0.69 -2.19 -0.81 -0.38 -0.83 -0.3 -0.02
-0.15 0.52 0.92 1.0 1.05 1.02 0.31 0.35 -1.14 -1.7 -1.65 -1.34 -0.05 -0.28 -0.35 -0.26 -0.41 -0.84 -0.69 -0.19 -2.88 -0.4 -3.62 -1.51 1.06 1.03
-0.3 0.64 1.0 0.94 0.79 0.6 0.22 0.11 0.01 -0.16 -0.3 -0.28 -0.33 -2.09 -1.32 -1.44 -0.86 -0.44 -0.39 0.15 -3.08 1.08 -0.85 -0.34 0.04 0.18
-1.49 -0.31 0.35 0.47 0.62 0.63 0.42 0.41 -0.0 -0.1 -0.31 -0.33 -1.27 -0.09 -0.05 0.07 -0.21 0.14 0.22 0.23 -2.82 -0.88 -0.09 -0.15 0.41 0.45
0.03 0.31 0.54 0.57 0.61 0.63 0.39 0.48 0.35 0.3 0.08 0.08 -0.05 -1.05 -0.97 -1.04 -0.16 0.2 0.14 0.45 -4.18 -1.82 -0.54 -0.55 -0.3 -0.1
-4.05 -0.16 0.17 1.08 0.71 1.2 0.93 1.16 1.36 0.58 0.33 -0.7 - -2.89 -1.77 -2.12 -1.0 0.32 -0.23 0.12 -2.37 -1.41 -1.21 -3.98 0.62 -0.24
-1.71 -0.04 0.54 0.29 0.27 0.25 0.23 0.22 0.05 0.41 0.17 -0.08 -2.15 -0.4 -0.02 -0.75 0.02 0.58 0.89 0.67 -5.4 -0.29 -1.31 -0.89 0.25 0.47
0.04 0.22 0.53 0.63 0.68 0.52 0.13 0.26 0.26 0.25 0.01 0.07 -0.59 -0.99 -1.43 -1.41 -0.46 0.36 0.35 0.06 -4.26 -0.15 -0.82 -0.57 0.04 0.66
-0.25 -0.99 -0.5 0.63 0.7 0.67 1.02 1.09 0.92 0.38 0.21 -0.44 -0.55 -1.31 -1.26 -0.8 -0.72 -0.65 -0.53 -1.01 -2.68 0.15 -0.09 -0.84 0.74 -0.01
-0.99 -0.42 0.03 0.35 0.43 0.5 0.59 0.38 0.47 0.3 0.11 -0.13 -0.7 -0.77 -0.52 -0.43 -0.31 0.32 0.47 0.49 -3.83 -0.34 -0.74 -0.72 0.63 0.23
0.51 -0.33 0.0 0.77 0.49 0.23 0.79 0.94 0.56 0.25 0.27 0.05 -0.05 -0.76 -0.99 -0.86 -1.12 -0.96 -0.87 -0.63 -6.95 -0.45 -0.73 -0.34 0.69 0.52
-0.03 -1.26 0.04 0.25 0.47 1.12 1.46 1.29 0.9 -0.04 -0.59 -0.85 -0.48 -2.37 -1.03 -1.63 -0.28 -0.19 -0.42 0.2 -2.66 -2.71 0.19 -0.48 0.36 -0.3
-2.34 -0.04 0.71 0.82 0.89 0.73 0.56 0.47 0.02 0.0 -0.6 -1.14 -2.37 -1.01 -0.39 -0.84 -0.29 0.74 0.78 0.76 -5.18 -0.53 -1.47 -2.0 0.48 0.36
-1.81 -1.43 0.25 0.93 0.83 0.48 0.84 0.74 0.47 0.42 0.06 -0.27 -1.32 -0.35 -0.64 0.08 -0.02 0.4 0.12 0.67 -5.3 -0.58 -3.44 -1.94 0.13 0.02
-1.68 -1.19 0.33 0.87 1.16 0.95 1.03 0.97 0.68 0.41 0.11 -0.11 -1.53 -0.79 -0.94 0.11 -0.45 0.01 0.01 0.33 -6.24 -1.12 -3.71 -1.9 -0.24 -0.21
0.16 0.45 0.36 0.71 1.05 0.58 0.39 0.27 0.25 -0.06 0.04 -0.32 -0.84 -0.36 -0.55 -0.4 -0.57 -0.39 -0.36 -0.46 -3.75 -0.78 -0.41 0.41 -0.02 0.11
-0.38 -0.96 0.15 0.73 0.85 1.14 0.81 0.74 0.63 0.45 0.47 0.49 0.11 -1.03 -0.23 -1.0 -1.23 -0.35 -0.26 -0.36 -2.94 -1.44 -1.33 -0.56 -0.56 -0.27
-0.88 -0.03 0.75 0.8 0.6 0.49 0.3 0.51 0.05 -0.28 -0.44 -0.41 -1.48 -0.35 0.2 -0.25 0.05 -0.21 0.1 0.26 -3.15 -0.87 0.19 -0.81 0.28 0.31
-0.3 0.38 0.78 0.55 0.32 0.11 0.21 0.39 0.28 -0.17 -0.39 -0.59 -0.47 -1.05 0.13 -0.57 -0.1 0.31 0.4 0.49 -2.07 -0.52 0.26 -0.38 -0.09 -0.55
-0.99 -0.18 0.22 0.44 0.73 0.93 0.62 0.42 0.3 -0.17 -0.05 -0.35 -0.92 -0.05 -0.5 0.06 -0.41 -0.02 0.04 -0.25 -3.37 0.02 -0.34 -0.7 0.29 0.26
-0.15 0.25 0.23 0.43 0.48 0.51 0.67 0.64 0.39 -0.05 0.1 -0.2 -0.38 -0.84 -0.44 -0.35 -0.28 0.11 -0.13 -0.28 -3.42 -0.12 -0.67 -0.41 0.34 0.07
-1.32 -0.56 -0.36 0.87 1.46 1.3 1.03 0.96 0.44 0.38 0.21 -0.52 -2.49 -2.47 -1.97 -1.89 -1.14 -0.06 -0.58 -0.27 -2.87 -0.97 0.02 -0.95 0.61 0.15
-1.96 0.56 0.99 1.03 1.07 0.9 0.19 0.19 -0.08 -0.17 -0.15 -0.33 -2.22 -0.97 -0.48 -0.77 -0.45 -0.36 -0.08 0.43 -2.82 0.25 -1.3 -0.72 0.07 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.