Heatmap: Cluster_94 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.73 0.56 0.44 0.48 0.5 0.53 0.62 0.69 0.47 0.5 0.55 0.5 0.61 1.0 0.4 0.69 0.33 0.7 0.72 0.42 0.09 0.59 0.77 0.79 0.78 1.0
0.53 0.47 0.47 0.5 0.55 0.48 0.65 0.6 0.63 0.67 0.58 0.59 0.6 0.81 0.61 0.77 0.53 0.81 0.74 0.57 0.23 1.0 0.65 0.56 0.71 0.66
0.88 0.33 0.28 0.28 0.37 0.5 0.68 0.69 0.61 0.51 0.45 0.43 0.96 0.46 0.58 0.56 0.34 0.57 0.52 0.28 0.24 1.0 0.69 0.51 0.52 0.36
0.59 0.48 0.46 0.46 0.43 0.37 0.58 0.53 0.45 0.44 0.43 0.41 0.52 0.5 0.49 0.47 0.45 0.66 0.52 0.49 0.05 1.0 0.23 0.39 0.63 0.58
0.8 0.6 0.65 0.73 0.83 0.77 0.79 0.76 0.74 0.71 0.8 0.78 0.88 0.89 0.7 0.92 0.69 0.67 0.65 0.59 0.43 1.0 0.75 0.66 0.81 0.81
0.84 0.49 0.47 0.38 0.31 0.3 0.5 0.55 0.47 0.66 0.71 0.9 1.0 0.76 0.8 0.73 0.62 0.84 0.69 0.74 0.39 0.93 0.58 0.62 0.62 0.97
0.75 0.74 0.7 0.75 0.74 0.59 0.65 0.54 0.59 0.6 0.52 0.48 0.65 0.92 0.69 1.0 0.5 0.73 0.7 0.46 0.15 0.98 0.5 0.51 0.85 0.73
0.85 0.5 0.34 0.27 0.24 0.17 0.23 0.18 0.17 0.2 0.2 0.29 1.0 0.33 0.26 0.33 0.39 0.38 0.28 0.25 0.48 0.89 0.21 0.66 0.59 0.67
0.68 0.56 0.56 0.51 0.39 0.22 0.43 0.5 0.36 0.5 0.45 0.5 0.67 0.6 0.43 0.65 0.6 0.67 0.43 0.58 0.12 1.0 0.27 0.37 0.95 0.68
0.84 0.55 0.49 0.59 0.67 0.7 0.72 0.76 0.68 0.57 0.66 0.53 0.51 0.76 0.6 0.65 0.5 0.82 1.0 0.58 0.2 0.92 0.64 0.8 0.87 0.98
0.36 0.59 0.34 0.37 0.42 0.18 0.39 0.33 0.2 0.37 0.28 0.36 0.38 0.97 0.81 0.72 0.63 0.71 1.0 0.57 0.12 0.92 0.28 0.4 0.39 0.87
0.88 0.62 0.59 0.68 0.77 0.74 0.82 0.76 0.74 0.72 0.77 0.83 0.98 0.72 0.6 0.75 0.59 0.59 0.51 0.48 0.5 1.0 0.98 0.8 0.8 0.73
0.66 0.37 0.28 0.3 0.29 0.27 0.41 0.41 0.23 0.22 0.23 0.26 0.61 0.43 0.59 0.56 0.41 0.53 0.49 0.33 0.22 1.0 0.41 0.32 0.45 0.3
0.8 0.73 0.66 0.71 0.77 0.85 0.72 0.73 0.77 0.68 0.65 0.7 0.73 0.83 0.84 0.77 0.71 0.97 1.0 0.66 0.2 0.85 0.78 0.53 0.85 0.85
0.47 0.39 0.35 0.41 0.41 0.36 0.47 0.5 0.35 0.28 0.23 0.2 0.5 0.15 0.64 0.38 0.35 0.61 0.48 0.4 0.38 1.0 0.38 0.25 0.37 0.3
1.0 0.79 0.64 0.51 0.45 0.38 0.52 0.55 0.56 0.62 0.64 0.68 0.86 0.66 0.66 0.51 0.64 0.69 0.56 0.63 0.39 0.93 0.5 0.57 0.68 0.69
0.41 0.52 0.48 0.53 0.65 0.72 0.62 0.59 0.56 0.5 0.57 0.46 0.4 0.56 0.37 0.61 0.45 0.4 0.5 0.52 0.06 0.58 0.6 0.61 0.72 1.0
0.88 0.41 0.3 0.31 0.4 0.29 0.38 0.42 0.27 0.34 0.38 0.38 0.82 0.08 0.12 0.06 0.1 0.28 0.24 0.16 0.13 1.0 0.35 0.1 0.44 0.21
0.8 0.45 0.3 0.3 0.21 0.21 0.34 0.21 0.2 0.22 0.19 0.25 0.59 0.12 0.09 0.07 0.12 0.27 0.3 0.19 0.25 1.0 0.57 0.11 0.34 0.33
0.71 0.57 0.51 0.43 0.39 0.41 0.43 0.41 0.38 0.44 0.38 0.38 0.68 0.97 0.81 0.78 0.66 1.0 0.96 0.63 0.13 0.87 0.39 0.4 0.69 0.77
0.68 0.53 0.51 0.47 0.38 0.28 0.45 0.46 0.35 0.42 0.37 0.43 0.7 0.97 0.69 0.74 0.66 1.0 0.73 0.53 0.14 0.81 0.36 0.34 0.69 0.8
0.68 0.57 0.56 0.52 0.53 0.55 0.66 0.65 0.52 0.55 0.48 0.43 0.71 0.63 0.58 0.63 0.46 0.77 0.53 0.49 0.28 1.0 0.22 0.42 0.53 0.48
0.63 0.34 0.33 0.42 0.3 0.25 0.33 0.43 0.29 0.29 0.38 0.47 0.98 0.57 0.8 0.55 0.29 0.34 0.24 0.23 0.47 1.0 0.35 0.41 0.68 0.6
0.8 0.75 0.64 0.54 0.56 0.53 0.57 0.52 0.46 0.46 0.42 0.44 0.62 0.85 0.75 0.87 0.61 0.75 0.66 0.58 0.17 1.0 0.41 0.5 0.76 0.79
0.77 0.37 0.21 0.55 0.54 0.3 0.31 0.45 0.3 0.27 0.39 0.27 0.37 0.37 0.44 0.43 0.36 0.47 0.34 0.28 0.05 0.59 0.46 0.39 1.0 0.66
0.52 0.49 0.36 0.41 0.32 0.31 0.51 0.47 0.38 0.39 0.35 0.34 0.58 1.0 0.36 0.76 0.47 0.91 0.48 0.48 0.13 0.88 0.43 0.49 0.58 0.55
0.53 0.5 0.41 0.39 0.38 0.39 0.45 0.43 0.35 0.4 0.35 0.32 0.54 1.0 0.45 0.82 0.51 0.76 0.61 0.55 0.1 0.6 0.34 0.35 0.51 0.43
0.81 0.59 0.62 0.68 0.63 0.51 0.68 0.74 0.62 0.62 0.6 0.58 0.82 0.65 0.74 0.73 0.58 0.7 0.61 0.57 0.17 1.0 0.47 0.41 0.76 0.78
0.64 0.43 0.52 0.53 0.36 0.35 0.51 0.59 0.39 0.35 0.34 0.34 0.67 0.42 0.58 0.81 0.34 0.63 0.5 0.37 0.22 1.0 0.26 0.3 0.56 0.5
0.77 0.48 0.49 0.56 0.53 0.48 0.59 0.62 0.48 0.52 0.53 0.56 0.77 0.81 0.66 0.87 0.63 0.96 0.73 0.49 0.32 0.89 0.66 0.91 0.81 1.0
0.61 0.53 0.55 0.63 0.67 0.53 0.7 0.7 0.58 0.62 0.57 0.53 0.58 0.76 0.67 0.91 0.63 0.97 0.85 0.69 0.23 1.0 0.45 0.48 0.68 0.71
0.8 0.66 0.73 0.7 0.56 0.49 0.62 0.69 0.54 0.63 0.63 0.63 0.8 0.85 0.65 0.75 0.57 0.59 0.54 0.52 0.18 0.86 0.44 0.55 0.78 1.0
1.0 0.44 0.19 0.13 0.22 0.35 0.62 0.55 0.36 0.35 0.28 0.25 0.88 0.45 0.41 0.35 0.42 0.5 0.51 0.35 0.03 0.78 0.74 0.3 0.39 0.29
1.0 0.54 0.63 0.59 0.68 0.75 0.82 0.77 0.74 0.67 0.57 0.54 0.98 0.61 0.71 0.7 0.72 0.88 0.93 0.8 0.36 0.77 0.84 0.59 0.66 0.79
0.5 0.52 0.47 0.43 0.34 0.28 0.45 0.43 0.23 0.27 0.24 0.27 0.47 0.62 0.57 0.51 0.47 0.54 0.63 0.52 0.06 1.0 0.26 0.44 0.51 0.87
0.54 0.57 0.65 0.69 0.62 0.51 0.6 0.54 0.5 0.51 0.52 0.5 0.65 0.97 0.73 0.86 0.99 1.0 0.88 0.55 0.2 0.88 0.38 0.45 0.78 0.91
0.46 0.45 0.44 0.61 0.53 0.41 0.52 0.59 0.44 0.45 0.43 0.44 0.47 0.67 0.76 0.83 0.52 0.93 0.73 0.51 0.22 1.0 0.5 0.52 0.79 0.73
0.69 0.5 0.61 0.69 0.5 0.38 0.56 0.71 0.49 0.54 0.56 0.6 0.79 0.68 0.58 0.61 0.66 0.47 0.49 0.47 0.07 1.0 0.57 0.5 0.93 0.83
0.64 0.43 0.5 0.51 0.54 0.53 0.58 0.39 0.53 0.59 0.53 0.65 0.53 0.49 0.64 0.71 0.48 0.66 0.72 0.53 0.07 0.71 0.69 0.55 1.0 0.84
0.73 0.4 0.36 0.39 0.24 0.17 0.33 0.37 0.26 0.3 0.39 0.37 0.83 0.65 0.36 0.66 0.3 0.6 0.43 0.31 0.26 1.0 0.34 0.5 0.62 0.78
0.51 0.51 0.55 0.52 0.46 0.35 0.56 0.64 0.46 0.63 0.49 0.5 0.38 0.7 0.68 0.6 0.65 0.72 0.65 0.64 0.11 0.97 0.51 0.39 1.0 0.81
0.98 0.21 0.06 0.08 0.18 0.35 0.61 0.6 0.43 0.32 0.32 0.39 0.81 0.21 0.19 0.14 0.26 0.38 0.34 0.22 0.31 1.0 0.62 0.34 0.47 0.27
0.46 0.5 0.54 0.47 0.4 0.39 0.51 0.57 0.48 0.48 0.41 0.47 0.47 0.56 0.54 0.45 0.52 0.57 0.63 0.54 0.16 0.67 0.6 0.5 0.82 1.0
0.81 0.83 0.56 0.49 0.24 0.13 0.22 0.16 0.18 0.28 0.36 0.53 0.75 0.52 0.44 0.43 0.44 0.58 0.57 0.28 0.24 1.0 0.27 0.51 0.67 0.5
1.0 0.87 0.6 0.72 0.35 0.16 0.21 0.3 0.27 0.34 0.53 0.62 0.88 0.57 0.39 0.49 0.39 0.56 0.54 0.3 0.25 0.93 0.42 0.62 1.0 0.84
0.61 0.53 0.46 0.55 0.54 0.45 0.47 0.53 0.61 0.69 0.72 0.75 0.66 0.73 0.44 0.74 0.49 0.76 0.6 0.56 0.33 1.0 0.55 0.53 0.71 0.84
0.59 0.54 0.64 0.71 0.69 0.52 0.62 0.57 0.44 0.5 0.49 0.54 0.65 0.89 0.66 0.82 0.61 0.73 0.65 0.54 0.13 1.0 0.36 0.45 0.7 0.76
0.95 0.7 0.72 0.81 0.88 0.89 0.87 0.79 0.78 0.8 0.81 0.87 0.98 1.0 0.87 0.89 0.65 0.91 0.81 0.64 0.42 0.89 0.87 0.85 1.0 0.95
0.79 0.57 0.61 0.62 0.71 0.72 0.68 0.57 0.59 0.57 0.58 0.7 0.75 0.82 0.87 0.84 0.57 0.69 0.58 0.67 0.3 0.71 0.7 0.73 0.89 1.0
0.54 0.35 0.32 0.36 0.42 0.39 0.37 0.37 0.24 0.24 0.26 0.25 0.53 0.56 0.83 0.57 0.33 0.23 0.24 0.22 0.47 1.0 0.45 0.25 0.55 0.45
0.75 0.43 0.43 0.46 0.39 0.31 0.49 0.52 0.4 0.39 0.37 0.35 0.79 0.65 0.67 0.83 0.49 0.88 0.74 0.45 0.35 1.0 0.47 0.32 0.73 0.68
1.0 0.44 0.19 0.2 0.33 0.44 0.65 0.58 0.46 0.39 0.34 0.28 0.85 0.11 0.19 0.09 0.36 0.51 0.43 0.29 0.18 0.81 0.66 0.39 0.46 0.31
0.19 0.15 0.0 0.17 0.16 0.16 0.16 0.23 0.0 0.08 0.08 0.17 0.07 0.94 0.65 0.81 0.35 0.62 0.47 0.36 0.34 1.0 0.58 0.58 0.55 0.76
0.56 0.46 0.36 0.39 0.51 0.51 0.71 0.63 0.51 0.51 0.44 0.37 0.49 0.63 0.48 0.6 0.43 0.86 0.6 0.41 0.17 1.0 0.31 0.47 0.69 0.66
1.0 0.7 0.75 0.81 0.82 0.59 0.55 0.55 0.45 0.6 0.59 0.57 0.87 0.63 0.61 0.64 0.55 0.86 0.64 0.53 0.17 0.98 0.58 0.58 0.92 0.9
0.61 0.46 0.43 0.42 0.47 0.44 0.57 0.56 0.48 0.52 0.49 0.48 0.63 0.62 0.54 0.63 0.61 0.73 0.67 0.6 0.17 1.0 0.44 0.42 0.65 0.68
0.81 0.65 0.73 0.77 0.67 0.49 0.64 0.7 0.62 0.69 0.71 0.7 0.85 0.81 0.58 0.75 0.64 0.76 0.49 0.63 0.3 0.84 0.6 0.53 0.91 1.0
0.69 0.39 0.53 0.58 0.44 0.41 0.53 0.6 0.55 0.54 0.48 0.51 0.74 0.48 0.42 0.6 0.4 0.48 0.6 0.43 0.27 1.0 0.49 0.55 0.9 0.79

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)