Heatmap: Cluster_94 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.29 -0.08 -0.43 -0.32 -0.26 -0.17 0.06 0.22 -0.33 -0.24 -0.11 -0.26 0.04 0.75 -0.56 0.21 -0.84 0.23 0.28 -0.51 -2.69 -0.02 0.37 0.41 0.39 0.75
-0.2 -0.39 -0.39 -0.3 -0.16 -0.35 0.09 -0.05 0.03 0.13 -0.09 -0.05 -0.03 0.4 -0.01 0.33 -0.21 0.41 0.26 -0.1 -1.43 0.7 0.08 -0.14 0.21 0.1
0.74 -0.68 -0.91 -0.89 -0.5 -0.07 0.38 0.4 0.23 -0.05 -0.21 -0.3 0.88 -0.19 0.14 0.1 -0.61 0.13 -0.01 -0.9 -1.12 0.93 0.4 -0.03 -0.0 -0.52
0.29 -0.0 -0.07 -0.06 -0.18 -0.4 0.26 0.14 -0.1 -0.14 -0.17 -0.25 0.1 0.05 0.02 -0.06 -0.12 0.45 0.09 0.02 -3.41 1.04 -1.06 -0.32 0.37 0.25
0.11 -0.33 -0.21 -0.02 0.15 0.05 0.08 0.03 -0.02 -0.08 0.1 0.07 0.25 0.25 -0.09 0.3 -0.1 -0.15 -0.21 -0.34 -0.81 0.42 0.0 -0.17 0.12 0.11
0.38 -0.4 -0.47 -0.77 -1.08 -1.1 -0.38 -0.23 -0.46 0.03 0.12 0.48 0.62 0.23 0.3 0.16 -0.06 0.36 0.09 0.2 -0.73 0.51 -0.17 -0.06 -0.06 0.58
0.2 0.17 0.1 0.2 0.18 -0.15 -0.01 -0.29 -0.15 -0.12 -0.32 -0.45 -0.0 0.49 0.07 0.61 -0.39 0.16 0.09 -0.5 -2.14 0.58 -0.4 -0.37 0.38 0.15
1.09 0.33 -0.21 -0.59 -0.75 -1.26 -0.79 -1.16 -1.2 -1.0 -0.97 -0.46 1.32 -0.26 -0.6 -0.25 -0.04 -0.06 -0.5 -0.67 0.28 1.15 -0.93 0.72 0.57 0.75
0.38 0.1 0.09 -0.04 -0.45 -1.27 -0.3 -0.09 -0.54 -0.08 -0.23 -0.06 0.35 0.19 -0.27 0.3 0.18 0.36 -0.3 0.15 -2.18 0.93 -0.96 -0.52 0.85 0.37
0.32 -0.29 -0.47 -0.2 -0.02 0.05 0.08 0.18 0.01 -0.26 -0.04 -0.34 -0.41 0.17 -0.17 -0.05 -0.44 0.27 0.56 -0.22 -1.73 0.45 -0.09 0.24 0.36 0.54
-0.45 0.23 -0.56 -0.44 -0.23 -1.5 -0.37 -0.6 -1.32 -0.43 -0.81 -0.49 -0.38 0.95 0.7 0.54 0.33 0.51 1.01 0.18 -2.0 0.88 -0.83 -0.31 -0.35 0.81
0.27 -0.23 -0.3 -0.11 0.08 0.02 0.17 0.07 0.01 -0.02 0.09 0.19 0.43 -0.02 -0.28 0.04 -0.31 -0.3 -0.51 -0.6 -0.54 0.46 0.42 0.13 0.14 0.01
0.7 -0.14 -0.52 -0.45 -0.49 -0.57 -0.0 0.0 -0.85 -0.9 -0.82 -0.63 0.58 0.07 0.52 0.47 0.02 0.39 0.28 -0.29 -0.9 1.3 0.02 -0.34 0.14 -0.44
0.11 -0.03 -0.16 -0.06 0.05 0.19 -0.05 -0.02 0.05 -0.13 -0.19 -0.1 -0.03 0.15 0.18 0.05 -0.06 0.38 0.43 -0.17 -1.91 0.19 0.07 -0.5 0.19 0.19
0.19 -0.08 -0.21 0.0 0.02 -0.19 0.21 0.28 -0.24 -0.56 -0.83 -1.01 0.3 -1.41 0.65 -0.09 -0.22 0.57 0.25 -0.04 -0.1 1.29 -0.09 -0.68 -0.15 -0.44
0.67 0.33 0.03 -0.3 -0.47 -0.73 -0.28 -0.19 -0.16 -0.02 0.03 0.11 0.46 0.07 0.08 -0.3 0.02 0.15 -0.17 0.01 -0.69 0.57 -0.32 -0.13 0.11 0.13
-0.4 -0.04 -0.18 -0.03 0.27 0.42 0.21 0.14 0.05 -0.12 0.09 -0.22 -0.43 0.06 -0.53 0.18 -0.27 -0.43 -0.12 -0.04 -3.09 0.12 0.16 0.18 0.41 0.89
1.38 0.26 -0.2 -0.14 0.23 -0.23 0.16 0.32 -0.34 0.01 0.15 0.17 1.26 -2.03 -1.56 -2.5 -1.76 -0.3 -0.49 -1.09 -1.39 1.56 0.05 -1.81 0.37 -0.72
1.38 0.54 -0.02 -0.03 -0.59 -0.54 0.15 -0.54 -0.62 -0.5 -0.68 -0.3 0.93 -1.33 -1.84 -2.16 -1.42 -0.18 -0.03 -0.72 -0.32 1.69 0.89 -1.55 0.12 0.1
0.28 -0.04 -0.2 -0.46 -0.57 -0.52 -0.43 -0.53 -0.6 -0.42 -0.62 -0.61 0.21 0.74 0.48 0.41 0.18 0.78 0.71 0.12 -2.15 0.58 -0.59 -0.54 0.25 0.39
0.29 -0.07 -0.12 -0.24 -0.54 -1.0 -0.31 -0.27 -0.66 -0.4 -0.6 -0.39 0.33 0.79 0.3 0.41 0.25 0.84 0.39 -0.08 -2.01 0.54 -0.65 -0.72 0.31 0.52
0.3 0.03 0.01 -0.08 -0.07 -0.02 0.26 0.23 -0.1 -0.02 -0.21 -0.38 0.36 0.18 0.07 0.18 -0.25 0.47 -0.06 -0.18 -1.0 0.85 -1.36 -0.41 -0.08 -0.19
0.45 -0.42 -0.46 -0.13 -0.61 -0.9 -0.5 -0.09 -0.69 -0.66 -0.29 0.03 1.08 0.32 0.79 0.27 -0.67 -0.43 -0.92 -1.01 0.03 1.12 -0.39 -0.17 0.57 0.39
0.38 0.28 0.06 -0.19 -0.13 -0.22 -0.1 -0.25 -0.41 -0.43 -0.55 -0.49 -0.0 0.47 0.29 0.5 -0.01 0.28 0.09 -0.08 -1.89 0.7 -0.57 -0.31 0.3 0.37
0.87 -0.2 -1.02 0.4 0.35 -0.49 -0.42 0.1 -0.51 -0.64 -0.1 -0.63 -0.2 -0.19 0.06 0.04 -0.21 0.16 -0.3 -0.61 -3.06 0.48 0.13 -0.1 1.25 0.66
0.07 -0.01 -0.45 -0.28 -0.63 -0.69 0.05 -0.09 -0.38 -0.37 -0.53 -0.53 0.21 1.0 -0.45 0.6 -0.08 0.86 -0.06 -0.04 -1.95 0.83 -0.21 -0.02 0.21 0.14
0.15 0.06 -0.23 -0.3 -0.33 -0.3 -0.09 -0.17 -0.45 -0.26 -0.46 -0.56 0.17 1.06 -0.09 0.78 0.08 0.66 0.34 0.21 -2.3 0.32 -0.49 -0.47 0.09 -0.17
0.34 -0.12 -0.04 0.09 -0.03 -0.33 0.08 0.2 -0.05 -0.04 -0.09 -0.16 0.36 0.03 0.2 0.19 -0.15 0.12 -0.08 -0.17 -1.9 0.64 -0.43 -0.65 0.25 0.28
0.42 -0.17 0.12 0.13 -0.4 -0.47 0.09 0.29 -0.29 -0.48 -0.48 -0.5 0.47 -0.2 0.26 0.75 -0.51 0.4 0.06 -0.39 -1.11 1.06 -0.9 -0.67 0.21 0.05
0.23 -0.47 -0.42 -0.23 -0.31 -0.45 -0.17 -0.1 -0.45 -0.33 -0.31 -0.23 0.23 0.29 0.0 0.39 -0.06 0.54 0.14 -0.43 -1.04 0.43 0.01 0.47 0.29 0.6
-0.09 -0.29 -0.24 -0.03 0.05 -0.29 0.11 0.1 -0.15 -0.05 -0.19 -0.28 -0.15 0.23 0.05 0.49 -0.05 0.58 0.4 0.09 -1.51 0.63 -0.52 -0.43 0.07 0.13
0.31 0.04 0.19 0.11 -0.21 -0.41 -0.06 0.1 -0.27 -0.03 -0.02 -0.04 0.31 0.4 0.01 0.21 -0.18 -0.13 -0.24 -0.3 -1.8 0.42 -0.55 -0.22 0.27 0.63
1.22 0.04 -1.17 -1.7 -0.93 -0.31 0.52 0.35 -0.24 -0.31 -0.62 -0.79 1.05 0.09 -0.06 -0.28 -0.02 0.22 0.26 -0.29 -3.75 0.86 0.79 -0.53 -0.15 -0.57
0.48 -0.42 -0.17 -0.27 -0.06 0.07 0.19 0.1 0.04 -0.11 -0.34 -0.42 0.46 -0.24 -0.01 -0.04 0.0 0.3 0.37 0.16 -1.01 0.1 0.23 -0.27 -0.12 0.13
0.13 0.18 0.03 -0.1 -0.4 -0.72 -0.02 -0.09 -0.99 -0.78 -0.95 -0.76 0.05 0.43 0.31 0.15 0.03 0.25 0.46 0.19 -2.82 1.13 -0.81 -0.06 0.15 0.93
-0.28 -0.21 0.0 0.07 -0.07 -0.36 -0.13 -0.28 -0.37 -0.36 -0.34 -0.38 -0.01 0.58 0.17 0.39 0.6 0.61 0.43 -0.24 -1.7 0.42 -0.78 -0.55 0.26 0.48
-0.31 -0.34 -0.39 0.09 -0.12 -0.5 -0.15 0.05 -0.38 -0.35 -0.41 -0.4 -0.3 0.22 0.39 0.54 -0.15 0.7 0.33 -0.18 -1.36 0.8 -0.22 -0.14 0.46 0.35
0.21 -0.25 0.03 0.21 -0.25 -0.66 -0.1 0.26 -0.27 -0.13 -0.08 0.02 0.41 0.19 -0.04 0.03 0.16 -0.33 -0.29 -0.34 -3.07 0.75 -0.05 -0.26 0.64 0.48
0.15 -0.43 -0.2 -0.2 -0.09 -0.12 0.0 -0.57 -0.12 0.03 -0.13 0.17 -0.12 -0.24 0.15 0.29 -0.28 0.19 0.31 -0.13 -2.97 0.3 0.25 -0.07 0.79 0.54
0.66 -0.21 -0.33 -0.23 -0.96 -1.43 -0.47 -0.33 -0.8 -0.6 -0.25 -0.3 0.85 0.49 -0.35 0.52 -0.59 0.4 -0.1 -0.58 -0.84 1.12 -0.44 0.12 0.42 0.77
-0.17 -0.16 -0.06 -0.15 -0.33 -0.71 -0.05 0.14 -0.32 0.12 -0.24 -0.2 -0.61 0.28 0.24 0.06 0.16 0.32 0.17 0.15 -2.44 0.75 -0.18 -0.56 0.79 0.49
1.33 -0.88 -2.7 -2.25 -1.14 -0.16 0.64 0.64 0.16 -0.29 -0.28 0.01 1.06 -0.85 -1.01 -1.44 -0.6 -0.01 -0.2 -0.84 -0.33 1.37 0.67 -0.18 0.26 -0.5
-0.21 -0.09 0.02 -0.15 -0.4 -0.44 -0.04 0.12 -0.13 -0.14 -0.36 -0.17 -0.17 0.1 0.03 -0.22 -0.01 0.1 0.25 0.05 -1.71 0.35 0.18 -0.08 0.63 0.92
0.82 0.85 0.28 0.09 -0.96 -1.87 -1.04 -1.49 -1.32 -0.71 -0.34 0.19 0.69 0.17 -0.06 -0.1 -0.07 0.32 0.31 -0.7 -0.96 1.12 -0.77 0.14 0.53 0.11
0.88 0.68 0.14 0.41 -0.64 -1.77 -1.35 -0.84 -1.0 -0.66 -0.05 0.18 0.69 0.07 -0.49 -0.15 -0.48 0.03 -0.01 -0.88 -1.13 0.77 -0.38 0.2 0.88 0.63
0.0 -0.2 -0.41 -0.15 -0.18 -0.44 -0.37 -0.21 -0.0 0.17 0.23 0.31 0.12 0.25 -0.45 0.29 -0.31 0.32 -0.02 -0.13 -0.87 0.71 -0.14 -0.2 0.21 0.46
-0.05 -0.17 0.09 0.23 0.18 -0.23 0.03 -0.1 -0.47 -0.29 -0.32 -0.16 0.1 0.55 0.12 0.44 -0.0 0.26 0.11 -0.16 -2.17 0.72 -0.76 -0.44 0.2 0.32
0.2 -0.24 -0.2 -0.04 0.09 0.1 0.07 -0.08 -0.1 -0.05 -0.04 0.06 0.24 0.27 0.07 0.11 -0.35 0.14 -0.04 -0.39 -0.99 0.1 0.06 0.03 0.26 0.19
0.2 -0.26 -0.17 -0.14 0.05 0.07 -0.01 -0.27 -0.23 -0.27 -0.23 0.04 0.13 0.26 0.34 0.3 -0.26 0.01 -0.24 -0.04 -1.21 0.04 0.04 0.08 0.37 0.54
0.37 -0.23 -0.36 -0.19 0.01 -0.09 -0.15 -0.18 -0.81 -0.81 -0.67 -0.72 0.36 0.42 1.0 0.46 -0.35 -0.86 -0.81 -0.9 0.18 1.27 0.12 -0.74 0.42 0.13
0.44 -0.35 -0.36 -0.26 -0.5 -0.82 -0.18 -0.1 -0.47 -0.51 -0.57 -0.64 0.51 0.25 0.27 0.58 -0.16 0.68 0.41 -0.28 -0.64 0.86 -0.24 -0.77 0.41 0.31
1.25 0.07 -1.17 -1.06 -0.35 0.07 0.62 0.46 0.11 -0.11 -0.31 -0.61 1.02 -1.9 -1.13 -2.25 -0.22 0.28 0.04 -0.51 -1.2 0.94 0.66 -0.13 0.14 -0.45
-0.95 -1.35 - -1.15 -1.18 -1.22 -1.22 -0.71 - -2.28 -2.27 -1.14 -2.34 1.35 0.81 1.13 -0.08 0.74 0.36 -0.05 -0.14 1.44 0.65 0.65 0.58 1.05
0.09 -0.22 -0.56 -0.42 -0.06 -0.04 0.41 0.24 -0.07 -0.04 -0.28 -0.52 -0.11 0.26 -0.14 0.19 -0.29 0.7 0.19 -0.38 -1.65 0.92 -0.75 -0.17 0.38 0.31
0.57 0.05 0.16 0.26 0.29 -0.18 -0.28 -0.3 -0.57 -0.15 -0.18 -0.22 0.38 -0.09 -0.13 -0.08 -0.29 0.36 -0.08 -0.34 -1.94 0.54 -0.21 -0.21 0.45 0.42
0.15 -0.26 -0.36 -0.4 -0.23 -0.32 0.06 0.02 -0.19 -0.08 -0.17 -0.19 0.19 0.18 -0.04 0.19 0.15 0.41 0.27 0.12 -1.68 0.86 -0.31 -0.4 0.24 0.29
0.24 -0.09 0.09 0.17 -0.04 -0.48 -0.1 0.02 -0.14 -0.0 0.04 0.02 0.31 0.24 -0.26 0.12 -0.09 0.14 -0.49 -0.14 -1.2 0.28 -0.19 -0.37 0.41 0.54
0.31 -0.51 -0.08 0.07 -0.33 -0.45 -0.06 0.12 -0.0 -0.05 -0.2 -0.11 0.42 -0.21 -0.39 0.12 -0.45 -0.21 0.11 -0.37 -1.03 0.85 -0.18 -0.01 0.7 0.51

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.