Heatmap: Cluster_95 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.77 -0.5 -0.49 -0.54 -0.37 -0.19 -0.15 -0.4 -0.32 -0.2 -0.7 -0.85 -0.95 0.57 0.8 0.61 0.6 0.87 1.14 0.66 -1.22 -0.6 -0.34 -0.23 -0.44 0.36
-1.02 -0.6 -0.77 -0.45 -0.07 0.13 0.08 -0.13 -0.18 -0.15 -0.47 -0.49 -0.97 0.22 0.46 0.35 0.22 1.14 0.63 0.32 -0.72 -0.78 0.24 0.18 0.01 0.38
-2.09 -1.46 -0.78 -0.48 -0.5 -0.55 0.06 0.14 0.21 0.5 -0.13 -0.67 -1.58 0.62 0.2 0.82 0.45 1.33 0.44 0.6 -2.12 -0.73 0.55 -0.46 -0.04 -0.12
-2.14 -1.33 -0.94 -0.75 -0.37 -0.12 -0.08 -0.13 -0.02 0.12 -0.4 -0.79 -1.9 0.64 0.3 0.71 0.26 1.47 0.89 0.66 -1.7 -1.2 0.3 -0.42 0.33 0.31
-1.5 -0.44 -0.3 -0.12 0.35 0.39 0.24 -0.03 -0.34 -0.31 -0.64 -0.77 -1.98 0.19 0.54 0.05 0.36 0.86 0.82 0.65 -1.87 -2.12 0.48 -0.07 0.17 0.4
-1.42 -0.22 0.03 0.07 0.05 -0.43 0.24 0.13 0.07 0.33 0.26 -0.1 -1.56 0.35 0.44 0.51 0.24 0.42 0.71 0.51 -6.55 -0.08 -0.82 0.09 -0.29 -0.28
-0.48 -0.23 -0.19 -0.22 -0.11 -0.11 0.03 0.08 0.23 0.21 0.16 0.01 -0.55 0.26 0.34 0.2 0.33 0.64 0.63 0.48 -3.22 -1.13 -0.42 -0.15 -0.07 0.13
-1.24 -0.59 -0.45 -0.45 -0.41 -0.29 -0.0 -0.2 0.05 0.06 -0.32 -0.49 -1.05 0.51 0.62 0.88 0.24 1.04 0.45 0.36 -1.47 -0.96 0.13 0.25 0.04 0.07
-2.5 -1.05 -0.52 -0.73 -0.15 0.38 0.45 -0.22 0.48 0.18 -0.24 -0.91 -2.04 0.92 0.65 0.73 -0.34 1.33 0.74 0.38 -2.29 -1.03 -0.4 -0.71 0.05 -0.02
-0.32 -0.65 -0.73 -0.25 0.11 0.24 0.23 0.15 -0.18 -0.12 -0.54 -0.71 -0.35 0.3 0.63 0.49 -0.04 1.06 0.86 0.29 -2.68 -1.12 -0.55 -0.63 0.19 0.4
-1.28 -0.56 -0.48 -0.32 0.11 0.33 0.22 -0.07 0.31 0.05 -0.33 -0.56 -1.56 0.72 0.28 0.38 0.34 0.86 0.72 0.01 -1.83 0.11 -0.11 -0.37 -0.17 0.01
-0.27 -0.0 0.03 -0.03 -0.04 -0.2 0.11 0.01 -0.04 0.08 -0.17 -0.17 -0.47 0.01 0.25 -0.14 0.14 0.95 0.66 0.38 -3.2 -1.07 -0.23 -0.24 0.18 0.36
-0.37 -0.12 -0.19 -0.14 -0.26 -0.06 -0.01 0.06 0.12 0.12 -0.02 -0.04 -0.34 0.18 0.16 0.13 -0.04 0.79 0.73 0.39 -2.77 -1.54 -0.32 0.04 -0.01 0.54
-2.57 -0.84 -0.32 -0.1 -0.12 -0.05 0.29 0.23 0.03 0.22 0.16 0.07 -2.62 0.28 0.4 0.3 0.26 1.18 0.63 0.18 -2.71 -1.04 -0.06 -0.21 0.08 0.4
-2.03 -0.41 -0.1 -0.26 0.04 0.04 0.31 0.18 0.29 0.28 -0.13 -0.29 -3.35 0.23 0.5 0.09 0.54 1.34 0.89 0.54 -4.01 -2.35 -1.15 -0.5 -0.04 0.27
-1.27 -0.45 -0.33 -0.33 -0.16 -0.4 -0.09 -0.31 -0.39 -0.09 -0.55 -0.61 -1.61 0.22 0.49 0.21 0.2 1.04 0.92 0.43 0.73 -1.3 -0.25 -0.3 -0.04 0.7
-0.26 -1.45 -1.76 -1.71 -0.99 -0.69 0.32 0.18 -0.08 0.45 0.26 0.05 -0.45 0.32 -0.12 0.05 0.35 0.81 0.58 0.17 -0.63 -0.95 0.52 0.29 0.51 0.4
-0.75 -1.43 -1.96 -1.54 -0.45 -0.01 0.59 0.17 0.17 0.45 0.0 -0.42 -0.94 0.2 -0.4 -0.35 0.37 0.7 0.65 0.46 -0.22 -0.25 0.51 0.41 -0.06 0.43
-0.61 -0.03 -0.12 -0.23 0.06 -0.01 0.29 -0.03 -0.1 0.02 -0.11 -0.22 -0.94 0.18 0.35 0.07 0.36 0.55 0.75 0.42 -2.07 -0.71 0.26 -0.17 -0.19 0.08
-1.01 -0.42 -0.35 -0.38 -0.4 -0.8 -0.09 -0.31 -0.59 -0.03 -0.4 -0.63 -1.33 0.4 0.46 0.51 0.75 1.06 0.88 0.77 -1.63 -0.81 0.16 -0.26 -0.03 0.51
-0.86 -0.21 -0.11 -0.08 0.18 0.22 0.36 0.16 0.1 0.17 -0.15 -0.47 -1.05 -0.11 0.26 -0.04 0.35 0.97 0.6 0.49 -1.77 -0.91 -0.35 -0.37 0.04 0.06
-0.75 -0.19 0.03 0.05 0.11 -0.14 -0.0 0.09 -0.02 0.23 0.14 0.08 -0.68 0.2 -0.0 0.48 0.06 0.54 0.56 0.47 -2.18 -0.67 -0.54 0.19 -0.21 0.08
-0.61 -0.3 -0.17 0.02 0.24 0.1 0.36 0.33 0.31 0.13 -0.06 -0.08 -0.45 0.27 0.26 0.27 0.24 0.54 0.37 0.36 -1.45 -1.5 0.08 -0.55 -0.36 -0.31
-1.28 -0.52 -0.25 -0.29 -0.2 -0.11 -0.18 -0.5 -0.51 -0.42 -0.59 -0.58 -1.36 0.73 0.12 0.38 0.12 0.28 0.36 0.17 0.41 -0.16 0.04 0.43 0.2 1.11
-0.13 -0.12 -0.25 -0.13 -0.12 0.05 0.33 0.32 0.18 0.18 -0.31 -0.24 -0.23 0.12 0.16 0.2 -0.0 0.8 0.54 0.33 -1.33 -0.9 -0.78 -0.4 -0.11 0.24
-1.11 -0.28 -0.31 -0.25 0.07 0.27 0.17 -0.19 -0.12 -0.01 -0.46 -0.39 -1.19 0.34 0.29 0.51 0.07 0.93 0.66 0.38 -1.87 -0.79 -0.38 -0.38 0.39 0.61
-1.62 -0.47 -0.21 -0.05 0.15 -0.02 0.18 -0.03 0.04 0.28 0.09 0.03 -1.85 0.28 0.4 0.07 0.11 0.62 0.68 0.37 -3.0 0.3 -0.47 -0.06 -0.07 0.28
-3.12 -0.73 -0.28 -0.19 0.27 0.33 0.33 0.1 0.09 0.18 -0.19 -0.53 -3.48 -0.41 0.07 -0.61 0.48 1.15 1.13 1.04 -2.44 -1.29 -0.45 -0.17 0.13 0.39
-1.65 -0.18 0.07 0.19 0.44 0.32 0.34 0.16 0.13 0.17 -0.1 -0.25 -2.29 -0.14 0.53 -0.3 0.29 1.15 0.96 0.58 -2.5 -2.16 -0.9 -0.57 -0.47 0.05
-1.84 -0.48 -0.21 -0.15 0.25 0.18 0.24 0.08 0.17 0.07 -0.03 -0.43 -1.97 0.31 0.46 0.22 0.01 1.02 0.67 0.13 -2.64 -0.78 0.29 -0.19 0.09 0.16
-2.09 -0.76 -0.52 -0.27 0.01 0.52 0.37 0.09 0.05 -0.33 -0.6 -0.82 -1.98 0.5 0.31 0.59 0.11 0.99 0.8 0.36 -1.67 -0.43 -0.13 0.12 -0.1 0.38
-0.44 -0.09 -0.23 -0.29 0.02 -0.12 0.14 -0.31 -0.19 0.07 -0.26 -0.51 -0.68 0.51 0.61 0.46 0.22 0.83 0.57 0.2 -1.89 -0.55 -0.27 -0.51 0.16 0.28
-1.1 -0.5 -0.42 -0.27 -0.0 0.39 0.49 0.25 0.19 0.07 -0.29 -0.5 -1.75 -0.07 0.43 -0.16 0.35 1.02 0.88 0.81 -2.5 -2.93 -0.37 -0.19 -0.23 0.49
-2.51 -0.79 -0.67 -0.58 -0.56 -0.45 -0.51 -0.87 -0.61 -0.91 -1.12 -1.07 -2.34 0.1 0.94 0.32 0.86 1.31 1.18 0.74 -0.76 -1.21 0.3 0.84 0.3 0.3
-1.68 -0.41 -0.23 -0.15 -0.03 0.01 0.11 -0.08 -0.18 -0.05 -0.3 -0.3 -2.04 0.24 0.42 0.11 0.31 0.68 0.85 0.5 -0.65 -0.55 0.27 -0.12 0.11 0.33
-1.86 -0.36 -0.18 -0.26 -0.27 -0.72 -0.02 -0.05 -0.31 -0.03 -0.14 -0.47 -1.98 0.39 0.6 0.28 0.63 0.99 0.86 0.72 -0.7 -0.9 -0.01 -0.24 -0.2 0.35
-0.44 -0.03 0.02 0.03 0.22 0.39 0.27 0.22 0.34 0.16 0.07 -0.06 -0.39 0.1 0.31 0.24 0.23 0.26 0.21 0.3 -1.08 -0.78 -0.32 -0.4 -0.46 -0.54
-0.83 -0.35 -0.03 0.11 -0.06 -0.6 -0.23 -0.4 -0.67 -0.37 -0.47 -0.47 -0.33 0.17 0.44 0.02 1.08 1.21 0.95 0.3 -1.6 -0.98 -0.26 -0.48 -0.08 0.37
-3.99 -0.72 -0.39 -0.31 0.21 0.49 0.29 0.35 0.39 0.01 -0.1 -0.35 -3.25 0.31 0.05 0.29 0.11 0.93 0.61 0.66 -4.12 -0.33 -0.77 0.17 0.18 0.36
-3.76 -1.45 -0.97 -0.49 -0.24 0.48 0.2 0.05 0.61 0.01 -0.04 -0.23 -3.49 0.99 0.47 0.57 -0.33 1.13 0.7 0.0 -2.02 -0.62 -0.19 0.31 -0.43 0.3
-1.81 -0.42 -0.2 -0.11 0.28 0.46 0.23 -0.1 0.22 0.37 0.21 0.06 -1.37 -0.41 0.06 -0.33 0.11 0.85 0.93 0.6 -5.9 -0.6 -0.33 -0.07 -0.23 0.33
-1.1 -0.33 -0.37 -0.41 0.09 0.04 -0.05 -0.18 -0.11 0.24 0.01 0.04 -1.3 0.73 0.5 0.44 0.24 0.57 0.72 0.62 -2.11 -2.51 -0.06 0.2 -0.28 0.15
-1.76 -1.35 -1.39 -1.91 -0.64 -0.87 -0.36 -0.9 -0.67 0.07 -0.48 -0.49 -2.43 0.02 0.07 0.53 0.24 1.06 1.02 0.07 -0.46 -0.84 1.35 0.54 0.67 1.1
-0.8 -0.21 -0.13 -0.18 0.19 -0.02 0.12 -0.07 -0.41 -0.12 -0.3 -0.67 -1.58 0.37 0.34 0.36 0.01 0.57 0.65 0.2 -0.39 0.33 -0.35 0.09 -0.47 0.59
-0.08 -0.46 -0.4 -0.18 -0.23 -0.2 0.14 0.06 -0.15 -0.07 -0.14 -0.1 -0.21 0.23 -0.14 0.19 -0.2 0.32 0.17 -0.17 -0.09 -0.07 -0.26 0.46 0.25 0.69
-1.58 -0.49 -0.08 0.17 0.28 0.18 0.12 -0.13 0.15 0.14 -0.08 -0.26 -2.07 0.16 0.4 -0.0 0.25 1.03 0.59 0.31 -3.37 -0.19 -0.86 0.02 0.11 0.33
-4.57 -4.02 -3.15 -1.03 -0.8 0.93 -0.77 0.2 -0.59 -0.1 -0.29 0.69 -2.85 -0.6 -0.85 0.29 0.07 0.8 1.2 0.08 -0.1 -3.59 1.78 0.65 -0.17 0.52
-0.68 -1.15 -1.08 -1.06 -0.29 -0.0 0.61 0.26 0.27 0.05 -0.26 -0.52 -0.69 0.42 0.51 0.16 0.42 1.13 0.85 0.27 -1.4 -0.82 0.07 -0.21 -0.49 0.07
-1.21 -0.75 -0.62 -0.22 -0.37 -0.08 0.33 0.27 0.25 -0.03 -0.54 -0.52 -1.19 0.39 0.29 0.47 -0.02 1.07 0.26 0.39 -1.43 -0.67 0.46 -0.2 0.37 0.32
-1.41 -0.63 -0.51 -0.53 -0.19 -0.46 0.07 -0.19 -0.03 0.26 -0.09 -0.29 -1.43 0.23 0.35 0.06 0.38 1.13 0.93 0.55 -1.23 -0.5 -0.09 0.1 -0.04 0.35
-1.3 -0.25 -0.0 -0.05 0.18 -0.13 0.26 0.18 0.03 0.18 -0.06 -0.32 -1.21 -0.19 0.24 -0.03 0.45 1.09 0.8 0.78 -2.88 -1.3 -0.26 -0.51 -0.09 0.07
-1.87 -1.57 -0.49 -0.2 -0.16 -0.13 0.0 -0.2 0.11 0.32 -0.22 -0.38 -1.61 0.53 0.18 0.4 0.73 0.88 0.92 0.94 -2.65 -1.51 -0.36 0.5 -0.64 0.38
-2.34 -1.22 -0.75 -0.43 0.06 0.11 0.26 -0.02 0.23 0.03 -0.36 -0.59 -2.39 0.91 0.42 0.82 0.52 1.28 0.53 0.44 -1.15 -1.24 -0.41 -0.51 -0.16 0.03
-2.39 -0.65 -0.13 -0.06 0.16 -0.05 0.21 0.11 0.24 0.21 0.19 0.27 -2.9 0.14 0.34 0.11 0.22 0.82 0.6 0.23 -2.36 -0.02 -0.13 -0.25 -0.01 0.24
-0.5 -0.03 0.0 -0.0 0.19 0.29 0.28 0.05 0.11 0.08 -0.09 -0.21 -0.67 0.04 -0.22 -0.13 -0.14 0.59 0.48 0.25 -1.98 -0.22 -0.4 -0.09 0.16 0.49
-1.34 -0.72 -0.45 -0.55 -0.29 0.02 -0.04 -0.19 -0.13 -0.2 -0.65 -0.73 -1.44 0.53 0.52 0.53 0.36 1.02 0.67 0.42 -0.33 -1.21 -0.37 0.43 0.34 0.42
-0.73 -0.74 -0.93 -0.95 -0.55 -0.48 0.52 0.39 0.26 0.37 0.03 -0.29 -0.71 0.22 0.44 0.26 0.38 0.85 0.71 0.62 -4.68 -1.16 -0.32 0.06 0.06 0.41
-0.47 -0.62 -1.08 -0.97 -0.37 -0.05 0.61 0.45 0.32 0.52 0.11 -0.11 -0.71 0.2 0.17 0.0 0.06 0.93 0.87 0.41 -4.48 -1.21 -0.74 -0.05 -0.04 0.4
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-0.97 -0.26 -0.41 0.01 0.45 0.26 0.3 0.12 -0.35 -0.31 -0.27 -0.58 -1.36 -0.1 0.15 0.09 0.24 0.46 0.89 0.83 -3.26 -0.2 -0.13 -0.25 0.12 0.52
-1.31 -1.13 -1.15 -0.98 -0.31 0.26 0.63 0.31 0.34 0.33 -0.2 -0.83 -1.51 0.21 0.35 -0.18 0.57 1.27 0.93 0.6 -2.5 -1.07 -0.5 -0.13 0.13 0.15
-1.31 -0.27 -0.1 0.08 0.35 0.42 0.21 0.12 -0.03 0.06 -0.19 -0.28 -1.28 0.13 0.26 0.21 -0.06 0.71 0.53 -0.02 -2.1 -0.13 -0.15 -0.35 0.14 0.46
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-1.24 -0.67 -0.43 -0.35 -0.33 0.16 -0.06 -0.27 -0.46 -0.54 -0.82 -0.81 -1.25 0.31 0.04 0.59 -0.03 1.25 1.02 0.1 -0.1 -0.12 -0.34 0.13 0.45 0.51
-0.31 0.01 0.08 -0.11 -0.05 -0.06 0.13 -0.07 0.04 0.25 0.19 -0.0 -0.52 0.3 0.23 -0.07 0.12 0.62 0.62 0.33 -2.91 -0.85 -0.55 -0.36 0.04 0.3
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-0.84 -0.47 -0.45 -0.42 -0.27 -0.5 -0.63 -0.27 -0.32 0.03 0.11 0.03 -0.73 0.24 0.09 0.37 -0.16 -0.02 0.15 -0.27 0.5 -1.14 -0.11 1.03 0.75 0.87
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-0.57 -0.86 -0.57 -0.6 -0.45 -0.16 -0.02 -0.16 -0.01 0.29 0.14 0.02 -0.47 0.91 0.51 0.42 -0.25 -0.4 -0.51 -0.03 0.34 -0.83 0.44 0.41 -0.09 0.59
-0.29 -0.19 -0.29 -0.4 -0.25 -0.57 0.16 -0.0 -0.18 -0.11 -0.34 -0.36 -0.27 0.24 0.27 0.35 0.41 1.03 0.59 0.36 -1.45 -0.71 0.03 -0.15 -0.01 0.24
-0.08 -0.34 -0.13 -0.09 -0.19 0.21 -0.13 -0.5 -0.36 -0.17 -0.51 -0.47 -0.18 -0.1 0.4 -0.13 0.0 0.72 1.03 0.41 0.08 -1.89 -0.47 -0.69 0.24 0.79
-1.17 -0.18 -0.17 -0.1 0.12 0.28 0.55 0.32 0.2 -0.05 -0.28 -0.29 -1.34 -0.32 0.28 -0.09 0.17 0.92 0.89 0.32 -2.54 -1.4 0.12 0.24 -0.05 -0.27
-0.54 -0.25 -0.09 0.02 0.25 0.26 0.34 0.09 -0.02 0.11 -0.02 -0.2 -0.88 0.34 0.24 0.1 0.13 0.42 0.28 0.28 -1.93 -0.69 -0.45 -0.11 0.02 0.5
-0.6 -0.4 -0.49 -0.71 -0.32 -0.18 0.05 -0.41 -0.36 -0.46 -0.54 -0.68 -0.71 0.43 0.47 0.87 0.01 0.82 0.94 0.32 -0.24 -0.02 -0.38 0.23 -0.12 0.23
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-2.37 -0.68 -0.75 -1.03 -0.57 -1.4 0.01 -0.76 -0.79 -0.43 -0.8 -0.63 -1.87 0.21 0.86 0.66 0.67 1.19 1.62 0.73 -1.02 -1.7 0.3 -0.29 0.09 0.63
-1.05 -0.9 -0.78 -0.96 -0.69 -0.59 -0.58 -1.0 -0.86 -0.5 -0.75 -0.72 -1.29 0.42 0.69 0.65 0.56 1.2 1.35 0.81 -1.88 -0.79 0.3 0.26 0.27 0.58
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-1.18 -0.74 -0.63 -0.84 0.04 0.38 0.35 -0.06 -0.09 -0.01 -0.47 -0.68 -1.32 0.06 0.3 0.14 0.47 0.96 1.05 0.62 -1.85 -1.42 0.2 -0.16 0.27 0.38
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-1.1 -0.19 -0.47 -0.2 0.05 0.54 0.3 -0.01 0.11 -0.04 -0.26 -0.29 -1.55 -0.0 -0.21 -0.13 -0.06 0.9 0.82 0.22 -1.89 -0.55 0.03 0.09 0.26 0.62
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.