Heatmap: Cluster_108 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
1.0 0.98 0.77 0.87 0.44 0.47 0.6 0.68 0.5 0.23 0.3 0.31 0.78 0.53 0.51 0.45 0.49 0.5 0.43 0.4 0.03 0.05 0.06 0.32 0.59 0.45
0.52 0.61 0.49 0.49 0.47 0.46 0.53 0.47 0.23 0.17 0.15 0.16 0.55 0.31 0.32 0.39 0.51 0.5 0.34 0.29 0.01 0.04 0.07 0.07 1.0 0.27
1.0 0.45 0.43 0.39 0.29 0.3 0.62 0.55 0.3 0.37 0.32 0.33 0.78 0.45 0.34 0.41 0.28 0.5 0.33 0.38 0.03 0.11 0.09 0.25 0.5 0.52
0.83 0.85 0.89 1.0 0.96 0.86 0.85 0.81 0.82 0.7 0.79 0.72 0.52 0.38 0.51 0.45 0.62 0.72 0.78 0.81 0.01 0.55 0.62 0.77 0.54 0.65
1.0 0.73 0.56 0.63 0.6 0.64 0.68 0.64 0.52 0.39 0.47 0.46 0.79 0.47 0.48 0.42 0.52 0.68 0.69 0.5 0.04 0.32 0.34 0.37 0.75 0.65
0.86 0.65 0.61 0.48 0.45 0.38 0.57 0.6 0.48 0.51 0.51 0.56 1.0 0.71 0.62 0.75 0.51 0.74 0.65 0.45 0.03 0.05 0.22 0.23 0.81 0.49
1.0 0.68 0.57 0.51 0.52 0.45 0.47 0.52 0.55 0.53 0.41 0.38 0.85 0.4 0.55 0.38 0.42 0.65 0.53 0.43 0.06 0.08 0.41 0.45 0.94 0.55
1.0 0.76 0.82 0.8 0.65 0.46 0.7 0.72 0.54 0.57 0.56 0.57 0.94 0.58 0.64 0.75 0.67 0.83 0.67 0.59 0.12 0.36 0.37 0.34 0.71 0.59
0.83 1.0 0.86 0.91 0.7 0.6 0.56 0.61 0.43 0.51 0.57 0.58 0.98 0.61 0.47 0.54 0.49 0.57 0.55 0.52 0.02 0.28 0.37 0.3 0.6 0.62
0.85 0.9 0.89 0.78 0.82 0.64 0.69 0.7 0.88 1.0 0.99 0.95 0.86 0.61 0.42 0.39 0.48 0.5 0.51 0.71 0.02 0.56 0.05 0.25 0.32 0.37
1.0 0.97 0.81 0.76 0.68 0.78 0.77 0.72 0.39 0.38 0.42 0.45 0.99 0.6 0.53 0.61 0.77 0.6 0.65 0.51 0.15 0.15 0.26 0.27 0.87 0.55
0.69 0.67 0.68 0.69 0.54 0.45 0.58 0.61 0.67 0.8 0.87 0.93 0.72 0.74 0.56 0.65 0.64 0.71 0.7 0.74 0.17 0.37 0.94 1.0 0.73 0.85
0.76 0.56 0.57 0.65 0.61 0.44 0.33 0.36 0.17 0.24 0.34 0.46 1.0 0.46 0.26 0.34 0.37 0.28 0.27 0.21 0.05 0.14 0.03 0.13 0.44 0.37
1.0 0.62 0.62 0.54 0.4 0.37 0.51 0.5 0.28 0.24 0.25 0.26 0.97 0.5 0.57 0.47 0.37 0.65 0.57 0.46 0.01 0.03 0.11 0.15 0.68 0.6
1.0 0.98 0.81 0.68 0.6 0.69 0.54 0.6 0.39 0.27 0.32 0.4 0.88 0.47 0.63 0.53 0.5 0.62 0.64 0.46 0.04 0.12 0.22 0.2 0.75 0.57
0.54 0.53 0.68 0.96 1.0 0.89 0.71 0.63 0.64 0.82 0.98 0.97 0.58 0.18 0.24 0.22 0.52 0.43 0.42 0.66 0.13 0.49 0.36 0.96 0.31 0.37
0.74 0.7 0.71 0.74 0.71 0.59 0.64 0.63 0.67 0.74 0.9 1.0 0.59 0.46 0.35 0.37 0.51 0.57 0.47 0.62 0.07 0.44 0.24 0.65 0.56 0.74
1.0 0.72 0.57 0.35 0.17 0.15 0.33 0.46 0.21 0.23 0.25 0.29 0.81 0.66 0.2 0.5 0.28 0.32 0.24 0.31 0.06 0.16 0.23 0.19 0.78 0.52
0.92 1.0 0.96 0.93 0.86 0.67 0.69 0.72 0.56 0.72 0.69 0.73 0.79 0.42 0.42 0.35 0.6 0.66 0.6 0.58 0.02 0.41 0.18 0.6 0.76 0.8
0.72 0.71 0.91 0.85 0.82 0.82 0.93 0.98 0.9 0.78 0.84 1.0 0.75 0.57 0.6 0.69 0.41 0.63 0.55 0.47 0.08 0.14 0.58 0.43 0.85 0.63
0.91 0.64 0.57 0.53 0.44 0.36 0.76 0.79 0.55 0.59 0.57 0.51 1.0 0.65 0.5 0.68 0.59 0.6 0.57 0.57 0.02 0.3 0.23 0.42 0.73 0.47
0.77 0.37 0.25 0.19 0.17 0.18 0.36 0.43 0.07 0.08 0.1 0.18 1.0 0.4 0.33 0.28 0.15 0.31 0.32 0.2 0.03 0.06 0.09 0.03 0.58 0.32
0.79 0.88 0.87 0.95 0.87 0.75 0.69 0.84 0.77 0.66 0.73 0.73 0.9 0.45 0.44 0.47 0.45 0.72 0.58 0.61 0.17 0.52 0.56 0.61 1.0 0.91
1.0 0.76 0.82 0.81 0.84 0.69 0.72 0.6 0.43 0.36 0.35 0.42 0.9 0.53 0.57 0.56 0.5 0.65 0.71 0.55 0.06 0.29 0.34 0.5 0.7 0.96
0.89 0.58 0.55 0.53 0.56 0.49 0.56 0.5 0.32 0.28 0.33 0.42 1.0 0.47 0.49 0.52 0.5 0.58 0.43 0.37 0.09 0.2 0.18 0.21 0.52 0.4
0.95 0.74 0.79 0.89 0.84 0.7 0.65 0.74 0.51 0.53 0.55 0.54 1.0 0.6 0.55 0.59 0.5 0.56 0.68 0.58 0.05 0.39 0.36 0.36 0.78 0.76
1.0 0.76 0.71 0.59 0.65 0.62 0.8 0.73 0.75 0.71 0.63 0.67 0.94 0.5 0.67 0.42 0.79 0.98 0.85 0.9 0.06 0.45 0.26 0.46 0.65 0.65
0.81 0.8 0.84 1.0 0.69 0.46 0.64 0.86 0.85 0.65 0.71 0.61 0.68 0.32 0.39 0.26 0.48 0.55 0.61 0.65 0.05 0.57 0.54 0.42 0.94 0.77
1.0 0.75 0.52 0.47 0.4 0.38 0.52 0.56 0.4 0.33 0.32 0.36 0.89 0.42 0.34 0.31 0.27 0.43 0.6 0.35 0.05 0.19 0.34 0.4 0.54 0.59
1.0 0.75 0.54 0.51 0.37 0.26 0.55 0.51 0.38 0.29 0.31 0.32 0.69 0.45 0.36 0.32 0.34 0.5 0.55 0.37 0.06 0.19 0.26 0.41 0.74 0.62
0.79 0.85 1.0 0.93 0.58 0.3 0.49 0.64 0.36 0.53 0.6 0.58 0.72 0.56 0.33 0.54 0.59 0.47 0.44 0.51 0.02 0.2 0.15 0.27 0.79 0.7
0.98 0.98 1.0 0.92 0.54 0.33 0.43 0.57 0.37 0.45 0.65 0.7 0.85 0.52 0.36 0.6 0.63 0.62 0.67 0.6 0.02 0.13 0.14 0.22 0.62 0.81
0.34 0.71 0.59 0.44 0.24 0.1 0.23 0.4 0.5 0.79 0.89 1.0 0.28 0.14 0.18 0.27 0.29 0.35 0.44 0.56 0.0 0.3 0.23 0.37 0.38 0.42
1.0 0.49 0.41 0.44 0.47 0.41 0.68 0.74 0.72 0.71 0.76 0.62 0.74 0.49 0.32 0.54 0.34 0.54 0.5 0.56 0.2 0.14 0.48 0.44 0.57 0.66
0.92 0.28 0.28 0.2 0.34 0.21 0.24 0.23 0.15 0.16 0.24 0.43 1.0 0.39 0.22 0.32 0.27 0.34 0.33 0.3 0.06 0.06 0.16 0.02 0.52 0.24
0.56 0.71 0.74 1.0 0.79 0.56 0.66 0.63 0.59 0.56 0.57 0.47 0.52 0.25 0.71 0.28 0.2 0.42 0.47 0.63 0.17 0.62 0.34 0.18 1.0 0.88
1.0 0.76 0.79 0.78 0.76 0.75 0.84 0.84 0.92 0.92 0.93 0.95 0.94 0.64 0.66 0.73 0.59 0.71 0.6 0.72 0.14 0.29 0.47 0.55 0.8 0.78
0.51 0.65 0.55 0.61 0.58 0.31 0.32 0.33 0.54 0.68 0.81 1.0 0.38 0.39 0.42 0.59 0.48 0.55 0.5 0.45 0.1 0.08 0.89 0.9 0.44 0.61
0.98 1.0 0.75 0.71 0.62 0.55 0.72 0.57 0.65 0.96 0.9 0.87 0.76 0.27 0.17 0.35 0.53 0.35 0.32 0.58 0.03 0.37 0.1 0.31 0.41 0.49
0.81 0.39 0.35 0.33 0.33 0.36 0.43 0.42 0.18 0.18 0.21 0.27 1.0 0.48 0.4 0.53 0.46 0.37 0.3 0.28 0.02 0.22 0.07 0.1 0.6 0.31
1.0 0.47 0.39 0.36 0.28 0.28 0.48 0.49 0.29 0.28 0.29 0.32 0.95 0.6 0.34 0.54 0.23 0.45 0.33 0.29 0.1 0.07 0.37 0.18 0.8 0.43
0.56 0.5 0.54 0.55 0.6 0.54 0.72 0.69 0.71 0.96 0.96 0.86 0.66 0.33 0.62 0.19 0.84 0.95 0.71 1.0 0.04 0.67 0.14 0.5 0.56 0.67
0.56 0.46 0.72 0.93 0.64 0.39 0.35 0.46 0.56 0.81 0.95 1.0 0.6 0.07 0.09 0.06 0.24 0.4 0.32 0.57 0.01 0.37 0.21 0.51 0.58 0.65
0.8 0.77 0.78 0.72 0.74 0.56 0.52 0.53 0.49 0.72 0.9 1.0 0.59 0.55 0.43 0.4 0.5 0.55 0.4 0.54 0.05 0.26 0.73 0.67 0.76 0.87
0.87 0.41 0.43 0.44 0.42 0.36 0.47 0.4 0.44 0.48 0.37 0.55 1.0 0.53 0.43 0.55 0.41 0.53 0.53 0.38 0.11 0.08 0.39 0.28 0.63 0.51
1.0 0.37 0.31 0.44 0.36 0.3 0.48 0.57 0.35 0.33 0.32 0.29 0.86 0.52 0.19 0.4 0.26 0.43 0.36 0.32 0.04 0.25 0.17 0.21 0.43 0.48
1.0 0.73 0.56 0.54 0.44 0.4 0.66 0.71 0.43 0.39 0.38 0.37 0.92 0.59 0.57 0.51 0.51 0.64 0.61 0.5 0.02 0.19 0.26 0.26 0.73 0.56
0.71 0.99 0.84 0.67 0.78 0.88 0.89 0.73 1.0 0.83 0.77 0.74 0.58 0.81 0.81 0.44 0.69 0.54 0.58 0.85 0.06 0.81 0.31 0.85 0.33 0.48
1.0 0.69 0.67 0.59 0.48 0.44 0.58 0.63 0.24 0.21 0.2 0.26 0.85 0.62 0.48 0.42 0.36 0.51 0.45 0.32 0.07 0.21 0.21 0.23 0.62 0.62
0.89 0.87 0.73 0.67 0.68 0.66 0.77 0.71 0.98 1.0 0.92 0.98 0.94 0.58 0.52 0.44 0.8 0.81 0.62 0.82 0.05 0.64 0.4 0.74 0.59 0.89
0.95 0.64 0.66 0.58 0.56 0.68 0.7 0.7 0.74 0.82 0.85 0.95 1.0 0.58 0.57 0.86 0.76 0.94 0.71 0.76 0.14 0.85 0.26 0.56 0.47 0.71
0.87 0.64 0.71 0.64 0.39 0.31 0.49 0.67 0.43 0.5 0.49 0.63 1.0 0.49 0.71 0.55 0.39 0.39 0.39 0.41 0.02 0.22 0.23 0.27 0.66 0.61
0.9 0.63 0.59 0.53 0.34 0.29 0.59 0.66 0.43 0.47 0.43 0.48 1.0 0.74 0.61 0.74 0.46 0.61 0.59 0.47 0.12 0.44 0.26 0.32 0.57 0.58
1.0 0.61 0.52 0.39 0.36 0.28 0.49 0.54 0.56 0.58 0.69 0.68 0.56 0.72 0.2 0.6 0.38 0.24 0.52 0.35 0.09 0.26 0.45 0.49 0.48 0.56
1.0 0.7 0.65 0.58 0.37 0.29 0.51 0.62 0.53 0.55 0.6 0.59 0.73 0.52 0.48 0.53 0.47 0.4 0.47 0.39 0.02 0.09 0.39 0.42 0.78 0.7
0.78 0.79 0.92 0.96 1.0 0.73 0.77 0.81 0.68 0.71 0.78 0.82 0.78 0.41 0.49 0.4 0.52 0.77 0.67 0.76 0.03 0.53 0.51 0.62 0.79 0.78

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)