Heatmap: Cluster_159 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.89 0.7 0.09 0.05 -0.04 -0.25 -0.29 -0.31 -0.07 0.06 0.33 0.43 0.3 -1.22 -0.98 -1.67 -0.44 0.08 -0.17 -0.08 -2.37 0.43 0.26 0.5 0.17 0.02
0.45 0.37 0.42 0.58 0.33 -0.06 0.1 0.37 -0.09 -0.3 -0.21 -0.04 0.4 -0.85 -0.8 -0.68 -0.72 -0.1 -0.55 -0.3 -0.55 -0.27 0.17 -0.2 0.56 0.31
0.42 0.64 0.54 0.45 0.06 -0.59 -1.06 -0.64 -0.66 -0.36 -0.2 0.06 0.06 -1.43 -1.22 -1.77 -0.28 -0.03 -0.12 0.14 -1.47 0.89 -0.06 0.51 0.94 0.72
0.49 0.03 -0.07 -0.3 -0.06 0.16 0.29 0.39 0.14 0.09 -0.07 -0.14 0.27 -0.87 -0.64 -0.83 -0.26 0.03 0.16 -0.11 -4.8 -0.03 -0.16 0.22 0.74 0.65
0.05 0.7 0.81 0.92 0.77 0.61 0.16 0.24 0.18 -0.45 -0.25 -0.69 -0.44 -0.67 -0.98 -1.3 -1.19 -0.17 0.17 0.22 -0.03 -1.27 -1.55 -0.72 0.11 0.61
0.28 0.36 0.41 0.21 0.01 -0.12 -0.22 0.03 -0.06 -0.24 -0.02 -0.05 -0.05 -0.36 -0.4 -0.17 -0.22 -0.08 -0.18 0.3 -0.62 0.31 -0.63 0.04 0.32 0.4
0.31 0.3 0.4 0.32 0.09 0.04 -0.0 0.21 0.24 -0.13 -0.06 0.03 0.13 -0.38 -0.49 -0.06 -0.36 -0.07 -0.21 0.21 -1.42 0.4 -0.79 -0.15 0.06 0.18
0.16 0.32 0.21 0.09 -0.04 -0.17 -0.23 -0.15 -0.07 -0.57 -0.38 -0.24 -0.11 -0.73 -0.48 -0.22 -0.3 -0.18 -0.02 -0.11 -1.58 0.91 0.27 0.66 0.49 0.52
0.87 0.97 0.87 0.59 0.17 -0.44 -0.52 -0.35 -0.23 -0.03 0.32 0.68 0.76 -0.64 -1.43 -0.82 -0.46 -0.88 -1.1 -0.3 -3.22 0.16 -1.23 0.46 0.16 -0.14
0.92 1.31 1.17 0.67 0.4 -0.72 -0.45 -0.8 -0.66 -0.77 -0.9 -0.21 -0.06 0.48 -0.6 -0.94 -0.7 -0.5 -0.07 -0.12 - -2.38 -1.33 0.12 0.14 1.27
0.42 0.74 0.44 0.24 -0.28 -0.7 -0.53 -0.24 -0.01 0.07 0.3 0.43 0.25 -0.27 -0.44 0.51 -0.25 -0.1 -0.13 -0.25 -1.71 0.3 -0.09 0.15 -0.29 -0.41
0.48 1.0 0.19 -0.12 -0.27 -0.46 -0.56 -0.62 -0.26 -0.13 -0.18 -0.35 -0.23 -1.02 -0.58 -1.38 -0.22 0.37 -0.0 -0.1 -1.84 1.16 0.76 0.25 0.55 -0.16
0.53 0.87 0.45 0.02 -0.61 -1.04 -0.78 -0.31 0.0 0.2 0.58 0.78 -0.08 -0.95 -0.77 -1.07 -0.25 -0.04 -0.38 -0.2 -1.32 0.5 0.12 0.86 -0.04 -0.35
0.31 0.21 0.11 0.19 0.19 -0.01 0.1 -0.08 -0.2 -0.27 -0.6 -0.17 0.24 0.06 -0.5 -0.01 -0.61 0.18 0.11 -0.33 -2.17 0.54 -0.41 0.43 0.31 0.47
0.59 0.28 0.39 0.65 0.44 0.1 -0.15 -0.16 -0.52 -0.59 -0.49 -0.18 0.8 -0.39 -0.55 -0.41 -0.47 -0.52 -0.77 -0.42 -0.44 -0.19 -0.02 -0.82 1.02 0.42
0.35 0.12 0.22 0.23 0.1 -0.41 -0.05 0.09 -0.35 0.09 0.02 0.06 0.29 -0.51 -0.78 -0.46 -0.13 0.28 0.37 0.11 -3.25 0.66 -0.92 0.19 0.08 0.48
0.48 0.32 0.41 0.3 0.08 -0.14 -0.44 -0.45 -0.99 -0.69 -0.46 -0.0 0.49 -0.19 -0.14 -0.09 0.11 0.3 0.29 -0.18 -1.81 0.23 -0.9 -0.16 0.7 0.54
1.15 0.58 0.83 0.76 -0.22 -0.76 -0.17 0.48 -0.56 -0.6 -0.42 -0.22 1.09 -1.06 -1.08 -1.21 -1.19 -1.1 -1.12 -0.51 0.29 -1.09 -0.37 -0.4 0.57 0.9
0.42 0.26 0.09 0.18 0.11 -0.19 0.02 0.28 -0.3 0.1 0.2 0.22 0.1 0.11 -0.19 -1.04 -0.16 0.18 0.74 -0.01 -3.1 0.16 -0.96 -0.35 -0.25 0.38
0.3 -0.06 -0.14 0.06 0.27 -0.36 0.06 -0.05 -0.44 -0.01 -0.27 -0.07 0.14 0.36 -0.51 -0.43 -0.22 0.52 0.6 0.16 -2.33 -0.15 -0.95 0.48 0.17 0.53
0.74 0.34 0.24 0.19 -0.32 -0.02 0.01 0.13 -0.09 -0.45 -0.39 -0.25 0.16 -0.52 -0.55 -0.59 -0.27 0.28 0.21 -0.22 -3.13 0.34 -0.04 0.22 0.46 0.56
0.8 0.33 -0.32 -0.48 -0.81 -0.75 -0.34 0.18 0.17 0.26 0.38 0.36 0.43 -1.92 -0.37 -1.79 -0.22 -0.01 0.1 -0.11 -4.14 0.98 -0.48 0.21 0.71 0.5
0.4 0.24 0.41 0.53 0.18 -0.28 -0.8 -0.48 -0.81 -1.01 -0.96 -0.4 0.25 -0.38 0.63 -0.41 -0.65 -0.32 -0.56 -0.65 -1.16 0.84 0.23 0.05 0.69 1.04
0.69 0.71 0.67 0.49 0.34 -0.09 -0.74 -0.78 -0.56 -0.24 0.24 0.67 0.65 -0.8 -0.73 -1.27 -0.06 -0.43 -0.41 -0.04 -2.5 0.68 -0.67 0.54 -0.36 -0.26
-0.1 0.53 0.54 0.38 0.29 0.07 -0.25 -0.17 0.02 -0.12 -0.39 -0.38 -0.23 -0.37 -0.26 -0.14 -0.05 0.06 0.15 0.37 -0.21 0.43 -0.56 -0.93 0.23 0.04
0.33 -0.05 -0.12 -0.34 -0.15 -0.22 -0.83 -0.63 -1.35 -0.64 -0.94 -0.68 -0.22 0.16 -1.07 -1.93 -0.61 0.65 0.45 -0.52 -1.9 1.04 0.06 0.99 0.93 1.41
0.57 0.8 0.34 0.09 -0.44 -1.18 -0.65 -0.22 -0.2 0.07 0.19 0.34 0.0 -0.38 -0.83 -0.76 -0.12 0.32 0.12 0.06 -3.82 0.84 -0.89 0.33 0.33 0.39
0.97 0.5 0.71 0.89 0.44 -0.17 0.15 0.43 -1.76 -1.4 -1.2 -0.8 1.07 -0.02 -0.73 -0.03 -0.92 -0.51 -0.98 -0.42 -0.22 -1.25 -0.84 -1.38 0.82 0.69
0.61 -0.18 0.11 0.19 -0.06 -0.41 -0.04 0.07 -0.15 -0.04 -0.05 0.2 0.52 -0.21 -0.38 -0.34 -0.17 0.11 -0.64 -0.05 -0.18 -0.46 -0.39 -0.27 0.55 0.63
0.15 0.47 0.48 0.27 0.04 -0.12 0.0 0.1 0.09 -0.3 -0.48 -0.54 -0.11 -0.29 -0.13 -0.14 -0.01 -0.06 -0.09 0.46 -0.47 0.53 -1.04 -0.51 0.3 0.25
0.92 0.6 0.63 0.44 -0.57 -1.18 0.0 0.44 -0.72 -0.59 -0.48 -0.4 0.77 0.09 -1.6 -0.24 -0.65 -0.1 -1.03 -0.4 0.11 -0.67 -0.57 -0.47 0.87 0.85
0.96 0.69 0.73 0.44 -0.52 -1.04 0.01 0.36 -0.62 -0.65 -0.58 -0.41 0.77 -0.01 -1.5 -0.33 -0.73 -0.34 -0.83 -0.42 0.01 -0.94 -0.7 -0.52 0.85 1.03
1.0 0.8 0.71 0.49 -0.45 -0.59 0.01 0.37 -0.55 -0.63 -0.62 -0.46 0.75 -0.1 -1.52 -0.51 -0.9 -0.35 -0.71 -0.37 -0.1 -0.83 -0.67 -0.69 0.83 0.96
0.42 0.46 0.49 0.44 0.25 -0.04 -0.22 0.1 0.14 -0.53 -0.35 -0.23 0.2 -0.48 -0.41 -0.2 -0.27 -0.02 -0.21 0.2 -0.8 0.48 -1.18 -0.49 0.34 0.37
0.3 0.54 0.53 0.37 0.22 0.08 -0.33 -0.21 -0.17 -0.48 -0.34 -0.09 0.31 0.07 -0.78 0.57 0.06 -0.77 -0.69 -0.05 -0.41 0.0 -0.65 -0.28 0.67 -0.02
0.17 0.58 0.44 0.32 0.12 -0.06 -0.12 0.0 0.09 -0.24 -0.39 -0.22 0.06 -0.47 -0.29 -0.11 -0.21 0.33 0.04 0.23 -2.17 0.29 -1.01 -0.41 0.41 0.51
0.55 0.34 0.4 0.76 0.2 -0.58 -0.17 0.13 -0.61 -0.36 -0.25 -0.25 0.21 -0.56 -1.26 -0.72 -0.51 0.1 0.01 0.46 -1.98 0.49 0.08 -0.3 0.51 0.46
0.98 0.77 0.43 -0.13 -0.02 -0.24 -0.32 0.03 -0.14 -0.06 0.39 0.28 0.4 -0.98 -1.16 -1.6 -0.16 -0.54 -0.5 0.28 -0.22 0.09 -0.25 0.57 -0.54 -0.08
0.35 0.06 0.13 -0.01 -0.15 -0.04 -0.01 -0.03 -0.32 -0.26 -0.19 -0.12 0.3 -0.21 -0.16 -0.48 -0.52 -0.4 -0.08 -0.35 -2.27 0.61 0.23 0.34 0.82 0.58
1.17 0.37 0.51 0.55 -0.04 -0.91 -0.59 0.21 -0.72 -1.14 -0.7 -0.62 0.83 -0.94 -0.61 -0.78 -1.35 -0.57 -0.96 -0.64 -0.1 -0.42 0.8 -0.67 1.15 0.92
0.34 0.2 -0.07 -0.21 -0.56 -0.03 -0.39 -0.42 -0.4 -0.73 -1.06 -0.95 0.51 0.29 -0.28 0.08 -1.03 -0.06 0.07 -0.91 -2.03 0.28 0.65 -0.21 1.53 0.92
1.69 1.35 1.31 -0.1 -2.58 -4.37 -4.23 -1.95 -2.32 -2.63 -1.08 -0.91 0.93 0.85 -1.05 0.48 -0.33 -1.07 -0.86 -1.77 -0.19 -1.35 -2.53 -2.27 1.39 1.57
0.13 0.58 0.64 0.72 0.56 0.09 -0.13 -0.16 -0.24 -0.19 -0.2 -0.06 -0.09 -1.76 -1.21 -1.27 -0.41 0.56 -0.25 0.26 -1.9 0.45 0.15 0.13 0.05 0.1
0.81 0.98 0.43 0.24 -0.06 -0.42 -0.27 -0.2 -0.14 -0.04 0.28 0.38 0.35 -0.98 -0.6 -1.36 -0.39 -0.33 -0.44 -0.11 -3.26 0.73 -0.61 0.29 0.34 -0.06
0.58 0.51 0.82 0.47 0.14 -0.55 -0.66 -0.26 -0.84 -0.95 -0.62 -0.25 0.08 -0.68 -0.92 -0.57 -0.41 0.0 -0.14 0.39 -2.51 0.76 -0.94 -0.08 1.04 0.89
1.22 0.77 0.57 0.23 -0.55 -0.86 -0.21 0.24 -0.84 -0.73 -0.43 -0.23 0.94 -0.99 -1.31 -1.08 -0.82 -0.96 -0.86 -0.62 0.29 -0.92 0.08 -0.01 1.15 0.75
0.14 0.22 0.41 0.46 0.63 -0.11 -0.7 -0.84 -1.55 -0.8 -0.55 -0.13 -0.01 -0.49 -1.04 -0.45 0.03 -0.02 -0.45 -0.0 -0.24 0.68 -0.43 0.42 0.81 0.95
0.15 0.29 0.23 0.07 -0.06 0.08 -0.02 -0.08 0.13 -0.47 -0.23 -0.19 -0.35 -0.27 -0.07 -0.31 -0.09 0.2 0.12 -0.03 -1.25 0.15 -0.37 0.23 0.74 0.35
0.48 0.88 0.3 0.26 0.15 0.28 0.03 0.42 0.17 -1.1 -1.11 -1.16 -0.03 -0.52 -0.43 -0.75 -0.49 0.16 0.56 0.51 -2.3 0.54 -2.05 -1.77 0.76 0.61
-0.07 -0.22 0.11 0.37 0.26 -0.26 0.0 0.06 -0.03 -0.05 -0.07 -0.13 -0.11 0.53 -0.58 0.09 -0.28 0.44 0.08 0.1 -1.55 -0.08 -1.21 -0.65 0.4 0.87
0.06 0.3 0.43 0.53 0.18 -0.13 -0.04 0.09 0.07 -0.12 -0.17 -0.13 -0.26 -0.69 -0.85 -0.67 -0.49 0.07 0.0 0.33 -2.79 0.46 0.13 0.21 0.58 0.2
0.62 0.9 0.68 0.47 0.29 -0.37 -0.56 -0.83 -1.28 -0.59 -0.31 -0.17 0.04 -0.38 -0.8 -1.12 -0.08 -0.25 -0.28 0.74 -0.95 -0.35 -0.45 0.36 0.38 0.88
0.03 0.49 0.43 0.3 -0.27 -0.81 -0.39 -0.38 -0.27 -0.02 -0.04 0.09 -0.06 -0.32 -0.26 -0.33 -0.26 -0.14 -0.13 -0.03 -0.44 0.53 0.07 0.2 0.4 0.57
0.59 0.28 0.85 1.24 0.24 -1.2 0.08 0.9 -1.82 -2.27 -1.42 -0.94 0.47 -0.02 -1.11 -0.74 -1.34 -1.05 -1.97 -0.66 -0.19 -1.41 -1.33 -1.84 1.55 1.65
0.8 0.47 0.56 0.46 -0.32 -1.15 -0.45 0.1 -0.64 -0.39 -0.18 -0.02 0.45 -1.09 -1.53 -1.7 -0.82 0.0 -0.11 -0.17 -0.43 0.09 0.34 -0.17 0.92 0.96
0.26 0.18 0.35 0.17 0.12 -0.05 0.03 0.03 -0.25 -0.18 -0.38 -0.14 0.3 -0.25 -0.63 -0.58 -0.4 0.04 0.28 0.13 -4.16 0.54 -0.27 -0.3 0.44 0.84
0.82 1.06 0.38 0.03 -0.38 -0.16 -0.53 -0.55 -0.88 -0.81 -0.81 -0.57 0.57 -0.49 -0.88 -0.28 -0.64 0.07 -0.04 -0.46 -0.04 0.45 0.3 0.21 0.84 -0.09
1.03 1.43 0.88 0.74 0.01 -1.62 -1.97 -0.82 -1.38 -0.39 0.83 1.38 0.78 -2.32 -3.5 -3.69 -1.51 -0.2 -0.59 0.2 -4.21 -0.52 -1.31 0.59 0.01 0.38
1.23 1.14 0.9 0.31 -0.86 -1.86 -1.24 -0.48 -0.99 -1.33 -1.11 -0.74 0.9 -0.74 -0.11 -0.61 -0.34 -0.28 -0.3 -0.23 0.11 -0.47 -0.03 -0.86 1.22 0.54
0.16 -0.1 0.16 0.35 0.23 0.2 0.18 0.12 -0.32 -0.21 -0.27 -0.58 0.04 0.25 -0.01 -0.05 -0.27 0.36 0.19 0.09 -3.57 -0.23 -2.19 -0.23 0.48 0.98
-0.09 -0.28 -0.3 -0.31 -0.38 -0.11 0.05 -0.18 -0.1 -0.15 -0.39 -0.28 -0.14 -0.52 -0.28 -0.16 -0.17 0.36 0.18 -0.03 -1.52 0.82 0.35 1.0 0.46 0.27
0.83 0.4 0.82 0.82 -0.88 -1.33 -0.7 0.49 -1.67 -1.78 -1.32 -0.81 0.3 -1.18 -1.73 -1.35 -1.66 -0.16 -1.02 -0.29 0.45 0.76 -1.57 -0.74 1.72 1.41
0.18 0.26 0.35 0.32 0.28 0.27 -0.18 -0.11 -0.05 -0.24 -0.25 -0.01 0.03 -0.5 -0.14 -0.26 -0.12 -0.36 -0.06 0.3 -0.96 0.19 -0.08 -0.07 0.13 0.34
0.5 0.27 0.21 0.1 -0.08 -0.06 -0.19 -0.1 -0.22 -0.18 -0.2 -0.09 0.46 0.12 -0.5 -0.18 -0.31 0.48 0.15 0.13 -3.01 -0.15 -0.98 -0.44 0.55 0.77
1.0 0.98 0.99 0.65 0.0 -0.58 -0.54 0.32 -0.16 -0.94 -0.59 -0.44 0.59 -1.67 -0.84 -1.29 -0.6 -0.39 -0.5 -0.07 -0.2 -1.26 -0.39 -0.95 1.29 0.23
-0.14 0.12 0.16 0.62 0.19 -0.46 -0.58 -0.32 0.0 -0.23 0.2 0.18 -0.09 0.02 -0.49 -1.08 -0.85 0.39 -0.15 -0.28 -2.12 1.23 -0.83 0.12 0.66 0.43
0.35 0.71 0.69 0.26 -0.3 -0.62 -1.45 -0.86 -0.49 -0.36 -0.02 0.25 -0.1 -0.51 -0.17 -0.18 -0.13 -1.0 -0.19 0.2 -0.55 1.02 -0.01 0.55 0.08 0.22
0.53 0.24 0.27 0.47 0.27 0.13 0.07 0.11 -0.23 -0.44 -0.3 -0.45 0.32 -0.48 -0.49 -0.25 -0.46 0.35 0.42 -0.45 -3.59 0.71 -0.5 -0.56 0.25 0.41

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.