Heatmap: Cluster_139 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
- -0.32 -0.12 1.3 1.11 0.8 0.32 0.36 1.06 1.19 1.41 1.16 -2.81 -2.08 -3.11 -2.19 -1.4 -0.16 -0.8 -2.23 -4.43 -3.82 -1.59 -1.03 0.91 -0.87
0.25 0.02 0.04 0.53 0.92 0.53 0.68 0.79 0.82 0.69 0.55 0.44 0.02 -1.06 -0.41 -0.9 -0.68 -0.0 0.03 -0.35 -6.27 -2.33 -1.22 -1.2 -0.69 -0.83
-0.62 -0.86 -0.12 -0.03 0.16 0.34 0.66 0.74 0.64 0.71 0.62 0.72 -0.25 -1.07 -0.92 -0.86 -0.69 0.23 0.01 0.06 -6.71 -2.08 0.4 -0.11 0.45 -0.33
-1.23 -0.74 -0.65 -0.0 0.27 0.3 0.74 0.65 1.06 0.67 0.56 0.21 -1.14 -0.51 -0.62 0.36 -0.66 0.31 0.11 -0.28 -2.76 0.37 -0.59 -0.95 -0.02 -0.19
-0.9 0.46 0.74 1.3 1.32 1.16 0.75 0.82 -0.59 -0.1 -0.17 -0.07 -0.99 -1.23 -1.13 -0.92 -0.31 -0.11 -0.37 0.33 -7.51 -2.04 -5.11 -3.17 0.02 0.33
-1.4 -0.08 0.31 0.46 0.7 0.57 0.9 1.02 0.82 1.04 1.04 0.98 -1.24 -1.43 -0.95 -1.28 -0.78 0.26 -0.24 -0.27 -3.01 -1.89 -2.4 -1.05 -1.16 -0.98
-0.98 -0.3 -0.02 0.53 0.74 0.49 0.54 0.7 0.81 0.59 0.53 0.28 -1.57 -1.16 -0.68 -0.78 -0.26 0.16 0.06 0.02 -3.5 0.18 -0.55 -0.91 0.22 -0.76
-2.44 -0.1 -0.03 0.76 1.12 1.12 1.18 0.87 0.71 0.5 0.17 -0.16 -3.06 -1.46 -0.4 -0.78 -1.24 0.01 -0.11 -0.31 -4.14 -0.44 -0.77 -0.09 -0.3 -0.8
-0.19 0.17 0.32 0.34 0.36 0.18 0.33 0.5 0.8 0.59 0.61 0.18 -0.5 -0.57 -0.36 -0.43 -0.26 0.1 -0.13 -0.2 -4.1 -1.96 -0.36 -0.2 0.28 -0.44
-3.8 -0.94 -0.26 0.4 0.6 0.39 0.62 0.69 0.86 0.65 0.82 0.51 -3.13 -0.12 -0.62 -0.55 -0.42 0.1 -0.18 -0.27 -0.95 0.05 -0.86 -0.89 0.3 -0.11
-2.95 -1.68 -0.61 0.27 0.95 0.76 1.03 0.9 1.32 1.05 1.18 0.54 -3.27 -2.04 -1.12 -1.92 -0.94 -0.09 -0.01 -0.06 -5.7 -0.78 -1.06 -0.1 -0.5 -0.59
-0.55 0.33 0.58 0.8 0.81 0.6 0.7 0.78 0.76 0.52 0.93 0.77 -0.66 -0.58 -0.65 -0.78 -0.83 -0.62 -0.43 -0.61 -6.7 -2.23 -0.54 -1.47 -0.91 -0.89
-1.12 -0.21 -0.21 0.46 0.58 0.24 0.82 0.81 0.96 0.61 0.89 0.53 -1.66 -0.53 -0.64 -0.3 -0.86 0.11 -0.21 -0.66 -3.13 -0.62 -0.62 -0.29 -0.07 -0.5
-1.78 -0.78 0.02 0.31 0.75 0.63 0.86 0.63 0.9 0.9 0.69 0.45 -2.13 -0.33 -0.45 -0.19 -0.84 -0.2 -0.65 -0.48 -1.78 -1.67 -0.2 -0.47 0.2 -0.32
-0.08 -0.44 -0.31 0.4 0.55 0.44 0.81 0.69 0.84 0.61 0.52 0.15 -0.1 -0.78 -0.42 -0.39 -0.24 -0.12 -0.27 -0.37 -2.43 -1.18 -0.3 -0.18 -0.33 -0.67
-0.48 -0.19 0.12 0.54 0.55 0.46 0.55 0.46 0.7 0.61 0.68 0.73 -0.32 -0.5 -0.56 -0.27 -1.05 0.15 -0.43 -0.64 -2.72 -1.17 -0.44 -0.63 -0.14 -0.18
-3.74 -0.77 0.0 0.65 1.1 1.08 0.79 0.63 1.21 1.08 0.76 0.6 -2.07 -0.92 -1.6 -0.79 -0.96 -0.47 -0.07 -0.78 -1.58 -2.14 -0.55 -0.47 -0.62 -0.91
-2.41 -1.01 -0.1 1.59 1.3 0.79 0.62 1.3 1.66 0.56 1.46 0.31 -3.71 - -1.19 -2.62 -3.01 -0.74 -2.19 -0.72 -1.91 - -1.98 -0.81 -0.04 -1.82
0.13 -0.08 -0.19 0.42 0.48 0.29 0.47 0.56 0.13 0.22 0.28 0.02 0.34 -0.02 -0.3 -0.07 -0.42 -0.03 -0.63 -0.48 -2.61 0.69 -0.89 -0.6 -0.07 -0.42
-1.56 -0.01 0.12 0.65 0.75 -0.17 0.48 0.48 0.36 0.74 0.53 0.04 -2.2 -1.39 -0.95 -1.3 -2.03 0.37 -0.25 -1.35 -6.39 0.52 0.23 0.38 1.11 -0.27
-0.1 0.37 0.44 0.56 0.57 0.4 0.16 0.3 0.44 0.57 0.46 0.31 -0.29 -0.67 -0.85 -1.19 -0.5 -0.19 -0.07 0.08 -2.65 -0.04 -0.2 -0.85 -0.08 -0.33
-0.72 0.48 0.45 0.71 0.54 0.43 0.35 0.53 0.49 0.58 0.6 0.51 -0.98 -0.67 -0.42 -0.47 -0.5 -0.19 -0.31 -0.89 -3.71 -3.06 -0.91 0.32 0.36 -0.23
-0.19 -0.45 -0.32 0.01 0.23 0.12 0.49 0.47 0.51 0.61 0.52 0.28 0.18 -0.04 -0.11 0.13 -0.42 -0.42 -0.33 -0.31 -2.57 0.65 -0.87 -0.63 0.03 -0.38
-0.08 0.09 0.15 0.52 0.69 0.94 0.45 0.49 0.42 0.56 0.37 0.65 -0.49 -0.73 -1.11 -0.8 -0.19 0.14 0.29 0.12 -6.01 -0.73 -0.63 -1.5 -0.76 -0.68
-0.48 0.35 0.34 0.55 0.74 0.14 0.42 0.44 0.34 0.69 0.68 0.39 -1.16 -1.41 -1.42 -1.94 -1.11 -0.14 -1.03 -0.92 -3.88 0.7 0.29 -0.01 0.35 -0.02
-2.08 -0.59 -0.39 0.36 0.71 0.09 0.66 0.52 0.84 0.6 0.75 0.34 -1.91 -1.54 -1.51 -0.77 -0.81 0.16 -0.04 -0.72 -3.02 1.2 0.5 -0.96 0.29 -0.53
-2.39 -0.92 0.08 1.04 1.57 1.78 1.5 1.34 0.87 0.53 0.28 -0.59 -2.37 -3.29 -1.59 -3.22 -0.85 -0.6 -0.5 0.16 -8.19 -2.96 -3.29 -2.35 -0.7 -1.21
-3.38 -1.83 0.05 0.45 0.93 1.15 1.09 0.79 1.14 1.0 0.67 0.1 -2.33 -2.93 -0.67 -2.2 -0.51 0.16 -0.05 0.08 -10.58 0.81 -2.01 -1.52 -0.67 -1.45
-1.58 -0.8 -0.42 0.35 0.7 0.76 0.73 0.82 0.95 0.8 0.54 0.16 -1.65 -0.84 -0.88 -0.26 -0.74 -0.56 -0.29 -0.49 -3.15 0.49 -0.29 -0.24 0.02 -0.24
-0.11 -0.02 -0.57 0.52 0.87 1.0 1.14 0.94 0.72 0.39 0.12 -0.13 -0.51 -1.12 -1.32 -1.07 -0.66 -0.05 -0.06 -0.64 -3.24 -1.46 -0.73 -1.15 0.63 -0.38
-1.6 -1.3 -0.2 0.82 1.0 0.86 1.11 0.99 0.82 1.13 1.3 1.19 -1.26 -2.09 -1.42 -2.65 -1.82 -0.34 -0.41 -0.76 -8.39 -2.61 -1.49 -0.96 -0.3 -0.97
-0.01 0.36 0.24 0.95 0.99 0.48 0.35 0.62 0.6 0.26 0.72 0.8 -0.16 -1.06 -1.59 -1.13 -1.49 -0.72 -1.28 -1.2 -7.66 -2.01 -0.33 0.1 0.24 0.07
-0.84 -0.25 -0.3 -0.05 0.4 0.59 0.61 0.52 0.77 0.64 0.48 0.49 -0.75 -0.75 -0.28 -0.54 -0.41 0.04 -0.03 -0.05 -3.78 -0.54 0.3 -0.3 0.0 -0.43
-0.26 -0.17 -0.28 0.15 0.56 0.46 0.68 0.61 0.79 0.39 0.51 0.18 -0.54 -0.69 -0.7 -0.85 -0.56 0.26 0.16 -0.2 -4.33 -0.55 0.05 -0.78 0.48 -0.58
-0.14 0.25 -0.05 0.68 0.5 -0.27 0.54 0.63 0.62 0.45 0.9 0.4 -0.5 -1.64 -1.89 -1.91 -1.45 0.21 -0.56 -0.8 -4.97 0.73 -0.2 -0.11 0.21 -0.0
-0.08 -0.24 -0.13 0.37 0.55 0.22 0.65 0.63 0.71 0.59 0.62 0.39 -0.2 -0.81 -0.83 -0.61 -0.4 0.08 -0.09 0.1 -5.6 -1.27 -0.82 -0.7 0.36 -0.17
-0.79 -0.81 -0.2 0.53 0.85 0.68 0.96 0.82 0.95 1.1 0.87 0.51 -0.51 -0.64 -1.14 -0.52 -0.73 0.05 -0.63 -0.36 -3.11 -1.37 -1.11 -1.38 -0.47 -1.13
-1.61 0.01 0.28 1.11 1.0 1.01 0.91 0.67 0.99 0.79 0.47 0.29 -3.64 -2.32 -1.49 -2.75 -0.45 0.13 0.09 0.12 -3.13 -3.24 -0.19 -1.68 -0.89 -0.4
0.12 -0.05 0.07 0.32 0.5 0.38 0.57 0.56 0.42 0.24 0.13 -0.04 0.21 0.11 -0.4 0.09 -0.39 -0.55 -0.56 -0.5 -2.93 0.5 -0.5 -0.65 -0.29 -0.3
0.03 0.35 0.26 0.51 0.52 0.23 0.77 0.44 -0.01 0.08 -0.18 -0.18 -0.22 0.24 -0.39 0.3 -0.32 -0.36 -0.06 -0.64 -2.0 0.6 -0.65 -1.29 -0.1 -0.63
-2.0 0.04 0.45 0.73 0.85 0.6 0.77 0.79 0.52 0.57 0.4 0.09 -1.98 -0.12 -0.47 0.08 -0.62 -0.56 -0.64 -0.39 -4.74 0.62 -2.05 -0.16 -0.8 -0.56
-2.07 -0.43 -0.48 -0.25 -0.05 0.62 0.78 0.44 0.7 1.21 1.08 0.88 -2.18 -1.17 -0.78 -1.64 -0.72 0.84 -0.07 0.05 -4.38 -1.83 -0.02 -1.51 0.41 0.04
-0.43 -0.69 -0.44 0.01 0.34 0.48 0.78 0.74 0.6 0.68 0.4 0.14 -0.77 0.11 0.04 0.16 -0.35 -0.18 -0.21 -0.13 -2.16 -0.74 -0.36 -1.05 0.1 -0.16
-0.63 0.11 0.01 0.36 0.58 0.53 0.63 0.76 1.09 0.89 0.81 0.76 -1.59 -0.46 -1.35 -0.27 -1.04 -0.74 -0.73 -0.95 -7.93 -0.34 -1.41 -0.95 0.25 0.0
-1.27 0.5 -0.2 1.0 0.87 0.13 0.72 0.97 0.72 0.51 0.63 -0.25 -1.53 -1.43 -0.92 -1.29 -0.56 0.34 0.12 -0.53 -8.75 -0.95 -0.3 -1.56 0.72 -0.68
-0.11 0.52 0.21 1.07 0.85 0.42 0.1 0.13 0.06 0.19 0.54 0.69 0.28 -1.59 -1.08 0.4 -1.01 -0.14 -0.42 -0.82 -3.27 0.0 -1.44 -2.15 0.23 -0.12
-0.11 0.02 -0.1 0.12 0.34 0.39 0.54 0.65 0.75 0.57 0.64 0.53 0.01 -0.22 -0.36 -0.62 -0.48 -0.18 -0.13 -0.41 -3.46 -0.58 -1.43 -0.68 -0.07 -0.0
-0.36 0.27 -0.41 0.66 0.97 0.37 0.39 0.48 0.68 0.53 0.54 0.21 -1.0 -1.67 -1.23 -1.0 -0.26 0.37 0.21 0.08 -1.94 -1.41 -0.82 -0.92 0.47 -0.19
-0.89 -0.24 -0.24 0.25 0.41 0.5 0.48 0.81 0.81 0.58 0.72 0.36 -1.35 -1.03 -0.45 -0.6 -0.37 0.19 0.03 -0.19 -4.76 -0.93 0.29 -0.52 0.23 -0.39
-0.17 -0.52 -0.4 0.06 0.36 0.49 0.84 0.69 0.69 0.62 0.69 0.07 -0.21 -0.39 -0.18 -0.23 -0.81 0.34 -0.34 -0.22 -3.03 0.23 -1.52 -0.9 -0.09 -0.42
-1.15 -0.52 -0.26 0.01 0.8 0.66 0.71 0.42 0.93 0.97 1.05 0.53 -1.44 0.39 -0.28 -0.28 -0.26 -0.9 -0.26 -0.11 -4.83 -0.91 -0.99 -2.38 -0.17 -0.44
-1.74 0.21 0.37 0.8 1.21 1.2 0.91 0.78 0.53 0.43 0.27 -0.27 -2.41 -1.82 -0.95 -1.65 -0.37 0.17 -0.11 0.04 -4.37 0.15 -2.78 -2.5 0.25 -0.61
0.02 -0.04 0.11 0.43 0.57 0.39 0.67 0.69 0.5 0.48 0.46 0.26 0.11 -0.38 -0.74 -0.22 -0.36 -0.14 -0.45 -0.38 -3.42 -0.81 -0.36 -0.61 -0.13 -0.5
-0.15 -0.3 0.02 0.63 0.62 0.34 0.5 0.59 0.55 0.41 0.38 0.09 0.11 -0.92 -0.64 -0.55 -0.46 0.04 0.0 -0.15 -3.7 -0.3 0.01 -0.82 0.03 -0.37
-0.39 -0.41 -0.39 0.23 0.62 0.45 0.43 0.31 0.47 0.32 0.33 -0.11 -0.15 -0.2 -0.01 -0.17 -0.52 -0.48 -0.52 -0.44 -3.18 0.58 0.21 -0.18 0.32 -0.24
-0.3 -0.09 0.06 0.26 0.33 0.3 0.1 0.39 0.4 0.5 0.3 0.12 -0.08 -0.47 -0.47 -0.24 -0.46 0.17 0.04 -0.5 -3.22 0.26 -0.68 0.14 0.29 0.0
-0.79 -0.23 -0.02 0.28 0.38 0.72 0.47 0.74 0.73 0.8 0.77 0.38 -0.8 -1.12 -0.78 -1.08 -0.64 0.04 0.12 -0.12 -4.54 -1.23 -0.85 -0.65 0.7 -0.15
-0.01 -0.24 -0.08 0.48 0.56 0.35 0.43 0.43 0.38 0.42 0.35 0.22 -0.06 -0.53 -0.08 -0.15 -0.67 -0.54 -0.29 -0.63 -2.21 0.64 -0.19 -0.66 0.07 -0.59
-0.63 0.13 -0.06 0.63 0.63 0.23 0.62 0.81 0.82 0.35 0.46 0.37 -0.98 -0.13 -0.53 -0.22 -0.66 -0.5 -0.62 -0.82 -2.8 -0.78 -0.49 -0.61 0.53 -0.07
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-1.54 -0.12 -0.22 0.71 0.83 0.48 0.29 0.71 0.77 0.6 0.54 0.54 -2.73 -1.32 -1.04 -1.15 -1.08 0.31 0.15 -0.25 -4.74 -1.87 -0.52 0.37 0.63 0.12
-1.94 0.03 -0.1 0.88 0.82 0.43 0.74 0.86 0.64 0.26 0.62 0.47 -2.63 -0.07 -0.15 -0.44 -0.58 -0.16 -0.66 -0.8 -3.55 -3.36 -0.04 -1.19 0.5 0.19
-3.12 -0.18 0.16 1.0 1.14 0.61 0.77 0.65 0.79 0.57 0.68 0.28 -3.73 -0.92 -0.92 -1.04 -0.39 0.19 -0.26 -0.17 -4.3 -0.53 -0.57 -0.91 -0.06 -0.56
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-1.19 -0.19 0.34 1.4 1.06 0.54 0.49 0.5 0.29 0.9 0.87 0.54 -1.1 -1.81 -1.82 -2.69 -1.0 -0.6 -0.61 0.07 - -0.91 -3.82 -3.48 1.17 0.06
-1.74 -0.29 0.22 0.67 1.0 0.76 0.85 1.04 1.01 0.88 0.87 0.12 -2.17 -1.5 -2.59 -1.84 -1.16 0.14 -0.71 -0.28 -3.12 -2.31 -2.07 -0.31 0.57 -0.11
-1.48 -0.48 -0.41 0.76 0.83 0.29 0.7 0.87 1.02 0.7 0.9 0.46 -1.85 -1.03 -0.72 -0.74 -1.1 -0.76 -0.85 -1.14 -3.56 0.89 -0.11 -0.5 -0.24 -0.56
-1.64 -0.06 0.24 0.71 0.56 0.24 0.58 0.78 0.38 0.85 1.0 0.61 -1.34 -0.97 -1.72 -1.77 -0.78 -0.06 0.05 0.18 -2.36 -0.45 -0.12 -0.75 -0.03 -0.38
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-0.68 -0.09 0.11 0.92 0.85 0.35 0.69 0.95 0.79 0.87 0.97 0.69 -1.49 -1.46 -1.19 -1.61 -1.3 -0.34 -0.54 -0.8 -1.29 -0.51 -0.97 -0.61 -0.2 -0.72
-0.0 -0.06 0.04 0.63 0.58 0.26 0.55 0.67 0.45 0.38 0.26 -0.22 -0.27 -1.54 -0.74 -0.72 -0.27 0.38 -0.17 -0.07 -3.24 -0.14 0.49 -0.6 -0.05 -0.75
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-0.98 -0.12 0.04 0.68 1.01 1.01 1.02 0.86 0.66 0.39 0.19 -0.07 -0.64 -0.84 -0.76 -0.51 -0.48 -0.33 -0.66 -0.34 -4.48 0.3 -1.26 -1.02 -0.3 -0.63
-0.19 0.16 0.26 0.84 1.05 0.55 0.56 0.65 0.68 0.78 0.86 0.69 -0.68 -0.66 -1.44 -0.7 -1.15 -0.44 -0.49 -0.43 -5.61 -2.04 -1.39 -0.82 -0.24 -0.37
-1.43 0.09 -0.31 0.01 0.96 1.16 1.1 0.95 1.09 0.51 -0.2 -0.32 -2.28 -0.36 -0.83 -0.29 -0.55 -0.18 -0.1 -0.36 -5.81 -0.3 -0.09 -1.11 -0.04 -1.22
-1.3 -0.03 0.21 0.51 0.64 0.66 0.44 0.41 0.39 0.37 0.3 0.31 -1.27 -0.93 -0.81 -0.87 -0.25 0.07 -0.39 -0.21 -2.93 0.54 -0.29 -0.55 0.61 -0.06
-0.11 -0.54 -0.32 0.34 0.94 1.24 1.18 1.02 0.75 0.46 0.31 -0.04 -0.12 -0.69 -0.83 -0.43 -0.28 -0.28 -0.07 -0.1 -2.89 -2.56 -1.33 -1.72 -0.87 -0.9
-4.02 -2.58 -0.19 1.02 1.13 0.82 0.5 0.77 1.0 0.97 1.13 0.77 -3.87 -2.34 -2.15 -2.24 -1.64 -0.27 -0.27 -0.2 -5.66 -0.57 -1.64 -1.35 0.88 0.19
-1.85 -0.76 0.04 0.57 0.86 0.92 0.7 0.53 0.61 0.33 0.23 0.16 -1.21 -0.61 -0.55 -0.54 -0.18 0.1 -0.09 0.04 -7.29 -0.06 -0.66 -0.29 0.24 -0.3
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-0.16 0.14 0.16 0.44 0.56 0.52 0.54 0.6 0.55 0.47 0.41 0.42 -0.48 -0.54 -0.73 -0.56 -0.6 -0.22 -0.48 -0.58 -4.7 -0.43 -0.42 -0.59 0.47 -0.08
0.08 0.16 -0.04 0.4 0.53 0.33 0.62 0.67 0.57 0.61 0.36 0.16 -0.18 -1.25 -0.6 -0.98 -0.4 0.05 -0.24 -0.11 -5.11 -0.48 -0.56 -0.35 0.17 -0.11
-1.23 -0.98 -0.5 0.13 0.28 0.32 1.09 1.03 1.02 0.78 0.36 -0.33 -1.81 -1.15 -0.81 -0.76 -0.49 0.79 0.57 0.13 -3.41 -0.21 -0.85 -1.25 0.31 -0.5
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0.38 -0.04 0.1 0.76 0.91 0.78 0.59 0.72 0.43 0.36 0.41 0.27 -0.22 -1.05 -0.31 -0.88 -0.45 0.15 0.01 -0.17 -5.08 -1.88 -1.13 -1.04 -0.21 -0.97
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-1.28 -1.05 -0.06 0.51 0.88 0.98 0.51 0.47 1.12 1.26 1.46 1.21 -1.67 -0.68 -2.01 -1.74 -1.78 -1.04 -0.47 -0.45 -7.36 -0.97 -1.18 -1.24 -0.87 -0.27
0.05 0.05 -0.22 0.06 0.44 0.29 1.03 1.14 0.95 0.83 0.66 -0.11 -0.98 -1.78 -1.28 -0.81 -0.52 0.14 -0.4 -0.08 -5.87 -1.38 -1.25 -0.75 0.58 -0.35
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.