Heatmap: Cluster_143 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.72 0.43 0.37 0.25 0.22 -0.0 0.11 0.07 -0.72 -0.51 -0.76 -0.59 0.81 -0.02 0.04 0.28 0.34 0.47 0.19 0.1 -3.59 -0.5 -1.84 -1.13 0.43 -0.08
0.22 0.33 0.32 0.35 0.15 -0.5 -0.01 -0.36 -0.04 -0.05 0.34 0.36 0.05 0.6 0.09 0.44 0.17 -0.08 -0.19 -0.31 -4.15 0.24 -2.12 -0.71 0.35 -0.15
0.13 -0.43 -0.43 -0.19 -0.28 -0.49 -0.23 -0.36 -0.36 0.01 0.26 0.43 0.39 0.91 0.28 0.5 -0.23 -0.24 -0.18 -0.62 -1.06 0.32 -0.37 -0.07 0.5 0.17
0.39 -0.45 -0.37 -0.31 -0.16 -0.2 0.2 0.25 0.15 0.27 0.23 0.29 0.51 0.51 -0.06 0.23 -0.09 0.07 -0.19 -0.03 -1.58 0.61 -0.52 -0.89 -0.24 -0.33
0.62 -0.33 -0.33 0.13 -0.06 -0.44 -0.48 -0.53 -0.33 -0.1 0.34 0.08 0.66 0.57 0.2 0.32 -0.38 0.09 -0.44 -0.99 -1.87 1.25 -0.22 -0.4 0.16 -0.52
1.13 0.17 -0.46 -0.17 -0.44 -0.53 0.14 0.18 -0.27 -0.11 0.35 0.47 1.29 -0.41 -0.72 0.13 -0.87 0.89 -0.28 -0.7 -4.36 -0.56 -0.57 -1.28 0.88 -0.74
0.26 -0.31 -0.06 0.12 -0.29 -0.93 -0.19 -0.08 -0.76 -0.33 -0.22 -0.19 0.29 0.82 0.03 0.76 0.21 0.2 -0.19 -0.04 -2.02 0.07 -0.53 -0.08 0.54 0.49
-0.18 -0.09 -0.23 -0.05 0.04 -0.16 0.01 0.37 0.62 -0.85 -0.02 -0.35 -0.24 0.6 0.44 0.25 -0.91 0.28 0.04 -0.97 -0.93 -0.68 -0.06 -1.35 1.21 0.35
0.02 0.14 0.12 0.15 0.1 0.38 0.24 0.09 -0.01 -0.11 -0.17 -0.39 0.03 -0.11 -0.04 0.2 0.67 0.43 0.42 -0.03 -2.09 -0.52 -0.78 -0.61 0.07 -0.06
0.05 -0.58 -0.64 -0.41 -0.37 -0.72 -0.19 -0.15 -0.2 -0.01 -0.07 -0.04 0.32 0.8 0.23 0.81 -0.1 0.07 -0.16 -0.27 -1.1 0.59 -0.06 0.07 0.25 0.21
0.39 -0.18 -0.36 -0.37 -0.22 -0.18 0.49 0.38 0.1 0.14 0.02 -0.1 0.49 0.25 0.11 0.12 0.14 0.31 0.09 -0.02 -4.07 0.74 -0.97 -0.79 -0.28 -0.16
0.6 -0.04 -0.24 -0.42 -0.45 -0.38 -0.08 0.12 -0.08 0.01 0.09 0.08 0.71 0.63 -0.0 0.87 -0.16 0.07 -0.11 -0.12 -1.49 0.13 -0.48 -0.89 -0.01 -0.32
-0.14 -0.82 -1.38 -2.55 -3.52 -2.09 -0.03 -0.32 -0.45 0.83 0.63 0.11 -0.36 -0.58 -1.42 2.16 0.24 -0.05 0.29 0.37 -4.7 0.14 -0.51 -0.12 0.31 0.82
0.85 0.04 -0.36 -0.52 -1.07 -1.08 -0.01 0.28 0.19 0.19 0.17 -0.02 0.74 0.51 0.18 0.32 -0.47 0.45 0.56 0.02 -3.1 -0.46 -0.69 -0.55 0.21 -0.32
0.53 0.03 -0.04 0.04 -0.07 -0.09 0.31 0.35 0.35 0.08 -0.01 0.03 0.47 0.13 0.21 0.2 -0.07 -0.5 -0.21 0.03 -2.95 0.1 -0.41 -0.96 0.33 -0.45
0.95 0.25 -0.11 -0.1 -0.61 -1.37 -1.25 -1.15 -1.57 -1.48 -1.53 -1.15 1.32 1.06 1.1 1.09 0.62 -0.06 -0.87 -1.47 -2.02 1.59 -2.09 -1.64 0.08 -1.03
0.89 0.11 -0.7 -0.88 -1.47 -1.37 -0.36 0.14 -0.42 -0.21 0.03 0.02 1.12 0.36 -0.2 1.13 -0.22 0.61 0.13 -0.33 -2.31 -0.85 -0.07 -0.23 0.57 -0.31
1.03 -0.85 -0.87 -0.56 -1.34 -0.98 0.07 0.41 -0.42 -0.63 -0.61 -1.32 1.12 1.14 -0.36 0.71 -0.46 0.47 0.18 -0.6 -3.17 0.72 -1.05 -0.62 0.75 0.23
0.48 -0.3 -0.32 -0.31 0.03 -0.12 0.41 0.29 0.26 0.16 0.23 0.04 0.51 0.34 -0.2 0.57 -0.26 -0.11 -0.04 -0.18 -2.83 0.34 -0.5 -0.21 -0.38 -0.4
0.49 -0.02 -0.24 -0.08 0.58 0.29 0.42 0.15 0.15 -0.24 -0.43 -0.39 0.02 0.45 0.09 0.53 -0.36 0.47 0.27 -0.16 -4.03 -1.52 0.08 -0.21 -0.08 -0.39
0.54 -0.81 -1.59 -1.5 -0.56 0.03 0.34 0.14 0.07 -0.01 -0.25 -0.02 0.54 0.32 -0.07 -0.23 0.26 0.43 0.45 -0.0 -3.6 0.77 -0.16 0.18 0.07 0.09
0.41 -0.5 -0.74 0.26 0.41 0.02 -0.22 -0.46 -1.19 -1.14 -1.08 -1.17 0.6 1.03 0.51 0.52 -0.46 -0.21 -0.37 -1.23 -0.58 1.74 -0.43 -1.9 0.49 -0.33
0.69 -0.67 -0.79 -0.92 -1.32 -1.03 -0.13 0.16 -0.73 -0.26 -0.57 -1.27 0.97 0.31 1.16 0.71 -0.79 0.23 -0.1 -0.14 -1.65 -1.67 0.43 -1.0 1.02 1.03
0.57 0.14 0.29 0.13 -0.13 -0.39 0.56 0.27 -0.25 -0.66 -1.09 -0.99 0.73 0.08 0.18 0.41 0.24 0.51 0.43 0.41 -5.15 -0.7 -1.1 -1.95 0.53 0.03
0.6 -0.8 -0.81 -1.03 -1.59 -1.27 -0.13 0.42 0.05 0.51 0.3 0.37 0.72 0.45 -0.71 1.12 -0.26 0.17 0.02 -0.01 -1.12 0.35 -0.38 -0.26 -0.27 -0.11
0.26 -0.19 0.06 0.02 -0.06 -0.27 0.17 0.22 -0.08 -0.06 -0.22 -0.1 0.17 0.56 -0.19 0.51 0.06 0.02 -0.11 0.01 -1.52 -0.01 -0.2 -0.34 0.08 0.19
0.62 0.08 -0.01 -0.09 -0.23 -0.53 -0.09 -0.0 -0.49 -0.71 -0.59 -0.41 0.86 0.8 1.12 -0.06 -0.69 -0.32 -0.42 -0.91 -2.59 -0.59 -0.11 -1.3 1.16 0.56
0.48 0.08 0.05 0.16 0.41 0.11 0.1 -0.12 -0.49 -0.82 -1.08 -0.7 0.45 0.37 0.29 0.67 0.28 0.49 0.26 -0.14 -4.68 -0.23 -1.3 -0.48 0.28 0.26
1.07 0.18 -0.39 0.25 0.42 -0.07 0.07 -0.07 -0.11 0.07 0.26 0.4 1.05 -0.64 -0.94 -0.8 -0.57 0.43 -0.2 -0.63 -2.51 -0.07 -0.49 -0.61 0.44 -0.27
0.7 -0.45 -1.46 -1.55 -0.97 -0.31 0.41 0.3 0.03 -0.17 -0.54 -0.53 0.82 0.79 0.49 0.64 0.18 0.55 0.14 -0.32 -2.64 1.02 -0.87 -1.31 0.04 -0.61
0.37 -0.05 0.09 0.12 0.07 -0.01 0.07 0.07 -0.39 -0.35 -0.41 -0.38 0.56 0.44 0.29 0.38 -0.12 0.16 -0.19 -0.46 -1.33 -0.11 -0.4 -0.47 0.37 0.36
0.44 -0.18 -0.24 0.06 0.1 -0.31 0.12 0.19 0.0 -0.1 -0.24 -0.58 0.24 0.52 0.21 0.46 0.1 0.05 0.27 0.02 -2.21 -0.05 -0.29 -0.53 0.15 0.05
0.37 0.24 0.15 0.33 0.0 -0.59 -0.36 -0.24 -0.92 -0.76 -0.62 -0.63 0.1 0.04 1.38 0.55 -0.57 -0.04 -0.21 -0.49 -0.78 -0.37 -0.44 -0.07 0.86 0.28
0.22 -0.56 -0.93 -1.21 -0.86 -0.19 0.09 -0.12 0.06 0.21 -0.11 0.08 0.22 0.36 0.14 -0.09 0.57 0.28 0.6 0.57 -2.8 0.06 -0.22 -0.12 0.34 0.23
0.35 -0.73 -0.83 -0.54 -0.52 -0.63 0.33 0.73 0.44 0.3 0.19 -0.4 0.13 0.13 -0.05 0.27 0.15 -0.11 0.29 -0.08 -3.52 0.83 -1.2 -0.33 0.44 0.15
0.3 -0.24 -0.23 -0.19 -0.53 -0.8 0.04 0.22 0.11 0.17 0.24 0.18 0.51 0.63 -0.05 0.34 -0.26 0.05 -0.43 -0.39 -0.8 -0.03 -0.27 -0.11 0.18 0.25
0.3 0.48 0.27 0.27 0.24 -0.15 0.02 -0.06 -0.3 -0.63 -0.66 -0.77 -0.42 0.55 0.19 0.75 0.4 0.59 0.27 0.2 -3.85 -1.1 0.03 -0.93 0.04 -0.16
0.43 0.13 -0.32 -0.17 0.25 0.11 0.37 0.24 0.09 -0.2 -0.26 -0.69 0.05 0.75 0.36 0.62 -0.24 0.38 0.17 -0.29 -3.03 -0.69 -0.49 -0.51 -0.05 -0.02
0.7 0.18 -0.37 -0.42 -0.33 -0.12 0.25 0.24 0.07 0.07 -0.03 -0.19 0.28 0.02 -0.33 1.42 -0.31 -0.02 -0.19 -0.25 -4.47 0.44 -0.78 -0.47 -0.24 -0.11
0.72 -0.33 -1.87 -1.84 -1.09 -0.32 0.39 0.35 -0.31 -0.45 -0.62 -0.55 0.66 0.38 0.21 -0.19 0.14 0.11 0.4 -0.12 -1.62 1.25 -0.02 -0.02 0.32 0.01
2.03 0.46 -0.79 -0.3 -1.06 -1.23 -1.18 -0.77 -3.13 -3.26 -4.18 -2.66 1.72 1.76 1.19 0.45 -0.05 0.15 -0.58 -1.21 -2.45 0.35 -2.22 -6.15 0.08 -0.86
0.23 0.01 0.16 0.37 -0.55 -0.76 -0.41 0.3 -0.48 -0.31 0.07 -0.18 0.27 -0.08 1.35 1.06 -0.67 -0.38 -0.95 -0.59 -3.12 -1.89 -0.41 -0.51 0.59 0.99
0.18 -0.54 -0.37 -0.04 -0.0 0.31 0.17 0.16 -0.46 -0.25 -0.16 -0.18 0.28 0.87 -0.57 0.67 -0.77 0.37 -0.33 -0.23 -1.7 -0.0 -0.0 -0.52 0.42 0.53
0.34 -0.39 -0.34 -0.06 -0.23 -0.67 -0.19 -0.04 -0.33 -0.17 0.02 0.32 0.41 0.58 -0.35 0.22 -0.22 0.41 -0.3 -0.2 -1.23 0.16 -0.12 0.22 0.5 0.34
0.67 0.44 0.02 -0.48 -0.83 -1.2 -0.51 0.17 0.33 -0.04 0.23 0.5 0.81 0.18 0.3 0.32 -0.32 0.58 0.67 0.36 -2.25 -2.47 -0.62 -0.89 -0.09 -0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.