Heatmap: Cluster_71 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.85 0.58 0.23 -0.39 -0.69 -1.31 -0.41 -0.09 -0.38 -0.29 0.21 0.56 0.56 -0.53 -0.53 -0.99 -0.16 0.61 -0.19 0.25 -5.19 -0.68 -0.55 0.78 0.7 0.4
0.37 0.66 -0.48 -0.88 -0.77 0.25 0.81 0.89 0.75 -0.19 -0.5 -0.74 -0.3 -1.11 -0.39 -1.31 0.25 0.41 0.57 0.41 -3.69 -0.8 0.66 0.27 -0.34 -0.68
0.67 0.49 0.29 -0.09 -0.36 -0.1 0.26 0.38 0.17 -0.06 -0.23 -0.21 0.68 -0.39 0.05 -0.27 0.26 0.36 0.11 0.18 -2.96 -2.85 -0.7 -0.45 0.58 -0.29
1.34 1.12 0.53 0.28 -0.38 -0.16 -0.01 0.46 -0.46 -0.24 0.01 -0.13 0.65 -0.94 -1.03 -0.67 -0.48 -0.17 0.43 -0.06 -4.35 -2.13 0.04 -1.28 0.39 -0.08
0.71 1.0 0.66 0.04 -0.82 -0.86 0.08 0.52 -0.04 -0.65 -0.5 -0.39 0.3 -0.08 -0.42 -0.78 -0.12 0.26 0.36 0.33 -3.18 -0.1 -1.44 -0.3 0.5 0.33
0.55 0.99 0.67 -0.04 -1.37 -1.73 0.14 0.6 -0.01 -0.57 -0.6 -0.56 0.04 0.12 -0.42 -0.68 -0.03 0.63 0.19 0.32 -2.8 0.29 -1.35 -0.62 0.63 0.4
1.96 1.53 0.35 -1.13 -2.46 -2.15 -0.53 0.19 -0.57 -0.78 -0.7 -0.7 1.36 -1.4 -0.35 -1.22 -0.45 0.72 0.56 0.24 -7.64 -0.84 -2.83 -2.19 0.99 -0.57
0.82 0.59 0.31 0.09 -0.16 -0.48 0.06 0.1 -0.36 -0.3 -0.39 -0.23 0.58 -0.22 -0.45 -0.26 0.14 0.58 -0.1 0.11 -0.98 -0.34 -1.11 -1.0 0.67 0.17
0.54 0.53 0.17 0.09 -0.05 0.07 0.11 0.14 0.07 -0.2 -0.07 -0.04 0.45 -0.2 -0.02 -0.28 -0.3 0.48 0.08 -0.07 -2.99 -0.91 -0.46 -0.44 0.35 0.26
0.2 -0.1 -0.75 -0.6 -0.08 0.77 1.04 0.83 0.47 0.04 0.1 -0.13 -0.28 -0.73 -0.73 -0.31 -0.48 0.15 0.13 0.02 -3.5 -1.44 -0.41 -0.57 0.89 0.35
0.92 0.4 0.03 -0.15 -0.24 -0.36 -0.0 0.06 -0.22 -0.32 -0.42 -0.42 0.69 -0.17 0.12 -0.2 0.05 0.57 0.22 0.07 -1.23 -0.08 -0.15 -0.74 0.27 -0.34
0.85 0.95 0.1 -0.77 -1.14 -0.73 0.01 0.29 0.39 0.46 0.57 0.64 0.57 -0.25 -1.45 -0.97 -0.13 -0.04 -0.73 -0.15 -2.3 -0.27 -0.29 0.27 0.16 -0.3
1.64 1.03 0.11 -0.9 -1.45 -0.77 0.48 1.15 -0.42 -1.14 -0.94 0.24 0.77 0.24 -2.6 -1.78 -2.24 -0.2 -1.86 -0.34 -4.83 -2.67 -0.51 -2.16 1.48 1.24
0.64 0.81 -0.15 -0.96 -1.36 -0.62 -0.14 0.06 0.26 0.21 0.3 0.49 0.51 -0.42 -1.28 -0.81 -0.27 -0.39 -0.62 -0.43 -1.2 0.29 -0.02 0.82 0.76 0.07
1.07 1.05 0.43 -0.03 -0.34 -0.41 -0.54 -0.56 -1.9 -1.46 -1.1 -0.6 1.09 -0.07 -0.03 -0.15 -0.29 0.25 0.4 -0.27 -3.13 -0.26 -0.47 -1.41 1.39 0.08
0.86 0.6 -0.35 -0.8 -0.46 0.1 0.24 0.34 0.31 0.33 0.25 -0.25 0.39 -0.47 -0.08 -0.79 0.13 0.18 0.4 0.42 -2.63 -0.89 -0.21 -0.25 -0.03 -0.46
0.67 0.71 -0.01 -0.69 -1.02 -0.35 -0.08 0.18 0.44 0.39 0.58 0.71 0.78 -0.51 -1.34 -0.7 -0.43 -0.63 -0.85 -0.62 -1.08 -0.2 0.04 0.37 0.54 -0.2
0.83 0.49 -0.0 -0.46 -0.61 0.01 0.41 0.57 0.33 0.12 -0.0 -0.15 0.33 -0.41 -0.49 -0.59 -0.22 0.16 0.04 0.15 -1.32 -0.89 -0.14 -0.38 0.31 0.04
0.58 0.99 0.49 -0.19 -0.87 -1.17 -0.25 -0.08 -0.32 -0.01 0.0 0.07 -0.01 -0.05 -0.38 -0.47 0.17 0.72 0.27 0.34 -3.14 -1.28 -0.43 -0.32 0.65 0.36
0.7 0.64 0.09 -0.5 -0.98 -0.94 -0.31 0.16 0.05 0.23 0.11 0.13 0.43 -0.78 -1.06 -0.36 -0.34 0.27 0.02 -0.03 -1.58 0.57 -0.68 0.7 0.74 -0.33
0.69 0.84 -0.11 -0.99 -1.33 -0.58 -0.18 -0.1 0.13 0.3 0.37 0.7 0.55 -0.13 -0.71 -0.78 0.2 -0.3 -0.16 0.06 -1.89 -0.56 0.01 0.71 -0.11 0.09
1.03 1.72 0.58 -0.64 -0.98 -0.49 -0.07 0.14 0.42 0.3 0.42 0.4 0.45 -1.33 -1.05 -2.3 -0.29 -0.25 -0.3 0.03 -2.84 -1.42 0.01 -0.06 0.08 -0.86
0.83 -0.03 -0.16 -0.24 -1.29 -1.37 -0.19 0.53 0.26 0.13 0.31 0.38 0.51 -0.4 -0.34 0.0 -0.48 -0.01 -0.33 -0.48 -1.36 0.39 0.21 0.02 0.55 0.03
0.13 0.36 0.4 -0.03 -0.15 -0.31 -0.47 -0.61 -0.31 -0.12 -0.02 0.02 0.05 -0.2 0.02 0.18 0.36 0.15 0.23 -0.01 -0.92 0.16 -0.08 -0.15 0.54 -0.07
0.92 0.94 0.35 -0.1 -0.46 -0.56 0.03 0.2 -0.14 -0.01 0.08 0.22 0.57 -0.43 -0.78 -0.85 -0.07 0.36 -0.1 -0.07 -3.64 -0.87 -0.68 -0.6 0.86 0.11
0.95 0.6 0.31 0.14 -0.54 -0.55 -0.2 -0.1 -0.71 -0.68 -0.58 -0.54 1.02 -0.2 -0.2 0.02 0.97 0.47 0.3 -0.23 -3.56 -2.28 -1.82 -1.11 1.08 0.1
1.5 1.02 0.28 0.45 -0.21 -0.2 0.85 1.4 -0.11 -0.52 -0.69 -0.78 0.97 -1.33 -1.09 -1.78 -0.42 0.02 -0.01 -0.22 -4.56 -3.12 -2.5 -2.44 0.66 -0.43
1.39 1.11 0.6 -0.33 -2.44 -2.65 -1.33 -0.21 -0.88 -1.1 -0.57 0.03 1.36 0.0 -0.15 0.07 0.33 0.24 0.13 0.11 -1.77 -2.31 -2.04 -1.25 1.25 -0.07
0.62 0.64 0.47 0.1 -0.6 -1.23 -0.91 -0.41 -0.16 0.01 0.16 0.29 0.5 -0.95 -0.41 -0.48 0.24 0.58 0.49 0.1 -2.13 -0.19 -0.27 -0.09 0.61 -0.2
1.0 0.66 -0.13 -0.62 -0.52 -0.36 0.3 0.23 -0.09 0.01 -0.19 -0.09 0.57 -0.28 -0.84 -0.81 -0.11 0.54 0.07 0.08 -2.25 -0.58 -0.11 -0.38 0.68 0.14
0.73 0.76 0.07 -0.38 -1.07 -0.51 -0.27 0.18 0.33 0.15 0.39 0.72 0.65 -1.73 -2.46 -2.27 -1.6 -0.64 -1.66 -1.33 -0.97 0.36 0.79 1.02 0.96 -0.1
0.66 0.66 0.23 -0.07 -0.26 -0.41 -0.01 0.15 0.06 0.03 0.14 0.3 0.35 -0.58 -0.59 0.19 -0.07 0.07 -0.27 -0.1 -2.8 -0.11 -0.45 -0.21 0.64 -0.16
0.94 0.89 0.51 0.06 -0.52 -0.67 -0.39 -0.05 -0.55 -0.57 -0.43 -0.16 0.84 -0.84 -0.05 -0.3 0.23 0.37 0.1 0.2 -1.52 -0.15 -1.19 -0.74 0.77 -0.12
1.19 0.54 0.12 -0.34 -1.04 -1.46 -0.42 -0.08 -0.47 -0.2 -0.12 0.2 1.14 -0.35 -0.14 -0.32 -0.09 0.5 0.07 0.09 -2.49 -0.15 -1.09 -0.68 0.8 0.14
0.73 0.88 0.57 0.18 -0.49 -0.78 -0.25 0.23 -0.05 -0.01 -0.07 0.12 0.48 -1.28 -0.88 -1.42 -0.24 0.75 0.51 0.24 -4.76 -0.42 -1.41 -0.1 0.54 0.22
0.39 0.69 0.34 0.15 -0.1 -0.23 -0.3 -0.17 0.03 0.19 0.3 0.63 0.35 -1.31 -1.06 -0.87 -0.21 -0.01 -0.41 -0.05 -1.96 0.28 -0.5 0.39 0.64 -0.07
1.08 0.93 0.53 0.51 -0.2 -0.65 -0.35 -0.26 -0.68 -0.79 -0.55 -0.18 0.9 -0.91 -0.94 -0.99 -0.68 0.93 0.1 -0.1 -4.38 0.28 -2.87 -0.1 0.71 0.36
0.77 0.81 0.12 -0.64 -0.89 -0.43 0.03 0.2 0.38 0.39 0.5 0.58 0.78 -0.22 -1.14 -0.38 -0.33 -0.41 -0.84 -0.45 -1.48 0.07 -0.22 -0.08 0.33 -0.4
0.79 0.67 0.5 -0.02 -0.26 -0.35 0.32 0.29 -0.39 0.05 0.0 -0.13 0.48 -0.59 -0.09 -0.44 -0.01 0.21 0.22 0.0 -3.55 -0.47 -0.28 -0.59 0.25 -0.09
1.14 0.73 0.32 -0.22 -0.71 -0.97 -0.25 -0.07 -0.69 -0.27 -0.19 0.0 1.23 0.01 -0.1 -0.4 -0.19 0.49 0.22 -0.03 -3.81 -0.99 -1.29 -0.92 0.79 0.12
0.61 1.2 0.41 -0.18 0.34 0.03 0.2 0.28 -0.09 -0.07 -0.82 -0.94 0.24 -1.35 0.11 -0.97 -0.3 0.29 1.43 0.17 -1.53 -1.61 -1.43 -0.63 -0.37 -0.19
1.15 1.4 0.85 -0.07 -1.02 -1.03 -0.47 0.05 -0.21 0.06 0.2 0.33 0.75 -1.21 -0.93 -1.21 0.18 0.22 0.12 0.04 -1.8 -1.27 -0.13 -0.43 -0.2 -0.71
1.04 0.78 -0.19 -0.71 -0.51 -0.01 0.21 0.17 0.28 0.44 0.14 0.04 0.48 -0.19 -0.48 -0.68 0.27 0.34 0.01 0.14 -3.8 -1.31 -0.5 -0.67 0.25 -0.2
0.99 0.73 0.49 0.0 -0.48 -0.71 0.04 0.29 -0.44 -0.09 -0.17 -0.31 0.69 -0.69 -0.05 -0.53 -0.21 0.73 0.17 0.21 -2.05 -1.5 -0.31 -0.78 0.36 0.07
0.06 0.41 0.13 -0.44 -0.08 0.46 0.45 0.31 0.3 0.16 -0.15 -0.29 -0.38 -0.66 0.39 -0.92 0.16 0.15 0.11 0.4 -1.46 -0.69 -0.1 -0.12 0.31 -0.2
1.45 1.38 0.55 -0.4 -0.88 -0.85 -0.06 0.11 0.23 0.27 0.28 0.4 1.07 -0.74 -0.73 -1.23 -0.02 -0.41 -0.58 -0.17 -3.4 -1.68 -0.23 -0.48 -0.29 -0.81
1.54 0.87 0.47 -0.21 -1.22 -0.89 0.49 0.92 -0.25 -1.04 -1.31 -1.5 1.02 -1.42 -0.86 -2.04 0.14 0.38 0.36 0.32 -2.29 -1.33 -0.42 -1.38 0.71 0.21
1.04 1.12 0.58 -0.01 -0.98 -1.13 -0.24 0.23 0.21 0.34 0.33 0.39 0.74 -0.76 -1.05 -1.24 -0.36 0.01 -0.39 0.09 -2.44 -1.33 -0.7 -0.29 0.48 0.17
1.77 1.49 0.21 0.53 -0.35 -1.45 -1.21 -0.23 -0.04 -0.34 -0.43 -0.38 1.18 -0.96 -1.44 -1.17 -1.05 0.28 0.74 0.01 -5.87 -0.94 -1.99 -0.83 0.33 -0.13
1.32 1.08 0.42 0.06 -0.21 -0.43 -0.32 -0.01 -0.36 0.01 0.31 0.42 0.82 -0.7 -1.01 -1.19 -0.09 -0.25 -0.45 0.01 -3.21 -0.75 -0.25 -0.15 0.17 -0.28
1.64 1.42 0.7 0.05 -0.8 -1.26 -0.47 -0.61 -1.39 -0.65 -0.37 -0.17 1.39 -0.83 -1.24 -0.49 -0.29 0.56 0.89 0.64 -5.16 - -0.76 -0.45 -1.61 -0.36
0.88 1.16 0.26 -0.61 -1.16 -0.84 -0.12 0.08 0.18 0.24 0.25 0.37 0.7 -0.49 -1.02 -0.71 0.05 0.1 -0.46 -0.05 -2.53 0.13 -0.72 -0.05 0.47 -0.24
0.92 -0.2 -0.88 -1.04 -0.34 0.36 0.99 1.0 0.16 -0.32 -0.27 -0.65 0.75 0.07 -1.28 -0.47 -0.6 0.15 -0.21 -0.03 -2.62 -1.31 -0.25 -1.16 0.85 0.7
0.69 1.08 0.16 -0.66 -1.09 -0.59 -0.22 -0.02 0.13 -0.09 -0.08 0.25 0.57 -0.66 -1.29 -0.67 -0.18 -0.08 -0.32 -0.47 -0.85 0.29 -0.42 0.46 0.9 0.15
0.59 0.35 0.41 0.07 -0.35 -0.04 0.25 0.5 0.15 0.15 -0.01 0.16 0.36 -0.61 -0.46 -0.25 0.04 -0.05 -0.1 0.07 -3.38 -0.87 -1.13 -0.11 0.66 0.11
0.97 0.47 0.08 0.04 -0.21 -0.28 -0.28 -0.34 -0.43 -0.35 -0.2 0.17 0.89 -0.28 -0.39 -0.46 -0.42 0.82 0.27 -0.37 -3.01 -0.35 0.03 -0.08 0.26 0.03
1.36 1.27 0.74 0.12 0.02 -0.08 0.05 0.06 -1.22 -0.66 -0.64 -0.37 1.26 -1.49 -0.59 -1.22 -0.45 0.19 0.47 0.23 -1.73 -1.72 -0.08 -1.2 -0.29 -0.61
0.96 0.8 0.15 -0.28 -0.58 -0.79 -0.08 0.09 -0.1 -0.01 0.01 0.14 0.77 -0.33 -0.65 -0.71 0.14 0.36 0.26 0.18 -5.28 -1.55 -1.14 -0.64 1.06 0.1
0.55 0.62 0.48 0.11 -0.34 -0.68 -0.32 -0.23 -0.27 -0.09 -0.03 0.46 0.69 -0.23 -0.02 -0.17 -0.21 0.7 0.24 0.13 -3.33 -2.2 -0.9 -0.42 0.36 0.41
0.88 0.78 0.1 -0.8 -0.66 -0.6 0.04 0.23 0.01 0.25 0.37 0.35 0.51 -0.33 -0.4 -0.56 -0.22 0.04 -0.08 -0.13 -3.06 -0.85 -0.06 0.0 0.62 -0.06
0.89 -0.1 -0.84 -0.33 -0.11 0.18 0.84 0.75 -0.34 -0.36 -0.68 -1.07 0.73 0.22 -0.07 -0.08 -0.0 -0.03 0.13 -0.44 -3.84 -1.39 0.46 -0.94 0.41 0.55
1.36 1.02 0.64 -0.85 -3.55 -6.5 -2.02 -0.5 -0.77 0.16 -0.22 0.18 1.17 -0.21 -0.44 -0.92 -0.15 0.3 0.93 -0.02 -5.57 -2.4 -2.02 -0.21 0.04 1.48
0.75 0.71 0.47 0.36 -0.36 -1.03 -0.3 -0.33 -0.77 -0.18 -0.0 0.17 0.92 -0.46 -1.4 -0.41 -0.65 0.65 0.06 0.29 -1.64 -0.54 -1.43 -0.04 0.54 0.59
0.64 0.86 0.51 0.19 -0.29 -0.63 -0.41 -0.44 -0.88 -0.3 -0.27 0.03 0.67 -0.19 -1.01 -0.25 -0.26 0.63 0.46 0.64 -1.68 -0.71 -2.0 -0.58 0.45 0.64
0.71 0.9 -0.02 -0.79 -1.0 -0.41 -0.06 0.11 0.18 0.12 0.22 0.35 0.55 -0.17 -1.3 -0.89 -0.16 -0.34 -0.77 -0.53 -1.46 0.32 0.29 0.38 0.74 -0.11
0.92 1.22 0.76 0.07 -0.75 -1.07 -0.64 -0.07 -0.09 -0.03 -0.03 -0.06 0.52 -1.08 -0.47 -1.16 0.0 0.83 0.79 0.2 -2.83 -2.28 -0.71 -0.53 0.33 -0.19
0.58 0.82 0.3 0.03 -0.3 -0.19 0.26 0.4 0.0 0.21 0.01 0.19 0.22 -1.58 -1.02 -1.11 -0.28 0.47 -0.05 0.11 -1.92 -1.49 -0.21 -0.03 0.89 -0.08
0.82 0.98 0.12 -0.76 -1.09 -0.49 0.08 0.21 0.31 0.28 0.33 0.51 0.65 0.09 -0.93 -0.5 0.19 -0.23 -0.29 -0.06 -2.44 -0.58 -1.02 0.02 0.29 -0.27
1.01 0.29 0.14 0.25 -0.14 -0.21 -0.23 0.16 0.27 0.42 0.43 0.39 0.56 -0.83 -0.41 -0.33 -0.97 0.59 -0.4 -1.12 -3.72 -1.14 -1.65 -1.08 0.77 0.74
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0.64 0.67 0.35 0.75 0.38 -0.2 -0.39 -0.18 -0.24 0.01 0.23 0.31 -0.24 -1.24 -1.78 -1.44 -0.72 0.54 -0.24 -0.29 -5.98 0.84 -1.47 -0.74 0.98 0.49
1.6 1.7 0.73 -0.08 -1.06 -1.06 -1.0 -0.18 -0.03 -0.11 0.3 0.32 0.95 -0.79 -0.08 -1.28 -0.93 -1.26 -0.94 -0.85 -3.34 -0.69 -0.67 0.14 0.47 -0.61
0.47 0.5 0.34 0.16 -0.44 -0.79 -0.49 -0.33 -0.77 -0.67 -0.82 -0.64 -0.09 -0.08 0.29 0.03 0.12 0.63 0.82 1.04 -1.21 -0.14 -0.94 -0.49 -0.08 0.55
0.36 0.51 0.38 0.35 -0.02 -0.39 0.03 0.25 0.33 0.2 0.16 0.12 0.71 -0.05 -0.55 0.15 -1.14 0.52 0.05 0.04 -2.24 -0.97 -1.48 -0.94 0.39 -0.2
1.05 1.43 1.15 0.37 -0.4 -0.57 -0.43 -0.04 -0.08 0.03 0.04 0.2 0.91 -0.5 -0.59 -0.4 -0.31 -0.41 -0.06 -0.08 -4.58 -1.22 -0.82 -1.5 -0.01 -0.81
1.03 0.71 -0.1 -0.48 -1.04 -1.03 0.01 0.61 0.34 0.16 0.21 0.22 1.09 -0.48 -1.16 -1.51 -0.82 -0.2 0.03 0.12 -2.49 -0.22 -1.43 -0.19 0.8 0.32
1.09 1.54 1.02 0.31 -0.74 -1.29 -1.24 -0.18 0.0 0.3 0.41 0.45 0.61 -1.42 -0.47 -1.57 -0.14 -0.08 0.02 0.03 -3.96 -0.18 -1.82 -0.42 0.17 -1.03
1.04 1.0 0.11 -0.7 -1.33 -0.92 -0.55 -0.34 -0.01 0.27 0.57 0.99 0.82 -0.29 -1.6 -0.48 -0.17 -0.5 -0.73 -0.4 -2.3 -0.23 -0.49 0.44 0.48 0.1
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0.55 0.66 0.4 0.14 -0.27 -0.47 -0.15 -0.06 -0.44 -0.17 -0.3 -0.15 0.39 -0.07 -0.17 0.02 0.12 0.63 0.24 0.21 -3.12 -0.53 -0.7 -0.35 0.41 0.15
0.08 0.64 0.81 0.12 -1.1 -1.85 -1.23 -0.48 -0.46 -0.45 -0.42 -0.6 -0.17 -0.16 0.62 0.23 0.19 0.46 0.26 -0.09 -0.62 0.06 -0.04 0.35 0.52 0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.