Heatmap: Cluster_117 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.19 0.04 -0.07 0.42 0.28 0.03 0.28 0.41 0.28 0.09 0.24 0.2 0.25 -0.25 -0.3 -0.32 -0.74 -0.01 -0.47 -0.83 -2.2 0.2 0.04 -0.49 0.55 0.09
0.02 -0.33 -0.16 0.37 0.47 -0.01 0.33 0.6 0.03 0.36 0.7 0.63 -0.01 -0.5 -0.8 -0.7 -0.93 -0.3 -0.61 -0.93 -3.81 0.21 0.06 0.27 0.52 0.09
0.26 0.3 -0.94 0.32 0.23 0.23 0.53 0.72 0.94 0.52 0.7 0.96 0.75 -2.76 -2.21 -1.87 -2.28 -0.51 -1.91 -0.93 -2.21 -0.63 0.01 0.09 0.59 -0.02
0.36 0.02 -0.29 0.08 0.07 -0.2 -0.23 -0.12 0.01 0.11 0.36 0.21 0.15 0.07 -0.36 -0.18 -0.77 -0.14 -0.61 -1.41 -1.96 1.0 0.44 -0.14 0.68 0.19
0.17 -0.11 0.14 0.45 0.38 -0.01 0.32 0.57 0.42 0.74 0.85 0.63 0.25 -1.71 -1.14 -2.19 -0.56 -0.48 -0.92 -0.35 -4.77 0.53 -0.97 -0.19 0.26 0.2
0.04 -0.13 -0.79 0.52 0.18 -0.43 0.24 0.61 0.95 0.77 0.81 0.17 -0.81 -1.76 -1.73 -2.34 -1.86 -0.74 -1.31 -2.06 -1.9 1.81 0.78 -0.19 0.11 -0.75
0.24 -0.5 -0.99 0.16 0.71 -0.34 0.17 0.52 0.28 0.66 1.26 0.64 -0.18 -1.46 -1.92 -1.5 -0.93 -0.65 -1.12 -1.47 -5.17 1.19 -0.02 -0.2 0.86 -0.12
-0.01 0.02 -0.58 0.04 0.66 0.25 -0.13 0.31 0.2 0.85 1.01 0.66 -0.07 -1.35 -2.22 -1.97 -1.04 -0.99 -0.95 -0.84 -3.87 1.19 -0.14 -0.63 1.23 -0.55
0.56 -0.23 -0.34 0.7 0.64 0.41 0.45 0.75 0.66 0.43 0.79 0.74 0.72 -1.89 -1.88 -1.33 -1.64 -0.83 -1.26 -0.88 -4.6 -0.31 -0.24 -1.5 0.58 0.04
0.02 0.35 0.14 0.47 0.39 0.39 0.35 0.68 0.39 0.29 0.15 0.02 -0.37 -0.79 -0.62 -1.1 -0.58 -0.13 -0.17 -0.35 -5.3 0.18 -0.47 -0.3 0.82 -0.14
0.31 0.01 0.14 0.36 0.35 -0.01 0.07 0.23 0.26 0.34 0.58 0.37 0.28 -1.05 -0.84 -1.35 -0.52 -0.54 -0.67 -0.35 -3.98 0.71 -0.58 -0.04 0.57 0.44
-0.66 -0.7 -0.85 0.31 0.55 -0.07 0.36 0.18 0.61 0.54 0.77 0.41 -0.51 -0.21 -1.67 -1.13 -1.6 -0.44 -0.85 -1.43 -1.98 0.42 -0.16 0.66 1.11 0.65
- -3.83 -1.78 0.74 0.81 0.33 0.49 0.65 1.46 0.05 0.93 0.43 - -1.64 -1.23 -0.37 -0.91 0.18 -0.36 -1.89 - 0.1 -0.32 -0.35 1.52 0.23
-1.06 -0.21 -0.23 0.41 -0.07 -0.48 0.26 0.36 0.66 0.63 0.72 0.71 -1.04 -0.01 0.07 -0.09 -0.62 -0.12 -0.42 -1.04 -4.51 -0.93 0.04 -0.09 0.82 0.43
0.46 -0.22 -0.54 0.14 0.72 0.17 0.52 0.49 0.69 0.77 0.65 0.01 -0.56 -1.56 -0.68 -1.62 -0.85 -0.0 -0.09 -0.47 -3.41 0.41 -0.48 -0.44 0.88 -0.82
0.67 -1.14 -1.23 0.19 0.5 -0.12 0.48 0.78 0.58 0.51 0.98 0.71 0.18 -2.31 -2.38 -2.71 -2.44 -0.37 -1.15 -1.77 -2.82 0.39 0.96 0.21 0.81 -0.48
0.25 -0.14 -0.25 0.25 0.44 0.14 0.44 0.64 0.39 0.5 0.49 0.02 0.43 -0.22 -0.52 -0.67 -0.72 -0.22 -0.35 -0.48 -2.43 -0.02 -0.25 -0.06 0.03 -0.21
0.22 -0.31 -0.41 0.09 0.28 0.01 0.29 0.44 0.29 0.1 0.1 -0.21 0.32 -0.15 0.13 -0.23 -0.29 0.33 -0.14 -0.55 -2.13 0.32 -0.08 -0.61 0.47 -0.08
0.48 -0.57 -0.71 0.98 0.53 -0.84 -0.51 0.21 0.5 0.05 1.29 0.36 0.1 -3.26 -3.81 -2.17 -3.1 -1.05 -1.24 -2.1 -2.89 0.7 0.93 -0.4 1.49 0.43
0.38 -0.39 -0.86 0.26 0.22 -0.09 0.52 0.64 0.61 0.71 0.71 0.26 0.04 -1.86 -1.14 -1.78 -1.07 0.07 -0.72 -1.02 -3.4 -0.06 0.88 0.14 0.78 -0.5
-0.61 -0.28 -0.0 0.54 0.5 0.17 0.33 0.3 0.29 0.26 0.51 0.37 -0.52 -0.5 -0.83 -0.58 -0.87 -0.49 -0.64 -0.9 -1.94 0.7 0.15 0.09 0.72 0.18
-0.17 -0.23 -0.1 0.1 -0.07 -0.34 0.22 0.53 0.32 0.43 0.65 0.76 0.06 -0.1 -0.46 -0.3 -0.59 -0.63 -0.32 -0.71 -2.63 0.61 0.22 -0.12 0.19 -0.18
0.2 -0.27 -0.19 0.45 0.56 0.38 0.66 0.67 0.45 0.41 0.37 0.05 0.02 -0.84 -0.85 -0.58 -0.57 -0.14 -0.53 -0.5 -3.44 0.11 -0.27 -0.35 0.48 -0.22
0.16 -0.18 -0.28 0.18 0.32 -0.04 0.4 0.55 0.28 0.54 0.56 0.38 0.3 -0.8 -0.56 -0.35 -0.39 -0.07 -0.07 -0.28 -2.46 -0.08 0.19 -0.26 0.01 -0.44
-0.24 -0.72 -0.4 0.43 0.51 0.15 0.53 0.53 0.54 0.6 0.83 0.82 0.2 -0.99 -0.89 -0.84 -1.16 -0.23 -0.53 -0.79 -2.09 -0.52 -0.02 -0.38 0.58 0.02
-1.42 -1.06 -1.18 0.77 0.52 -0.53 0.55 0.43 0.99 0.32 0.78 -0.52 -1.53 -1.84 -0.83 -3.03 -2.78 -0.97 -0.57 -2.99 -2.4 1.47 0.09 -0.81 2.1 -0.36
0.01 -0.01 -0.01 0.45 0.53 0.13 0.39 0.35 0.33 -0.18 0.55 -0.09 -0.36 -1.37 -1.33 -0.82 -1.17 -0.59 -0.43 -0.91 -2.36 1.06 0.65 -0.08 0.76 -0.05
0.14 0.56 -0.13 0.45 0.34 -0.21 0.32 0.59 0.31 0.43 0.68 0.4 0.24 -0.23 -0.63 -0.44 -1.23 -0.78 -0.88 -1.1 -1.56 -0.39 0.57 -0.06 -0.16 -0.21
0.47 -0.47 -0.7 0.69 0.68 -0.12 0.45 0.74 0.46 0.59 0.82 0.35 0.36 -1.38 -2.07 -1.52 -1.87 -0.97 -1.44 -1.57 -2.15 0.48 -0.09 0.02 0.78 0.19
-0.18 -0.8 -0.59 -0.04 0.02 -0.17 0.77 0.7 0.52 0.34 0.54 0.28 -0.23 -0.32 -0.72 -0.19 -0.63 -0.29 -0.52 -0.97 -2.27 0.76 0.29 -0.01 0.53 -0.09
0.37 -0.16 -0.24 0.74 0.78 0.35 0.31 0.83 0.41 0.38 0.51 -0.07 -0.41 -1.67 -1.42 -1.29 -0.69 -0.05 -0.44 -0.35 -4.71 0.69 -0.77 -0.17 0.48 -0.3
0.15 -0.18 -0.51 0.71 0.49 -0.21 0.63 0.7 0.41 0.25 0.34 -0.3 -0.29 -1.9 -1.61 -1.56 -1.26 -0.01 -0.57 -0.93 -3.87 0.35 0.13 -0.23 1.3 0.6
-0.13 -0.51 -0.61 0.29 0.34 -0.34 0.01 0.34 0.1 0.0 0.26 -0.08 -0.17 -0.3 -0.71 -0.32 -0.53 0.13 -0.33 -0.7 -3.06 1.06 0.64 0.51 0.44 0.15
0.43 0.0 -0.28 0.15 0.36 0.26 0.48 0.31 0.38 0.15 0.34 0.08 0.1 -0.82 -0.38 -0.94 -0.5 -0.06 0.11 -0.7 -3.32 0.22 -0.28 0.03 0.49 0.1
-0.47 -0.42 -0.14 0.14 0.1 -0.23 0.26 0.26 0.4 0.62 0.66 0.65 -0.39 0.08 -0.51 -0.16 -0.55 -0.54 -0.53 -0.58 -3.7 -0.12 0.13 0.2 0.54 0.42
-0.2 -0.36 -0.21 0.23 0.09 -0.5 0.09 0.52 0.29 0.62 0.68 0.59 -0.36 -0.07 -0.6 -0.13 -0.6 -0.34 -0.54 -0.55 -2.73 0.84 0.04 -0.29 0.26 0.09
-0.04 -0.6 -0.91 0.18 0.22 -0.95 -0.28 0.33 0.33 0.51 0.65 -0.33 -0.17 -1.12 -1.16 -1.63 -1.56 -0.42 -0.36 -0.85 -0.84 1.85 1.26 0.13 -0.16 -0.31
0.18 -0.11 -0.13 0.22 0.15 -0.08 0.28 0.32 0.2 0.26 0.2 0.08 0.09 -0.16 -0.5 -0.22 -0.5 -0.04 -0.06 -0.4 -2.42 0.19 0.2 0.14 0.27 0.1
0.13 -0.91 -0.62 0.26 0.01 0.02 0.45 0.77 0.71 0.72 0.88 0.44 -0.55 -1.34 -1.55 -2.2 -1.07 -0.65 -0.43 -0.47 -5.8 0.63 -0.1 0.33 0.71 0.44
0.55 -0.08 -0.27 0.3 0.04 -0.46 0.01 0.28 0.21 -0.04 0.5 0.15 0.18 -0.39 -0.67 -0.32 -0.7 0.24 0.15 -0.63 -2.27 -0.56 0.0 0.11 0.8 0.4
-0.28 -1.18 -1.31 0.35 0.19 -0.19 0.23 0.5 0.77 0.75 0.88 0.48 0.14 -0.74 -1.17 -0.86 -1.59 -0.39 -1.06 -1.22 -1.43 0.9 0.33 0.2 0.24 0.4
0.04 -0.5 -0.48 0.32 0.38 0.12 0.42 0.52 0.24 0.24 0.27 0.04 0.2 -0.03 -0.9 -0.11 -0.7 -0.1 -0.81 -0.82 -1.83 0.34 0.34 0.1 0.34 0.17
-0.23 -0.67 -0.54 -0.22 -0.26 -0.04 0.53 0.76 0.76 0.8 0.99 0.81 -0.08 -0.19 -1.37 -0.18 -0.99 -0.68 -0.97 -0.73 -2.25 -0.87 0.17 -0.26 0.62 0.33
-0.35 -0.76 -0.49 -0.29 -0.19 -0.2 0.62 0.87 0.55 0.7 1.06 0.67 -0.03 0.04 -1.11 0.1 -0.72 -0.63 -1.03 -0.5 -2.21 -0.89 0.18 -0.55 0.56 0.24
0.13 -0.55 -0.39 -0.06 -0.13 -0.22 -0.03 0.17 0.47 0.18 0.44 -0.06 -0.07 -0.68 -0.53 -0.47 -0.1 0.05 -0.14 -0.82 -2.5 1.0 0.42 0.54 0.53 -0.09
0.16 0.26 0.09 0.46 0.55 0.15 0.35 0.38 0.65 0.54 0.73 0.51 0.39 -0.92 -1.08 -0.81 -1.46 -0.49 -0.39 -1.49 -3.2 -1.5 0.12 0.18 0.41 -0.15
-2.48 -0.64 -0.79 0.84 0.97 0.06 0.1 0.59 0.55 0.86 0.93 0.02 -3.18 -3.87 -1.89 -1.86 -1.33 0.09 -0.34 -1.53 -5.47 1.43 -1.89 -1.93 1.65 0.39
-0.17 -0.07 0.35 0.8 0.33 -0.39 0.08 0.59 0.39 0.64 0.93 0.98 0.59 -1.31 -1.52 -2.0 -1.03 -0.77 -0.92 -0.38 -4.42 -1.01 -1.58 -0.06 0.66 0.61
-0.25 -0.39 -0.39 0.09 0.16 -0.29 0.36 0.6 0.56 0.74 0.86 0.46 -0.13 -0.26 -0.49 -0.39 -0.34 -0.64 -0.49 -0.68 -2.71 0.27 -0.34 -0.57 0.71 0.07
-0.46 -0.51 -0.39 0.87 0.58 0.17 0.18 0.71 0.74 0.59 0.87 0.36 -0.42 -0.88 -1.06 -1.32 -1.26 -0.22 -1.64 -0.82 -4.45 -3.42 -0.01 0.41 0.76 0.86
-1.02 -0.05 -1.07 -0.57 -0.48 -0.17 -0.61 0.11 0.38 0.53 0.53 0.64 -1.08 0.22 -0.04 0.28 -0.49 0.46 -0.09 -0.29 -1.78 -1.0 0.4 0.98 0.43 0.28
0.2 -0.48 -0.58 0.02 0.08 -0.15 0.39 0.61 0.37 0.46 0.66 0.39 0.12 -0.47 -0.79 -0.55 -0.33 -0.15 -0.32 -0.52 -2.55 0.46 -0.21 0.25 0.46 -0.18
0.0 -0.53 -0.41 0.14 0.19 0.08 0.39 0.51 0.63 0.45 0.48 0.47 0.23 -0.23 -0.79 -0.13 -0.68 -0.08 -0.42 -0.76 -3.03 0.25 0.38 -0.39 0.03 -0.0
-0.29 0.04 0.07 0.48 0.29 0.08 0.21 0.41 0.57 0.16 0.52 0.29 -0.5 -0.53 -0.9 -0.49 -1.15 -0.38 -0.6 -1.28 -1.68 0.53 0.38 -0.17 0.6 0.32
0.46 -0.8 -0.39 0.41 0.4 0.08 0.87 0.35 0.16 0.52 1.09 0.54 0.08 -2.05 -1.33 -1.65 -0.41 -0.56 -2.41 -1.29 -2.18 0.64 -0.04 0.99 -0.2 -0.52
-0.09 -0.46 -0.41 -0.06 0.24 0.21 0.33 0.46 0.15 0.29 0.33 0.15 -0.06 -0.46 -0.93 -0.52 -0.73 0.05 -0.17 -0.3 -1.87 0.37 0.62 0.15 0.42 0.2
0.41 0.2 -0.57 0.91 0.53 -0.17 0.47 0.53 0.22 0.32 0.62 -0.37 -0.35 -0.8 -1.88 -1.08 -1.32 -0.76 -0.98 -1.2 -3.36 0.95 0.37 -0.6 0.77 0.43
0.15 -0.17 -0.1 0.43 0.6 0.48 0.72 0.65 0.61 0.19 0.16 0.39 0.42 -0.58 -0.84 -1.06 -0.47 -0.39 -0.23 -0.64 -2.6 -0.75 -0.06 -0.08 -0.03 -0.25
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0.07 -0.27 -0.61 0.17 0.45 0.58 0.6 0.33 0.65 0.55 0.49 0.38 -0.04 -1.28 -0.6 -0.62 -0.63 -0.15 -0.72 -0.92 -3.77 0.66 -0.03 0.03 0.21 -0.35
0.21 -0.17 -0.58 -0.33 0.44 0.34 0.56 0.49 0.58 0.63 0.68 0.42 0.18 -0.72 -0.9 -0.72 -0.61 -0.68 -0.35 -0.71 -3.48 0.26 0.01 0.15 0.32 -0.34

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.