Heatmap: Cluster_177 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - 5.12 - - - - - - 3.36 3.02 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.53 - - - - -
2.53 3.35 1.77 - -1.72 - -1.37 -4.71 -6.6 -6.21 -6.77 -5.63 -3.23 -2.75 -2.31 -2.32 - -1.71 3.18 2.83 - -0.57 - - - - - - - - - - - - - -1.07 -1.35 -1.33 -0.25 -1.31 -0.25 0.13 -1.11 -1.21 -0.31 2.28 - -1.35 -1.94 - - 1.51 0.52 1.79 - - - -0.57
-1.5 -0.27 2.7 2.04 -0.97 - 1.6 - - -7.24 - -8.5 3.02 1.25 1.29 1.14 - 0.44 - -2.08 - 0.2 - - - - - - - - - - - 2.17 1.83 2.9 -2.32 -2.25 - -0.66 - 0.0 -2.23 -0.18 1.07 - - -5.02 -2.56 - 0.92 -2.97 -1.27 -1.85 - - - 0.22
4.01 3.96 2.56 -0.96 -0.97 - - - - - -5.94 -5.82 -2.84 -4.57 -4.02 -1.39 - -1.51 2.53 2.75 - 1.62 - - - - - - - - - - - - - - 0.61 - - - - -2.24 - - - -2.86 - -3.74 -1.32 - - - -2.48 -2.77 - - - -2.49
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.69 1.54 1.84 -2.02 -2.12 -7.12 -5.26 -8.11 -7.79 -6.89 -7.3 -7.15 -3.2 -1.44 -2.17 -1.46 -1.1 -0.57 2.54 1.78 -0.4 0.1 -0.91 -0.58 -0.58 1.38 0.62 -0.0 -0.31 -0.36 -0.88 -0.73 -0.78 -1.2 -0.48 -1.53 0.02 -0.27 0.06 -0.27 -0.54 -0.46 -0.32 -0.55 -1.18 0.07 -0.7 0.47 -1.48 1.33 -0.02 1.19 0.04 -0.06 -0.9 0.35 0.61 0.06
4.41 3.69 1.32 - - - 1.65 -1.94 - 0.36 0.22 0.18 -0.12 -0.19 0.7 -0.7 - - 3.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.31 - - - -2.81 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.52 - - - 3.6 - - - - - - - - - - - - - - - -
3.05 3.48 1.26 - - - - - - - -5.15 - - - - - - - 4.0 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.45 2.97 -0.12 - - -4.12 1.69 0.4 0.21 0.66 0.89 0.56 - -2.55 - -0.26 - -0.81 -0.4 - 0.21 0.26 -0.51 0.48 -1.02 - -1.09 0.31 -0.35 -0.44 0.07 - - - - -0.07 - - - -2.62 - - - -0.2 -0.84 -0.92 2.57 - 1.3 0.64 -0.03 - 0.55 -0.7 - -
2.52 1.68 3.94 -0.66 0.24 - - - - -3.09 -3.69 -4.6 -1.58 1.37 0.74 1.57 - - 1.96 0.57 - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - 0.37 - - - -1.9 - 2.36 - 1.65 - -0.48 1.82 - -0.82 0.57 -0.02 - - - - -
- - 3.29 - - - - - - 4.43 3.58 3.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.75 - - - - - - 4.29 4.04 3.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.9 1.26 - - - 2.05 0.9 - - - 4.54
3.73 4.99 - - - - - - - - - - - 3.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.08 - - - - - - - - - - -1.36 - - - - -
-4.91 - -1.96 -1.74 - -5.03 - - - - - - 0.97 2.02 1.33 -2.23 1.64 3.75 - -4.37 -0.36 1.41 0.44 0.67 0.72 -2.53 0.47 -2.68 -2.96 -1.91 0.14 -0.09 -0.51 -2.75 -1.76 -3.32 -2.02 -3.5 -2.55 -2.56 -2.55 -2.17 -1.48 - -1.6 2.26 -3.8 0.42 -6.28 0.96 -1.35 -3.66 2.36 -0.56 -3.28 - -5.33 1.18
0.37 0.33 0.52 -2.16 - - - - - - - - 2.66 3.1 2.27 -0.45 - 2.3 -0.33 -0.84 - 2.25 - - - - -1.42 - - - - - - - -0.49 - - -0.26 - - - -2.73 - - - 1.92 - -0.32 -2.65 - - -2.03 1.68 -0.51 - - - 3.51
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.66 3.18 3.66 - - - - - -0.45 -1.06 -1.03 -0.35 - - - - - - 1.89 2.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.76 3.46 2.92 - - - - - - -2.94 -1.69 -2.48 - - - - - - 2.66 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.85 - - - -4.4 - - - - -
-0.56 - 1.91 -2.75 0.26 - 1.03 - -3.44 -5.68 -5.26 -5.4 1.79 0.53 1.19 0.68 - 1.55 - - - 0.69 - - - - -1.01 - - - - - - 0.1 1.43 0.8 2.38 1.4 1.3 0.51 2.62 1.14 2.17 - 0.8 -0.29 - - 0.62 - -0.87 -2.67 -1.68 0.02 - - - -
- - 3.9 - - - - - -0.11 1.02 1.97 2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.98
3.01 1.4 2.55 -0.07 1.91 - 1.44 - -1.22 -1.42 -1.76 -2.1 0.18 -3.65 - -2.25 - -1.27 2.95 1.01 - 2.22 - - - - - - - - - - - - 0.18 -1.01 -0.11 0.45 0.99 1.44 - 0.41 0.98 - 0.93 - - -0.81 0.12 - - -0.38 -2.17 - - - - -
- - - - - - - - 4.86 - - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.88 - - - - -
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.97 4.42 - - - - - - - - - - - - - - - 3.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.44 -0.6 - - - - -
4.72 3.5 4.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.91 2.74 3.72 - - - - - -1.26 0.01 1.23 1.01 - - - - - - 3.89 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.45 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.45 - - - 0.96 - - - - -0.33 - - - - - - - 2.19 - - - - - - -0.77 2.71 4.61 - 3.1 - -0.23 - - - 1.8 1.78 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.78 -0.43 -2.13 -1.58 -5.11 -2.91 -3.16 -2.58 -2.23 -2.74 -2.62 -2.06 -1.0 -2.24 -1.81 -1.97 1.55 -1.48 0.38 0.16 0.72 -1.87 3.13 2.59 2.15 -0.75 0.52 0.84 -1.92 -0.75 -0.15 -0.65 -0.8 -0.07 0.7 1.43 -0.66 -0.31 -0.72 0.21 -0.99 0.2 -1.05 -0.68 2.1 -2.05 -3.52 -2.13 -1.08 -1.99 0.21 -2.16 -0.95 -3.29 -2.0 -1.45 -0.86 -3.27
3.45 3.91 3.56 - - - - - 0.34 -0.02 -0.66 -0.37 - - - - - - - 2.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.36 - - - - 3.36
- - - 2.37 - - - - - - - - - - - - - 1.51 - 4.18 2.31 - - - - - 1.52 - - - - - 1.58 - - - - - - - - - - - - - - - 2.78 - - - -0.51 - 3.75 - - -
2.11 2.15 2.78 -1.99 - - - - - - - - 1.79 1.51 -0.17 -0.17 - -0.85 1.17 - - -1.94 - - - - - - - - - - - - 1.41 1.41 -0.05 0.9 0.99 -0.65 - 0.43 2.02 3.03 0.04 - - - 1.38 - - -0.36 0.75 -1.0 - - - -
3.7 3.36 2.79 - - - - - - -3.49 -5.47 -5.69 - - - - - - 4.05 3.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.55 - - - - 1.28
-0.43 -0.42 1.87 1.21 3.03 - 3.93 -3.98 -5.6 -4.53 -6.93 -7.14 2.44 -0.36 -0.55 0.4 - -0.84 - - - 1.8 - - - - -1.77 - - - - - - - - - - -0.62 - - 1.13 -1.16 - - - 0.91 - -0.67 2.26 - - -1.81 -0.06 0.2 - - - 0.52
2.48 - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.35 - 3.77 - - 0.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.53 2.95 - - - 0.42 - - - 2.5 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.43 -0.68 - - - - - - - - - - - - - -2.29 - - - - - - - - - - - - - -2.49 - - - - - - - - 2.37 -2.93 - - - 2.81 - 4.43 4.06 - -0.77 - 1.15 1.7 - - - -
- - - 3.07 - - - - - - - - - - - - - 1.46 - - - - 2.86 1.05 1.69 - - - - - - 1.39 - - - - - - - - - 0.41 - - - 3.54 - - - - 2.98 - 1.0 3.14 - - - -
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.27 -0.07 -0.21 2.62 3.25 - 2.0 -5.54 -6.0 -4.13 -6.6 -4.4 0.68 -0.62 0.02 -0.92 - -1.21 0.4 -1.44 -3.9 2.39 -4.2 -3.89 -4.91 -2.9 0.34 -2.11 -3.88 -2.15 - -3.6 -3.6 - -0.59 -2.37 0.29 0.19 0.36 0.81 0.35 -0.25 0.82 0.98 -0.22 1.08 - -1.41 0.74 -1.57 -0.71 0.09 0.31 -0.16 - - -3.43 -1.62
- -0.56 - -0.04 0.29 1.04 1.28 1.75 1.76 1.49 1.62 1.65 0.69 -2.23 -0.46 0.11 0.4 2.27 - - -1.88 - 0.33 0.45 -1.53 -1.48 0.13 -2.27 - - - 0.87 -0.57 - - - -0.98 -1.89 - -0.46 - -2.01 0.2 - - - - - -0.8 - - - -0.35 - - - - 3.75
- - 5.76 - - - - - - - 1.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.63 - - - - - - - - - - 0.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.47
2.96 3.06 1.08 - - - - - - - - - 0.14 1.86 - - - - 3.53 1.22 - 1.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.17 - - - - - - - - - 1.45 -0.33 1.05 - - - 3.65
2.61 - 4.46 - - - - - 0.89 2.26 2.59 2.57 - - - - - - 3.03 1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.85 - - - - - - - - - - 0.93 0.76 - - - - - 3.04 - -1.04 - - 1.15 - - - -1.12 - - - - 0.35 3.09 0.98 - 2.62 2.13 0.87 3.57 2.17 0.98 - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.77 4.67 - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.14 - - - - -
- 0.41 -4.76 1.05 -1.89 - -3.46 - -5.08 - - -4.45 -4.71 - - - 2.18 -0.15 -1.02 1.98 0.43 - 3.18 2.67 1.01 -0.95 1.26 -0.52 -3.78 0.06 -1.27 0.88 1.59 2.32 1.13 -1.0 - -2.75 - -2.45 - -1.78 - - - -0.24 - 1.78 -0.88 -2.42 - - -3.8 0.72 - - -2.53 -2.36
- - 0.84 1.89 0.86 - - -1.56 0.67 1.17 0.79 0.53 2.3 0.28 0.93 -0.55 - 2.53 - - - 3.11 - - - - - - - - - - - - - 1.03 1.81 -0.43 - 0.39 - 0.15 - - - -1.69 - - 2.07 - - -0.69 0.56 -1.08 - - - 2.16
3.11 - 2.79 - 3.74 - - - - - - - 2.18 - - - - 2.22 - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.71 - - - - - 2.95 - - - - 1.55 - - - - -
- - 2.97 1.26 2.17 - 3.17 - 2.29 0.35 1.03 -0.35 0.67 - 1.5 -0.19 - 1.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.42 - - 0.7 - - - 2.24 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.68 -2.47 2.05 -0.16 -2.47 -8.47 -3.48 -6.93 -7.57 -8.83 -8.8 -9.17 -1.33 0.56 -0.35 0.37 -1.0 -0.9 -1.02 -2.37 -0.29 0.94 -1.04 -0.64 -0.71 1.12 0.18 0.13 -0.25 -0.2 -0.67 -0.41 -0.46 -0.03 0.33 -0.34 -0.1 0.04 0.21 -0.23 -0.14 -0.1 0.09 -0.57 -0.3 1.23 0.39 -1.8 -2.3 -0.56 1.99 1.61 0.88 -0.4 -0.68 0.55 1.9 1.1
3.18 3.02 2.29 - - - - - 0.17 1.07 1.0 1.28 - - - - - - 3.27 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.55 - - - - 3.41
2.48 2.44 3.04 3.87 - - - - - - - - 1.38 0.16 2.5 1.95 - - - 1.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.16 - - - - - - 2.47 - - - 0.97 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.88 1.72 1.19 2.32 - - - - - -6.66 - -7.08 1.65 1.45 0.34 0.63 - -0.77 2.36 0.73 - 1.77 - - - - -1.37 - - - - - - 0.01 1.97 -0.05 -0.88 -1.9 - - - -0.5 1.32 - 0.71 1.44 - -2.0 1.29 - 0.64 0.28 0.61 0.05 - - - 0.7
-1.5 -2.88 -0.83 0.95 1.77 -6.7 -1.2 -4.2 -4.92 -6.15 -7.02 -6.04 -0.48 -1.01 -1.16 -1.2 -0.63 -0.39 -1.45 -2.66 -2.37 0.21 -1.55 -1.82 -2.2 1.8 0.37 -2.28 -2.55 -2.33 -1.8 -2.49 -2.24 0.77 -1.73 -1.84 0.13 0.21 -0.88 -0.51 0.12 -0.24 -1.93 -0.84 -0.54 2.32 -0.65 0.98 0.59 -0.89 -0.55 1.08 0.34 1.87 -0.14 1.47 1.65 2.44
3.01 1.3 0.8 0.38 1.19 - - -2.8 -3.64 -6.1 -5.61 -5.61 0.88 0.3 -0.09 0.33 - -0.43 2.33 0.93 - 1.16 - - - - -1.17 - - - - - - -0.27 -0.88 0.45 0.42 -0.04 - 1.4 - 0.45 0.07 2.29 -1.23 2.27 - -2.87 0.19 - -0.79 0.34 0.39 0.3 - - - -1.47
2.39 3.97 4.76 - - - - - -0.32 0.59 - - - - - - - - - 2.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.84 2.03 3.13 - - - - - - - - - - - - - - - 4.03 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.1 -2.54 - - - - -
- - 0.53 - - - - -2.15 - - - - - - - -1.19 - - 4.12 - - 1.24 0.77 1.81 -0.53 0.93 - - - - - - -0.52 3.65 2.9 - - - - - - - - - - - - - 2.9 - - - -2.07 - - - - -
3.44 2.7 2.03 1.08 -0.31 - - - -3.78 -4.88 -4.29 -4.55 0.23 -0.5 -1.03 -2.74 - -3.05 3.35 3.45 - 1.36 - - - - - - - - - -4.0 -3.12 - 0.39 - - - - - - -2.28 - - -0.39 -2.82 - -3.03 1.23 -1.93 - -2.15 -1.16 -1.0 - -0.64 - -
- - - 5.0 - - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.18 - - - - -
- - 4.31 - - - - - - 3.64 3.78 3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.4 3.16 0.08 - - - - - - - - -0.5 3.0 0.3 1.01 - -0.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.3 - - - 0.21 - -0.73 - -0.54 2.48 1.32 1.01 2.7 - 2.5 2.96 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.