Heatmap: Cluster_57 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.68 -0.94 -0.33 0.38 0.52 0.44 0.35 0.6 0.36 -0.0 0.08 -0.08 -1.4 -0.69 -1.01 -0.72 -0.95 -0.26 -0.39 -0.8 -3.31 1.66 -0.04 -0.05 0.93 0.37
0.04 -1.04 -0.68 -0.12 -0.24 -0.43 -0.29 0.01 0.14 0.01 0.22 0.2 0.14 0.08 -0.37 -0.18 -0.51 -0.16 -0.7 -0.97 -0.73 1.17 0.77 0.33 0.69 0.19
-0.13 -0.41 -0.45 0.08 -0.14 -0.63 -0.09 0.04 -0.07 0.06 0.32 0.2 -0.2 -0.54 -0.71 -0.51 -0.6 -0.0 -0.41 -0.36 -2.38 1.37 0.7 0.25 0.73 0.41
0.1 -0.04 0.01 0.4 0.55 0.41 0.33 0.34 0.19 -0.03 0.17 0.02 -0.27 -0.78 -1.89 -0.67 -1.54 -0.21 -0.89 -1.21 -2.25 1.06 0.33 -0.02 0.93 0.18
0.14 -1.24 -1.43 0.13 -0.08 -0.74 -0.33 -0.43 0.04 0.29 1.1 0.68 -0.05 -2.51 -2.46 -3.04 -1.52 -0.4 -1.13 -2.12 -2.37 1.32 0.04 1.52 1.35 0.62
-0.31 -0.4 -0.31 0.3 0.52 -0.29 -0.01 0.14 -0.11 0.08 0.22 -0.0 -0.12 -0.82 -1.61 -0.79 -0.85 -0.23 -1.02 -0.91 -1.59 1.95 0.05 -0.09 0.78 0.26
-0.46 -0.89 -0.99 -0.66 -0.66 -0.78 -0.48 -0.32 -0.0 0.02 0.38 -0.04 -0.34 -0.01 -0.49 -0.13 -0.89 0.29 -0.68 -0.79 -0.69 1.89 0.56 0.51 0.75 0.37
0.14 -0.06 -1.2 0.06 -0.71 -2.97 -0.1 0.57 0.05 0.53 0.93 0.1 0.55 -0.58 -1.27 -1.34 -0.12 0.14 -0.75 -1.31 -1.85 1.77 -2.34 -1.59 1.08 0.62
-0.93 -0.8 -0.79 -0.54 -0.34 -0.47 -0.2 -0.24 0.1 0.32 0.34 0.15 -1.03 -0.37 -0.52 -0.5 -0.53 0.75 -0.4 -0.51 -0.45 1.4 0.47 0.29 0.86 0.52
-1.29 -2.24 -1.81 -0.57 -0.3 -0.25 0.32 0.7 0.9 0.56 0.58 0.2 -1.67 -0.37 -1.47 -0.39 -1.06 -0.2 -0.98 -1.73 -1.72 2.1 -0.36 0.67 0.53 0.18
-0.65 -0.83 -0.69 -0.13 -0.34 -0.69 -0.38 -0.12 0.09 0.13 0.03 0.03 -0.36 -0.29 -0.46 -0.14 -0.29 -0.22 -0.52 -0.89 -1.09 1.74 0.48 0.74 0.78 0.3
-1.9 -1.16 -1.26 -0.05 -0.02 -0.25 -0.03 0.2 0.23 0.27 -0.1 -0.56 -2.33 -0.01 -0.47 -0.05 -0.89 -0.05 -0.23 -1.26 -0.79 1.5 0.79 0.35 1.34 0.42
0.09 -0.27 -0.59 0.11 0.02 -0.79 -0.39 -0.23 -0.42 -0.58 -0.3 -0.53 -0.49 -0.65 -0.04 -0.47 -0.55 -0.04 -0.47 -0.86 -0.63 1.53 0.13 0.19 1.49 0.75
-0.06 -0.86 -0.99 -0.11 -0.36 -1.12 -0.4 -0.1 -0.2 0.04 0.19 0.11 -0.01 -0.47 -1.22 -0.63 -1.44 -1.0 -1.42 -1.26 -1.48 1.72 0.9 0.97 1.09 0.97
0.09 -0.5 -1.06 -0.8 -0.22 -0.41 -0.08 -0.02 0.17 -0.24 -0.05 -0.22 0.01 -0.57 -1.01 -0.93 -0.72 0.26 -0.21 -1.05 -1.73 1.54 0.69 0.51 0.97 0.82
0.29 -0.73 -1.22 -0.41 -0.04 -0.71 0.01 0.11 0.23 -0.01 0.26 -0.29 0.22 -0.84 -1.59 -1.17 -1.33 0.2 -0.66 -1.13 -1.57 1.65 0.3 0.09 1.16 1.01
0.76 -0.64 -1.15 -0.04 -0.02 -0.57 -0.33 -0.36 -0.69 -0.11 0.39 0.43 1.1 -0.85 -1.73 -1.47 -1.67 -0.38 -0.83 -0.74 -1.94 1.84 0.24 0.16 0.97 0.14
-0.52 -1.02 -1.12 -0.1 0.02 -0.0 0.07 -0.15 -0.46 -0.21 0.14 0.26 -0.31 -0.16 -0.65 -0.07 -0.62 -0.68 -0.86 -1.14 -0.87 2.03 0.15 0.37 0.88 0.18
0.03 -0.6 -0.69 0.43 0.09 0.0 -0.15 0.08 0.21 0.01 0.25 0.07 -0.39 -0.37 -0.61 -0.57 -1.01 -0.67 -0.8 -1.41 -0.88 1.37 0.22 0.41 1.02 0.43
0.09 -0.22 -0.56 -0.57 -0.3 -0.38 -0.5 -0.47 -0.22 -0.1 0.23 -0.2 -0.23 -0.79 -0.3 -1.01 -1.73 -0.39 -0.52 -2.16 -3.2 1.84 1.19 1.39 0.54 0.16
0.11 -1.44 -1.64 0.23 -0.08 -0.89 0.02 0.36 0.45 -0.03 0.24 -0.42 -0.55 -1.15 -2.39 -2.75 -2.21 -0.36 -1.53 -2.4 -0.22 1.96 0.85 -0.55 1.71 0.56
-0.1 -0.99 -0.6 -0.02 -0.51 -0.73 -0.05 0.11 -0.69 -1.42 -0.94 -1.11 -1.64 -0.24 -0.3 -0.03 0.04 -0.66 -0.4 -0.57 -1.47 1.95 0.85 0.02 1.56 0.62
-0.11 -0.72 -0.5 0.59 0.2 -0.95 -0.24 0.31 -0.4 0.13 0.62 0.42 -0.94 -1.4 -2.17 -1.69 -0.83 -0.24 -1.1 -1.28 -4.38 1.7 -0.52 0.32 1.5 0.98
-1.12 -1.12 -1.72 -1.12 -1.37 -2.54 -1.24 -1.86 -1.38 -1.1 -0.51 -0.24 -1.56 -1.01 -1.34 -0.54 -1.22 -0.07 -1.25 -1.38 -1.54 2.7 1.25 0.94 1.78 0.97
-0.14 -0.36 -0.65 0.15 0.44 0.1 0.69 0.46 0.5 0.13 0.28 -0.18 -0.13 -0.9 -0.85 -0.89 -0.83 -0.3 -0.62 -0.7 -2.98 1.52 -0.16 -0.39 0.65 0.19
0.25 -1.12 -1.43 -0.68 0.27 -0.98 0.33 0.45 -0.33 0.78 0.92 -0.34 -0.91 -1.86 -1.26 -2.23 -1.5 0.33 -1.72 -1.4 - 1.75 0.11 -0.61 1.78 0.63
-1.42 -1.62 -1.7 -0.27 -0.42 -0.81 -0.33 -0.03 0.13 -0.08 0.36 -0.26 -1.55 -0.31 -0.93 -0.23 -0.94 -0.15 -1.07 -0.88 -0.47 2.08 0.86 0.8 1.03 0.49
-2.4 -1.33 -1.45 -0.25 -0.29 -0.7 0.03 0.04 0.04 -0.35 -0.4 -1.01 -3.12 -0.46 -0.51 -0.37 -0.49 0.27 -0.07 -0.93 -2.1 2.27 0.72 0.34 1.23 0.71
-0.52 -0.55 -0.55 -0.14 -0.07 -0.39 -0.15 -0.05 -0.09 0.04 0.07 -0.09 -0.12 -0.36 -0.18 -0.38 -0.92 0.2 -0.41 -0.92 -0.33 1.23 0.52 0.55 0.81 0.47
-0.39 -0.22 -0.41 0.17 0.44 0.07 0.1 0.06 -0.1 0.18 0.08 -0.05 -0.4 0.06 -1.26 -0.34 -0.81 -0.44 -0.6 -0.79 -1.05 1.1 0.59 0.27 0.72 0.45
-0.1 -0.21 -0.43 -0.25 -0.04 0.04 0.03 0.03 -0.13 -0.25 0.01 -0.29 -0.18 -0.6 -0.89 -0.65 -0.57 0.38 -0.44 -0.62 -1.31 1.55 0.17 0.36 0.56 0.78
0.4 0.04 -0.3 0.72 0.36 -0.56 0.04 0.51 0.38 0.59 0.74 0.34 0.19 -1.25 -2.23 -2.01 -1.64 -0.61 -1.45 -1.2 -3.49 1.93 -1.64 -0.53 0.39 0.03
0.33 0.18 -0.15 0.54 0.26 -0.42 0.08 0.48 0.44 0.52 0.59 0.32 0.29 -1.34 -1.93 -1.93 -1.58 -0.67 -1.11 -1.18 -3.78 2.0 -2.14 -0.6 0.52 -0.11
-1.14 -0.78 -0.69 0.59 0.34 -0.41 0.12 0.17 0.32 0.59 0.78 0.33 -1.39 -1.09 -2.18 -1.47 -1.65 -0.82 -0.81 -1.23 -3.4 2.11 0.26 0.35 0.81 -0.11
-0.93 -0.81 -0.82 -0.12 -0.1 -0.41 0.25 0.12 0.39 0.25 0.4 0.19 -0.9 -0.15 -0.54 -0.02 -0.47 -0.31 -0.65 -0.84 -1.07 1.21 0.47 0.27 1.1 0.18
0.11 -0.88 -1.17 0.44 0.19 -0.61 -0.3 0.06 0.09 0.56 1.1 0.78 0.26 -1.12 -1.93 -1.72 -2.09 -1.1 -1.82 -2.25 -1.83 1.33 0.2 0.38 1.26 0.57
-0.06 -0.74 -0.76 -0.04 -0.14 -0.8 -0.22 -0.14 -0.09 0.31 0.73 0.46 -0.22 -2.16 -1.97 -2.9 -1.21 -0.73 -1.11 -1.18 -1.19 1.43 0.59 1.01 1.33 0.88
-0.52 -1.1 -0.63 0.1 0.02 -0.26 -0.27 -0.26 0.08 0.24 0.36 -0.09 -0.79 -0.11 -0.78 -0.09 -0.9 -0.37 -0.39 -0.65 -1.58 1.55 0.5 0.42 0.99 0.47
-0.45 -0.88 -0.93 -0.18 0.21 -0.25 -0.13 0.11 -0.03 0.11 0.28 -0.01 -0.52 -0.22 -0.42 -0.56 -0.77 -0.75 -0.7 -0.94 -2.1 2.07 0.43 0.23 0.85 0.01
-0.07 -0.27 -0.48 0.22 0.74 0.47 0.5 0.36 0.42 0.12 0.31 -0.06 -0.55 -1.34 -1.63 -1.39 -1.56 -0.21 -0.39 -0.86 -6.35 1.72 0.04 -0.11 0.41 0.12
-0.95 -0.76 -0.87 -0.32 0.06 -0.4 -0.15 0.09 0.26 0.17 0.29 -0.17 -1.46 0.35 -0.71 -0.26 -0.64 -0.91 -1.0 -0.89 -2.7 1.45 0.86 0.4 1.1 0.92
-0.02 -1.14 -1.21 0.17 -0.19 -0.59 -0.16 -0.0 0.49 0.24 0.42 -0.04 -0.17 -0.3 -1.19 -0.54 -2.08 0.09 -0.8 -1.73 -1.59 1.79 0.49 0.29 0.6 0.8
-0.05 0.08 -0.35 0.3 -0.18 0.01 -0.25 -0.05 -0.12 0.08 0.31 0.37 0.19 -1.05 -1.13 -1.25 -1.79 -0.12 -0.75 -1.7 -3.06 1.68 0.33 -0.44 1.24 0.55
-0.87 -2.14 -0.96 0.62 0.15 -0.88 -1.43 -0.94 -0.57 -0.23 0.51 0.27 -0.83 -1.63 -1.88 -2.99 -2.0 -0.9 -0.95 -1.94 -2.55 2.07 0.71 1.23 1.53 1.25
-0.28 -1.48 -0.59 0.55 0.37 -0.52 -0.69 -0.64 -0.38 0.13 0.43 0.51 -0.5 -0.65 -0.85 -1.55 -1.02 -0.3 -0.4 -0.77 -2.76 1.58 0.58 0.57 0.93 0.92
-0.81 -0.38 -0.87 -0.01 0.3 0.05 0.31 0.39 0.63 0.38 0.4 0.23 -0.98 -0.8 -1.05 -0.76 -1.05 -0.02 -0.73 -1.21 -1.97 1.84 0.01 0.15 0.48 -0.04
-0.58 -1.3 -1.02 -0.09 0.05 -0.21 0.07 0.07 0.38 0.65 0.81 0.63 0.11 -0.83 -2.03 -0.97 -1.06 -0.99 -1.32 -1.72 -0.54 1.25 0.73 1.07 0.16 0.36
-0.35 -0.79 -0.84 -0.15 -0.32 -0.85 -0.12 0.13 -0.03 -0.07 0.08 -0.26 -0.74 -0.26 -0.89 -0.21 -0.7 -0.32 -0.36 -0.57 -0.62 1.87 -0.24 0.11 0.99 1.05
0.02 -0.44 -0.38 0.16 0.18 0.12 0.27 0.16 0.15 -0.16 -0.01 0.1 0.19 -0.87 -1.05 -0.58 -0.66 0.05 -0.23 -0.61 -1.17 1.65 -0.29 -0.23 0.56 0.01
-1.28 -0.59 -0.87 -0.11 0.07 -0.28 -0.09 0.23 0.16 0.09 0.27 0.01 -1.79 -1.06 -1.33 -0.83 -0.71 -0.27 -0.07 -0.73 -4.15 1.89 0.39 0.49 1.25 0.58
0.36 -0.05 -0.46 -0.08 -0.36 -0.54 -0.03 0.23 0.23 0.2 0.31 0.37 0.46 -0.36 -0.92 -0.43 -1.08 -0.2 -0.7 -0.9 -1.7 1.45 -0.18 -0.28 0.74 0.32
-0.5 -0.67 -0.52 -0.19 -0.25 -0.82 -0.37 -0.2 -0.28 -0.0 0.02 -0.04 -0.35 0.25 -0.35 -0.0 -0.75 0.09 -0.3 -0.61 -0.29 1.67 -0.14 0.29 0.65 0.71
-2.47 -2.38 -1.72 -0.51 -0.47 -0.94 0.04 -0.36 0.17 -0.15 0.36 -0.42 -3.39 -0.52 -1.46 -0.45 -1.04 0.06 -0.97 -1.63 -0.77 2.65 0.6 0.42 0.58 1.04
-0.64 -0.36 -0.46 -0.46 -0.3 -0.61 -0.28 -0.15 0.29 0.58 0.57 0.72 -0.14 -0.63 -1.22 0.12 -0.95 -0.53 -0.78 -1.49 -3.35 1.79 -1.01 0.44 1.18 0.27
-0.38 -0.93 -1.22 -0.35 -0.56 -1.24 -0.59 -0.35 -0.18 -0.16 0.08 -0.1 -0.35 0.25 -0.59 -0.04 -1.07 -0.16 -0.99 -1.15 -0.95 1.72 0.65 0.94 1.28 0.6
-0.66 -1.26 -1.54 0.39 -0.19 -0.92 -0.31 0.35 0.26 0.74 1.0 0.46 -1.28 -3.33 -3.01 -3.18 -1.97 -1.55 -2.32 -2.17 -2.26 1.65 0.4 0.83 1.8 0.9
0.37 -0.1 -0.98 -0.29 -0.95 -1.39 -0.77 -0.5 -0.36 -0.14 0.44 0.33 0.35 -0.96 -0.98 -0.44 -1.39 -0.27 -0.8 -1.71 -0.67 2.0 -0.03 0.45 1.08 0.8
-4.36 -5.13 -3.27 -1.07 -0.23 -0.2 0.44 0.31 0.57 0.39 0.48 -0.06 -5.16 -2.05 -1.77 -2.01 -1.13 -0.07 -0.8 -1.42 -2.84 2.1 1.05 0.93 1.53 0.51
0.25 -1.28 -0.99 -0.78 -0.25 -0.33 0.23 0.41 0.02 0.16 0.42 0.46 0.52 -0.76 -1.49 -1.03 -0.91 -0.58 -0.81 -0.66 -1.68 1.4 -0.07 0.08 1.28 0.73
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0.2 -0.87 -0.77 0.07 0.15 -0.26 -0.4 0.01 -0.24 -0.42 0.01 -0.11 -0.26 -0.67 -1.18 -0.67 -0.56 0.05 -0.8 -0.54 -0.05 1.63 -0.02 0.38 1.11 0.49
-0.05 -0.42 -0.26 0.15 0.12 -0.24 0.21 0.4 0.21 0.54 0.69 0.57 0.21 -1.14 -1.42 -1.44 -0.92 -0.73 -0.75 -0.68 -2.13 1.11 -0.1 0.21 0.77 0.43
-0.97 -1.41 -2.22 -0.03 -0.7 -1.0 -1.17 -0.29 -1.62 -2.7 -1.23 -3.05 -4.56 -3.27 -2.07 -2.75 -1.96 0.03 -1.09 -2.19 -1.18 3.02 1.6 0.28 1.64 1.07
0.55 -0.97 -0.79 0.21 -0.3 -0.47 -0.42 0.02 -0.38 0.1 0.21 0.12 -0.78 -0.82 -1.66 -1.18 -1.67 -0.29 -0.74 -0.95 -2.61 1.83 0.49 0.0 1.5 0.86
-0.28 -0.51 -0.52 -0.18 -0.13 0.04 -0.31 -0.16 0.17 0.22 0.35 0.26 -0.14 -0.87 -0.91 -0.78 -0.99 0.17 -0.54 -0.66 -0.78 1.75 -0.23 -0.22 0.82 0.63
0.41 -0.54 -0.87 0.1 0.31 -0.04 0.3 0.4 0.02 0.26 0.4 -0.24 -0.03 -1.03 -0.81 -0.94 -0.53 -0.48 -0.21 -0.75 -4.33 1.63 0.12 -0.37 0.93 -0.19
-0.14 -0.66 -0.64 -0.35 -0.91 -1.56 -0.85 -0.46 -0.39 -0.03 0.4 0.35 -0.18 -0.22 -0.24 -0.61 -0.5 -0.39 -0.67 -0.7 -0.86 1.88 0.52 0.76 0.77 0.6
-2.14 -1.41 -1.25 0.53 0.39 0.01 0.44 0.55 0.61 0.25 0.41 -0.4 -2.74 -1.28 -1.45 -1.31 -1.15 -0.62 -0.71 -0.95 -3.47 1.89 0.38 0.25 1.2 0.52
-0.49 -0.64 -0.32 0.05 -0.08 -0.72 -0.56 -0.44 -0.21 -0.09 0.24 0.21 -0.36 -0.65 -1.34 -1.04 -1.07 -0.42 -1.47 -1.45 -0.66 1.91 0.59 0.51 1.26 0.8
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-0.16 -0.74 -1.18 0.84 0.65 -0.58 -0.12 -0.21 -0.3 0.4 0.39 0.26 0.1 -0.27 -1.57 -0.78 -1.44 -1.08 -2.15 -2.14 -1.08 1.69 -0.08 0.18 0.74 1.03
-1.04 -0.68 -0.65 -0.23 -0.07 -0.11 -0.15 -0.04 -0.05 -0.04 0.08 -0.11 -0.67 -0.65 -0.15 -0.7 -0.9 0.41 -0.23 -0.98 0.01 1.56 0.62 0.2 0.98 0.13
0.19 -0.45 -0.72 -0.25 0.14 -0.1 -0.07 0.17 0.04 0.33 0.29 -0.15 -0.4 -0.58 -0.64 -0.83 -0.61 -0.12 0.04 -0.03 -4.6 1.34 0.26 0.61 0.39 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.