Heatmap: Cluster_104 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.01 0.01 0.05 0.07 0.1 0.11 0.12 0.1 0.15 0.15 0.16 0.15 0.01 0.11 0.07 0.12 0.07 0.08 0.08 0.07 0.25 0.11 1.0 0.26 0.12 0.13
0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.09 0.03 1.0 0.06 0.04 0.04
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.06 0.09 0.05 0.06 0.02 0.01 0.07 0.04 0.05 0.01 0.06 0.02 0.03 0.06 0.01 1.0 0.22 0.07 0.17
0.09 0.04 0.02 0.02 0.06 0.1 0.13 0.11 0.16 0.18 0.18 0.2 0.07 0.11 0.06 0.07 0.08 0.13 0.09 0.09 0.09 0.14 1.0 0.2 0.15 0.13
0.14 0.19 0.09 0.12 0.09 0.08 0.1 0.14 0.15 0.12 0.19 0.2 0.09 0.06 0.05 0.05 0.06 0.12 0.12 0.07 0.18 0.04 1.0 0.17 0.16 0.11
0.02 0.02 0.04 0.1 0.12 0.12 0.12 0.14 0.18 0.15 0.14 0.13 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.08 0.05 0.06 0.08 0.04 1.0 0.2 0.12 0.07
0.04 0.04 0.03 0.05 0.05 0.03 0.02 0.03 0.05 0.05 0.06 0.04 0.02 0.04 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.03 1.0 0.13 0.04 0.05
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.14 0.09 1.0 0.09 0.05 0.05
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.01 0.04 0.02 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.05 1.0 0.09 0.05 0.04
0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.05 0.05 0.02 0.17 0.04 1.0 0.09 0.04 0.06
0.01 0.02 0.03 0.05 0.06 0.07 0.07 0.08 0.1 0.1 0.1 0.09 0.0 0.05 0.03 0.04 0.06 0.07 0.05 0.05 0.07 0.09 1.0 0.15 0.15 0.11
0.08 0.08 0.05 0.07 0.05 0.03 0.05 0.05 0.06 0.04 0.07 0.04 0.14 0.01 0.02 0.01 0.09 0.03 0.03 0.02 0.07 0.01 1.0 0.01 0.07 0.03
0.05 0.07 0.07 0.09 0.13 0.14 0.17 0.14 0.17 0.15 0.15 0.16 0.04 0.05 0.11 0.06 0.1 0.16 0.14 0.11 0.08 0.13 1.0 0.3 0.2 0.09
0.11 0.14 0.11 0.12 0.14 0.15 0.13 0.11 0.12 0.12 0.14 0.13 0.1 0.08 0.13 0.11 0.1 0.19 0.16 0.09 0.14 0.07 1.0 0.3 0.08 0.09
0.07 0.04 0.06 0.05 0.05 0.08 0.05 0.06 0.06 0.11 0.09 0.08 0.05 0.09 0.06 0.07 0.08 0.12 0.13 0.12 0.23 0.03 1.0 0.22 0.1 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.14 0.0 0.12 0.08 0.12 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0
0.1 0.04 0.06 0.09 0.19 0.16 0.25 0.2 0.18 0.09 0.08 0.06 0.07 0.04 0.03 0.07 0.08 0.15 0.13 0.09 0.2 0.06 1.0 0.16 0.3 0.1
0.14 0.21 0.23 0.23 0.17 0.14 0.13 0.16 0.18 0.19 0.18 0.18 0.16 0.05 0.07 0.07 0.12 0.16 0.13 0.16 0.04 0.14 1.0 0.17 0.13 0.1
0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.04 0.03 0.04 0.05 0.05 0.04 0.01 0.12 0.15 0.04 0.04 0.06 0.03 0.04 0.13 0.02 1.0 0.23 0.06 0.09
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.06 0.04 0.04 0.01 0.14 0.14 0.07 0.05 0.05 0.03 0.03 0.14 0.02 1.0 0.19 0.06 0.08
0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.04 0.04 0.03 0.05 0.04 0.03 0.01 0.1 0.1 0.02 0.03 0.05 0.03 0.02 0.15 0.03 1.0 0.25 0.12 0.07
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.03 0.02 0.04 0.05 0.03 0.01 0.08 0.09 0.03 0.04 0.03 0.04 0.02 0.12 0.03 1.0 0.16 0.06 0.06
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.05 0.05 0.04 0.01 0.08 0.1 0.03 0.04 0.02 0.02 0.01 0.13 0.02 1.0 0.2 0.07 0.06
0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.06 0.05 0.02 0.05 0.06 0.06 0.06 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.04 0.03 0.02 0.08 0.05 1.0 0.2 0.02 0.03
0.04 0.06 0.05 0.07 0.07 0.09 0.08 0.06 0.08 0.06 0.07 0.06 0.02 0.06 0.06 0.05 0.06 0.1 0.1 0.07 0.28 0.11 1.0 0.23 0.12 0.11
0.09 0.03 0.04 0.07 0.09 0.09 0.08 0.09 0.11 0.08 0.1 0.1 0.09 0.04 0.06 0.05 0.04 0.05 0.05 0.03 0.18 0.07 1.0 0.24 0.11 0.09
0.05 0.09 0.1 0.17 0.15 0.11 0.17 0.16 0.24 0.19 0.17 0.13 0.03 0.11 0.13 0.15 0.13 0.18 0.17 0.15 0.1 0.21 1.0 0.17 0.18 0.16
0.17 0.11 0.07 0.04 0.05 0.09 0.15 0.18 0.15 0.13 0.11 0.1 0.15 0.06 0.07 0.05 0.1 0.15 0.12 0.13 0.16 0.05 1.0 0.15 0.14 0.09
0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.04 0.05 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.0 0.11 0.02 1.0 0.19 0.23 0.09
0.08 0.05 0.06 0.07 0.08 0.11 0.1 0.11 0.15 0.16 0.2 0.21 0.09 0.09 0.09 0.11 0.1 0.13 0.13 0.13 0.25 0.12 1.0 0.38 0.17 0.16
0.03 0.01 0.03 0.08 0.11 0.08 0.12 0.1 0.15 0.17 0.19 0.15 0.05 0.08 0.09 0.08 0.06 0.12 0.12 0.07 0.19 0.14 1.0 0.25 0.14 0.08
0.11 0.07 0.05 0.05 0.06 0.06 0.08 0.08 0.1 0.11 0.13 0.14 0.08 0.06 0.08 0.06 0.07 0.09 0.1 0.06 0.19 0.05 1.0 0.26 0.13 0.15
0.05 0.17 0.16 0.14 0.13 0.12 0.14 0.16 0.15 0.1 0.09 0.06 0.03 0.04 0.11 0.03 0.09 0.17 0.28 0.1 0.07 0.06 1.0 0.07 0.06 0.05
0.06 0.09 0.09 0.11 0.13 0.12 0.13 0.13 0.2 0.22 0.26 0.3 0.08 0.07 0.05 0.08 0.07 0.1 0.09 0.09 0.11 0.14 1.0 0.36 0.16 0.14
0.06 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.06 0.05 0.07 0.06 0.05 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 0.19 0.06 1.0 0.12 0.08 0.05
0.05 0.05 0.05 0.05 0.07 0.05 0.04 0.06 0.06 0.06 0.06 0.08 0.07 0.03 0.04 0.03 0.04 0.07 0.04 0.02 0.08 0.08 1.0 0.22 0.13 0.09
0.04 0.04 0.0 0.01 0.05 0.0 0.09 0.02 0.06 0.01 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.07 0.0 1.0 0.02 0.01 0.0
0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.05 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.09 0.01 1.0 0.08 0.06 0.05
0.01 0.04 0.09 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.07 0.07 0.05 0.0 0.1 0.14 0.05 0.05 0.0 1.0 0.11 0.03 0.09
0.01 0.02 0.06 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.0 0.04 0.04 0.01 0.06 0.02 1.0 0.1 0.08 0.04
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.14 0.02 0.02 0.04 0.04 0.01 0.05 0.02 1.0 0.07 0.03 0.04
0.13 0.13 0.11 0.14 0.16 0.15 0.15 0.12 0.13 0.14 0.14 0.16 0.11 0.16 0.15 0.16 0.13 0.12 0.17 0.12 0.09 0.1 1.0 0.17 0.14 0.14
0.16 0.07 0.05 0.09 0.06 0.07 0.07 0.11 0.19 0.11 0.25 0.28 0.14 0.03 0.08 0.05 0.03 0.1 0.1 0.08 0.09 0.06 1.0 0.06 0.12 0.03
0.07 0.1 0.09 0.1 0.12 0.12 0.13 0.13 0.14 0.2 0.23 0.25 0.06 0.11 0.09 0.13 0.11 0.11 0.11 0.09 0.11 0.1 1.0 0.33 0.19 0.14
0.01 0.02 0.03 0.03 0.09 0.1 0.07 0.06 0.04 0.03 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.05 0.02 0.07 0.06 0.03 0.03 0.02 1.0 0.07 0.08 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.24 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0
0.11 0.04 0.03 0.04 0.04 0.05 0.1 0.11 0.12 0.15 0.18 0.15 0.1 0.02 0.04 0.03 0.05 0.07 0.06 0.06 0.13 0.01 1.0 0.3 0.12 0.05
0.07 0.05 0.05 0.09 0.07 0.06 0.08 0.07 0.09 0.06 0.08 0.08 0.05 0.03 0.04 0.03 0.03 0.06 0.05 0.05 0.21 0.12 1.0 0.19 0.18 0.08
0.01 0.04 0.03 0.05 0.07 0.08 0.11 0.08 0.12 0.11 0.12 0.1 0.02 0.05 0.05 0.05 0.05 0.1 0.06 0.04 0.14 0.17 1.0 0.31 0.15 0.11
0.06 0.06 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.09 0.07 0.04 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.05 0.09 0.03 0.04 0.0 1.0 0.05 0.0 0.09
0.03 0.02 0.02 0.07 0.06 0.06 0.04 0.07 0.09 0.07 0.1 0.06 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.19 0.14 1.0 0.26 0.15 0.1
0.1 0.1 0.13 0.12 0.06 0.03 0.04 0.06 0.04 0.05 0.07 0.07 0.07 0.1 0.1 0.08 0.06 0.09 0.08 0.08 0.15 0.07 1.0 0.14 0.13 0.21
0.06 0.06 0.05 0.07 0.07 0.1 0.07 0.07 0.09 0.08 0.09 0.12 0.05 0.04 0.06 0.04 0.05 0.07 0.09 0.05 0.22 0.04 1.0 0.18 0.11 0.07
0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.02 0.04 0.02 0.05 0.03 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.17 0.01 1.0 0.05 0.03 0.02
0.04 0.08 0.11 0.11 0.13 0.15 0.13 0.12 0.16 0.17 0.15 0.2 0.04 0.07 0.09 0.14 0.11 0.18 0.18 0.13 0.09 0.02 1.0 0.27 0.11 0.17
0.03 0.07 0.04 0.11 0.07 0.05 0.05 0.08 0.05 0.05 0.08 0.07 0.02 0.04 0.05 0.03 0.03 0.08 0.07 0.04 0.22 0.06 1.0 0.1 0.13 0.1
0.02 0.08 0.11 0.13 0.14 0.12 0.14 0.13 0.14 0.14 0.14 0.15 0.02 0.12 0.13 0.13 0.11 0.15 0.13 0.1 0.24 0.2 1.0 0.25 0.18 0.17
0.01 0.04 0.06 0.06 0.09 0.05 0.08 0.1 0.07 0.1 0.09 0.07 0.02 0.04 0.06 0.05 0.04 0.06 0.07 0.08 0.05 0.02 1.0 0.11 0.08 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)