Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.77 - - - 1.73 - - - - -
- - - - 4.36 - - - -1.54 - - - - 2.71 1.74 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.66 - - - 4.06 - - - -1.41 - - - - -
- - - 3.89 - - - - -0.81 - - - 0.98 3.45 4.33 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.8 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.76 - - - - - - - - -
- - - 3.65 - - - - - - - - 5.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.77 - - - - - - -0.28 - - - - -
- - - 4.43 - 1.08 - - -1.42 - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.83 - - - - - - - - - - -1.16 - - - - - - 4.04 - - - 1.09 - - - - -
- - - 5.03 - - - - - - - - - 3.72 - 3.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.55 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.16 - - 4.49 - - - - 2.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - - - -0.82 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.62 - - - 2.39 - - - - -
- - - 5.4 - - - - - - - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.1 - - - - - - 2.88 - - - - - - - - -
- - - 3.68 - - - - - - -0.0 - 5.02 1.78 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.93 - - - - - - - - -
0.15 0.28 1.86 0.97 - - - - - - - - 0.75 -1.0 - - - 0.39 - - - - 0.04 -1.56 -0.45 0.03 1.7 1.78 0.82 1.4 - 0.47 -0.06 - - - - - 2.95 2.37 - -0.48 - - - 0.91 - 2.37 2.37 - - -0.02 1.68 - - - - -
- -4.3 - - - - - 0.49 0.44 - - - - -2.97 - -1.83 0.64 - - - -2.73 - - -0.22 0.03 -1.69 -1.04 -3.4 - 0.23 - -1.96 -0.97 - -2.33 - - - - - - -1.57 1.98 - - 4.94 -1.45 -2.19 0.15 -0.29 -2.49 - 3.38 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - - 5.05 - - - - - - - - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.51 - - - - -
- - - 5.21 - - - - - - - - 2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - 1.42 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.77 - - - 1.73 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.39 - - - - - - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.85 - - - -0.65 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.18 4.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.57 1.83 - - - -1.22 - - - 1.63 0.01 - -12.99 - -1.53 - - - 2.59 - - - - 2.36 - - - - - - - -1.47 - - - - - - -5.55 1.65 - - 2.83 - - 1.92 - - - 4.03 -0.08 - - - -0.39
- - - 4.23 2.58 - - 0.49 - - - - - 0.03 3.18 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - - - -0.79 - - - - -
2.43 1.86 0.15 2.43 - - - - - - - - 1.94 1.3 -0.14 -0.97 - -0.68 1.83 1.11 - -1.35 -2.21 -1.39 - - - - - - -0.94 -2.03 - - - - - - - 0.62 - - - - - 4.01 - 0.13 1.42 - - -1.71 1.72 - - - - 0.79
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - 2.43 - - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.0 - - - - - - - - -
-0.45 1.33 -1.72 -2.11 -2.12 - - -3.48 -2.4 -2.29 -2.07 -1.51 - -2.41 -3.6 -4.13 -2.2 -1.55 - - -2.35 0.19 - -2.72 -4.38 0.05 -0.51 -3.71 -1.65 - - -2.12 -1.44 - 2.42 0.11 0.42 0.14 0.88 0.61 - -0.04 1.77 - 1.24 1.92 -1.78 2.76 0.87 - - -0.34 2.29 3.3 -0.96 - - -
-5.04 -6.07 -2.24 -3.2 -3.09 - - -11.2 -9.61 -9.48 - - -5.29 -7.28 -6.2 -7.72 -1.32 -3.12 -6.72 -4.23 -1.92 - -1.62 -2.02 -2.89 -7.12 -9.11 -0.61 -1.4 -1.33 0.12 -0.65 0.17 -0.55 -1.55 -5.0 -5.25 -7.16 -4.21 -6.58 - -5.88 -6.21 - -4.0 2.27 -2.12 3.33 2.09 -3.46 -1.37 -0.71 2.47 1.67 2.18 2.93 0.81 2.87
- -7.82 -0.55 -4.75 -5.64 - - -7.14 -10.73 - - - 0.38 2.99 2.12 2.41 -0.04 -2.29 -5.58 -4.29 -3.68 -6.57 -4.21 -4.41 -3.7 -8.14 - -3.79 -2.99 -3.33 -1.44 -1.68 -0.58 2.4 2.02 -4.79 - - - - - -5.88 - - -4.28 1.64 -1.15 -4.37 -7.86 -3.07 -4.42 -0.04 4.37 -7.11 -5.92 -2.31 -3.06 -6.78
- -1.27 0.52 0.97 - - - 0.56 -1.63 - - - -2.51 3.39 3.34 3.07 -1.59 -2.44 - -1.37 -0.02 3.59 - - -2.97 -1.62 - - - -0.97 - -3.17 -1.41 - 0.6 - - - - - - - - - - -0.27 -1.37 - -0.36 -1.3 - 1.37 -0.32 - - -0.86 - -
- - - - - - 2.3 - 0.44 - - 0.69 1.06 - - - - - - 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 2.86 - - - 1.45 4.17 - - - -
0.42 0.13 0.46 4.01 0.14 - 0.85 - -4.21 - - - 2.61 -2.79 - -3.05 - - - -0.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.7 - - - 2.23 - - 3.73 - - 1.56 2.65 -1.79 - - - -
- - -3.54 - - -2.24 -1.08 0.42 0.25 -0.24 -0.29 -0.33 - 3.05 0.33 1.02 2.52 0.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.58 - - -1.53 4.51 - - -0.67 - - - 3.33 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.25 5.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - 0.34 -0.88 - - - - - - - - -2.1 -4.28 -0.97 -2.48 -1.92 - -1.64 - - - - - - - - - - - - -2.76 - - -23.12 - - - - - -4.18 - - -1.72 3.46 -25.39 - -0.31 - - - 5.4 - - - - -
4.8 - - - - - - - - - - - 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.23 - - - - - - 4.33 - - - - - - - - -
- - - 5.05 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.19 - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.02 - - - - -
- - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.38 - - - 1.31 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.77 - - - 1.73 - - - - -
- -3.15 - -6.23 - - - - - - - - - - - -4.01 - - - - -3.25 - 1.23 -6.36 - - - -4.38 -5.22 -0.85 4.87 4.54 -1.54 0.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -7.58 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.19 - - - - - 4.43 - - -
- - - - - - 4.04 - - - - - 4.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.69 - - - 2.65 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.21 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - 1.13 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 2.75 - - 4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.47 2.71 - - - - 1.99 - - - - - - - - - - 0.81 - - - - - - 3.56 - - - -0.74 - - - - -
- - - - - - - - - - - 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.8 - - - - -
- - - - - - - - - 1.79 0.6 0.89 5.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.45 2.72 - - - - - - - - - -0.04 - - - - - - 4.15 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.82 - - - - 3.39 - - - - 3.57 - - 3.85 2.61 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - 3.2 - - 3.07 2.17 - 4.57 - - - - - - - - - - - - - - 1.02 - - - -1.14 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.11 0.34 - - - - -
2.23 2.31 0.94 3.5 -1.01 - - -6.33 - -6.08 - - 2.53 - -4.76 -5.9 -3.37 -5.51 2.07 1.96 - - -4.81 -5.86 - - 0.1 -4.7 -2.77 - -3.79 -5.98 -3.48 - - - - -2.52 -1.43 - - -3.17 - -0.33 -0.75 1.26 -0.08 0.39 2.73 - - -2.03 2.37 -2.03 - -4.22 - -
- - - - - - - -3.62 - - - - -1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 2.94 - 2.51 - 2.79 3.76 2.42 - - - 1.24 1.79 - - - -3.18 - - - - -
- - - 4.52 - - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.2 - - - - - - 3.75 - - - 0.78 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 0.31 3.92 4.68 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.44 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48 - - - - - - - - 4.69 - - - 1.04 - - - - -
- - - 4.33 - - - - - - - - 5.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.65 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - 0.73 - - - - -
- - - - - - 5.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - 1.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.3 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.79 4.39 2.09 - - 0.56 0.66 - - - - - - - - - - - - 3.47 - - 3.16 - - - 0.51 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.85 0.32 - - - - - - - - 0.66 3.44 3.88 2.78 - -0.84 2.69 1.53 - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.2 - -0.91 - - - -1.67 -1.63 0.32 - - - 1.87
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 1.96 - - - -2.79 -4.19 - - - -1.4 2.62 2.88 2.74 - -0.49 - - -0.45 - - -3.92 - - - -1.14 - - -1.3 0.5 0.96 3.29 1.02 - 0.07 - - - - -0.65 - 2.21 - 2.09 - - -0.27 - - - 2.13 - - - - -
2.3 1.26 1.76 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.56 3.56 1.27 -0.43 - 3.12 1.93 - - - 2.28 - 0.22 - - 2.97 0.33 - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.