Heatmap: Cluster_163 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.58 -0.3 -0.1 -0.05 0.17 0.1 0.36 0.2 0.25 0.39 0.04 -0.22 -0.39 0.08 0.33 0.44 0.62 0.67 0.49 0.6 -3.1 -0.5 -1.08 -0.99 -0.61 -0.57
0.38 0.13 0.26 0.27 0.07 -0.11 0.29 0.43 0.02 0.11 -0.04 -0.25 0.23 0.33 0.74 0.22 0.02 0.11 -0.19 0.03 -2.79 -0.25 -1.26 -1.18 -0.31 -0.25
0.41 0.12 0.27 0.11 0.02 0.22 0.38 0.39 0.13 -0.03 -0.3 -0.63 0.08 0.8 0.79 0.47 0.11 0.17 0.21 0.28 -5.68 -1.96 -1.65 -1.72 -0.18 -0.5
-0.24 -0.24 -0.23 0.12 0.21 0.02 0.34 0.5 0.32 0.46 0.11 0.05 -0.38 0.32 0.21 0.33 0.3 0.31 0.33 0.3 -4.27 -1.57 -0.63 -0.87 -0.29 -0.03
-1.69 -0.42 0.03 -0.24 -0.15 0.17 0.45 0.35 0.44 0.16 -0.08 -0.48 -1.44 1.02 0.29 -0.62 -0.01 0.64 0.65 0.33 -3.88 -0.74 -0.11 -0.36 0.27 0.1
0.23 -0.74 -1.42 -1.32 -0.51 -0.08 0.73 0.48 0.05 -0.03 -0.52 -0.67 0.0 0.74 0.43 0.06 0.68 1.19 1.03 0.41 -5.09 -0.36 -1.81 -0.85 -0.5 -0.44
-0.03 -0.01 0.14 0.07 0.19 0.19 0.38 0.24 0.23 0.19 -0.05 -0.1 0.03 0.19 0.39 0.55 0.25 0.63 0.38 0.19 -2.39 -1.38 -0.86 -0.92 -0.8 -0.83
0.16 0.11 0.24 0.46 0.74 0.51 0.09 -0.23 -0.23 0.05 -0.17 -0.16 0.14 -0.09 0.45 0.36 -0.17 0.19 0.4 0.21 -2.11 -0.76 -0.96 -0.51 -0.71 -0.48
-1.5 -1.1 -0.25 -0.0 0.25 0.38 0.7 0.57 0.41 0.36 0.04 -0.32 -1.34 1.96 -0.87 0.33 -0.13 0.35 0.13 0.46 -5.42 -2.89 -1.56 -1.42 -0.28 -0.24
-2.6 -0.37 0.21 0.14 0.45 0.61 0.67 0.31 0.19 0.24 0.22 0.23 -1.72 0.1 0.33 -0.37 0.54 0.1 -0.07 0.61 -6.06 -0.1 -1.23 -0.86 0.21 -0.15
-0.05 -0.47 -0.37 -0.05 0.23 0.25 0.41 0.31 -0.1 -0.07 -0.13 -0.19 -0.03 -0.31 -0.07 0.26 0.32 0.41 0.56 0.43 -1.67 -0.41 -0.82 -0.33 0.01 0.24
-0.67 -0.26 0.01 -0.09 0.3 0.32 0.48 0.54 0.33 0.24 0.2 -0.14 -0.67 0.62 -0.48 0.57 -0.36 0.37 0.67 0.39 -4.1 0.33 -1.28 -1.41 -0.45 -0.77
-0.75 -0.78 -0.12 -0.02 -0.01 -0.31 0.47 0.4 -0.02 0.27 0.03 -0.11 -0.92 0.88 -0.29 0.83 -0.11 0.77 0.83 0.47 -4.1 -0.01 -1.29 -1.18 -0.12 -0.53
-0.38 -0.42 -0.43 -0.14 0.32 0.55 0.4 0.16 0.25 0.43 0.17 0.03 -0.35 0.39 0.27 0.09 0.12 0.52 0.22 -0.02 -2.17 -1.6 -0.08 -0.79 -0.2 0.03
0.41 0.36 0.32 0.22 0.07 -0.11 0.2 0.1 0.15 0.08 0.1 0.13 0.57 0.17 0.19 0.21 -0.21 0.22 0.02 -0.3 -3.59 -0.75 -0.59 -0.23 -0.48 -0.38
-0.16 -0.23 -0.04 0.1 0.2 0.25 0.17 0.14 0.09 0.2 0.21 0.2 -0.12 0.43 0.22 0.39 -0.0 0.35 0.11 0.06 -3.15 -0.57 -0.75 -0.44 -0.3 0.08
-4.44 -0.66 -0.18 -0.05 0.57 0.76 0.61 0.03 0.47 0.29 0.08 -0.18 -3.23 0.31 0.87 0.41 0.31 0.51 0.7 0.17 -1.81 -2.32 -0.47 -1.08 -0.39 -0.24
0.11 0.14 0.28 0.2 0.06 -0.01 0.27 0.32 0.12 0.16 -0.05 -0.24 -0.01 0.58 0.29 0.21 -0.09 0.33 -0.08 0.29 -2.92 -0.86 -1.61 -1.12 0.14 0.2
-1.74 -0.73 -0.9 -0.63 -0.1 0.26 0.57 0.55 0.4 0.18 -0.11 -0.85 -1.45 0.96 0.29 0.21 0.23 0.9 0.79 0.38 -1.76 -1.82 -0.57 -0.64 0.45 -0.18
-2.37 -1.2 -0.43 -0.27 -0.13 0.1 0.73 0.52 0.69 0.64 0.3 -0.31 -1.93 0.52 0.25 0.14 0.39 0.01 0.17 0.66 -6.45 -1.01 -0.62 -0.22 -0.04 0.61
-0.04 0.14 0.16 0.19 0.43 0.29 0.3 0.11 0.06 -0.15 -0.16 -0.09 0.12 0.49 0.45 0.57 -0.16 0.01 0.35 -0.14 -3.43 -0.4 -0.67 -0.84 -0.63 -0.18
-2.46 -0.89 -0.21 -0.01 0.13 0.4 0.61 0.35 0.46 0.41 0.31 0.13 -2.54 0.48 -0.07 0.48 0.19 0.7 0.33 0.13 -5.33 -1.77 -0.34 -0.26 0.25 0.0
-2.6 -1.53 -0.73 -0.22 0.5 1.08 1.2 0.69 0.58 -0.47 -1.23 -2.01 -2.62 2.31 0.91 0.52 -0.09 -0.2 -0.21 -0.11 -5.24 -2.25 -2.58 -4.36 -0.37 -1.22
0.07 -0.04 -0.17 0.02 0.26 0.36 0.21 0.12 -0.14 -0.34 -0.15 -0.42 -0.02 0.64 0.17 0.37 0.05 0.49 0.35 0.08 -4.07 -0.26 -0.71 -0.41 0.01 -0.01
0.66 -0.89 -0.64 -0.57 -0.46 -0.37 0.36 0.16 -0.17 0.21 -0.23 -0.3 0.25 1.39 0.71 1.48 0.31 0.18 -0.04 0.31 -6.98 -3.88 -2.59 -2.77 -0.43 -0.02
0.54 -1.0 -1.3 -1.21 -0.86 -0.28 0.53 0.47 0.47 0.58 0.46 0.16 0.48 1.67 -0.08 0.64 0.18 0.43 0.32 0.15 -6.91 -4.38 -4.86 -3.99 -0.1 -0.67
0.31 0.1 0.1 0.19 0.18 0.11 0.07 0.01 0.02 0.2 0.16 0.26 0.04 1.27 -0.34 0.17 -0.2 -0.07 -0.08 -0.17 -4.8 -0.61 -0.92 -0.41 -0.41 0.0
0.0 -0.15 -0.1 -0.14 0.15 0.25 0.31 0.17 -0.09 -0.09 -0.3 -0.35 -0.02 0.29 0.58 0.54 0.15 0.32 0.17 0.01 -1.17 -0.13 -0.11 -0.48 -0.42 -0.45
-1.71 -0.63 -0.12 -0.03 0.25 0.59 0.58 0.47 0.58 0.48 0.2 0.05 -1.45 0.06 0.55 0.43 -0.02 0.65 0.33 0.19 -4.13 -0.19 -1.36 -1.01 -0.42 -0.41
-0.0 -0.33 -0.23 0.11 0.34 0.64 0.51 0.52 0.41 0.15 -0.03 -0.4 -0.35 0.02 0.17 0.15 -0.24 0.3 0.13 -0.04 -2.36 -0.25 -0.25 -0.85 -0.35 0.03
-3.21 -2.26 -0.71 -0.53 0.14 0.63 0.66 0.44 0.84 0.75 0.15 -0.37 -2.87 0.87 0.39 1.09 0.5 0.54 -0.06 0.57 -1.68 -3.47 -0.76 -0.51 -1.19 -0.78
-0.27 -0.05 0.05 0.12 0.22 0.12 0.62 0.48 -0.09 -0.01 -0.11 -0.22 -0.46 0.17 -0.04 0.57 0.31 0.43 0.45 0.22 -3.36 -0.5 -0.68 -0.77 -0.29 -0.12
0.73 0.57 0.46 0.07 -0.16 -0.09 0.19 0.24 0.03 -0.14 -0.34 -0.39 0.29 0.35 0.15 -0.02 -0.13 0.36 0.22 0.34 -4.43 -1.87 -1.37 -0.94 0.25 0.22
-3.8 -1.22 -0.75 -0.05 0.51 0.65 0.78 0.13 0.49 -0.09 0.22 -0.11 -2.6 0.9 0.48 0.85 0.05 0.15 0.15 -0.09 -3.23 -0.2 -2.96 -0.44 0.64 -0.17
0.39 0.01 0.16 0.17 0.34 0.37 0.37 0.36 0.16 0.03 -0.05 -0.02 0.42 0.05 0.14 0.1 -0.07 -0.18 0.27 -0.33 -3.38 0.32 -1.09 -0.52 -0.59 -0.61
-0.21 -0.46 -0.31 -0.11 0.11 0.34 0.63 0.4 0.24 0.1 -0.21 -0.31 -0.26 1.57 -0.24 0.54 -0.11 0.53 0.13 0.18 -3.64 -0.99 -1.75 -1.38 -0.36 -0.33
-2.51 -0.69 -0.27 -0.12 0.53 0.68 0.86 0.78 0.62 0.61 -0.04 -0.55 -3.65 0.67 -0.02 0.39 0.14 -0.32 -0.25 0.51 -4.63 -0.13 -1.38 -0.88 0.03 0.16
0.07 -0.4 -0.32 0.11 0.28 0.01 0.27 0.3 -0.01 0.2 0.06 -0.22 -0.33 0.63 0.79 0.73 -0.17 -0.19 -0.04 0.26 -4.29 0.18 -1.09 -1.14 -0.51 0.2
-0.26 -0.72 -0.9 -0.95 -0.31 0.16 0.52 0.4 0.13 0.1 -0.18 -0.43 -0.12 0.26 0.32 0.75 0.51 0.91 0.65 0.18 -2.31 -0.45 -0.69 -0.62 -0.25 -0.09
-0.06 -0.06 0.1 0.24 0.31 0.16 0.26 0.26 -0.14 -0.11 -0.19 -0.34 0.03 1.11 -0.12 1.26 -0.04 0.05 -0.07 -0.09 -4.13 0.14 -2.26 -1.69 -0.5 -0.32
0.41 0.26 0.45 0.52 0.22 0.14 0.04 0.32 0.03 -0.18 -0.1 -0.06 0.62 0.14 0.19 0.4 -0.4 -0.01 0.1 -0.36 -2.78 -0.19 -0.62 -0.62 -0.9 -0.39
-0.41 -0.27 -0.15 -0.19 0.18 0.27 0.39 0.2 0.23 0.13 -0.23 -0.38 -0.28 0.24 0.54 0.46 0.28 0.78 0.4 0.29 -3.38 -0.04 -0.78 -0.77 -0.41 -0.62
-3.23 -0.61 -0.0 0.42 0.55 0.58 0.58 0.59 0.43 0.27 0.06 -0.03 -3.15 0.28 0.11 0.5 0.32 0.54 0.38 0.14 -3.18 -2.31 -0.12 -0.96 -0.14 -0.35
-2.07 -0.47 0.24 0.35 0.37 0.38 0.53 0.56 0.39 0.3 0.24 0.18 -1.47 0.33 0.31 0.15 0.23 0.3 0.29 0.14 -5.99 -0.95 -0.79 -0.84 0.01 -0.26
-0.17 -0.22 -0.11 -0.39 -0.15 -0.1 0.25 0.05 0.16 0.15 0.06 -0.09 -0.28 1.05 0.31 0.71 0.24 0.22 0.37 0.37 -4.4 -0.59 -0.96 -0.54 -0.31 -0.19
-4.95 -2.23 -0.34 0.18 -0.21 -0.41 0.73 0.69 0.02 -0.15 -0.16 -1.1 -4.12 1.13 0.16 0.96 0.53 0.74 0.71 0.4 -3.35 -1.72 -0.94 -0.71 0.4 0.51
-0.85 -0.42 -0.2 0.13 0.3 0.21 0.53 0.38 0.38 0.37 0.17 -0.12 -0.86 0.1 0.2 0.6 0.38 0.55 0.25 0.42 -3.5 -0.34 -0.51 -0.58 -0.77 -0.86
-0.17 -0.34 -0.07 -0.05 -0.01 0.08 0.2 0.27 0.47 0.37 0.1 0.16 0.21 0.18 0.17 0.62 0.04 0.47 0.39 0.2 -4.65 -2.07 -0.21 -0.92 -0.18 -0.4
-1.68 -1.44 -0.0 0.53 0.81 0.7 0.55 0.31 0.17 0.04 -0.11 -0.14 -1.19 0.4 0.49 0.48 0.19 0.28 0.32 0.0 -3.6 -0.62 -1.08 -1.35 0.34 -0.34
0.85 0.09 0.02 0.24 0.39 0.37 0.55 0.52 0.11 -0.14 -0.35 -0.47 0.89 0.06 -0.23 0.1 -0.69 0.29 0.15 -0.23 -2.46 -0.74 -0.51 -1.19 -0.27 -0.76
-1.65 -0.88 -0.24 -0.04 0.29 0.56 0.64 0.3 0.59 0.37 0.19 -0.11 -1.15 0.55 -0.0 0.54 0.2 0.36 0.02 0.22 -2.57 -0.71 -0.54 -0.35 -0.39 -0.05
-0.26 -0.11 0.01 -0.04 0.03 0.48 0.98 0.69 0.72 0.21 0.06 -0.33 -0.19 0.11 -0.17 0.4 -0.37 0.75 0.15 0.04 -2.34 -0.54 -1.4 -1.76 -0.35 -0.97
-0.15 -0.62 -0.34 -0.4 -0.17 -0.05 0.22 0.18 0.44 0.49 0.4 0.29 -0.11 1.22 0.39 0.76 0.22 -0.18 -0.11 0.06 -4.41 -2.02 -1.06 -0.76 0.05 -0.36
-3.23 -1.1 -0.31 0.0 0.12 0.43 0.72 0.45 0.58 0.4 0.03 -0.12 -2.79 0.01 0.11 0.36 0.34 0.65 0.21 0.48 -2.25 -1.07 -0.79 0.02 0.0 0.32
-1.16 -0.83 -0.33 -0.01 0.42 0.37 0.65 0.45 0.28 0.53 0.3 -0.06 -1.02 0.43 -0.27 0.28 0.06 0.28 0.23 0.32 -2.52 -0.4 -0.19 -0.66 -0.1 -0.2
-0.05 -0.37 -0.36 -0.66 -0.39 -0.19 0.19 0.28 -0.0 0.13 0.0 -0.32 -0.33 1.16 0.92 1.56 0.08 0.55 0.55 0.29 -8.35 -1.54 -3.97 -2.18 -0.65 -0.75
-1.39 -0.29 -0.04 -0.05 0.42 0.67 -0.1 -0.19 0.71 0.35 0.29 0.15 -1.62 0.25 -0.38 0.64 -0.14 0.26 0.53 0.26 -2.93 0.46 -1.45 -0.63 -0.08 -0.29
-0.97 0.08 0.36 0.44 0.41 0.22 0.49 0.17 0.12 0.42 -0.07 -0.29 -1.35 0.34 0.17 0.71 -0.03 0.62 0.8 0.52 -4.94 -1.06 -2.1 -1.09 -0.78 -0.62
0.46 0.39 0.51 0.34 0.11 0.01 0.29 0.46 0.02 -0.02 -0.26 -0.49 0.18 0.19 0.43 0.33 -0.09 0.3 0.11 0.21 -5.76 -0.76 -1.95 -1.55 -0.03 -0.14
-3.18 -0.74 -0.42 -0.29 0.36 0.69 0.49 0.41 0.76 0.5 0.16 -0.17 -2.76 0.15 0.11 0.43 0.36 0.56 0.43 0.3 -4.22 -2.76 -0.36 0.3 -0.29 -0.11
-0.0 -0.3 -0.22 -0.31 0.06 -0.3 0.36 0.21 0.28 0.14 -0.07 0.04 0.14 0.79 0.3 0.76 0.35 0.45 0.13 0.19 -3.61 -1.38 -0.5 -1.06 -0.25 -0.3
-0.24 -0.47 -0.84 -0.85 -0.96 -0.29 0.34 0.26 -0.07 0.09 -0.46 -0.69 -0.16 0.89 0.37 0.79 0.68 0.57 0.71 0.47 -3.8 0.22 -1.38 -0.63 -0.0 0.03
-2.9 -1.07 -0.0 0.26 0.38 0.44 0.63 0.43 0.65 0.3 0.01 -0.15 -2.12 0.66 0.1 0.58 -0.14 0.32 0.08 0.1 -2.93 -0.72 -0.9 -0.82 0.48 0.07
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-0.53 -0.35 -0.21 -0.09 0.07 0.03 0.33 0.18 0.02 -0.0 -0.11 -0.14 -0.62 1.02 0.44 0.93 0.21 0.54 0.21 0.25 -2.53 -1.22 -0.87 -0.62 -0.31 -0.13
-0.98 -0.36 -0.09 0.06 0.37 0.53 0.57 0.3 0.42 0.49 0.22 -0.15 -0.66 0.16 -0.34 0.34 0.23 0.14 0.25 0.16 -4.81 0.25 -1.59 -1.02 0.17 -0.12
-0.31 -0.05 0.14 0.16 0.26 0.09 0.45 0.39 0.26 0.27 0.0 -0.23 -0.31 -0.02 0.31 0.34 0.25 0.7 0.25 0.33 -2.92 -0.9 -0.9 -0.89 -0.41 -0.4
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-3.25 -4.0 -3.78 -2.38 -0.77 0.35 1.01 0.38 0.81 0.11 -0.72 -1.61 -2.93 1.46 0.79 1.25 0.57 1.18 0.07 0.17 -6.25 -1.86 -2.92 -1.54 0.72 0.38
-1.57 -0.46 -0.07 0.13 0.37 0.74 0.83 0.49 0.69 0.44 -0.09 -0.38 -1.74 0.31 0.17 0.55 0.06 0.69 0.12 0.11 -2.98 -0.96 -0.64 -1.17 -0.61 -0.45
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-0.38 -0.97 -0.38 -0.14 0.0 -0.29 0.56 0.44 0.46 0.67 0.23 -0.01 -0.37 -0.01 -0.56 1.21 0.47 0.53 0.3 0.65 -4.61 -0.88 -1.21 -1.31 -0.48 -0.42
0.04 -0.38 -0.6 -0.73 -0.37 -0.05 0.39 0.11 -0.11 -0.2 -0.47 -0.62 0.01 0.53 0.36 0.24 0.47 1.0 0.7 0.49 -2.74 0.48 -0.94 -0.53 -0.37 -0.36
-0.72 -2.32 -2.51 -2.21 -1.42 -0.59 -0.08 -0.19 0.38 0.59 0.75 0.81 0.16 1.52 0.5 1.43 0.28 -0.1 -0.84 -0.48 -2.0 -0.58 -1.17 -0.81 0.35 -0.04
-1.34 -0.68 -0.21 -0.24 0.35 0.62 0.22 0.04 0.42 0.12 0.01 -0.21 -0.87 0.76 0.63 0.73 0.3 0.46 0.33 0.26 -3.39 -0.76 -0.09 -0.99 -0.85 -0.38
-0.63 -0.37 -0.29 -0.36 -0.41 -0.34 0.16 0.44 0.48 0.43 0.12 -0.37 -0.67 1.18 0.2 1.1 0.29 0.61 0.27 0.37 -4.54 -0.85 -1.57 -1.47 -0.14 -0.46
-1.44 -1.95 -0.84 -0.3 -0.26 0.06 0.45 0.36 0.64 0.46 -0.05 -0.33 -1.52 1.13 1.05 1.47 0.33 0.4 0.37 -0.26 -3.21 -0.5 -1.45 -2.23 -0.48 -0.77
-3.39 -1.37 -0.92 -0.36 0.25 0.86 0.87 0.37 0.62 0.42 0.11 -0.15 -3.46 0.62 0.69 0.58 0.35 0.55 0.53 0.19 -3.58 -1.33 -0.55 -0.53 -0.9 -0.37
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-2.0 -1.65 -0.81 -0.36 0.12 0.72 0.6 0.33 0.44 0.68 0.34 -0.39 -1.79 0.56 0.49 0.22 0.44 0.56 0.37 0.63 -4.55 -1.62 -0.75 -0.37 -0.48 0.19
-0.97 -0.31 0.01 0.24 0.3 0.16 0.39 0.41 0.2 0.26 0.2 0.13 -0.93 0.12 0.31 0.26 0.18 0.38 0.29 0.0 -3.36 -0.27 -0.26 -0.47 -0.16 -0.27
0.82 0.08 -0.56 -1.14 -1.14 -0.78 0.29 0.39 0.08 0.43 0.21 0.14 0.83 1.26 -1.1 0.1 0.24 0.75 0.19 0.4 -4.41 -3.26 -1.46 -1.23 0.12 -0.37
-0.36 -0.23 -0.02 0.06 0.27 0.3 0.52 0.4 0.28 0.12 -0.14 -0.31 -0.35 0.07 0.43 0.25 0.21 0.64 0.35 0.2 -4.41 -0.25 -1.04 -0.81 -0.12 -0.39
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-1.0 -1.16 -0.32 -0.34 -0.02 0.6 0.58 0.37 0.47 0.17 -0.1 -0.46 -0.93 0.96 0.4 1.14 0.32 0.44 0.08 0.19 -1.84 -1.35 -0.95 -1.12 -0.73 -0.08
0.36 0.19 0.38 -0.02 -0.12 0.04 0.22 0.35 -0.02 -0.02 -0.08 0.06 -0.04 0.58 0.13 0.28 0.38 -0.03 0.24 0.21 -3.67 -2.22 -0.72 -0.65 -0.12 0.12
-1.45 -0.3 -0.12 0.02 0.27 0.29 0.19 -0.03 0.27 0.13 0.03 -0.19 -1.5 0.66 0.42 1.46 0.04 1.02 0.71 0.23 -6.1 -0.95 -1.54 -1.31 -1.03 -0.97

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.