Heatmap: Cluster_125 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.08 -0.22 -0.4 -0.06 -0.21 -0.4 -0.16 0.04 0.05 0.22 0.4 0.28 0.13 0.15 -0.08 -0.05 -0.46 -0.17 -0.58 -0.26 -0.46 0.83 0.21 0.05 0.15 0.21
-0.94 -1.17 -1.04 -0.46 0.15 0.14 0.4 0.2 0.45 0.54 0.68 0.5 -0.46 1.1 -0.23 0.36 -0.55 -0.91 -1.55 -1.36 -2.59 0.9 0.33 -0.23 0.29 -0.01
-0.62 -1.11 -0.72 -0.14 0.1 -0.12 -0.14 -0.0 0.37 0.41 0.6 -0.12 -0.89 0.33 0.03 0.09 -0.32 0.37 -0.01 -0.96 -1.49 1.31 0.17 -0.08 0.09 -0.07
-0.99 -0.39 -0.23 0.01 0.1 0.11 0.22 0.05 -0.02 0.28 0.26 0.18 -0.86 0.99 0.07 0.84 -0.27 -0.29 -0.35 -0.43 -1.32 0.54 -0.43 -0.12 -0.03 -0.07
-0.26 -0.44 -0.52 -0.05 -0.05 -1.11 -0.16 -0.12 -0.22 -0.05 0.22 0.03 -0.15 0.01 0.05 0.41 -0.58 0.11 -0.14 -1.07 0.35 0.8 0.85 -0.42 0.65 -0.05
-1.54 -1.09 -0.38 0.06 0.33 0.15 0.37 0.13 0.41 0.47 0.55 0.28 -0.68 1.04 -0.3 0.48 0.25 -0.87 -0.99 -0.99 -2.05 -0.52 0.73 -0.33 0.23 0.05
-1.89 -1.54 -0.8 -0.35 0.0 -0.06 0.03 -0.21 0.34 0.19 0.1 -0.22 -1.2 1.37 0.2 0.73 0.61 -0.82 -0.37 -0.67 -1.71 -0.21 0.8 -0.19 0.49 0.4
-3.96 -1.29 -0.84 -0.37 -0.31 -1.36 -0.4 -0.28 0.71 0.24 0.6 0.18 -2.79 1.12 0.57 1.51 -0.87 -0.26 -0.8 -0.75 -2.53 0.5 -0.03 0.33 0.47 0.63
-0.1 -0.4 -0.21 0.02 -0.02 -0.13 -0.1 -0.03 0.07 0.18 0.33 0.41 -0.17 -0.74 -0.88 0.93 -0.63 -0.32 -0.9 -0.79 -1.57 1.23 0.1 0.18 0.37 0.21
-0.6 -1.11 -1.15 -0.48 -0.48 -0.58 -0.06 -0.0 0.3 0.16 0.23 -0.14 -0.61 -0.06 -0.69 1.4 -0.75 -0.36 -0.97 -1.06 0.37 0.8 0.97 -0.22 0.73 0.24
-0.48 -0.5 -0.15 -0.1 0.05 -0.25 -0.02 -0.01 0.15 0.24 0.32 0.27 -0.27 0.7 0.12 0.57 -0.25 -0.37 -0.32 -0.45 -1.8 0.5 -0.12 -0.27 0.37 0.28
-0.96 -1.12 -0.81 -0.28 -0.34 -0.71 -0.09 -0.36 -0.21 -0.29 -0.08 -0.5 -1.36 1.27 0.53 1.28 -0.32 0.35 -0.07 -0.34 -3.39 0.28 -0.64 -0.1 0.86 0.98
-0.84 -1.02 -0.6 -0.2 -0.61 -0.96 -0.01 0.15 0.2 -0.22 -0.44 -0.86 -0.83 1.06 0.06 0.91 -0.13 0.19 -0.22 -0.3 -1.35 -0.1 0.7 0.25 0.86 0.68
-0.24 -0.47 -0.55 -0.2 -0.2 -0.46 -0.16 -0.16 -0.44 -0.26 -0.14 -0.21 0.04 0.51 0.22 0.54 -0.59 0.08 0.0 -0.92 -0.42 0.02 1.18 0.34 0.57 0.04
0.27 -0.59 -0.96 -0.31 -0.31 -0.51 0.12 0.35 0.08 0.1 0.17 0.08 0.45 0.42 -0.09 0.29 -0.47 -0.03 -0.24 -1.1 -1.61 1.14 0.65 -0.67 0.18 -0.16
-0.39 -0.91 -0.93 -0.11 -0.25 -0.59 0.07 0.08 0.15 0.17 0.51 0.18 -0.24 -0.07 -0.74 1.27 -0.97 -0.65 -1.37 -1.43 -0.41 0.8 0.53 0.54 0.58 0.31
-0.24 -0.61 -0.35 -0.18 -0.05 -0.01 0.28 0.29 0.17 0.23 0.17 0.32 0.2 0.37 -0.16 0.36 -0.2 0.05 -0.31 -0.29 -1.15 0.49 -0.2 -0.25 0.06 -0.01
-1.11 -1.09 -0.8 -0.21 -0.12 -0.43 -0.02 -0.04 0.09 0.26 0.39 0.55 -0.46 0.87 -0.08 0.6 -0.18 -0.58 -0.49 -0.95 -1.04 0.55 0.27 0.28 0.61 0.34
-0.57 -0.98 -1.46 -0.74 -1.75 -2.5 -1.49 -0.93 -0.75 -0.32 0.36 -0.0 -0.44 1.4 -0.35 0.24 -0.6 -0.42 -0.75 -1.21 -0.53 0.94 1.61 0.33 1.49 0.41
-0.63 -0.84 -0.46 -0.24 -0.41 -0.81 -0.28 -0.36 -0.5 -0.2 -0.23 -0.23 -0.71 1.13 0.24 0.94 0.05 0.24 -0.06 -0.22 -1.25 0.52 0.31 0.33 0.51 0.39
0.01 -0.47 -0.79 -0.68 -0.21 -0.39 0.3 0.23 0.39 0.35 0.25 0.18 0.14 -0.26 -0.78 0.87 -0.17 0.13 -0.22 -0.44 -3.93 0.13 0.14 0.44 0.57 0.14
-0.56 -0.67 -0.38 -0.3 -0.25 -0.37 0.18 0.14 0.12 0.25 0.03 0.14 -0.25 0.67 -0.12 0.52 0.03 0.25 -0.23 0.0 -1.63 0.64 -0.14 -0.07 0.12 0.25
-0.45 -0.77 -0.61 -0.15 -0.14 -0.32 0.06 0.13 0.08 0.24 0.34 0.47 -0.05 0.46 -0.35 0.22 -0.2 0.06 -0.49 -0.55 -0.72 1.08 -0.27 0.17 0.12 0.05
-0.45 -0.72 -1.02 -0.47 -0.14 0.25 0.53 0.28 0.41 0.33 0.1 0.21 -0.33 0.88 0.67 0.65 -0.52 -0.49 -0.63 -0.48 -2.67 0.46 -0.2 -0.11 -0.14 0.1
-0.69 -3.0 -1.71 -0.25 0.2 -0.08 0.58 0.49 0.16 0.12 -0.08 0.09 -0.56 0.57 -0.2 0.3 -0.11 0.0 -0.25 -0.55 -1.54 -0.11 0.46 0.5 0.9 0.31
-0.5 -0.72 -0.44 -0.21 -0.29 -0.27 0.03 0.09 0.17 0.32 0.33 0.24 -0.25 0.66 0.3 0.47 -0.17 -0.01 -0.31 -0.43 -1.11 0.77 -0.6 -0.2 0.24 0.27
-2.32 -2.24 -1.66 -0.63 0.1 -0.13 -0.33 -0.61 -0.18 -0.48 -0.5 -0.52 -2.49 1.72 0.09 1.58 -0.64 -0.53 -0.96 -1.31 -1.97 0.08 0.8 0.3 1.31 0.71
-1.64 -0.82 -0.7 -0.4 -0.74 -0.93 0.02 0.42 0.24 0.52 0.6 0.15 -1.03 -0.26 -0.29 1.38 -0.25 0.01 -0.19 -0.21 -3.1 0.92 -0.6 -0.33 1.05 0.21
-1.08 -1.19 -1.03 -0.06 0.35 0.19 0.83 0.15 0.38 -0.15 -0.2 -0.84 -1.48 0.98 0.58 0.62 -0.35 -0.76 -1.1 -1.24 -3.04 0.77 0.03 0.05 1.07 0.15
0.09 -0.37 -0.29 -0.15 -0.1 -0.12 0.07 0.02 0.11 0.0 0.09 0.26 0.46 0.45 0.32 0.32 -0.45 -0.45 -0.33 -0.76 -1.1 -0.2 0.44 0.11 0.21 0.22
-0.17 -0.49 -0.12 0.11 -0.02 -0.27 0.17 0.19 0.22 0.17 0.15 0.08 -0.27 0.58 0.2 0.49 0.01 -0.41 -0.53 -0.3 -1.66 0.12 -0.38 -0.01 0.3 0.41
-0.24 -0.96 -0.36 0.31 -0.05 -0.14 0.3 0.62 0.49 0.47 0.41 0.05 -0.06 0.81 -0.3 0.63 -0.62 -0.67 -0.72 -0.86 -2.99 -0.01 -0.3 -0.44 0.64 0.12
-0.73 -1.09 -0.44 -0.04 -0.21 -0.44 0.3 0.12 0.17 -0.06 0.05 0.07 -0.88 0.75 -0.23 0.63 -0.4 -0.52 -0.64 -0.8 -2.32 0.43 0.15 0.75 0.85 0.77
-1.07 -0.94 -0.39 -0.01 0.15 -0.05 0.35 0.16 -0.07 -0.08 0.12 -0.01 -0.75 0.82 0.09 0.94 -0.07 0.09 -0.34 -0.58 -1.98 0.29 -0.03 -0.16 0.57 0.18
-1.35 -0.41 -0.16 -0.15 -0.07 -0.48 -0.07 -0.08 0.0 0.02 -0.14 -0.07 -1.45 1.06 0.25 0.9 0.11 0.18 0.23 -0.32 -2.48 0.24 -0.33 -0.23 0.42 0.67
-0.29 -0.56 -0.75 -0.41 -0.56 -0.97 -0.52 -0.47 -0.49 0.01 0.34 0.23 -0.05 0.83 -0.27 0.97 -0.52 -0.5 -0.7 -1.28 -1.44 0.86 0.62 0.69 0.73 0.52
-0.4 -0.5 -0.74 -0.0 0.18 -0.1 0.27 0.19 0.15 0.16 0.22 0.08 -0.25 0.55 0.08 0.36 -0.31 -0.59 -0.24 -0.65 -1.63 1.05 0.07 -0.33 0.37 -0.09
-0.59 -0.71 -0.22 0.31 -0.04 0.12 0.29 0.52 0.21 0.53 0.59 0.48 -0.59 0.54 -1.12 0.57 -0.27 -0.39 -0.88 -0.24 -2.84 0.13 -0.29 -0.46 0.47 0.24
-1.69 -1.01 -0.66 0.25 0.19 -0.45 -0.27 -0.18 -0.37 -0.38 -0.11 -0.35 -1.91 1.42 0.66 0.71 -0.34 -0.33 -0.6 -1.13 -1.91 0.7 -0.41 -0.4 1.3 0.86
-1.51 -1.16 -1.25 -1.07 -1.08 -1.11 -0.34 -0.19 0.56 0.97 1.06 0.91 -0.98 1.2 -0.28 0.65 -0.78 -0.25 -0.43 -0.12 -2.82 0.31 -0.05 0.12 0.38 0.38
-1.9 -1.27 -1.4 -1.25 -1.43 -1.64 -0.5 -0.22 0.31 0.91 0.99 0.68 -1.15 1.47 -0.19 0.93 -0.38 -0.01 -0.46 0.02 -2.66 0.71 -0.09 -0.18 0.25 0.31
-0.4 -0.91 -0.67 -0.21 -0.19 -0.48 -0.19 -0.24 -0.2 0.05 0.12 0.06 -0.32 0.49 -0.23 0.32 -0.15 -0.08 -0.44 -0.36 -0.59 0.9 0.71 0.56 0.44 0.27
0.04 -0.5 -0.4 -0.26 -0.38 -0.9 -0.06 0.24 -0.23 0.08 0.22 0.33 0.28 0.18 -0.23 0.42 -0.23 -0.3 -0.55 -0.26 -0.96 1.02 0.29 0.19 0.36 -0.05
0.13 -0.38 -0.35 -0.15 -0.35 -0.76 -0.21 -0.01 -0.2 -0.04 0.13 0.18 0.26 0.29 -0.23 0.25 -0.32 -0.06 -0.27 -0.5 -0.81 0.75 0.62 0.19 0.31 0.29
-3.27 -3.25 -1.77 -1.53 -0.95 -0.5 0.44 0.55 -0.67 -0.5 -0.61 -0.98 -1.32 1.68 0.78 1.07 0.47 0.18 -0.41 -0.7 -5.13 0.61 -0.66 -2.01 1.39 1.16
-0.42 -0.63 -0.47 -0.3 -0.14 -0.06 0.24 0.19 -0.14 0.13 0.11 -0.03 -0.27 1.14 0.37 0.93 0.07 -0.35 -0.59 -0.35 -2.91 0.84 -0.63 -0.53 0.27 -0.21
-2.73 -1.11 -0.61 -0.02 0.2 0.79 0.37 -0.09 -0.7 -0.83 -1.1 -1.27 -2.31 1.14 -0.83 1.03 -0.69 0.14 -0.76 -0.16 -0.4 -0.66 1.01 0.78 0.78 0.59
-0.36 -0.69 -0.54 0.06 0.09 -0.13 0.36 0.15 0.09 0.06 0.16 -0.1 -0.07 0.57 0.08 0.5 -0.52 0.21 -0.34 -0.74 -1.63 0.7 0.12 -0.19 0.31 0.05
-2.13 -1.98 -0.99 -0.67 -0.49 -0.79 0.13 0.18 0.36 0.73 0.75 0.54 -1.92 0.49 0.14 0.42 -0.49 -0.36 -0.73 -0.36 -1.97 0.74 0.66 0.5 0.22 0.78
-0.15 -0.49 -0.24 0.09 -0.11 -0.28 0.3 0.39 0.11 0.28 0.41 0.1 0.02 0.12 -0.32 -0.44 -0.1 -0.47 -0.71 -0.42 -0.9 1.06 0.39 -0.3 0.03 0.08
-0.3 -1.05 -0.6 -0.44 -0.43 -0.34 -0.02 0.08 0.19 0.15 0.15 0.31 -0.21 0.57 -0.58 0.45 -0.67 -0.63 -0.73 -0.78 -0.44 0.91 0.38 0.32 0.81 0.46
-1.12 -1.2 -1.13 -1.02 -1.27 -1.2 -0.55 -0.74 -0.42 0.27 0.3 0.32 -0.92 0.61 0.31 0.54 -0.61 0.0 -0.19 -0.51 -0.82 1.27 0.98 0.81 0.89 0.08
-1.07 -0.78 -0.53 -0.03 -0.18 -0.26 0.29 0.29 0.42 0.42 0.34 0.36 -0.75 0.74 -0.5 0.4 -0.46 0.05 -0.51 -0.56 -1.37 0.45 -0.05 0.02 0.37 0.5
-0.29 -0.96 -1.15 -0.54 -0.32 -0.09 0.2 0.22 0.36 0.27 0.33 0.19 -0.09 -0.59 0.13 0.61 0.1 -0.1 -0.47 -0.77 -1.64 0.18 0.45 0.12 0.89 0.37
-0.36 -0.53 -0.38 0.07 0.25 0.51 0.43 0.23 0.47 0.21 0.31 0.32 -0.2 0.39 -0.11 0.15 -0.74 -0.4 -0.38 -0.74 -1.79 1.01 -0.21 -0.38 -0.22 -0.31
-0.58 -0.63 -0.42 -0.06 0.09 0.07 0.17 0.19 0.28 0.25 0.13 0.01 -0.3 0.49 0.09 0.4 -0.21 -0.05 -0.39 -0.56 -1.44 1.13 0.01 -0.55 -0.0 -0.04
-0.48 -0.66 -0.41 -0.14 0.09 0.12 0.23 0.16 0.29 0.25 0.26 0.18 -0.26 0.57 0.07 0.41 -0.35 -0.33 -0.39 -0.5 -1.04 0.85 -0.14 -0.3 0.15 -0.09
-2.9 -0.48 -0.35 0.37 0.27 0.14 0.26 0.33 0.37 0.56 0.5 0.12 -2.67 0.68 -0.27 0.77 -0.36 -0.64 -0.58 -0.66 -1.9 0.1 0.58 0.14 -0.01 0.14
-0.76 -0.81 -0.7 -0.23 -0.36 -0.56 -0.21 -0.21 0.22 0.55 0.54 0.42 -0.57 0.58 0.55 0.44 -0.56 -0.44 -0.59 -0.46 -2.58 0.42 0.48 0.33 0.66 0.31
-0.74 -0.53 -0.58 -0.03 -0.08 -0.33 -0.2 -0.16 0.06 0.36 0.0 0.23 -0.62 1.09 -0.53 1.08 -0.91 -0.09 -0.1 -0.39 -1.53 0.0 -0.35 0.4 0.25 0.73
-0.27 -0.78 -0.56 -0.24 0.01 -0.2 0.12 -0.28 -0.18 0.13 0.24 0.35 0.15 0.52 -0.3 0.22 0.15 0.06 -0.44 0.08 -1.62 0.56 0.18 0.33 0.08 0.17
0.14 -1.84 -2.23 -1.69 -0.86 -1.17 -0.77 -0.65 -0.45 -0.05 0.31 0.07 0.01 1.04 -0.69 0.16 -0.85 -0.21 -0.55 -1.19 -1.23 1.08 1.39 0.01 1.37 0.82
-0.07 -0.65 -0.4 -0.29 -0.2 -0.45 -0.05 -0.06 -0.06 0.18 0.22 0.16 0.27 0.82 0.03 0.4 -0.58 -0.01 -0.33 -0.53 -1.78 0.85 0.39 -0.02 0.01 0.12
-0.83 -1.33 -0.7 -0.27 -0.66 -0.55 0.13 0.29 0.45 0.5 0.34 0.22 -0.64 0.52 0.05 0.62 0.01 -0.14 -0.14 -0.31 -1.1 0.93 -0.58 -0.16 0.56 0.1
-0.01 -1.25 -1.42 -0.86 -0.61 -0.73 -0.02 -0.04 -0.02 0.26 0.34 0.26 0.02 0.5 0.25 0.31 0.11 -0.05 -0.56 -0.67 -1.7 0.65 0.63 0.39 0.7 0.31
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-0.46 -1.31 -1.1 -0.27 -0.08 -0.46 -0.07 -0.23 -0.34 0.07 0.37 0.22 -0.16 0.95 -0.23 0.58 -0.58 -0.13 -0.56 -0.89 -0.97 0.18 0.0 0.74 1.07 0.5
-0.27 -1.27 -1.23 -0.36 0.18 -0.0 0.19 0.08 0.2 -0.0 0.24 0.11 0.18 0.57 0.1 0.61 -0.32 -0.29 -0.83 -1.11 -2.62 0.33 0.54 0.04 0.83 0.34
-2.14 -1.3 -0.82 -0.34 -0.2 -0.58 -0.03 0.26 0.34 0.59 0.5 0.06 -1.53 -0.02 -0.15 0.4 -0.09 0.66 0.27 -0.16 -0.86 1.08 0.24 0.22 -0.03 -0.13

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.