Heatmap: Cluster_200 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.09 -0.64 -0.69 -0.01 -0.07 -0.54 -0.43 -0.1 -0.11 0.08 0.27 -0.1 -0.2 -0.34 -0.4 0.67 -0.52 -0.16 -0.45 -0.6 -1.57 0.03 1.26 0.62 0.7 0.57
-0.2 -0.41 -0.57 -0.02 0.1 -0.32 0.1 0.03 -0.18 -0.08 -0.04 -0.25 -0.27 -0.42 -0.4 -0.24 0.02 0.45 -0.2 -0.18 -1.65 0.94 0.7 0.39 0.4 0.39
0.15 -0.13 -0.38 0.11 0.23 -0.02 0.45 0.41 0.34 0.09 -0.03 -0.45 -0.17 -0.41 -0.49 -0.37 -0.29 0.14 -0.25 -0.56 -2.03 0.33 0.79 -0.13 0.7 -0.16
0.2 -0.57 -0.89 -0.8 -0.65 -0.72 -0.02 0.1 0.18 0.25 0.49 0.12 0.19 0.19 -0.73 -0.05 -0.73 0.14 -0.4 -0.78 -0.92 0.68 1.06 0.28 0.51 0.28
-0.56 -1.05 -1.56 -0.09 0.09 -0.66 -0.01 -0.16 0.04 -0.02 0.38 -0.26 -0.24 -0.14 -0.92 0.15 -1.25 -0.29 -0.68 -1.33 0.46 0.73 1.71 0.06 0.73 0.21
-0.01 -0.53 -0.66 0.2 -0.63 -0.88 -0.27 0.16 -0.01 0.31 0.62 0.09 -0.14 0.14 -0.78 0.14 -1.06 -0.04 -0.64 -0.86 -1.36 -0.0 1.09 0.18 1.12 0.49
-0.65 -0.51 -0.43 -0.05 0.02 -0.28 0.12 0.23 0.07 0.08 0.23 0.15 -0.36 0.24 -0.22 0.12 -0.19 -0.07 -0.41 -0.7 -0.59 0.67 0.44 0.02 0.59 0.31
-0.02 -0.51 -0.43 -0.18 -0.12 -0.4 -0.01 0.1 -0.08 -0.08 0.12 0.06 0.11 0.01 0.03 0.48 -0.53 0.27 -0.3 -0.72 -0.42 0.49 0.7 0.23 0.12 0.1
-0.43 -0.75 -0.79 -0.41 -0.27 -0.68 -0.12 0.06 -0.45 -0.16 -0.12 -0.43 -0.52 0.2 -0.23 0.15 -0.24 0.21 -0.04 -0.11 0.44 0.21 1.22 0.41 0.55 0.37
-1.07 -1.67 -1.39 -0.61 -0.4 -0.32 -0.1 -0.14 0.08 0.47 0.49 0.27 -0.77 0.71 -0.36 0.31 -0.77 -0.56 -0.56 -0.75 -2.0 0.68 0.93 0.61 1.21 0.44
-0.26 -0.87 -0.37 -0.28 -0.25 -0.45 0.09 0.07 0.17 0.23 0.56 0.73 0.12 0.08 -0.89 0.2 -0.54 -0.2 -0.58 -0.11 -1.45 0.44 0.6 0.2 0.37 0.32
-0.61 -0.24 -0.28 0.05 0.33 0.33 0.15 0.04 -0.44 -0.23 -0.22 -0.37 -0.62 -0.3 -0.18 -0.12 -0.24 0.14 -0.09 -0.25 -1.36 0.96 0.42 0.39 0.49 0.47
0.05 -0.79 -0.64 -0.06 -0.22 -0.81 -0.18 0.1 0.14 0.33 0.75 0.67 0.16 -0.18 -0.82 0.06 -1.52 -0.51 -0.96 -1.16 -0.25 0.23 1.24 0.35 0.45 0.17
-0.6 -0.76 -0.64 -0.17 0.09 -0.38 -0.0 0.11 0.52 0.34 0.59 0.44 -0.65 -0.15 -0.39 -0.02 -0.5 -0.11 -0.41 -0.83 -1.48 0.33 0.86 0.57 0.49 0.26
-1.05 -0.27 -0.49 0.22 0.22 -0.25 0.19 0.39 0.26 0.17 0.53 0.34 -1.57 0.29 0.47 -0.17 -0.66 -0.48 -0.47 -1.0 -2.64 0.58 0.57 0.33 0.66 -0.08
-0.34 -0.64 -0.54 -0.12 -0.03 -0.16 0.17 0.2 0.45 0.45 0.43 0.24 -0.25 0.4 -0.33 0.19 -0.62 -0.36 -0.49 -0.73 -0.28 0.16 0.3 0.25 0.31 0.15
-1.24 -1.46 -1.12 -0.52 -0.3 -0.71 -0.33 -0.05 -0.49 -0.08 0.28 0.16 -0.95 0.71 -0.31 0.46 -0.2 -0.31 -0.74 -1.08 -0.39 0.93 0.97 0.4 1.13 0.73
0.07 -0.73 -0.72 -0.06 0.22 -0.31 -0.03 0.24 -0.02 -0.17 0.44 0.38 -0.9 0.5 0.06 -0.09 -1.35 -0.17 -0.55 -1.08 -0.97 0.78 0.91 -0.28 0.91 -0.08
-0.09 -0.48 -0.36 -0.15 -0.22 -0.45 0.16 0.24 0.26 0.14 0.28 0.24 -0.18 0.41 -0.32 0.1 -0.5 -0.16 -0.44 -0.62 -0.92 0.75 0.58 0.15 -0.01 0.25
-0.37 -0.34 -0.53 -0.33 -0.25 -0.69 -0.16 -0.11 -0.03 0.31 0.47 0.38 -0.12 0.15 -0.25 -0.04 -0.29 0.27 -0.17 -0.5 -1.61 0.61 0.64 0.15 0.58 0.33
-0.08 -0.34 -0.41 0.06 -0.12 -0.27 0.02 0.11 0.28 0.33 0.29 0.2 -0.07 -0.22 -0.39 -0.07 -0.46 0.06 -0.54 -0.83 -1.22 0.39 0.66 -0.09 0.83 0.27
0.06 -0.4 -0.58 0.11 -0.35 -0.72 -0.23 0.01 -0.15 0.01 0.35 0.26 0.17 0.22 -0.47 -0.47 -0.37 -0.68 -0.51 -0.68 -0.74 0.12 1.19 0.74 0.57 0.34
-0.21 -0.79 -0.86 -0.44 -0.3 -0.76 -0.19 0.09 -0.03 0.39 0.73 0.62 -0.02 -0.15 -1.35 -0.25 -1.03 -1.36 -1.23 -0.96 -0.43 0.79 1.3 0.66 0.78 0.34
-0.51 -0.99 -0.89 -0.61 -0.91 -1.12 -0.15 0.15 -0.04 0.11 0.19 0.01 -0.42 0.41 -0.6 0.45 -0.35 0.65 -0.41 -0.47 -0.59 0.68 0.74 0.57 0.78 0.41
-0.13 -0.52 -0.74 -0.08 0.17 -0.4 0.08 0.12 -0.18 -0.02 -0.21 -0.48 -0.31 -0.15 -0.37 0.14 -0.32 0.12 0.17 -0.41 -0.19 1.05 0.64 0.23 0.24 0.21
-0.1 -0.28 -0.12 -0.25 -0.12 -0.41 -0.17 -0.1 -0.27 -0.38 -0.3 -0.22 -0.34 0.17 0.22 0.35 -0.11 -0.24 -0.31 -0.29 -1.62 -0.46 1.44 0.28 0.83 0.28
-0.06 -0.31 -0.55 -0.25 -0.05 -0.38 0.19 0.49 0.26 0.16 -0.02 -0.53 -0.34 -0.36 -0.42 0.18 -0.14 0.48 -0.15 -0.27 -1.4 0.66 0.59 -0.07 0.65 -0.05
-0.43 -0.55 -0.85 -0.13 0.05 -0.39 -0.05 0.09 0.15 0.09 0.21 -0.14 -0.55 0.01 -0.1 0.09 -0.01 0.5 0.02 -0.79 -1.02 0.65 0.73 0.45 0.35 -0.01
0.25 -0.87 -1.28 -0.32 -0.17 -0.4 0.45 0.68 0.27 0.16 0.22 -0.41 -0.0 -0.47 -0.62 0.51 -0.98 -0.36 -0.23 -0.97 -1.07 0.65 0.77 0.35 0.74 0.09
-0.72 -1.16 -1.13 -0.48 -0.45 -0.43 -0.23 -0.22 -0.17 -0.13 -0.12 0.34 -0.31 0.81 0.02 0.56 -0.35 0.13 -0.5 -0.51 0.21 0.36 1.28 -0.22 0.42 0.25
-0.57 -0.99 -0.39 0.16 -0.02 -0.35 0.67 0.55 0.18 -0.29 -0.4 -0.69 -0.74 -0.63 -0.34 -0.02 -0.15 0.31 0.09 -0.27 -0.67 1.09 0.59 -0.21 0.55 0.21
0.02 -0.29 -0.19 -0.02 0.02 -0.6 -0.16 0.08 0.11 0.08 0.4 0.16 -0.32 -0.07 -0.41 -0.47 -0.55 0.21 -0.14 -0.55 -1.88 -0.07 0.93 -0.16 0.83 0.72
-0.8 -0.71 -0.5 0.13 -0.11 -1.08 -0.23 0.33 0.09 -0.16 0.28 -0.12 -0.64 0.37 0.01 0.24 -0.3 0.3 -0.53 -1.07 -0.5 0.07 0.93 -0.19 0.97 0.68
-0.33 -0.69 -0.61 -0.33 -0.17 -0.22 0.18 0.28 0.21 0.44 0.31 0.06 -0.28 -0.61 -0.72 -0.66 -0.93 -0.13 -0.34 -0.4 -0.58 0.65 0.84 0.34 0.69 0.71
0.17 -0.85 -1.65 -0.59 -0.76 -1.11 -0.31 0.3 0.26 0.84 1.3 0.7 0.25 -2.41 -3.96 -3.05 -3.12 -1.67 -2.88 -1.93 -0.17 0.79 1.68 1.09 0.92 -0.08
-0.59 -0.91 -0.77 -0.08 -0.11 -0.25 0.13 -0.02 0.58 0.36 0.53 -0.08 -0.46 -0.07 -0.58 -0.47 -1.03 -0.73 -0.62 -1.26 -1.96 0.93 1.12 0.36 0.72 0.81
-0.94 -0.82 -0.77 -0.38 -0.91 -1.02 -0.63 0.09 -0.45 0.25 0.42 0.52 -0.83 0.17 -1.27 -0.4 -1.46 -0.36 -1.24 -1.58 -1.66 0.28 1.81 1.04 1.19 1.0
-1.11 -1.25 -0.76 -0.34 -0.28 -0.2 0.1 -0.0 0.36 0.49 0.74 0.86 -0.51 0.32 -0.64 0.01 -0.7 -0.31 -0.71 -0.7 -0.46 0.55 0.48 0.65 0.29 0.23
-0.51 -1.02 -0.82 -0.47 -0.51 -0.66 -0.11 0.02 0.12 0.3 0.17 0.07 -0.14 0.67 -0.15 0.51 -0.37 0.19 -0.39 -0.36 -0.59 0.23 0.8 0.04 0.6 0.43
-0.98 -0.81 -0.62 -0.24 0.02 -0.32 0.15 0.41 0.53 0.18 0.26 -0.2 -1.58 -0.44 -0.18 0.17 -0.57 0.27 -0.36 -0.75 -3.92 0.51 1.19 0.52 0.78 0.36
-0.32 -1.02 -0.74 -0.57 -0.75 -0.47 -0.09 0.43 0.27 0.37 0.61 0.55 -0.57 0.04 -0.81 0.08 -0.43 -0.45 -0.86 -0.7 -0.98 -0.31 1.24 0.52 0.87 0.53
-0.7 -0.57 -0.33 0.27 0.23 -0.34 0.02 0.28 -0.1 0.01 0.17 0.01 -0.88 -0.01 0.12 0.18 -0.28 0.16 -0.01 -0.82 -0.72 0.76 0.43 -0.01 0.55 0.12
0.24 -0.55 -0.94 -0.17 -0.43 -1.21 -0.67 -0.23 -0.3 0.09 0.38 0.38 0.32 0.11 0.06 -0.07 -0.62 -0.48 -1.31 -1.28 -0.69 0.46 1.3 0.01 1.09 0.58
-0.71 -1.11 -1.61 -0.05 -0.44 -0.38 -0.28 -0.16 0.07 0.25 0.24 0.39 -0.61 -0.04 -0.4 0.03 -1.76 -0.23 -0.41 -1.15 -0.35 0.97 1.35 0.52 0.79 0.54
-0.45 -0.49 -0.7 -0.46 -0.34 -0.62 0.07 0.15 -0.01 -0.45 -0.18 -0.8 -0.59 -0.55 -0.6 -0.37 -0.45 0.83 -0.07 -0.53 -0.29 1.17 0.91 -0.38 1.28 0.45
-0.33 -0.44 -0.39 -0.12 -0.21 -0.24 0.2 0.17 0.17 0.24 0.24 0.32 -0.23 0.21 -0.32 0.14 -0.37 -0.19 -0.32 -0.6 -1.11 0.37 0.7 -0.05 0.42 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.