Heatmap: Cluster_81 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.51 -0.34 -0.45 -0.78 -0.24 0.02 -0.01 -0.44 -0.22 0.13 -0.54 -0.51 -0.76 0.36 0.87 0.4 1.03 0.74 1.2 1.22 -1.95 -2.07 -1.55 -0.32 -1.28 -0.23
-0.2 0.24 0.19 -0.03 -0.22 -0.11 0.08 0.21 0.1 0.04 -0.3 -0.53 -0.45 -0.29 0.38 0.11 0.18 0.74 0.64 0.67 -2.85 -1.9 -0.38 -0.36 0.27 0.26
-0.33 0.16 0.04 -0.13 0.2 0.54 0.11 -0.16 0.04 0.18 -0.38 -0.69 -0.55 -0.06 0.37 -0.08 0.59 0.53 0.9 0.58 -4.83 -1.06 -1.11 -0.03 -0.39 0.13
-0.66 -0.22 -0.72 -0.44 0.24 0.36 0.12 -0.06 0.35 0.3 -0.06 -0.2 -1.3 0.42 0.75 0.29 0.44 0.57 0.76 0.41 -3.48 -1.55 -0.4 0.11 -0.2 -0.57
-0.18 0.03 0.12 -0.09 0.46 0.79 0.61 0.2 0.48 0.33 0.16 -0.06 -0.13 0.22 0.29 0.37 0.38 0.05 0.47 0.62 -5.4 -2.87 -1.87 -1.35 -1.93 -0.68
-1.1 -0.47 -0.24 -0.18 0.43 0.76 0.52 0.13 0.32 0.32 -0.2 -0.63 -1.2 0.3 0.78 0.49 0.62 0.61 0.54 0.74 -4.88 -1.38 -1.34 -1.0 -0.82 -0.66
-0.89 0.09 -0.14 -0.35 0.35 0.83 0.25 -0.08 0.35 0.68 0.35 0.36 -1.45 0.27 0.49 0.01 0.31 0.04 0.64 0.48 -4.13 -4.21 -0.78 -0.09 -1.35 -0.21
-0.18 0.25 0.29 0.19 0.47 0.59 0.56 0.2 0.2 0.16 -0.18 0.0 -0.11 0.34 0.34 0.03 0.09 0.44 0.62 0.24 -4.58 -2.69 -2.39 -0.48 -1.56 -0.25
-0.54 -0.31 0.01 0.19 0.29 0.29 0.34 0.25 0.29 0.3 0.27 0.1 -0.43 -0.17 0.44 0.46 -0.02 0.57 0.82 0.58 -2.95 -1.62 -1.18 -0.83 -0.94 -0.6
-0.32 0.36 0.2 0.01 0.4 0.9 0.32 0.21 -0.23 -0.5 -0.75 -0.92 -0.83 -0.49 0.17 -0.02 0.39 0.54 1.29 0.9 -4.62 -1.07 -1.61 -0.4 -0.73 -0.27
0.0 0.03 0.19 0.16 0.14 0.17 0.16 0.14 0.18 0.01 -0.25 -0.22 -0.21 0.05 0.21 -0.12 0.2 0.57 0.54 0.38 -2.71 -1.37 -0.77 -0.43 -0.15 0.38
-0.43 -0.09 0.26 0.02 0.32 0.61 0.39 0.08 -0.02 -0.29 -0.73 -0.88 -0.66 -0.08 0.45 0.35 0.44 0.59 0.84 0.64 -2.7 -1.28 -1.05 -0.62 -0.09 -0.06
-0.42 0.17 0.32 0.15 0.14 0.32 0.32 0.33 0.08 0.18 0.18 0.36 -0.61 0.02 0.23 0.42 0.23 0.3 0.54 0.43 -2.93 -1.93 -1.51 -0.49 -0.69 -0.24
-0.12 0.18 -0.12 -0.35 0.08 0.35 -0.19 -0.33 -0.13 -0.01 -0.24 -0.28 -0.52 0.5 0.58 0.48 0.39 0.51 0.72 0.54 -3.55 -1.09 -0.25 -0.19 -0.61 -0.17
-3.23 -0.99 -0.21 -0.05 0.99 1.56 0.94 0.45 0.06 -0.58 -1.22 -1.64 -2.94 0.18 0.76 0.58 0.56 0.29 0.69 0.83 -4.73 -1.07 -1.7 -2.33 -0.64 -0.59
0.52 0.3 0.57 0.22 -0.1 0.11 -0.05 -0.12 -0.82 -0.66 -0.89 -0.81 0.21 0.42 0.61 0.26 0.19 0.61 0.99 0.4 -4.92 -3.53 -1.91 -0.83 -0.42 0.69
-0.16 0.24 0.14 0.01 0.3 -0.02 0.24 0.22 0.04 0.02 -0.2 -0.67 -0.61 0.2 0.47 0.3 0.2 0.41 0.54 0.71 -4.08 -2.04 -0.7 -0.47 0.04 0.05
-0.81 0.01 0.47 0.08 0.2 0.04 -0.09 -0.25 -0.95 -0.79 -0.95 -1.06 -1.73 0.34 0.24 0.44 0.52 0.41 0.81 0.71 -1.06 -0.32 -0.36 -0.27 0.18 0.71
-0.03 -0.01 0.07 0.04 0.3 0.42 0.17 -0.04 -0.1 -0.06 -0.33 -0.38 -0.34 -0.01 0.14 -0.13 0.29 0.25 0.62 0.42 -1.64 -0.08 -0.31 -0.15 -0.52 0.09
-0.28 -0.21 -0.06 0.06 0.26 0.12 0.3 0.12 0.26 -0.06 -0.07 -0.32 -0.63 0.1 0.36 0.22 0.32 0.52 0.7 0.4 -3.71 -2.22 -0.57 -0.06 0.04 0.1
-0.44 -0.03 -0.05 -0.29 0.11 0.45 0.24 -0.03 0.02 -0.18 -0.22 -0.26 -0.47 0.06 0.61 0.35 0.39 0.61 0.94 0.48 -4.29 -0.79 -0.07 -0.45 -0.97 -0.44
-0.32 -0.08 -0.12 -0.24 0.19 0.46 0.28 0.03 -0.1 -0.06 -0.28 -0.26 -0.53 0.06 0.4 0.09 0.58 0.56 1.02 0.69 -3.86 -0.94 -0.2 -0.45 -0.84 -0.52
0.34 0.24 0.54 0.32 0.0 -0.0 0.1 0.1 -0.1 -0.37 -0.59 -0.74 0.1 -0.03 0.87 0.0 0.17 0.37 0.41 0.63 -1.79 -2.27 -1.07 -0.98 -0.21 0.29
-0.28 -0.21 -0.25 -0.1 0.09 0.24 0.53 0.45 -0.05 0.03 -0.34 -0.42 -0.81 0.12 0.37 0.19 0.32 0.43 0.88 0.59 -3.23 -1.46 -1.0 -0.2 -0.15 0.24
-0.27 -0.03 0.08 0.1 0.27 0.46 0.52 0.32 0.33 0.24 -0.03 -0.24 -0.6 -0.08 0.19 -0.14 0.17 0.5 0.83 0.5 -6.17 -1.74 -1.07 -0.25 -0.59 -0.23
-3.8 -2.09 -0.66 -0.15 0.96 1.44 1.28 0.69 0.58 -0.03 -1.36 -2.34 -3.94 -2.26 -0.26 -0.13 0.75 0.96 1.24 1.37 -7.6 0.04 -4.94 -4.03 -1.63 -1.5
-1.4 0.18 0.13 0.03 0.28 0.86 0.6 -0.19 0.86 -0.43 -0.46 -0.4 -1.74 0.27 1.23 0.62 0.53 0.21 0.33 0.4 -4.41 -0.4 -2.5 -1.11 -1.24 -1.11
-2.0 -0.36 0.04 -0.28 0.75 1.38 0.62 0.09 -0.33 -1.13 -2.04 -2.37 -2.52 -0.57 0.28 0.25 0.98 1.07 1.62 1.4 -4.48 -1.95 -3.44 -2.37 -1.67 -0.8
-0.12 0.08 0.19 0.0 0.01 0.23 -0.04 -0.02 -0.38 -0.27 -0.45 -0.49 -0.36 0.24 0.5 0.22 0.13 0.59 0.62 0.51 -1.79 -0.98 -0.93 -0.69 0.13 0.65
0.08 0.07 0.25 -0.02 0.16 0.35 0.18 0.11 -0.15 -0.14 -0.29 -0.48 -0.03 0.59 0.8 0.38 0.37 0.39 0.59 0.58 -4.63 -1.99 -1.86 -1.04 -0.93 0.1
0.04 0.23 0.25 -0.04 0.02 0.21 0.39 0.19 0.02 0.21 -0.12 -0.27 -0.04 0.36 0.49 0.29 0.39 0.43 0.35 0.69 -3.86 -1.97 -1.14 -0.89 -0.85 -0.37
0.01 0.18 -0.0 -0.12 0.26 0.48 0.4 0.07 -0.04 -0.13 -0.52 -0.73 -0.24 -0.24 0.15 -0.29 0.26 0.66 1.0 0.44 -1.67 -0.91 -0.47 -0.75 -0.18 -0.01
-1.17 -0.33 0.13 0.05 0.37 0.83 0.67 0.42 0.39 0.27 -0.38 -0.76 -1.16 0.57 0.82 0.68 0.53 0.35 0.58 0.76 -4.19 -2.44 -2.09 -1.92 -1.54 -1.07
-0.6 -0.21 -0.02 -0.1 0.31 0.88 0.47 0.43 0.52 0.13 -0.08 -0.25 -0.5 0.41 0.73 0.27 0.4 0.4 0.59 0.46 -4.07 -2.43 -1.42 -1.33 -1.16 -0.96
-0.72 -0.02 0.23 -0.14 0.3 0.71 0.22 -0.01 0.14 -0.02 -0.01 -0.4 -0.88 -0.08 0.29 0.26 0.56 0.39 0.59 0.78 -2.3 -1.53 0.14 -0.36 -0.88 -0.8
0.4 0.48 0.53 0.31 0.26 0.28 0.03 0.14 -0.39 -0.42 -0.68 -0.53 0.08 -0.01 -0.22 -0.4 -0.07 0.52 0.69 0.34 -3.47 -0.8 -1.17 -0.61 -0.04 0.64
-0.07 -0.71 -0.25 -0.36 -0.17 -0.21 -0.28 -0.31 -0.47 -0.47 -0.85 -0.9 -0.37 0.57 0.58 0.36 0.09 0.62 1.09 0.27 -0.91 -0.89 -0.13 -0.21 0.09 1.0
-0.01 -0.63 -0.28 -0.33 -0.16 -0.81 0.03 -0.14 -0.47 -0.36 -0.59 -0.77 -0.04 0.56 0.58 0.43 0.09 0.66 0.93 0.37 -1.27 -0.87 -0.32 -0.23 -0.08 0.93
-0.07 0.13 0.17 -0.02 0.03 0.23 0.15 -0.07 -0.07 -0.44 -0.57 -0.63 -0.17 -0.14 1.28 0.32 0.63 0.5 0.73 0.27 -3.03 -1.28 -1.45 -0.61 -0.3 -0.15
0.68 0.52 -0.1 -0.49 -0.26 -0.0 -0.22 -0.47 -0.79 -0.69 -1.07 -0.64 0.41 0.44 0.43 0.59 0.39 0.76 1.24 0.56 -3.74 -3.26 -1.09 -0.14 -0.89 0.14
-0.97 -0.21 -0.09 -0.42 0.14 0.63 0.32 -0.14 0.01 0.05 -0.76 -0.85 -1.27 0.03 0.77 -0.01 0.73 0.93 0.98 0.92 -5.1 -1.1 -1.39 -0.38 -0.21 -0.2
-3.15 -1.47 -0.48 -0.36 0.32 0.75 0.51 -0.02 0.22 0.09 -0.55 -0.7 -3.26 0.61 0.56 0.74 0.7 0.87 1.27 1.16 -3.85 -2.84 -2.14 -0.98 -1.23 -0.09
0.15 0.36 0.33 0.19 0.14 0.44 0.28 0.18 0.24 0.11 -0.01 0.05 0.09 -0.18 0.19 0.06 0.18 0.29 0.5 0.45 -2.6 -1.0 -1.19 -0.42 -1.28 -0.78
0.26 0.35 0.37 0.15 0.17 0.29 0.18 0.11 -0.0 -0.21 -0.47 -0.72 0.04 0.34 0.66 0.5 0.37 0.44 0.54 0.4 -4.6 -0.46 -1.9 -1.29 -0.88 -0.58
-0.46 -0.51 -0.59 -0.82 -0.25 0.63 0.65 0.28 0.22 0.14 -0.22 -0.39 -0.49 0.34 0.47 -0.01 0.5 0.41 0.87 0.55 -3.44 -1.29 -0.83 -0.6 0.01 0.23
-0.83 -0.02 0.1 -0.1 0.14 0.7 0.49 0.23 0.58 0.36 0.11 -0.13 -1.67 -0.36 0.61 -0.03 0.3 0.45 0.81 0.29 -3.48 -1.15 -0.48 -0.63 -0.74 -0.51
0.24 0.37 0.29 0.0 0.0 0.21 0.25 0.19 -0.09 -0.33 -0.54 -0.72 -0.14 0.24 0.35 0.23 0.39 0.48 0.64 0.44 -3.91 -0.95 -1.45 -0.75 -0.23 0.3
-0.26 0.18 0.32 0.28 0.27 -0.2 0.16 -0.05 -0.63 -0.34 -0.78 -0.76 -0.47 0.03 0.13 -0.07 0.14 0.8 0.7 0.47 -1.89 0.1 -0.85 -0.7 0.11 0.65
-0.54 -0.03 -0.05 -0.34 0.05 0.61 0.46 0.15 0.23 0.09 -0.28 -0.47 -0.64 -0.16 0.35 0.16 0.43 0.83 0.75 0.9 -3.28 -1.41 -0.57 -0.57 -0.64 -0.54
0.0 0.39 0.19 -0.15 0.06 0.81 0.53 0.29 0.17 -0.05 -0.53 -0.41 -0.2 -0.41 0.26 -0.36 0.25 0.6 1.21 0.66 -5.65 -2.62 -1.74 -0.65 -1.12 -0.19
-0.63 0.14 0.2 0.01 0.45 0.83 0.48 0.32 0.26 0.33 -0.24 -0.61 -0.96 -0.35 0.71 -0.16 0.46 0.44 0.87 0.83 -5.75 -1.75 -1.15 -1.23 -1.09 -0.93
-0.7 -0.49 -0.37 -0.37 0.08 0.35 0.21 0.08 0.16 0.26 0.05 -0.07 -0.65 0.43 0.56 0.25 0.24 0.51 0.85 0.5 -2.94 -1.13 -0.5 0.15 -0.6 -0.45
0.11 0.49 0.24 0.02 0.34 0.43 0.31 0.16 -0.03 -0.13 -0.58 -0.74 -0.12 0.19 0.56 -0.21 0.3 0.54 0.61 0.44 -3.17 -1.44 -1.14 -0.69 -0.35 -0.13
-0.99 -0.02 -0.31 -0.45 -0.34 -0.08 -0.04 -0.35 0.51 -0.12 -0.35 -0.5 -1.08 0.38 1.53 0.3 0.58 0.58 0.66 0.59 -3.56 -2.6 -0.54 -0.46 -0.08 0.11
-0.17 0.21 0.26 0.21 0.1 0.19 0.13 0.03 -0.06 -0.46 -1.06 -1.14 -0.67 0.07 0.38 0.06 0.04 0.85 0.92 0.34 -5.68 -0.94 -1.44 -0.3 0.31 0.76
0.16 -0.02 -0.25 -0.02 -0.08 0.12 0.34 0.09 0.25 0.48 0.26 0.09 -0.22 0.28 0.3 0.19 0.28 0.66 0.54 0.72 -3.17 -2.65 -1.46 -0.65 -0.82 -0.57
-1.86 -0.45 -0.11 0.07 0.67 1.21 0.83 0.47 0.21 -0.19 -0.81 -1.4 -2.28 -0.36 0.31 0.17 0.63 0.69 0.93 1.06 -5.1 -1.23 -1.5 -1.47 -0.72 -0.51
-0.26 -0.16 0.07 0.06 0.21 0.59 0.54 0.38 0.11 -0.05 -0.44 -0.52 -0.53 -0.6 0.03 0.14 0.41 0.67 1.03 0.85 -4.56 -3.69 -0.93 -0.79 -0.32 0.02
-0.47 0.15 0.01 -0.07 0.0 0.07 0.15 0.01 0.34 0.2 -0.11 -0.18 -0.67 0.37 0.47 0.49 0.4 0.46 0.56 0.45 -4.61 -1.72 -0.83 -0.63 0.0 0.01
-0.37 -0.11 0.17 0.09 0.12 -0.01 0.05 0.05 0.09 0.15 -0.19 -0.27 -0.49 -0.26 0.24 0.09 0.34 0.7 0.88 0.9 -4.72 -0.71 -0.97 -0.74 -0.15 0.04
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-0.12 0.07 0.24 -0.05 -0.17 -0.27 -0.02 0.09 -0.05 -0.06 -0.33 -0.4 -0.24 0.68 1.1 0.68 0.23 0.29 0.25 0.62 -4.33 -0.87 -0.92 -1.32 -0.3 -0.02
-0.99 -0.21 0.41 0.2 0.2 0.22 0.21 0.05 -0.26 -0.25 -0.56 -0.61 -1.05 0.5 1.42 0.31 0.17 0.42 0.39 0.11 -2.3 -1.38 -0.82 -0.59 -0.52 0.53
-2.26 -0.64 -0.67 -0.63 0.14 0.52 0.46 0.08 0.44 0.38 -0.09 -0.61 -2.55 -0.11 0.85 0.44 0.63 0.94 0.81 0.73 -3.37 -0.06 -1.04 -0.24 -1.09 -0.58
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0.57 0.33 -0.28 -0.78 -0.17 0.33 0.46 -0.0 0.05 -0.05 -0.37 -0.1 0.28 -0.32 0.38 -0.33 0.35 0.78 1.12 0.6 -2.98 -2.28 -0.84 -0.27 -1.36 -0.44
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-2.17 -1.19 -0.22 -0.29 0.32 0.77 0.6 0.2 -0.01 -0.47 -0.85 -0.8 -2.12 0.38 0.68 0.96 0.9 0.28 0.93 0.77 -1.55 -0.87 -0.45 -1.16 -0.61 -0.51
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.