Heatmap: Cluster_84 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.12 -0.64 -0.57 0.29 0.53 0.26 0.5 0.46 0.59 0.64 0.53 0.24 -0.67 -0.85 -1.29 -0.95 -1.04 -0.68 -1.14 -1.24 -1.81 1.86 0.21 -0.77 0.31 -0.19
-2.35 -1.23 -0.46 -0.0 0.05 -0.15 0.42 0.31 0.09 0.43 0.51 -0.03 -1.76 0.68 -0.05 0.82 0.32 0.15 -0.01 -0.18 -2.58 0.28 0.46 -0.34 0.27 -0.55
-1.91 -0.72 -0.51 -0.03 0.22 0.07 0.72 0.49 1.08 0.59 0.4 -0.16 -1.3 0.1 -0.58 0.34 -0.61 0.4 -0.78 -0.32 -1.73 0.78 0.57 -0.92 -0.4 -0.36
-2.41 -1.4 -0.39 -0.01 0.17 0.05 0.39 0.28 0.36 0.68 0.38 0.11 -1.67 0.61 0.11 0.68 0.18 -0.13 0.01 -0.04 -2.66 -0.06 0.55 -0.38 0.06 -0.37
-2.64 -1.4 -0.52 -0.1 -0.04 -0.5 0.37 0.16 0.07 0.64 0.41 -0.16 -1.87 0.71 0.22 0.96 0.47 0.09 0.09 0.0 -2.38 0.27 0.52 -0.45 0.03 -0.32
-1.37 -0.78 -0.37 -0.18 -0.11 -0.3 0.42 0.28 0.27 0.45 0.15 -0.2 -1.39 0.73 0.24 1.04 0.41 0.29 0.26 0.02 -1.79 -0.14 0.08 -0.56 -0.15 -0.59
-1.41 -1.29 -0.92 -0.46 -0.1 0.24 0.65 0.5 0.87 0.53 0.22 -0.14 -1.31 0.43 -0.08 0.6 -0.42 0.24 -0.16 -0.17 -2.31 0.78 -0.27 -0.59 0.44 -0.28
-0.84 -0.85 -0.33 0.05 0.22 -0.1 0.62 0.51 0.66 0.56 0.34 -0.01 -0.61 0.38 0.06 0.78 -0.22 0.13 -0.04 -0.07 -4.74 -0.11 -0.15 -1.25 0.18 -0.6
-3.75 -2.13 -0.53 0.32 0.42 0.32 0.54 0.43 0.71 0.77 0.7 0.49 -3.21 0.79 -0.37 0.08 -0.33 -0.01 -0.15 -0.28 -4.15 -0.14 -0.04 0.3 -0.04 -0.55
-0.5 -0.51 -0.84 -0.53 -0.23 -0.17 0.54 0.79 0.87 0.77 0.4 -0.07 -0.56 -0.25 -0.91 -1.13 -0.51 0.19 -0.25 -0.0 -0.02 0.76 -0.48 -0.29 -0.01 0.28
-1.49 -0.46 -0.26 -0.09 0.13 0.17 0.45 0.64 0.86 0.59 0.58 0.34 -1.24 0.35 -0.57 0.24 -0.75 -0.14 -0.57 -0.7 -2.18 0.61 -0.11 -0.6 0.42 -0.14
-0.19 -0.54 -0.75 -0.2 0.31 -0.0 0.15 0.29 0.68 0.7 0.84 0.6 -0.0 -0.33 0.45 -0.65 -1.12 -0.53 -0.6 -1.12 -2.88 1.1 -0.34 -0.34 -0.08 -0.0
-2.86 -1.04 -0.52 0.23 0.31 0.33 0.56 0.54 1.06 0.62 0.63 0.06 -2.8 0.1 -0.84 0.03 -0.35 0.08 -0.33 -0.25 -4.93 1.14 -0.34 -0.75 0.27 -0.36
-1.16 -1.15 -0.83 0.08 0.39 0.09 0.38 0.62 0.91 0.54 0.66 0.39 -1.15 0.25 -0.37 0.2 -0.66 -0.28 -0.6 -0.92 -2.15 0.69 -0.38 0.38 0.06 -0.18
-1.2 -0.73 -0.5 -0.08 0.08 0.09 0.7 0.73 0.91 0.64 0.27 0.12 -1.04 0.33 -0.21 0.4 -0.26 0.59 -0.18 -0.28 -1.87 -0.39 -0.38 -0.78 -0.01 -0.27
-1.3 -1.91 -0.61 0.09 0.05 0.01 0.44 0.25 0.2 0.58 0.39 0.11 -0.97 0.2 -0.76 0.36 -0.07 0.04 -0.1 0.06 -1.48 0.38 0.07 0.05 0.61 0.29
-1.32 -1.78 -0.62 -0.18 0.06 -0.26 0.37 0.31 -0.11 0.57 0.41 -0.09 -1.2 0.58 -0.48 0.6 0.29 0.3 0.17 0.45 -1.51 0.25 -0.11 -0.41 0.36 0.11
-5.26 -2.32 -0.96 0.32 0.75 0.61 0.46 0.44 0.67 0.43 0.41 0.49 -4.8 -0.87 -1.25 -0.91 -0.79 0.1 -0.74 -0.74 -2.75 1.34 0.35 -0.02 0.79 0.44
-0.95 -0.81 -0.34 -0.04 -0.0 -0.14 0.5 0.51 0.35 0.61 0.35 0.16 -0.69 0.63 0.13 0.88 0.35 -0.15 -0.11 -0.0 -2.6 -0.22 -0.13 -0.68 -0.3 -0.62
-1.72 -0.92 -1.02 -0.39 0.44 0.52 0.7 0.42 0.65 0.57 0.49 -0.07 -2.26 0.49 -1.59 0.18 -0.85 -0.67 -0.89 -0.9 -1.36 1.33 0.26 0.12 0.07 0.23
-1.08 -1.01 -0.48 -0.14 -0.09 -0.39 0.62 0.59 0.28 0.63 0.32 -0.07 -1.01 0.4 0.14 0.89 0.47 0.44 0.31 0.18 -1.74 -0.81 0.0 -0.64 -0.44 -0.85
-1.22 -0.2 -0.27 -0.1 0.13 0.09 0.37 0.46 0.75 0.54 0.48 0.26 -1.15 -0.07 -0.21 -0.54 -0.33 0.37 -0.23 -0.3 -0.56 0.63 -1.24 0.25 0.04 -0.34
-2.07 -0.79 -0.43 0.08 0.43 0.12 0.6 0.59 0.57 0.47 0.15 -0.25 -2.12 -0.29 -0.44 0.27 -0.18 0.22 -0.1 0.1 -2.66 0.85 -0.12 -0.24 0.39 0.01
-1.99 -1.05 -0.46 -0.12 0.28 0.56 0.5 0.27 0.84 0.22 0.3 -0.02 -2.09 -0.13 -0.04 0.26 -0.26 0.36 0.04 -0.07 -0.99 0.58 -0.55 -0.07 0.17 -0.06
-2.99 -2.24 -1.35 -0.51 0.23 0.38 0.68 0.48 0.6 0.64 0.67 0.65 -2.53 -0.88 -0.25 -0.52 -0.17 0.09 -0.13 -0.26 -0.55 1.3 -0.08 0.13 0.01 -0.5
-3.14 -2.24 -1.27 -0.69 -0.07 -0.17 0.39 0.21 0.29 0.5 0.26 0.23 -3.47 -0.34 0.18 0.09 0.35 0.57 0.25 0.39 -0.35 1.21 -0.3 0.41 -0.18 -0.2
-1.17 -0.84 -0.35 0.07 0.19 -0.03 0.43 0.61 0.72 0.68 0.34 0.06 -0.94 0.29 -0.13 0.61 0.05 0.09 -0.24 -0.24 -2.47 0.11 0.06 -0.62 0.02 -0.61
-1.85 -0.86 -0.45 0.0 0.43 0.66 0.73 0.43 0.76 0.42 0.13 0.09 -1.63 -0.07 -0.06 0.17 -0.48 0.0 -0.23 -0.61 -1.0 0.65 0.22 -0.37 -0.28 -0.14
-0.53 -1.88 -1.47 -1.08 -0.44 -0.29 -0.39 0.04 1.21 1.16 0.91 0.78 -0.66 -0.96 -1.81 -0.89 -0.85 0.23 -0.06 0.0 -0.87 1.16 -1.02 -0.17 0.81 0.2
-0.08 -0.29 -1.28 -0.44 -0.28 -0.83 0.47 0.63 1.12 0.88 0.73 0.66 -0.23 -0.66 -1.34 -1.91 -1.73 0.05 -0.59 -1.4 -0.34 0.83 -1.35 -0.11 1.1 -0.06
-1.19 -2.52 -1.62 -0.59 -0.25 0.33 0.38 0.42 1.39 1.28 0.79 0.66 -1.29 -0.8 -2.0 -0.98 -0.18 0.22 -0.37 -0.18 -2.27 0.83 0.26 -0.51 0.4 -0.57
-1.17 -0.74 -0.4 0.02 0.11 0.08 0.72 0.69 0.79 0.5 0.42 0.37 -0.48 0.44 -0.16 0.88 -0.14 0.48 -0.09 -0.11 -3.57 -0.88 -0.74 -0.87 -0.65 -0.69
-1.17 -0.58 -0.55 0.08 0.35 0.25 0.51 0.58 0.74 0.67 0.45 0.28 -1.32 0.07 -0.19 0.06 -0.17 -0.06 -0.4 -0.27 -2.52 0.14 0.24 -0.37 0.15 -0.35
-1.48 -1.08 -0.43 -0.12 -0.01 -0.09 0.53 0.55 0.66 0.72 0.52 0.2 -0.97 0.61 -0.08 0.84 0.18 0.21 -0.2 0.13 -2.01 -0.39 -0.69 -0.47 -0.54 -0.37
-0.81 -0.49 -0.58 -0.05 0.05 0.23 0.29 0.35 0.78 0.65 0.5 0.15 -0.41 -0.35 -0.33 0.21 -0.23 0.04 -0.35 -0.37 -2.71 0.6 0.43 -0.29 0.14 -0.52
-0.78 -0.92 -0.33 -0.08 0.01 0.03 0.71 0.64 0.51 0.67 0.32 0.23 -0.46 0.55 0.12 0.79 0.25 0.09 0.08 0.19 -2.29 -0.75 -0.59 -1.24 -0.68 -0.95
-1.24 -0.68 -0.15 0.89 0.79 0.58 0.62 0.35 0.68 0.52 0.58 0.44 -0.91 -0.32 -1.01 -0.42 -0.77 -0.24 -0.38 -0.56 -3.74 0.08 0.09 -1.08 0.16 0.05
-3.95 -1.83 -0.59 -0.03 0.42 0.48 0.59 0.54 1.02 0.91 0.9 0.36 -4.3 0.42 -0.21 0.29 -0.51 -0.53 -0.61 -0.47 -4.46 -0.05 0.22 -0.76 0.24 0.11
-2.59 -0.97 -0.81 0.0 0.36 0.18 0.35 0.49 0.78 0.6 0.53 0.32 -2.48 -0.4 -0.76 -0.73 -0.51 0.31 -0.23 -0.51 -2.5 1.14 0.04 0.08 0.22 0.56
-4.88 -1.81 -0.76 -0.03 0.21 0.65 0.81 0.83 0.8 0.53 0.76 0.4 -3.74 -0.63 -0.21 -0.57 -0.42 -0.26 0.33 -0.18 -3.51 1.24 0.46 -0.64 -0.88 -0.55
-3.55 -2.54 -0.75 -0.12 -0.39 0.11 0.83 0.45 0.97 0.15 0.23 -0.12 -2.81 -1.02 -0.45 -0.62 -0.36 0.27 0.33 -0.75 -4.16 1.71 0.8 -0.67 0.63 -0.02
-1.46 -1.44 -0.69 0.01 -0.22 -0.41 0.6 0.71 0.84 0.71 0.55 0.33 -0.98 0.31 -0.32 0.4 -0.28 -0.09 -0.5 -0.62 -2.55 1.13 -0.3 -0.5 -0.1 -0.11
-2.19 -1.02 -0.93 0.03 0.12 -0.02 0.22 0.37 0.75 0.78 0.15 -0.04 -3.09 0.05 -0.71 0.18 -1.35 -0.79 -0.55 -0.67 -0.98 1.57 0.52 -1.15 0.78 0.55
-0.11 -0.79 -0.87 -0.07 -0.24 -0.14 0.3 0.24 0.6 0.25 0.11 0.16 -0.2 0.23 -0.28 0.33 -0.29 -0.29 -0.18 -0.47 -1.5 1.22 -0.13 -0.34 0.34 -0.12
-4.06 -2.28 -0.81 -0.34 -0.19 -0.16 0.18 0.17 0.5 0.93 0.76 0.37 -2.27 0.61 -0.51 0.6 0.38 0.33 -0.22 0.43 -5.15 -0.3 -0.19 0.1 0.72 -0.17
-1.51 -0.85 -1.0 -0.13 -0.25 -0.83 0.06 0.27 0.47 0.58 0.71 0.4 -1.32 0.41 -0.57 0.22 0.0 0.61 -0.13 0.28 -3.05 -0.56 -0.32 0.73 0.58 0.29
-1.46 -0.85 -0.32 -0.11 -0.09 -0.26 0.6 0.55 0.3 0.58 0.27 -0.16 -1.27 0.7 0.09 1.02 0.4 0.47 0.21 0.12 -3.37 -0.64 -0.02 -1.06 -0.18 -0.71
-1.12 -0.79 -0.34 0.49 0.54 0.3 0.67 0.61 0.81 0.68 0.92 0.74 -0.66 -1.34 -1.39 -0.87 -0.82 -0.57 -0.74 -0.85 -6.18 1.53 -0.49 -0.82 -0.11 -0.75
-0.47 -0.53 -0.48 -0.05 -0.02 0.06 0.34 0.52 0.57 0.5 0.29 0.08 -0.44 -0.09 -0.46 -0.01 -0.29 0.16 -0.17 -0.08 -2.48 0.33 0.27 -0.22 0.25 0.19
0.07 0.01 -0.3 -0.03 -0.03 -0.26 0.2 0.46 0.8 0.69 0.75 0.4 0.02 -0.42 -0.63 -1.07 -0.47 -0.03 -0.01 -0.12 -1.75 0.51 -1.49 -0.04 0.02 -0.18
-1.27 -0.24 -0.22 0.38 0.22 0.43 0.55 0.53 0.63 0.42 0.41 -0.02 -0.73 0.07 -0.81 0.4 -0.7 0.3 -0.15 -0.76 -3.86 0.68 -1.14 -0.73 0.37 0.07
-0.48 -0.34 -0.58 -0.13 0.09 0.15 0.54 0.53 0.68 0.68 0.35 0.2 -0.63 -0.66 -0.68 -0.45 -0.12 0.15 -0.29 -0.0 -1.81 0.41 0.18 0.06 0.21 -0.34
-2.37 -1.6 -0.7 -0.6 -0.16 0.41 0.41 0.06 0.93 0.44 0.3 -0.01 -1.57 0.22 0.1 0.31 -0.06 -0.08 -0.02 -0.03 -2.63 1.24 -0.21 0.34 -0.05 -0.3
-1.96 -0.86 -0.78 -0.19 0.21 0.3 0.39 0.25 0.44 0.19 0.31 -0.07 -1.39 0.46 -0.57 0.2 -0.46 -0.72 -1.01 -1.48 -1.21 1.17 0.08 1.08 0.49 0.18
-0.96 -0.84 -0.27 0.17 0.15 0.01 0.34 0.32 0.67 0.51 0.58 0.25 -0.64 -0.06 -0.5 -0.14 -0.51 0.28 -0.08 0.02 -2.59 0.12 0.2 -0.32 0.24 0.21
-2.89 -1.72 -0.76 -0.47 0.17 0.43 0.69 0.4 1.01 0.54 0.45 0.15 -2.5 0.38 -0.16 0.62 -0.5 0.37 -0.53 -0.51 -2.12 0.11 -0.28 0.31 0.26 0.0
-0.93 -0.74 -0.62 -0.34 0.14 0.21 0.45 0.44 0.47 0.59 0.24 0.07 -0.54 -0.23 -0.44 -0.21 -0.51 0.04 -0.11 -0.54 -1.25 1.02 0.23 -0.11 0.33 0.05
-1.32 -0.67 -0.44 0.05 -0.07 -0.36 0.48 0.49 0.71 0.6 0.39 0.01 -1.09 0.35 -0.16 0.52 -0.27 0.42 -0.1 -0.37 -2.43 0.15 0.04 -0.07 0.2 -0.29
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-1.51 -2.73 -0.68 -0.09 0.15 0.05 0.64 0.52 0.3 0.85 0.54 0.17 -1.01 0.52 -0.02 0.74 0.25 0.25 0.17 0.02 -2.74 -0.07 -0.09 -0.68 -0.33 -0.67
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-2.16 -1.2 -0.76 -0.05 0.23 0.51 0.33 0.9 0.94 0.99 0.53 0.2 -1.76 -0.91 -0.99 -1.42 -0.55 0.62 0.5 0.12 -1.99 0.8 -0.53 -1.01 0.08 -0.14
-1.74 -0.71 -0.48 -0.01 0.26 0.31 0.86 0.76 0.88 0.53 0.13 -0.27 -1.44 0.08 -0.36 0.3 -0.27 0.44 -0.15 -0.41 -1.48 0.68 -0.49 -0.77 0.15 -0.77
- -1.94 -0.53 0.67 0.66 0.14 0.25 -0.12 0.86 0.94 1.23 0.66 - -1.34 -2.35 -1.63 -1.79 -1.28 -1.51 -1.22 -3.4 2.25 -0.53 0.57 -0.22 -0.44
-0.21 -0.56 -0.38 -0.09 -0.09 -0.03 0.4 0.26 0.56 0.47 0.46 0.06 -0.32 0.05 -0.43 0.07 -0.31 0.21 -0.14 -0.16 -2.75 0.46 0.26 -0.96 0.55 -0.07
-1.63 -1.03 -0.73 0.17 0.49 0.48 0.83 0.67 0.74 0.52 0.42 0.04 -1.5 0.09 -0.61 -0.27 -0.32 -0.64 -0.98 -0.53 -3.07 0.98 0.21 -0.88 0.46 0.13
-3.01 -0.5 -0.01 0.18 0.18 0.05 0.1 0.2 1.1 0.66 0.61 0.51 -2.75 -0.6 -0.13 -0.13 0.06 0.18 -0.12 -0.07 -2.12 0.93 -0.41 -0.76 -0.0 -0.29
-1.17 -0.69 -0.19 -0.05 0.17 0.06 0.32 0.34 0.56 0.46 0.35 0.19 -1.13 0.34 -0.34 0.26 -0.14 0.15 0.01 -0.06 -2.31 0.27 -0.26 -0.22 0.19 0.27
-2.01 -0.64 -0.49 0.01 0.19 0.04 0.3 0.25 0.78 0.73 0.64 0.29 -1.99 0.16 -0.21 -0.1 -0.24 0.18 -0.11 -0.35 -2.2 0.55 -0.3 -0.21 0.15 0.4

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.