Heatmap: Cluster_83 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.32 0.01 0.24 0.28 0.34 0.24 0.6 0.31 0.46 0.47 0.24 0.1 -0.78 -0.31 0.48 -0.51 -0.0 -0.03 -0.54 -4.04 -1.16 -3.15 -0.13 0.04 0.52 0.49 0.47 0.85 -0.32 -0.17 -0.74 -0.83
-0.24 -0.01 0.19 0.2 0.09 0.32 0.66 0.5 0.6 0.36 0.33 0.09 -0.91 -0.49 0.45 -0.33 -0.06 -3.24 -0.6 -4.62 -0.51 -0.52 -0.2 -0.19 0.64 0.62 0.66 0.74 -0.37 -0.36 -0.76 -0.65
-0.03 0.17 -0.05 0.25 0.09 0.2 0.04 0.26 0.06 -0.2 -0.14 -0.15 -2.31 -0.98 -3.29 -0.98 -0.59 -2.28 -0.59 -0.47 -0.13 -4.01 -0.9 -1.06 1.18 1.56 1.69 1.64 -0.66 -0.58 -0.77 -0.84
0.06 -0.0 0.13 0.21 0.3 -0.05 0.17 0.52 0.69 0.45 0.25 0.42 -1.37 0.33 -0.26 -0.81 -0.78 -1.64 -0.88 -2.48 0.15 -5.13 -0.48 -0.68 1.41 0.92 0.66 0.78 -0.59 -0.66 -0.59 -1.0
0.02 0.02 -0.13 0.25 0.29 0.27 0.34 0.6 0.4 0.36 0.33 0.22 -0.25 -0.45 -0.35 0.05 -0.48 -1.33 -0.46 -1.35 -0.45 -3.39 -0.47 -0.46 0.54 0.93 0.9 0.97 -0.52 -0.44 -0.8 -0.9
-0.0 0.11 0.09 0.22 0.46 0.49 0.47 0.35 0.35 0.19 0.06 0.06 -0.96 -0.74 -0.46 -0.84 0.09 -0.25 -0.77 -0.5 -0.15 -0.05 -0.5 -0.43 0.68 -0.53 0.55 0.71 -0.12 -0.06 -0.28 -0.45
-0.29 0.08 -0.39 0.26 0.32 0.24 -0.18 -0.1 -0.1 -0.06 0.18 -0.05 -0.25 -0.25 -0.92 -0.07 -0.21 -1.59 0.4 -4.44 -0.71 -5.61 -0.19 -0.14 1.57 0.82 0.93 1.08 -0.12 -0.05 -0.8 -0.8
0.1 -0.13 -0.21 -0.08 -0.14 -0.06 -0.28 0.42 0.32 0.35 0.37 0.23 -2.15 -2.6 -3.49 -1.49 -0.78 -1.85 -0.21 -2.06 0.03 -3.13 -0.27 -0.21 1.8 1.57 0.93 0.93 -0.12 -0.19 -0.52 -0.33
0.07 0.14 0.04 0.15 0.24 -0.02 0.02 0.18 0.05 0.3 0.31 0.24 -0.29 -1.1 -0.93 -0.29 -0.47 -1.01 0.07 -0.4 -0.51 -2.37 -0.55 -0.4 1.01 1.19 0.62 0.64 -0.34 -0.32 -0.28 -0.17
0.19 0.1 -0.09 0.26 0.31 0.29 0.15 0.43 0.26 0.16 0.07 0.17 -0.57 -0.62 -0.97 -0.59 -0.57 -0.98 -0.19 -2.27 0.35 -3.08 -0.6 -0.57 1.16 0.62 1.14 0.96 -0.54 -0.51 -0.67 -0.32
-0.15 0.02 -0.15 0.08 0.11 -0.05 -0.1 0.02 0.11 -0.03 0.03 0.01 -0.05 -0.28 -0.18 0.15 -0.51 -1.17 0.08 -0.64 -0.54 -0.67 -0.21 -0.15 0.97 0.88 0.78 0.72 -0.42 -0.36 -0.29 -0.25
0.06 0.05 -0.11 0.16 0.31 0.08 0.04 0.25 0.18 0.25 0.31 0.27 -1.36 -1.06 -1.64 -0.73 -0.51 -0.9 -0.01 -1.18 -0.32 -3.0 -0.58 -0.76 1.12 1.53 0.93 0.95 -0.42 -0.43 -0.21 -0.53
0.29 0.48 0.33 0.19 0.01 -0.12 -0.17 -0.15 -0.15 -0.2 -0.2 -0.05 -0.4 0.04 -1.75 -0.02 -0.35 -0.94 0.07 -3.44 -0.68 -3.28 -0.27 -0.12 0.87 0.99 1.25 1.5 -0.35 -0.3 -0.69 -1.18
0.31 0.18 0.15 0.45 0.48 0.36 0.35 0.58 0.47 0.47 0.31 0.41 -1.16 -0.63 -0.31 -1.05 -1.01 -2.47 -0.61 -0.63 -0.74 -0.23 -1.12 -1.27 1.03 0.8 0.84 0.87 -0.88 -0.86 -0.74 -0.8
-0.05 -0.06 -0.07 -0.12 0.05 -0.06 0.24 0.29 0.3 0.45 0.37 0.21 -0.14 -0.33 -0.41 -0.07 -0.78 -0.86 0.04 -1.61 -0.13 -1.48 -0.47 -0.41 1.07 0.89 0.46 0.56 -0.35 -0.28 -0.35 -0.14
-0.27 -0.12 -0.12 0.23 0.17 0.1 0.15 0.31 0.22 0.22 0.11 0.21 -0.13 0.01 0.08 -0.02 -0.42 -0.61 0.3 -2.26 -0.52 -0.74 -0.22 -0.35 0.24 1.17 0.46 0.26 -0.13 -0.23 -0.4 -0.38
0.35 0.11 0.11 0.15 0.11 0.34 0.27 0.34 -0.03 -0.02 0.06 0.35 -0.4 -0.9 0.66 -0.61 -0.14 -0.67 -0.14 -1.81 -1.7 -0.81 -0.59 -0.7 -0.03 0.54 0.94 0.92 -0.12 -0.2 -0.19 0.06
0.04 -0.07 -0.21 -0.01 0.07 0.05 -0.02 0.1 0.11 0.16 -0.15 -0.08 0.06 0.21 0.29 0.19 -0.24 -0.26 0.08 -3.91 -0.87 -1.14 0.06 0.1 0.34 0.53 0.91 0.83 -0.29 -0.32 -0.42 -0.42
0.08 0.1 -0.1 -0.07 -0.05 0.06 -0.16 0.15 0.17 0.15 -0.0 -0.06 -0.77 -0.42 -0.16 0.35 -0.41 -0.99 0.14 -1.15 -0.36 -0.43 -0.25 0.02 0.77 1.39 0.55 0.47 -0.24 -0.31 -0.7 -0.62
-0.4 -0.51 -0.27 -0.03 0.28 0.41 0.61 0.8 0.46 0.42 0.15 -0.04 -0.81 -0.4 -0.25 -0.78 -0.32 -0.61 -0.33 -1.69 -0.43 -1.45 -0.46 -0.56 0.94 0.9 0.62 0.76 -0.24 -0.29 -0.35 -0.29
-0.27 -0.1 -0.07 0.41 0.48 0.67 0.71 0.9 0.71 0.53 0.18 0.07 -1.4 -1.19 -1.14 -0.91 -0.45 -2.09 -0.45 -5.96 -1.17 -3.19 -1.0 -1.27 0.64 1.03 1.12 0.94 -0.45 -0.54 -0.04 0.19
0.19 -0.46 -0.64 -0.35 0.04 0.1 0.24 0.38 0.31 0.17 0.23 0.07 -1.13 -1.07 -1.29 -0.68 -0.66 -0.69 0.08 -1.05 -0.73 -0.54 -0.29 -0.09 1.24 0.75 0.94 0.94 -0.37 -0.34 0.32 0.04
-0.22 -0.05 -0.04 0.26 0.41 0.32 0.3 0.43 0.33 0.2 0.08 0.03 -0.32 0.33 0.09 -0.02 -0.55 -0.94 -0.46 -2.05 -0.17 -2.38 -0.44 -0.54 0.78 0.48 0.85 0.96 -0.33 -0.29 -0.71 -0.96
0.53 0.44 0.76 0.32 0.82 0.6 -0.31 0.36 0.56 0.43 0.48 0.55 -3.01 -0.74 -0.93 -1.84 -1.44 -2.09 -1.41 -0.7 -0.03 - -0.34 -0.64 1.64 0.02 0.8 1.01 -0.59 -0.69 -2.32 -1.68
0.23 0.03 -0.1 -0.12 0.08 -0.07 -0.15 0.0 0.08 0.41 0.45 0.18 -0.25 -1.5 -1.71 0.05 -0.67 -1.72 -0.3 -1.84 -0.69 -2.98 -0.33 -0.36 1.11 1.71 0.9 0.99 -0.37 -0.43 -0.42 -0.48
0.23 0.08 -0.04 0.01 0.14 -0.08 -0.11 0.2 0.11 -0.04 0.04 0.08 -0.57 0.3 -0.38 -0.41 -0.07 -1.06 -0.14 -1.73 0.04 -1.21 -0.83 -1.07 0.93 1.26 0.79 0.88 -0.2 -0.24 -0.43 -0.64
-0.01 -0.07 -0.36 -0.17 -0.45 -0.01 0.28 0.21 0.54 0.4 0.32 0.38 -1.51 -0.86 -0.13 -0.84 -0.79 -0.18 -0.27 -2.55 -0.92 -1.55 -0.73 -0.49 1.36 1.29 0.98 1.29 -0.32 -0.12 -1.38 -1.27
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-0.15 -0.89 -0.51 -0.21 -0.11 -0.17 0.17 0.78 0.73 0.8 0.59 0.29 -1.46 -1.86 -7.85 -1.62 -0.9 -0.55 -0.3 -2.98 -0.02 -7.51 -0.44 -0.18 1.97 1.06 0.83 0.73 -0.14 -0.19 -0.74 -0.62
0.02 0.1 0.3 0.56 0.6 0.66 0.7 0.73 0.61 0.46 0.3 0.12 -1.41 -0.95 -0.85 -0.77 -0.07 -0.84 -0.56 -0.24 -0.76 -2.53 -0.56 -0.91 0.69 -0.02 0.36 0.4 -0.11 -0.2 -0.31 -0.42
0.04 -0.15 -0.15 0.01 0.22 0.12 0.0 0.36 0.21 0.19 0.13 0.03 0.06 -0.51 -0.54 -0.11 -0.76 -0.92 -0.06 -1.88 0.32 -0.98 -0.14 0.0 0.97 0.45 0.71 0.6 -0.38 -0.39 -0.26 -0.03
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0.35 0.15 0.01 0.44 0.76 0.49 0.48 0.77 0.48 0.43 0.23 0.38 -2.19 -1.24 -0.49 -1.5 -0.84 -3.08 -0.56 -0.49 -1.2 -1.68 -1.27 -1.39 1.15 1.08 1.02 0.99 -0.77 -0.62 -0.9 -1.33
-0.08 -0.17 0.0 0.21 -0.16 0.3 0.3 0.47 0.46 -0.03 0.24 -0.01 -0.67 -0.6 -0.45 -0.11 -0.7 -1.22 -0.22 -0.81 -2.26 -0.31 -0.99 -0.89 0.93 1.16 1.15 1.17 -0.34 -0.64 -0.74 -0.66
0.1 -0.07 -0.06 0.23 0.39 0.22 0.12 0.28 0.25 0.13 0.26 0.17 -1.1 -0.33 -0.75 -0.45 -0.78 -1.54 -0.2 -2.46 -1.07 -2.39 -0.63 -0.24 0.84 1.22 1.25 1.52 -0.43 -0.43 -0.91 -1.48
0.3 0.21 0.07 0.14 0.28 0.29 0.36 0.27 0.34 0.33 -0.02 0.14 -0.55 -0.34 0.3 -0.53 -0.68 -1.68 -0.24 -1.43 -0.28 -3.03 -0.63 -0.59 0.72 0.53 1.15 1.05 -0.61 -0.68 -0.51 -0.43
0.19 -0.08 -0.37 -0.15 -0.18 -0.3 0.09 0.44 0.58 0.77 0.8 0.63 0.36 -0.21 -0.56 0.2 -0.97 -2.98 -0.23 -0.89 -1.04 -1.35 -0.47 -0.17 0.77 1.32 0.12 -0.14 -0.62 -0.46 -0.49 -0.21
0.13 0.46 -0.01 0.26 0.37 -0.0 0.27 0.26 0.04 0.01 0.36 0.26 -1.17 -0.17 -0.41 -1.28 -1.63 -1.69 -0.8 -1.64 -0.38 -1.95 -1.08 -0.79 1.07 1.77 1.47 1.31 -1.75 -1.47 -1.77 -1.64
0.2 -0.04 -0.13 0.04 0.49 0.26 -0.19 0.24 0.36 0.19 0.1 0.24 -0.66 -0.24 -0.01 -0.14 -0.71 -2.93 0.03 -5.46 -0.91 -1.19 -0.46 -0.6 1.33 0.97 1.03 1.19 -0.4 -0.37 -1.19 -1.76
-0.32 -0.19 -0.15 -0.18 -0.19 -0.21 -0.05 0.27 -0.19 0.05 0.2 -0.18 -0.03 -0.89 0.02 -0.11 -0.31 -1.82 -0.13 -2.5 -0.11 -2.43 -0.34 -0.38 1.25 1.61 1.04 1.01 -0.4 -0.3 -0.63 -0.59
-0.09 -0.28 -0.34 -0.21 -0.16 0.03 -0.05 0.49 0.24 0.28 0.3 0.17 -0.22 0.01 0.4 0.44 -1.02 -2.05 -0.19 -3.0 -0.29 -1.27 -0.38 -0.09 0.53 2.03 0.63 0.47 -0.97 -0.76 -1.25 -1.56
0.6 0.0 -0.24 -0.15 -0.1 -0.19 -0.03 0.43 0.67 0.86 0.88 0.9 -0.27 -1.28 -1.79 -0.49 -1.24 -2.56 -0.89 -1.99 -1.27 -3.12 -0.66 -0.42 1.23 1.88 0.44 0.3 -0.91 -0.87 -0.71 -0.61
0.45 0.42 0.61 0.28 0.32 0.27 0.33 0.23 0.18 0.24 0.34 0.29 -0.85 -0.67 -0.37 -1.0 -0.71 -3.04 -0.21 -0.59 0.22 -2.94 -0.91 -0.85 1.09 0.74 0.89 1.06 -0.97 -1.06 -0.9 -0.97
-0.31 -0.33 0.08 0.23 0.3 0.24 0.26 0.2 0.36 0.25 0.14 0.0 0.1 -0.68 -1.52 -0.28 -0.08 -0.66 -0.63 -1.46 -1.54 -5.61 -0.2 -0.14 0.79 1.32 0.89 1.06 -0.18 -0.15 -0.8 -0.46
-0.28 -0.13 -0.35 0.2 0.36 -0.19 -0.05 0.19 0.03 0.28 0.2 0.3 -0.52 -0.49 -0.7 -0.74 -0.4 -4.15 0.14 -1.73 0.22 -4.45 -0.23 -0.09 1.6 0.81 1.1 1.08 -0.44 -0.55 -0.83 -0.8
-0.15 0.04 0.06 0.09 0.18 0.13 0.15 0.11 0.18 0.16 -0.01 -0.05 -0.15 -0.08 -0.08 -0.24 -0.74 -1.3 -0.45 -0.92 -0.01 -1.27 -0.34 -0.25 0.89 1.06 1.0 0.98 -0.68 -0.58 -0.84 -0.68
0.23 0.14 0.18 0.25 0.27 0.19 0.22 0.23 0.26 0.31 0.21 0.25 0.1 -0.14 -1.19 -0.25 -0.36 -0.88 -0.81 -2.4 0.49 -4.67 -0.7 -0.56 1.18 0.51 0.77 0.74 -0.47 -0.54 -0.66 -0.41
0.06 0.21 -0.05 0.11 0.14 0.14 0.12 0.03 0.2 0.15 0.36 0.05 -0.12 -0.05 0.11 -0.07 -0.56 -0.65 0.26 -2.45 -0.34 -2.95 -0.5 -0.42 0.59 0.46 1.11 0.86 -0.42 -0.32 -0.45 -0.45
0.07 -0.07 -0.07 -0.19 0.0 -0.04 -0.43 0.04 -0.07 -0.1 0.01 -0.21 -0.53 -0.64 -0.85 -0.3 -0.15 -0.6 -0.08 -2.14 -0.51 -1.82 -0.19 -0.27 1.04 1.18 1.13 1.34 -0.08 -0.16 -0.27 -0.27
0.21 -0.19 -0.1 0.11 0.14 0.04 0.02 0.21 0.17 0.18 0.11 0.14 -0.38 -0.43 -1.12 -0.03 -0.47 -0.39 0.1 -1.87 -1.26 -2.54 -0.1 -0.04 1.32 0.99 0.59 0.2 -0.21 -0.09 -0.13 0.12
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0.28 0.25 0.35 0.34 0.63 0.42 0.29 0.37 0.3 0.23 0.16 0.17 -0.48 -0.74 -0.19 -0.32 -0.66 -0.82 -0.11 -1.75 -0.2 0.05 -0.65 -0.72 0.45 0.54 0.61 0.71 -0.52 -0.55 -0.88 -0.87
0.2 0.21 0.26 0.43 0.41 0.52 0.57 0.35 0.32 0.25 0.16 0.01 -0.88 -0.69 -1.51 -0.32 -0.05 -0.6 0.11 -0.35 0.37 -1.12 -0.84 -1.03 0.45 0.1 0.33 0.44 -0.17 -0.09 -0.28 -0.39
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0.13 0.01 -0.08 0.03 0.17 -0.12 -0.01 0.31 0.47 0.02 0.4 0.13 -0.38 -0.78 -0.19 0.12 -0.78 -2.94 0.06 -2.21 -1.37 0.3 -0.43 -0.17 0.38 1.4 0.92 0.93 -0.61 -0.42 -0.95 -0.62
-0.16 -0.16 -0.1 0.18 0.41 -0.06 -0.24 0.22 0.07 -0.07 -0.01 -0.3 0.35 0.28 -0.02 0.54 -0.28 -0.04 -0.1 -2.92 -1.35 -0.5 -0.03 -0.12 0.25 1.04 0.74 0.85 -0.46 -0.22 -1.14 -0.94
-0.01 -0.09 -0.16 -0.04 0.05 -0.19 -0.12 0.1 0.33 0.36 0.26 0.17 -0.04 -0.26 -1.08 0.07 -0.81 -2.33 -0.3 -1.24 -1.18 -0.38 -0.05 0.08 1.26 1.42 0.61 0.75 -0.66 -0.44 -0.73 -0.7
-0.42 -0.26 -0.16 0.04 0.24 0.16 0.13 0.35 0.13 0.06 -0.13 -0.31 -0.26 -0.37 -0.35 0.21 -0.47 -1.15 -0.15 -1.92 -1.49 -1.59 0.29 0.27 1.1 1.31 0.72 1.0 -0.21 -0.27 -0.92 -1.15
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-0.05 -0.3 -0.32 0.29 0.56 0.42 0.71 0.97 0.59 0.36 0.28 0.16 -1.48 -1.25 -1.09 -0.97 -0.39 -1.56 -0.45 -2.52 -0.7 -2.85 -1.11 -1.31 0.82 0.94 1.11 1.06 -0.43 -0.52 -0.09 -0.02
0.01 0.0 -0.05 0.27 0.13 0.12 0.14 0.17 0.16 0.14 0.06 0.11 -1.07 -0.92 -0.98 -0.86 -0.46 -0.86 -0.38 -0.84 -0.16 -2.06 -0.56 -0.65 1.38 0.93 1.16 1.21 -0.49 -0.42 -0.41 -0.49
-0.23 -0.1 -0.04 0.26 0.28 0.34 0.18 0.28 0.16 0.18 0.05 0.01 -0.49 -0.37 -0.19 -0.29 -0.18 -0.02 -0.22 -1.82 0.01 -1.73 0.16 0.03 0.69 0.29 0.7 0.66 -0.24 -0.13 -0.41 -0.47
0.04 -0.26 -0.31 -0.18 -0.07 -0.1 -0.03 0.36 0.34 0.47 0.45 0.28 0.14 -0.88 -1.7 0.1 -0.96 -1.31 -0.12 -2.34 0.03 -2.19 -0.14 0.2 1.47 0.9 0.45 0.56 -0.31 -0.23 -0.45 -0.27
-0.31 -0.06 0.04 0.32 0.43 0.4 0.62 0.74 0.69 0.68 0.5 0.15 -0.58 -0.35 -0.07 -0.57 -0.43 -2.47 -0.29 -3.21 -0.07 -4.68 -0.23 -0.24 1.01 0.11 0.52 0.56 -0.24 -0.3 -0.73 -1.13
-0.04 -0.24 0.0 0.02 0.16 0.04 -0.02 0.31 0.16 -0.06 0.04 -0.12 -0.01 -0.6 -0.89 0.09 -0.3 0.1 0.37 -2.4 -0.29 -1.67 -0.24 -0.13 0.54 0.93 0.67 0.96 -0.01 0.08 -0.49 -0.7
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-0.28 -0.06 -0.31 0.21 0.1 -0.17 0.02 0.24 0.25 0.18 0.03 -0.23 0.3 -0.23 -0.46 0.69 -0.65 -0.24 -0.28 -1.97 -1.0 -0.96 -0.05 -0.01 0.8 1.25 0.68 0.91 -0.67 -0.78 -0.77 -0.91
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.