Heatmap: Cluster_118 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.02 0.09 0.06 0.2 0.34 0.34 0.34 0.45 0.41 0.43 0.24 0.08 -0.29 -0.59 0.04 0.05 -0.33 -0.77 0.11 -0.02 -0.72 -0.14 -0.08 -0.2 0.34 -0.07 -0.21 -0.12 -0.1 -0.07 -0.38 -0.59
-1.07 -0.75 -0.68 0.59 1.1 1.06 -0.09 -0.39 -0.11 -0.94 -0.67 -1.15 -1.16 -1.56 -1.41 1.44 1.14 -0.34 0.47 0.63 -2.03 -3.48 0.48 0.04 -0.82 0.87 -0.35 0.43 0.09 0.2 -0.27 -2.08
0.43 0.16 0.0 0.25 0.31 0.3 0.29 0.3 0.23 0.45 0.35 0.4 -0.28 -0.28 0.17 -0.05 -0.3 -1.04 0.34 -0.74 - -1.9 -0.18 -0.15 -0.88 0.35 0.48 0.34 -0.13 -0.13 -0.18 0.18
-0.25 0.35 0.14 0.24 0.29 -0.07 0.12 -0.48 -0.04 -0.07 0.06 0.03 -0.35 0.63 1.38 0.29 0.3 -0.11 0.17 -0.27 -1.11 -3.89 0.68 0.57 -0.89 -0.18 -0.68 -0.31 -0.07 0.13 -1.12 -1.4
-0.94 -0.96 -0.65 -0.35 -0.56 -0.48 0.36 0.63 0.77 1.07 0.73 0.66 0.52 0.85 1.05 0.44 -0.96 -0.92 -0.59 -1.28 0.58 -1.95 -0.75 -0.71 0.57 -0.31 -1.09 -1.67 -0.1 -0.24 -0.35 -0.14
0.26 0.21 0.14 0.25 0.14 0.31 0.19 0.2 0.32 0.26 0.26 0.17 0.15 0.56 0.94 0.35 -0.12 -0.31 -0.14 0.32 -1.37 -2.17 -0.04 0.04 -1.72 -0.57 -0.68 -0.39 -0.15 -0.01 -0.47 -0.48
-0.12 0.18 0.15 0.23 0.04 -0.08 0.37 0.48 0.64 0.9 0.81 0.58 0.01 -0.46 0.43 -0.23 -0.95 -0.84 0.42 0.81 -1.78 -2.87 -0.29 -0.29 -0.71 0.1 -0.25 -0.5 -0.51 -0.36 -0.53 -0.4
0.58 0.52 0.54 0.47 0.66 0.59 0.01 0.26 0.38 0.28 0.27 0.04 -0.44 1.29 1.72 -1.28 -1.75 -0.32 0.96 -0.71 -3.92 -0.11 -1.88 -1.82 - -1.57 0.5 -0.19 -2.06 -1.53 -1.66 -0.83
0.23 -0.25 -0.62 -0.25 -0.05 0.32 0.74 0.42 0.54 0.52 -0.04 0.07 -1.4 -2.01 -0.52 -0.83 0.16 -0.01 0.76 0.68 -3.33 -5.69 -0.01 -0.26 -3.63 -1.53 -0.85 -0.93 0.9 0.89 1.14 0.77
-0.15 0.19 0.29 0.2 0.3 0.29 0.77 0.48 0.31 0.44 -0.25 -0.72 -0.06 -0.62 1.16 -0.18 -1.12 -2.58 0.43 0.73 -1.37 -0.63 -0.93 -0.83 -0.84 0.27 0.21 0.16 -0.65 -0.61 0.13 0.11
0.43 0.26 -0.11 0.11 0.17 0.23 0.18 0.32 0.53 0.39 0.35 0.19 -0.3 -0.66 0.09 -0.14 -0.48 -0.6 -0.03 0.19 -0.29 -1.05 -0.04 -0.0 -0.82 0.29 -0.04 0.03 -0.1 0.01 -0.24 -0.24
-0.35 0.3 0.44 0.63 0.3 0.63 0.83 0.58 0.38 0.32 -0.05 -0.14 -0.47 -1.08 -2.03 0.17 -0.27 -0.39 -0.67 -0.64 -0.39 -2.75 0.05 0.32 0.26 0.25 0.02 0.27 -0.26 -0.13 -0.26 -0.33
0.71 -0.17 -1.09 -0.72 -0.46 0.26 0.36 0.66 0.45 0.54 0.25 0.6 -2.15 -2.48 -0.74 -1.52 -0.38 -0.1 -0.51 0.36 -1.34 0.14 -0.79 -1.1 -2.29 -0.45 0.52 0.8 0.51 0.57 1.05 0.5
-0.67 -0.28 -0.07 -0.01 0.29 -0.09 -0.08 0.07 0.1 0.25 0.05 -0.01 0.73 0.77 1.16 0.84 -0.46 -1.21 -0.04 -0.6 -0.44 -0.4 -0.28 0.29 -0.68 0.5 -0.12 0.13 -0.46 -0.32 -1.31 -1.14
0.23 0.04 0.03 0.07 0.16 0.1 -0.17 0.3 0.38 0.46 0.52 0.6 0.17 0.12 -0.29 0.08 -0.51 0.57 -0.26 -0.17 -0.34 -0.12 0.09 0.1 -1.48 -0.05 -0.98 -0.94 -0.05 -0.18 -0.22 -0.15
0.43 0.15 -0.03 -0.17 -0.13 -0.08 -0.13 0.01 0.2 0.47 0.41 0.46 0.47 0.67 -0.06 0.62 -0.71 0.06 -0.21 0.04 -0.28 -0.96 0.12 0.45 -1.14 0.26 -0.91 -1.13 -0.44 -0.5 -0.21 -0.17
-0.66 -0.44 0.06 0.05 0.24 0.24 0.27 0.29 0.24 0.15 0.08 -0.4 1.11 0.37 1.06 0.02 -0.51 -0.54 -0.07 -0.19 -0.85 -0.23 0.0 0.13 -0.75 -0.24 0.27 0.36 -0.58 -0.41 -0.96 -0.94
0.42 -0.31 -0.4 -0.01 -0.2 -0.14 -0.87 -0.71 -0.77 0.16 -0.81 0.15 -2.08 -0.82 -2.63 -0.13 -0.42 0.32 1.66 1.12 - - 0.06 0.51 -0.21 0.43 0.08 0.19 -0.32 0.18 0.72 1.06
0.29 0.3 0.23 0.26 0.22 0.26 0.06 0.15 0.31 0.27 0.18 0.26 -0.02 0.25 0.29 0.56 -0.4 -0.95 0.32 -0.39 -0.9 -0.35 -0.23 -0.06 -0.96 -0.22 -0.1 0.01 -0.18 -0.03 -0.5 -0.46
0.17 -0.02 0.09 0.22 0.19 0.19 0.18 0.42 0.39 0.38 0.26 0.28 0.5 -0.45 0.25 0.41 -0.45 -1.36 0.36 -0.13 -2.77 -2.51 -0.17 -0.07 -1.41 0.7 0.23 0.34 -0.31 -0.26 -0.28 -0.28
-0.18 -0.51 -0.44 -0.21 -0.17 -0.17 0.13 0.63 0.56 0.68 0.52 0.44 -0.05 0.04 1.05 -0.06 -0.72 -0.77 -0.06 0.2 0.01 -0.98 -0.35 0.05 -1.24 0.58 -0.71 -0.7 -0.51 -0.45 0.04 0.32
0.5 0.18 0.12 0.02 0.44 0.35 0.19 0.11 0.18 0.05 -0.05 -0.07 -0.0 -0.02 0.69 -0.07 -0.5 -0.68 0.25 0.42 -1.08 -1.58 -0.3 -0.42 0.05 0.02 0.6 0.51 -0.58 -0.55 -0.62 -0.67
-0.04 0.18 0.29 0.32 0.4 0.17 0.24 0.18 0.14 -0.05 0.07 -0.16 -0.12 -0.17 0.01 -0.18 -0.16 -0.62 0.3 0.35 -1.31 0.24 0.05 -0.03 0.9 -0.38 0.19 0.03 -0.37 -0.34 -1.12 -1.03
0.3 0.47 0.4 0.29 -0.12 -0.04 0.49 0.27 0.57 0.52 0.33 0.69 -0.72 -0.3 0.52 -0.32 -0.18 -0.16 0.41 0.09 -0.81 -3.4 0.05 -0.09 -0.5 -0.41 -0.58 0.07 -0.3 -0.62 -0.33 -0.7
-0.95 -0.47 -1.13 -0.28 -1.07 0.07 0.13 -0.01 0.0 -0.38 -0.82 -0.94 -4.33 -4.47 -2.65 -1.77 0.53 -0.66 1.37 0.97 -3.14 -0.22 -0.82 -1.56 -0.19 0.66 1.49 2.01 0.92 1.06 -1.16 -2.08
-0.13 0.3 0.46 0.4 0.66 0.42 0.35 0.25 0.58 0.2 0.19 -0.09 -0.14 0.27 0.6 0.22 -0.29 -0.99 -0.72 0.33 -2.29 -1.12 0.67 0.61 -0.88 -0.61 -0.56 -0.12 -0.65 -0.25 -1.03 -0.94
-0.04 0.61 0.85 0.91 0.69 0.61 0.54 0.53 0.15 0.32 0.44 0.02 -1.06 -2.47 -1.41 -2.57 0.25 -0.54 0.15 -0.4 -2.0 -1.12 0.33 0.13 -2.35 0.12 0.37 0.54 0.01 0.0 -0.84 -1.19
0.17 0.02 0.03 0.27 0.52 0.29 0.42 0.42 0.46 0.39 0.48 0.25 -0.5 -0.28 0.22 -0.72 0.12 -0.62 0.08 -0.0 -1.2 -0.47 -0.14 -0.34 -1.15 -1.21 -0.05 0.02 0.15 0.4 0.09 -0.46
0.42 0.39 0.22 0.3 0.33 0.47 0.15 0.06 0.33 0.27 0.22 0.16 0.18 -0.21 -0.07 0.53 -0.28 -0.27 0.01 0.81 -0.5 -0.26 0.09 0.17 -2.01 -0.89 -1.01 -1.18 -0.3 -0.26 -0.39 -0.4
-0.14 0.0 -0.02 0.3 0.3 0.17 0.39 0.23 0.31 0.15 -0.11 -0.38 0.13 0.98 1.22 0.32 -0.12 -0.39 0.16 -0.72 -4.35 -4.42 0.03 0.21 -2.9 -0.36 0.21 0.1 -0.18 -0.07 -0.25 -0.24
0.0 0.18 0.41 0.37 0.44 0.53 0.41 0.14 0.09 -0.01 -0.2 -0.33 0.07 0.81 1.08 0.08 -0.17 -0.81 -0.05 -0.35 -1.24 -2.12 0.09 0.0 -0.78 -0.65 0.12 0.2 -0.15 -0.05 -0.8 -1.06
0.91 0.53 0.29 0.65 0.7 -0.02 0.54 0.53 1.3 0.46 1.08 0.45 -3.24 1.22 2.08 -4.41 - -3.93 -1.78 -0.88 -1.32 0.71 -4.57 -5.61 -1.54 0.25 -0.03 -0.28 - - -5.62 -
-0.01 0.09 0.01 0.14 0.21 0.79 0.69 0.73 0.76 0.5 0.24 -0.03 -1.06 -1.9 -0.73 -0.46 -0.81 -0.04 0.22 -0.14 - -1.59 -0.23 -0.6 1.48 -0.63 0.73 0.61 -0.45 -0.2 -1.5 -1.77
-0.03 -0.27 -0.03 0.22 0.48 0.03 0.21 0.44 -0.21 -0.08 -0.36 -0.37 -0.42 -0.66 -0.42 0.44 -0.45 -1.42 1.13 0.4 -3.93 -5.06 0.55 0.52 -0.38 0.16 0.34 0.26 0.29 0.3 0.01 -0.2
0.15 0.41 0.31 0.42 0.32 0.44 0.6 0.32 0.31 0.41 0.25 0.04 0.16 -0.42 -0.08 -0.07 -0.44 -0.67 -0.5 -0.12 -0.0 -2.67 -0.13 -0.07 0.45 -0.58 0.43 0.45 -0.58 -0.45 -1.24 -1.12
-0.15 -0.08 0.05 0.25 0.59 0.29 -0.02 0.17 0.26 0.07 0.03 -0.2 0.15 -0.19 0.6 0.41 -0.15 -0.93 0.51 0.28 -2.81 -3.72 0.12 0.15 -2.32 0.52 0.29 0.46 0.02 -0.05 -0.6 -0.39
0.61 0.33 0.24 0.0 0.14 0.22 -0.19 -0.01 0.12 0.51 0.36 0.34 0.43 0.57 0.63 0.67 -0.86 -0.46 -0.15 -0.23 -0.17 -1.76 -0.33 -0.2 -0.11 0.2 -0.62 -0.61 -0.69 -0.1 -0.9 -0.98
0.32 0.54 0.17 0.38 0.27 0.28 0.43 0.24 0.43 0.34 0.47 0.29 -0.74 0.89 1.87 -0.12 -0.28 -0.58 -1.34 0.8 -2.18 -0.92 -0.76 -0.75 -2.02 -1.74 -1.16 -0.9 -0.74 -0.37 -0.46 -1.01
0.34 0.12 0.33 0.39 0.62 0.49 0.59 0.23 0.18 0.47 0.0 0.1 -0.26 -1.1 -0.03 -0.8 -0.65 -0.09 0.37 -0.03 -0.05 -1.35 -0.31 -0.34 0.18 -0.05 0.19 0.24 -0.78 -0.4 -0.47 -0.44
0.14 0.44 0.49 0.38 0.71 0.82 0.81 0.77 0.6 0.57 0.03 -0.05 -0.74 -1.11 0.11 -0.58 -0.2 -0.76 -0.08 -0.84 -1.76 -4.98 0.06 -0.06 0.42 -1.11 0.03 -0.01 -0.27 -0.39 -0.49 -0.39
0.31 0.4 0.06 0.35 0.48 0.39 0.62 0.43 0.26 0.47 0.35 0.44 -0.07 -0.92 -0.58 -0.44 -0.85 -1.75 -0.43 -0.69 -1.55 -1.15 -0.02 0.23 0.69 0.11 0.5 0.56 -0.45 -0.51 -0.82 -0.53
0.42 0.54 0.49 0.57 0.39 0.4 0.3 0.23 0.31 0.18 0.14 0.14 -0.19 0.63 0.3 -0.04 -0.12 -0.92 0.18 -1.72 -1.03 0.37 -0.57 -0.65 -0.59 -0.69 -0.22 -0.63 -0.14 -0.1 -0.51 -0.37
0.15 0.99 0.65 0.93 0.25 0.1 0.36 0.57 0.6 0.42 0.46 0.42 -0.39 -0.42 1.52 0.31 -0.02 -0.0 -0.85 -0.2 -3.65 -1.48 -0.08 -0.06 -1.76 -0.44 -2.39 -1.93 -0.2 -0.63 -1.74 -2.65
0.04 0.21 0.16 0.34 0.36 0.7 0.99 0.89 0.8 0.62 0.71 0.18 -0.9 -0.31 0.28 -0.17 -0.6 -0.56 -0.43 0.99 -3.77 -1.09 -0.36 -0.91 -3.33 -1.06 -0.66 -0.5 -0.3 -0.2 -0.36 -0.14
0.21 0.24 0.03 0.24 0.28 0.2 0.11 0.16 0.24 0.28 0.08 0.05 0.5 0.08 0.81 0.65 -0.55 -0.92 -0.0 0.03 -0.18 -1.04 -0.18 -0.06 -0.67 0.4 -0.11 -0.1 -0.56 -0.5 -0.98 -1.08
-0.18 -0.05 0.34 0.48 0.26 0.37 0.62 -0.04 0.45 0.14 0.16 -0.0 -0.66 0.71 0.72 0.09 0.25 -0.32 -1.36 0.23 -0.55 0.06 -0.32 -0.37 -0.72 -1.64 -0.3 0.12 -0.38 -0.14 -0.34 -0.33
-0.08 -0.06 -0.23 0.17 0.15 0.18 0.28 0.44 0.32 0.35 0.24 0.28 0.19 -0.21 0.43 0.39 -0.62 -1.34 0.13 -1.07 -1.43 -0.77 -0.16 0.07 -0.03 0.99 0.2 0.23 -0.23 -0.25 -0.66 -0.7
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0.19 0.36 0.13 0.32 0.13 0.23 0.21 0.17 0.18 0.22 0.1 0.09 0.22 -0.17 0.42 0.35 -0.28 -0.9 0.36 -0.08 -1.79 -1.62 -0.07 0.09 -1.02 0.06 0.28 0.2 -0.23 -0.18 -0.13 -0.29
0.61 0.42 0.42 0.38 0.31 0.69 0.16 0.33 0.32 0.47 0.4 0.33 -0.16 -0.14 0.56 0.05 -0.38 -0.98 0.09 -0.99 0.33 - -0.38 -0.19 -2.75 -0.43 -0.18 0.12 -0.5 -0.46 -0.15 -0.3
0.38 0.58 0.6 0.61 0.31 0.18 0.95 0.31 0.63 0.58 0.92 0.91 -1.83 -1.75 -0.4 -2.21 0.2 -0.92 0.59 0.27 -3.05 - -0.21 -1.5 -2.18 -0.21 -0.12 0.2 -0.62 -0.4 -0.12 0.05
0.21 0.28 0.06 0.31 0.5 0.61 0.19 0.1 0.2 0.32 0.02 0.03 0.32 -0.06 0.33 0.45 -0.01 -0.71 0.26 -0.79 -2.1 -1.41 0.17 0.1 -0.64 -0.5 -0.21 -0.03 -0.07 -0.08 -0.25 -0.27
0.04 0.23 0.11 0.33 0.5 0.59 0.6 0.52 0.51 0.41 0.22 -0.03 -0.59 -0.16 0.76 -0.57 -0.88 -1.04 -0.77 -0.43 -0.65 -0.94 -0.68 -0.88 0.59 -0.39 0.77 0.86 -0.87 -0.72 -0.89 -0.76
0.34 0.27 0.12 0.22 0.07 0.32 0.03 0.06 0.13 -0.04 -0.14 -0.06 0.13 0.86 1.13 0.37 -0.44 -1.19 0.33 0.28 -2.16 -1.66 -0.13 0.01 -0.15 -0.67 -0.11 -0.11 -0.25 -0.15 -0.68 -0.45
0.19 0.17 0.22 0.09 0.17 0.25 0.26 0.37 0.34 0.45 0.33 0.22 0.06 -0.27 -0.0 0.15 -0.3 -0.39 0.12 -0.67 -0.15 -0.73 -0.17 -0.2 -0.79 0.32 -0.29 -0.16 -0.15 -0.09 -0.27 -0.11
0.03 -0.04 -0.32 -0.05 0.17 0.19 0.22 0.35 0.39 0.4 0.41 0.25 0.09 -0.82 0.8 0.07 -0.66 -0.7 0.13 -0.09 -0.05 -0.48 -0.08 0.26 -0.95 0.34 0.18 -0.01 -0.49 -0.11 -0.65 -0.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.