Heatmap: Cluster_189 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-1.79 -0.71 -0.32 0.38 0.6 0.41 0.48 0.53 0.46 0.36 0.15 -0.03 -1.48 -0.13 -0.29 0.24 -0.02 0.46 0.2 -0.07 -2.38 0.36 -0.39 -0.36 -0.08 -0.21
-0.73 0.04 0.07 0.43 0.42 0.61 0.63 0.47 0.46 0.34 0.36 0.37 -0.49 -0.29 -0.16 0.04 -0.6 -0.26 0.13 -0.36 -3.45 0.25 -0.35 -0.77 -0.56 -0.33
-1.39 -0.28 -0.22 0.17 0.27 0.27 0.32 0.28 0.12 0.03 -0.33 -0.28 -2.0 -0.19 -0.36 -0.05 -0.15 0.45 -0.05 0.06 -2.87 0.53 -0.1 -0.03 0.99 0.67
-1.05 -0.93 -0.2 -0.36 -0.18 -0.23 0.18 0.25 0.45 0.62 0.36 0.14 -0.71 -0.4 -0.45 -0.19 -0.39 0.5 0.52 0.31 -2.37 0.11 0.18 0.11 0.46 0.4
-1.26 -0.69 -0.21 0.15 0.14 0.24 0.13 0.07 0.13 0.01 -0.1 -0.28 -1.25 -0.33 0.21 0.51 -0.3 0.24 -0.04 -0.09 -2.87 0.41 0.46 -0.07 0.66 0.7
-0.81 -0.3 -0.41 -0.31 -0.3 -0.99 -0.12 0.2 0.3 0.52 0.34 0.02 -1.15 -0.04 -0.47 -0.31 -0.23 0.63 0.35 0.02 -3.9 0.3 0.8 0.24 0.82 0.12
-1.1 -0.31 -0.38 0.07 0.27 0.06 0.3 0.36 0.89 0.78 0.47 0.18 -1.3 -0.18 -0.73 -0.94 -0.64 0.31 0.16 -0.22 -1.92 0.36 -0.37 0.19 0.27 0.12
-0.72 -0.65 -0.22 -0.02 0.15 0.22 0.38 0.36 0.52 0.7 0.41 0.02 -0.79 -0.65 -0.27 0.42 -0.29 0.84 0.1 -0.21 -4.39 -0.84 0.15 -0.52 0.29 0.12
-1.4 -0.08 -0.18 0.49 0.42 0.04 0.39 0.47 0.58 0.68 0.7 0.58 -1.09 -0.72 -0.47 -0.22 -0.41 0.25 0.27 -0.39 -5.27 -0.23 -0.26 -0.01 -0.19 -0.08
-0.43 -0.15 -0.02 0.07 -0.06 -0.71 0.09 0.26 0.15 0.55 0.38 0.1 -1.13 -0.12 -0.52 -0.1 -0.15 0.47 0.26 0.32 -6.36 0.39 0.1 0.01 0.39 0.12
-0.4 -0.15 -0.16 0.15 0.1 0.24 0.39 0.23 0.23 0.07 -0.1 -0.18 -0.54 -0.04 -0.01 -0.02 -0.22 0.7 0.25 -0.07 -2.84 -0.81 0.28 -0.23 0.44 0.23
-1.6 -0.46 -0.02 0.26 0.3 0.1 0.15 0.11 0.21 0.15 0.03 -0.05 -1.63 0.17 0.07 0.53 -0.22 0.13 0.11 -0.35 -1.17 0.61 0.37 -0.03 0.01 0.03
-5.19 -1.32 -0.13 0.24 0.4 0.47 0.13 0.1 0.66 0.12 0.51 0.2 -3.53 0.03 0.16 0.09 -0.24 0.33 -0.07 -0.35 -2.33 -0.15 0.26 0.02 0.84 0.15
-3.22 -0.18 0.28 0.2 0.73 0.55 0.33 -0.09 0.23 0.31 -0.14 -0.35 -2.1 -0.07 0.12 0.06 0.17 0.34 0.39 0.3 -2.18 0.31 -0.22 -0.62 0.08 -0.08
-0.31 -0.79 -0.33 -0.01 0.06 -0.14 0.02 0.17 0.04 -0.03 0.2 0.2 -0.18 0.12 0.01 0.04 -0.28 -0.25 -0.22 -0.49 -2.04 0.49 0.45 0.04 0.83 0.44
-0.62 -0.2 -0.62 -0.05 0.18 0.36 0.43 0.25 0.51 0.41 0.13 -0.03 -0.7 0.24 -0.38 0.29 -0.49 0.38 0.23 0.07 -3.24 -0.01 -0.2 -0.16 0.18 0.08
-1.98 -0.77 -0.48 0.21 0.34 0.11 0.57 0.46 0.58 0.39 0.23 0.13 -2.11 0.09 -0.14 0.23 -0.07 0.33 0.13 0.07 -2.33 -0.39 -0.06 -0.01 0.35 0.09
-1.75 -0.59 -0.07 0.46 0.55 0.12 0.33 0.22 0.68 0.22 0.27 0.03 -1.94 0.04 0.03 0.05 -0.49 0.18 0.07 -0.35 -1.78 -0.19 0.29 -0.12 0.43 0.07
-1.58 -2.21 -1.13 -0.91 0.31 0.47 0.61 0.38 0.94 0.53 0.22 -0.13 -2.2 -0.11 -0.45 -0.62 -0.09 0.58 0.27 -0.16 -3.16 -0.18 0.23 0.94 0.45 0.07
-0.24 -0.58 -0.61 0.15 -0.1 -0.4 0.23 0.39 0.36 0.51 0.55 0.03 -1.07 -0.37 -0.19 -0.41 0.04 0.26 0.4 0.01 -5.15 -0.32 0.34 -0.02 0.52 0.5
-5.04 -2.86 -1.04 -0.02 0.24 0.15 0.52 0.24 0.39 0.51 0.01 -0.6 -2.73 -0.32 -0.42 -0.46 0.16 0.52 -0.22 0.19 -2.9 0.26 0.58 0.36 1.27 0.62
-2.06 -0.76 -0.35 0.04 -0.16 -0.26 0.17 -0.08 0.45 0.4 0.33 0.5 -1.04 0.28 0.05 0.25 -0.39 -0.27 -0.32 -0.6 -2.61 0.62 -0.31 0.65 0.9 0.38
-3.02 -1.43 -0.27 0.44 0.46 0.41 0.7 0.72 0.27 0.02 0.23 -0.06 -2.66 0.13 0.18 0.48 -0.16 -0.09 -0.31 -1.0 -1.12 -1.24 0.68 -0.44 0.77 0.18
-1.83 -0.59 -0.48 0.39 0.3 -0.04 0.08 0.39 0.51 0.36 0.68 0.35 -2.31 -1.05 -0.67 -1.15 -0.54 0.66 0.02 -0.47 -3.65 0.87 0.79 -0.08 0.39 0.29
-0.69 0.16 0.28 0.23 0.14 -0.04 0.18 0.2 0.2 0.23 0.08 0.03 -0.72 -0.18 0.03 -0.15 -0.09 0.41 0.28 0.2 -2.79 0.24 -0.4 -0.13 -0.2 0.29
-1.28 -0.34 0.08 0.24 0.5 0.6 0.42 0.54 0.55 0.27 0.11 -0.27 -1.99 0.04 0.59 -0.39 -0.49 0.63 -0.11 -0.77 -3.48 0.09 -0.39 -2.29 0.81 0.09
-1.69 -0.71 -0.1 -0.08 0.34 0.39 0.49 0.24 0.41 0.09 -0.0 -0.41 -2.0 0.13 -0.17 -0.41 -0.67 0.44 0.16 -0.4 -3.31 0.15 0.58 0.26 0.74 0.55
-2.39 -0.87 -0.42 0.16 0.65 0.22 0.67 0.62 0.91 0.67 0.68 0.58 -2.15 -0.17 -0.55 -0.41 -0.64 0.35 0.25 -0.34 -4.96 -0.65 -0.41 -0.03 0.08 0.12
-1.55 0.33 0.34 0.59 0.61 0.48 0.41 0.51 0.34 0.17 0.07 0.01 -1.37 -0.3 -0.15 -0.04 -0.42 0.57 0.15 -0.4 -4.53 -0.49 -0.36 -0.65 0.3 -0.08
-0.58 -0.07 0.05 0.18 0.34 0.12 0.39 0.32 0.07 0.22 0.08 -0.11 -0.66 -0.02 -0.25 -0.17 0.03 0.37 0.46 0.29 -3.88 -0.01 -0.1 -0.39 0.12 -0.02
-0.86 -0.56 -0.36 -0.18 0.18 0.29 0.43 0.21 0.27 0.17 0.19 0.19 -0.91 -0.2 -0.44 0.18 -0.15 0.45 0.11 -0.01 -2.41 0.34 0.44 -0.17 0.27 0.15
-1.13 0.12 0.1 -0.1 -0.16 -0.18 0.23 0.31 0.58 0.53 0.4 0.34 -1.0 -0.5 0.16 -0.34 0.04 0.6 0.48 0.32 -3.38 0.52 -0.91 -1.03 0.06 -0.26
-0.26 -0.32 -0.02 0.3 0.44 0.28 0.56 0.49 0.24 0.25 0.27 0.12 -0.3 -0.26 -0.22 -0.09 -0.16 0.02 -0.06 -0.15 -2.95 -0.07 -0.35 -0.43 0.33 -0.07
-3.85 -0.68 -0.39 0.19 0.45 -0.35 -0.16 -0.02 0.41 0.57 0.74 0.19 -4.06 -0.41 -1.06 -0.7 0.06 -0.32 -0.32 -0.24 -3.62 0.88 -0.08 0.44 1.26 0.79
-2.3 -1.5 -0.47 0.1 0.45 0.46 0.51 0.2 0.24 0.19 -0.08 -0.42 -1.78 0.22 0.38 0.34 0.15 0.1 0.21 0.09 -2.81 0.71 0.49 -0.22 0.08 -0.32
-0.63 -0.25 0.17 0.72 0.65 0.2 0.62 0.67 0.42 0.29 0.34 0.02 -1.07 -0.34 -0.26 -0.12 -0.07 0.2 0.0 -0.11 -5.58 -1.12 -0.58 -0.68 0.29 0.03
-2.69 -0.53 -0.13 0.25 0.59 0.65 0.43 0.25 0.26 0.03 0.07 0.05 -2.72 -0.53 -0.06 0.11 0.01 0.6 0.23 0.11 -3.95 0.55 -0.03 -0.14 0.26 -0.2
-1.55 -0.25 0.12 0.33 0.42 0.1 0.42 0.32 0.67 0.43 0.52 0.59 -1.29 0.15 -0.14 0.15 -0.37 0.08 -0.16 -0.37 -3.98 -0.25 -0.07 -0.39 0.03 -0.11
-2.62 -0.85 0.31 0.6 0.34 -0.26 0.0 -0.04 0.04 0.28 0.13 0.09 -2.17 0.65 -0.43 -0.04 0.19 0.49 -0.2 0.45 -1.71 -0.75 -0.02 0.02 0.41 0.61
-1.48 -0.92 -0.26 0.12 0.51 0.68 0.78 0.56 0.48 0.27 0.1 -0.21 -1.22 -0.19 -0.46 -0.23 -0.14 0.04 -0.32 0.17 -1.63 0.05 0.5 -0.0 -0.02 -0.08
-1.61 -0.87 0.04 0.42 0.55 0.07 0.1 0.1 0.3 0.08 -0.08 -0.09 -1.42 -0.05 0.15 0.15 -0.39 0.56 0.61 -0.14 -2.61 0.13 -0.07 0.1 0.24 0.3
-1.65 -0.71 -0.75 -0.67 -0.43 -0.11 0.18 -0.13 0.06 0.28 0.22 0.11 -1.68 0.3 0.28 0.5 0.08 0.91 0.43 -0.01 -1.85 0.53 -0.1 -0.01 0.47 0.18
-1.99 -0.94 -0.22 0.18 0.26 0.26 0.79 0.49 0.42 -0.14 -0.31 -0.56 -2.39 -0.18 -0.04 0.06 -0.2 0.45 0.01 -0.43 -2.27 0.62 0.26 -0.26 0.78 0.48
-3.15 -1.22 -0.31 0.08 0.34 0.28 0.41 0.2 0.35 0.32 0.03 -0.16 -2.01 0.17 0.01 0.19 0.17 0.45 0.16 -0.11 -1.21 -0.37 0.31 0.16 0.51 0.21
-0.97 -0.34 -0.38 0.13 0.28 0.06 0.26 0.15 0.22 0.0 0.05 -0.21 -1.26 -0.26 -0.04 -0.32 -0.26 0.67 0.2 0.1 -3.87 0.48 0.17 -0.01 0.8 0.28
-2.28 -1.05 -0.52 -0.26 -0.32 -0.93 -0.02 -0.06 0.07 0.37 0.19 0.04 -1.96 0.28 0.02 0.35 0.23 0.71 0.4 0.18 -2.13 0.01 0.35 0.18 0.74 0.74
-0.94 -0.41 -0.15 0.21 0.19 0.27 0.25 0.45 0.55 0.38 0.41 0.09 -1.2 0.38 0.11 0.32 -0.07 0.23 0.2 0.02 -2.7 -1.07 0.13 -0.56 -0.09 -0.15
-2.02 -0.61 -0.4 0.04 0.1 -0.15 -0.08 0.03 0.5 0.65 0.38 0.24 -2.03 0.01 -0.16 -0.05 -0.27 0.69 0.3 -0.09 -2.13 -0.17 0.19 0.05 0.56 0.5
-2.69 -0.58 -0.04 0.29 0.68 0.9 0.93 0.67 1.11 0.4 0.09 -0.43 -2.87 -0.55 -0.42 -0.61 -0.22 0.32 -0.11 0.04 -3.47 -0.58 0.04 -0.76 0.13 -0.04
-0.71 -0.38 -0.23 0.05 0.27 0.35 0.4 0.34 0.42 0.29 0.2 0.13 -0.56 -0.03 -0.04 0.11 -0.18 0.4 -0.06 -0.34 -2.7 0.27 0.03 -0.14 0.01 -0.15
-3.22 -0.94 -0.67 -0.48 -0.1 -0.1 0.08 -0.1 0.29 0.1 -0.13 -0.31 -2.87 0.73 0.01 0.42 0.09 0.39 0.07 -0.38 -2.09 0.53 0.76 -0.05 1.06 0.48
-0.45 -0.17 -0.24 0.21 0.52 0.19 0.35 0.15 0.07 -0.13 -0.08 -0.12 -0.75 0.03 0.43 0.0 -0.12 0.24 0.22 -0.21 -3.66 0.23 0.34 -0.28 0.27 -0.08
-0.63 -0.47 -0.24 -0.18 -0.01 -0.41 0.07 0.11 0.02 0.28 0.08 -0.08 -0.72 0.29 -0.03 0.21 0.09 0.52 0.16 0.23 -3.95 0.73 0.44 -0.43 0.38 -0.1
-0.29 -0.29 -0.49 -0.13 -0.13 -0.24 0.36 0.44 0.22 0.2 -0.04 -0.46 -0.82 -0.28 0.1 -0.09 0.21 0.6 0.57 0.28 -3.36 0.38 0.16 -0.12 0.42 -0.33
-0.87 -0.04 -0.23 0.4 0.49 0.12 0.5 0.65 0.46 0.25 0.09 -0.21 -1.26 -0.77 -0.45 -0.61 -0.09 0.38 0.27 0.03 -4.53 0.68 -0.17 -1.09 0.67 -0.15
-3.55 -1.26 -0.52 -0.39 0.01 -0.03 -0.17 -0.19 0.12 -0.04 -0.41 -0.54 -3.14 0.79 0.43 0.54 0.12 0.41 0.16 0.04 -2.26 0.18 0.09 0.49 0.93 0.9
-1.26 -0.07 0.16 0.4 0.41 0.19 0.38 0.47 0.52 0.1 -0.01 -0.19 -2.26 -1.32 -0.45 -0.9 0.0 0.54 0.06 0.61 -8.58 0.61 0.21 -0.5 0.41 0.04
-0.33 -0.35 -0.19 0.18 0.44 0.32 0.5 0.44 0.54 0.25 0.38 0.05 -0.71 -0.22 0.1 -0.26 -0.25 0.32 0.09 0.05 -4.12 0.09 0.08 -0.8 0.02 -0.45
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-0.9 -0.48 -0.16 0.4 0.5 0.38 0.69 0.54 0.27 -0.13 -0.27 -0.42 -1.39 -0.46 -0.37 -0.15 -0.06 0.51 0.16 -0.14 -2.07 0.33 0.04 -0.08 0.44 0.06
-0.84 -0.31 -0.06 0.13 0.36 0.19 0.54 0.68 0.63 0.47 0.21 -0.19 -1.23 -0.47 -0.43 -0.28 -0.04 0.14 -0.04 0.19 -2.25 0.02 0.01 0.09 -0.16 0.05
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-2.22 -0.76 -0.33 -0.28 -0.18 0.15 0.4 0.27 0.45 0.51 0.19 0.15 -2.4 -0.05 -0.75 -0.4 -0.15 0.7 0.5 0.09 -2.81 -0.24 -0.08 0.27 0.81 0.68
-0.14 0.02 0.1 0.23 0.14 -0.23 0.23 0.24 0.12 0.14 0.15 -0.08 -0.44 -0.21 -0.16 -0.27 0.03 0.41 0.36 0.12 -3.19 0.23 -0.19 -0.05 0.05 0.11
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-1.82 -0.07 0.22 0.38 0.47 0.29 0.28 0.0 0.26 0.43 0.14 -0.27 -2.58 -0.36 0.23 -0.16 -0.03 0.81 0.44 0.29 -1.75 -0.07 -0.31 -0.12 -0.42 -0.07
-0.92 -0.44 -0.45 -0.0 0.18 0.33 0.2 0.28 1.03 0.53 0.72 0.39 -1.13 -0.15 0.16 -0.42 -0.47 -0.1 0.12 -0.68 -5.43 0.22 0.16 -0.51 0.31 -0.04
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-2.27 -2.18 -1.09 -0.23 0.08 -0.05 0.18 0.21 0.66 0.85 0.72 0.17 -1.87 -0.38 -0.85 -0.51 -0.35 1.01 0.0 -0.11 -2.41 0.15 0.65 0.7 0.28 0.06
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-2.55 -1.05 -0.46 0.06 0.22 0.37 0.35 0.34 0.46 -0.24 -0.29 -0.29 -2.36 0.39 0.01 -0.06 -0.05 0.14 0.03 -0.44 -2.14 0.46 0.45 0.25 0.77 0.64
-1.95 -0.73 -0.53 -0.16 0.3 0.55 0.58 0.35 0.15 0.07 0.07 -0.3 -1.77 -0.33 -0.09 -0.17 -0.23 0.35 0.29 -0.33 -1.92 0.03 0.55 0.41 0.75 0.31
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-1.21 -0.41 -0.23 -0.01 0.24 0.7 0.64 0.23 0.42 0.15 -0.24 -0.4 -1.23 -0.09 -0.21 0.07 -0.15 0.67 0.41 0.15 -2.89 0.31 -0.35 -0.31 0.03 0.27
-0.76 -0.44 -0.25 0.22 0.52 0.64 0.73 0.28 0.64 0.58 0.12 0.01 -0.67 0.12 -0.52 0.04 -0.67 -0.16 -0.08 0.0 -4.77 -0.2 -0.07 0.11 0.03 -0.36
-1.13 -0.63 -0.29 0.13 0.39 0.69 0.67 0.4 0.17 -0.22 -0.32 -0.28 -0.97 0.23 0.33 0.35 -0.11 0.34 0.08 -0.23 -1.97 0.29 0.23 -0.45 -0.08 -0.14
-1.26 -0.76 -0.53 -0.32 -0.07 0.13 -0.02 -0.14 -0.05 -0.25 -0.47 -0.6 -1.49 0.39 0.07 0.15 -0.01 1.03 0.58 -0.14 -1.52 0.49 -0.23 0.14 0.68 0.86
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-2.29 -0.18 -0.05 0.54 0.55 0.24 0.4 0.42 0.2 0.62 0.4 0.46 -2.19 -1.22 -0.92 -0.98 -0.08 0.29 0.19 0.21 -4.53 0.56 -0.26 -0.44 0.65 0.02
-0.01 -0.33 -0.29 0.39 0.39 0.13 0.64 0.56 0.48 0.46 0.52 0.45 -0.19 -0.58 -0.49 -0.34 -0.52 0.1 0.21 -0.58 -4.59 -1.2 0.02 -0.49 0.33 -0.03
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-2.41 -1.6 -0.96 -0.33 -0.22 -0.35 0.66 0.33 0.28 0.23 -0.08 -0.35 -2.71 0.03 -0.21 0.74 0.4 0.36 0.24 0.23 -2.24 1.0 1.02 -0.24 -0.06 -0.19
-2.56 -1.03 -0.46 0.07 0.31 0.18 0.47 0.37 0.25 0.11 0.04 -0.25 -2.07 0.08 0.18 0.22 0.17 0.4 0.08 0.02 -1.51 0.32 0.31 -0.3 0.65 0.07
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-0.28 0.17 0.23 0.32 0.53 0.28 0.41 0.61 0.33 0.31 0.43 0.38 -0.76 -0.12 -0.38 -0.2 -0.28 -0.01 -0.13 -0.04 -5.62 -0.59 -0.54 -0.45 0.22 -0.24
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-2.14 -1.45 -0.46 0.22 0.23 -0.28 0.11 0.29 -0.2 0.15 0.15 -0.06 -1.96 0.27 -0.73 0.43 -0.0 -0.35 -0.39 -0.3 -1.84 0.99 -0.07 -0.04 1.19 0.94
-2.5 -0.7 -0.4 -0.09 0.23 0.38 0.58 0.57 1.02 0.59 0.49 0.25 -2.09 -1.08 -0.84 -0.79 -0.46 0.76 -0.04 -0.25 -5.28 0.1 0.49 -0.18 0.42 0.19
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-1.56 -0.63 -0.7 -0.14 0.02 0.07 -0.03 -0.1 0.43 0.07 0.18 -0.06 -1.75 -0.02 -0.15 -0.19 -0.1 0.36 0.36 -0.22 -0.08 0.94 0.22 0.04 0.17 0.5
-1.3 -0.59 -0.99 -0.04 -0.02 -0.02 0.55 0.51 0.46 0.14 -0.05 -0.24 -1.44 -0.1 -0.51 -0.08 -0.75 0.46 0.22 -0.38 -2.62 -0.21 0.62 0.49 1.22 0.21
-0.67 -0.3 -0.05 -0.13 -0.0 -0.24 0.2 0.14 -0.05 0.23 0.17 0.05 -0.85 -0.02 -0.11 -0.05 0.06 0.29 0.07 0.13 -1.99 0.18 0.53 -0.12 0.65 0.16

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.