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Heatmap: Cluster_94 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
- - - -2.07 -2.14 -0.34 -0.28 -0.17 -1.66 -2.66 -1.72 - 0.85 -3.15 -0.47 1.49 0.99 1.68 1.56 - - - 1.08 1.02 - -1.4 0.82 1.09 1.25 1.02 -0.55 0.19
-0.23 -0.17 -0.6 -0.47 -0.46 -0.47 -0.85 -1.01 -1.28 -0.54 -0.94 -0.56 0.54 -0.4 -0.28 1.15 0.11 0.45 0.84 - - - 1.6 1.54 -2.56 0.63 -0.15 0.2 0.46 0.57 0.11 -0.06
-0.28 -0.55 -0.73 -0.37 -0.6 -0.41 -0.18 -0.52 0.0 0.13 0.08 0.04 -0.59 -1.92 1.26 0.14 0.64 1.81 -1.38 -2.73 -6.49 -1.49 1.18 1.09 - -3.14 -1.74 -3.27 0.99 1.24 0.12 0.25
-0.06 0.7 0.43 -0.03 -0.05 -0.01 0.15 -0.34 -0.03 0.01 -0.24 -0.38 0.65 0.63 -1.37 1.25 0.23 0.5 -2.17 -1.93 0.15 -7.7 1.51 1.0 -0.31 -3.16 -1.94 -1.46 -0.06 0.16 -0.97 -0.78
-0.28 -0.29 -0.42 -0.47 -1.5 -0.44 -0.54 -0.73 -0.23 -0.16 -0.44 -0.41 1.17 -0.44 -0.92 0.91 0.27 1.31 0.19 -0.94 -1.14 0.09 0.94 0.8 0.01 -2.37 -1.79 -1.67 0.78 0.82 0.17 -0.09
-0.04 0.28 -0.04 -0.14 0.33 0.46 0.29 -0.04 0.13 0.25 0.36 0.23 0.38 -0.39 -1.2 1.03 -0.59 -0.83 0.77 -4.94 -5.82 -0.98 1.02 1.13 -3.04 -0.6 -0.88 -0.47 0.08 -0.07 -0.04 0.13
-0.89 -0.66 -0.23 -0.7 -0.59 -0.57 -0.64 -0.6 -0.62 -0.63 -0.84 -0.5 1.03 1.72 -1.69 0.18 -0.53 -1.09 -2.33 -3.56 -1.67 - 2.11 1.92 0.23 0.24 0.37 0.23 -0.8 -0.31 -0.44 -0.8
-0.03 -0.33 -0.43 -0.25 -0.06 0.11 -0.27 -0.04 0.17 -0.12 -0.03 -0.65 0.53 0.35 0.51 0.83 0.02 0.35 0.44 -1.35 -1.93 -0.8 0.62 0.76 -0.77 0.27 -0.2 -0.11 0.05 0.36 -0.72 -0.74
-0.27 0.04 0.15 -0.01 -0.1 -0.06 0.39 0.15 0.43 0.23 0.39 -0.18 0.92 0.27 -3.79 0.96 -0.57 -0.64 0.43 -7.11 -0.23 -6.05 1.03 0.79 -1.29 -0.22 -0.09 0.3 -0.19 -0.07 -0.13 -1.22
-0.86 -0.49 -0.44 -0.62 -0.58 -0.54 -0.27 -0.69 -0.31 -0.21 -0.64 -0.82 0.34 -0.55 -0.31 0.16 0.44 1.02 0.92 -0.48 -0.08 -0.62 0.22 0.38 0.52 0.07 -0.18 -0.09 0.59 0.73 0.15 0.23
-1.63 -1.51 -2.25 -1.82 -2.31 -1.9 -1.48 -2.34 -1.34 -1.0 -1.86 -1.49 1.02 -0.61 -1.06 1.13 0.72 1.22 1.01 -4.18 -1.72 1.12 1.15 0.97 -0.61 -0.86 -1.51 -1.53 1.43 1.22 0.78 0.64
0.16 0.2 -0.02 -0.25 -0.3 -0.26 -0.39 -0.32 -0.24 -0.18 -0.19 -0.06 0.52 0.53 -0.16 0.86 0.16 0.19 0.54 -0.86 -0.92 -1.94 0.74 0.7 -0.79 -0.07 -0.32 -0.2 0.35 0.29 -0.41 -0.4
-0.06 0.22 -0.15 -0.59 -0.7 -0.77 -0.29 -0.88 -0.45 -0.64 -0.41 -0.6 -0.84 0.67 -2.08 1.07 -0.3 -0.32 1.17 -4.5 -0.68 -8.96 1.59 1.61 -0.49 -1.86 0.29 0.52 0.26 0.58 -0.44 -0.31
-0.03 0.28 -0.09 0.1 -0.17 0.0 0.08 -0.43 0.15 0.07 -0.08 -0.05 0.48 -0.12 -1.42 0.67 -0.29 -0.41 0.53 -2.75 -0.39 -4.4 1.29 0.96 -0.72 0.43 0.1 0.28 -0.02 -0.1 -0.79 -0.62
0.05 0.01 -0.12 0.13 0.23 0.19 0.05 0.15 0.18 0.27 0.2 0.01 0.2 0.55 -0.16 0.82 -0.01 -0.04 0.15 -2.05 -0.83 -1.37 0.21 0.27 -1.36 -0.36 0.03 -0.16 0.05 -0.01 0.03 -0.08
-0.18 0.17 0.2 -0.05 0.25 0.22 -0.06 -0.0 0.14 -0.45 -0.39 -0.2 0.49 0.01 0.26 0.37 -0.09 0.27 0.43 -1.31 -1.16 -0.76 0.09 0.33 -1.32 0.52 0.32 0.51 -0.09 0.06 -0.58 -0.35
0.28 0.21 0.2 0.05 -0.14 -0.29 -0.19 -0.24 0.11 0.18 0.16 -0.1 0.46 0.47 -3.3 1.17 -0.48 -0.38 1.14 -1.93 -1.2 -3.28 1.04 1.14 -0.9 -0.3 -0.46 -0.12 -0.28 -0.11 -1.19 -0.56
-0.1 -0.11 -0.12 -0.2 0.12 -0.07 -0.38 -0.48 -0.6 -0.52 -0.63 -0.76 0.39 0.43 0.13 0.99 0.46 1.18 1.02 -5.68 -2.96 -4.14 0.99 0.96 -2.5 -1.03 -0.68 -1.01 0.39 0.37 0.23 0.16
-0.73 -0.12 -0.1 -0.13 -0.41 -0.24 -0.28 -0.69 -0.84 -0.94 -0.81 -0.82 0.13 1.11 0.3 1.03 0.99 1.26 -0.21 -5.83 -6.0 -6.04 1.52 1.16 -4.63 -2.61 -1.77 -0.96 0.98 1.11 -0.41 -0.84
-0.12 -0.02 0.26 0.08 0.1 0.1 0.09 -0.12 -0.04 0.05 -0.09 -0.23 0.46 0.01 0.19 0.55 0.42 0.31 -0.11 -1.66 -0.21 -0.82 0.69 0.49 -0.01 -0.9 -0.61 -0.25 0.22 0.39 -0.77 -0.79
0.15 0.15 -0.06 0.19 0.13 0.19 -0.05 0.55 -0.63 0.04 -0.27 -0.03 0.91 -0.89 -1.24 0.56 0.39 1.18 0.7 - - - 0.6 0.56 - -1.24 -1.08 -1.58 0.81 0.83 0.15 0.2
-0.85 -0.96 -0.63 -0.91 -0.78 -0.96 -0.64 -1.2 -0.97 -1.09 -1.29 -0.93 0.75 0.03 0.34 0.97 0.61 1.37 0.85 -1.51 -0.0 -1.07 0.51 0.6 0.55 -0.9 -0.24 0.13 0.61 0.56 0.08 0.11
- - 0.85 - - - - - - - - - -0.44 - - 0.76 1.11 3.45 0.46 - - - 1.52 0.98 - - - - 1.23 -0.4 2.21 -0.46
-0.06 -0.26 0.02 -0.24 -0.04 0.07 -0.43 -0.17 -0.27 -0.22 0.06 -0.23 -0.12 0.23 -0.9 0.27 -0.54 0.5 0.37 -0.39 -1.3 -1.15 0.61 0.86 -1.01 0.81 0.34 0.02 0.04 -0.05 0.08 0.41
-0.29 -0.16 -0.28 -0.34 -0.29 -0.24 -0.38 -0.21 -0.39 -0.11 -0.21 -0.58 0.43 0.39 0.09 0.97 0.09 0.36 0.78 -0.97 -0.79 -1.44 0.44 0.36 -0.05 -0.25 -0.39 -0.28 0.45 0.41 0.23 0.05
-0.88 -0.12 0.43 0.15 0.04 -0.23 -0.37 -1.57 -0.65 -0.17 -1.04 -0.17 1.39 1.63 -0.47 0.74 0.09 0.27 -0.04 - - - 1.93 1.09 -2.56 -1.2 -0.13 -0.38 -0.56 -0.31 -1.02 -0.66
-4.05 -5.48 -3.89 -1.88 -1.06 0.15 0.32 -0.52 -1.38 -1.17 -2.85 -3.15 0.58 -1.17 -2.15 1.15 -0.45 2.16 1.72 -4.23 -4.2 - 1.18 0.31 0.35 -1.62 0.59 0.12 0.61 0.08 0.62 1.12
-1.42 -1.3 -0.8 -0.55 -0.12 -0.05 -0.43 -0.88 -1.07 -1.65 -1.27 -1.61 -1.54 -0.06 1.53 0.84 -0.96 -0.05 2.22 -6.86 -0.18 -4.91 -0.25 0.16 -0.43 0.42 0.71 0.06 -0.21 0.02 0.12 1.34
-0.63 -0.42 -0.14 -0.04 -0.04 0.11 0.01 -0.07 0.22 -0.06 -0.02 -0.34 1.42 0.08 1.31 1.25 -0.4 0.11 -0.66 -2.17 -2.2 -1.65 -0.76 -0.59 -0.87 0.22 0.65 1.05 -0.35 -0.24 -1.32 -1.49
-0.27 -0.63 -0.28 -0.62 -0.65 -0.64 -0.41 -0.74 -0.64 -0.6 -0.59 -0.31 1.19 1.45 -0.49 0.31 -0.13 0.93 -1.43 -8.74 -2.66 - 1.88 1.76 -2.25 -2.47 -1.62 -1.99 0.18 0.44 0.52 0.44
-1.28 -0.81 -0.51 -0.56 -0.59 -0.57 -0.28 -0.17 0.17 0.04 0.08 -0.37 0.09 0.65 -4.56 0.92 -0.45 -0.2 0.77 -4.82 -1.13 -6.69 1.09 1.02 -0.84 1.28 0.16 0.35 0.22 0.38 -0.14 0.37
-1.19 -0.65 -0.61 -0.73 -0.48 -0.14 -0.75 -1.18 -0.77 -0.88 -1.28 -1.61 1.43 1.88 -3.72 1.64 0.06 1.16 -1.16 -3.39 -0.77 -6.41 1.96 1.2 -1.17 -3.59 -2.12 -1.67 -0.12 -0.01 -0.35 0.28
-0.64 -0.49 -0.66 -0.41 -0.12 -0.2 -0.35 -0.13 -0.83 -0.47 -0.56 -0.6 0.04 -1.01 -0.19 0.43 0.55 0.97 0.86 -3.24 -1.76 -0.26 0.63 0.48 -0.15 -0.2 0.28 0.43 0.38 0.4 0.69 0.5
0.06 -0.21 -0.62 -0.22 -0.07 -0.2 -0.42 -0.4 -0.69 -0.15 -0.34 -0.36 0.6 0.18 0.59 1.14 0.2 0.99 0.56 -2.0 -2.23 0.75 0.08 0.26 0.03 -0.75 -0.94 -0.97 0.46 0.32 -0.46 -0.29
-0.92 -0.58 -0.42 -0.31 0.24 -0.31 -0.25 0.31 -0.15 -0.49 -0.53 -0.69 0.75 -0.58 -0.7 0.93 0.6 1.67 0.47 - - -3.89 0.67 0.61 -3.15 -0.86 -0.93 -1.21 0.76 0.75 0.64 0.64
0.49 1.1 -0.21 0.28 0.0 0.32 -1.44 -1.11 -1.15 -1.36 -2.85 0.4 0.7 -1.13 -1.11 1.32 0.08 0.9 2.26 - -1.84 - 0.44 0.01 -2.08 -1.51 - -1.9 0.57 0.46 0.35 -0.65
-0.24 0.02 -0.23 -0.46 -1.04 -0.82 -0.85 -0.88 -0.64 -0.39 -0.58 -0.21 0.53 0.38 -2.5 0.72 0.6 1.57 -0.32 -3.08 -0.33 -2.75 1.4 1.32 -1.38 -2.25 -1.52 -1.45 0.99 0.85 0.1 0.33
-4.45 -2.76 -3.35 -4.61 - - - -3.29 -3.14 - -4.71 -4.62 1.07 -4.63 -3.65 0.75 1.07 2.28 1.16 -0.54 0.23 -0.4 1.4 1.49 0.65 - - - 1.26 1.3 0.76 1.07
-1.46 -3.73 -2.39 -1.49 -2.53 -2.52 -2.73 -3.99 -3.93 -1.66 -1.3 -1.35 1.5 -3.39 -4.3 1.59 0.7 1.7 0.84 -2.53 -2.25 - 1.51 1.06 -0.77 -0.89 -0.65 - 1.7 0.9 1.49 0.69
-0.15 -0.14 0.4 0.07 -0.09 0.23 0.07 0.13 0.46 -0.17 -0.13 -0.04 0.42 0.04 0.5 0.69 0.12 0.15 0.74 - -6.73 -2.22 0.34 0.15 -1.85 -0.12 -0.08 0.3 0.48 0.66 -0.95 -0.53
-0.52 -0.71 0.22 -0.09 0.32 0.67 0.47 0.22 0.03 0.21 0.02 -0.15 0.43 0.53 1.32 1.03 -0.01 0.65 0.08 - - - -0.02 -0.57 -2.54 -0.28 -0.46 -0.63 0.09 0.27 -0.21 0.01
-0.29 -0.0 0.24 -0.01 0.33 0.22 0.02 0.26 0.11 -0.03 0.36 0.03 0.61 0.64 0.06 0.59 -0.32 0.29 0.47 -6.27 -2.35 -6.22 0.24 0.42 -1.93 -0.33 0.06 0.08 0.06 0.11 -0.03 -0.05
-0.72 -0.34 -0.27 -0.44 -0.64 -0.34 -0.53 -1.09 -0.99 -1.2 -1.06 -1.2 1.46 1.28 -0.38 1.01 0.75 1.65 -0.48 -3.25 -1.58 -1.86 1.37 0.99 -2.31 -2.06 -1.25 -1.3 0.21 0.42 0.07 -0.04
-0.66 -0.08 -0.59 -1.14 -0.51 -0.56 -1.29 -1.35 -1.09 -0.47 -1.73 -1.39 1.39 0.13 1.08 2.21 0.73 1.13 0.5 - - 0.47 0.24 -0.08 - -0.89 -2.4 - 0.59 0.53 0.28 0.18
-1.76 0.61 -1.62 -0.87 -0.73 -0.11 -0.28 -1.19 -2.24 -2.3 -2.16 -2.13 -0.85 0.76 -0.24 0.71 1.11 1.67 1.47 - -2.2 - 2.06 0.62 -2.48 -1.19 -0.67 0.28 0.51 1.18 -1.12 -1.84
0.02 -0.35 0.56 0.12 0.19 0.09 0.18 0.54 0.11 0.09 -0.17 0.05 0.29 -0.88 -0.97 0.4 0.56 0.43 0.28 -4.03 -2.86 -3.07 0.62 0.73 -2.04 -0.97 -0.81 -0.28 0.66 0.93 0.02 -0.01
-1.07 -0.67 -0.16 -0.74 1.16 -0.1 -0.77 -0.15 -2.44 -1.86 -0.24 -1.06 0.8 -1.05 -0.43 0.92 0.84 1.7 1.01 - - - 0.74 0.56 - -2.7 -1.39 -2.09 0.89 0.76 0.81 0.85
0.1 0.22 0.44 0.14 0.03 0.22 -0.23 0.2 -0.14 0.25 0.39 -0.04 0.4 -0.06 -3.3 1.19 -0.33 -0.75 0.49 - -4.08 - 1.19 1.17 0.0 0.36 0.22 -0.16 -0.24 -0.59 -1.16 -1.37
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0.03 0.16 -0.26 -0.14 0.16 0.21 -0.19 0.29 -0.07 0.12 0.2 0.2 0.42 -0.61 0.75 0.44 0.03 0.5 0.65 -6.74 -3.14 -3.9 0.73 0.71 -1.65 -0.3 -0.44 -0.21 0.47 0.32 -0.57 -0.23
-0.3 -0.4 0.02 0.02 0.11 0.09 0.23 0.13 -0.02 0.03 0.07 -0.31 0.35 -0.04 0.02 0.54 0.12 0.63 0.39 -3.03 -1.83 -1.68 0.36 0.31 -1.2 -0.01 0.21 0.01 0.01 0.04 0.4 0.35
-1.0 -1.6 -1.17 -0.79 -0.67 -1.15 -0.48 -1.11 -0.27 -1.26 -1.19 -1.1 -0.1 0.15 1.36 0.72 0.81 0.94 2.19 - - - 0.6 0.37 -3.6 -1.28 0.18 0.04 0.79 0.57 0.68 -0.06
-0.62 -0.04 0.43 -0.45 0.18 -0.59 -0.77 -0.55 -0.63 -0.75 -0.31 -0.46 0.02 -0.99 -1.48 0.42 0.91 1.96 1.19 -6.65 - - 0.98 0.71 - -1.27 -0.75 -0.03 0.64 0.84 0.19 0.12
-3.11 - -0.98 -2.1 0.63 -1.53 -1.73 -1.88 -1.67 -0.3 - - -0.61 - -0.71 2.02 0.21 2.2 1.28 - - - 1.51 1.94 - - - - 0.76 0.97 1.11 0.66
0.03 0.22 0.07 0.13 0.06 0.04 0.08 0.13 0.2 0.25 0.01 -0.09 0.63 0.13 -1.56 0.59 -0.19 -0.74 0.76 -2.15 -0.48 -3.39 0.36 0.34 0.17 0.38 0.15 0.35 -0.02 -0.01 -0.88 -0.76
-0.41 -0.77 -0.57 -0.41 -1.0 -0.53 -1.05 -0.73 -0.31 -0.32 -0.52 0.15 0.8 0.87 -0.87 1.28 0.1 1.37 1.63 -2.34 -2.7 -3.03 0.77 0.81 -2.94 -1.75 -1.98 -2.35 0.75 0.8 0.18 -0.2
-0.25 -0.03 0.06 -0.17 -0.15 0.03 -0.24 -0.62 -0.46 -0.44 -0.58 -0.57 0.17 1.06 0.49 0.75 0.25 -0.01 -0.08 -0.86 -0.7 -0.98 1.21 0.76 0.43 -1.33 -0.86 -0.54 0.28 0.36 -0.54 -0.44
-0.04 0.13 -0.12 -0.4 -0.17 -0.38 -0.58 -0.49 -0.08 -0.21 -0.31 -0.24 0.47 0.45 -1.66 1.2 -0.25 0.19 1.44 - - - 0.98 1.04 - -0.08 0.07 0.12 0.29 0.39 -0.07 0.14
0.16 0.14 -0.21 -0.18 0.0 0.2 0.0 -1.0 -0.68 -0.64 -0.78 -0.94 0.27 1.12 -0.78 1.47 0.27 0.88 0.84 -3.81 -0.84 -4.67 1.56 1.46 -5.13 -3.41 -1.57 -1.39 -0.04 0.22 -0.97 -0.82
-0.25 -0.22 0.3 -0.4 0.21 0.24 -0.89 -0.47 -0.7 -0.62 -0.42 -0.79 0.91 0.36 0.47 1.1 0.41 1.35 0.98 -5.65 - - 0.54 0.59 - -2.46 -0.97 -1.02 0.55 0.7 0.12 0.31
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-0.24 -0.32 0.02 0.33 0.19 0.19 0.15 0.12 0.35 -0.29 -0.12 -0.24 0.78 0.31 0.39 1.23 -0.21 -0.15 1.12 - - - 0.52 0.43 - -0.19 -0.39 0.04 0.41 0.54 -1.04 -1.03
-0.11 0.18 0.02 -0.19 -0.17 -0.24 -0.35 -0.12 -0.01 0.17 0.18 0.13 0.21 -0.91 -1.63 0.23 0.26 1.26 0.32 -1.69 -4.39 -0.92 0.79 0.62 -1.94 -0.24 -0.74 -0.45 0.44 0.44 0.5 0.61

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.