Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.33 0.66 0.85 0.65 0.19 0.13 0.68 0.81 0.71 1.0 0.89 0.76 0.59 0.24 0.05 0.34 0.17 0.82 0.57 0.01 0.07 0.01 0.36 0.46 0.08 0.79 0.13 0.08 0.61 0.76 0.66 0.66
0.31 0.64 0.87 0.76 0.32 0.27 0.71 0.88 0.8 0.94 0.79 0.62 1.0 0.2 0.12 0.38 0.11 0.12 0.18 0.0 0.04 0.0 0.31 0.32 0.02 0.79 0.17 0.11 0.32 0.29 0.38 0.46
0.45 0.85 0.8 0.66 0.16 0.07 0.41 0.58 0.33 0.56 0.59 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.04 0.01 0.14 0.01 0.04 0.01 0.08 0.92 0.05 0.02 0.09 0.05 0.02 0.01
0.11 0.29 0.35 0.35 0.07 0.04 0.26 0.38 0.14 0.15 0.15 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.01 0.03 0.07 0.01 0.0 0.08 0.01 0.12 1.0 0.04 0.03 0.07 0.03 0.02 0.01
0.05 0.22 0.74 1.0 0.73 0.49 0.59 0.54 0.3 0.24 0.14 0.09 0.14 0.0 0.0 0.03 0.04 0.01 0.19 0.03 0.06 0.0 0.19 0.15 0.11 0.85 0.19 0.19 0.03 0.02 0.01 0.02
0.41 0.81 1.0 0.88 0.68 0.61 0.77 0.71 0.64 0.66 0.6 0.56 0.46 0.19 0.05 0.34 0.14 0.16 0.17 0.09 0.31 0.08 0.25 0.26 0.07 0.57 0.31 0.36 0.13 0.11 0.14 0.18
0.4 0.45 0.52 0.67 0.91 1.0 0.51 0.33 0.24 0.21 0.2 0.14 0.31 0.35 0.48 0.49 0.6 0.41 0.59 0.07 0.07 0.11 0.74 0.57 0.05 0.17 0.57 0.7 0.36 0.42 0.3 0.27
0.16 0.34 0.62 1.0 0.49 0.41 0.52 0.73 0.4 0.21 0.16 0.11 0.04 0.01 0.01 0.11 0.06 0.04 0.18 0.01 0.21 0.0 0.19 0.24 0.74 0.67 0.18 0.25 0.11 0.07 0.05 0.07
0.39 0.68 0.69 0.74 0.69 0.74 1.0 0.73 0.7 0.58 0.42 0.43 0.34 0.22 0.16 0.45 0.32 0.2 0.26 0.28 0.13 0.07 0.37 0.41 0.25 0.46 0.48 0.53 0.32 0.36 0.3 0.29
0.37 0.52 0.63 0.69 0.76 0.79 0.68 0.62 0.57 0.52 0.48 0.43 0.57 0.63 0.57 0.73 0.53 0.23 0.57 0.1 0.45 0.12 0.66 0.59 0.22 1.0 0.55 0.64 0.48 0.47 0.26 0.23
0.59 0.8 0.8 0.69 0.75 0.73 0.56 0.4 0.38 0.34 0.38 0.34 0.55 0.65 0.55 0.74 0.56 0.48 0.75 0.31 0.28 0.4 0.92 1.0 0.19 0.26 0.38 0.44 0.4 0.45 0.2 0.23
0.38 0.82 1.0 0.89 0.88 0.91 0.51 0.28 0.34 0.19 0.21 0.19 0.25 0.18 0.14 0.33 0.63 0.63 0.6 0.08 0.23 0.05 0.55 0.6 0.1 0.14 0.36 0.36 0.23 0.3 0.17 0.16
0.28 0.5 0.71 0.91 1.0 0.85 0.55 0.38 0.36 0.3 0.29 0.25 0.4 0.28 0.55 0.55 0.5 0.26 0.71 0.01 0.05 0.02 0.6 0.53 0.23 0.94 0.72 0.79 0.36 0.35 0.18 0.16
0.84 0.93 0.9 0.85 0.88 0.88 0.91 0.97 1.0 0.96 0.91 0.79 0.61 1.0 0.51 0.82 0.53 0.58 0.69 0.23 0.43 0.36 0.89 0.9 0.6 0.52 0.79 0.79 0.65 0.68 0.63 0.56
0.5 0.58 0.77 0.68 0.61 0.62 0.66 0.77 0.81 0.85 0.77 0.68 0.58 0.66 0.08 0.4 0.22 0.24 0.48 0.01 0.31 0.01 1.0 0.87 0.38 0.52 0.4 0.54 0.32 0.31 0.26 0.3
0.39 0.8 0.89 1.0 0.86 0.67 0.62 0.47 0.4 0.53 0.39 0.37 0.29 0.19 0.12 0.33 0.68 0.45 0.45 0.11 0.05 0.1 0.67 0.41 0.24 0.23 0.15 0.14 0.35 0.34 0.16 0.12
0.37 0.75 0.77 0.75 0.55 0.62 1.0 0.7 0.81 0.86 0.7 0.62 0.37 0.75 0.42 0.41 0.63 0.87 0.16 0.09 0.46 0.17 0.82 0.78 0.27 0.47 0.32 0.45 0.46 0.53 0.41 0.46
0.3 0.41 0.65 1.0 0.96 0.82 0.82 0.59 0.52 0.55 0.46 0.43 0.35 0.22 0.15 0.22 0.51 0.35 0.32 0.0 0.01 0.0 0.59 0.57 0.01 0.25 0.35 0.4 0.35 0.33 0.35 0.39
0.36 0.45 0.54 0.68 0.82 1.0 0.74 0.5 0.43 0.57 0.47 0.46 0.3 0.24 0.13 0.38 0.69 0.53 0.77 0.06 0.25 0.01 0.79 0.55 0.41 0.38 0.56 0.69 0.35 0.35 0.49 0.61
0.5 0.66 0.84 0.69 0.68 0.65 0.77 0.84 0.88 1.0 0.86 0.71 0.55 0.64 0.07 0.43 0.22 0.25 0.42 0.03 0.37 0.0 0.94 0.85 0.29 0.48 0.43 0.49 0.33 0.35 0.27 0.28
0.18 0.43 0.7 0.77 0.64 0.59 0.75 0.63 0.5 0.47 0.4 0.35 0.5 0.32 0.14 0.43 0.27 0.22 0.29 0.24 0.27 0.09 0.43 0.4 0.73 1.0 0.56 0.61 0.27 0.25 0.23 0.29
0.6 1.0 0.94 0.82 0.48 0.39 0.63 0.49 0.48 0.54 0.51 0.74 0.41 0.44 0.13 0.45 0.22 0.22 0.4 0.18 0.37 0.11 0.27 0.23 0.33 0.78 0.17 0.16 0.35 0.31 0.3 0.4
0.15 0.44 1.0 0.82 0.58 0.45 0.88 0.6 0.56 0.61 0.53 0.4 0.6 0.11 0.03 0.4 0.21 0.23 0.19 0.0 0.0 0.0 0.68 0.77 0.0 0.53 0.16 0.25 0.29 0.25 0.4 0.42
0.53 0.7 0.63 0.73 0.87 0.86 0.65 0.6 0.55 0.6 0.39 0.39 0.67 0.33 0.43 0.81 0.59 0.65 0.76 0.01 0.15 0.0 0.63 0.58 0.07 0.35 0.31 0.37 0.58 0.59 1.0 0.88
0.59 0.79 0.78 0.79 0.81 0.75 1.0 0.8 0.81 0.91 0.69 0.67 0.61 0.44 0.18 0.69 0.19 0.32 0.44 0.02 0.0 0.12 0.41 0.37 0.04 0.62 0.3 0.25 0.27 0.28 0.32 0.39
0.19 0.48 0.96 0.83 0.14 0.05 0.75 1.0 0.61 0.74 0.6 0.42 0.96 0.18 0.07 0.04 0.04 0.08 0.07 0.01 0.0 0.0 0.17 0.18 0.0 0.79 0.1 0.02 0.13 0.11 0.32 0.39
0.34 0.45 0.57 0.72 0.91 0.6 0.58 0.31 0.34 0.34 0.31 0.26 0.72 0.44 0.47 1.0 0.93 0.58 0.9 0.0 0.0 0.0 0.87 0.61 0.01 0.32 0.31 0.31 0.41 0.43 0.81 0.83
0.45 0.48 0.79 0.74 0.74 0.8 0.74 0.66 0.74 1.0 0.85 0.42 0.74 0.33 0.16 1.0 0.69 0.68 0.98 0.22 0.19 0.26 0.75 0.71 0.03 0.29 0.24 0.35 0.76 0.54 0.82 0.89
0.16 0.31 0.6 0.84 0.83 0.84 1.0 0.6 0.45 0.48 0.39 0.43 0.15 0.1 0.29 0.49 0.31 0.17 0.29 0.13 0.16 0.18 0.3 0.23 0.27 0.65 0.46 0.64 0.29 0.28 0.07 0.07
0.13 0.22 0.58 0.66 0.72 1.0 0.71 0.43 0.39 0.25 0.18 0.15 0.0 0.01 0.0 0.01 0.34 0.43 0.5 0.0 0.09 0.01 0.49 0.37 0.16 0.41 0.35 0.36 0.21 0.3 0.16 0.11
0.28 0.77 0.78 0.66 0.99 0.82 0.51 0.44 0.19 0.13 0.19 0.2 0.75 0.35 0.45 1.0 0.92 0.26 0.34 0.02 0.0 0.0 0.78 0.35 0.0 0.13 0.47 0.32 0.43 0.38 0.25 0.2
0.66 0.84 0.94 1.0 0.89 0.83 0.67 0.49 0.53 0.54 0.52 0.52 0.15 0.05 0.26 0.14 0.58 0.51 0.28 0.41 0.26 0.25 0.43 0.33 0.16 0.38 0.26 0.28 0.33 0.33 0.21 0.22
0.61 0.9 1.0 0.96 0.84 0.77 0.75 0.47 0.5 0.54 0.49 0.51 0.24 0.21 0.38 0.31 0.6 0.54 0.22 0.36 0.09 0.24 0.4 0.4 0.02 0.32 0.17 0.25 0.34 0.45 0.22 0.23
0.15 0.4 0.71 0.83 0.92 1.0 0.97 0.98 0.63 0.5 0.3 0.24 0.37 0.2 0.56 0.35 0.77 0.33 0.47 0.25 0.34 0.0 0.46 0.23 0.22 0.26 0.58 0.55 0.35 0.35 0.29 0.45
0.44 0.62 0.99 1.0 0.81 0.89 0.93 0.6 0.61 0.57 0.52 0.44 0.15 0.02 0.1 0.27 0.4 0.42 0.54 0.15 0.38 0.34 0.36 0.47 0.31 0.1 0.19 0.3 0.43 0.4 0.32 0.23
0.3 0.49 0.84 0.83 0.98 0.67 0.91 1.0 0.93 0.71 0.67 0.53 0.18 0.27 0.17 0.3 0.81 0.4 0.81 0.02 0.31 0.32 0.64 0.55 0.05 0.6 0.62 0.68 0.82 0.85 0.52 0.53
0.22 0.74 1.0 0.88 0.32 0.22 0.89 0.78 0.69 0.87 0.74 0.84 0.2 0.94 0.23 0.24 0.15 0.24 0.1 0.0 0.01 0.29 0.21 0.24 0.01 0.73 0.12 0.06 0.14 0.16 0.87 0.47
0.52 0.83 1.0 0.83 0.23 0.15 0.61 0.72 0.51 0.82 0.81 0.78 0.02 0.0 0.0 0.01 0.15 0.01 0.03 0.01 0.0 0.08 0.06 0.02 0.01 0.59 0.05 0.05 0.12 0.06 0.07 0.04
0.48 1.0 1.0 0.89 0.74 0.56 0.91 0.57 0.42 0.38 0.33 0.37 0.52 0.31 0.26 0.65 0.46 0.4 0.58 0.13 0.06 0.03 0.57 0.51 0.08 0.88 0.76 0.84 0.29 0.34 0.23 0.26
0.04 0.16 0.61 1.0 0.82 0.48 0.36 0.33 0.17 0.12 0.06 0.05 0.04 0.01 0.01 0.08 0.24 0.07 0.2 0.07 0.07 0.01 0.34 0.19 0.14 0.6 0.37 0.28 0.16 0.11 0.13 0.07
0.4 0.6 0.81 0.89 1.0 0.89 0.58 0.43 0.42 0.3 0.25 0.18 0.22 0.25 0.06 0.35 0.56 0.41 0.31 0.04 0.11 0.0 0.61 0.52 0.16 0.22 0.28 0.36 0.27 0.29 0.14 0.12
0.39 0.74 0.86 0.92 1.0 0.86 0.65 0.47 0.43 0.34 0.35 0.31 0.53 0.62 0.32 0.73 0.75 0.44 0.45 0.02 0.08 0.01 0.87 0.76 0.05 0.37 0.37 0.43 0.38 0.41 0.25 0.25
0.44 0.54 0.63 0.75 0.99 1.0 0.75 0.67 0.56 0.5 0.46 0.36 0.32 0.41 0.32 0.63 0.82 0.62 0.76 0.05 0.12 0.09 0.87 0.75 0.54 0.45 0.76 0.91 0.51 0.6 0.38 0.39
0.27 0.55 0.53 0.75 0.79 0.89 0.73 0.54 0.38 0.37 0.23 0.28 0.71 0.48 0.63 0.94 0.76 0.31 1.0 0.0 0.03 0.0 0.73 0.73 0.13 0.52 0.43 0.55 0.4 0.42 0.4 0.41
0.14 0.2 0.02 0.48 0.85 0.79 0.73 0.38 0.52 0.17 0.08 0.12 0.13 0.01 0.2 0.23 0.85 0.86 0.58 0.04 0.03 0.21 0.71 0.59 0.08 0.47 1.0 0.67 0.44 0.4 0.26 0.2
0.08 0.14 0.18 0.37 0.66 0.79 0.76 0.6 0.31 0.17 0.1 0.06 0.27 0.12 0.13 0.39 0.73 0.63 0.61 0.0 0.02 0.0 0.82 0.57 0.07 0.28 1.0 0.97 0.55 0.56 0.62 0.55
0.23 0.37 0.68 0.62 0.46 0.41 1.0 0.64 0.65 0.59 0.55 0.45 0.32 0.27 0.48 0.33 0.51 0.56 0.32 0.0 0.01 0.0 0.7 0.68 0.01 0.22 0.14 0.15 0.45 0.48 0.43 0.62
0.55 0.85 0.87 1.0 0.81 0.77 0.96 0.76 0.8 0.74 0.66 0.61 0.47 0.34 0.45 0.36 0.42 0.48 0.28 0.0 0.01 0.07 0.42 0.32 0.24 0.53 0.73 0.78 0.33 0.33 0.18 0.13
0.16 0.28 0.68 0.72 0.62 1.0 0.85 0.44 0.46 0.34 0.33 0.24 0.01 0.01 0.02 0.02 0.7 0.74 0.52 0.0 0.19 0.09 0.71 0.71 0.11 0.5 0.49 0.65 0.49 0.65 0.37 0.22
0.52 0.82 1.0 0.93 0.85 0.87 0.96 0.63 0.67 0.62 0.46 0.51 0.21 0.33 0.54 0.39 0.71 0.39 0.76 0.44 0.39 0.36 0.5 0.37 0.42 0.27 0.36 0.47 0.66 0.7 0.39 0.42
0.22 0.66 0.94 0.97 0.68 0.49 1.0 0.79 0.58 0.58 0.41 0.34 0.49 0.15 0.16 0.53 0.22 0.25 0.51 0.0 0.03 0.0 0.32 0.28 0.03 0.73 0.32 0.31 0.34 0.43 0.42 0.6
0.38 0.47 0.74 0.91 0.89 0.67 0.59 0.58 0.44 0.47 0.44 0.41 0.78 0.54 0.15 0.59 0.55 0.37 0.52 0.02 0.26 0.01 0.48 0.5 0.46 1.0 0.62 0.62 0.44 0.41 0.48 0.6
0.73 0.78 0.79 0.84 0.8 0.84 0.92 0.88 0.88 0.86 0.84 0.77 0.71 0.89 0.7 0.86 0.61 0.5 0.83 0.32 0.75 0.47 0.73 0.72 0.67 1.0 0.82 0.8 0.71 0.75 0.5 0.45
0.53 0.84 0.84 0.73 0.45 0.35 0.72 0.73 0.76 1.0 0.81 0.87 0.52 0.19 0.13 0.36 0.1 0.2 0.21 0.01 0.04 0.0 0.32 0.33 0.02 0.43 0.14 0.11 0.38 0.35 0.3 0.39
0.6 0.98 1.0 0.9 0.8 0.74 0.47 0.46 0.46 0.5 0.42 0.41 0.42 0.2 0.01 0.18 0.52 0.48 0.26 0.14 0.11 0.0 0.44 0.3 0.42 0.2 0.18 0.2 0.37 0.39 0.22 0.23
0.12 0.32 0.71 1.0 0.84 0.7 0.74 0.27 0.13 0.13 0.12 0.11 0.16 0.16 0.24 0.24 0.37 0.21 0.24 0.0 0.03 0.0 0.55 0.43 0.0 0.41 0.31 0.4 0.13 0.16 0.2 0.22
0.24 0.63 1.0 0.83 0.42 0.33 0.66 0.9 0.67 0.84 0.75 0.63 0.65 0.49 0.04 0.34 0.06 0.16 0.24 0.0 0.01 0.0 0.25 0.45 0.02 0.76 0.26 0.13 0.09 0.08 0.33 0.39
0.6 0.63 0.65 0.7 0.75 0.79 0.5 0.49 0.45 0.47 0.37 0.37 0.65 0.4 0.14 1.0 0.52 0.39 0.63 0.14 0.19 0.19 0.76 0.7 0.09 0.28 0.33 0.39 0.42 0.43 0.29 0.36
0.44 0.45 0.23 0.49 0.72 1.0 0.67 0.76 0.57 0.62 0.46 0.42 0.56 0.57 0.66 0.69 0.48 0.54 0.89 0.03 0.13 0.1 0.62 0.62 0.01 0.22 0.39 0.42 0.72 0.56 0.7 0.7
0.11 0.22 0.4 0.83 1.0 0.98 0.84 0.53 0.25 0.2 0.13 0.08 0.33 0.07 0.37 0.37 0.73 0.66 0.56 0.0 0.0 0.0 0.64 0.37 0.0 0.17 0.41 0.32 0.34 0.3 0.12 0.13
0.28 0.4 0.7 0.68 0.88 0.55 0.98 0.79 1.0 0.57 0.44 0.49 0.09 0.18 0.13 0.21 0.62 0.48 0.47 0.0 0.0 0.07 0.57 0.43 0.2 0.25 0.27 0.33 0.67 0.72 0.28 0.34
0.27 0.36 0.45 0.6 0.79 1.0 0.72 0.57 0.36 0.27 0.22 0.19 0.52 0.39 0.56 0.73 0.75 0.67 0.8 0.03 0.02 0.01 0.98 0.77 0.19 0.35 0.53 0.66 0.49 0.53 0.46 0.46
0.48 0.56 0.64 0.8 1.0 0.93 0.74 0.59 0.56 0.57 0.46 0.44 0.4 0.47 0.3 0.39 0.47 0.32 0.57 0.25 0.33 0.16 0.51 0.45 0.11 0.38 0.43 0.58 0.41 0.4 0.49 0.57
0.36 0.66 0.63 0.76 0.69 0.72 0.46 0.28 0.25 0.25 0.23 0.24 0.91 0.49 0.54 1.0 0.81 0.27 0.33 0.11 0.06 0.05 0.58 0.45 0.14 0.14 0.42 0.52 0.43 0.42 0.18 0.15
0.21 0.45 0.51 0.51 0.1 0.03 0.52 0.48 0.3 0.3 0.33 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.04 0.06 0.03 0.0 0.0 0.16 1.0 0.01 0.05 0.01 0.02 0.02 0.01
0.18 0.29 0.43 0.41 0.05 0.02 0.28 0.45 0.18 0.28 0.28 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.01 0.05 1.0 0.01 0.05 0.07 0.02 0.0 0.0
0.45 0.59 0.74 0.66 0.57 0.6 1.0 0.81 0.9 0.98 0.86 0.66 0.63 0.62 0.12 0.62 0.52 0.51 0.34 0.01 0.3 0.38 0.88 0.83 0.16 0.56 0.4 0.39 0.56 0.52 0.77 0.91
0.29 0.45 0.5 0.81 0.93 1.0 0.82 0.56 0.37 0.32 0.23 0.25 0.54 0.28 0.33 0.65 0.78 0.61 0.62 0.1 0.05 0.07 0.86 0.64 0.01 0.27 0.44 0.33 0.27 0.3 0.37 0.59
0.58 0.77 0.83 0.9 0.88 1.0 0.77 0.65 0.68 0.67 0.57 0.48 0.27 0.55 0.5 0.41 0.75 0.63 0.75 0.05 0.21 0.01 0.92 0.78 0.73 0.38 0.62 0.82 0.57 0.64 0.5 0.47
0.17 0.33 0.26 0.29 0.67 0.57 0.59 0.42 0.83 1.0 0.55 0.27 0.0 0.0 0.0 0.03 0.61 0.22 0.31 0.0 0.01 0.0 0.36 0.21 0.07 0.2 0.14 0.28 0.58 0.45 0.3 0.19
0.61 0.93 0.95 1.0 0.75 0.62 0.89 0.74 0.72 0.88 0.79 0.94 0.48 0.29 0.53 0.52 0.31 0.34 0.39 0.35 0.58 0.13 0.34 0.38 0.24 0.71 0.3 0.33 0.48 0.47 0.46 0.53
0.34 0.63 0.85 1.0 0.99 0.88 0.93 0.78 0.86 0.74 0.65 0.5 0.78 0.42 0.03 0.34 0.54 0.3 0.29 0.01 0.06 0.01 0.29 0.23 0.09 0.35 0.4 0.52 0.29 0.32 0.26 0.23
0.07 0.21 0.24 0.23 0.09 0.06 0.26 0.22 0.11 0.17 0.16 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.03 0.04 0.02 0.16 0.0 0.16 0.01 0.43 1.0 0.13 0.1 0.19 0.08 0.03 0.02
0.29 0.5 0.66 0.62 0.34 0.44 1.0 0.6 0.43 0.52 0.52 0.56 0.38 0.26 0.18 0.67 0.18 0.31 0.43 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.0 0.65 0.35 0.34 0.54 0.65 0.25 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)