Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.28 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.27 0.85 0.27
0.26 0.34 0.23 0.27 0.58 0.57 0.89 0.47 0.28 0.51 0.33 0.23 0.12 0.06 0.25 0.1 0.31 0.17 1.0 0.0 0.31 0.02 0.17 0.17 0.32 0.23 0.64 0.58 0.27 0.31 0.36 0.29
0.14 0.21 0.42 0.68 0.79 0.78 0.71 0.51 0.56 0.39 0.3 0.18 0.67 0.32 0.03 0.9 0.95 0.37 0.84 0.28 0.63 0.0 1.0 0.82 0.77 0.38 0.74 0.82 0.83 1.0 0.37 0.45
0.1 0.09 0.08 0.16 0.34 0.32 0.42 0.24 0.28 0.46 0.23 0.22 0.0 0.03 0.08 0.06 0.17 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.24 0.46 0.36 0.28 0.24 0.34 0.27
0.32 0.41 0.35 0.47 0.52 0.51 0.43 0.39 0.45 0.32 0.31 0.39 0.03 0.17 0.2 0.06 0.47 0.42 1.0 0.0 0.01 0.0 0.44 0.24 0.39 0.47 0.69 0.79 0.44 0.51 0.21 0.17
0.23 0.39 0.22 0.17 0.15 0.1 0.06 0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.09 0.14 0.16 0.16 0.57 0.27 0.82 0.03 0.06 0.0 0.67 1.0 0.94 0.05 0.16 0.15 0.1 0.15 0.21 0.19
0.11 0.18 0.28 0.38 0.41 0.85 0.61 0.55 0.48 0.31 0.3 0.15 0.43 0.29 0.12 0.52 1.0 0.41 0.64 0.03 0.1 0.01 0.78 0.66 0.3 0.59 0.43 0.59 0.8 0.7 0.44 0.38
0.02 0.04 0.04 0.17 0.41 0.3 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05 0.04 0.3 1.0 0.35 0.74 0.0 0.01 0.0 0.96 0.73 0.03 0.02 0.31 0.22 0.05 0.04 0.09 0.11
0.12 0.18 0.22 0.32 0.49 0.55 0.67 0.85 0.56 0.59 0.46 0.34 0.44 0.12 0.19 0.46 0.4 0.47 0.59 0.0 0.01 0.0 0.47 0.41 0.02 1.0 0.61 0.66 0.5 0.46 0.49 0.62
0.08 0.2 0.25 0.24 0.34 0.26 0.19 0.14 0.15 0.17 0.11 0.09 0.01 0.0 0.03 0.02 0.74 0.67 1.0 0.01 0.05 0.11 0.89 0.69 0.53 0.15 0.37 0.28 0.27 0.26 0.11 0.2
0.66 0.86 0.91 0.87 0.99 1.0 0.78 0.8 0.67 0.67 0.76 0.61 0.31 0.4 0.31 0.24 0.65 0.94 0.68 0.01 0.16 0.07 0.5 0.38 0.15 0.18 0.42 0.54 0.71 0.88 0.68 0.74
0.38 0.45 0.57 0.68 0.83 0.8 0.67 0.66 0.53 0.47 0.49 0.42 0.21 0.2 0.19 0.37 1.0 0.57 0.84 0.15 0.44 0.22 0.74 0.59 0.96 0.45 0.82 0.78 0.91 0.94 0.56 0.54
0.24 0.3 0.37 0.41 0.56 0.46 0.27 0.18 0.19 0.2 0.18 0.18 0.2 0.09 0.07 0.26 0.64 0.23 0.75 0.08 0.44 0.09 0.78 0.7 1.0 0.29 0.49 0.75 0.29 0.33 0.15 0.16
0.11 0.41 0.26 0.41 0.08 0.38 0.04 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.9 0.02 1.0 0.06 0.06 0.01 0.52 0.36 0.75 0.1 0.36 0.43 0.2 0.26 0.08 0.09
0.12 0.1 0.15 0.08 0.08 0.11 0.1 0.08 0.13 0.11 0.08 0.09 0.01 0.01 0.0 0.05 0.25 0.6 1.0 0.1 0.32 0.0 0.12 0.07 0.08 0.16 0.1 0.13 0.25 0.28 0.09 0.1
0.57 0.74 0.63 0.61 0.83 1.0 0.75 0.73 0.64 0.5 0.5 0.47 0.34 0.24 0.48 0.29 0.87 1.0 0.62 0.08 0.33 0.18 0.52 0.45 0.53 0.14 0.6 0.62 0.69 0.74 0.62 0.68
0.08 0.08 0.16 0.21 0.22 0.26 0.1 0.11 0.17 0.12 0.03 0.05 0.15 0.04 0.02 0.42 0.4 0.01 0.59 0.0 0.04 0.0 0.75 0.99 1.0 0.41 0.56 0.65 0.26 0.23 0.14 0.11
0.14 0.66 0.56 0.54 0.43 0.21 0.09 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.33 0.09 0.1 0.49 0.96 0.74 0.69 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.01 0.02 0.31 0.27 0.28 0.26 0.32 0.23
0.2 0.08 0.16 0.08 0.18 0.19 0.21 0.17 0.3 0.19 0.19 0.13 0.08 0.06 0.09 0.07 0.23 0.33 1.0 0.03 0.12 0.0 0.14 0.07 0.35 0.19 0.17 0.14 0.27 0.37 0.18 0.1
0.1 0.05 0.09 0.07 0.08 0.06 0.17 0.1 0.13 0.2 0.1 0.12 0.04 0.01 0.0 0.53 0.2 0.79 1.0 0.01 0.0 0.15 0.01 0.06 0.19 0.07 0.01 0.01 0.47 0.31 0.37 0.31
0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 0.0 0.06 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.03 0.4 0.99 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.1 0.31 0.35 0.07 0.2
0.15 0.12 0.26 0.08 0.41 0.13 0.14 0.04 0.04 0.03 0.1 0.04 0.1 0.0 0.0 0.15 0.39 0.6 1.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.11 0.25 0.1 0.17 0.11 0.22 0.59 0.31 0.19
0.12 0.03 0.06 0.11 0.36 0.09 0.57 0.52 0.28 0.24 0.47 0.22 0.02 0.02 0.27 0.03 0.16 0.28 1.0 0.06 0.18 0.06 0.2 0.12 0.13 0.35 0.78 0.69 0.21 0.38 0.14 0.11
0.03 0.02 0.04 0.07 0.12 0.25 0.44 0.15 0.13 0.2 0.23 0.07 0.0 0.03 0.02 0.06 0.2 0.38 1.0 0.03 0.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.05 0.54 0.23 0.44 0.22 0.19 0.05
0.07 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.2 0.0 0.06 0.05 0.0 0.16 0.38 0.24 0.18 0.24 0.36 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 0.37 0.13 0.0 0.19 0.46 0.05 0.27
0.0 0.01 0.02 0.06 0.37 0.45 0.17 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.05 0.08 0.89 0.23 0.32 0.02 0.14 0.01 1.0 0.36 0.26 0.01 0.45 0.49 0.04 0.03 0.01 0.01
0.13 0.14 0.2 0.15 0.14 0.18 0.25 0.29 0.26 0.26 0.19 0.09 0.22 0.13 0.35 0.15 0.08 0.13 1.0 0.16 0.02 0.0 0.09 0.09 0.4 0.47 0.78 0.7 0.07 0.1 0.12 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.16 0.16 0.0 0.35 0.46 0.81 0.16 0.17 0.0 0.0
0.28 0.56 0.63 0.7 0.88 1.0 0.45 0.27 0.38 0.21 0.19 0.14 0.03 0.01 0.01 0.04 0.74 0.34 0.31 0.0 0.12 0.01 0.85 0.37 0.98 0.2 0.82 0.71 0.55 0.64 0.21 0.26
0.12 0.06 0.16 0.12 0.21 0.28 0.28 0.35 0.21 0.11 0.11 0.11 0.0 0.09 0.12 0.06 0.12 0.23 1.0 0.0 0.09 0.12 0.33 0.16 0.21 0.24 0.53 0.36 0.24 0.25 0.15 0.12
0.16 0.25 0.25 0.33 0.7 0.86 0.68 0.61 0.3 0.16 0.17 0.16 0.29 0.26 0.23 0.2 0.67 0.27 0.52 0.48 0.4 0.25 0.7 0.43 0.66 0.42 0.78 1.0 0.41 0.38 0.17 0.11
0.06 0.18 0.19 0.35 0.52 0.65 0.57 0.33 0.26 0.23 0.2 0.14 0.11 0.13 0.37 0.18 1.0 0.48 0.28 0.43 0.01 0.03 0.67 0.32 0.09 0.1 0.89 0.81 0.38 0.38 0.22 0.24
0.4 0.42 0.46 0.38 0.34 0.57 0.8 0.53 0.44 0.27 0.32 0.46 0.0 0.05 0.06 0.04 0.56 0.18 0.97 0.02 0.0 0.0 0.36 0.16 0.2 0.25 1.0 0.67 0.41 0.39 0.29 0.29
0.08 0.07 0.0 0.05 0.0 0.31 0.0 0.13 0.17 0.06 0.0 0.08 0.19 0.0 0.0 0.26 0.5 0.42 1.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.61 0.0 0.42 0.17 0.28 0.62 0.2 0.29 0.35
0.29 0.11 0.37 0.34 0.47 0.22 0.13 0.24 0.42 0.16 0.18 0.25 0.06 0.1 0.18 0.36 0.71 0.77 1.0 0.0 0.0 0.16 0.33 0.25 0.42 0.18 0.18 0.16 0.57 0.59 0.37 0.59
0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.16 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.19 0.0 0.37 0.0 0.0 0.36 0.56 0.24 0.11
0.07 0.08 0.08 0.11 0.04 0.08 0.07 0.07 0.1 0.1 0.11 0.1 0.02 0.01 0.05 0.01 0.36 0.31 1.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.07 0.05 0.06 0.28 0.32 0.09 0.12
0.12 0.28 0.1 0.13 0.15 0.35 0.3 0.31 0.29 0.27 0.24 0.23 0.05 0.19 0.5 0.06 0.5 0.5 1.0 0.04 0.08 0.0 0.42 0.55 0.16 0.24 0.5 0.39 0.46 0.54 0.2 0.2
0.23 0.34 0.87 0.35 0.3 0.52 0.41 0.32 0.25 0.06 0.21 0.1 0.01 0.02 0.05 0.0 0.7 0.74 0.03 0.07 0.14 0.0 0.11 0.04 0.0 0.04 0.32 0.35 0.42 0.77 0.29 1.0
0.14 0.15 0.14 0.15 0.19 0.42 0.38 0.21 0.3 0.23 0.18 0.12 0.04 0.02 0.11 0.06 0.21 0.12 1.0 0.0 0.01 0.0 0.19 0.12 0.29 0.07 0.36 0.47 0.25 0.37 0.17 0.14
0.79 0.86 0.75 0.71 0.96 0.94 0.82 0.76 0.66 0.55 0.61 0.53 0.31 0.59 0.43 0.53 0.93 1.0 0.82 0.18 0.33 0.36 0.61 0.63 0.54 0.29 0.71 0.67 0.84 0.85 0.8 0.87
0.28 0.54 0.52 0.42 0.53 0.34 0.15 0.1 0.07 0.06 0.03 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.46 0.25 1.0 0.42 0.14 0.0 0.74 0.27 0.51 0.21 0.37 0.45 0.11 0.1 0.03 0.03
0.19 0.39 0.43 0.37 0.47 0.48 0.4 0.24 0.33 0.22 0.22 0.22 0.01 0.05 0.09 0.17 0.8 0.6 1.0 0.0 0.03 0.01 0.54 0.42 0.39 0.15 0.56 0.81 0.6 0.76 0.42 0.36
0.22 0.52 0.59 0.58 0.5 0.49 0.46 0.14 0.16 0.08 0.09 0.08 0.01 0.03 0.0 0.01 0.74 1.0 0.28 0.04 0.16 0.0 0.37 0.14 0.36 0.01 0.47 0.51 0.35 0.39 0.54 0.7
0.25 0.3 0.46 0.46 0.55 0.49 0.47 0.31 0.23 0.19 0.18 0.12 0.21 0.22 0.09 0.43 0.71 0.47 0.58 0.12 0.43 0.06 1.0 0.75 0.42 0.27 0.3 0.37 0.44 0.43 0.4 0.32
0.01 0.28 0.05 0.2 0.3 1.0 0.36 0.24 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.04 0.63 0.0 0.36 0.0 0.59 0.22 0.55 0.15 0.97 0.79 0.07 0.0 0.07 0.0
0.51 0.71 0.76 0.74 0.95 1.0 0.96 0.93 0.78 0.71 0.59 0.68 0.32 0.2 0.21 0.77 0.72 0.77 0.96 0.14 0.08 0.0 0.71 0.48 0.26 0.32 0.46 0.78 0.81 0.74 0.54 0.67
0.18 0.26 0.34 0.51 0.2 0.3 0.26 0.23 0.36 0.29 0.27 0.24 0.08 0.03 0.04 0.19 0.52 0.26 1.0 0.0 0.0 0.25 0.32 0.35 0.08 0.15 0.32 0.61 0.28 0.3 0.18 0.16
0.03 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 1.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.21 0.38 0.12
0.24 0.41 0.32 0.46 0.8 0.77 0.41 0.33 0.19 0.26 0.15 0.12 0.29 0.11 0.11 0.41 0.5 0.42 0.65 0.28 0.35 0.06 0.72 0.63 1.0 0.31 0.72 0.91 0.24 0.22 0.19 0.18
0.47 0.58 0.67 0.64 0.63 0.76 0.55 0.46 0.39 0.3 0.36 0.33 0.27 0.37 0.44 0.36 0.7 0.6 0.41 0.42 0.33 0.45 0.4 0.37 0.93 0.3 0.83 1.0 0.52 0.55 0.17 0.17
0.32 0.3 0.26 0.28 0.66 0.56 0.79 0.75 0.69 0.63 0.52 0.45 0.19 0.15 0.35 0.37 0.41 0.25 1.0 0.0 0.0 0.03 0.43 0.45 0.05 0.54 0.58 0.99 0.51 0.52 0.71 0.47
0.14 0.25 0.41 0.25 0.24 0.29 0.2 0.18 0.24 0.13 0.18 0.12 0.07 0.0 0.0 0.03 0.37 1.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.01 0.16 0.68 0.36 0.18 0.19 0.72 0.9
0.52 0.69 0.71 0.8 0.76 0.74 0.95 0.68 0.76 0.59 0.58 0.53 0.58 0.58 0.78 0.8 0.87 0.74 0.73 0.83 0.83 0.48 0.73 0.67 0.89 0.49 0.95 1.0 0.85 0.86 0.54 0.41
0.15 0.26 0.35 0.21 0.28 0.27 0.2 0.17 0.19 0.16 0.19 0.19 0.01 0.01 0.06 0.05 0.32 0.19 1.0 0.19 0.04 0.01 0.23 0.05 0.43 0.09 0.3 0.2 0.31 0.34 0.16 0.13
0.07 0.09 0.07 0.2 0.13 0.29 0.34 0.41 0.23 0.22 0.12 0.08 0.02 0.02 0.35 0.06 0.3 0.24 1.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.14 0.39 0.11 0.76 0.53 0.29 0.19 0.11 0.04
0.26 0.14 0.2 0.31 0.32 0.5 0.57 0.63 0.55 0.48 0.41 0.36 0.12 0.18 0.36 0.24 0.35 0.38 1.0 0.0 0.18 0.01 0.28 0.25 0.14 0.34 0.51 0.56 0.44 0.51 0.75 0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)