Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.1 -0.17 -0.24 -0.09 0.19 0.14 -0.15 0.15 0.14 0.22 -0.01 -0.23 0.44 0.2 0.77 0.46 -0.51 -0.82 0.27 -0.98 0.16 -2.41 -0.37 0.05 0.6 0.39 0.57 0.37 -0.55 -0.46 -0.59 -0.65
-0.4 -0.14 -0.59 -0.32 -0.3 -0.37 -0.7 -0.66 -0.35 -0.18 -0.73 -0.53 0.5 0.34 1.01 0.66 -0.4 -0.97 0.37 1.0 -0.32 -1.17 -0.19 0.13 0.76 0.19 0.48 0.39 -0.51 -0.46 -0.06 0.12
-0.02 0.06 -0.12 0.21 0.22 0.03 -0.17 -0.12 -0.09 -0.28 -0.06 -0.16 0.29 -0.16 0.66 0.76 0.01 -0.37 0.26 -1.18 -1.09 -0.29 0.29 0.32 0.39 0.23 0.06 -0.05 -0.19 -0.1 -0.51 -0.47
0.35 0.13 -0.19 -0.11 -0.35 -0.17 -0.32 0.33 -0.34 -0.29 -0.58 -0.24 -0.1 -0.8 0.58 1.09 -1.05 -2.33 1.78 -0.3 -2.68 - -1.2 -0.76 1.22 0.58 0.97 1.06 -0.69 -1.09 -2.13 -0.88
-0.27 -2.39 -2.19 -0.41 -0.58 0.35 -1.37 -0.21 0.54 -0.51 -1.62 -1.2 - - -2.1 -1.34 0.15 1.22 1.02 - - - -3.17 -2.51 1.8 1.18 2.51 1.24 0.32 0.49 -1.19 -0.73
0.19 0.12 -0.61 -0.33 0.13 -0.12 0.34 0.01 0.36 0.22 0.5 0.36 -0.19 0.38 -0.01 -0.1 -0.68 -1.81 0.09 -1.58 0.87 -0.21 0.21 0.18 0.48 0.62 -0.16 -0.38 -0.69 -0.36 -0.58 -0.25
-0.25 -0.15 -0.27 0.18 0.1 0.09 0.06 0.25 0.07 -0.07 -0.11 -0.14 0.07 0.4 0.32 0.25 -0.79 -1.14 -0.01 -0.41 0.19 0.27 -0.36 -0.23 0.72 0.75 0.44 0.46 -0.55 -0.57 -0.78 -0.95
-0.5 -0.4 -0.32 -0.41 -0.22 -0.16 -0.14 -0.32 -0.43 -0.49 -0.62 -0.88 0.26 -0.23 0.25 0.39 -0.07 -0.19 0.35 1.14 -0.07 -0.49 0.09 0.05 0.11 0.25 0.79 0.86 -0.01 0.0 -0.48 -0.45
0.09 -0.08 -0.29 -0.03 0.13 0.05 0.22 0.35 0.25 0.21 0.08 0.09 -0.09 -0.51 0.72 0.14 -0.26 -0.63 0.15 -1.06 -0.83 -2.37 -0.07 -0.08 0.78 0.68 0.12 0.06 -0.08 -0.02 -0.25 -0.24
-0.04 -0.27 -0.07 -0.04 0.23 0.18 0.26 0.62 0.42 0.22 0.2 0.02 -0.32 0.41 0.42 -0.38 -0.42 0.33 -0.15 -0.7 -1.12 -2.35 -0.18 -0.14 -0.06 0.46 0.83 0.67 -0.43 -0.34 -0.82 -0.87
-0.51 -0.3 -0.29 -0.12 0.39 0.48 0.32 0.3 0.18 -0.0 0.01 -0.47 -0.04 -0.29 0.66 0.18 -0.54 -0.44 0.2 0.74 0.02 -0.19 -0.26 -0.24 -0.31 0.03 0.44 0.32 -0.55 -0.48 -0.48 -0.29
-0.21 -0.51 -0.38 -0.23 -0.16 -0.1 0.02 0.27 0.28 0.24 0.11 0.14 -0.69 0.26 -0.75 -0.27 -1.13 -1.17 0.14 -0.35 -0.29 -2.74 -0.86 -0.76 1.38 0.48 0.56 0.28 -0.45 -0.48 0.72 1.18
-0.11 -0.45 -0.28 -0.28 0.1 0.0 -0.04 0.46 0.29 0.09 0.18 -0.11 -2.05 -0.96 -1.58 -1.09 -0.44 -0.2 0.25 -0.58 0.07 -0.14 -0.95 -0.69 0.43 0.59 0.97 0.8 -0.05 -0.01 0.87 0.53
-0.44 -0.57 -0.88 -0.31 1.15 0.4 -1.3 -1.4 -1.99 -2.19 -1.47 -1.86 -0.8 -1.72 -2.49 -0.02 -1.07 1.06 0.17 -1.98 -0.27 1.23 -0.43 -0.22 2.03 -0.42 1.37 1.55 -1.11 -0.89 -0.18 -0.35
-0.07 -0.26 -0.38 -0.12 -0.18 -0.02 0.46 0.68 0.52 0.46 0.08 0.14 -0.67 0.23 0.66 -0.06 -1.02 -2.08 0.31 -0.95 0.35 -2.03 -0.97 -0.42 0.59 0.39 0.47 0.22 -0.45 -0.29 0.24 0.0
-1.61 -1.03 -0.34 0.03 0.25 0.57 0.57 0.51 -0.16 -0.36 -0.71 -1.33 -0.87 0.21 0.34 0.17 -0.39 -0.74 0.32 0.24 0.27 -1.64 -0.18 0.1 1.44 -0.34 0.9 1.0 -0.39 -0.23 -1.43 -1.33
-0.7 -0.48 -0.12 0.13 0.41 0.4 0.29 0.38 -0.03 -0.33 -0.42 -0.77 -0.49 -0.28 -1.12 -0.56 0.02 -0.7 -0.3 -2.05 -0.37 -2.23 0.04 -0.15 1.28 0.37 0.75 0.75 -0.19 -0.2 0.73 0.69
-0.34 0.03 0.19 0.39 0.22 0.19 0.0 -0.03 -0.16 -0.32 -0.31 -0.38 -0.24 -0.59 0.65 -0.0 -0.61 -0.77 0.45 -0.2 0.33 -1.71 -0.09 -0.12 0.91 0.69 0.63 0.81 -0.35 -0.33 -1.05 -1.6
-0.49 -0.57 -0.43 -0.21 -0.1 0.02 -0.03 0.06 -0.03 -0.29 -0.32 -0.5 -0.0 -0.33 0.72 0.18 -0.38 -0.65 0.32 -0.3 0.18 -0.68 -0.12 0.05 1.09 0.58 0.56 0.55 -0.21 -0.05 -0.38 -0.3
- - - - - - - 0.82 0.03 - - - - - - - - 0.1 - - - - 0.3 - 2.17 - 3.43 2.35 - 1.75 0.12 1.06
-0.63 -0.3 -0.7 -0.35 -0.01 0.78 0.49 0.8 0.33 0.31 -0.19 -0.58 1.03 -1.0 1.13 0.81 -1.0 -0.7 -0.05 - - - 0.78 1.27 -1.79 -0.37 0.32 0.46 -0.26 0.22 -1.28 -1.13
-0.7 0.33 -0.08 0.51 0.51 0.71 0.38 0.18 -0.09 -0.39 -0.29 -0.5 0.54 -0.24 0.03 0.74 -0.36 -1.1 -0.53 -2.89 -1.05 -2.83 0.59 0.92 1.24 -0.01 0.58 0.49 -1.12 -0.98 -1.2 -1.81
-0.49 -0.39 -0.66 -0.42 -0.03 0.1 0.23 0.32 0.44 0.11 0.06 0.07 -0.2 -0.31 0.66 -0.25 0.17 0.06 -0.18 -4.74 -0.46 -2.76 0.09 0.31 0.93 0.63 0.32 -0.14 0.14 -0.08 0.23 -0.03
-0.04 -0.31 -0.04 -0.24 -0.15 -0.18 0.02 0.33 0.08 0.25 0.13 0.08 -0.42 0.03 0.57 -0.09 -0.45 -1.78 0.37 -0.82 0.67 -1.61 -0.21 -0.07 0.63 0.81 0.49 0.28 -0.24 -0.25 -0.37 -0.4
-0.04 -0.31 -0.04 -0.24 -0.15 -0.18 0.02 0.33 0.08 0.25 0.13 0.08 -0.42 0.03 0.57 -0.09 -0.45 -1.78 0.37 -0.82 0.67 -1.61 -0.21 -0.07 0.63 0.81 0.49 0.28 -0.24 -0.25 -0.37 -0.4
-0.7 -0.72 -0.76 -0.55 -0.29 -0.1 0.02 0.01 -0.33 -0.36 -0.47 -0.84 0.63 0.04 0.63 0.11 -0.48 -0.25 0.41 -0.2 -1.18 -2.69 -0.03 0.11 1.17 0.59 1.09 1.07 -0.02 -0.0 -0.52 -0.78
-1.15 -0.96 -1.21 -0.68 -0.01 -0.66 -0.58 -0.38 -1.43 0.01 -1.31 -1.7 1.33 -1.36 1.22 0.58 0.29 0.71 -0.14 - - - 1.68 1.55 -0.79 -0.22 0.89 1.1 -0.16 0.24 -2.11 -1.05
-0.03 -0.45 -0.23 -0.43 -0.12 0.1 0.29 0.27 0.47 0.47 -0.01 0.37 0.1 -0.13 0.84 0.4 -0.76 -0.69 -0.03 -0.81 0.15 - -0.58 -0.21 0.56 0.93 0.31 0.47 -0.65 -0.35 -0.78 -0.46
-0.3 -0.18 0.01 0.09 -0.27 0.1 -0.28 -0.03 -0.1 -0.09 -0.13 -0.1 0.04 -0.93 1.18 0.03 -0.41 -0.61 -0.03 -0.99 -0.2 -1.25 0.54 1.44 0.33 0.12 -0.14 0.27 -0.09 -0.07 -0.67 -0.63
-0.96 -0.66 -0.8 -0.41 0.22 0.33 0.37 0.28 0.07 -0.2 -0.45 -0.81 0.57 0.21 0.94 0.4 -1.09 -0.69 -0.01 -1.5 -1.31 -1.44 0.1 0.56 0.74 -0.37 1.39 1.11 -0.55 -0.32 -0.95 -1.02
-1.32 -0.28 0.53 0.68 0.6 0.41 0.35 -0.58 -0.54 -0.63 -0.71 -1.18 -0.15 0.34 0.81 -0.32 -0.22 -1.8 -0.13 -7.06 0.13 -5.09 0.63 1.61 1.01 0.58 0.28 0.81 -1.34 -1.05 -1.78 -1.31
-0.37 -0.11 -0.49 -0.15 -0.3 -0.41 -0.56 0.03 -0.41 -0.69 -0.58 -0.93 0.43 0.34 -0.13 0.6 -0.76 -0.96 0.37 -0.9 -3.07 0.91 0.33 0.24 1.82 0.64 0.8 0.62 -0.54 -0.5 -1.35 -1.67
-0.41 -0.9 -1.3 -0.89 -0.86 -0.71 -1.67 -0.51 -0.16 -0.52 0.05 -0.2 1.51 1.38 1.19 1.14 -1.26 -1.64 -0.5 1.09 -1.24 -2.34 -0.43 -0.72 0.45 1.41 -0.03 -0.32 -0.67 -0.38 -0.78 -0.29
-0.33 -0.31 -0.19 0.07 0.11 -0.07 0.16 0.1 0.16 0.37 0.06 -0.16 -0.44 0.47 0.47 -0.29 -0.27 -0.58 0.05 0.05 -0.19 -1.38 -0.2 -0.01 0.03 0.59 0.67 0.58 -0.19 -0.28 -0.36 -0.33
-0.26 0.06 0.05 0.18 0.23 0.28 -0.05 0.14 -0.22 0.12 -0.16 -0.12 -0.14 -0.16 0.78 0.11 0.07 -0.48 0.1 -2.69 -0.18 -0.66 0.5 0.42 0.77 -0.38 -0.05 -0.07 -0.34 -0.01 -0.21 -0.27
-2.1 -0.32 - - - 1.22 -0.27 0.84 0.75 0.75 0.91 -1.29 - - 1.33 - - 2.05 -0.12 - - - - -1.18 2.47 -0.16 1.15 - -0.11 1.21 -1.15 -
-0.5 -0.4 -0.99 -0.5 0.14 -0.03 -0.12 0.46 0.24 -0.2 0.18 -0.4 0.08 -1.03 0.78 -0.03 -0.64 -0.28 0.72 -0.92 -1.53 -0.81 -0.11 0.2 0.97 0.64 0.81 0.93 -0.35 -0.04 -0.77 -0.68
- - - - - 0.27 - -0.03 0.19 -1.47 0.21 - - - - -0.92 -1.09 1.95 -1.23 - - - 0.37 -0.22 2.73 0.9 2.45 2.02 -1.2 -1.21 -0.24 -
-0.65 -0.52 -1.25 -0.24 0.16 0.33 0.3 0.01 0.07 -0.3 -0.31 -0.37 -0.26 -0.32 0.64 -0.38 -0.45 -1.81 0.31 -1.09 0.47 -0.2 -0.44 -0.3 0.46 1.19 1.04 1.16 -0.72 -0.34 -0.56 -0.28
-0.75 -2.98 - -3.28 - -2.71 -0.3 -0.27 - -2.17 -1.69 -0.92 -1.86 -2.86 1.18 -2.67 -0.33 1.54 -0.18 - - -0.21 -0.17 - 1.87 -0.71 2.02 2.46 1.31 -0.35 0.38 -0.42
- - - - - - 0.78 - - - 1.25 -0.27 - - - - 0.09 - 2.27 - - - 0.1 - 2.78 0.97 - 3.22 - 0.97 - -
-1.27 -3.02 -3.66 -1.47 -2.04 0.24 0.34 -0.0 -0.31 -0.44 -0.63 -1.56 -0.99 -0.91 0.39 -0.61 0.63 1.65 0.37 -4.66 - 0.19 -0.22 -0.73 1.96 -0.23 0.72 0.84 0.8 0.87 -0.16 -0.93
-1.18 -0.55 0.41 0.16 0.62 -0.19 0.13 -0.3 -1.72 -1.44 -1.94 -0.8 -0.39 -1.21 -0.19 0.39 0.21 0.81 0.79 - 0.14 0.69 -0.38 -0.96 1.62 0.02 0.2 1.12 0.22 0.37 -1.33 -1.72
0.16 -0.28 -0.37 0.04 0.32 0.28 0.07 0.5 0.57 0.26 -0.13 0.07 -1.28 -0.36 0.82 -0.5 -0.26 -1.4 0.27 -1.67 -0.92 -1.72 -0.22 -0.21 1.49 0.33 0.57 0.24 -0.14 -0.01 -0.76 -0.95
0.54 -1.55 -1.67 -0.07 2.05 - 0.54 -1.91 -0.43 -1.83 0.56 -0.13 -1.54 - - - - 1.8 0.65 - - 2.47 - -0.59 2.16 - 1.85 - - - - -
-0.2 0.23 -0.29 0.42 0.86 0.42 0.34 0.45 -0.41 -0.17 0.12 0.01 0.5 0.16 0.74 0.75 -0.34 -3.41 0.79 - -3.45 -5.55 0.06 0.11 -1.54 -0.17 0.51 0.87 -0.07 -0.11 -0.88 -0.64
-0.47 -0.72 -0.84 -0.43 -0.11 0.16 0.4 0.25 0.29 0.15 -0.02 -0.23 -0.98 -2.09 -0.4 -0.9 -0.4 -0.29 0.59 -1.13 0.01 -1.54 -0.14 -0.15 0.97 0.33 0.54 0.8 0.03 0.18 0.73 0.76
-0.78 -0.51 -0.28 -0.08 -0.05 0.25 0.31 0.55 0.43 0.41 0.34 -0.03 -0.15 0.03 0.31 0.1 -0.72 -1.44 0.1 -0.4 -0.05 -0.85 -0.26 -0.26 1.01 0.81 0.32 0.33 -0.56 -0.5 -0.58 -0.68
-0.19 -0.34 -0.3 -0.33 -0.15 -0.34 -0.55 -0.2 -0.27 0.06 -0.15 -0.04 0.33 -0.02 0.51 0.77 -0.76 -1.43 0.39 0.0 0.54 -1.22 -0.38 -0.1 0.82 0.84 0.46 0.38 -0.2 -0.17 -0.63 -0.22
-0.41 -0.3 -0.16 -0.35 0.07 -0.08 0.07 0.17 0.32 0.48 0.22 0.16 0.14 0.27 -0.0 0.21 -0.53 -3.47 0.15 -1.63 0.77 -3.81 -0.34 -0.1 0.73 0.72 0.36 0.67 -0.29 -0.06 -0.4 -0.39
-0.23 -0.39 -0.21 -0.04 0.4 0.33 0.57 0.62 0.8 0.42 -0.02 0.04 -1.22 -0.46 0.9 -0.98 -0.9 -0.7 0.19 -0.71 -0.7 -0.58 -1.18 -0.9 1.38 0.42 0.5 0.63 -0.45 -0.14 -1.79 -1.64
-0.68 -0.47 -0.49 -0.32 -0.24 -0.23 -0.32 -0.2 -0.36 -0.44 -0.55 -0.73 0.46 0.08 0.62 0.56 -0.41 -0.66 0.53 0.45 -0.1 -0.02 0.13 0.34 1.01 0.3 0.26 0.22 -0.21 -0.13 -0.4 -0.15
-0.11 -0.17 -0.09 -0.04 0.03 0.12 0.18 0.36 0.17 0.1 -0.1 -0.25 -0.13 0.07 0.44 -0.03 -0.26 -0.24 0.1 -0.69 -0.86 -1.35 -0.01 -0.0 0.22 0.22 0.76 0.79 -0.27 -0.12 -0.24 -0.32
-0.12 -0.14 -0.18 -0.03 -0.03 0.21 0.12 0.18 0.21 0.18 0.15 -0.01 -0.11 -0.04 0.45 0.05 -0.42 -1.03 -0.45 -0.48 0.5 -0.53 0.1 0.14 0.33 0.54 0.5 0.36 -0.43 -0.32 -0.51 -0.57
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-0.58 -2.4 -0.73 -0.79 0.25 -0.86 -0.34 -0.45 -0.25 -1.74 -3.73 -1.7 -3.64 -1.48 -0.4 -0.56 -0.61 1.05 0.67 -0.75 -0.51 0.55 -2.2 -0.95 2.43 -2.8 1.98 1.59 -0.29 -0.2 -1.24 -0.18
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-0.13 -0.11 -0.11 -0.08 0.03 -0.0 -0.07 0.22 0.11 -0.03 -0.15 -0.14 -0.11 -0.19 0.14 -0.17 -0.59 -0.82 -0.11 -1.21 0.61 0.47 -0.37 -0.17 0.57 0.66 0.8 0.77 -0.42 -0.4 -0.53 -0.65
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-0.72 -0.28 -0.49 0.1 0.45 0.31 0.23 0.2 -0.01 -0.06 -0.37 -0.48 -0.21 -0.64 0.86 0.08 -0.36 -0.6 0.12 -2.34 -0.35 -1.99 1.0 1.18 0.18 -0.1 0.63 0.56 -0.32 -0.26 -0.63 -0.65
0.0 -0.3 -0.09 -0.09 0.06 0.44 0.3 0.44 0.44 0.28 0.08 0.05 -0.02 -0.9 0.82 0.22 -0.23 -0.24 0.28 -2.62 -1.71 -4.19 0.23 0.36 0.62 0.17 0.26 0.46 -0.17 -0.02 -0.74 -0.71
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-1.89 -0.3 -2.26 -0.69 -0.4 -0.88 -0.95 -0.46 -2.88 -1.78 -0.63 -1.44 0.03 -1.13 -0.73 1.36 -0.76 -0.59 1.81 -0.08 - 0.48 -3.77 -2.73 2.15 -0.13 1.62 1.94 -0.82 0.09 -2.54 -3.92
-0.34 -0.2 -0.12 0.12 0.13 0.22 0.0 0.22 0.06 0.08 0.03 -0.25 -0.18 -0.08 0.48 0.18 -0.5 -1.17 -0.17 -0.09 0.33 -0.49 -0.18 -0.17 1.02 0.55 0.39 0.62 -0.32 -0.22 -1.13 -1.2
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.