Heatmap: Cluster_189 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.29 -0.08 -0.0 0.15 0.06 0.19 -0.22 -0.11 -0.23 -0.34 -0.29 -0.43 -0.07 0.9 0.96 0.14 -0.24 -0.87 -0.21 -0.41 -1.34 -2.41 -0.22 -0.35 0.84 0.37 0.9 1.14 -0.44 -0.37 -0.85 -0.67
-0.11 0.16 0.03 0.33 0.33 0.31 0.17 0.18 0.01 -0.26 -0.27 -0.33 0.1 1.28 0.51 -0.12 -0.27 -0.86 -0.64 -1.05 -1.51 -2.09 -0.47 -0.55 1.03 0.18 0.95 0.94 -0.71 -0.65 -1.11 -1.4
-0.31 -0.37 -0.29 0.0 0.09 0.05 0.22 0.41 0.24 0.28 0.22 0.18 0.06 0.36 1.02 -0.03 -0.54 -1.17 -0.17 -2.15 -2.15 -0.4 -0.3 -0.39 0.68 0.51 0.76 0.79 -0.42 -0.25 -0.71 -0.91
0.07 0.07 0.15 0.22 0.19 0.13 0.22 0.28 -0.0 0.0 0.02 0.01 0.24 1.03 -0.08 0.76 -0.44 -1.4 0.44 -0.61 -2.03 -4.24 -0.27 -0.2 1.01 0.7 -0.11 0.23 -0.4 -0.28 -1.64 -1.43
-0.91 -0.67 -0.42 0.47 0.83 0.85 0.46 0.4 0.02 -0.15 -0.43 -0.83 -0.04 0.11 0.54 0.29 -0.13 -1.14 0.48 -2.87 -0.84 -1.79 -0.09 -0.49 0.58 0.57 0.77 0.62 -0.3 -0.36 -0.87 -0.48
-0.27 -0.08 -0.13 0.11 0.05 0.08 -0.11 -0.14 -0.05 -0.14 -0.14 -0.09 -0.33 0.37 0.85 0.14 -0.02 -0.44 0.27 -0.41 0.13 -0.7 0.15 0.17 0.59 0.13 0.11 0.55 -0.08 0.07 -0.98 -1.61
-0.05 -0.17 -0.11 -0.04 0.16 -0.02 -0.11 -0.06 0.12 0.02 0.16 0.02 -0.31 0.4 0.63 -0.2 -0.12 -1.24 -0.23 -1.43 -1.14 -1.57 0.23 0.26 -0.23 1.08 0.76 0.77 -0.28 -0.09 -0.34 -0.25
-0.42 -0.03 0.02 0.27 0.34 0.34 0.33 0.34 0.2 0.19 0.05 -0.07 0.21 -0.19 0.58 0.25 -0.38 -1.14 0.12 -2.28 -2.36 -0.36 -0.08 -0.04 0.27 0.67 0.57 0.55 -0.49 -0.34 -0.65 -0.52
-0.03 -0.34 -0.56 -0.2 -0.37 -0.06 0.0 0.32 0.42 0.25 0.16 0.19 0.44 0.1 0.35 0.73 -0.83 -1.36 0.19 -0.25 -3.34 -4.09 -0.52 -0.16 -1.82 1.49 1.05 0.96 -0.31 -0.19 -0.82 -0.99
-0.34 -0.25 -0.24 0.22 0.33 0.3 0.3 0.24 -0.05 -0.14 -0.16 -0.35 -0.2 0.42 0.77 0.13 -0.51 -0.69 -0.37 -2.78 -1.99 -1.61 -0.26 -0.1 1.07 0.5 1.15 1.01 -0.32 -0.25 -1.05 -1.18
-0.44 0.1 0.29 0.58 0.63 0.75 0.39 0.35 0.02 -0.05 -0.29 -0.37 -0.69 -0.1 0.88 -0.49 -0.14 -0.46 -0.4 -0.89 0.18 -0.91 -0.16 -0.23 1.05 -0.37 0.48 0.54 -0.8 -0.65 -1.34 -1.54
-0.28 0.17 0.34 0.45 0.26 0.3 0.19 0.09 0.14 0.09 0.21 -0.18 0.23 1.13 0.12 0.1 -0.21 -0.25 -0.38 -0.57 -1.07 -1.72 -0.46 -0.78 0.74 0.18 0.15 0.11 -0.2 -0.29 -0.83 -0.78
0.07 0.04 -0.11 0.12 0.27 -0.0 -0.19 -0.0 -0.01 -0.14 0.05 -0.08 0.11 1.35 0.33 0.07 -0.34 -0.93 -0.0 -1.77 -0.53 -1.97 0.0 -0.15 1.14 0.17 0.23 0.04 -0.44 -0.37 -0.53 -0.3
-0.13 0.02 -0.13 0.03 -0.06 -0.11 -0.13 -0.08 0.03 -0.31 -0.33 -0.24 0.13 1.27 0.48 0.26 -0.3 -0.28 0.09 -2.47 0.09 -2.64 -0.28 -0.25 1.09 0.5 0.63 0.61 -0.43 -0.33 -1.08 -1.23
-0.29 -0.07 -0.07 0.03 0.31 0.35 0.2 0.13 0.01 -0.09 0.05 -0.41 0.06 0.09 0.36 0.48 -0.36 -0.56 0.22 -1.25 -1.54 -0.86 -0.14 -0.06 -0.8 1.09 0.85 1.16 -0.38 -0.23 -1.27 -1.36
-0.5 -0.1 0.03 0.46 0.62 0.55 0.28 0.22 0.2 -0.04 -0.27 -0.39 0.78 0.9 -0.08 0.62 0.07 -2.55 -0.29 -1.68 -0.88 -4.48 -0.52 -0.76 0.71 0.19 0.52 0.68 -0.28 -0.18 -0.86 -1.02
-1.21 -0.93 -0.6 0.44 1.13 1.14 0.62 0.03 -0.49 -0.71 -0.87 -1.2 0.52 0.44 0.62 0.37 -0.2 -1.12 0.2 -1.64 0.1 -4.05 0.26 0.1 1.32 0.29 0.22 0.37 -1.16 -1.06 -1.59 -0.99
-0.72 -0.26 0.08 0.43 0.69 0.79 0.82 0.73 0.1 -0.07 -0.63 -0.59 -0.37 0.29 0.72 -0.17 -0.05 -0.42 -0.03 -4.3 -2.69 -4.74 0.46 0.38 -1.46 0.37 0.56 0.42 -0.39 -0.3 -0.26 0.04
-0.38 -0.13 0.05 0.16 0.18 0.22 0.19 0.04 0.13 -0.18 -0.25 -0.27 -0.13 1.08 1.26 -0.37 -0.22 -0.23 -0.73 -0.75 0.02 -0.24 -0.41 -0.76 0.32 -0.85 0.63 0.69 -0.45 -0.19 -0.75 -0.73
-0.01 -0.02 -0.2 -0.01 0.2 0.15 0.01 0.22 0.0 -0.24 -0.14 -0.11 -0.41 0.06 0.61 -0.07 -0.26 -0.41 0.32 -2.58 -1.38 -1.3 0.41 0.3 0.05 0.41 0.95 1.07 -0.2 -0.06 -0.77 -0.72
-0.1 -0.13 -0.01 0.02 0.02 0.05 0.14 0.18 0.19 0.2 0.17 -0.01 -0.11 0.53 1.06 -0.07 -0.69 -0.89 0.16 -0.54 -0.97 -0.51 -0.33 -0.19 0.34 0.58 0.35 0.38 -0.65 -0.55 -0.48 -0.31
0.09 0.24 0.35 0.46 0.22 0.07 -0.16 0.03 -0.08 -0.09 -0.13 -0.13 0.39 1.35 -0.43 0.05 -0.51 -1.43 -0.23 -0.05 -0.48 -1.15 -0.27 -0.2 0.76 0.61 0.4 0.25 -0.8 -0.81 -0.97 -1.14
-1.5 -1.37 -0.53 0.34 0.74 0.62 0.81 0.77 0.49 -0.03 -0.45 -0.96 0.45 0.12 0.96 -0.28 0.01 -1.14 -0.47 -3.32 -2.18 -2.74 0.09 0.03 -0.87 1.29 0.38 0.57 -0.11 0.01 -0.7 -0.5
0.04 -0.2 -0.21 0.05 0.12 0.07 0.12 0.21 0.18 0.35 0.07 -0.16 0.23 0.39 0.74 0.22 -0.45 -0.75 0.05 -1.56 -1.79 -1.47 -0.45 -0.27 0.65 0.31 0.69 0.75 -0.26 -0.1 -0.67 -0.42
-0.16 0.06 -0.03 0.18 -0.04 0.02 -0.09 0.09 -0.01 -0.06 0.0 -0.14 -0.65 0.72 0.58 -0.04 -0.5 -0.89 0.02 -2.19 -2.25 -1.91 -0.19 -0.27 -0.01 1.53 0.95 0.88 -0.6 -0.55 -0.3 -0.19
0.12 0.1 -0.09 0.11 0.21 0.11 -0.06 0.19 0.14 0.16 -0.02 -0.11 0.05 0.09 0.81 0.22 -0.54 -1.03 0.01 -0.65 -0.78 -0.49 -0.09 0.1 -0.14 0.49 0.42 0.47 -0.43 -0.23 -0.49 -0.22
-0.71 -0.24 -0.29 0.13 0.82 1.05 0.54 0.29 -0.1 -0.55 -0.66 -0.92 -0.25 0.19 0.17 0.07 0.2 -0.51 0.27 -1.77 -1.08 -0.73 0.05 -0.07 0.48 0.15 0.92 1.0 -0.28 -0.22 -1.53 -1.54
-0.18 -0.17 -0.23 0.26 0.18 0.19 0.25 0.38 0.29 0.14 0.02 0.01 -0.15 0.5 1.25 -0.21 -1.32 -1.62 -0.14 -0.6 -0.4 -0.54 -0.9 -0.58 0.79 0.82 0.9 0.58 -1.18 -0.88 -1.52 -1.4
0.04 0.14 0.15 0.14 0.16 0.18 0.14 -0.03 0.08 -0.11 -0.12 -0.14 0.47 0.91 0.25 0.27 -0.08 -0.19 -0.43 -0.45 -0.79 -2.55 -0.69 -0.65 0.9 -0.11 0.53 0.57 -0.41 -0.36 -0.8 -0.46
-0.11 0.3 0.86 0.57 0.57 0.93 0.55 0.38 0.5 -0.13 -0.03 0.02 -0.61 -0.18 0.39 -0.01 -1.05 -3.1 -0.16 -0.84 -2.93 -2.06 -0.57 -0.37 0.7 0.37 0.9 0.98 -0.98 -0.66 -2.17 -2.02
0.16 0.17 -0.2 -0.11 0.32 0.16 -0.28 0.09 -0.05 -0.18 -0.29 -0.25 0.06 0.61 0.34 -0.14 -0.29 -0.02 0.09 -0.96 0.19 -2.26 -0.04 0.04 0.85 -0.14 0.64 0.59 -0.34 -0.24 -0.68 -0.55
-1.09 -0.5 0.06 0.58 0.78 0.72 0.77 0.47 0.07 -0.25 -0.58 -0.86 -0.1 0.49 0.42 -0.32 0.09 -0.84 -0.32 -1.59 -0.99 -2.03 0.27 0.25 0.92 -0.13 0.56 0.52 -0.48 -0.36 -1.06 -0.62
-0.23 -0.17 -0.05 -0.0 0.07 -0.07 -0.04 0.07 0.17 0.22 0.18 0.09 -0.07 0.56 0.43 0.09 -0.41 -1.11 0.05 -3.37 -1.73 -3.1 -0.06 -0.01 -0.55 1.34 1.01 0.94 -0.28 -0.16 -0.69 -0.43
-0.22 -0.09 0.15 0.2 0.28 0.37 0.16 0.27 0.05 -0.06 -0.14 -0.38 0.36 0.39 0.46 0.53 -0.56 -1.17 0.19 -1.6 -0.88 -1.65 -0.26 -0.21 -0.27 0.93 0.83 0.96 -0.45 -0.42 -1.04 -1.11
0.51 0.22 -0.15 -0.43 -0.52 -0.67 -0.54 -0.25 -0.35 -0.16 -0.15 0.24 0.33 1.53 -1.72 0.67 -0.66 -1.37 0.69 -4.76 -1.98 -6.99 -0.47 -0.35 1.14 0.11 0.4 0.44 0.17 0.27 0.26 0.24
-0.61 -0.26 -0.03 0.04 0.2 0.36 0.4 0.26 -0.1 -0.17 -0.24 -0.46 -0.07 0.92 1.2 -0.13 -0.46 -0.84 -0.03 -0.63 -0.39 -0.81 -0.27 -0.3 0.47 0.09 0.8 0.79 -0.77 -0.63 -0.97 -0.88
-0.23 -0.02 -0.18 0.08 0.04 0.14 -0.07 0.19 -0.07 -0.06 -0.13 -0.34 0.29 0.28 0.71 0.4 -0.69 -1.52 0.13 -0.77 -0.55 -0.57 -0.14 0.23 0.33 0.66 0.92 0.73 -0.62 -0.49 -0.95 -0.64
-0.32 -0.19 -0.22 -0.03 0.15 -0.05 -0.29 -0.03 -0.08 -0.24 -0.3 -0.35 0.59 1.18 0.25 0.58 -0.58 -2.03 0.34 -0.89 -0.1 -0.72 -0.0 0.25 0.96 0.59 0.2 -0.06 -0.66 -0.55 -0.38 -0.56
-0.04 0.14 0.1 0.37 0.4 0.33 0.21 0.28 0.13 0.04 -0.03 -0.28 0.42 0.42 0.84 0.55 -0.87 -1.74 0.33 -2.96 -3.27 -1.29 -0.54 -0.42 -0.88 0.53 1.08 1.31 -0.73 -0.53 -1.55 -1.47
0.6 0.76 0.49 0.99 1.14 0.2 0.04 0.21 -0.56 0.49 -1.03 0.64 0.77 1.83 -0.31 0.41 -0.49 -3.76 -0.27 - - - -0.81 -0.63 -0.48 0.91 -0.08 -0.56 -1.25 -1.03 -2.34 -2.65
-0.32 -0.27 -0.39 -0.09 -0.09 -0.12 -0.13 -0.01 0.15 0.06 0.02 -0.0 0.25 0.68 0.69 0.31 -0.26 -1.6 -0.86 -2.51 -2.09 -2.81 -0.17 0.16 0.29 1.85 0.6 0.63 -0.46 -0.43 -0.23 -0.75
-0.08 0.19 0.17 0.38 0.37 0.17 0.34 0.47 0.27 0.09 -0.03 -0.19 -0.19 0.56 0.78 -0.04 -0.45 -1.35 -0.48 -1.71 -0.53 -0.76 -0.29 -0.29 0.26 0.14 0.65 0.36 -0.67 -0.54 -0.08 -0.37
-0.66 -0.38 0.17 0.34 0.58 0.6 0.56 0.51 0.26 0.13 0.05 -0.5 -0.25 0.07 0.56 -0.11 -0.17 -0.83 -0.03 -2.34 -0.32 -1.48 0.27 0.4 -0.04 0.16 0.59 0.45 -0.56 -0.4 -0.7 -0.67
-0.16 0.07 0.08 0.22 0.29 0.25 0.05 0.18 0.01 -0.09 -0.14 -0.21 -0.7 0.56 0.69 0.1 -0.39 -0.62 0.43 -4.81 -2.2 -2.32 -0.51 -0.66 0.74 1.12 1.02 1.04 -0.51 -0.43 -1.11 -1.4
-0.53 -0.15 -0.44 0.38 0.14 0.68 0.43 0.35 0.3 -0.11 -0.19 -0.47 -0.2 0.19 0.45 -0.03 -0.33 -1.95 0.16 -1.29 -1.01 -2.18 0.18 0.03 0.6 0.27 1.06 1.02 -0.84 -0.58 -0.71 -0.31
-0.5 0.19 -0.26 -0.17 -0.08 -0.02 -0.23 -0.27 -0.16 -0.32 -0.5 -0.4 -0.4 0.21 0.86 0.19 -0.71 -1.64 0.2 - -0.61 - -0.35 -0.07 1.02 1.01 1.78 1.31 -0.4 -0.4 -1.15 -1.34
-0.31 0.1 -0.41 -0.0 -0.6 0.17 -0.03 -0.19 0.03 0.36 -0.19 -0.23 -0.37 1.56 1.25 -0.84 -1.88 -2.23 -0.04 -6.97 -1.18 -3.61 -1.06 -1.16 1.12 0.99 1.43 1.45 -1.34 -1.42 -1.33 -1.39
-0.13 0.49 0.42 0.5 0.36 0.97 0.69 0.42 -0.05 0.11 -0.16 -0.03 -0.81 -0.42 1.54 -0.28 -0.71 -2.57 0.23 -0.75 -1.68 -0.53 -1.03 -0.98 1.06 -0.79 0.33 0.54 -0.78 -1.04 -1.2 -1.64
-0.39 -0.29 -0.12 0.05 0.21 0.33 0.24 0.48 -0.02 0.14 0.16 -0.43 0.23 0.15 0.69 0.16 -0.33 -1.06 -0.26 -1.17 -0.86 0.13 -0.11 -0.01 0.3 0.61 0.59 0.7 -0.26 -0.19 -1.36 -1.38
-1.15 -0.57 0.17 0.57 1.04 0.94 0.8 0.22 -0.25 -0.68 -0.91 -1.37 0.79 1.07 -0.62 0.43 -0.35 -0.61 0.5 -1.73 -1.07 -3.14 0.39 0.38 0.04 0.36 0.42 0.46 -0.88 -0.66 -1.97 -1.39
-0.31 -0.1 -0.1 0.03 0.07 0.06 -0.03 -0.06 -0.14 -0.21 -0.29 -0.43 -0.08 0.18 0.95 0.22 -0.63 -0.95 0.11 -0.53 -0.39 -0.7 -0.27 -0.08 0.5 0.84 1.07 1.1 -0.63 -0.48 -1.11 -1.22
-0.25 0.14 0.21 0.77 0.73 0.83 0.62 0.4 0.35 0.22 -0.05 0.04 -0.81 0.01 0.54 -0.49 -0.4 -0.5 0.13 -2.6 -2.25 -3.4 -0.09 -0.0 0.77 -0.02 0.61 0.54 -1.0 -0.89 -0.92 -0.93
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-0.58 -0.3 -0.26 0.12 0.14 0.45 0.44 0.32 0.11 -0.13 -0.32 -0.47 -0.13 -0.1 0.26 0.04 -0.44 -0.58 -0.06 -1.76 -0.99 -2.56 0.39 0.55 -0.14 0.55 1.06 1.25 -0.28 -0.07 -0.8 -0.62
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-0.03 -0.25 -0.31 -0.03 0.16 0.06 -0.2 0.22 0.24 0.25 0.2 -0.02 0.29 0.23 0.78 0.39 -0.54 -1.02 0.48 -1.5 -1.36 -1.85 -0.25 -0.02 -0.2 0.88 0.48 0.67 -0.26 -0.21 -0.68 -0.25
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0.18 -0.09 -0.29 0.09 0.26 0.09 -0.06 -0.11 0.15 0.29 0.27 0.3 -0.53 2.06 -0.02 0.2 -0.78 -1.73 -0.25 -0.7 -1.81 -3.05 -0.75 -0.67 0.98 0.76 0.36 -0.2 -0.92 -1.06 -0.74 -0.45
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-0.48 -0.37 -0.16 -0.26 0.16 -0.07 0.18 0.24 0.32 0.29 0.04 -0.13 -0.06 0.36 1.05 0.05 -0.74 -0.91 -0.11 -1.69 -1.95 -2.35 -0.52 -0.48 0.83 0.94 1.12 1.1 -0.48 -0.52 -0.95 -1.13
-0.47 0.27 0.18 0.7 0.39 0.45 0.2 0.32 0.28 0.31 -0.03 -0.33 0.09 0.03 0.68 -0.09 0.11 -0.82 -0.73 -1.41 -3.34 -3.89 0.34 0.25 0.52 0.84 0.56 0.33 -0.72 -0.61 -1.32 -0.91
-0.53 -0.54 -0.15 0.09 0.33 0.43 0.42 0.52 0.13 0.21 0.01 -0.25 -0.11 0.68 0.61 -0.28 -0.51 -0.79 -0.19 -2.05 -2.58 -2.71 0.05 0.38 0.45 0.37 0.82 0.94 -0.44 -0.26 -0.64 -0.55
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-0.29 -0.22 -0.22 0.1 0.03 0.11 -0.0 0.04 -0.15 -0.35 -0.5 -0.36 0.3 0.92 0.49 0.46 -0.09 -0.17 0.35 -1.14 -0.47 -1.93 -0.02 0.09 0.99 -0.39 0.29 0.1 -0.07 0.02 -0.36 -0.31
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-0.02 0.1 -0.0 0.24 0.1 0.24 -0.18 0.22 0.06 -0.13 -0.22 -0.31 0.43 0.36 0.6 0.48 -0.29 -1.09 0.22 -5.65 -3.48 -5.43 -0.16 0.09 -0.43 1.01 1.07 1.05 -0.36 -0.3 -0.68 -0.69
-0.68 -0.45 -0.06 0.11 0.28 0.34 0.17 0.12 -0.04 -0.45 -0.33 -0.76 0.08 0.86 1.15 0.04 -0.01 -0.5 0.03 0.03 -1.01 -0.68 0.3 0.3 0.05 -0.13 0.41 0.56 -0.31 -0.15 -1.08 -1.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.