Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.53 0.48 0.58 0.53 0.76 0.69 0.9 0.84 0.82 0.65 0.69 0.62 0.65 0.17 0.36 0.52 0.6 0.5 0.78 0.04 0.01 0.0 0.6 0.51 0.0 0.47 0.7 0.74 0.92 1.0 0.37 0.33
0.33 0.36 0.36 0.41 0.52 0.48 0.36 0.34 0.4 0.31 0.28 0.2 0.39 1.0 0.28 0.85 0.49 0.33 0.3 0.01 0.03 0.07 0.86 0.84 0.05 0.12 0.36 0.47 0.35 0.46 0.37 0.48
0.41 0.46 0.45 0.4 0.4 0.46 0.43 0.33 0.43 0.41 0.39 0.33 0.36 0.95 0.04 0.51 0.47 0.4 0.2 0.07 0.27 0.0 1.0 0.83 0.23 0.08 0.27 0.3 0.39 0.42 0.34 0.31
0.39 0.5 0.45 0.44 0.43 0.43 0.47 0.36 0.45 0.46 0.41 0.36 0.41 0.93 0.41 0.51 0.53 0.64 0.3 0.0 0.03 0.0 1.0 0.85 0.02 0.19 0.24 0.25 0.45 0.48 0.64 0.6
0.42 0.49 0.58 0.53 0.71 0.67 0.78 0.6 0.55 0.48 0.52 0.41 0.57 0.94 0.57 0.82 0.98 0.95 0.72 0.12 0.3 0.06 0.72 0.64 0.49 0.52 0.6 1.0 0.75 0.89 0.61 0.5
0.37 0.56 0.6 0.53 0.5 0.55 0.47 0.33 0.38 0.36 0.32 0.32 0.39 0.68 0.21 0.53 0.45 0.41 0.24 0.04 0.11 0.01 1.0 0.81 0.08 0.12 0.21 0.3 0.33 0.4 0.3 0.34
0.21 0.22 0.25 0.22 0.27 0.26 0.18 0.16 0.16 0.14 0.15 0.12 0.4 1.0 0.05 0.42 0.2 0.31 0.07 0.0 0.0 0.0 0.45 0.53 0.07 0.03 0.08 0.08 0.13 0.16 0.11 0.13
0.34 0.49 0.54 0.56 0.47 0.55 0.52 0.41 0.45 0.39 0.39 0.34 0.34 1.0 0.66 0.38 0.5 0.56 0.26 0.17 0.25 0.1 0.95 0.79 0.6 0.1 0.26 0.32 0.4 0.44 0.33 0.36
0.17 0.36 0.61 0.72 0.83 0.84 0.7 0.45 0.37 0.25 0.23 0.16 0.42 1.0 0.56 0.38 0.94 0.77 0.41 0.1 0.22 0.08 0.9 0.7 0.11 0.15 0.5 0.61 0.53 0.55 0.38 0.3
0.4 0.55 0.49 0.51 0.48 0.48 0.47 0.43 0.42 0.44 0.41 0.38 0.37 0.8 0.38 0.42 0.48 0.36 0.25 0.04 0.04 0.06 1.0 0.88 0.33 0.23 0.33 0.46 0.4 0.44 0.3 0.32
0.36 0.38 0.37 0.31 0.29 0.3 0.3 0.18 0.24 0.26 0.22 0.24 0.29 0.55 0.03 0.38 0.47 0.27 0.18 0.05 0.11 0.03 1.0 0.85 0.21 0.13 0.17 0.25 0.38 0.43 0.24 0.25
0.2 0.32 0.33 0.27 0.26 0.27 0.35 0.2 0.25 0.24 0.19 0.16 0.31 0.71 0.02 0.49 0.32 0.28 0.1 0.0 0.07 0.0 1.0 0.85 0.07 0.02 0.13 0.22 0.31 0.38 0.26 0.23
0.58 0.6 0.52 0.54 0.44 0.44 0.56 0.57 0.75 0.78 0.73 0.71 0.4 0.96 0.4 0.4 0.74 0.57 0.21 0.02 0.02 0.02 1.0 0.67 0.12 0.14 0.24 0.24 0.56 0.57 0.66 0.66
0.31 0.53 0.69 0.77 0.84 0.89 0.4 0.25 0.25 0.2 0.17 0.15 0.26 0.8 0.31 0.59 1.0 0.95 0.3 0.02 0.33 0.02 0.94 0.57 0.33 0.15 0.53 0.9 0.56 0.63 0.11 0.07
0.21 0.31 0.37 0.36 0.38 0.44 0.42 0.33 0.38 0.4 0.37 0.3 0.35 0.83 0.51 0.46 0.39 0.2 0.1 0.02 0.08 0.02 1.0 0.85 0.1 0.13 0.16 0.27 0.27 0.32 0.18 0.17
0.61 0.64 0.67 0.75 0.79 0.79 0.76 0.77 0.72 0.68 0.67 0.63 0.52 0.95 0.58 1.0 0.8 0.5 0.91 0.42 0.45 0.1 0.92 0.92 0.62 0.65 0.67 0.75 0.85 0.85 0.58 0.4
0.18 0.28 0.32 0.35 0.35 0.38 0.34 0.23 0.29 0.26 0.22 0.19 0.4 1.0 0.58 0.53 0.49 0.33 0.12 0.03 0.15 0.01 0.97 0.7 0.18 0.08 0.16 0.28 0.26 0.35 0.12 0.13
0.2 0.27 0.29 0.28 0.28 0.28 0.33 0.21 0.26 0.24 0.24 0.21 0.3 0.5 0.12 0.37 0.42 0.48 0.16 0.0 0.03 0.0 1.0 0.76 0.09 0.07 0.16 0.23 0.38 0.41 0.34 0.34
0.47 0.47 0.43 0.4 0.37 0.39 0.41 0.31 0.4 0.39 0.37 0.35 0.3 0.81 0.17 0.34 0.57 0.47 0.14 0.0 0.01 0.03 1.0 0.85 0.03 0.09 0.11 0.17 0.45 0.54 0.59 0.5
0.45 0.45 0.59 0.61 0.64 0.74 0.68 0.62 0.6 0.51 0.49 0.44 0.4 0.77 0.68 0.45 1.0 0.62 0.4 0.14 0.49 0.2 0.61 0.55 0.87 0.28 0.8 0.66 0.77 0.7 0.58 0.54
0.48 0.86 0.67 0.47 0.37 0.38 0.6 0.51 0.47 0.46 0.47 0.46 0.85 1.0 0.63 0.65 0.97 0.74 0.61 0.32 0.18 0.01 0.54 0.35 0.41 0.13 0.71 0.46 0.78 0.84 0.12 0.05
0.26 0.32 0.35 0.31 0.3 0.31 0.36 0.28 0.38 0.36 0.36 0.31 0.31 0.65 0.13 0.35 0.38 0.39 0.13 0.02 0.04 0.03 1.0 0.92 0.05 0.1 0.17 0.24 0.33 0.38 0.43 0.4
0.32 0.53 0.58 0.54 0.45 0.48 0.46 0.29 0.36 0.32 0.3 0.29 0.36 0.87 0.35 0.48 0.67 0.54 0.2 0.01 0.06 0.01 1.0 0.73 0.26 0.06 0.15 0.24 0.41 0.49 0.35 0.29
0.22 0.28 0.27 0.24 0.22 0.22 0.33 0.26 0.31 0.29 0.27 0.22 0.26 0.69 0.17 0.4 0.27 0.25 0.15 0.01 0.15 0.02 0.92 1.0 0.16 0.12 0.18 0.23 0.32 0.37 0.35 0.37
0.56 0.55 0.63 0.68 0.67 0.73 0.68 0.69 0.7 0.63 0.76 0.62 0.58 0.97 0.76 0.67 0.82 0.5 0.78 0.32 0.45 0.16 0.9 1.0 0.47 0.62 0.6 0.72 0.74 0.88 0.56 0.44
0.39 0.49 0.62 0.63 0.6 0.81 0.95 1.0 0.71 0.69 0.59 0.5 0.61 0.26 0.37 0.63 0.66 0.71 0.68 0.13 0.07 0.03 0.7 0.69 0.25 0.53 0.86 0.76 0.76 0.78 0.41 0.44
0.4 0.34 0.4 0.56 0.69 0.81 0.94 0.81 1.0 0.76 0.67 0.53 0.49 0.45 0.67 0.69 0.8 0.33 0.55 0.1 0.42 0.02 0.82 0.6 0.42 0.58 0.68 0.5 0.84 0.86 0.57 0.51
0.36 0.43 0.43 0.45 0.52 0.52 0.47 0.39 0.4 0.38 0.33 0.3 0.49 1.0 0.57 0.61 0.35 0.38 0.19 0.0 0.06 0.05 0.78 0.66 0.08 0.22 0.4 0.41 0.25 0.29 0.17 0.17
0.68 0.77 0.76 0.87 0.87 0.92 0.73 0.64 0.64 0.68 0.61 0.58 0.42 0.91 0.64 0.68 0.67 0.47 0.33 0.11 0.63 0.08 0.45 0.41 1.0 0.31 0.71 0.82 0.74 0.82 0.6 0.6
0.19 0.38 0.42 0.17 0.28 0.32 0.26 0.21 0.17 0.13 0.16 0.21 0.37 0.94 0.09 0.41 0.91 0.17 1.0 0.0 0.29 0.0 0.6 0.3 0.24 0.06 0.21 0.27 0.53 0.58 0.43 0.23
0.5 0.6 0.5 0.5 0.43 0.46 0.56 0.38 0.52 0.49 0.5 0.43 0.24 0.68 0.43 0.46 0.7 0.32 0.17 0.06 0.14 0.01 1.0 0.73 0.18 0.08 0.21 0.37 0.46 0.56 0.3 0.24
0.35 0.44 0.3 0.42 0.44 0.45 0.4 0.4 0.41 0.33 0.41 0.35 0.59 1.0 0.18 0.52 0.27 0.27 0.29 0.24 0.23 0.06 0.35 0.48 0.25 0.36 0.23 0.32 0.24 0.29 0.16 0.14
0.23 0.33 0.37 0.36 0.32 0.34 0.48 0.34 0.49 0.49 0.43 0.37 0.53 1.0 0.21 0.57 0.2 0.17 0.14 0.14 0.05 0.04 0.81 0.68 0.16 0.11 0.21 0.27 0.25 0.3 0.17 0.21
0.57 0.63 0.64 0.64 0.55 0.56 0.62 0.72 0.73 0.69 0.73 0.65 0.48 0.67 0.95 0.57 0.75 0.8 0.64 0.41 0.51 0.15 0.69 0.61 1.0 0.44 0.8 0.85 0.85 0.94 0.45 0.44
0.15 0.19 0.23 0.21 0.21 0.21 0.31 0.24 0.25 0.21 0.21 0.15 0.24 0.72 0.31 0.35 0.3 0.4 0.07 0.01 0.04 0.0 1.0 0.93 0.04 0.04 0.08 0.13 0.28 0.29 0.22 0.21
0.39 0.48 0.5 0.49 0.52 0.58 0.5 0.32 0.34 0.29 0.27 0.23 0.41 0.88 0.3 0.49 0.72 0.63 0.33 0.05 0.18 0.01 1.0 0.73 0.18 0.07 0.24 0.34 0.5 0.59 0.42 0.37
0.35 0.44 0.47 0.55 0.49 0.45 0.49 0.36 0.46 0.44 0.43 0.43 0.19 0.68 0.07 0.18 0.79 0.44 0.18 0.03 0.2 0.01 1.0 0.57 0.18 0.15 0.16 0.23 0.49 0.51 0.35 0.3
0.29 0.47 0.48 0.52 0.46 0.48 0.51 0.35 0.35 0.37 0.33 0.29 0.36 1.0 0.62 0.5 0.63 0.62 0.3 0.02 0.08 0.03 0.95 0.76 0.07 0.18 0.43 0.65 0.45 0.52 0.25 0.23
0.37 0.43 0.38 0.4 0.36 0.37 0.43 0.25 0.33 0.32 0.26 0.28 0.3 0.72 0.18 0.48 0.56 0.58 0.21 0.0 0.01 0.0 1.0 0.87 0.01 0.03 0.09 0.15 0.47 0.56 0.37 0.35
0.34 0.44 0.43 0.45 0.39 0.41 0.5 0.42 0.52 0.49 0.48 0.41 0.5 1.0 0.27 0.44 0.43 0.47 0.17 0.0 0.09 0.01 0.82 0.78 0.08 0.06 0.11 0.15 0.41 0.43 0.41 0.53
0.38 0.48 0.51 0.52 0.4 0.42 0.43 0.42 0.46 0.46 0.51 0.37 0.28 1.0 0.74 0.47 0.42 0.44 0.57 0.0 0.03 0.0 0.8 0.73 0.16 0.2 0.25 0.32 0.36 0.38 0.19 0.19
0.29 0.33 0.37 0.41 0.45 0.49 0.45 0.41 0.5 0.45 0.46 0.32 1.0 0.93 0.23 0.99 0.33 0.36 0.33 0.0 0.0 0.0 0.99 0.89 0.02 0.13 0.28 0.42 0.31 0.37 0.25 0.31
0.38 0.53 0.64 0.63 0.69 0.72 0.94 0.97 0.94 0.88 0.66 0.69 0.55 0.23 0.49 0.84 0.86 0.53 0.92 0.01 0.02 0.0 0.77 0.76 0.14 0.35 0.37 0.4 0.99 1.0 0.37 0.36
0.26 0.3 0.27 0.27 0.28 0.33 0.27 0.19 0.21 0.2 0.2 0.16 0.5 0.96 0.04 0.68 0.37 0.4 0.15 0.05 0.12 0.01 1.0 0.86 0.11 0.06 0.18 0.25 0.28 0.31 0.25 0.23
0.47 0.57 0.61 0.52 0.45 0.52 0.46 0.4 0.39 0.38 0.34 0.32 0.63 0.91 0.51 0.72 0.58 0.59 0.52 0.07 0.09 0.07 1.0 0.82 0.31 0.41 0.45 0.54 0.43 0.49 0.32 0.37
0.32 0.56 0.56 0.6 0.56 0.69 0.53 0.34 0.34 0.31 0.24 0.23 0.28 0.52 0.47 0.36 0.76 0.61 0.33 0.03 0.19 0.06 1.0 0.65 0.23 0.18 0.3 0.41 0.37 0.42 0.26 0.22
0.26 0.32 0.35 0.39 0.47 0.46 0.31 0.29 0.31 0.27 0.25 0.16 0.41 1.0 0.23 0.81 0.45 0.26 0.2 0.02 0.03 0.01 0.7 0.68 0.07 0.07 0.33 0.45 0.3 0.39 0.28 0.36
0.67 0.7 0.74 0.84 0.92 0.85 0.97 0.83 0.94 0.81 0.89 0.78 0.58 0.95 0.57 0.55 0.97 0.58 0.55 0.17 0.5 0.2 0.95 0.84 0.9 0.53 0.81 1.0 0.87 0.9 0.65 0.5
0.33 0.42 0.4 0.37 0.35 0.37 0.49 0.34 0.45 0.46 0.41 0.38 0.45 0.8 0.11 0.6 0.35 0.35 0.18 0.02 0.09 0.01 0.92 1.0 0.25 0.06 0.2 0.26 0.41 0.45 0.49 0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)