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Heatmap: Cluster_145 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.52 -0.83 -0.92 -0.83 -0.37 -0.62 -0.24 -0.22 -0.38 -0.11 -0.54 -0.64 0.1 -1.89 -0.77 0.32 -0.57 -0.26 0.53 -8.71 - -5.72 -0.2 0.05 -6.85 1.97 1.94 1.6 0.11 -0.0 0.18 0.5
0.09 0.17 0.16 0.23 0.26 0.2 0.16 0.32 0.13 0.13 0.1 -0.08 -0.23 -0.51 -0.35 0.0 -0.54 -0.77 0.2 -1.11 -3.06 -2.48 -0.36 -0.36 -0.82 1.08 1.2 1.3 -0.28 -0.26 -0.54 -0.49
0.06 0.02 0.07 0.09 0.03 0.06 0.02 0.15 0.05 0.01 -0.08 -0.09 -0.05 0.07 0.27 0.13 -0.65 -0.86 0.08 -3.0 -1.52 -1.23 -0.55 -0.45 -0.52 1.29 1.29 1.42 -0.7 -0.62 -0.6 -0.6
-0.6 -0.92 -0.42 -0.31 -0.18 0.12 -0.29 0.29 0.22 -0.57 -0.42 -0.82 -0.15 0.63 -1.17 0.17 -0.89 -0.36 -0.09 -6.67 -3.55 -2.28 -1.14 -0.91 -1.16 1.65 2.13 2.04 -0.57 -1.03 -1.22 -0.22
-0.07 -0.19 -0.45 -0.16 -0.06 -0.04 -0.14 -0.06 -0.18 -0.1 0.04 -0.33 0.36 -0.03 0.55 0.5 -0.56 -1.04 0.11 - -5.74 -8.3 -0.29 -0.2 -2.13 1.57 1.47 1.56 -0.38 -0.26 -0.36 -0.51
0.09 0.03 0.0 0.16 0.02 0.02 0.09 0.24 0.18 0.17 0.09 0.07 -0.04 -0.04 0.62 -0.05 -0.32 -0.85 0.17 -2.66 -1.79 -1.6 -0.08 0.03 0.22 0.78 0.7 0.89 -0.27 -0.22 -0.44 -0.51
-0.58 -0.44 -0.22 -0.15 0.06 -0.06 -0.01 0.35 0.12 0.17 0.15 -0.08 0.01 -0.13 0.53 -0.04 -0.83 -1.28 0.09 -3.0 -2.03 -1.36 -0.61 -0.37 -0.9 1.73 1.49 1.41 -0.59 -0.5 -0.92 -0.92
0.07 0.06 0.08 0.07 0.07 -0.08 -0.05 0.09 0.09 0.12 0.14 -0.01 0.4 0.19 0.02 0.32 -0.53 -0.87 -0.04 -4.56 -5.8 -2.75 -0.05 0.13 -2.17 1.34 1.05 1.15 -0.36 -0.3 -0.17 -0.31
-0.55 -0.29 -0.53 -0.13 -0.03 -0.33 -0.06 0.1 0.04 -0.07 -0.03 -0.16 -1.37 -1.06 -0.48 -0.89 0.02 -0.33 0.3 -2.82 -1.96 - -0.54 -0.53 -0.62 1.98 1.65 1.69 0.0 -0.01 -0.51 -0.69
-0.34 -0.19 -0.17 -0.09 0.18 -0.12 0.14 0.18 0.02 -0.01 0.06 -0.25 -0.23 -0.26 0.12 -0.03 -0.36 -0.59 0.13 -2.78 -2.06 -1.68 -0.29 -0.18 0.34 1.31 1.32 1.39 -0.33 -0.24 -0.78 -0.91
-0.67 -0.53 -0.42 -0.25 -0.12 -0.08 -0.01 0.09 -0.09 -0.24 -0.34 -0.54 0.14 -0.01 1.02 0.02 -0.74 -0.96 -0.22 -1.81 -3.1 -1.05 -0.45 -0.22 -1.25 1.82 1.63 1.56 -0.76 -0.81 -0.75 -0.84
-0.54 -0.66 -0.61 -0.37 -0.24 -0.29 0.11 0.39 0.14 0.25 0.16 -0.18 -0.19 -0.63 0.43 -0.09 -1.21 -1.86 0.36 -2.53 -2.79 -0.34 -0.6 -0.21 -1.48 2.16 1.29 1.52 -0.54 -0.33 -1.23 -1.36
0.33 0.01 -0.06 -0.03 0.06 -0.0 -0.0 0.31 0.28 0.24 0.28 0.12 -0.38 -0.13 0.41 -0.14 -0.53 -0.91 -0.34 -2.77 -2.65 -3.0 -0.66 -0.82 -1.65 1.55 1.34 1.24 -0.55 -0.51 -0.12 -0.29
-0.1 -0.0 0.09 0.1 0.27 0.42 0.18 0.26 -0.02 -0.09 -0.2 -0.33 -0.11 -0.06 0.62 0.08 -0.27 -0.91 0.11 -2.94 -2.05 -0.78 -0.36 -0.33 -1.17 0.8 1.27 1.31 -0.42 -0.3 -0.49 -0.57
-0.02 0.04 -0.06 0.06 0.06 0.0 -0.06 0.31 0.17 0.21 0.24 0.1 -0.02 -0.15 0.12 0.26 -0.67 -1.21 0.3 -1.03 -0.89 -2.06 -0.23 -0.05 -0.23 1.12 0.82 0.96 -0.53 -0.47 -0.47 -0.39
-0.17 -0.26 -0.26 -0.17 -0.25 -0.33 -0.19 -0.15 -0.33 -0.28 -0.2 -0.38 -0.04 -0.46 0.12 0.1 -0.51 -0.61 0.18 -1.66 -4.81 -2.1 -0.2 -0.13 -1.55 1.88 1.58 1.69 -0.25 -0.29 -0.63 -0.68
-0.04 -0.05 -0.19 0.1 0.05 -0.02 -0.13 0.07 0.09 0.07 0.13 -0.02 -0.45 -0.36 0.9 -0.28 -0.44 -1.07 0.46 -1.12 -1.98 -2.67 -0.39 -0.46 -0.52 1.29 1.13 1.2 -0.37 -0.3 -0.37 -0.36
0.0 -0.05 0.04 0.15 0.27 0.25 0.35 0.39 0.25 0.11 0.06 -0.07 -0.13 0.14 0.89 -0.24 -0.26 -0.67 -0.19 -2.17 -1.91 -2.85 -0.39 -0.12 -0.19 0.45 0.94 0.73 -0.37 -0.3 -0.13 -0.07
0.13 -0.14 0.07 0.11 0.21 0.2 0.1 0.3 0.18 0.08 0.12 -0.06 -0.31 -0.12 0.88 -0.22 -0.41 -0.7 0.23 -3.11 -2.66 -1.76 -0.29 -0.15 0.18 0.61 0.89 0.8 -0.43 -0.36 -0.18 0.14
-0.45 -0.22 -0.18 -0.02 0.25 0.1 0.26 0.35 0.11 -0.01 -0.07 -0.27 -0.06 -0.03 0.84 -0.0 -0.62 -1.09 0.42 -0.28 -2.17 -1.78 -0.37 -0.23 0.0 0.73 1.14 1.15 -0.5 -0.44 -0.71 -0.64
-0.13 -0.12 -0.11 0.03 0.15 0.13 0.22 0.22 0.05 0.03 -0.01 -0.11 -0.13 -0.51 0.55 0.14 -0.46 -0.84 0.23 -2.54 -2.04 -3.16 -0.36 -0.18 0.23 1.12 1.1 1.03 -0.34 -0.28 -0.12 -0.27
-0.38 -0.32 -0.26 -0.03 -0.06 -0.24 -0.1 -0.18 -0.15 -0.14 -0.2 -0.36 0.43 0.51 0.46 0.42 -0.56 -1.42 0.26 -5.09 -7.35 -5.01 0.02 0.13 -3.3 1.93 1.25 1.48 -0.46 -0.31 -0.73 -1.27
0.16 0.11 0.02 0.29 0.37 0.18 0.15 0.33 0.18 0.23 0.17 0.07 -0.32 -0.6 -0.25 -0.21 -0.88 -1.49 -0.29 -2.28 -3.09 -1.64 -0.42 -0.37 -0.88 1.69 1.3 1.17 -0.68 -0.66 -0.31 -0.52
-0.11 -0.0 0.06 0.38 0.41 0.26 0.18 0.34 0.26 0.12 0.18 0.02 -0.28 0.08 0.8 -0.09 -0.42 -1.21 -0.13 -1.84 -1.93 -1.22 -0.31 -0.37 0.33 0.39 0.96 0.87 -0.52 -0.39 -0.6 -0.49
-0.11 -0.37 -0.33 -0.45 0.13 0.04 -0.15 0.28 0.03 -0.26 -0.2 -0.35 -0.25 -1.24 -0.41 0.05 -1.98 -2.35 -0.11 -3.46 -5.79 -2.91 -1.03 -1.07 -2.11 2.31 1.82 2.15 -0.83 -0.7 -0.87 -1.06
-0.53 -0.27 -0.29 -0.01 -0.06 -0.27 0.12 0.15 0.1 0.03 0.01 -0.08 -0.09 -0.24 0.17 0.11 -0.47 -0.96 0.51 -1.27 -3.97 -0.24 -0.51 -0.55 -5.63 1.68 1.06 1.41 -0.11 -0.05 -0.54 -0.46
-0.2 -0.19 -0.19 -0.05 0.17 0.07 0.26 0.51 0.36 0.4 0.27 0.14 -0.02 -0.56 0.0 -0.01 -0.99 -1.4 0.06 -2.43 -2.95 -3.21 -0.54 -0.29 -1.13 1.67 1.3 1.34 -0.53 -0.5 -0.79 -0.77
-0.08 -0.17 -0.27 0.06 0.01 0.16 0.11 0.38 0.28 0.2 -0.05 -0.13 -0.06 0.25 0.98 0.14 -0.46 -0.83 0.12 -1.09 -2.63 -3.32 -0.22 0.0 -1.07 1.18 0.97 0.92 -0.49 -0.44 -0.67 -0.58
-0.27 -0.27 -0.04 0.04 0.34 0.2 0.19 0.06 0.13 0.17 -0.0 -0.06 -0.58 -0.36 0.83 -0.26 -1.03 -2.47 -0.25 -3.1 - -1.53 -0.77 -0.54 -3.83 1.48 1.9 1.89 -0.9 -0.68 -1.45 -1.19
-0.14 0.14 0.21 0.57 0.71 0.75 0.46 0.53 0.17 0.01 -0.29 -0.4 -0.28 -0.21 0.33 -0.21 -0.47 -1.92 -0.24 -1.49 -2.14 -3.07 -0.41 -0.55 -0.82 1.1 1.33 1.29 -0.82 -0.72 -1.08 -1.25
0.0 0.02 0.02 0.07 0.3 -0.13 -0.11 0.18 0.18 -0.03 -0.11 -0.18 0.12 0.16 0.43 0.2 -0.51 -1.07 -0.09 -4.59 -1.49 -1.69 -0.13 0.14 -1.49 1.15 1.18 1.06 -0.52 -0.54 -0.05 -0.04
0.06 0.09 0.13 0.13 0.17 0.24 0.01 -0.04 -0.06 -0.0 -0.02 -0.1 -0.12 -0.41 0.4 -0.12 -0.72 -1.18 0.15 -1.03 -1.35 -0.74 -0.28 -0.1 -0.32 1.19 1.13 1.23 -0.58 -0.44 -0.73 -0.74
-0.11 0.09 -0.01 0.23 0.3 0.32 0.48 0.37 0.17 0.12 0.06 -0.1 -0.07 -0.72 0.11 0.16 -0.55 -1.03 0.04 -1.58 -2.25 -1.45 -0.4 -0.43 -0.56 0.91 1.22 1.34 -0.44 -0.35 -0.7 -0.84
-0.33 -0.28 -0.2 -0.02 -0.14 -0.07 0.05 0.02 -0.09 -0.1 -0.14 -0.27 -0.37 -0.29 0.45 -0.25 -0.63 -0.95 -0.17 -1.46 -2.03 -0.5 -0.59 -0.58 -1.28 1.87 1.54 1.62 -0.59 -0.56 -0.8 -0.97
0.11 -0.13 -0.08 -0.04 0.04 -0.02 -0.16 -0.06 0.17 0.24 0.21 -0.01 -0.25 -0.07 0.61 -0.29 -0.78 -3.35 -0.42 -1.15 -0.92 -0.5 -0.53 -0.35 -0.34 1.39 1.37 1.49 -0.81 -0.69 -0.95 -0.9
-0.19 0.1 0.38 0.42 0.53 0.49 -0.15 0.28 0.03 -0.03 0.06 0.0 0.34 -0.32 0.54 -0.04 -1.11 -1.19 -1.2 - -6.3 -6.08 -0.45 -0.28 -1.58 1.31 1.68 1.69 -1.28 -1.21 -1.31 -0.97
0.11 -0.06 -0.26 -0.03 -0.03 0.07 -0.02 0.14 0.09 0.17 0.15 0.13 0.2 -0.19 -0.26 0.29 -0.84 -1.07 0.04 -1.81 -2.56 -1.99 -0.57 -0.42 -0.72 1.64 1.33 1.31 -0.54 -0.54 -0.75 -0.53
-0.34 -0.15 -0.13 0.23 0.31 0.28 0.49 0.5 0.3 0.22 0.12 0.03 -0.05 -0.58 -0.53 0.14 -0.67 -2.91 -0.26 -1.51 -3.44 -1.83 -0.4 -0.25 -0.37 1.51 1.32 1.41 -0.53 -0.32 -0.87 -1.82
-0.53 -0.25 -0.15 -0.11 0.12 0.11 0.3 0.22 0.06 -0.14 -0.23 -0.42 -0.06 -0.41 1.0 -0.04 -0.9 -1.26 0.19 -1.71 -2.45 -1.11 -0.5 -0.2 -0.87 1.43 1.56 1.61 -0.71 -0.64 -1.38 -1.47
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-0.36 -0.35 -0.06 -0.16 0.16 0.1 0.33 0.13 0.12 0.01 -0.26 -0.4 -0.35 -0.47 0.63 -0.13 -0.52 -0.33 -0.05 -3.41 -1.85 -1.29 -0.44 -0.26 -1.51 1.44 1.61 1.55 -0.46 -0.48 -0.97 -0.85
-0.09 -0.18 -0.57 -0.08 0.04 0.48 0.45 0.21 0.25 -0.15 -0.1 -0.47 -0.38 -0.62 1.18 -0.08 -0.81 -0.69 0.42 -4.71 -1.24 -2.69 -0.69 -0.57 0.05 1.36 1.27 1.15 -0.84 -1.09 -0.26 -0.49
-0.26 -0.09 -0.23 -0.06 0.27 0.14 0.02 0.23 -0.11 -0.19 -0.26 -0.53 0.43 0.0 0.56 0.51 -0.74 -0.95 0.06 -1.84 -3.09 -2.59 -0.37 -0.36 0.37 0.99 1.43 1.38 -0.79 -0.64 -0.85 -0.46
-0.48 -0.36 0.05 -0.04 -0.04 -0.15 0.35 0.55 0.15 0.44 0.55 0.22 0.92 -1.14 -1.79 -0.73 -0.52 -0.08 -0.51 - -5.25 - 0.01 0.19 0.68 0.75 1.37 1.46 -0.34 -0.54 -1.11 -1.12
-0.82 -0.87 -0.47 -0.26 0.16 0.25 0.44 0.33 0.27 -0.13 -0.26 -0.68 -0.82 -1.69 -0.16 -0.7 -1.2 -1.46 -0.4 -2.11 -0.74 -0.09 -0.52 -0.48 -0.42 1.72 2.03 1.85 -0.95 -0.87 -1.39 -0.92
0.04 -0.22 0.02 0.09 0.17 0.21 0.21 0.24 0.14 0.12 0.12 -0.13 0.42 0.39 0.48 0.03 -0.66 -0.89 -0.08 -1.45 -3.9 -3.96 -0.28 -0.28 -0.75 1.08 1.3 1.15 -0.72 -0.67 -0.65 -0.65
-0.57 -0.42 -0.11 -0.07 0.1 -0.02 0.17 0.08 -0.18 -0.28 -0.43 -0.53 -0.2 -0.33 0.73 0.07 -0.82 -0.46 0.06 -1.69 -4.5 -1.05 -0.29 -0.11 -0.37 1.24 1.71 1.75 -0.89 -0.72 -1.0 -0.68
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0.16 0.12 0.08 0.16 0.22 0.1 0.11 0.21 0.17 0.16 0.15 0.1 -0.23 -0.4 -0.11 0.0 -0.51 -0.85 0.26 -2.82 -3.37 -4.17 -0.41 -0.36 -1.44 1.14 1.19 1.21 -0.3 -0.24 0.19 -0.08
-0.13 -0.14 -0.1 0.04 0.14 0.07 -0.06 0.08 -0.06 -0.19 -0.15 -0.29 -0.11 0.07 1.2 0.15 -0.57 -0.74 0.11 -1.94 -3.04 -1.72 -0.43 -0.35 -0.65 1.61 1.08 0.97 -0.52 -0.43 -0.71 -0.47
0.12 -0.06 -0.05 0.0 0.11 -0.08 0.03 0.21 0.21 0.15 0.09 0.04 -0.24 -0.28 0.42 -0.01 -0.39 -0.81 0.06 -1.41 -0.59 -2.34 -0.42 -0.37 -0.29 1.16 0.97 0.88 -0.35 -0.28 -0.28 0.01
0.06 -0.09 0.02 0.06 0.08 0.09 -0.01 0.2 0.01 -0.06 -0.04 -0.12 0.04 -0.11 0.34 0.27 -0.21 -0.59 0.27 -3.79 -3.57 -3.19 -0.17 -0.05 -0.32 1.08 1.02 1.04 -0.24 -0.13 -0.15 -0.19
-0.37 -0.37 -0.26 -0.08 0.12 -0.14 0.27 0.3 0.22 0.25 0.14 -0.15 -0.09 -0.41 -0.27 -0.03 -0.59 -1.5 0.04 -3.13 -6.24 -1.2 -0.24 -0.3 -4.58 1.73 1.54 1.55 -0.34 -0.32 -0.61 -0.53
0.23 -0.07 -0.2 -0.05 -0.05 -0.03 0.12 0.12 0.22 0.14 0.16 0.12 -0.48 -0.28 -0.02 -0.16 -0.63 -1.09 -0.0 -1.01 -1.97 -1.35 -0.37 -0.31 -0.31 1.29 1.25 1.25 -0.5 -0.36 -0.22 -0.28
-0.38 -0.16 -0.05 0.35 0.26 0.4 0.61 0.33 0.16 0.04 0.02 -0.15 -0.85 -0.38 0.94 -0.72 -0.33 -0.64 0.15 -2.83 -2.43 -1.6 -0.05 -0.02 -0.71 0.46 1.18 1.31 -0.33 -0.35 -0.53 -0.44
0.19 -0.07 0.19 0.13 0.18 0.32 -0.21 -0.01 -0.11 -0.2 -0.15 -0.39 -0.51 -0.18 1.19 0.03 -0.18 -0.36 0.61 -5.47 -5.58 -7.65 0.04 0.0 -1.95 1.06 1.09 1.23 -0.2 -0.1 -0.81 -0.7
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0.12 0.02 0.05 0.1 0.22 0.16 0.27 0.36 0.17 0.13 0.07 -0.11 -0.1 0.15 -0.32 0.11 -0.8 -1.65 -0.12 -1.0 -3.95 -4.03 -0.7 -0.61 -2.05 1.53 1.42 1.62 -0.67 -0.55 -1.02 -0.99
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.