Heatmap: Cluster_114 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.15 0.33 0.3 0.46 0.44 0.49 0.21 0.14 0.15 -0.03 0.03 0.08 -1.96 -0.91 -0.82 -1.51 0.49 -0.32 -0.55 -1.5 0.47 -1.44 -0.62 -0.95 1.01 -0.37 0.83 1.13 -0.01 0.01 -0.67 -0.74
0.18 0.44 0.42 0.47 0.11 0.34 0.42 -0.28 0.14 -0.1 -0.45 0.04 -3.28 -2.5 -3.15 -2.62 1.34 1.04 -0.51 -1.33 1.23 -0.9 -0.12 -0.79 0.25 -3.79 -1.66 -1.24 0.82 0.86 0.39 -0.08
0.23 0.18 0.36 0.37 0.38 0.48 0.41 0.4 0.35 0.16 0.31 0.34 -2.14 -1.95 -3.25 -1.86 0.51 0.27 -1.0 -1.15 0.77 -4.35 -0.08 -0.31 1.12 -0.83 0.11 0.22 0.25 0.15 -0.07 -0.54
0.19 0.08 -0.2 0.12 0.36 0.26 0.13 0.58 0.44 0.14 0.24 0.1 -1.03 -0.99 -0.47 -0.84 -0.06 -0.47 -0.12 -2.02 0.35 -0.88 -0.31 -0.41 0.47 0.39 0.72 0.73 0.03 0.11 -0.47 -0.44
0.33 0.17 0.28 -0.09 -0.05 -0.01 -0.14 0.07 0.1 0.26 0.51 0.25 0.43 -0.29 -1.23 0.24 -0.05 -1.15 0.19 -2.27 -1.68 -2.53 0.35 0.66 0.87 0.16 -1.03 -0.49 0.17 0.21 0.43 0.05
-0.13 -1.22 -0.36 -0.82 -0.71 -0.56 -0.28 0.31 0.17 -0.35 -0.06 -0.14 -1.78 -1.84 -1.68 -1.42 0.17 -1.15 -0.35 -0.36 1.21 -0.74 -0.48 -0.74 2.52 -0.35 1.17 0.9 -0.0 -0.41 -0.77 -0.8
-0.08 0.5 0.48 0.68 0.8 0.34 0.71 1.03 0.76 0.75 0.66 0.45 -1.34 -1.7 -2.82 -1.18 -0.92 -1.18 -1.25 -1.68 0.5 -2.57 -1.32 -1.47 1.28 -0.01 0.19 -0.17 -0.71 -0.75 -0.39 -0.2
0.19 0.23 0.04 0.28 0.2 0.36 0.64 0.49 0.63 0.52 0.42 0.4 -1.41 -1.23 -1.67 -1.07 -0.34 -0.78 -0.14 -0.26 0.51 0.11 -0.98 -1.25 0.7 0.32 0.3 0.36 -0.22 -0.17 -0.87 -0.8
0.06 0.16 0.11 0.19 0.14 0.36 0.2 0.12 0.11 -0.15 0.03 -0.11 -0.51 -1.17 -0.8 -0.45 0.14 -0.04 -0.07 -0.7 0.05 -0.02 0.04 -0.13 0.65 -0.41 0.62 0.66 -0.04 0.04 -0.35 -0.37
-0.19 -0.09 0.03 0.15 0.23 0.27 0.26 0.61 0.36 0.17 -0.11 -0.08 -0.66 -1.19 -0.28 0.03 -0.26 -0.44 0.02 -1.14 -0.89 -1.56 -0.14 -0.2 1.37 0.46 0.7 0.88 -0.05 -0.13 -1.11 -1.79
-0.25 -0.05 0.04 0.37 0.47 0.6 0.62 0.76 0.54 0.18 -0.17 -0.04 -1.13 -0.98 -0.63 -0.79 0.18 -0.59 -0.28 -1.47 -0.74 -0.8 -0.22 -0.3 0.75 -0.39 0.53 0.8 0.05 0.09 -0.14 -0.63
0.56 0.34 0.19 0.17 0.03 0.11 0.36 0.44 0.55 0.63 0.51 0.89 -1.81 -1.23 -1.32 -1.57 0.5 0.41 -0.94 -2.63 -0.01 -3.7 -0.14 -0.76 0.93 -1.5 0.03 0.23 0.48 0.32 -0.17 -0.9
0.27 -0.05 0.1 0.41 0.17 0.31 0.25 0.79 0.21 0.69 0.6 0.47 -2.55 -2.31 -0.94 -1.93 -0.09 -3.0 -0.01 -0.73 -1.56 -2.73 -0.25 -0.54 1.07 0.72 0.35 0.99 0.28 0.14 -0.35 -0.93
-0.03 -0.19 -0.11 -0.06 -0.12 0.06 0.04 0.22 0.16 0.01 -0.05 -0.17 -0.88 -0.47 -0.3 -0.75 -0.12 -0.58 -0.21 -0.44 0.53 -0.1 -0.56 -0.56 1.89 0.08 0.39 0.44 -0.09 -0.11 -0.69 -0.74
0.09 0.1 0.15 0.3 0.34 0.39 0.32 0.53 0.42 0.28 0.25 0.18 -1.12 -1.13 -1.33 -0.95 0.01 -0.46 -0.15 -2.2 0.22 -2.01 -0.32 -0.4 0.82 0.05 0.48 0.61 -0.03 0.01 0.01 -0.01
0.27 0.23 0.35 0.22 0.73 0.27 0.11 0.15 0.03 -0.24 -0.14 -0.03 -2.13 -1.84 -0.8 -1.53 0.31 0.29 -0.69 -0.57 0.17 -0.34 0.06 -0.02 1.23 -0.98 0.56 0.81 -0.07 0.14 -0.7 -0.97
0.11 0.15 0.33 0.17 0.39 0.35 0.68 0.86 0.79 0.76 0.75 0.52 -4.32 -2.65 -2.96 -2.85 -0.26 -0.66 -1.3 0.72 0.44 -1.27 -0.86 -1.54 0.3 -0.27 0.65 0.67 -0.32 -0.47 -0.41 -0.45
1.27 1.0 -0.26 0.52 -0.18 0.28 -0.69 0.67 -0.15 1.1 -0.64 1.65 - - -6.95 -6.41 -0.61 -1.64 -3.33 -1.39 1.5 - -1.72 -3.6 2.7 -1.09 -31.32 -1.28 -0.26 -0.81 -1.35 -1.63
0.16 0.0 0.17 0.1 -0.04 0.3 -0.02 0.12 -0.01 0.08 0.16 -0.11 -0.47 -0.96 -0.76 -0.26 -0.48 -0.82 -0.13 -0.61 0.94 0.4 -0.21 -0.09 1.48 0.07 -0.02 0.15 -0.37 -0.38 -0.81 -0.57
-0.25 0.32 0.5 0.51 0.54 0.48 0.5 0.08 0.06 0.18 0.04 -0.07 0.06 -1.74 -1.0 -0.5 0.03 -0.61 0.0 -1.23 -0.96 -3.05 0.17 -0.05 1.64 -0.4 0.28 0.43 -0.05 -0.12 -1.1 -1.21
-0.09 -0.2 0.22 0.08 0.28 0.44 0.3 0.52 0.41 0.28 0.16 -0.27 -2.89 -2.09 -0.42 -1.33 0.2 -0.57 0.18 -1.35 0.55 -0.12 -0.21 -0.47 1.03 -0.46 0.07 0.26 0.3 0.44 -0.12 -0.2
-0.06 0.01 0.0 0.12 0.06 0.26 0.1 0.24 0.12 -0.11 -0.1 -0.14 -1.07 -0.61 -0.85 -0.73 0.37 0.12 0.16 -2.37 0.38 -3.0 -0.47 -0.66 1.47 0.02 0.67 0.66 0.1 0.06 -0.18 -0.18
0.01 0.08 0.48 0.5 0.49 0.66 0.74 0.49 0.38 0.13 0.01 -0.06 -1.21 -1.03 -0.49 -1.01 0.38 -0.14 -0.53 -0.87 -0.49 -0.87 -0.36 -0.45 0.44 -0.26 0.42 0.6 0.02 -0.05 -0.35 -0.9
0.32 0.22 0.17 0.37 0.36 0.11 0.11 0.46 0.36 0.51 0.59 0.65 -3.4 -2.33 -1.99 -2.1 0.07 -0.19 -0.89 -1.83 -1.18 -3.78 -0.54 -0.75 1.44 0.18 0.84 0.58 0.04 -0.07 0.03 0.17
0.63 0.27 0.63 0.1 0.83 -0.41 -0.17 -0.19 -0.01 0.77 1.39 1.1 -1.6 -0.49 -1.24 -3.09 -4.32 -3.67 -1.5 -4.15 0.7 -1.19 -2.2 -2.31 2.38 1.66 -1.06 -0.14 -3.44 -2.0 -4.27 -2.79
-0.21 -0.7 -0.79 -0.87 -0.81 -0.37 -0.03 0.08 0.36 0.33 0.33 0.57 -0.98 -1.6 -1.83 -0.99 -0.55 -0.62 0.04 -0.73 1.08 -0.27 -0.78 -0.55 1.85 -0.06 -0.17 -0.21 0.16 0.2 0.96 0.5
0.37 0.2 0.2 0.32 0.37 0.53 0.59 0.8 0.76 0.76 0.78 0.66 -2.64 -2.62 -2.72 -2.24 0.09 -0.46 -1.76 -1.0 1.02 -1.83 -1.0 -1.25 0.74 -1.16 0.28 0.48 -0.05 -0.09 -0.34 -0.81
-0.12 -0.02 -0.14 0.15 0.33 0.35 0.55 0.47 0.57 0.22 0.1 0.05 -2.42 -2.21 -1.98 -1.45 0.52 0.39 -0.76 -0.89 0.44 -0.56 -0.29 -0.73 1.01 -0.58 0.34 0.28 0.32 0.24 0.2 -0.22
-0.37 0.05 -0.02 0.23 0.41 0.59 0.12 0.4 -0.21 -0.36 -0.52 -0.45 -0.45 -0.43 -0.13 0.04 -0.34 -0.72 0.35 -0.09 -1.65 -2.61 -0.3 -0.21 1.55 0.45 0.78 0.84 -0.43 -0.47 -0.58 -0.73
0.23 0.03 0.1 0.17 0.31 0.46 0.22 0.54 0.51 0.5 0.48 0.17 -1.3 -1.18 -1.04 -0.99 -0.21 -0.48 -0.65 -0.92 -0.77 -0.77 0.23 0.1 0.51 -0.23 0.67 0.82 -0.08 0.06 -0.65 -0.41
-0.02 0.03 -0.05 0.25 0.47 0.25 0.18 0.47 0.41 0.26 0.08 0.01 -0.31 -0.76 -0.36 0.0 -0.52 -1.6 -0.04 -1.93 -0.45 0.22 -0.33 -0.28 1.04 0.75 0.31 0.3 -0.31 -0.32 -0.55 -0.53
0.14 0.42 0.41 0.44 0.47 0.4 0.35 0.18 -0.01 -0.31 -0.28 -0.02 -1.56 -0.63 -2.59 -0.92 0.05 -0.09 -0.06 -1.37 -0.64 -2.76 -1.06 -1.49 0.53 -0.52 1.05 1.12 0.21 0.12 0.71 0.33
-0.24 -0.25 -0.02 -0.07 0.06 0.1 0.3 0.32 0.25 0.06 0.0 -0.08 -0.79 -0.5 -1.35 -0.42 0.04 0.05 -0.07 -0.85 0.68 -1.21 -0.68 -0.93 0.88 0.06 0.74 0.6 0.08 0.16 0.1 0.14
0.74 1.05 1.11 0.87 0.65 0.28 0.03 -1.03 -0.9 -1.0 -0.34 0.34 -5.74 -2.23 -4.09 -2.82 0.96 0.37 -1.27 -1.75 1.9 -2.22 0.15 -0.3 -0.29 -2.76 -1.16 -0.75 0.32 0.28 0.08 0.14
-0.24 0.22 0.18 0.36 0.54 0.35 0.02 0.02 -0.33 -0.66 -0.72 -0.78 -1.65 -2.41 -3.16 -1.1 0.34 -0.22 -0.16 -2.26 -0.21 -2.97 0.22 0.05 2.0 0.4 1.19 1.24 -0.26 -0.27 -0.86 -0.96
0.37 0.2 0.2 0.32 0.37 0.53 0.59 0.8 0.76 0.76 0.78 0.66 -2.64 -2.62 -2.72 -2.24 0.09 -0.46 -1.76 -1.0 1.02 -1.83 -1.0 -1.25 0.74 -1.16 0.28 0.48 -0.05 -0.09 -0.34 -0.81
0.15 0.1 0.27 0.28 0.33 0.6 0.56 0.67 0.74 0.61 0.48 0.46 -2.53 -2.04 -1.98 -1.92 -0.39 -0.27 -0.7 -0.62 0.66 -1.39 -0.69 -1.03 0.8 -0.48 0.57 0.62 -0.16 -0.16 -0.48 -0.41
-0.22 -0.13 0.13 0.05 0.39 0.41 0.39 0.57 0.5 0.29 0.22 -0.08 -0.68 -0.88 -0.14 -0.7 -0.31 -1.17 0.19 -0.84 -0.86 -1.74 0.1 0.24 0.79 0.37 0.47 0.45 -0.02 0.07 -0.82 -0.32
0.42 0.41 0.22 0.25 0.37 0.39 0.77 0.91 0.52 0.18 0.29 0.18 -8.52 -7.61 -7.17 -4.63 -0.08 -0.64 -0.23 -0.91 0.68 -1.44 -0.7 -1.31 1.71 0.0 0.58 0.22 -0.29 -0.34 -0.49 -0.81
-0.12 -0.09 -0.04 0.12 0.31 0.38 0.35 0.43 0.42 0.26 0.18 -0.0 -1.36 -0.54 -0.99 -0.73 -0.02 -0.53 -0.0 -0.43 -0.13 -0.69 -0.54 -0.54 1.15 0.08 0.24 0.13 -0.0 -0.01 0.28 -0.02
0.52 0.45 0.29 0.26 0.31 0.04 0.14 0.34 0.52 0.44 0.48 0.7 -4.22 -1.53 -2.07 -1.14 -0.03 -0.79 0.38 -1.19 0.44 -1.97 -1.27 -1.38 0.86 0.48 0.15 0.24 0.15 0.16 -0.07 -0.23
-0.19 0.32 0.13 0.08 -0.12 -0.15 0.43 0.78 0.77 1.14 1.13 1.08 -7.76 -1.99 -2.82 -2.92 -0.72 -0.6 -1.22 -3.71 -1.49 -1.4 -0.96 -1.57 1.91 0.19 0.68 0.59 -0.41 -0.71 -0.52 -0.53
-0.56 0.44 0.68 0.62 0.64 0.1 0.07 0.35 0.09 0.26 -0.29 -0.48 -0.93 -1.41 -6.78 -0.95 -0.93 -2.33 -0.71 -2.15 -0.88 - -1.07 -1.44 2.34 1.21 1.36 0.94 -0.65 -0.72 -1.39 -2.34
0.09 0.34 0.3 0.03 0.31 0.21 0.11 0.1 0.02 -0.04 -0.03 -0.16 -0.66 -0.22 -0.02 -0.49 0.17 -0.13 0.25 -1.08 -0.42 -0.87 -0.37 -0.28 0.16 -0.02 0.64 0.6 -0.01 0.1 -0.1 0.04
0.16 0.12 0.29 0.33 0.32 0.38 0.38 0.2 0.42 0.27 0.19 0.27 -1.25 -0.84 -1.7 -1.34 0.59 -0.06 -0.39 -1.77 -0.31 -2.19 -0.23 -0.38 1.09 -0.21 0.39 0.61 0.27 0.18 -0.38 -0.63
0.45 0.33 0.42 0.47 0.51 0.62 0.71 0.6 0.57 0.36 0.43 0.52 -3.36 -2.87 -4.0 -2.6 0.63 -0.11 -1.06 -1.7 0.09 -4.07 -0.7 -1.46 1.15 -1.51 0.21 0.52 0.22 0.12 0.02 -0.42
0.79 0.58 0.36 0.36 0.33 0.17 0.38 0.88 0.82 0.94 0.86 1.06 -4.24 -3.05 -5.55 -2.92 -0.29 -0.78 -0.6 -1.21 0.62 -2.38 -0.84 -1.49 1.16 -0.44 -0.25 -0.19 0.05 -0.09 -0.88 -1.24
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0.47 0.61 0.44 0.27 0.11 0.0 0.4 0.61 0.65 0.79 0.75 0.91 -3.89 -2.42 -3.28 -1.98 -0.38 -1.12 -0.72 -3.46 -0.58 -5.61 -0.3 -0.41 1.14 -0.58 -0.32 -0.41 0.18 0.01 0.66 0.85
-0.07 -0.21 -0.19 0.05 -0.02 -0.01 -0.13 0.19 0.08 0.25 0.22 0.14 0.2 -0.81 -0.77 0.3 -0.54 -1.09 -0.08 -0.78 -0.42 0.44 -0.17 -0.01 0.96 0.72 0.1 -0.1 -0.35 -0.49 0.17 0.37
0.34 0.37 0.49 0.52 0.6 0.42 0.48 0.01 0.25 0.02 0.25 0.19 -1.93 -1.83 -2.41 -1.37 0.56 0.23 -0.59 -1.46 -0.02 -2.05 -0.27 -0.88 0.92 -0.37 0.64 0.58 0.25 0.12 -0.46 -0.53
-0.25 -0.14 -0.2 -0.09 -0.06 0.35 0.43 0.48 0.21 -0.04 -0.05 -0.09 -1.81 -0.77 -0.99 -1.32 -0.21 -0.91 -0.13 -1.76 1.23 -3.3 -0.88 -0.98 1.38 0.21 1.13 1.0 -0.09 -0.13 -0.16 -0.21
0.52 0.29 0.16 0.29 0.18 0.24 0.37 0.66 0.62 0.64 0.53 0.64 -3.04 -2.45 -2.78 -1.83 0.18 -0.48 -0.7 -2.51 -0.59 -2.25 -0.69 -1.11 1.49 -0.01 0.56 0.62 0.27 0.11 -0.29 -1.04
-0.14 0.18 0.45 0.7 0.81 0.62 0.77 0.76 0.57 0.67 0.54 0.32 -0.31 -0.51 -1.78 -0.58 -1.07 -1.12 -0.64 -0.17 0.46 -1.59 -0.78 -0.77 1.14 0.32 -0.4 -0.52 -1.03 -1.15 -1.46 -1.08
0.56 0.6 0.44 0.27 0.18 0.18 0.03 0.18 0.19 0.29 0.32 0.45 -0.43 -0.42 -1.24 -0.53 -0.07 -0.08 -0.26 -1.04 0.24 -1.11 -0.16 -0.36 1.15 -0.81 -0.29 -0.1 0.03 0.16 -0.61 -0.84
-0.53 0.02 -0.14 0.1 0.0 0.22 0.86 0.92 0.99 0.91 0.77 0.53 -5.16 -3.27 -3.04 -3.39 0.46 -0.49 -1.55 -0.97 0.24 -2.03 -0.64 -1.66 1.53 -2.54 0.1 0.07 0.29 0.1 0.23 0.16
-0.18 -0.08 0.01 0.35 0.43 0.29 0.17 0.54 0.4 0.35 0.33 0.23 -1.15 -1.14 -1.31 -0.74 0.03 -1.21 -0.2 -0.62 0.45 -0.6 -0.22 -0.48 0.78 0.67 0.46 0.38 -0.07 -0.22 -0.41 -0.6
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0.47 0.27 0.19 0.38 0.47 0.38 0.29 0.64 0.49 0.46 0.3 0.38 -1.67 -1.26 -1.39 -1.03 0.12 -2.24 -0.06 -3.43 -0.35 -1.72 -0.07 -0.28 0.88 -0.01 0.25 0.32 0.19 0.17 -0.06 -0.19
-0.26 -0.18 -0.2 -0.03 0.27 0.24 0.13 0.15 0.14 -0.08 -0.12 -0.14 -0.63 -0.7 -1.03 -0.31 0.04 -0.28 0.35 0.32 0.42 -0.99 -0.25 -0.43 1.02 0.47 0.12 0.22 0.18 0.24 -0.17 -0.47
0.15 -0.06 -0.19 -0.08 0.03 -0.06 0.05 0.11 0.27 0.32 0.35 0.38 -0.73 -1.54 -2.14 -0.55 0.21 -0.97 -0.46 -1.67 0.85 -1.98 -0.43 -0.76 1.95 0.33 -0.32 -0.09 0.24 0.18 0.06 -0.3
0.4 0.26 0.18 0.09 0.13 -0.17 -0.09 -0.1 -0.1 0.02 0.23 0.39 -2.54 -2.48 -2.97 -2.14 0.38 -1.1 -0.77 -1.05 1.33 -2.53 -0.32 -0.84 1.11 0.32 0.75 0.8 0.42 0.27 0.02 0.04
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0.26 0.08 0.17 0.02 0.08 0.22 0.28 0.09 0.29 0.15 0.22 0.23 -2.36 -1.06 -2.43 -1.75 0.58 0.28 -0.36 -0.01 0.93 -3.7 -0.46 -0.75 1.28 -0.45 -0.01 0.05 0.27 0.3 -0.1 -0.12
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1.0 0.64 -0.15 0.01 -0.03 -0.78 -0.54 -0.04 -1.03 0.34 0.35 0.56 -1.41 0.45 -2.15 -1.19 -0.89 -0.2 -0.29 - - - -0.31 -0.75 2.72 1.41 -0.81 -1.1 -0.29 -1.07 -0.57 -0.94
0.77 1.03 0.7 0.18 -0.16 -0.14 -0.29 0.02 -0.08 -0.04 0.04 0.3 -8.2 -2.44 -7.93 -4.23 0.3 0.8 -0.97 -1.75 0.38 -5.02 -0.75 -1.8 1.9 -2.24 0.77 0.79 -0.06 -0.1 0.43 -0.31
0.04 -0.14 -0.17 -0.0 0.12 0.16 0.32 0.25 0.38 0.15 0.31 0.13 -2.32 -1.63 -1.03 -1.74 0.34 -0.16 -0.39 -1.95 0.8 -2.62 -0.06 -0.35 1.27 -0.43 0.54 0.77 0.36 0.45 -0.17 -0.36

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.