Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.02 -1.58 -1.69 -0.05 -0.43 -0.54 0.74 0.9 0.57 0.72 -0.45 0.38 -1.66 -2.85 -1.36 -0.53 0.17 0.14 -0.09 - - - 0.06 -0.42 - 0.36 0.74 1.03 0.29 0.9 1.28 1.17
-0.72 -0.28 0.13 0.23 0.23 0.77 1.13 0.86 0.96 1.08 0.58 0.25 -1.36 -0.37 -0.21 -0.95 -0.32 -0.49 -0.6 - -7.48 -2.13 -0.8 -1.24 -3.52 -2.02 -0.38 -0.43 0.26 0.28 1.4 0.88
-0.87 -0.51 -0.19 0.02 0.1 0.43 0.87 0.81 0.84 0.85 0.29 -0.08 -1.34 -0.44 -0.15 -0.9 -0.14 -0.49 -0.37 -4.4 -1.78 -3.23 -0.64 -1.46 -0.51 -2.36 -0.27 -0.61 0.48 0.41 1.75 1.15
-0.74 -0.41 -0.2 0.11 0.24 0.33 0.89 0.71 0.77 0.66 0.19 -0.04 -1.02 -0.27 -0.23 -0.69 -0.13 -0.05 -0.3 -4.75 -2.77 -0.77 -0.6 -1.09 -2.26 -2.15 -1.24 -1.15 0.68 0.54 1.72 1.21
-0.36 -0.12 -0.58 -0.33 0.48 -0.07 0.29 -0.74 0.36 0.52 0.51 0.47 0.22 0.19 -2.59 0.86 -0.54 0.62 1.63 - -1.85 - 0.34 0.32 -2.5 -1.98 -1.3 -2.33 0.55 0.54 0.69 0.25
-0.11 -0.66 -0.46 -0.38 -0.14 0.1 0.78 0.97 0.85 1.02 0.74 0.68 -1.62 -2.49 -1.6 -1.25 -0.38 -0.67 -0.48 -1.28 -0.22 -3.73 -0.76 -0.76 -0.41 0.62 0.11 0.08 0.1 -0.05 0.96 0.9
-0.26 -0.17 -0.15 -0.14 0.09 0.52 0.79 0.65 0.58 0.5 0.04 0.05 -2.36 -0.91 -0.0 -0.92 0.16 -0.05 1.0 -2.32 -2.42 -6.98 -0.2 -0.17 -1.97 0.67 0.26 0.27 0.22 0.47 0.28 0.27
0.28 -0.42 -0.21 -0.13 0.08 0.32 0.21 0.42 0.5 0.38 0.51 0.01 -0.64 -0.81 -0.12 -0.19 0.19 0.22 0.15 -2.62 -1.03 -4.02 0.4 0.58 -2.26 -0.65 -0.38 -0.55 0.26 0.44 0.83 0.79
-0.15 0.03 0.05 -0.13 -0.22 -0.53 0.18 1.03 0.91 0.7 0.8 0.48 0.23 -1.78 -0.74 0.44 -0.67 -0.12 0.26 - - - -0.23 -0.08 -5.75 0.39 -0.94 -0.82 0.76 0.52 0.6 0.81
-0.6 0.23 0.07 -0.13 -1.21 -1.19 0.13 0.8 0.98 1.62 1.51 1.99 -0.08 1.33 0.38 1.07 -3.31 -1.63 -1.57 - - - -3.19 -2.43 -2.7 1.13 -1.25 -0.63 -1.31 -1.52 -1.86 -2.01
-0.05 -0.15 -0.33 0.06 -0.02 -0.07 -0.05 0.16 -0.18 -0.03 -0.08 0.18 -0.58 -1.54 -2.41 -0.19 0.46 0.27 0.42 -1.76 -1.25 -2.78 0.02 -0.2 0.43 -0.34 -0.15 -0.15 0.98 0.78 1.33 0.54
-0.05 0.01 0.07 -0.3 -1.12 -1.29 -0.09 0.38 0.36 1.33 1.31 1.66 0.17 0.61 -0.88 1.88 -2.07 -2.49 -0.5 -6.18 -2.67 -2.96 -2.08 -0.9 -0.19 0.8 -0.61 -0.4 -0.62 -0.82 -0.41 -0.89
-0.52 -0.55 -3.09 -2.55 -1.69 0.27 0.27 1.44 0.57 0.17 -0.4 -0.13 -1.0 -2.89 0.48 -0.08 -0.3 0.83 -0.13 - - - 0.03 -1.15 -0.85 -0.63 0.84 0.89 0.44 0.71 1.39 1.14
-0.21 -0.98 -0.19 -0.45 0.03 -0.26 1.03 0.94 1.05 1.01 0.31 0.28 -2.31 -2.24 -1.15 -1.93 0.36 -0.53 -0.49 -6.02 -0.63 - -0.6 -0.91 -3.59 -0.27 0.33 0.62 0.53 0.27 1.39 1.02
-0.38 -2.59 -1.3 -0.88 -0.05 0.57 0.95 0.66 0.38 0.04 0.62 0.38 -1.81 -3.76 -0.69 -0.53 0.3 0.69 0.35 - -0.95 - 0.0 -0.55 -2.25 -0.76 0.05 0.36 0.93 0.79 1.18 0.98
0.7 -0.74 -1.21 -1.54 -0.87 -0.07 -0.25 -0.63 -0.26 0.0 -0.39 0.27 -1.78 - -1.53 -1.28 0.31 1.52 0.44 - - - -0.19 -0.86 -1.49 -2.49 0.53 -0.32 1.49 1.12 1.97 1.36
0.51 0.34 0.27 0.28 0.06 0.43 0.1 0.1 0.41 0.44 0.4 0.33 -0.82 -0.53 -0.81 -0.22 -0.25 0.21 -0.26 -1.47 -0.94 -0.6 0.22 0.13 -3.48 -0.83 0.04 -0.08 0.19 0.07 0.62 0.51
0.22 -0.18 -0.23 -0.08 0.26 0.46 0.32 0.47 0.3 0.38 0.37 0.09 -2.42 -2.78 0.07 -1.17 0.51 -0.61 0.55 -3.83 - -5.74 -0.19 -0.09 -2.14 0.87 0.47 0.74 0.66 0.7 0.31 0.3
0.25 0.25 0.14 0.29 0.15 0.18 0.32 0.33 0.4 0.76 0.65 0.32 -0.91 1.02 -0.08 -0.24 0.05 -0.22 0.24 -5.81 -1.89 -4.43 -0.83 -1.0 -1.24 0.15 0.32 0.28 0.11 0.24 -0.45 -0.15
0.13 -0.09 -0.23 -0.28 -0.44 -0.56 0.01 0.88 1.0 1.21 1.02 0.85 -1.26 0.29 -2.82 -0.82 -0.78 -1.06 0.29 -5.83 -3.62 - -1.3 -1.46 -4.96 0.08 -1.18 -1.46 1.39 1.53 0.54 0.62
-0.66 -0.15 0.23 -0.3 -0.26 -0.23 0.26 0.78 0.74 1.04 0.69 0.5 -2.06 -0.38 -4.58 -0.63 -0.32 -1.28 0.7 -5.04 -2.28 - -1.21 -1.39 -2.72 -0.46 -0.45 -0.77 1.68 1.75 0.48 0.5
0.64 0.01 -0.32 -0.4 -0.48 -0.4 -0.38 0.35 0.68 0.87 0.79 0.81 -2.07 -2.86 -8.86 -2.13 -0.01 -0.82 0.38 -3.63 -1.51 -6.55 0.42 0.51 -0.56 0.75 -0.15 0.09 0.66 0.76 0.5 0.8
0.2 -0.82 -0.68 -0.59 0.13 0.25 0.96 0.96 0.68 1.09 0.61 0.34 -1.58 -2.7 -0.7 -0.75 -0.18 0.25 -0.2 -3.38 0.13 -2.0 -0.6 -0.44 -2.65 -1.13 -1.1 -1.55 0.44 0.41 1.31 1.17
0.24 -0.02 -0.05 -0.23 -0.21 -0.24 -0.06 0.32 0.55 0.69 0.77 0.48 -1.09 -1.82 -2.5 -0.17 -0.53 0.56 0.87 -0.94 -1.14 -1.54 -0.0 -0.01 -1.89 0.32 -0.22 -0.02 0.06 0.09 0.53 0.93
-0.2 -0.81 -0.69 -0.82 -0.56 -0.75 -0.08 0.22 0.41 0.61 0.91 0.5 -1.78 -3.74 -5.46 -1.14 0.78 0.52 -0.5 -3.82 -2.86 -7.71 0.22 -0.12 -0.85 -1.58 -1.43 -1.22 1.29 1.04 1.73 1.73
0.16 0.24 0.16 0.12 -0.08 0.18 0.38 0.71 0.41 0.56 0.57 0.29 -1.17 -0.5 -2.64 -0.15 -0.18 0.39 0.41 -2.31 -1.99 -5.12 -0.21 -0.3 -0.6 -1.0 -0.45 -0.61 0.53 0.41 0.98 0.84
0.92 0.38 0.51 0.26 0.72 0.53 0.23 0.16 0.37 0.15 0.5 0.0 -0.37 -1.43 -2.45 -0.03 0.06 0.15 0.46 -5.97 - -0.98 0.09 0.14 -5.11 -1.21 -0.76 -0.12 0.81 0.81 0.12 -0.14
1.16 0.35 0.37 0.13 0.49 0.33 -0.76 0.11 0.51 0.42 0.53 0.18 -0.67 -2.8 -3.73 -0.96 0.32 0.22 0.73 - -5.62 - 0.2 -0.13 -3.99 0.08 0.05 0.32 0.85 0.73 -0.12 0.18
0.63 -1.7 -1.74 -0.4 -1.37 -0.64 0.65 1.16 0.02 0.12 -0.95 -0.07 -0.28 -3.89 -0.44 -0.09 0.43 1.08 0.87 - - - 0.58 0.42 - -1.55 -1.45 -1.43 1.06 0.97 1.47 1.08
0.15 -0.93 0.24 -0.05 -0.19 0.05 0.61 0.23 0.95 0.69 0.78 0.66 -4.91 -1.95 -1.82 -2.7 -0.54 -2.82 -0.25 -2.72 -1.79 - 0.58 -0.47 0.67 -0.5 -0.49 -0.54 1.67 1.68 -0.1 -0.59
-0.15 -0.02 0.19 0.11 0.01 -0.01 0.42 0.37 0.71 0.56 0.46 0.29 -1.87 -1.08 -2.03 -1.4 0.48 0.41 0.41 -2.39 -1.91 -1.35 0.6 0.23 -1.79 -0.74 -0.49 -0.5 0.53 0.63 0.56 0.86
0.35 0.56 0.34 0.17 0.08 -0.13 -0.08 -0.23 0.06 0.02 0.18 0.13 -1.53 -1.3 -0.52 -0.43 0.64 0.28 -0.35 -0.9 -1.98 -2.13 -0.44 -1.16 -0.56 0.54 0.43 0.72 0.36 0.54 0.44 0.73
0.21 -0.01 -0.18 0.05 0.04 0.14 0.55 0.41 0.57 0.65 0.63 0.62 -1.06 -0.56 0.09 -0.54 0.21 0.04 0.52 -3.6 -1.19 -3.05 -0.23 -0.51 -0.73 -0.79 -0.34 -0.51 0.34 0.2 0.53 0.69
-0.14 -0.3 0.06 0.03 0.28 -0.04 0.25 0.62 0.51 0.24 0.29 -0.07 -0.33 -1.79 -2.0 0.41 0.13 0.34 0.24 -2.87 -2.64 -1.78 0.13 0.02 -0.81 0.5 -0.73 -0.73 0.59 0.39 0.79 0.92
-0.47 -0.65 -0.46 -0.7 -1.29 -0.52 0.4 0.05 0.63 1.02 0.71 0.2 -2.67 -1.47 -0.35 -1.77 -0.39 -0.39 -0.01 - 0.14 -1.29 0.41 -0.33 -0.4 -0.31 -0.23 -0.06 1.73 1.74 0.01 -0.54
0.97 -3.35 - -1.9 0.2 -0.19 -0.92 -1.58 -1.06 -3.3 0.06 -0.8 -0.44 -0.01 -3.74 0.1 -0.59 -2.38 1.77 - 0.93 - -0.64 0.61 -1.33 -1.05 -1.9 - 1.2 1.66 1.91 1.58
0.56 0.24 0.55 0.26 0.65 0.0 -0.34 -0.67 -0.49 -0.94 -0.66 -0.72 -2.56 -2.56 -3.02 -0.71 0.52 1.44 0.33 - - - 1.1 0.65 - -2.43 -0.85 -1.56 0.96 1.02 1.44 1.17
-0.14 -1.33 -0.98 -0.06 -1.11 -1.65 -1.06 -0.81 0.36 -0.21 -0.68 0.38 -0.75 -3.69 - -1.09 0.92 0.26 0.98 - -0.17 -2.92 0.61 1.14 0.72 -1.1 -2.25 - 1.54 1.32 1.31 1.11
0.17 0.02 0.3 -0.08 0.22 0.01 -0.04 -0.26 0.33 -0.07 -0.03 -0.24 0.04 -0.4 0.37 0.42 0.78 0.54 0.18 -1.92 -2.05 -2.47 0.28 0.26 -0.97 -0.41 -0.42 -0.4 0.32 0.41 0.28 0.37
0.36 -0.16 -0.15 -0.39 -0.96 -1.27 0.36 0.75 0.7 1.26 1.37 1.39 -0.11 -0.73 -3.74 -0.18 -1.1 -0.41 0.21 -6.85 -5.61 - -0.65 -0.81 -5.28 -0.07 -2.21 -2.78 0.76 1.05 0.8 1.06
-0.28 -0.38 0.01 -0.01 0.22 0.03 0.18 0.21 -0.09 -0.18 -0.32 -0.04 -0.63 -1.21 -1.05 -0.45 0.63 0.38 0.22 -2.97 -1.62 -3.76 0.22 0.13 -0.19 -0.47 -0.05 -0.14 1.01 0.75 1.05 1.03
0.31 0.12 -0.08 -0.29 0.0 0.38 0.12 0.34 0.02 -0.02 -0.0 -0.11 -0.15 -0.96 -0.47 0.31 0.01 0.14 0.54 -6.71 -1.22 -6.21 -0.11 -0.25 -0.25 0.83 0.22 0.64 -0.0 -0.09 0.5 0.56
0.29 -0.38 -0.58 -0.16 -0.19 0.11 -0.5 0.0 0.51 0.79 0.81 0.53 0.36 -0.53 -1.1 0.52 -0.67 0.52 0.9 -2.83 -1.5 -2.31 0.27 0.27 -2.62 -0.15 0.03 -0.1 0.19 0.25 -0.18 0.36
0.29 -0.39 0.43 -0.04 0.87 0.27 -0.09 -0.22 -0.15 -0.89 0.05 -0.67 -0.43 -1.03 -0.76 -0.27 1.21 1.63 -0.07 - - - 0.32 -0.29 - -3.46 -1.9 -1.29 1.05 0.99 0.89 1.0
0.67 0.11 0.17 -0.13 -0.54 -0.45 -0.21 -0.11 -0.09 0.47 0.37 0.59 -2.19 -3.61 -2.98 -0.56 0.71 0.68 0.65 - - - 0.23 0.19 - -2.35 -1.99 -1.01 1.21 1.07 1.39 1.46
0.23 -0.03 0.26 -0.08 -0.15 -0.18 -0.03 0.34 0.43 0.58 0.78 0.64 -0.19 -0.68 -2.76 0.3 0.32 0.15 0.96 -2.27 -2.12 -2.25 0.1 -0.13 -0.98 0.51 -0.25 -0.53 -0.1 -0.07 -0.19 0.57
0.35 0.34 0.27 0.29 0.89 0.63 -0.14 0.15 0.62 0.59 0.3 0.33 -0.21 -1.29 -2.28 0.18 -0.14 0.35 0.81 - -2.91 - -0.18 0.02 -1.92 -1.24 -0.36 -1.65 0.66 1.1 0.13 -0.16
0.43 -1.1 -1.32 -0.72 -2.42 0.88 -2.62 0.92 0.48 0.14 -0.32 0.96 -0.11 - -0.87 -0.61 0.75 0.68 0.77 - -1.14 0.08 -0.81 -0.85 0.58 0.15 - -0.24 1.17 1.16 -1.16 0.78
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-0.17 -0.33 -0.52 -0.5 -0.61 -0.15 0.38 0.49 0.59 0.59 0.52 0.24 -1.3 -2.1 -1.14 -0.27 0.23 -0.37 0.56 -2.3 -1.59 -1.79 0.35 0.29 -2.18 0.38 0.1 -0.69 0.69 0.58 0.87 1.15
1.21 0.27 0.19 0.02 0.11 -0.09 -0.43 -0.51 0.36 0.37 0.61 0.71 -0.94 -3.84 -5.95 -0.8 0.64 0.71 0.41 -1.6 -1.48 -4.05 0.79 0.4 -0.15 -0.74 -0.9 -0.11 0.44 0.49 -0.01 -0.14
-0.31 -0.05 -0.27 0.02 0.25 -0.12 0.48 0.05 0.54 0.25 0.41 0.33 -2.3 -1.15 0.11 -1.78 0.62 0.27 0.49 - -5.75 -7.09 0.38 0.11 -2.1 0.57 0.43 0.17 0.51 0.53 0.29 0.81
0.09 -0.26 0.02 -0.0 -0.03 -0.09 -0.01 0.04 0.56 0.33 0.38 0.05 -0.56 -1.0 0.0 0.53 0.32 -0.26 0.11 -4.81 -1.61 -3.15 -0.02 0.08 0.15 -0.24 -0.2 -0.51 0.5 0.54 0.72 0.8
0.06 -0.45 -0.48 -0.19 -0.46 -0.55 0.37 0.6 0.97 1.18 1.23 1.16 -1.89 -2.37 -4.75 -1.62 0.27 -1.03 -0.72 -10.89 -5.23 -6.29 -0.28 -0.74 -4.77 0.01 -0.22 -0.37 0.76 0.66 1.34 1.33

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.