Heatmap: Cluster_190 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.36 0.26 0.28 0.27 0.32 0.27 0.29 0.37 0.48 0.44 0.49 0.46 0.68 0.98 0.39 1.0 0.2 0.21 0.77 0.3 0.82 0.15 0.19 0.24 0.71 0.66 0.4 0.27 0.37 0.36 0.78 0.86
0.29 0.3 0.31 0.33 0.42 0.49 0.31 0.38 0.21 0.24 0.21 0.2 0.36 1.0 0.34 0.56 0.42 0.42 0.59 0.26 0.73 0.27 0.5 0.56 0.46 0.51 0.83 0.69 0.41 0.4 0.17 0.18
0.0 0.3 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 1.0 0.7 0.63 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.48 0.51 0.42 0.43 0.53 0.51 0.51 0.53 0.58 0.62 0.52 0.48 0.57 0.98 0.59 1.0 0.29 0.48 0.87 0.18 0.8 0.92 0.47 0.51 0.78 0.41 0.46 0.43 0.48 0.42 0.57 0.57
0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.32 0.08 0.2 0.11 0.03 0.1 0.29 0.43 0.47 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.74 1.0 0.17 0.07 0.02 0.03 0.06 0.0
0.12 0.2 0.24 0.19 0.2 0.17 0.17 0.13 0.11 0.15 0.12 0.1 0.77 0.19 0.02 0.51 0.2 0.2 0.34 0.08 0.89 0.04 0.27 0.32 1.0 0.07 0.1 0.13 0.13 0.13 0.1 0.12
0.43 0.36 0.27 0.33 0.31 0.29 0.3 0.46 0.47 0.52 0.47 0.57 0.53 1.0 0.51 0.69 0.43 0.36 0.67 0.17 0.18 0.04 0.38 0.45 0.35 0.93 0.49 0.46 0.59 0.59 0.54 0.58
0.42 0.36 0.34 0.36 0.35 0.35 0.3 0.36 0.31 0.28 0.3 0.35 0.34 1.0 0.39 0.53 0.25 0.53 0.7 0.35 0.61 0.05 0.35 0.46 0.48 0.77 0.62 0.45 0.37 0.41 0.42 0.56
0.32 0.26 0.3 0.32 0.34 0.35 0.32 0.43 0.38 0.4 0.34 0.31 0.57 0.54 0.53 0.58 0.3 0.33 0.52 0.15 0.73 0.34 0.41 0.49 0.47 1.0 0.52 0.48 0.34 0.34 0.51 0.59
0.23 0.17 0.12 0.21 0.23 0.24 0.18 0.31 0.23 0.22 0.2 0.2 0.12 1.0 0.09 0.32 0.18 0.24 0.83 0.0 0.13 0.0 0.19 0.25 0.5 0.71 0.67 0.58 0.34 0.28 0.24 0.21
0.26 0.14 0.12 0.11 0.13 0.13 0.19 0.23 0.18 0.22 0.16 0.14 0.12 0.23 0.07 0.17 0.14 0.16 0.45 0.44 1.0 0.13 0.06 0.06 0.43 0.93 0.48 0.38 0.2 0.21 0.36 0.26
0.41 0.43 0.44 0.46 0.36 0.43 0.43 0.55 0.52 0.6 0.53 0.52 0.58 0.86 0.66 0.68 0.35 0.59 0.63 0.34 1.0 0.66 0.59 0.64 0.67 0.69 0.47 0.41 0.47 0.45 0.45 0.55
0.32 0.26 0.22 0.21 0.28 0.25 0.27 0.22 0.27 0.28 0.29 0.25 0.17 0.85 0.17 0.37 0.1 0.33 0.41 0.12 0.68 0.05 0.14 0.17 0.32 0.32 0.49 0.25 0.35 0.7 1.0 0.67
0.56 0.4 0.36 0.37 0.33 0.36 0.35 0.38 0.5 0.55 0.48 0.49 0.56 1.0 0.39 0.75 0.29 0.3 0.92 0.24 0.44 0.5 0.41 0.52 0.49 0.89 0.59 0.51 0.49 0.56 0.68 0.65
0.44 0.44 0.42 0.47 0.44 0.43 0.39 0.44 0.41 0.39 0.37 0.37 0.77 0.88 0.48 0.83 0.36 0.29 0.67 0.11 0.8 0.24 0.49 0.53 1.0 0.29 0.25 0.24 0.45 0.44 0.37 0.37
0.33 0.31 0.28 0.33 0.32 0.27 0.24 0.24 0.31 0.3 0.35 0.27 0.37 1.0 0.38 0.65 0.32 0.3 0.44 0.02 0.85 0.04 0.36 0.37 0.65 0.29 0.18 0.16 0.47 0.46 0.48 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.93 0.87 0.13 0.03 0.01 0.02 0.05 0.0 0.15 0.0 0.01 0.01 1.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
0.46 0.56 0.54 0.59 0.56 0.57 0.59 0.64 0.63 0.62 0.52 0.51 0.71 0.96 0.67 0.88 0.45 0.4 0.76 0.37 0.63 0.32 0.52 0.57 1.0 0.5 0.45 0.5 0.45 0.5 0.36 0.48
0.28 0.23 0.25 0.25 0.23 0.22 0.24 0.3 0.33 0.33 0.35 0.34 0.45 1.0 0.35 0.29 0.24 0.24 0.26 0.06 0.25 0.02 0.2 0.21 0.58 0.22 0.23 0.19 0.28 0.28 0.24 0.27
0.32 0.27 0.3 0.27 0.31 0.33 0.25 0.29 0.34 0.34 0.35 0.33 0.1 0.16 0.14 0.28 0.2 0.38 1.0 0.07 0.68 0.06 0.17 0.21 0.66 0.43 0.56 0.28 0.28 0.25 0.29 0.39
0.71 0.59 0.41 0.31 0.41 0.25 0.28 0.53 0.26 0.54 0.52 0.5 0.22 0.3 0.07 0.41 0.07 0.12 0.83 0.05 1.0 0.0 0.14 0.16 0.87 0.67 0.86 0.65 0.27 0.25 0.39 0.3
0.27 0.27 0.21 0.24 0.22 0.25 0.22 0.25 0.25 0.26 0.22 0.24 0.54 0.58 0.32 0.57 0.29 0.38 0.65 0.1 0.72 0.09 0.36 0.39 1.0 0.21 0.17 0.16 0.4 0.39 0.53 0.57
0.45 0.3 0.27 0.29 0.27 0.31 0.32 0.47 0.38 0.38 0.37 0.39 0.01 0.34 0.02 0.06 0.15 0.22 0.8 0.05 0.72 0.0 0.11 0.11 1.0 0.96 0.64 0.5 0.24 0.21 0.35 0.4
0.26 0.16 0.16 0.16 0.14 0.16 0.19 0.36 0.29 0.34 0.33 0.34 0.45 1.0 0.09 0.6 0.13 0.12 0.44 0.25 0.31 0.02 0.18 0.24 0.4 0.61 0.29 0.24 0.34 0.29 0.51 0.45
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.0 0.51 1.0 0.12 0.24 0.14 0.16 0.19 0.12 0.55 0.03 0.17 0.18 0.77 0.28 0.07 0.17 0.21 0.19 0.08 0.12
0.15 0.06 0.03 0.04 0.03 0.06 0.07 0.11 0.1 0.1 0.09 0.09 0.13 0.11 0.03 0.19 0.09 0.12 0.59 0.17 0.62 0.24 0.06 0.06 0.18 1.0 0.46 0.44 0.24 0.23 0.33 0.32
0.27 0.25 0.19 0.29 0.33 0.32 0.34 0.47 0.53 0.48 0.37 0.4 0.51 0.27 0.63 0.62 0.27 0.26 0.55 0.27 0.7 0.2 0.44 0.57 0.48 1.0 0.5 0.52 0.37 0.52 0.29 0.23
0.18 0.08 0.22 0.26 0.06 0.1 0.27 0.21 0.04 0.01 0.06 0.2 0.44 1.0 0.08 0.31 0.08 0.28 0.66 0.0 0.42 0.18 0.15 0.08 0.73 0.66 0.73 0.64 0.06 0.08 0.04 0.04
0.03 0.05 0.2 0.09 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.12 0.19 0.09 0.02 0.54 0.63 0.02 0.02 0.01 0.18 0.0 0.24 0.0 0.0 0.02 0.64 1.0 0.72 0.42 0.0 0.02 0.0 0.05
0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.49 0.69 0.15 0.39 0.2 0.14 0.22 0.17 0.52 0.13 0.21 0.17 1.0 0.19 0.21 0.22 0.24 0.23 0.19 0.12
0.34 0.1 0.19 0.12 0.05 0.18 0.12 0.17 0.37 0.15 0.26 0.14 0.04 0.01 0.18 0.03 0.18 0.07 0.39 0.07 0.64 0.0 0.11 0.06 0.12 0.65 0.44 1.0 0.17 0.21 0.15 0.18
0.27 0.26 0.21 0.22 0.36 0.12 0.45 0.35 0.33 0.7 0.39 0.5 0.53 0.93 0.49 0.63 0.28 0.37 0.64 0.04 0.7 0.09 0.37 0.45 0.11 0.72 0.6 0.46 0.48 0.48 1.0 0.76
0.18 0.16 0.32 0.25 0.15 0.24 0.26 0.29 0.19 0.43 0.34 0.36 0.41 0.58 0.54 0.33 0.15 0.64 0.38 0.01 1.0 0.0 0.22 0.46 0.1 0.47 0.29 0.53 0.22 0.18 0.14 0.24
0.09 0.11 0.05 0.07 0.12 0.06 0.04 0.08 0.06 0.07 0.1 0.1 0.09 1.0 0.11 0.2 0.07 0.04 0.08 0.53 0.28 0.26 0.07 0.05 0.29 0.09 0.06 0.07 0.05 0.05 0.09 0.11
0.01 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.06 0.07 0.02 0.19 0.09 0.39 0.83 0.15 0.02 0.04 0.01 1.0 0.67 0.81 0.02 0.02 0.04 0.02
0.3 0.21 0.14 0.12 0.09 0.08 0.14 0.22 0.28 0.35 0.3 0.42 0.38 0.93 0.08 0.75 0.1 0.72 0.74 0.39 0.65 0.11 0.3 0.47 0.22 0.79 0.26 0.16 0.45 0.71 0.87 1.0
0.27 0.31 0.28 0.29 0.3 0.31 0.26 0.31 0.27 0.27 0.25 0.26 0.62 1.0 0.28 0.68 0.32 0.42 0.5 0.3 0.77 0.33 0.48 0.47 0.72 0.63 0.56 0.53 0.31 0.33 0.32 0.35
0.09 0.11 0.06 0.03 0.01 0.06 0.1 0.12 0.03 0.07 0.07 0.08 0.03 0.5 0.0 0.12 0.05 0.05 0.87 0.08 0.8 0.05 0.03 0.03 0.36 1.0 0.53 0.19 0.13 0.08 0.16 0.15
0.15 0.11 0.05 0.07 0.03 0.07 0.09 0.08 0.1 0.1 0.09 0.09 0.55 1.0 0.08 0.36 0.08 0.05 0.59 0.09 0.44 0.02 0.05 0.04 0.11 0.55 0.25 0.09 0.14 0.09 0.29 0.08
0.39 0.29 0.25 0.22 0.22 0.21 0.28 0.32 0.42 0.39 0.4 0.41 0.45 0.59 0.27 0.57 0.12 0.31 0.46 0.51 0.53 0.2 0.24 0.43 0.27 0.87 0.28 0.17 0.35 0.41 0.71 1.0
0.1 0.08 0.08 0.08 0.07 0.09 0.08 0.11 0.09 0.09 0.1 0.1 0.23 1.0 0.34 0.37 0.11 0.21 0.43 0.51 0.67 0.42 0.15 0.25 0.43 0.41 0.18 0.09 0.2 0.19 0.42 0.35
0.32 0.47 0.47 0.43 0.46 0.41 0.36 0.39 0.43 0.39 0.4 0.39 0.19 1.0 0.42 0.46 0.24 0.18 0.87 0.06 0.06 0.07 0.35 0.33 0.35 0.49 0.67 0.57 0.42 0.43 0.45 0.43
0.11 0.11 0.11 0.13 0.12 0.14 0.15 0.13 0.14 0.12 0.11 0.1 0.76 1.0 0.11 0.26 0.08 0.1 0.17 0.07 0.42 0.01 0.1 0.11 0.68 0.13 0.17 0.17 0.13 0.13 0.12 0.09
0.35 0.21 0.2 0.24 0.29 0.2 0.29 0.33 0.39 0.4 0.46 0.39 0.28 0.3 0.31 0.42 0.1 0.1 0.64 0.21 0.56 0.13 0.18 0.26 0.1 1.0 0.76 0.57 0.24 0.25 0.4 0.68
0.11 0.08 0.04 0.04 0.05 0.06 0.03 0.12 0.05 0.04 0.05 0.06 0.06 0.54 0.37 0.25 0.01 0.07 0.28 0.02 0.23 0.0 0.02 0.04 0.69 1.0 0.48 0.16 0.04 0.03 0.06 0.03
0.18 0.18 0.15 0.12 0.09 0.13 0.11 0.13 0.11 0.13 0.14 0.16 0.46 1.0 0.1 0.41 0.18 0.19 0.2 0.05 0.43 0.01 0.17 0.15 0.53 0.09 0.06 0.06 0.25 0.22 0.21 0.14
0.15 0.12 0.09 0.1 0.13 0.08 0.09 0.1 0.13 0.12 0.14 0.12 0.45 0.39 0.17 0.64 0.05 0.07 0.38 0.0 0.48 0.0 0.11 0.12 0.54 1.0 0.31 0.29 0.14 0.15 0.26 0.27
0.32 0.18 0.19 0.19 0.19 0.21 0.28 0.37 0.47 0.45 0.42 0.3 0.33 0.25 0.0 0.54 0.22 0.17 0.65 0.21 1.0 0.01 0.15 0.17 0.52 0.91 0.57 0.75 0.39 0.45 0.25 0.26
0.25 0.18 0.14 0.15 0.14 0.15 0.22 0.3 0.27 0.37 0.32 0.32 0.36 1.0 0.34 0.77 0.3 0.37 0.52 0.32 0.28 0.1 0.39 0.41 0.25 0.65 0.3 0.21 0.53 0.46 0.7 0.52
0.53 0.39 0.36 0.43 0.43 0.46 0.35 0.47 0.43 0.46 0.44 0.41 0.57 0.66 0.56 0.57 0.46 0.58 0.7 0.14 1.0 0.38 0.57 0.58 0.86 0.38 0.33 0.3 0.45 0.46 0.57 0.48
0.56 0.51 0.5 0.47 0.46 0.57 0.54 0.52 0.62 0.56 0.58 0.49 0.41 0.85 0.51 0.63 0.5 0.49 0.68 0.33 1.0 0.04 0.64 0.54 0.21 0.62 0.82 0.74 0.53 0.53 0.72 0.76
0.47 0.46 0.51 0.57 0.54 0.65 0.51 0.65 0.62 0.56 0.46 0.49 0.76 0.89 0.85 0.89 0.6 0.75 0.93 0.56 0.9 0.42 0.7 0.66 0.64 0.82 1.0 0.95 0.6 0.65 0.5 0.53

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)