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Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.4 -0.51 -0.41 0.15 0.37 0.43 0.56 0.73 0.52 0.34 0.09 -0.23 0.05 -0.46 1.06 -0.07 -0.46 -1.19 0.21 -2.45 -5.14 -3.15 -0.05 0.21 -1.63 0.52 0.83 0.8 -0.19 -0.06 -0.36 -0.27
0.11 -0.05 0.27 0.38 0.67 0.55 0.42 0.8 0.53 0.29 0.11 -0.09 0.06 -0.4 0.62 0.07 -0.61 -1.22 0.21 -2.42 -2.48 - -0.37 0.04 -0.93 0.31 0.64 0.76 -0.47 -0.19 -0.77 -0.71
-0.46 -0.24 -0.15 0.05 0.09 0.15 0.3 0.55 0.0 0.01 -0.03 -0.3 0.16 0.15 1.0 -0.09 -0.29 -0.82 0.49 -4.69 -3.15 -3.82 -0.24 -0.09 -0.72 0.91 1.03 0.79 -0.11 -0.03 -0.22 -0.27
-0.73 -0.64 -0.14 -0.16 0.13 0.46 0.49 0.68 0.35 0.13 -0.22 -0.67 -0.35 -0.98 1.13 -0.23 -0.57 -0.85 0.54 -2.31 -4.67 -3.22 -0.2 -0.07 -2.26 0.7 1.43 1.62 -0.26 0.12 -1.38 -0.84
-0.7 -0.4 -0.36 0.05 0.36 0.32 0.68 0.62 0.45 0.37 -0.11 -0.32 -0.55 -0.96 0.9 -0.34 -0.53 -1.12 0.2 -4.08 -3.33 -2.91 -0.22 -0.24 -0.94 1.11 1.29 1.38 -0.23 0.06 -0.87 -1.22
0.15 0.09 0.19 0.21 0.29 0.16 0.18 0.49 0.33 0.31 0.36 0.25 -0.5 -0.4 0.71 -0.18 -0.55 -0.6 0.19 -3.57 -2.88 -2.75 -0.58 -0.5 -1.79 0.98 1.04 1.05 -0.29 -0.25 -0.6 -0.37
-0.73 -0.53 -0.41 -0.2 0.26 0.49 0.67 0.61 0.44 0.2 -0.14 -0.28 -0.51 -1.24 1.42 -0.6 -0.72 -0.53 -0.05 -0.48 -2.02 0.09 -0.61 -0.37 0.04 0.08 1.1 0.8 -0.66 -0.36 -0.61 -0.12
-0.35 -0.24 -0.18 0.04 0.28 0.03 0.37 0.55 0.44 0.48 0.34 0.12 0.03 0.19 0.84 0.21 -0.42 -0.91 -0.05 -2.3 -0.8 -2.81 -0.12 0.25 -1.32 0.62 0.46 0.53 -0.3 -0.1 -0.46 -0.42
-0.12 -0.12 -0.01 0.16 0.33 0.28 0.36 0.44 0.39 0.28 0.24 0.03 0.25 0.43 0.8 0.07 -0.46 -1.12 -0.16 -3.29 -2.1 -3.01 -0.17 -0.21 -1.3 0.48 0.98 1.01 -0.53 -0.36 -0.65 -0.57
-0.06 -0.07 -0.01 0.15 0.23 0.1 0.14 0.28 0.23 0.3 0.2 0.07 0.07 0.05 0.92 0.14 -0.55 -1.01 0.14 -2.46 -3.83 -2.44 -0.42 -0.18 -0.54 0.99 0.75 0.77 -0.42 -0.28 -0.23 -0.13
-0.45 -0.27 -0.22 -0.04 0.12 0.13 0.09 0.23 -0.09 -0.08 -0.24 -0.43 0.11 -0.15 1.13 0.29 -0.46 -1.36 0.32 -1.56 -1.85 -1.2 -0.25 0.01 -1.05 1.06 1.15 1.18 -0.31 -0.18 -0.66 -0.52
-0.53 -0.22 -0.19 0.14 0.34 0.42 0.32 0.52 0.26 -0.06 -0.11 -0.41 0.33 -0.6 0.88 0.31 -0.77 -0.94 0.42 -6.13 -4.09 -3.01 -0.15 0.04 -1.07 1.28 1.21 1.12 -0.5 -0.31 -1.43 -1.04
-0.57 -0.59 -0.38 -0.1 0.46 0.2 0.42 0.62 0.49 0.49 0.24 -0.06 -0.06 -0.37 0.89 0.09 -0.68 -0.8 0.05 -3.08 -3.99 -3.0 -0.07 0.19 -1.12 1.34 0.89 0.91 -0.38 -0.16 -0.95 -1.26
-0.04 0.09 0.21 0.35 0.57 0.51 0.48 0.46 0.52 0.53 0.48 0.0 -0.52 -0.16 0.83 -0.17 -0.79 -2.04 -0.15 -3.07 -1.13 -0.91 -0.75 -0.49 -1.25 0.89 0.79 1.01 -0.65 -0.69 -1.24 -1.03
-0.14 -0.05 -0.05 0.16 0.2 0.18 0.16 -0.02 0.11 -0.02 0.06 -0.32 -0.39 -0.3 1.24 0.09 -0.14 -0.89 0.09 -1.59 -3.1 -2.94 -0.48 -0.57 -0.96 0.87 1.05 1.29 -0.11 -0.01 -0.17 -0.75
0.08 0.01 -0.16 0.13 0.14 0.2 0.34 0.55 0.47 0.43 0.24 0.26 -0.73 -0.61 0.72 -0.79 -0.82 -1.05 -0.26 -0.67 -1.37 -0.8 -0.86 -0.72 0.29 1.19 0.92 0.74 -0.6 -0.55 -0.72 -0.52
-0.52 -0.33 -0.12 0.11 0.41 0.37 0.51 0.66 0.45 0.36 0.2 -0.1 0.2 -0.05 0.86 0.26 -0.49 -1.17 0.16 -5.25 -3.53 -3.49 -0.21 -0.05 -2.3 0.64 1.0 1.14 -0.09 0.01 -1.33 -1.25
-0.11 0.1 0.14 0.09 0.22 0.26 0.36 0.3 0.01 -0.04 -0.1 -0.33 0.07 -0.16 1.08 0.2 -0.43 -0.89 0.3 -2.51 -4.3 -1.72 -0.33 -0.14 -3.0 0.93 1.16 1.12 -0.46 -0.38 -0.54 -0.58
0.03 0.15 0.16 0.31 0.29 0.19 0.22 0.39 0.38 0.29 0.3 0.19 0.15 0.09 0.17 0.24 -0.85 -1.21 -0.11 -4.06 -1.89 -3.6 -0.26 -0.18 -1.39 1.03 0.88 0.94 -0.66 -0.58 -0.34 -0.05
-0.28 -0.36 -0.21 0.07 0.3 0.24 0.4 0.58 0.35 0.24 0.13 -0.1 -0.19 -0.76 0.7 -0.03 -0.53 -1.28 0.14 -2.5 -3.43 -2.88 -0.39 -0.04 -2.79 1.06 1.12 1.07 -0.21 -0.06 -0.04 0.07
-0.2 -0.09 0.0 0.23 0.32 0.16 0.11 0.27 0.15 0.08 0.01 -0.09 0.14 0.48 0.63 0.15 -0.7 -1.27 -0.08 -1.65 -3.09 -1.21 -0.34 -0.2 -1.04 1.02 1.12 1.3 -0.66 -0.53 -0.74 -1.0
0.0 -0.04 0.07 0.08 0.16 0.03 0.05 0.24 0.11 0.22 0.15 -0.03 -0.09 0.04 0.61 0.05 -0.72 -0.81 -0.11 -7.9 -5.41 -3.53 -0.13 -0.07 -3.08 1.29 1.25 1.08 -0.64 -0.55 0.15 0.15
0.13 0.1 0.08 0.23 0.27 0.24 0.1 0.19 0.14 0.03 0.06 -0.07 -0.16 0.28 0.52 0.07 -0.31 -0.71 0.12 -2.44 -1.56 -1.53 -0.4 -0.3 -0.5 0.72 0.93 0.98 -0.36 -0.28 -0.39 -0.4
0.2 0.07 0.05 0.19 0.21 0.1 0.13 0.37 0.32 0.27 0.27 0.14 -0.24 0.03 0.62 -0.1 -0.58 -1.38 -0.28 -2.58 -4.57 -2.84 -0.54 -0.43 -2.46 1.34 1.2 1.25 -0.54 -0.44 -0.52 -0.46
-0.11 -0.1 0.04 0.27 0.5 0.36 0.45 0.68 0.47 0.36 0.26 0.07 -0.32 -0.48 0.34 -0.02 -0.5 -1.4 0.23 -3.12 -2.29 -4.34 -0.43 -0.39 -1.12 0.92 0.98 1.03 -0.24 -0.18 -0.65 -0.56
0.0 -0.03 0.17 0.11 0.22 0.6 0.37 0.57 0.23 0.21 -0.1 -0.17 -0.17 -0.31 0.74 -0.09 -0.46 -0.47 -0.06 -1.41 -1.15 -0.75 -0.38 -0.23 -0.08 0.44 0.74 0.59 -0.49 -0.48 -0.34 -0.44
0.07 -0.01 -0.03 0.18 0.34 0.2 0.24 0.3 0.13 0.17 0.1 -0.05 -0.09 0.15 1.18 0.06 -0.63 -1.27 0.0 -2.23 -1.78 -1.95 -0.5 -0.24 -0.71 0.8 0.92 0.9 -0.53 -0.45 -0.41 -0.48
0.12 0.07 0.06 0.29 0.38 0.25 0.36 0.59 0.44 0.4 0.37 0.26 0.02 0.07 0.49 -0.06 -0.4 -1.09 -0.02 -4.65 -3.89 -4.19 -0.25 -0.18 -2.13 0.81 0.72 0.77 -0.46 -0.32 -0.29 -0.11
0.2 -0.02 0.09 0.19 0.45 0.28 0.35 0.45 0.32 0.42 0.36 0.13 0.21 -0.11 1.11 -0.07 -0.85 -1.03 -0.15 -6.05 -7.22 -3.64 -0.56 -0.5 -5.43 0.93 1.01 1.09 -0.67 -0.62 -0.55 -0.31
0.12 0.16 0.11 0.22 0.23 0.37 0.27 0.3 0.17 0.21 0.04 0.07 0.1 0.04 0.38 0.08 -0.49 -0.48 -0.04 -2.58 -3.0 -1.92 -0.43 -0.35 -0.42 0.67 0.99 1.06 -0.51 -0.4 -0.41 -0.43
-0.1 -0.07 -0.06 0.31 0.41 0.46 0.43 0.54 0.38 0.32 0.17 0.02 -0.47 -0.9 0.73 -0.38 -0.51 -1.5 -0.02 -0.48 -1.48 -0.03 -0.17 -0.17 -0.55 0.28 0.78 0.73 -0.41 -0.35 -0.62 -0.51
0.0 -0.06 0.06 0.05 0.23 0.19 0.13 0.34 0.19 0.06 0.13 -0.11 -0.11 -0.24 0.74 -0.03 -0.25 -0.54 -0.1 -2.0 -2.54 -1.7 -0.11 -0.07 -1.21 0.97 0.84 0.94 -0.17 -0.07 -0.33 -0.26
0.61 0.19 -0.01 0.11 0.05 -0.14 0.19 0.48 0.55 0.54 0.66 0.79 -0.83 -0.83 0.77 -0.45 -0.58 -1.4 -0.29 -1.27 -3.1 -1.46 -1.12 -1.13 -2.1 0.56 0.85 0.86 -0.26 -0.17 0.27 0.06
-0.35 -0.19 -0.29 0.2 0.48 0.61 0.68 0.84 0.59 0.55 0.18 -0.08 0.13 -0.7 1.15 0.18 -1.01 -1.23 -0.01 -2.91 -1.31 -2.13 -0.47 -0.11 -1.71 0.54 0.8 0.71 -0.54 -0.4 -0.99 -0.91
-0.06 -0.05 0.05 0.31 0.3 0.22 0.48 0.63 0.43 0.36 0.21 0.13 -0.24 0.06 0.51 -0.08 -0.47 -0.92 -0.01 -2.72 -4.88 -2.68 -0.25 -0.24 -1.02 0.95 0.85 0.8 -0.26 -0.23 -0.56 -0.5
-0.4 -0.41 -0.31 0.16 0.32 0.34 0.32 0.62 0.34 0.09 -0.06 -0.34 0.15 -0.28 0.24 0.25 -0.62 -1.64 0.45 -3.07 -1.93 -1.61 -0.12 0.04 -0.39 1.11 1.02 1.01 -0.43 -0.37 -0.61 -0.42
0.0 -0.2 -0.26 0.13 0.02 0.02 0.18 0.54 0.44 0.46 0.37 0.14 0.26 -0.02 0.42 0.34 -0.91 -1.72 -0.09 -7.42 -4.01 -2.64 -0.35 -0.17 -1.82 1.36 1.01 0.98 -0.52 -0.45 -0.28 -0.14
-0.16 0.13 0.38 0.44 0.73 0.5 0.43 0.66 0.33 0.31 0.27 -0.1 -0.45 -0.74 0.51 -0.46 -0.74 -0.72 -0.43 -0.54 -1.04 0.06 -0.54 -0.36 -0.87 0.65 0.72 0.59 -0.92 -0.87 -0.8 -0.55
-0.49 -0.35 -0.27 0.07 0.27 0.31 0.41 0.56 0.32 0.12 -0.03 -0.22 -0.33 -0.32 1.1 -0.2 -0.51 -1.31 0.07 -2.41 -1.24 -1.7 -0.33 -0.15 -0.47 0.79 1.12 1.17 -0.37 -0.23 -0.49 -0.72
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0.17 -0.08 -0.12 0.11 0.11 0.17 0.08 0.28 0.16 0.13 0.11 -0.05 -0.07 0.13 0.59 0.28 -0.35 -0.74 0.06 -2.28 -4.55 -1.9 -0.23 -0.22 -1.82 1.03 1.1 0.94 -0.25 -0.2 -0.3 -0.22
0.02 -0.09 -0.2 0.05 0.11 0.06 0.02 0.4 0.37 0.37 0.38 0.21 0.17 0.04 0.51 0.05 -0.58 -1.32 0.1 -3.83 -3.49 -3.49 -0.26 -0.13 -1.91 1.42 0.95 0.86 -0.35 -0.28 -0.38 -0.26
-0.4 -0.23 -0.09 0.03 0.35 0.37 0.37 0.55 0.3 0.1 -0.1 -0.24 -0.37 -0.35 0.89 -0.23 -0.59 -0.96 -0.05 -1.19 -0.79 -1.91 -0.15 0.02 -0.62 0.97 1.15 1.01 -0.58 -0.51 -0.85 -0.66
0.11 0.13 -0.0 0.18 0.22 0.11 0.15 0.27 0.27 0.29 0.31 0.16 -0.01 0.37 0.51 0.15 -0.73 -0.89 -0.25 -4.17 -5.03 -4.8 -0.37 -0.39 -4.81 1.28 1.23 1.13 -0.66 -0.6 -0.39 -0.22
-0.21 0.12 0.06 0.02 0.27 0.4 0.56 0.62 0.47 0.53 0.29 0.1 -0.12 -0.84 0.7 -0.03 -0.66 -0.53 0.06 -1.51 -1.72 -1.78 -0.48 -0.21 -0.5 0.55 0.66 0.65 -0.48 -0.38 -0.31 -0.41
0.15 0.01 -0.03 0.31 0.36 0.23 0.25 0.58 0.33 0.31 0.29 0.1 -0.05 -0.07 0.65 -0.12 -0.67 -1.39 -0.16 -10.41 -5.37 -5.15 -0.43 -0.32 -2.96 1.22 0.92 0.86 -0.49 -0.46 0.18 0.13
-0.49 -0.33 -0.17 0.02 0.09 0.23 0.24 0.34 0.15 0.09 -0.19 -0.36 0.17 0.16 1.05 0.07 -0.78 -0.77 -0.11 -3.57 -2.12 -3.59 -0.49 -0.19 -0.4 1.19 1.36 1.42 -0.6 -0.45 -1.11 -1.03
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-0.17 0.03 0.1 0.35 0.38 0.6 0.6 0.85 0.34 0.39 0.17 -0.08 -0.28 -0.04 1.07 -0.29 -1.14 -1.34 -0.08 - -6.7 -4.97 -0.36 -0.27 -1.49 0.88 1.21 1.1 -0.8 -0.66 -1.3 -0.88
-0.14 -0.21 -0.14 0.09 0.18 0.24 0.21 0.47 0.24 0.18 0.07 -0.12 0.2 0.09 0.65 -0.01 -0.83 -1.24 0.0 -4.54 -4.78 -7.4 -0.58 -0.46 -1.59 1.17 1.54 1.51 -0.51 -0.36 -0.94 -0.91
0.02 0.04 0.0 0.23 0.11 0.2 -0.05 0.26 0.15 0.05 0.13 0.03 -0.19 0.08 0.77 0.09 -0.42 -1.18 0.09 -7.94 -8.09 -2.94 -0.35 -0.38 -2.66 1.52 1.18 1.19 -0.4 -0.28 -0.59 -0.62
-0.35 -0.63 -0.57 -0.23 0.22 0.14 0.31 0.63 0.41 0.25 0.06 -0.11 -0.09 -1.02 0.75 0.05 -0.74 -1.29 0.03 -1.6 -3.07 -4.64 -0.28 -0.19 -0.28 1.26 1.43 1.34 -0.35 -0.18 -0.92 -1.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.