Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.02 0.11 0.36 0.06 -0.2 -0.14 -0.52 -0.45 0.24 0.41 0.39 0.1 1.25 1.04 -2.89 1.04 -0.79 -0.3 -0.44 -0.56 -0.06 -4.37 0.32 -0.04 0.86 0.92 -0.45 -0.43 -1.04 -1.01 -1.71 -1.52
0.35 -0.03 0.02 0.06 0.16 -0.05 0.03 0.38 0.44 0.49 0.69 0.49 0.23 0.71 -2.36 0.41 -0.83 -2.0 -0.15 -1.39 -0.65 -6.39 0.18 0.42 0.09 0.64 0.21 0.25 -0.39 -0.22 -0.63 -0.5
-0.24 0.13 0.3 0.21 0.4 0.26 -0.04 -0.03 0.0 -0.02 -0.16 -0.35 -0.15 0.48 0.59 0.02 0.02 -0.02 -0.18 -0.25 -1.84 -1.07 0.67 0.56 -0.44 0.12 0.36 0.58 -0.32 -0.25 -1.17 -1.05
-0.57 0.68 1.25 1.88 1.49 1.32 0.97 0.54 0.24 -0.07 -0.41 -0.8 -1.2 1.18 -3.4 -0.48 -2.38 -2.44 -4.95 - -3.99 - -1.93 -1.8 -1.53 -1.11 1.6 1.14 -2.98 -2.39 -1.94 -1.61
-0.35 -0.43 -0.51 -0.38 -0.37 -0.4 -0.11 0.3 0.42 0.4 0.3 0.26 -0.23 0.28 -0.17 0.12 -1.17 -1.2 -0.38 -1.15 -0.53 -3.47 -0.51 -0.24 0.23 1.21 1.07 0.91 -0.41 -0.36 0.71 0.15
-0.14 -0.34 -0.48 -0.17 -0.21 -0.33 -0.26 0.11 0.2 0.34 0.2 0.28 0.54 1.25 0.37 0.43 -0.87 -0.89 0.53 -4.06 -0.49 -5.15 -0.22 -0.01 0.66 0.86 0.04 -0.06 -0.4 -0.38 -0.3 -0.07
-0.24 0.05 0.27 0.46 0.4 0.32 0.21 0.36 0.06 0.05 -0.1 -0.14 0.31 1.09 -0.87 0.19 -0.31 -1.05 -0.43 -2.08 -0.53 -3.8 0.3 0.24 0.36 0.12 0.17 0.16 -0.43 -0.34 -0.3 0.21
-0.26 -0.09 -0.13 0.01 -0.05 -0.07 0.11 0.04 0.06 0.02 -0.17 -0.12 0.5 0.8 0.51 0.56 -0.44 -0.29 0.4 -0.62 -0.53 -1.4 0.29 0.33 0.26 0.16 -0.4 -0.45 -0.33 -0.34 -0.09 -0.08
0.18 0.03 -0.14 0.17 0.19 0.18 0.39 0.51 0.43 0.44 0.29 0.28 -0.15 0.75 0.3 0.06 -0.6 -1.0 -0.34 -1.64 -0.87 -0.98 -0.5 -0.34 0.34 0.06 0.4 0.26 -0.57 -0.63 -0.16 -0.1
-0.2 -0.13 -0.17 0.15 -0.1 -0.01 -0.27 0.08 -0.14 -0.13 -0.08 0.02 0.33 0.51 0.34 0.55 -0.29 -0.97 0.42 -0.92 -0.51 -0.65 0.09 0.12 0.26 0.43 0.27 0.29 -0.22 -0.15 -0.37 0.01
-0.3 -0.46 -0.44 -0.21 -0.14 -0.14 0.03 0.18 0.4 0.35 0.18 0.11 0.14 0.18 0.16 0.22 -0.37 -0.63 -0.3 -0.93 -1.6 -0.81 -0.1 -0.04 0.16 0.87 0.75 0.65 -0.19 -0.25 -0.0 0.11
-0.26 -0.05 -0.01 0.09 -0.0 0.15 0.07 0.07 0.1 0.08 0.06 -0.15 0.2 0.66 0.7 0.17 -0.26 -0.82 -0.38 -0.84 -0.39 0.13 0.21 0.35 0.31 0.01 0.06 0.36 -0.36 -0.27 -0.68 -0.79
-0.08 0.04 -0.13 -0.02 0.09 -0.11 0.17 0.31 0.3 0.25 0.15 0.07 -1.61 0.18 -0.13 -0.35 -0.64 -0.49 -0.18 -2.19 -0.98 -2.51 -0.55 -0.28 0.58 0.94 0.98 0.45 -0.36 -0.21 0.46 0.69
-0.1 -0.32 -0.39 -0.09 -0.21 0.03 -0.01 0.23 0.2 0.19 0.3 0.03 0.41 1.09 0.67 0.67 -0.59 -1.59 -0.02 -3.35 -1.89 -1.43 0.01 0.06 0.9 0.55 0.46 0.46 -0.6 -0.37 -0.84 -1.06
-0.12 -0.15 -0.08 0.02 -0.04 -0.09 0.06 0.31 0.37 0.43 0.42 0.21 0.27 0.78 0.63 0.3 -0.64 -0.93 -0.26 -1.46 -1.26 -2.32 0.0 0.3 0.74 0.48 -0.17 -0.05 -0.54 -0.45 -0.33 -0.24
0.21 0.08 0.1 0.26 0.21 0.23 0.07 0.36 0.32 0.48 0.31 0.33 0.52 0.7 -0.41 0.19 -0.84 -0.77 -0.14 -2.09 -1.44 -3.86 -0.06 0.08 0.58 0.26 0.11 -0.07 -0.61 -0.52 -0.19 0.1
0.02 -0.17 -0.15 0.02 0.1 0.17 -0.29 0.21 0.16 0.25 0.03 -0.1 1.3 1.2 -0.8 1.3 -1.61 -1.87 -0.43 -3.01 -1.73 -3.61 0.53 1.21 0.43 0.6 -0.36 -0.15 -0.98 -0.82 -1.52 -1.42
-0.78 0.44 0.9 1.36 1.23 0.93 0.67 -0.03 -0.34 -0.91 -1.15 -1.35 0.17 1.37 -0.5 -0.01 -0.86 -1.29 0.24 -2.72 -1.3 -3.74 -0.47 -0.71 0.7 -0.21 0.27 0.03 -1.35 -1.18 -0.45 -0.25
-0.13 0.05 0.01 0.11 0.09 -0.04 0.15 0.33 0.32 0.34 0.36 0.16 -0.12 0.78 -0.08 0.13 -0.57 -0.89 -0.14 -2.47 -1.19 -4.01 -0.18 -0.19 0.77 0.41 0.37 0.42 -0.4 -0.33 0.05 0.19
-0.32 -0.59 -0.5 -0.33 -0.14 -0.38 -0.2 0.23 0.26 0.28 0.3 -0.04 0.18 1.11 0.47 0.17 -0.92 -0.98 0.47 -0.61 -0.59 -1.36 -0.84 -0.3 1.23 0.8 0.48 0.27 -0.36 -0.31 -0.89 -0.8
-0.1 -0.18 -0.26 -0.03 -0.07 -0.09 -0.09 0.09 0.07 0.08 0.04 0.03 0.32 0.73 0.31 0.45 -0.41 -0.46 0.13 -0.37 -0.21 -1.76 0.15 0.32 0.58 0.42 -0.22 -0.12 -0.24 -0.15 -0.36 -0.32
-0.29 -0.33 -0.1 0.1 0.06 0.13 0.05 0.24 0.34 0.27 0.17 0.05 -0.04 0.78 0.64 -0.09 -0.56 -1.2 -0.57 -3.08 -1.72 -1.59 0.7 0.73 0.61 0.32 0.42 0.44 -0.45 -0.27 -0.5 -0.64
-0.28 -0.16 -0.24 -0.01 -0.1 -0.07 0.04 0.16 0.22 0.22 0.23 0.17 0.29 1.17 0.7 0.4 -0.71 -0.85 -0.17 -1.03 -0.93 -2.93 -0.29 -0.08 0.08 0.83 0.48 0.44 -0.61 -0.53 -0.53 -0.37
0.54 0.21 0.05 0.13 0.02 -0.35 -0.31 0.17 0.15 0.23 0.37 0.6 0.36 0.41 -1.23 0.3 -0.59 -0.8 -0.2 -2.4 -1.0 -4.39 -0.19 -0.09 0.29 1.01 0.61 0.62 -0.45 -0.37 -0.34 -0.09
0.16 -0.15 -0.31 0.02 0.1 0.21 0.12 0.56 0.44 0.38 0.48 0.21 -0.49 0.29 -0.2 -0.04 -0.73 -0.94 -0.16 -1.34 -0.4 -1.58 -0.56 -0.61 -0.01 0.05 0.92 0.59 -0.27 -0.17 0.24 0.3
-0.11 -0.08 -0.11 0.06 -0.01 0.14 -0.23 -0.08 0.08 0.07 0.13 -0.16 0.19 1.35 0.08 0.54 -0.44 -0.81 0.29 -1.2 -0.77 -4.87 -0.03 -0.09 0.57 -0.21 0.47 0.41 -0.48 -0.32 -0.12 -0.07
-0.5 0.18 0.2 0.38 0.72 0.81 0.26 -0.35 -0.78 -0.71 -1.13 -1.06 -0.97 1.5 -3.44 0.71 0.65 -0.02 0.09 -1.89 -1.19 -7.27 -0.64 -1.57 0.32 0.88 1.19 0.95 -0.09 -0.4 -0.76 -2.05
-0.44 -0.54 -0.52 -0.39 -0.15 -0.26 -0.03 0.31 0.26 0.51 0.43 0.19 -0.12 -0.6 -0.68 -0.56 -1.53 -1.32 -0.59 -1.45 -1.1 -0.38 -0.71 -0.41 0.36 1.43 1.23 1.02 -1.17 -1.1 0.49 1.07
0.41 0.65 0.4 0.29 0.16 0.44 -0.05 0.13 0.29 0.49 0.25 0.15 0.05 -0.07 0.43 -0.06 -0.4 -0.42 -0.05 -6.74 -0.73 -2.92 -0.23 -0.4 0.71 -0.16 0.14 -0.35 -0.45 -0.75 0.12 0.21
-0.33 0.02 0.09 0.08 0.15 0.08 0.2 0.35 0.22 0.4 0.35 0.23 1.11 0.84 -1.04 1.08 -1.08 -0.58 0.29 -1.34 -1.07 -6.78 0.13 0.19 0.47 -0.26 -0.49 -0.54 -0.48 -0.43 -0.58 -0.4
-1.58 -0.68 -0.08 0.47 0.61 0.77 0.74 0.09 -0.11 -0.49 -0.91 -1.17 0.11 1.68 -0.85 -0.25 0.48 -1.87 -1.72 -2.26 -0.31 -5.56 0.43 0.44 -0.61 0.16 0.87 1.06 -0.36 -0.35 -0.56 -0.27
-0.82 -0.23 0.11 0.7 0.23 0.49 0.88 0.68 0.17 -0.07 -0.21 -1.03 -1.14 1.57 0.93 -1.02 -0.34 0.22 -2.55 -3.99 -2.18 - 0.95 1.05 -2.53 0.17 0.61 0.83 -1.1 -1.16 -1.31 -1.93
0.25 0.4 0.43 0.28 0.23 0.18 -0.08 -0.08 0.13 0.13 0.23 -0.06 -0.3 0.94 -2.52 0.89 -0.06 -0.41 -0.67 -2.3 -1.45 -3.48 0.66 0.97 0.73 -0.19 -0.37 -0.15 -0.45 -0.13 -1.0 -0.38
-0.28 -0.16 -0.13 0.09 0.1 -0.02 0.11 0.24 0.3 0.24 0.23 0.16 0.48 0.74 -0.03 0.23 -0.5 -0.7 0.11 -3.72 -1.77 -5.3 0.37 0.59 0.38 0.37 0.44 0.22 -0.37 -0.29 -0.2 -0.15
0.1 0.26 0.09 -0.02 0.09 0.34 -0.05 0.33 0.43 0.1 0.15 -0.1 -0.39 0.99 0.4 0.46 -0.4 -0.66 0.04 -0.98 -2.9 -5.22 -0.11 -0.16 -1.28 0.41 0.79 0.72 -0.28 -0.08 -0.46 -0.51
0.25 0.25 0.06 0.45 0.25 0.23 0.21 0.39 0.27 0.33 0.17 0.29 0.04 0.38 0.37 0.16 -0.58 -1.06 -0.29 -0.89 -0.21 -1.33 -0.24 -0.3 0.38 0.22 0.21 -0.08 -0.72 -0.52 -0.39 -0.38
-0.37 -0.16 -0.25 0.11 0.22 0.02 -0.1 -0.03 0.09 -0.0 -0.27 -0.33 0.16 -0.2 -0.24 0.34 -1.18 -1.5 -0.37 -3.42 -3.09 -6.43 -0.32 -0.32 0.63 1.55 1.22 1.0 -0.9 -0.61 0.69 0.63
0.05 0.06 -0.02 0.08 0.2 0.08 0.06 0.02 -0.04 0.15 0.03 0.09 -0.15 -0.73 -0.41 -0.26 -0.73 -1.08 -0.21 -2.47 -0.34 0.2 -0.57 -0.41 -0.35 1.12 1.08 1.09 -0.79 -0.73 0.27 0.35
0.06 -0.0 -0.01 0.2 0.27 0.04 0.02 0.16 0.12 0.12 -0.0 -0.06 0.29 1.44 0.2 0.45 -0.38 -1.31 0.23 -3.6 -2.48 -3.63 -0.27 -0.08 -0.86 0.54 0.4 0.53 -0.17 -0.06 -0.18 -0.16
0.01 -0.29 -0.33 -0.3 -0.23 -0.36 -0.31 -0.15 0.08 0.22 0.15 0.07 0.89 1.06 0.49 0.78 -0.76 -0.87 0.31 -0.91 -0.35 -0.36 -0.16 0.11 0.32 0.75 -0.45 -0.36 -0.58 -0.52 -0.46 -0.33
-0.14 -0.11 -0.03 0.01 -0.17 -0.02 -0.18 0.2 0.29 0.32 0.27 0.12 0.69 0.96 -0.37 0.42 -0.82 -0.83 -0.25 -0.48 -0.13 -1.77 -0.14 0.12 0.65 0.59 -0.02 -0.12 -0.57 -0.53 -0.4 -0.25
0.23 0.06 0.43 0.45 0.2 0.39 0.37 0.48 0.48 0.25 0.2 0.19 0.25 0.75 0.28 0.17 -0.64 -1.75 -0.05 -2.69 -3.32 -1.72 -0.22 0.06 -0.27 -0.17 0.53 0.14 -0.47 -0.38 -0.28 -0.13
-0.04 0.01 -0.15 -0.06 0.02 -0.08 -0.12 0.12 -0.01 -0.09 -0.07 -0.11 0.48 1.35 0.14 0.18 -0.54 -0.44 0.09 -3.21 -0.84 -3.58 -0.14 -0.06 0.34 0.47 0.68 0.35 -0.49 -0.51 -0.16 0.35
-0.4 -0.42 -0.24 0.03 -0.12 0.23 0.18 0.25 0.42 0.41 0.16 0.07 0.8 1.33 1.18 0.38 -0.61 -1.06 -0.85 -1.65 -1.15 -2.08 -1.14 -1.12 0.03 0.91 0.3 0.76 -0.67 -0.62 -1.31 -1.24
0.08 0.15 0.06 0.03 -0.07 -0.12 -0.22 0.08 0.27 0.36 0.34 0.06 0.87 0.67 0.48 0.86 -0.54 -0.34 0.01 -0.82 -0.72 -3.09 0.34 0.34 0.27 0.11 -1.04 -0.6 -0.44 -0.48 -0.66 -0.41
-0.13 0.0 -0.03 0.08 0.09 0.03 -0.22 0.18 0.31 0.2 0.34 -0.12 0.65 0.6 0.62 0.61 -0.46 -0.86 0.15 -3.24 -0.74 -7.11 0.55 0.55 0.24 0.31 -0.01 -0.05 -0.35 -0.27 -0.79 -0.62
-0.22 -0.01 -0.13 0.07 0.19 0.01 0.11 0.3 0.09 0.33 0.34 0.09 -0.16 0.01 -0.09 -0.14 -0.58 -1.41 -0.03 -1.37 -1.59 -0.13 -0.28 -0.21 0.41 1.0 0.61 0.38 -0.49 -0.39 -0.06 0.47
0.23 -0.12 -0.21 -0.06 -0.09 -0.13 -0.15 0.28 0.38 0.39 0.4 0.34 0.55 0.81 0.99 -0.07 -0.41 -1.14 -0.17 -1.51 -1.24 -2.51 -0.48 -0.22 0.31 0.79 0.09 0.17 -0.36 -0.28 -0.57 -0.52
0.02 0.13 0.24 0.27 0.25 0.2 -0.14 0.16 0.21 0.23 0.17 0.03 0.09 -0.43 -0.63 -0.18 -0.62 -0.4 -0.33 -4.11 -1.6 -1.8 -0.03 -0.04 -0.16 1.21 0.98 0.52 -0.58 -0.49 0.2 0.43
-0.25 0.09 0.29 0.21 -0.02 -0.19 0.15 0.34 0.5 0.38 0.13 0.09 0.86 0.61 0.01 -0.08 -0.38 -0.28 -0.31 -2.16 -3.47 -2.33 0.26 0.52 -0.51 0.59 0.46 0.0 -0.59 -0.49 -0.36 0.05
0.26 0.22 0.15 0.15 0.29 0.16 0.02 0.21 0.19 0.26 0.17 0.06 0.22 0.25 0.36 0.02 -0.42 -0.33 -0.13 -1.44 -1.84 -1.25 -0.14 -0.03 0.37 0.14 0.11 0.02 -0.58 -0.5 0.18 0.42
-0.97 -0.74 -0.45 -0.25 -0.16 -0.03 0.38 0.61 0.72 0.6 0.4 0.15 -0.0 -0.67 0.39 -0.29 -0.75 -0.47 -0.01 -0.47 -0.79 -1.58 -0.32 -0.07 0.24 1.05 0.71 0.59 -0.49 -0.37 -0.38 -0.09
-0.05 0.23 0.22 0.24 0.25 0.24 -0.02 -0.04 0.26 0.26 0.07 -0.06 1.14 0.84 -3.56 1.13 -0.97 -1.93 0.17 -2.85 -0.22 -2.45 0.35 0.51 0.81 -0.44 -0.09 0.06 -0.5 -0.46 -1.27 -1.33
-0.02 -0.35 -0.11 -0.12 0.02 -0.01 0.1 0.36 0.46 0.55 0.47 0.26 0.17 0.37 -0.34 0.44 -0.9 -1.03 -0.34 -1.09 -0.48 -1.15 0.01 -0.04 -0.78 0.65 0.47 0.67 -0.09 -0.04 -0.42 -0.33
-0.1 -0.3 -0.44 -0.09 -0.27 -0.11 0.18 0.35 0.27 0.63 0.4 0.44 -0.11 0.53 0.2 0.59 -0.82 -1.19 -0.19 -1.85 -1.04 -1.77 -0.53 -0.22 0.32 0.67 0.55 0.46 -0.54 -0.51 0.17 0.34
-0.26 -0.14 -0.25 -0.01 0.16 -0.03 0.14 0.3 0.31 0.36 0.27 0.04 -0.19 0.26 -0.03 0.09 -0.39 -0.8 0.12 -0.89 -1.86 -2.53 -0.17 -0.06 0.21 0.74 0.85 0.76 -0.32 -0.25 -0.1 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.