Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.71 -0.64 -0.2 -0.04 0.11 0.27 0.53 0.49 0.36 0.39 0.24 0.02 -0.23 -0.93 -0.39 -0.08 -0.52 -1.16 -0.03 -1.27 0.07 -1.11 -0.32 -0.29 -1.68 1.75 0.81 0.72 -0.47 -0.59 -0.43 0.03
-0.04 0.02 0.15 0.36 0.31 0.26 0.25 0.61 0.39 0.43 0.31 0.24 -0.28 0.15 -0.58 -0.3 -0.78 -0.89 -0.21 -2.53 -1.8 -3.85 -0.34 -0.28 -0.48 1.08 0.88 0.91 -0.48 -0.57 0.09 -0.22
-0.1 -0.24 0.13 -0.05 0.06 -0.13 0.3 0.4 0.37 0.62 0.62 0.42 -0.03 -0.32 0.2 0.12 -0.74 -0.82 0.03 -0.45 -1.56 -2.63 -0.43 -0.25 -0.98 1.17 0.41 0.4 -0.24 -0.29 -0.15 -0.07
-0.08 -0.17 -0.28 -0.08 -0.08 -0.23 -0.16 0.04 -0.03 0.03 -0.03 -0.04 -0.12 0.07 -0.52 0.19 -0.5 -0.9 0.35 -6.15 -4.08 -6.58 0.02 0.19 -1.68 1.57 1.25 1.16 -0.11 -0.02 0.45 -0.01
-0.02 0.19 0.09 0.23 0.34 0.35 0.31 0.62 0.43 0.46 0.35 0.21 -0.41 -0.71 0.07 -0.39 -0.77 -1.33 -0.19 -8.66 -2.77 -2.11 -0.5 -0.41 -0.23 0.93 1.13 1.08 -0.72 -0.55 -0.04 -0.08
-0.11 -0.06 0.02 0.15 -0.02 0.06 0.21 0.38 0.46 0.41 0.46 0.28 -0.26 -0.19 0.32 -0.02 -0.33 -0.99 0.03 -1.48 -2.37 -1.32 -0.34 -0.23 -0.85 0.86 0.69 0.62 -0.26 -0.32 0.14 0.12
0.33 0.24 0.27 0.15 0.3 0.38 0.46 0.5 0.45 0.58 0.58 0.38 -0.21 -0.67 -0.57 -0.31 -0.82 -0.77 -0.39 -0.62 -2.4 -1.13 -0.68 -0.61 -1.1 1.07 0.77 0.81 -0.52 -0.54 -0.56 -0.46
0.16 -0.03 -0.07 -0.1 0.19 0.29 -0.09 0.27 0.21 0.32 0.39 0.23 0.32 0.21 -0.12 0.17 -0.37 -0.38 0.2 -2.35 -1.3 -2.23 0.05 0.05 -2.32 0.78 0.77 0.59 -0.46 -0.52 -0.1 0.14
-0.12 -0.44 -0.18 -0.12 0.01 -0.29 -0.32 0.51 0.38 0.48 0.4 0.36 0.16 -0.29 -2.4 0.26 -1.33 -1.09 0.08 -2.26 -0.57 -2.65 -0.29 -0.17 -0.77 2.03 0.8 0.66 -0.23 -0.23 -0.56 -0.27
-0.19 -0.03 0.04 0.05 -0.01 -0.14 -0.01 0.18 0.16 0.11 0.18 -0.05 -0.09 0.32 -0.31 -0.1 -0.6 -1.04 -0.29 -1.53 -1.02 -2.14 -0.28 -0.14 0.7 1.38 0.94 0.96 -0.56 -0.43 -0.47 -0.25
0.22 -0.19 -0.33 -0.12 0.1 -0.01 0.08 0.34 0.28 0.31 0.5 0.27 -0.47 -1.04 -1.05 -0.35 -0.99 -1.65 -0.7 -1.41 -0.64 -0.8 -0.63 -0.46 0.86 2.05 1.04 0.98 -0.99 -1.07 -0.97 -1.17
0.11 -0.01 -0.11 0.14 0.11 0.15 -0.0 0.24 0.28 0.35 0.28 0.29 0.06 -0.23 0.1 0.22 -0.33 -1.0 0.24 -2.78 -1.65 -1.45 -0.25 -0.16 -0.74 1.2 0.67 0.71 -0.23 -0.21 -0.26 -0.38
-0.13 -0.23 -0.36 -0.14 -0.05 -0.05 0.27 0.58 0.57 0.6 0.5 0.47 -0.54 -1.28 -0.08 -0.25 -0.69 -1.04 0.13 -1.54 -2.45 -1.33 -0.39 -0.19 -1.2 1.63 0.84 0.89 -0.1 -0.06 -0.48 -0.53
-0.1 -0.14 0.02 0.12 0.08 -0.04 0.01 0.37 0.41 0.43 0.41 0.14 -0.09 -0.21 -0.47 -0.48 -1.05 -3.54 -0.37 -1.32 -1.4 -4.02 -0.97 -0.64 0.32 1.91 1.25 1.21 -0.59 -0.64 -0.77 -1.09
0.08 0.03 0.15 0.08 0.25 0.13 0.3 0.2 0.03 0.13 0.24 -0.1 -0.0 -0.56 -0.07 0.25 -0.45 -0.56 0.16 -0.92 -3.63 -5.13 -0.27 -0.18 -1.17 1.26 1.03 1.15 -0.33 -0.15 -0.58 -0.54
-0.01 0.06 -0.03 0.13 -0.0 -0.06 -0.06 0.16 0.26 0.3 0.29 0.17 0.49 0.28 -0.18 0.38 -0.8 -1.03 -0.32 -1.78 -2.22 -1.83 -0.25 -0.11 0.03 1.54 0.84 0.86 -0.79 -0.7 -0.84 -0.76
-0.16 -0.18 -0.12 0.02 -0.03 -0.1 0.15 0.43 0.39 0.48 0.45 0.35 0.01 0.01 0.09 0.05 -0.67 -1.11 -0.14 -1.84 -0.78 -1.78 -0.44 -0.26 -0.97 1.25 0.73 0.78 -0.38 -0.33 -0.1 -0.05
0.07 0.07 0.06 0.33 0.58 0.28 0.13 0.43 0.19 0.26 0.13 -0.13 -0.24 -0.32 -0.96 0.19 -0.78 -2.73 0.01 -2.6 -1.95 -4.47 -0.07 -0.1 -0.26 1.35 0.92 1.05 -0.67 -0.73 0.36 -0.26
0.05 0.1 0.16 0.31 0.41 0.38 0.41 0.52 0.2 0.22 0.14 -0.01 -0.28 -0.62 -0.27 -0.1 -0.43 -1.33 -0.12 -2.11 -2.11 -2.57 -0.45 -0.45 -0.71 1.13 1.18 1.2 -0.4 -0.42 -0.3 -0.59
0.16 0.16 0.14 0.36 0.39 0.25 0.16 0.34 0.35 0.32 0.32 0.19 -0.25 -0.17 -0.03 -0.14 -0.56 -1.39 -0.2 -3.4 -2.38 -2.12 -0.35 -0.31 -1.19 1.16 1.07 1.13 -0.44 -0.38 -0.41 -0.45
-0.26 0.07 0.34 0.19 0.08 -0.23 0.26 0.25 0.2 0.36 0.45 0.23 -0.15 -1.52 -1.37 0.36 -0.49 -1.34 0.21 -1.52 -1.28 -0.52 -0.42 -0.48 -2.07 2.01 0.4 0.66 -0.26 -0.2 -0.47 -0.48
0.28 -0.05 -0.27 -0.05 0.02 -0.26 -0.28 0.21 0.19 0.34 0.47 0.34 0.17 -0.14 -0.57 0.17 -0.71 -1.85 -0.32 -2.83 -1.38 -2.41 -0.0 0.19 -0.26 1.93 0.83 0.96 -0.48 -0.51 -0.93 -1.12
-0.25 -0.35 -0.44 0.05 0.14 -0.18 -0.04 0.2 -0.02 0.23 0.05 -0.14 0.06 -0.56 0.05 0.17 -0.45 -0.76 0.64 -5.03 -0.95 -0.52 -0.36 -0.35 -1.1 1.55 1.02 0.89 -0.3 -0.32 -0.26 0.12
0.27 0.18 0.09 0.16 0.26 -0.02 0.03 0.37 0.16 0.36 0.44 0.23 -0.17 -0.21 -0.62 0.13 -0.46 -0.66 0.11 -1.72 -1.73 -1.29 -0.28 -0.26 -0.38 1.32 0.6 0.81 -0.31 -0.2 -0.72 -0.71
-0.08 -0.33 0.1 0.05 -0.01 -0.17 -0.27 0.4 0.2 0.33 0.41 0.18 0.26 -0.17 -0.63 0.39 -0.48 -0.88 0.34 - - - -0.14 -0.2 -4.33 1.62 0.82 0.9 -0.16 -0.08 0.06 0.32
0.2 0.18 0.19 0.27 0.07 -0.05 -0.03 0.45 0.33 0.63 0.51 0.35 0.58 -0.23 -0.6 0.72 -0.99 -1.47 0.2 -2.53 -3.5 -1.9 -0.33 -0.36 -2.17 1.35 0.19 0.14 -0.07 -0.1 -0.21 -0.06
-0.05 -0.71 -0.64 -0.43 -0.22 -0.19 0.09 0.63 0.71 0.78 0.75 0.54 -0.34 -0.25 0.28 -0.62 -1.4 -1.32 -0.79 -2.15 -2.66 -2.61 -0.39 0.14 -0.37 1.41 1.19 1.0 -0.8 -0.68 -0.27 0.27
-0.02 -0.11 -0.07 -0.03 -0.07 -0.14 0.08 0.34 0.35 0.4 0.39 0.32 0.12 0.08 -0.3 0.41 -0.58 -0.83 0.17 -1.48 -1.45 -3.22 -0.25 -0.14 -0.84 1.23 0.61 0.63 -0.19 -0.2 -0.11 -0.06
-0.48 -0.13 -0.12 -0.01 0.19 0.14 0.2 0.45 0.19 0.36 0.31 0.08 -0.26 -0.54 0.01 -0.09 -0.29 -1.08 0.16 -2.62 -3.18 -2.41 -0.34 -0.33 -0.41 1.41 1.09 1.23 -0.08 -0.06 -0.65 -0.6
-0.26 -0.48 -0.37 -0.28 -0.31 -0.31 -0.21 0.48 0.48 0.6 0.58 0.39 0.45 0.09 -0.85 0.39 -0.98 -1.24 -0.25 -2.16 -1.75 -2.47 -0.03 0.29 -1.53 1.62 0.65 0.51 -0.27 -0.3 0.02 0.29
0.16 -0.03 -0.02 0.23 0.15 0.06 0.21 0.49 0.41 0.44 0.39 0.34 -0.64 0.02 0.34 -0.33 -0.3 -0.8 -0.21 -3.73 -1.32 -1.76 -0.5 -0.44 -0.45 0.9 0.61 0.61 -0.28 -0.29 0.15 0.25
0.01 -0.12 -0.14 0.14 0.09 -0.07 0.19 0.47 0.27 0.37 0.13 -0.06 -0.1 -0.43 0.4 0.39 -0.43 -1.62 0.36 - - - 0.02 0.09 - 1.6 0.99 1.12 -0.1 -0.06 -0.74 -0.88
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-0.25 -0.38 -0.62 -0.14 0.24 0.1 -0.13 0.13 0.25 0.14 0.3 -0.04 -0.76 0.15 -0.21 -0.45 -0.62 -1.11 -0.13 -4.15 -0.66 -5.19 -0.62 -0.83 0.41 1.45 1.41 1.31 -0.51 -0.37 0.01 0.21
0.25 0.16 0.28 0.09 0.07 0.08 0.37 0.57 0.37 0.59 0.33 0.27 0.26 -0.5 -0.96 0.6 -0.85 -1.54 -0.02 -0.82 -2.63 -2.25 -0.27 -0.31 -2.26 1.31 0.65 0.63 -0.26 -0.19 -0.6 -0.54
0.04 -0.24 0.1 0.08 0.23 0.27 0.26 0.6 0.56 0.56 0.63 0.17 -0.51 -0.78 -0.51 -0.39 -0.65 -0.58 0.0 -1.17 -0.52 -2.0 -0.59 -0.52 -1.61 1.54 0.64 0.94 -0.54 -0.27 -0.83 -0.55
0.09 -0.05 0.01 0.28 0.18 0.36 0.84 0.61 0.56 1.03 0.42 0.47 -1.64 -0.49 -0.17 -1.9 -3.34 -3.01 -1.49 -5.89 - - -2.2 -2.47 -3.16 2.35 1.69 1.92 -3.31 -3.34 -3.27 -3.71
-0.22 -0.66 -0.67 -0.2 0.12 -0.05 0.21 0.45 0.34 0.38 0.22 -0.03 -0.11 -0.7 0.46 0.17 -0.74 -1.12 0.55 -2.88 -2.25 -1.94 -0.39 -0.04 -0.97 1.75 1.13 1.07 -0.39 -0.25 -0.87 -1.02
-0.03 0.09 0.15 0.06 0.13 -0.03 0.51 0.63 0.44 0.66 0.54 0.21 -0.49 -0.5 -1.39 0.13 -0.46 -0.95 -0.29 -2.94 -1.71 -3.07 -0.61 -0.45 -1.5 1.3 1.05 1.18 -0.15 -0.17 -0.42 -0.67
0.52 0.24 0.19 0.24 0.17 0.11 -0.14 0.29 0.47 0.7 0.83 0.5 -0.17 0.4 -0.18 -0.73 -1.05 -0.87 0.1 -5.29 -1.63 -7.98 -0.06 -0.19 -2.33 1.39 0.74 0.71 -1.2 -1.13 -0.53 -0.27
0.21 0.04 -0.07 0.18 0.19 0.19 0.05 0.32 0.29 0.37 0.33 0.25 -0.12 -0.24 0.05 0.08 -0.51 -1.1 -0.13 -3.03 -1.01 -2.4 -0.3 -0.31 -0.4 1.22 0.87 0.85 -0.56 -0.49 -0.24 -0.19
-0.1 -0.07 0.01 -0.01 0.19 -0.15 0.2 0.2 0.12 0.16 0.25 -0.05 0.15 -0.43 -0.34 0.34 -0.41 -0.38 0.11 -1.06 -1.71 -1.84 -0.13 -0.08 -1.58 1.22 0.93 0.88 -0.22 -0.16 -0.15 -0.13
0.3 -0.07 -0.33 -0.1 -0.11 -0.29 -0.19 0.02 0.08 0.05 0.18 0.35 -0.31 -1.29 -0.24 -0.12 -0.81 -0.76 -0.16 -1.49 -1.25 -0.54 -0.77 -0.87 0.34 1.97 1.13 1.15 -0.72 -0.61 -0.52 -0.4
-0.01 -0.34 0.04 0.1 -0.11 0.12 0.18 0.27 0.42 0.28 0.2 0.05 -0.78 -0.08 -0.4 -0.62 -0.37 -1.98 -0.04 -1.64 -0.47 -1.56 -0.56 -0.8 0.33 1.16 1.14 1.19 -0.56 -0.5 -0.05 0.16
0.65 0.35 0.46 0.45 0.11 0.19 0.54 0.54 0.78 1.0 0.88 0.73 -2.08 -0.66 -0.23 -2.36 -1.81 -2.63 -1.4 -0.6 -3.24 -5.98 -1.76 -1.45 -2.09 1.84 0.94 1.13 -1.3 -1.22 -1.18 -0.6
0.24 0.15 -0.08 0.06 0.17 0.03 0.11 0.29 0.26 0.38 0.27 0.25 0.11 -0.68 -0.3 0.34 -0.54 -1.14 0.16 -5.57 -6.75 -3.0 -0.31 -0.44 -1.73 1.54 0.88 0.88 -0.15 -0.1 -0.09 -0.04
-0.05 -0.02 -0.22 -0.12 0.0 -0.09 0.02 0.33 0.38 0.36 0.46 0.41 -0.05 -0.85 -0.75 -0.01 -0.65 -1.86 -0.03 -1.55 -1.16 -3.58 -0.59 -0.48 -2.78 2.08 1.11 0.98 -0.37 -0.4 -0.46 -0.42
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0.08 0.09 0.08 0.05 0.07 -0.14 0.07 0.42 0.37 0.4 0.46 0.26 0.44 -0.27 -0.32 0.55 -0.68 -0.93 0.14 -3.2 -5.75 -3.21 -0.11 -0.23 -3.43 1.46 0.64 0.74 -0.08 0.06 -0.5 -0.38
0.09 0.07 0.31 0.54 0.38 0.35 0.19 0.27 0.17 0.16 0.15 0.0 -0.14 -0.14 -0.7 0.29 -0.46 -1.1 0.25 -5.6 -4.46 -8.3 -0.04 -0.03 -2.43 1.34 0.73 0.9 -0.44 -0.51 0.34 -0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.