Heatmap: Cluster_202 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-0.07 -0.01 0.23 0.06 -0.08 0.16 -0.23 -0.02 -0.19 -0.36 -0.37 -0.41 0.06 0.71 1.32 0.14 -0.28 -0.59 0.49 -0.18 -0.46 -0.44 -0.01 0.18 -0.06 -0.16 0.33 0.26 -0.72 -0.41 -0.63 -0.34
0.17 0.03 0.04 -0.04 0.63 0.24 0.63 0.12 0.34 -0.65 0.1 -0.49 -0.92 0.52 1.68 -0.44 -0.11 -0.48 -0.18 0.49 -2.56 -1.68 -0.38 -0.82 -0.25 -0.21 0.71 0.71 -0.86 -0.72 -1.35 -0.65
0.02 0.02 -0.14 0.22 0.23 0.24 0.4 0.49 0.56 0.47 0.32 0.12 -0.77 0.78 1.23 0.29 0.18 -1.08 -0.65 -2.1 -1.18 -0.09 -0.58 -0.86 -0.56 0.43 -0.29 0.05 -0.34 -0.23 -0.64 -0.95
0.13 -0.38 -0.38 -0.21 -0.39 -0.32 -0.37 -0.17 0.2 0.08 0.26 0.23 0.28 0.88 1.14 0.42 -0.14 0.02 0.34 -0.68 -1.0 -0.29 -0.43 -0.13 -1.92 -0.29 -0.28 -0.25 0.33 0.21 -0.01 0.23
-0.42 -0.46 0.38 -0.05 -0.39 0.33 0.17 0.46 0.42 -0.34 -0.45 -0.77 1.09 1.59 2.28 0.81 -0.65 -1.43 -0.57 -3.99 -0.47 -3.13 -1.01 -0.22 -0.83 -1.69 0.02 0.28 -0.84 -1.08 -2.2 -2.08
0.17 0.3 0.06 0.27 0.5 0.66 0.23 -0.08 0.01 -0.17 -0.15 -0.27 -0.03 -0.05 1.59 0.21 -0.21 -0.29 0.18 -1.09 -1.57 0.38 -0.35 -0.21 -0.99 -0.74 -0.12 0.02 -0.23 -0.07 -0.93 -0.69
-0.04 0.06 -0.31 0.21 0.49 0.22 0.01 0.28 0.18 0.45 0.23 0.18 -0.32 0.04 0.91 -0.13 -0.49 -1.7 -0.2 -1.07 -0.56 0.41 -0.14 -0.07 0.74 0.28 0.29 0.14 -0.73 -0.68 -0.77 -0.88
-0.24 -0.2 -0.2 -0.19 0.02 0.02 -0.23 -0.08 -0.14 0.01 0.02 -0.29 0.45 0.83 1.06 0.5 -0.56 -0.63 0.29 0.12 -0.4 0.06 -0.13 0.09 -0.26 0.64 -0.06 -0.27 -0.63 -0.6 -0.48 -0.51
-0.23 0.04 0.16 0.3 0.29 0.35 0.27 0.13 0.18 0.02 -0.12 -0.5 -0.59 0.57 1.47 0.34 -0.1 -1.19 -0.09 -0.14 -1.66 0.29 -0.21 0.08 -0.18 -0.64 0.01 0.21 -0.45 -0.38 -0.69 -0.95
-0.21 -1.07 -0.77 -0.6 0.0 0.64 0.85 0.9 1.06 0.7 0.34 0.03 -0.96 -1.56 2.02 -0.31 -0.56 -1.61 -0.5 -0.06 - - -0.59 -0.52 - -0.62 0.21 0.33 -0.04 -0.1 0.39 0.24
0.22 0.31 0.22 0.32 0.38 0.35 0.35 0.14 0.32 0.18 0.13 0.15 -0.31 0.73 1.28 -0.4 -0.12 -0.41 -0.53 -0.53 -0.57 -0.37 -0.42 -0.58 0.4 -0.77 -0.41 -0.35 -0.47 -0.41 -0.77 -0.83
-0.35 -0.16 -0.18 -0.14 0.15 0.01 0.1 0.06 0.21 0.24 0.35 0.05 0.4 -0.27 1.29 0.54 -0.51 -0.74 -0.05 -0.48 -0.41 0.33 -0.36 -0.04 0.19 0.41 -0.26 -0.33 -0.45 -0.33 -0.82 -0.62
-0.22 -1.18 -1.49 -1.15 -0.82 -0.45 -0.15 0.26 0.62 0.76 0.69 0.4 0.8 1.32 1.94 0.74 -0.67 -0.45 0.4 -2.42 -0.7 -3.13 -0.03 0.32 -0.89 -2.02 -1.36 -1.56 -0.07 0.13 -0.65 -0.86
-0.63 -0.4 -0.27 -0.13 0.03 0.2 0.31 0.09 -0.25 -0.42 -0.53 -0.73 -0.11 -0.35 1.69 0.13 -0.37 -0.66 0.27 0.62 -2.81 -0.49 -0.33 -0.25 -0.53 0.56 0.94 1.13 -0.4 -0.2 -1.17 -1.12
-0.11 -0.16 -0.06 -0.09 -0.27 -0.02 -0.33 -0.11 -0.06 -0.02 0.01 -0.11 0.47 0.89 0.88 0.71 -0.48 -0.52 0.33 0.27 -1.52 0.39 0.04 0.2 -0.98 0.34 -0.23 -0.14 -0.4 -0.26 -0.64 -0.6
-0.07 -0.08 -0.12 -0.07 0.02 -0.0 0.16 0.25 0.05 0.12 0.01 -0.04 -0.02 0.19 1.17 0.17 -0.52 -0.48 0.48 -0.16 -1.72 -0.61 -0.21 -0.09 0.29 0.21 0.1 0.06 -0.32 -0.22 -0.25 -0.23
0.04 0.07 0.11 0.19 0.27 0.21 0.16 0.26 0.13 0.05 -0.02 -0.01 0.04 0.52 1.22 0.23 -0.38 -0.72 0.34 -1.26 -1.11 -2.16 -0.08 0.14 0.02 0.14 -0.01 -0.02 -0.33 -0.25 -0.47 -0.55
-0.14 0.04 0.18 0.27 0.25 0.17 0.2 0.19 0.31 0.2 0.17 0.0 -0.07 0.79 1.29 0.07 -0.44 -1.04 -0.17 -0.35 -2.67 -2.17 -0.17 -0.15 -0.54 0.14 0.46 0.63 -0.62 -0.42 -0.71 -0.66
-0.6 -0.54 -0.27 -0.0 0.16 0.19 0.41 0.49 0.18 0.11 -0.33 -0.44 -0.17 0.14 1.33 -0.12 -0.47 -0.46 0.19 -0.42 0.29 -0.01 -0.33 -0.22 1.08 -0.05 -0.51 -0.32 -0.28 -0.36 -0.41 -0.94
-0.04 -0.08 0.04 0.24 0.36 0.41 0.26 0.37 0.22 0.06 0.11 -0.23 -0.19 0.08 1.24 -0.03 -0.55 -0.88 0.12 -0.89 -1.3 0.42 -0.34 -0.18 -0.15 0.19 0.32 0.06 -0.71 -0.57 -0.52 -0.39
0.17 0.31 0.1 0.27 0.32 0.31 -0.08 -0.16 0.0 -0.23 -0.15 -0.31 -0.05 0.87 1.61 0.12 -0.03 -0.41 -0.4 -0.9 -1.55 -0.66 -0.21 -0.19 0.86 -0.89 -0.28 -0.04 -0.27 -0.16 -1.07 -1.22
0.29 0.12 0.07 -0.15 -0.05 -0.01 -0.11 0.02 0.13 -0.03 0.11 -0.1 0.29 0.74 0.96 0.31 -0.2 -0.23 -0.02 -1.24 -2.49 -1.42 -0.12 0.02 -0.2 -0.24 0.38 0.42 -0.0 0.12 -0.21 -0.38
-0.22 -0.41 -0.43 -0.07 -0.06 0.55 0.36 0.54 0.22 -0.15 -0.34 -0.27 -0.03 -0.49 1.11 -0.06 -0.28 -0.25 0.13 0.16 -0.24 -1.74 0.01 -0.01 0.15 -0.19 0.53 0.54 -0.35 -0.19 -0.54 -0.36
-0.14 -0.29 -0.35 0.02 -0.13 0.1 -0.18 -0.05 0.16 0.89 0.3 0.28 0.36 0.85 1.79 0.18 -1.03 -0.93 -0.23 -3.8 -0.8 - -0.43 -0.12 0.11 0.89 -0.03 0.23 -0.89 -0.52 -1.19 -0.74
-0.09 0.06 -0.03 -0.0 -0.04 0.1 0.2 0.14 0.34 0.21 0.18 0.0 0.06 0.62 0.98 0.26 0.01 -0.64 -0.13 -2.32 -2.17 -1.24 -0.0 0.07 0.44 0.14 -0.01 0.13 0.02 0.1 -0.4 -0.74
0.06 -0.1 -0.15 -0.09 -0.08 0.0 0.08 0.07 0.18 0.32 0.31 0.28 0.15 0.95 1.25 0.26 -0.5 -0.54 0.15 -1.0 0.0 -0.69 -0.27 -0.05 -0.4 -0.08 -0.82 -0.67 -0.43 -0.43 -0.15 -0.03
-0.1 0.24 0.32 0.47 0.49 0.4 0.3 0.14 0.37 0.15 0.28 0.1 0.38 -1.35 1.47 0.51 -0.19 -1.14 -1.24 -0.67 -2.55 0.36 -1.12 -0.54 -0.99 0.22 0.23 0.58 -0.88 -0.59 -0.77 -0.99
0.14 0.4 -0.01 0.29 -0.66 0.05 -0.24 -0.19 -0.07 -0.29 -0.46 -0.34 0.99 1.37 2.36 0.77 -1.93 -2.76 0.51 -0.52 -1.23 -4.54 -0.36 -0.68 -0.52 -0.95 0.11 -0.06 -1.84 -1.4 -0.99 -1.11
-0.38 -0.31 -0.17 -0.08 0.28 0.14 0.28 0.36 0.46 0.29 0.48 -0.13 -0.12 -0.23 1.7 -0.2 -0.57 -0.93 -0.22 0.59 -0.91 -0.56 -0.46 -0.24 -0.38 0.12 -0.13 0.05 -0.49 -0.38 -0.72 -0.47
-0.13 0.09 0.13 0.28 0.39 0.33 0.42 0.37 0.34 -0.17 -0.18 -0.28 0.51 0.45 1.32 0.07 -0.72 -2.31 -0.54 -0.13 -1.3 -2.19 -0.51 -0.42 0.69 -0.31 0.34 0.28 -0.78 -0.62 -0.29 -0.2
-0.76 -0.42 -0.13 -0.08 -0.32 -0.06 0.45 0.17 0.18 -0.91 -0.73 -0.5 -0.58 -0.9 1.97 -0.24 0.12 -0.34 0.4 1.04 -2.33 -2.46 -0.16 -0.31 -0.1 0.52 0.58 0.87 0.08 -0.13 -1.37 -2.33
0.07 0.34 0.2 0.34 0.29 0.27 0.14 0.45 0.29 0.46 0.4 0.2 -0.45 -0.13 0.46 -0.44 -1.15 -2.37 -0.49 -0.6 -0.39 -0.14 -0.42 -0.12 0.84 0.28 0.57 0.33 -1.1 -0.76 -0.49 -0.57
0.08 0.43 -0.32 0.41 0.11 0.42 -0.06 0.09 0.04 0.02 -0.2 0.12 0.34 0.5 1.16 0.17 -0.34 -2.93 -0.05 -0.34 -1.43 -0.79 -0.16 -0.05 1.02 -0.34 0.27 0.16 -0.44 -0.48 -1.29 -1.04
0.29 0.07 0.08 0.55 0.34 0.17 0.06 0.15 -0.04 0.31 0.12 -0.02 0.97 1.17 1.65 0.93 -0.95 -2.31 -0.52 - - -3.54 -0.09 -0.04 -4.26 0.13 0.02 -0.02 -0.6 -0.45 -0.67 -0.87
-0.16 -0.05 0.14 0.02 0.09 0.47 0.36 0.36 0.39 0.46 -0.04 0.01 0.28 -0.82 0.89 -0.06 -0.34 0.14 0.03 -0.63 -1.35 -3.04 -0.0 0.31 -0.35 -0.41 -0.1 -0.42 -0.13 -0.13 0.02 0.47
-0.25 -0.64 -0.4 0.04 0.14 -0.13 -0.07 0.1 -0.26 -0.33 -0.66 -0.38 0.18 0.58 2.18 -0.08 -0.71 -0.81 -0.63 -0.07 -0.5 -0.09 -0.57 -0.62 0.64 -0.09 0.86 0.61 -0.78 -0.78 -1.34 -1.35
0.04 -0.19 0.35 0.47 0.14 0.31 0.23 0.5 0.47 0.46 0.3 0.18 -0.66 0.73 1.94 -0.04 -1.22 -5.34 -1.35 -1.54 -0.2 -1.15 -1.56 -1.84 0.1 0.89 0.62 0.48 -1.32 -1.13 -1.94 -2.52
-0.67 0.07 0.17 0.1 0.35 0.22 -0.23 0.15 0.24 0.09 0.25 -0.14 0.44 0.65 1.9 0.76 -1.28 -1.74 -0.08 -0.49 -1.76 -0.38 -1.45 -1.65 0.17 0.69 0.58 0.45 -1.68 -1.2 -1.9 -1.81
0.09 0.1 0.17 0.14 0.33 0.21 0.21 0.36 0.42 0.4 0.32 0.12 0.31 1.26 1.88 0.45 -1.61 -3.97 -0.92 -1.86 -3.0 -4.04 -0.58 -0.49 -1.17 0.51 0.62 0.62 -1.44 -1.23 -1.77 -1.82
0.18 0.57 0.08 0.18 0.38 -0.17 0.14 0.17 0.3 0.24 0.02 0.42 0.4 1.83 2.24 0.64 -2.3 -3.55 -1.66 -3.19 - - -1.25 -1.2 - 0.53 0.02 0.66 -1.71 -1.4 -1.74 -1.94
-0.33 -0.32 -0.35 -0.16 0.19 0.27 0.28 0.45 0.36 0.5 0.26 0.01 -0.04 -0.01 1.15 -0.01 -1.1 -1.2 0.2 -0.82 -0.08 0.11 -0.58 -0.19 0.95 0.29 -0.06 -0.19 -0.64 -0.52 -0.83 -0.63
0.09 -0.17 -0.06 0.04 0.11 -0.0 -0.11 0.08 0.27 0.2 0.13 0.03 0.85 0.3 1.53 0.71 -0.87 -1.86 0.18 -1.4 -0.97 -0.61 -1.08 -0.9 0.35 0.76 0.2 0.15 -0.73 -0.46 -1.11 -1.1
-0.26 -0.13 -0.06 -0.01 0.08 0.07 0.08 0.11 0.33 0.32 0.38 0.2 0.38 0.19 1.51 0.38 -0.77 -1.42 -0.08 -0.24 -0.09 -1.51 -0.12 0.1 0.45 0.39 -0.53 -0.3 -0.76 -0.51 -1.11 -0.88
-0.42 -1.09 -0.48 0.17 0.64 0.63 1.21 0.31 0.14 -0.34 -0.16 -0.5 -0.8 -1.85 2.04 -0.24 -0.18 -0.05 0.05 0.83 - -4.09 -0.62 -0.38 -2.01 -0.5 1.0 0.31 -0.95 -0.37 -0.55 -0.62
-0.14 -0.62 -0.72 -0.41 -0.36 -0.37 -0.12 -0.02 0.3 0.31 -0.25 -0.05 0.4 0.76 1.57 0.7 -0.08 -0.52 0.31 -1.94 0.35 -1.65 0.04 0.01 -0.07 -0.33 -0.67 -0.48 0.18 0.24 -0.43 -0.3
-0.47 -0.55 -0.42 0.06 0.28 0.44 0.57 0.54 0.4 0.49 0.16 -0.18 -0.71 -0.32 1.69 -0.52 -1.38 -3.55 -0.93 -0.01 0.2 0.53 -0.95 -0.5 0.61 0.11 0.59 0.5 -1.28 -0.89 -1.14 -1.05
-0.05 -0.11 0.22 0.03 0.33 0.8 0.57 0.3 0.06 -0.29 -0.34 -0.38 -0.1 -1.44 1.46 0.09 -0.51 0.29 0.15 -2.37 -3.6 1.12 -0.35 0.13 -1.62 -0.37 0.49 0.22 -0.36 -0.2 -1.06 -0.93
-0.43 -0.11 -0.19 -0.01 -0.09 0.1 0.08 -0.07 -0.33 -0.38 -0.62 -0.63 0.27 0.16 1.36 0.34 -0.18 -0.27 0.48 -0.08 -2.57 -0.72 -0.03 0.14 0.23 0.31 0.42 0.33 -0.28 -0.28 -0.01 -0.21
-0.24 -0.14 -0.07 0.09 0.21 0.36 0.14 -0.07 -0.07 -0.16 -0.08 -0.36 1.21 0.74 1.9 1.01 -0.74 -1.95 0.18 -0.03 -2.37 -0.94 -0.56 0.04 -2.19 -0.63 0.31 0.61 -1.16 -0.75 -2.27 -2.59
-0.27 -0.25 -0.09 -0.21 -0.07 0.31 -0.23 -0.14 -0.14 -0.1 -0.47 -0.51 0.74 0.48 2.15 0.9 -0.87 -0.67 -0.63 0.74 -1.41 -0.31 -0.16 0.4 -0.7 -1.03 -0.38 0.14 -0.89 -0.53 -1.13 -1.38
-0.17 -0.04 -0.16 -0.02 0.09 -0.04 -0.03 0.05 0.03 0.04 -0.08 -0.11 0.31 0.46 1.01 0.28 -0.83 -1.29 0.08 -0.13 -1.09 0.16 -0.46 -0.35 -0.16 0.84 0.5 0.52 -0.65 -0.55 -0.54 -0.22
-0.24 -0.57 -0.52 -0.1 0.07 0.53 0.67 0.7 0.36 0.34 0.08 -0.21 -0.16 -1.1 1.14 0.02 -0.43 -0.57 0.35 -0.24 -2.14 -0.96 0.14 0.34 -1.89 -0.4 0.19 -0.22 -0.65 -0.47 0.44 0.78
-0.13 -0.17 -0.17 -0.11 -0.06 -0.0 -0.01 0.14 0.18 0.16 0.26 0.11 0.08 0.55 0.93 0.22 -0.14 -0.54 -0.08 -1.34 -0.48 -0.63 -0.04 0.1 0.52 0.09 -0.18 -0.07 -0.17 -0.15 -0.22 -0.21
0.39 0.26 0.03 -0.08 -0.32 -0.06 -0.07 -0.09 0.15 0.39 0.13 0.34 0.18 1.07 1.6 0.5 -0.16 -1.02 0.07 -0.81 -1.28 -2.15 -0.08 0.04 -0.25 -0.44 -0.54 -0.41 -0.41 -0.13 -0.99 -0.71
-0.03 -0.13 -0.11 0.09 0.09 0.1 0.13 0.17 0.38 0.28 0.25 0.28 0.14 0.55 1.19 -0.01 -0.18 -0.6 -0.31 -0.83 -1.01 -0.83 0.18 0.25 0.39 -0.72 -0.44 -0.46 -0.28 -0.19 -0.34 -0.28
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-0.49 -0.15 -0.2 0.1 0.03 0.56 0.17 0.19 0.13 -0.15 0.09 -0.21 0.13 0.17 1.97 -0.22 -1.13 -1.5 -0.6 -0.04 -4.06 0.33 -0.47 -0.17 0.64 0.23 0.62 0.54 -1.2 -0.93 -1.57 -1.46
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.