Heatmap: Cluster_102 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.24 -0.03 0.22 0.32 0.05 0.05 0.36 0.39 0.33 0.43 0.2 0.07 -0.14 -0.59 -1.39 -0.48 0.19 -0.88 -0.43 -0.29 0.14 -0.84 -0.27 -0.53 0.91 0.24 0.01 -0.14 0.01 -0.03 0.0 -0.15
-0.24 -0.01 -0.18 -0.22 -0.52 -0.09 -0.12 -0.01 -0.03 0.2 0.08 0.18 0.57 -0.06 -0.36 0.66 -0.78 -0.69 0.39 0.33 -0.55 -0.88 -0.68 -0.57 0.74 1.1 0.4 0.43 -0.36 -0.36 -0.54 -0.46
-0.3 -0.11 -0.93 -2.17 -0.8 -0.17 0.47 1.06 0.91 1.31 0.35 0.8 -3.12 -2.58 -5.84 -3.56 -0.32 -1.39 -1.02 0.25 -0.4 - -0.71 -1.85 1.34 1.67 0.41 -0.64 0.59 0.08 0.74 -1.29
-0.08 -0.47 -0.39 -0.36 -0.18 -0.17 -0.27 0.1 0.27 0.38 0.34 0.12 0.64 -0.31 -0.62 0.41 -1.0 -1.89 1.47 0.36 -0.24 -0.1 -0.12 0.45 0.62 0.79 -0.37 -0.34 -0.78 -0.6 -0.91 -1.23
-1.26 -1.44 -2.13 -1.62 -1.14 -1.63 -1.8 -0.92 -0.98 -0.76 -0.88 -1.17 0.61 0.74 -2.32 1.1 -0.83 -0.13 0.79 0.48 0.77 - 0.54 1.27 2.01 1.46 0.51 -0.87 -0.72 -0.72 -0.79 -0.44
-0.0 0.1 0.01 0.06 -0.1 -0.05 0.08 0.15 0.15 0.51 0.13 -0.19 -0.5 0.05 0.06 -0.33 -0.68 -1.26 0.15 0.69 -1.01 0.38 -0.59 -0.56 1.33 -0.19 0.32 0.36 -0.71 -0.3 -0.5 -0.4
-1.21 -0.84 -0.27 -0.3 -0.73 -0.55 -0.46 -0.35 0.04 -0.17 -0.5 -0.66 0.93 -0.09 -0.48 1.13 -0.77 -1.52 -0.07 0.12 -0.95 1.0 1.36 1.75 -0.04 0.22 -0.67 -0.44 -0.4 0.03 -1.02 -1.4
-0.73 -0.6 -0.75 -0.02 0.28 0.28 0.35 0.05 -0.31 -0.51 -0.39 -0.53 -3.01 -0.75 -1.75 0.77 -1.14 -2.03 -0.24 -1.7 1.23 -4.16 0.89 1.73 0.49 0.0 0.68 1.16 -0.43 0.04 -0.64 -0.65
-1.54 -1.45 -1.74 -1.27 -1.92 0.24 0.5 0.41 -0.37 0.86 -0.11 -1.27 -1.9 -4.09 -1.45 -1.99 -0.68 -0.46 -0.92 1.95 1.33 -0.1 -1.3 -1.98 2.32 -1.55 0.32 0.34 0.08 0.02 0.13 -0.56
-0.0 -0.18 -0.1 0.13 0.3 0.31 0.2 0.11 -0.01 -0.16 -0.31 -0.39 -0.66 0.23 0.4 -0.41 0.14 0.23 0.26 -0.52 -0.1 -3.08 -0.14 -0.03 1.39 -0.44 -0.01 0.11 -0.23 -0.24 -0.28 -0.02
-1.11 -0.2 0.1 -0.1 -0.16 -0.01 -0.01 -0.67 -0.71 -1.16 -0.94 -1.31 -0.92 -1.08 -3.32 0.41 -0.72 -0.99 0.7 0.01 2.12 -3.66 1.43 1.72 0.96 -1.26 -0.16 0.18 -0.79 -0.43 -1.49 -1.03
0.36 -0.13 -0.55 -0.45 -0.8 -0.57 -0.1 -0.2 0.47 0.33 0.56 0.84 -5.47 -2.28 -3.11 -2.28 0.39 -0.63 -0.17 1.84 -0.46 -0.76 -0.79 -1.09 0.73 0.74 -0.41 0.1 0.57 0.66 0.05 -0.25
-0.45 -0.21 -0.2 -0.26 0.03 0.3 -0.29 -0.35 -0.57 -0.42 -0.53 -0.79 0.5 -1.1 -1.27 0.23 0.09 0.23 0.26 0.71 1.59 -0.1 0.71 0.57 1.11 -1.07 -0.59 -0.43 -0.37 -0.01 -1.53 -1.39
0.28 -0.28 -0.5 -0.36 -0.48 -0.48 -0.33 0.12 0.25 0.47 0.29 0.46 0.23 -0.15 -0.13 0.52 -0.86 -0.62 0.1 0.84 -0.36 -0.86 -0.42 -0.1 0.11 0.87 0.17 0.09 -0.12 -0.27 -0.46 -0.14
-0.78 -1.11 -0.48 -0.96 -0.82 -0.3 -0.54 -0.64 -0.54 -0.81 -0.64 -0.9 -0.97 0.12 -0.3 -0.24 -0.37 0.88 -0.12 -0.37 0.97 -1.33 1.26 1.33 0.87 -1.39 0.29 0.58 0.02 0.26 0.42 0.34
-0.16 -0.21 -0.79 -0.31 -0.19 -0.15 -0.16 -0.07 -0.15 -0.02 -0.28 0.0 -0.42 -0.81 -0.15 -0.48 -0.74 -0.64 0.36 1.75 -0.82 -1.14 -0.49 -0.38 1.84 -0.34 0.02 -0.27 -0.58 -0.42 0.24 0.48
0.0 -0.46 -0.23 0.06 -0.34 -0.21 -0.21 0.06 0.19 0.11 0.16 0.14 0.19 0.32 0.04 0.18 -0.76 -2.26 -0.04 0.3 -0.26 -1.57 -0.35 -0.47 0.49 0.87 0.79 0.36 -0.66 -0.62 0.19 0.56
-0.78 -0.2 -0.36 -0.04 -0.42 -0.21 -0.37 -0.18 -0.21 -0.14 -0.16 -0.23 -0.06 0.7 -0.63 0.26 -0.78 -0.5 -0.22 0.92 0.81 -0.56 -0.34 -0.34 0.56 1.05 0.92 0.68 -0.77 -0.66 -0.75 -0.54
0.14 0.08 -0.08 0.15 0.24 0.15 0.33 0.29 0.42 0.4 0.12 0.29 -0.22 -0.36 0.23 -0.17 -0.13 -0.68 -0.03 0.38 -0.27 -2.25 -0.21 -0.25 0.86 0.28 -0.6 -0.24 -0.01 -0.14 -0.46 -0.67
0.39 -0.01 -0.11 0.27 0.02 -0.01 0.19 -0.14 0.33 0.32 0.38 0.55 -0.03 -0.64 -0.91 -0.0 -0.43 -0.82 -0.05 0.0 -1.32 0.5 0.04 -0.32 1.09 0.57 -0.34 -0.18 -0.32 -0.25 -0.62 -0.78
0.1 0.05 0.05 -0.08 0.18 0.22 0.11 0.12 0.18 0.11 0.04 -0.0 -0.28 -0.08 0.76 0.05 -0.24 -0.86 0.28 -0.04 -0.51 -0.65 -0.16 -0.23 1.29 -0.04 -0.23 -0.11 -0.15 -0.17 -0.86 -0.95
0.3 -0.29 -0.57 -1.13 -0.94 -1.12 -1.31 -0.59 0.02 0.25 0.34 0.29 0.4 0.86 -3.3 0.4 -1.26 -4.39 0.84 0.55 0.3 -3.2 -0.7 -0.47 1.69 1.69 -0.66 -1.23 -0.13 -0.43 0.08 -0.15
0.46 -0.12 -0.13 -0.39 0.17 0.25 0.14 0.17 0.47 0.51 0.56 0.36 -0.28 -3.7 -4.23 -0.9 -1.07 -4.87 -0.48 0.96 -1.7 - 1.22 0.92 1.21 1.27 -0.15 -0.46 -0.86 -1.03 -0.44 -0.74
0.32 0.1 0.09 0.2 -0.01 -0.0 0.23 0.35 0.47 0.82 0.35 0.47 -0.51 -1.21 -1.37 -0.13 -0.97 -1.11 0.75 0.25 -7.41 -0.73 -0.58 -0.58 -4.1 1.42 0.15 0.36 -0.17 0.01 -0.37 0.25
-1.71 -1.67 - - - 0.13 -0.68 -1.82 - - -1.68 -1.75 0.21 0.39 -0.82 - - - - - 2.36 - 0.33 3.12 1.3 - 0.9 2.3 -1.5 - -0.55 -1.62
-2.62 -1.83 -1.52 -1.95 1.03 0.23 - -2.09 - -2.01 -1.1 -1.85 0.21 -0.93 0.4 0.37 0.22 -0.95 0.31 2.28 - -1.13 -0.36 -1.74 3.08 -1.5 -1.15 -0.23 -0.08 -0.67 -0.36 -1.17
-0.24 -0.27 -0.08 -0.31 0.0 -0.26 -0.24 -0.04 0.04 0.05 0.24 0.06 -0.63 -0.93 -1.21 -0.8 -0.6 -0.41 0.77 -1.43 1.44 -2.08 0.74 0.79 0.39 0.5 0.04 0.12 -0.65 -0.62 0.12 0.49
-0.52 -1.14 -2.08 -0.65 -1.49 -1.01 -0.19 -0.58 -0.51 -1.67 -0.55 -0.29 -0.63 -1.65 -0.44 -0.69 -0.19 1.14 0.7 0.82 -1.0 -1.1 -0.29 -0.6 0.45 2.14 0.52 1.12 0.1 0.17 0.1 0.26
0.18 0.23 -0.05 0.08 -0.11 -0.01 0.15 0.26 0.4 0.38 0.39 0.31 -0.37 -0.27 -0.15 -0.12 -0.67 -0.93 0.37 0.02 -0.74 -2.0 -0.29 -0.02 1.16 0.45 0.01 -0.12 -0.35 -0.37 -0.38 -0.18
-0.07 -0.6 -0.9 -0.3 -0.29 0.07 -0.43 0.14 0.23 -0.35 -0.06 -0.11 -0.26 -0.25 -0.05 -0.47 -0.97 -3.2 -0.68 0.37 -0.54 0.3 -0.01 -0.33 0.14 1.55 1.64 0.88 -0.71 -0.6 -0.26 -0.34
-0.45 -0.33 -0.07 -0.63 -0.75 -0.23 -0.67 -1.08 -0.62 -0.24 -0.41 -0.19 0.07 -0.42 -1.31 0.45 -0.49 -0.33 0.77 0.77 -1.83 -3.09 -0.19 -0.19 2.63 0.25 0.0 -0.63 -0.53 -0.48 -0.11 0.25
-0.58 -0.22 0.03 0.25 -0.1 -0.41 0.06 0.17 0.19 0.11 -0.09 -0.28 -1.67 -1.7 -5.76 -0.44 -0.65 -0.91 -0.07 0.16 1.71 -5.76 1.51 1.17 0.87 -0.48 -0.44 -0.8 -0.16 -0.39 -0.29 0.1
- -3.01 - -2.37 0.24 -0.79 - -1.03 0.5 -3.26 -3.15 - -1.77 -2.66 -3.55 -0.71 0.45 -0.07 0.13 - 1.44 - 2.07 1.66 1.43 0.23 0.85 1.96 -0.34 0.29 -0.33 -0.38
-0.19 -0.28 -0.17 -0.11 -0.3 -0.08 0.27 0.46 0.42 0.49 0.35 0.18 -0.31 -0.81 -0.4 -0.37 -0.86 -1.19 -0.18 0.77 1.24 -0.6 -0.83 -0.66 0.64 0.81 0.05 0.15 -0.63 -0.52 -0.47 -0.4
0.36 -2.09 0.39 -0.69 -1.34 -3.22 0.5 0.05 1.13 0.84 -1.2 -1.54 - - - - -1.61 - -1.5 2.06 1.04 1.19 -1.08 -1.71 1.51 0.98 1.48 0.24 0.41 -0.59 - -3.67
-0.71 -0.4 -0.95 -2.13 -1.04 -1.92 -2.09 -1.29 -1.57 -1.14 -1.51 -0.78 0.36 -0.06 -6.78 0.35 -3.48 -2.44 1.16 1.47 -5.06 - -2.14 -1.18 2.97 1.62 1.48 1.32 -1.65 -1.65 -2.19 -2.3
-0.37 -0.52 -0.53 -0.55 -0.9 -0.44 -0.87 -0.61 -0.4 -0.51 -0.14 -0.46 0.36 -0.78 -1.11 0.44 -0.09 0.41 0.12 0.72 0.28 -0.18 -0.08 0.25 0.94 1.37 0.45 0.46 -0.03 -0.15 -0.31 -0.45
-0.51 -0.35 -0.81 -0.53 -0.35 -0.52 -0.71 -0.4 -0.15 -0.7 -0.65 -0.62 -1.43 0.32 -0.74 0.08 -0.71 0.16 0.28 -0.75 0.9 -1.72 1.52 1.79 1.79 0.1 -0.29 -0.28 -0.84 -0.79 -1.29 -0.83
-1.57 -1.38 -1.13 -1.23 -1.7 -0.78 -0.9 -0.13 -1.35 0.62 -1.46 -2.98 - -1.3 -1.46 -1.7 -0.14 - -1.27 2.39 -0.45 - -0.55 0.28 2.13 1.31 0.57 1.06 0.59 0.17 -0.26 0.55
-0.65 -0.48 -0.49 -0.37 -1.04 -0.07 0.57 0.55 0.54 0.69 0.43 0.51 -1.45 -1.62 -1.17 -0.89 -0.81 -2.04 -0.86 1.72 0.1 -2.49 -0.74 -0.69 1.5 1.13 0.47 0.59 -0.42 -0.41 -1.35 -1.59
-0.02 -0.55 -0.5 -0.02 -0.37 -0.32 0.22 0.11 0.2 0.02 0.28 0.26 0.09 -0.36 -0.16 0.08 -0.33 -4.4 0.04 0.09 -2.14 -0.48 0.08 0.03 0.1 1.47 0.65 0.85 -0.21 -0.07 -0.2 -0.73
0.14 0.29 -0.31 0.13 0.35 -0.13 -0.26 0.51 -0.71 0.03 -0.16 0.08 -0.01 -0.3 0.16 0.28 -0.97 -3.6 0.19 0.74 -0.1 0.25 -0.37 -0.01 0.6 0.85 0.03 0.11 -0.48 -0.29 -0.62 -0.55
-0.82 -0.47 -0.79 -0.26 -1.29 -1.18 -1.12 -0.3 -0.83 -1.23 0.05 -0.81 0.56 0.26 -1.16 1.24 0.0 -2.53 0.4 0.7 -2.29 -1.04 1.46 1.77 0.84 -0.04 0.4 -0.95 0.08 -0.08 -0.61 -0.2
- - - - - -0.33 - - -1.47 - -0.31 - 0.41 0.22 0.84 -0.43 0.63 -0.78 1.04 3.25 - 0.17 0.19 0.54 2.43 - - - - -0.68 -0.05 -0.76
-0.11 -0.54 -0.38 -0.26 0.04 0.07 0.05 -0.03 0.11 0.16 0.15 -0.09 0.68 0.03 0.29 0.5 -0.46 -1.84 0.11 -0.02 -0.2 -1.03 -0.12 0.07 0.32 0.67 0.49 0.15 -0.43 -0.24 -0.19 -0.08
0.52 0.09 -0.27 0.03 -0.1 0.03 -0.14 0.11 0.37 0.41 0.31 0.28 -0.77 -0.29 -0.54 -0.35 -0.93 -2.38 -0.07 1.24 0.1 -0.62 -0.71 -0.51 1.71 0.29 0.06 -0.12 -0.7 -0.68 -1.01 -1.02
-0.08 -0.89 -1.92 -2.05 -2.22 -0.0 -0.54 -0.03 0.5 0.57 0.86 0.51 -2.89 -3.48 -2.65 -0.68 -1.25 -1.63 -0.86 1.52 0.31 - -1.4 -0.41 1.02 2.37 0.97 0.56 -0.67 -0.84 -0.71 0.03
-1.65 -2.59 -2.79 -1.66 0.26 -1.41 -0.76 -0.58 0.39 0.3 -1.18 -2.54 -3.32 0.92 -0.61 -0.32 -3.47 -0.07 -1.46 1.33 1.82 -1.84 -0.77 -0.62 0.66 1.46 1.51 1.84 -1.45 -1.44 -1.13 -0.52
-0.38 -0.07 - - - - -0.66 -1.1 -0.38 -2.82 - - -2.26 - -2.72 1.24 -2.39 -2.37 1.27 2.64 - - - 0.2 3.5 -1.3 1.55 - -1.52 -2.38 -2.42 -
0.19 -0.05 -0.41 -0.27 -0.47 -0.46 -0.53 -0.33 -0.23 0.02 0.17 -0.0 0.84 0.6 -0.06 0.5 -1.41 -2.54 -0.25 1.17 0.1 -1.04 -0.27 -0.03 1.16 0.63 0.13 -0.05 -1.18 -1.02 -0.52 0.31
-0.71 -0.69 -0.71 -0.2 -0.11 -0.11 -0.31 0.03 -0.35 -0.22 -0.1 -0.21 0.15 -0.2 -0.88 0.43 -0.17 -1.41 0.41 0.41 0.66 -1.08 0.58 0.64 0.57 0.57 0.35 -0.04 0.22 0.15 -0.3 -0.03
-0.96 -0.35 -0.5 -0.3 -0.58 -0.13 -0.09 -0.25 -0.27 0.04 -0.12 -0.34 -0.82 -0.05 -0.27 0.11 -0.54 0.48 -0.27 0.85 0.21 -4.06 -0.13 -0.32 1.23 1.34 0.25 0.29 0.04 0.09 0.22 -0.71
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-0.61 -0.63 -1.19 -0.27 0.62 -0.24 -0.63 -0.44 -0.56 0.47 -0.54 -0.82 -0.58 -0.33 0.26 -1.59 -0.85 0.33 0.33 2.28 -0.14 -0.33 -0.89 -0.99 1.58 -0.14 0.69 -1.47 -1.46 -0.84 -0.16 -0.05
0.11 0.2 -0.02 0.08 0.16 0.2 0.14 0.35 0.49 0.63 0.48 0.23 -0.39 -0.11 -0.19 -0.11 -0.96 -3.91 -0.23 0.04 -0.28 -0.57 -0.58 -0.49 0.46 1.25 0.42 0.51 -0.78 -0.61 -0.96 -1.1
-1.42 -0.62 -0.04 0.02 -0.01 -0.11 -0.0 -0.55 -0.57 -0.8 -0.84 -1.17 0.61 0.32 -4.7 0.64 -0.38 -0.53 0.47 -1.87 0.94 -5.83 1.46 1.5 1.22 -0.07 -0.06 0.22 -0.32 -0.2 -1.16 -0.7
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-0.76 -0.05 -0.23 0.37 -0.38 -0.55 -0.17 0.9 0.82 1.0 -0.13 -0.25 -3.56 -5.11 - -3.53 -1.28 -1.41 -2.9 1.1 - 1.24 -1.61 -2.32 0.18 2.41 0.64 1.28 -0.47 -1.82 -0.52 -1.8
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-0.3 -0.37 -0.23 -0.11 0.27 0.17 0.39 0.53 0.78 0.88 0.78 0.44 -0.19 -0.52 0.54 -0.65 -0.15 -0.62 0.16 -0.09 -2.62 -3.19 -0.38 -0.51 -2.87 1.32 -0.06 0.13 -0.12 -0.06 -0.56 -0.6
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-0.44 -0.58 -0.52 -0.59 -0.35 -0.42 -0.45 -0.17 -0.13 0.25 0.28 0.19 0.21 -0.61 -0.37 0.37 -0.48 -0.52 0.2 0.22 -0.43 -0.66 -0.16 0.2 0.51 1.22 0.62 0.69 -0.23 -0.16 -0.09 0.01
-0.35 -0.15 -0.11 -0.14 -0.13 -0.17 -0.26 -0.19 -0.14 -0.14 -0.51 -0.33 0.14 -0.74 0.14 -0.01 -0.13 0.54 0.01 0.2 -1.9 0.74 0.16 0.11 0.07 1.02 0.43 0.52 0.06 -0.06 -0.5 -0.67
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-0.87 -0.92 -1.03 -0.59 -0.39 -0.43 -0.36 0.19 0.01 -0.08 -0.05 -0.38 0.32 -0.63 0.34 0.06 -0.21 -0.28 0.14 0.13 0.15 0.38 0.08 0.34 -0.3 0.63 0.63 0.34 0.09 0.13 0.12 0.49
-0.3 -0.65 -0.34 -0.33 -0.89 -0.4 -0.21 -0.15 -0.37 -0.17 -0.22 -0.11 -0.62 -0.44 0.38 0.01 -0.31 -0.93 0.61 0.53 0.19 0.74 -0.07 0.1 1.45 0.97 -0.32 0.07 0.23 0.21 -1.15 -1.71
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-0.77 -0.2 -0.29 -0.57 -0.65 -0.59 -0.54 -1.13 -0.87 -1.12 -0.96 -1.19 -0.28 -0.17 -4.2 0.93 -0.66 -0.12 0.45 -1.8 0.99 -5.24 2.03 2.06 1.77 -2.05 -0.91 -0.7 -0.4 -0.1 -1.28 -0.68
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-0.05 -0.1 -0.08 -0.15 -0.07 -0.02 -0.26 0.12 0.18 0.31 0.4 0.09 0.09 -0.45 0.02 0.21 -0.29 -0.5 0.26 0.63 0.07 -0.53 -0.17 -0.02 0.18 0.77 -0.42 -0.17 -0.06 -0.03 -0.48 -0.65
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.