Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.68 0.18 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.0 0.06 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 1.82 0.0 0.0 0.05 0.01
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.19 0.4 0.2 0.25 0.19 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.5 0.39 0.19 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 2.21 0.59 1.07 1.13 0.0 0.0 0.0 0.27 1.12 0.0 0.0 0.0 4.2 0.94 2.43 0.61 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.79 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.06 0.13 0.1 0.12 0.06 0.0 0.0 0.2 0.0 0.1 0.08 0.06 0.06 0.04 0.07 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.87 0.04 0.0 0.0 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
2.07 2.02 1.24 1.41 1.43 2.38 2.77 2.51 2.57 3.21 1.78 1.93 2.12 1.75 1.71 6.46 0.76 0.97 20.21 0.02 0.0 0.0 1.53 1.58 0.94 7.85 4.33 3.49 1.37 1.47 1.05 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
11.01 11.74 11.93 13.43 14.32 11.87 12.93 12.62 14.14 14.59 13.72 13.03 6.07 5.62 15.44 7.78 9.34 5.53 40.14 17.35 7.11 7.54 5.3 6.28 6.73 22.66 14.27 14.7 7.8 8.42 6.29 7.05
0.13 0.15 0.06 0.09 0.04 0.06 0.1 0.18 0.14 0.1 0.17 0.09 0.01 0.05 0.0 0.09 0.07 0.08 1.27 0.0 0.07 0.0 0.15 0.09 0.12 0.44 0.48 0.84 0.2 0.14 0.02 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.07 0.07 0.0 0.0
0.54 0.95 0.54 0.69 0.74 0.94 0.76 0.79 0.98 0.56 0.65 0.49 0.88 1.02 0.49 0.61 0.32 0.31 4.63 0.0 0.0 0.0 0.43 0.34 1.26 0.42 1.02 0.97 0.33 0.31 0.12 0.06
0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.17 0.12 0.07 0.13 0.15 0.24 0.19 0.21 0.12 0.14 0.12 0.03 0.04 0.11 0.03 0.13 0.14 1.16 0.0 0.0 0.1 0.08 0.06 0.2 0.11 0.55 0.71 0.05 0.18 0.07 0.11
0.0 0.14 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.06 0.06 0.0 0.0
0.18 0.2 0.13 0.15 0.11 0.12 0.2 0.2 0.15 0.12 0.13 0.12 0.0 0.07 0.13 0.01 0.01 0.05 1.25 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.24 0.6 0.25 0.0 0.02 0.0 0.02
0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.05 0.0 0.0
1.14 1.47 1.4 1.34 2.37 1.55 1.35 0.95 1.93 1.62 2.04 1.53 1.3 1.0 1.9 2.18 1.61 1.68 6.0 0.3 0.89 0.34 1.49 1.67 0.25 3.6 1.85 2.84 1.14 1.52 1.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 1.35 0.13 0.13 0.0 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.22 0.02 0.03 0.0 0.0
0.0 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.16 0.16 0.0 0.07 0.0 0.03
0.02 0.0 0.16 0.07 0.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.1 0.0 0.06 0.0 0.1 0.5 0.17 0.11 0.07 0.04 0.07 0.02 0.13 0.29 0.0 0.12 0.18 0.57 0.17 0.0 0.06 0.02 0.06 0.0 0.22 0.58 0.94 0.22 0.08 0.08 0.02
0.76 0.97 0.81 1.1 0.54 0.67 0.85 1.09 0.6 0.85 0.88 0.93 0.09 0.15 0.17 0.21 0.28 0.3 3.46 0.03 0.04 0.46 0.36 0.13 0.61 1.85 1.52 1.43 0.16 0.24 0.3 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0
8.98 7.41 5.32 5.7 11.32 9.25 10.48 8.6 9.63 8.0 8.74 9.07 0.16 1.2 0.94 0.26 3.26 6.26 65.28 0.0 3.97 3.66 2.74 2.25 1.68 11.68 36.42 34.76 3.74 3.34 3.07 3.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.02 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.3 0.03 0.03 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.38 0.0 0.03 0.0 0.0
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.2 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.0 0.25 1.23 0.11 0.11 0.04 0.0
0.04 0.13 0.0 0.07 0.0 0.0 0.22 0.0 0.11 0.18 0.07 0.13 0.0 0.4 0.07 0.0 0.0 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.15 0.18 1.36 0.09 0.33 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.03 0.04 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.23 0.0 0.05 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.04 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.09 0.0 0.0
1.84 2.17 1.52 1.54 1.26 2.04 1.51 2.29 2.39 1.37 1.5 1.7 1.12 0.96 0.3 2.29 0.98 0.58 11.9 0.0 0.0 0.0 2.03 1.91 1.86 2.95 3.26 5.02 1.25 1.26 0.82 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.09 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.18 0.0 0.0 0.0 0.37 0.07 0.22 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 1.26 0.59 1.31 1.4 1.94 0.62 1.5 1.24 1.58 0.19 1.13 2.32 0.36 0.14 3.05 2.0 2.07 2.32 0.0 0.0 0.0 1.9 3.65 1.26 0.71 1.42 3.16 1.41 2.11 2.4 0.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.15 0.04 0.5 0.11 0.22 0.41 0.42 0.33 0.1 0.32 0.14 0.02 0.18 0.1 0.08 0.26 0.2 2.98 0.0 0.0 0.0 0.24 0.13 0.49 0.46 1.1 0.82 0.2 0.44 0.06 0.08
17.07 17.89 15.84 19.39 18.53 19.6 12.88 15.48 16.26 16.34 13.0 13.0 16.51 12.02 6.98 24.72 13.75 4.23 47.12 4.04 10.93 6.45 17.81 17.42 9.18 28.17 14.18 13.26 11.69 12.06 10.71 12.11
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.41 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 1.35 6.57 0.21 0.0 0.45 0.38 0.0 0.0 0.0 0.4 0.19 2.27 2.26 4.33 5.24 0.42 0.2 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.02 0.0 0.06 0.06 0.02 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 0.3 0.25 0.0 0.02 0.04 0.02
30.14 29.31 24.97 30.79 26.75 26.79 23.63 23.55 26.63 26.74 22.92 24.96 23.76 19.59 14.8 28.05 18.17 9.14 129.15 11.16 23.27 11.62 18.53 17.46 49.11 24.65 21.69 19.38 15.66 17.11 19.14 18.91
19.28 16.34 15.22 14.34 15.66 13.89 13.32 15.36 17.41 17.1 20.85 15.85 17.26 10.58 8.89 24.53 10.9 9.62 82.52 0.37 4.66 0.11 10.41 13.54 1.42 51.09 22.22 26.21 14.31 14.13 8.38 7.6
17.91 17.35 14.31 16.36 17.04 16.8 13.19 14.3 13.61 14.67 16.77 14.87 17.36 9.03 14.36 18.44 13.91 8.59 48.27 0.37 1.5 13.07 17.24 17.51 6.4 15.21 14.12 16.63 12.66 13.94 14.49 15.81

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)