Heatmap: Cluster_166 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
-0.4 0.13 0.4 0.67 0.8 0.68 0.54 0.32 0.1 -0.39 -0.08 -0.12 -0.86 -0.24 -0.23 -0.24 0.1 -0.0 0.02 -0.62 -3.64 0.13 -0.82 -0.48 0.39 -0.17
0.35 0.54 0.52 0.37 0.23 -0.23 0.01 0.23 0.1 -0.17 -0.05 -0.16 0.26 -0.65 -0.02 -0.7 -0.41 0.43 0.17 0.0 -2.03 0.37 -0.97 -0.32 -0.1 0.09
0.08 0.46 0.29 0.48 0.55 0.52 0.54 0.53 0.18 -0.14 -0.44 -0.71 -0.26 -0.59 -0.01 -0.29 -0.31 0.45 0.47 -0.11 -2.64 -0.19 -0.77 -0.9 -0.06 -0.23
0.29 0.65 0.4 0.46 0.45 0.64 0.51 0.34 0.45 0.42 0.2 0.15 -0.22 -1.45 -0.38 -0.84 -0.24 0.38 0.37 0.1 -4.99 -1.77 -1.38 -0.4 -0.46 -0.55
-0.17 0.55 0.41 0.31 0.2 -0.35 0.27 0.35 0.15 0.47 0.54 0.15 -0.74 -0.35 -0.33 -0.45 -0.36 0.8 0.64 0.14 - -0.85 -1.53 -0.31 -0.14 -0.17
0.01 -0.09 0.03 0.46 0.44 0.62 0.86 0.68 0.31 0.19 -0.03 -0.39 -0.85 -1.15 -0.4 -0.45 -0.27 0.69 0.26 0.4 -6.01 -1.04 -0.39 -0.91 0.12 -0.19
0.09 0.13 0.09 0.36 0.48 0.57 0.68 0.64 0.29 0.18 -0.06 -0.26 0.05 -0.98 -0.61 -0.75 -0.12 0.49 0.1 0.05 -6.22 0.02 -1.61 -1.05 0.46 -0.23
0.1 0.57 0.59 0.42 0.56 0.67 0.5 0.26 0.26 -0.03 -0.16 -0.29 0.05 -0.89 -0.66 -0.82 -0.56 -0.18 -0.6 -0.32 -3.86 -0.09 -0.79 -0.08 0.48 0.38
-0.22 0.33 0.35 0.33 0.26 0.28 0.45 0.42 0.12 0.02 -0.07 -0.09 -0.01 -0.87 -0.39 -0.82 0.32 0.73 0.22 0.39 -5.02 0.06 -1.31 -0.75 0.24 -0.41
0.39 0.47 0.51 0.54 0.5 0.31 0.47 0.46 0.16 0.04 0.04 -0.09 0.1 -0.55 -0.63 -0.47 -0.41 0.04 -0.14 -0.26 -4.29 -0.42 -1.11 -0.31 0.24 -0.0
-2.07 0.22 0.57 0.63 0.6 0.4 0.36 0.42 0.32 -0.09 -0.28 -0.62 -1.55 -0.05 0.25 -0.08 -0.05 0.79 0.21 0.05 -1.28 -0.73 -0.88 -0.73 0.15 -0.25
-0.2 0.44 0.5 0.3 0.13 0.43 0.71 0.7 0.1 -0.13 -0.22 -0.12 -0.08 -0.64 -0.58 -0.28 -0.7 0.09 0.26 0.29 -3.46 -0.24 -0.9 -0.57 0.22 0.23
-0.03 -0.1 -0.11 0.19 0.3 0.16 0.4 0.47 0.32 0.13 0.13 -0.09 -0.08 -0.68 0.08 -0.39 -0.12 0.69 0.31 0.03 -4.19 0.81 -0.77 -0.74 -0.41 -0.58
-0.24 0.23 -0.32 0.08 0.37 -0.06 0.07 0.28 0.41 0.32 0.16 -0.31 -0.57 -0.02 -0.66 0.01 -0.64 0.67 0.13 -0.6 -1.32 -0.11 0.4 -0.22 0.55 -0.25
-0.4 0.26 0.23 0.07 0.28 0.39 0.41 0.57 -0.26 -0.23 -0.58 -0.34 -0.46 -0.79 -0.37 -0.74 -0.03 0.72 0.79 0.49 -3.44 -0.22 -0.45 0.24 0.36 -0.42
-0.36 0.37 0.59 0.9 0.79 0.65 0.48 0.46 0.39 -0.24 -0.3 -0.39 -0.51 -0.55 -0.14 -0.44 -0.72 -0.25 -0.34 -0.05 -3.71 -0.02 -1.7 -0.88 0.44 0.33
-1.99 -1.41 -0.8 -0.47 -0.04 0.03 0.78 0.7 1.01 1.29 0.7 0.29 -1.97 0.02 -0.33 0.49 -0.11 0.7 0.47 0.59 -4.92 -2.5 -0.42 -1.02 -0.74 -1.01
-1.17 -0.01 0.22 0.26 0.26 0.3 0.2 0.15 0.11 -0.05 -0.13 -0.15 -1.1 0.05 0.39 0.6 0.07 0.63 0.31 0.1 -1.37 0.02 -0.63 -0.33 -0.18 -0.49
-0.29 -0.15 -0.15 -0.18 0.19 0.31 0.19 0.24 0.33 0.15 0.2 0.04 -0.51 -0.09 0.52 -0.0 -0.37 0.57 0.23 -0.3 -2.85 0.21 0.01 0.0 -0.17 -0.45
0.21 -0.46 -0.38 0.14 0.46 0.19 0.35 0.42 0.54 0.26 0.15 -0.12 -0.23 -0.56 -0.35 -0.62 0.15 0.31 -0.18 -0.19 -3.45 -0.21 -0.11 0.11 0.52 -0.05
0.01 -0.03 0.09 0.37 0.33 0.18 0.36 0.48 -0.15 -0.49 -0.54 -1.06 -0.33 -0.23 0.34 0.21 -0.13 0.7 0.72 -0.06 -2.26 0.2 -0.63 -0.54 -0.02 -0.15
-0.02 0.21 0.06 0.33 0.41 -0.45 0.01 0.39 0.13 0.2 0.63 0.64 -0.14 -1.48 -0.84 -1.06 -0.77 0.55 0.22 -0.34 -4.49 0.02 -0.1 0.28 0.47 -0.1
-0.46 0.2 0.04 0.26 0.4 0.16 0.35 0.44 0.03 0.07 -0.02 -0.35 -1.24 -0.49 -0.15 -0.48 0.01 0.61 0.83 0.3 -3.41 0.03 -0.73 -0.62 0.32 0.09
-0.26 0.47 0.27 0.18 0.3 0.07 0.14 0.19 0.27 0.41 0.19 0.24 -0.47 -0.92 -0.69 -0.62 -0.05 0.43 0.32 0.09 -4.55 0.26 -0.51 -0.35 0.35 -0.16
-0.03 0.1 0.12 0.57 0.93 0.46 0.79 0.89 0.34 -0.12 0.25 -0.2 -0.31 -0.62 -0.39 -0.08 -0.99 0.59 -0.17 -0.66 -3.35 -0.38 -0.86 -1.52 0.28 -0.73
-0.12 0.05 -0.41 0.36 0.42 0.26 0.54 0.86 0.58 0.39 -0.04 -0.73 -0.96 -1.7 -0.97 -1.14 -0.72 0.95 0.18 -0.06 -3.88 0.13 -0.27 -0.26 0.78 -0.23
-1.8 -0.65 -0.3 -0.07 0.4 0.51 0.66 0.51 0.33 0.71 0.53 0.36 -1.42 -0.88 -1.49 -0.72 0.1 1.02 -0.07 0.41 -3.35 0.45 -1.78 -0.37 -0.05 0.23
-0.8 -0.47 -0.12 -0.14 -0.16 0.19 0.43 0.68 0.75 0.61 0.14 0.05 -0.91 -0.05 -0.4 -0.14 0.22 0.66 0.64 0.51 -2.65 -1.38 -0.21 -0.65 -0.46 -0.13
-0.49 0.42 0.57 0.53 0.44 0.41 0.4 0.37 0.16 -0.11 -0.39 -0.58 -0.63 -0.49 -0.09 0.05 -0.1 0.23 0.21 0.17 -4.64 0.13 -0.81 -0.61 0.27 -0.04
-0.46 -0.01 0.19 0.33 -0.01 -0.05 0.28 0.54 0.74 0.15 0.09 -0.21 -0.7 -0.02 -0.39 0.2 -0.39 1.09 0.37 0.1 -2.8 -0.35 -0.76 -0.71 -0.43 -0.12
0.49 0.33 -0.3 -0.04 0.25 0.28 0.53 0.5 0.13 0.06 -0.09 -0.13 0.4 -0.98 -0.84 -1.12 -1.06 0.73 -0.09 -0.78 -2.19 0.33 -0.12 -0.02 0.69 -0.32
-3.03 0.79 1.01 0.93 0.59 0.23 0.43 0.81 0.44 0.27 -0.36 -0.92 -3.41 -1.42 -0.97 -1.12 -0.59 1.01 0.66 0.32 -1.45 -1.63 -2.02 -2.37 0.43 0.22
-0.22 -0.73 -2.99 -3.1 -1.37 -0.07 0.87 0.68 1.27 1.3 0.75 0.48 -0.43 -1.77 -0.93 -1.34 0.08 0.64 0.91 0.59 -4.19 -3.33 0.19 -0.03 -0.15 -1.14
-0.38 -0.75 -2.18 -2.27 -1.44 -0.47 0.93 0.93 0.95 1.03 0.56 0.22 -0.88 -0.91 -0.26 -1.44 0.57 1.16 0.79 1.07 -4.64 -4.62 -0.06 -0.11 -1.05 -1.24
-0.73 -0.06 -0.17 0.16 0.91 0.73 0.75 0.69 0.18 0.41 0.23 0.09 -0.69 -0.98 -0.62 -0.56 0.05 0.31 0.23 0.45 -3.84 -3.7 -0.34 -0.54 0.05 -0.05
-0.78 -0.06 0.83 0.83 -0.15 -0.61 0.19 0.7 0.11 0.29 0.14 0.19 -0.08 -1.03 -0.28 -0.6 -0.16 0.89 0.62 0.44 -3.52 -2.64 -1.48 -1.46 0.24 0.39
0.31 0.17 0.12 0.29 0.15 0.21 0.49 0.39 0.26 0.09 -0.04 -0.27 -0.04 -0.13 -0.15 -0.45 -0.07 0.44 0.48 0.46 -6.03 -0.48 -0.88 -0.76 -0.04 -0.25
0.33 0.26 -0.09 0.04 0.35 0.34 0.52 0.44 0.03 0.16 -0.13 -0.41 0.21 -0.14 0.02 -0.1 0.11 0.3 0.36 0.33 -3.95 0.03 -1.43 -0.92 -0.19 -0.51
0.19 0.4 -0.12 -0.14 0.06 0.27 0.13 0.29 0.4 0.34 0.26 0.2 0.07 -0.44 0.1 -0.42 -0.13 0.48 0.26 -0.03 -2.89 -0.15 -1.35 -0.38 -0.02 -0.08
0.43 0.09 0.31 0.56 0.49 0.5 0.41 0.5 0.42 0.18 0.22 0.08 0.31 -0.56 -0.18 -0.15 -0.45 -0.12 -0.33 -0.36 -4.92 -1.25 -1.08 -0.98 0.3 0.03
0.15 -0.02 -0.22 -0.14 0.18 0.22 0.29 0.4 0.35 0.17 0.06 -0.06 -0.06 -0.24 -0.12 -0.16 -0.23 0.62 0.31 -0.07 -2.58 0.23 -0.23 -0.1 -0.13 -0.56
0.16 0.57 0.35 0.32 0.71 0.5 0.84 0.66 0.25 0.06 -0.12 -0.43 0.01 -0.45 -0.19 -0.69 -1.0 0.25 0.26 -0.51 -5.15 -0.31 -1.38 -1.42 0.05 0.16
-0.29 -0.23 -0.06 0.22 0.11 0.04 0.5 0.6 0.5 0.3 0.49 0.15 -1.13 -0.46 -0.39 -0.41 -0.39 0.33 0.06 -0.2 -2.66 -0.15 -0.05 0.14 0.39 -0.11
0.34 0.16 -0.01 0.34 0.37 0.12 0.26 0.28 0.18 0.22 0.14 -0.16 -0.11 -1.22 -0.3 -1.01 -0.21 0.7 0.32 0.14 -3.66 0.38 -0.74 -0.49 0.16 -0.07
-0.41 -0.18 -0.01 0.47 0.67 0.18 0.39 0.4 0.27 0.16 -0.02 -0.14 -1.28 -0.57 -0.4 -0.43 -0.51 0.44 0.17 -0.41 -0.84 0.24 -0.43 0.43 0.19 -0.09
0.69 0.54 0.46 0.51 0.47 0.29 0.4 0.52 0.02 -0.13 0.01 0.08 0.81 -0.84 -0.53 -1.0 -0.66 0.13 -0.17 -0.07 -5.25 -1.44 -1.16 -1.1 0.52 -0.04
0.17 0.35 0.25 0.51 0.79 0.65 0.58 0.41 0.47 0.19 0.17 0.16 -0.11 -0.61 -0.29 -0.28 -0.66 0.08 -0.29 -0.25 -4.39 -0.25 -0.95 -1.16 -0.13 -0.4
-0.36 0.3 0.12 0.54 0.77 0.65 0.45 0.7 0.19 0.2 0.17 -0.2 -1.86 -1.24 -0.68 -0.85 -0.22 0.46 0.37 0.17 -4.39 -1.25 -0.04 -0.38 0.32 -0.13
0.68 0.48 0.29 0.32 0.05 -0.47 -0.02 0.05 -0.12 0.22 0.24 0.15 0.05 -1.3 -0.29 -1.29 -0.32 0.52 0.25 0.28 -5.89 0.99 -1.93 -0.23 0.08 -0.16
-0.83 -1.22 -1.4 -1.15 -0.15 0.52 1.1 1.09 0.79 0.56 0.33 -0.15 -0.78 -1.19 -0.97 -1.43 0.18 1.47 0.35 0.36 -1.82 -1.6 -0.24 -0.02 -0.35 -0.67
-0.18 0.07 0.29 0.45 0.49 0.39 0.1 0.05 0.12 0.06 -0.17 0.04 -0.2 -0.16 -0.03 -0.04 -0.11 0.19 0.02 0.14 -1.3 0.26 -0.85 -0.85 0.05 -0.06
-0.75 0.28 0.15 0.25 0.34 0.26 0.37 0.49 0.49 0.21 -0.04 -0.38 -1.44 -0.6 -0.0 -0.33 -0.13 0.68 0.66 0.11 -3.57 -0.19 -0.7 -0.53 0.35 -0.19
-0.34 0.33 0.35 0.46 0.85 0.7 0.39 0.4 0.1 -0.0 -0.19 -0.51 -0.7 -0.53 -0.12 -0.31 -0.04 0.27 -0.05 -0.0 -4.14 -1.01 0.01 -0.47 0.19 -0.01
-0.44 -0.07 0.07 0.46 0.83 0.93 0.33 0.2 -0.07 -0.35 -0.59 -1.03 -0.97 -0.57 -0.38 -0.57 -0.58 0.31 -0.01 -0.36 -2.93 0.7 -0.33 0.04 0.9 0.23
0.39 0.4 0.31 0.65 0.79 0.93 0.71 0.72 0.1 -0.41 -0.57 -0.98 -0.47 -1.26 -0.88 -0.28 -0.63 0.47 0.22 -0.08 -2.04 0.05 -1.72 -2.22 0.35 -0.11
-0.19 0.32 0.23 0.65 0.52 0.19 0.17 0.37 -0.29 0.0 0.09 -0.09 0.13 -0.17 -0.49 -0.56 -1.1 0.66 -0.34 -0.41 -1.84 0.37 -1.98 -0.25 0.47 0.39
0.19 0.09 -0.12 0.43 0.61 0.35 0.5 0.23 -0.08 -0.29 -0.25 -0.78 -0.26 -0.43 0.29 0.08 -0.18 0.43 0.48 0.3 -1.75 0.55 -0.98 -1.1 -0.32 -0.47
0.57 0.18 0.04 0.36 0.67 0.55 0.67 0.57 0.3 0.22 -0.1 -0.58 -0.24 -1.02 -0.73 -1.02 -0.02 0.35 0.47 0.41 -4.37 -0.1 -2.05 -1.36 0.15 -0.32
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-0.59 -0.53 -0.22 0.0 0.11 0.04 0.21 0.07 0.2 0.33 0.29 0.09 -0.38 -0.01 0.7 -0.15 0.07 0.09 0.24 0.28 -2.73 0.22 -0.32 -0.5 0.29 -0.1
0.0 0.21 -0.02 0.03 0.45 0.56 0.77 0.56 0.21 0.24 -0.13 -0.56 -0.21 -0.86 -0.55 -1.26 0.07 0.83 0.31 0.32 -3.28 -1.04 -0.62 -0.89 0.45 -0.14
0.18 0.38 0.34 0.19 0.34 0.44 0.43 0.2 0.14 0.02 -0.12 -0.17 0.02 -0.46 -0.2 -0.32 0.03 0.26 0.37 0.14 -3.29 -0.07 -1.11 -0.83 0.06 -0.07
-0.84 0.87 0.45 0.4 0.53 0.56 0.73 0.56 0.18 -0.12 -0.19 -1.12 -1.9 -2.62 -0.77 -1.15 0.05 0.82 0.77 0.44 -5.22 -5.72 -1.56 -0.85 1.14 0.01
-0.18 -0.14 -0.35 0.26 0.66 0.53 0.81 0.81 0.61 0.53 0.28 -0.42 -0.22 -1.88 -0.89 -1.46 -0.59 1.11 0.32 -0.0 -6.46 -0.1 -1.29 -1.11 0.2 -0.55
0.31 -0.16 -0.67 -0.36 0.24 0.58 0.68 0.38 0.16 0.21 -0.26 -0.53 0.09 -1.04 -0.18 -1.07 -0.15 0.7 0.56 0.21 -3.76 0.23 -0.67 0.05 0.19 -0.07
-4.86 -1.15 -0.28 0.29 0.79 0.83 0.74 0.66 1.16 0.91 0.38 -0.01 -3.8 -1.73 -1.34 -1.13 -0.23 1.08 0.34 -0.03 -1.4 -1.16 -0.02 0.08 -0.99 -1.01
-0.08 0.14 0.12 0.36 0.42 0.51 0.55 0.51 0.26 0.05 -0.17 -0.55 -0.34 -1.17 -0.31 -0.59 -0.1 0.55 0.38 0.44 -4.27 -0.61 -0.32 -0.98 0.54 -0.16
-0.2 -0.21 0.03 0.24 0.45 0.51 0.62 0.69 0.47 0.35 -0.02 -0.19 -0.35 -0.8 -0.29 -0.53 -0.05 0.5 0.13 0.27 -3.91 -0.84 -0.05 -0.46 0.04 -0.5
0.76 0.51 0.02 0.44 0.59 0.6 0.63 0.88 0.26 0.03 -0.13 -0.59 0.27 -2.21 -1.12 -1.7 -0.48 0.76 0.32 0.08 -7.17 -0.06 -1.75 -1.76 0.17 -0.47
0.4 0.34 0.34 0.6 0.5 0.22 0.45 0.69 0.31 0.25 0.16 -0.22 0.07 -0.94 -0.8 -0.73 -0.61 0.2 -0.18 -0.19 -5.31 -0.12 -1.48 -0.94 0.66 -0.08
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0.42 0.34 -0.1 0.08 -0.14 -0.65 -0.35 0.1 0.12 0.04 0.22 0.1 0.43 -1.0 -1.06 -0.95 -0.93 0.69 -0.18 -0.39 -0.72 0.79 0.26 0.3 0.41 -0.1
0.01 0.42 0.34 0.25 0.35 0.09 0.01 0.36 -0.19 -0.11 -0.27 -0.46 -0.68 -0.32 -0.04 -0.28 -0.01 0.74 0.49 0.27 -4.4 0.09 -1.46 -0.31 0.21 0.33
0.47 -0.51 -1.29 -1.16 -0.43 0.68 0.9 0.35 0.05 -0.36 -0.49 -0.91 0.19 0.11 0.08 -0.52 0.22 1.1 1.17 0.11 -4.53 -0.72 -0.52 -0.84 0.04 -0.05
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0.13 0.67 0.13 0.22 0.42 0.94 0.78 0.84 -0.71 -0.67 -0.83 -1.09 -1.0 -1.23 -0.02 -0.3 -0.09 1.07 0.91 0.56 -4.98 -1.75 -1.71 -2.18 0.37 -0.39
-0.25 -0.62 -0.26 0.1 -0.07 0.22 0.13 0.27 0.64 0.07 0.15 0.32 -0.68 -0.14 -0.58 -0.42 -0.5 0.85 0.09 -0.28 -3.38 0.35 0.35 -0.61 0.65 -0.02
-0.03 0.31 0.37 0.5 0.58 0.46 0.4 0.34 0.15 -0.11 -0.03 -0.34 -0.06 -0.55 -0.36 -0.13 0.04 0.35 -0.05 0.02 -3.57 -0.4 -0.59 -0.72 0.32 -0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.