1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_197 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.1 0.12 0.11 0.1 0.15 0.12 0.11 0.1 0.12 0.08 0.13 0.1 0.66 0.74 0.47 0.91 0.06 0.05 0.09 0.92 0.13 1.0 0.14 0.32 0.25 0.07 0.07 0.08 0.08 0.11 0.06 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.14 0.25 0.27 0.18 0.71 0.54 0.0 0.14 0.18 1.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.22 0.11 0.1
0.33 0.33 0.25 0.29 0.36 0.3 0.29 0.29 0.27 0.32 0.34 0.3 0.38 0.25 0.59 0.34 0.16 0.24 0.32 0.75 0.69 1.0 0.2 0.23 0.49 0.26 0.37 0.28 0.15 0.17 0.32 0.32
0.58 0.66 0.59 0.55 0.52 0.59 0.84 0.72 0.71 0.83 0.75 0.77 0.08 0.34 0.35 0.18 0.23 0.18 0.25 0.39 1.0 0.71 0.15 0.12 0.55 0.59 0.5 0.42 0.33 0.37 0.35 0.29
0.48 0.53 0.5 0.59 0.56 0.54 0.56 0.53 0.58 0.55 0.6 0.54 0.39 0.37 0.48 0.52 0.31 0.23 0.35 0.58 0.47 1.0 0.36 0.37 0.5 0.31 0.25 0.26 0.3 0.31 0.38 0.4
0.23 0.21 0.25 0.23 0.26 0.27 0.38 0.25 0.29 0.26 0.24 0.19 0.26 0.36 0.57 0.25 0.47 0.68 0.28 1.0 0.77 0.69 0.32 0.33 0.79 0.17 0.43 0.34 0.38 0.35 0.42 0.53
0.32 0.24 0.25 0.26 0.24 0.27 0.32 0.36 0.44 0.41 0.4 0.4 0.33 0.36 0.33 0.34 0.23 0.18 0.41 1.0 0.71 0.35 0.28 0.33 0.66 0.3 0.21 0.17 0.29 0.3 0.41 0.41
0.63 0.59 0.53 0.63 0.57 0.59 0.61 0.65 0.71 0.73 0.74 0.77 0.36 0.59 0.64 0.43 0.49 0.41 0.5 0.73 0.79 1.0 0.46 0.4 0.89 0.61 0.47 0.43 0.51 0.5 0.42 0.47
0.4 0.46 0.35 0.62 0.53 0.58 0.39 0.54 0.58 0.51 0.39 0.48 0.78 0.64 0.99 0.83 0.48 0.42 0.67 1.0 0.6 0.97 0.72 0.73 0.51 0.29 0.32 0.29 0.5 0.53 0.41 0.41
0.16 0.18 0.17 0.2 0.29 0.32 0.31 0.27 0.23 0.19 0.15 0.14 0.27 0.11 0.72 0.31 0.23 0.26 0.43 0.68 0.44 1.0 0.26 0.31 0.81 0.08 0.16 0.14 0.25 0.26 0.23 0.31
0.34 0.25 0.25 0.36 0.35 0.51 0.44 0.48 0.59 0.55 0.55 0.49 0.49 0.74 0.56 0.63 0.33 0.24 0.43 1.0 0.68 0.74 0.26 0.26 0.94 0.23 0.34 0.43 0.44 0.47 0.18 0.13
0.3 0.35 0.3 0.35 0.43 0.46 0.46 0.45 0.44 0.5 0.45 0.39 0.68 0.75 1.0 0.57 0.27 0.3 0.47 0.78 0.63 0.71 0.31 0.38 0.52 0.39 0.4 0.39 0.25 0.26 0.55 0.53
0.37 0.41 0.3 0.35 0.3 0.37 0.34 0.35 0.47 0.44 0.4 0.45 0.08 0.26 0.38 0.28 0.25 0.07 0.26 0.55 0.47 1.0 0.12 0.15 0.71 0.35 0.32 0.13 0.19 0.23 0.16 0.16
0.04 0.04 0.04 0.06 0.07 0.08 0.08 0.08 0.04 0.06 0.04 0.04 0.25 0.01 0.05 0.19 0.16 0.24 0.17 0.91 0.51 0.41 0.16 0.18 1.0 0.17 0.15 0.15 0.11 0.12 0.19 0.22
0.09 0.15 0.09 0.14 0.13 0.12 0.07 0.18 0.11 0.15 0.13 0.08 0.78 0.25 0.73 0.69 0.16 0.19 0.34 0.73 0.66 1.0 0.41 0.54 0.6 0.37 0.26 0.33 0.15 0.25 0.15 0.13
0.2 0.24 0.23 0.21 0.22 0.2 0.23 0.19 0.21 0.2 0.2 0.19 0.16 0.22 0.15 0.21 0.21 0.28 0.54 1.0 0.4 0.29 0.25 0.21 0.7 0.18 0.21 0.2 0.21 0.2 0.17 0.16
0.12 0.11 0.11 0.12 0.08 0.16 0.13 0.17 0.17 0.15 0.15 0.15 0.23 0.06 0.07 0.21 0.14 0.17 0.39 1.0 0.29 0.84 0.17 0.15 0.86 0.21 0.17 0.18 0.15 0.15 0.12 0.1
0.28 0.33 0.38 0.32 0.38 0.36 0.34 0.3 0.3 0.25 0.26 0.27 0.17 0.25 0.26 0.22 0.29 0.22 0.25 1.0 0.53 0.52 0.23 0.23 0.62 0.32 0.42 0.38 0.21 0.21 0.19 0.24
0.08 0.09 0.04 0.18 0.01 0.19 0.21 0.17 0.1 0.2 0.21 0.14 0.32 0.63 0.65 0.38 0.07 0.0 0.19 0.87 0.52 0.5 0.13 0.16 1.0 0.15 0.22 0.21 0.05 0.14 0.04 0.07
0.03 0.04 0.05 0.05 0.06 0.05 0.07 0.05 0.05 0.04 0.03 0.03 0.04 0.13 0.26 0.05 0.04 0.06 0.05 0.33 0.12 1.0 0.04 0.05 0.11 0.03 0.09 0.06 0.04 0.05 0.1 0.11
0.05 0.01 0.06 0.06 0.03 0.06 0.04 0.02 0.11 0.02 0.08 0.03 0.12 0.35 0.58 0.13 0.13 0.05 0.14 0.76 0.17 0.69 0.1 0.1 1.0 0.41 0.24 0.26 0.08 0.1 0.06 0.11
0.27 0.26 0.27 0.28 0.32 0.34 0.26 0.31 0.33 0.34 0.32 0.3 0.5 0.23 0.4 0.36 0.22 0.17 0.27 0.79 0.38 1.0 0.36 0.41 0.68 0.42 0.25 0.24 0.23 0.22 0.18 0.2
0.11 0.09 0.1 0.1 0.15 0.09 0.12 0.13 0.08 0.16 0.11 0.09 0.43 0.52 0.43 0.67 0.12 0.17 0.14 0.67 0.16 1.0 0.62 0.74 0.05 0.27 0.2 0.21 0.15 0.14 0.08 0.11
0.06 0.11 0.18 0.21 0.19 0.21 0.33 0.16 0.17 0.14 0.13 0.11 0.08 0.05 0.09 0.1 0.36 0.16 0.17 1.0 0.53 0.51 0.14 0.17 0.72 0.35 0.13 0.14 0.19 0.26 0.23 0.16
0.1 0.08 0.12 0.1 0.16 0.1 0.12 0.24 0.14 0.14 0.14 0.18 0.27 0.16 0.36 0.28 0.18 0.07 0.27 0.84 0.36 0.26 0.2 0.28 1.0 0.59 0.37 0.32 0.2 0.2 0.18 0.17
0.25 0.13 0.15 0.21 0.16 0.21 0.21 0.21 0.19 0.1 0.05 0.09 0.32 0.15 0.45 0.32 0.18 0.1 0.17 0.34 0.13 1.0 0.23 0.23 0.36 0.29 0.31 0.24 0.18 0.26 0.27 0.33
0.23 0.29 0.26 0.25 0.28 0.25 0.22 0.24 0.23 0.24 0.26 0.19 0.42 0.37 0.47 0.41 0.2 0.17 0.37 0.55 0.3 1.0 0.36 0.46 0.44 0.21 0.17 0.18 0.21 0.25 0.14 0.15
0.08 0.05 0.08 0.04 0.0 0.21 0.1 0.27 0.12 0.14 0.09 0.07 0.01 0.01 0.15 0.0 0.05 0.09 0.03 1.0 0.3 0.51 0.05 0.03 0.31 0.07 0.6 0.33 0.04 0.06 0.08 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.41 0.67 0.56 0.23 0.08 0.3 0.74 0.0 0.41 0.19 0.18 1.0 0.5 0.24 0.09 0.12 0.17 0.08 0.1
0.18 0.22 0.21 0.27 0.22 0.23 0.25 0.25 0.23 0.29 0.17 0.2 0.16 0.1 0.17 0.21 0.15 0.04 0.29 0.69 0.19 0.23 0.21 0.23 1.0 0.17 0.12 0.15 0.14 0.21 0.13 0.14
0.0 0.0 0.05 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.62 0.5 0.0 0.0 0.93 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.22 0.07 0.07 0.11 0.32 1.0 0.0 0.92 0.0 0.18 0.63 0.16 0.0 0.0 0.07 0.0 0.2 0.06
0.38 0.34 0.17 0.43 0.36 0.5 0.48 0.3 0.32 0.37 0.21 0.45 0.09 0.65 0.32 0.14 0.14 0.11 0.13 0.36 0.75 0.45 0.09 0.11 1.0 0.19 0.22 0.04 0.17 0.13 0.15 0.09
0.06 0.05 0.09 0.07 0.04 0.08 0.07 0.23 0.08 0.03 0.06 0.05 0.07 0.03 0.07 0.04 0.04 0.04 0.11 0.46 0.55 0.41 0.12 0.08 1.0 0.07 0.22 0.21 0.04 0.05 0.03 0.06
0.19 0.21 0.19 0.25 0.28 0.25 0.21 0.22 0.21 0.2 0.22 0.19 0.24 0.37 0.39 0.19 0.18 0.2 0.17 0.56 0.37 0.54 0.23 0.25 1.0 0.15 0.48 0.43 0.14 0.16 0.13 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.02 0.16 0.04 0.08 0.2 0.17 0.71 0.43 0.69 0.08 0.11 1.0 0.05 0.14 0.02 0.17 0.16 0.07 0.1
0.15 0.09 0.1 0.21 0.22 0.3 0.28 0.3 0.36 0.22 0.39 0.28 0.01 0.12 0.09 0.01 0.07 0.03 0.05 1.0 0.63 0.09 0.05 0.04 0.48 0.2 0.25 0.07 0.09 0.07 0.06 0.04
0.02 0.02 0.0 0.03 0.31 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.09 0.06 0.01 1.0 0.53 0.61 0.05 0.01 0.92 0.0 0.19 0.0 0.06 0.02 0.01 0.0
0.04 0.05 0.01 0.07 0.0 0.04 0.04 0.01 0.03 0.03 0.02 0.05 0.22 0.14 0.21 0.21 0.11 0.06 0.37 1.0 0.68 0.14 0.15 0.33 0.87 0.39 0.27 0.25 0.07 0.1 0.12 0.11
0.09 0.09 0.08 0.07 0.1 0.12 0.11 0.08 0.08 0.07 0.1 0.07 0.03 0.04 0.16 0.06 0.11 0.09 0.13 0.74 0.36 0.43 0.07 0.08 1.0 0.12 0.14 0.16 0.08 0.09 0.07 0.06
0.17 0.13 0.16 0.18 0.16 0.19 0.21 0.23 0.28 0.25 0.24 0.22 0.17 0.25 0.45 0.16 0.12 0.09 0.15 0.64 0.54 1.0 0.12 0.13 0.36 0.23 0.16 0.13 0.12 0.13 0.1 0.12
0.25 0.24 0.27 0.25 0.26 0.25 0.29 0.28 0.3 0.33 0.32 0.29 0.31 0.42 0.49 0.36 0.18 0.18 0.25 0.54 0.33 1.0 0.19 0.2 0.3 0.29 0.22 0.23 0.19 0.21 0.19 0.18
0.2 0.29 0.25 0.31 0.34 0.41 0.31 0.27 0.18 0.18 0.18 0.15 0.52 0.89 0.65 0.63 0.25 0.34 0.3 0.52 0.22 0.51 1.0 0.92 0.12 0.13 0.32 0.41 0.23 0.27 0.13 0.19
0.2 0.16 0.25 0.26 0.23 0.23 0.3 0.4 0.34 0.3 0.32 0.25 0.13 0.11 0.11 0.15 0.16 0.15 0.25 1.0 0.8 0.46 0.17 0.18 0.54 0.25 0.25 0.26 0.26 0.25 0.18 0.1
0.12 0.11 0.09 0.11 0.12 0.12 0.11 0.1 0.12 0.11 0.12 0.11 0.1 0.08 0.1 0.1 0.07 0.03 0.11 1.0 0.48 0.68 0.09 0.09 0.59 0.29 0.3 0.25 0.07 0.06 0.09 0.11
0.12 0.1 0.11 0.12 0.15 0.13 0.14 0.12 0.15 0.11 0.16 0.14 0.03 0.01 0.02 0.04 0.23 0.29 0.09 0.81 1.0 0.4 0.13 0.1 0.76 0.14 0.12 0.17 0.3 0.24 0.17 0.1
0.2 0.18 0.19 0.18 0.18 0.19 0.23 0.25 0.26 0.3 0.27 0.25 0.05 0.07 0.06 0.06 0.14 0.06 0.09 0.93 0.46 0.26 0.09 0.06 1.0 0.22 0.18 0.18 0.15 0.15 0.14 0.14
0.27 0.25 0.28 0.32 0.42 0.36 0.36 0.42 0.36 0.36 0.33 0.27 0.32 0.24 0.38 0.45 0.29 0.16 0.38 1.0 0.36 0.82 0.33 0.32 0.84 0.41 0.31 0.22 0.28 0.29 0.27 0.28
0.12 0.12 0.18 0.15 0.15 0.17 0.13 0.14 0.13 0.12 0.13 0.12 0.31 0.4 0.36 0.22 0.24 0.57 0.21 0.85 0.62 0.87 0.25 0.24 1.0 0.08 0.13 0.1 0.21 0.19 0.23 0.29
0.09 0.08 0.06 0.07 0.06 0.07 0.05 0.06 0.08 0.09 0.07 0.1 0.32 0.15 0.11 0.43 0.13 0.12 0.24 1.0 0.54 0.1 0.15 0.16 0.79 0.13 0.08 0.08 0.19 0.22 0.23 0.28
0.25 0.41 0.37 0.36 0.48 0.29 0.23 0.24 0.24 0.22 0.24 0.24 0.91 0.53 0.83 0.8 0.17 0.52 0.37 1.0 0.13 0.79 0.26 0.34 0.33 0.22 0.29 0.29 0.15 0.16 0.15 0.14
0.15 0.15 0.18 0.19 0.28 0.22 0.18 0.18 0.19 0.17 0.12 0.11 0.17 0.18 0.54 0.29 0.13 0.25 0.38 0.63 0.15 1.0 0.47 0.55 0.09 0.12 0.16 0.17 0.11 0.14 0.08 0.1
0.37 0.39 0.36 0.39 0.39 0.39 0.34 0.32 0.35 0.33 0.33 0.31 0.34 0.48 0.41 0.38 0.26 0.22 0.29 0.62 0.37 1.0 0.34 0.34 0.8 0.25 0.31 0.31 0.24 0.24 0.27 0.28
0.04 0.05 0.03 0.04 0.05 0.05 0.05 0.03 0.05 0.04 0.05 0.04 0.03 0.47 0.47 0.17 0.05 0.05 0.14 0.45 0.19 1.0 0.05 0.09 0.07 0.08 0.07 0.03 0.06 0.08 0.08 0.1
0.13 0.12 0.09 0.1 0.1 0.13 0.11 0.12 0.13 0.13 0.13 0.14 0.14 0.33 0.35 0.13 0.09 0.2 0.09 0.46 0.26 1.0 0.09 0.11 0.05 0.11 0.07 0.06 0.1 0.08 0.11 0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)