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Heatmap: Cluster_249 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
AT1G02145 (EBS4)
 0.62 0.9 1.03 1.1 0.79 0.32 1.02 -0.77 -1.47 -2.75 -2.25 -3.16 -3.77 0.41 -0.37 -0.25 -0.12 -0.05 -1.0 0.62 0.31 0.02 0.55 -0.04 -1.43 -0.12 -0.51 0.07 -0.19 -1.87 0.57 0.03 -0.9 -0.33 0.35 0.21 0.49 0.13 0.01 -1.41 -4.16 -0.04 0.81 1.06 0.25 -0.68 -4.49 0.37
0.53 1.25 0.22 -0.09 0.53 0.52 0.06 -1.46 -1.75 -3.61 -4.13 -3.45 -3.29 0.45 0.9 0.13 0.37 -0.39 -1.83 0.84 -0.12 0.24 0.46 0.05 -0.61 0.26 -0.99 -0.6 -1.6 -0.7 0.28 -0.26 -0.49 -0.02 -0.48 1.13 0.75 0.48 0.57 -2.75 -6.71 -0.04 0.57 0.84 -0.39 1.52 -8.85 -0.02
AT1G09100 (RPT5B)
 0.96 -0.16 0.81 1.1 0.64 -0.9 0.91 -7.32 -5.92 -5.98 -4.93 -4.43 -6.85 -0.16 0.29 -0.42 0.5 -0.06 -1.24 0.08 0.01 -0.44 0.06 0.01 -0.56 -0.5 0.17 -0.33 1.55 -0.71 0.59 1.24 -0.87 -0.65 0.4 0.27 1.17 0.02 -0.04 -4.41 -4.62 -0.13 0.36 0.44 0.4 0.24 -0.5 0.19
0.29 0.35 -0.5 -0.46 -0.21 0.26 -0.07 -2.11 -2.45 -4.67 -4.77 -0.16 -3.59 0.11 0.95 0.76 0.46 0.17 -1.47 0.66 -0.01 0.68 0.72 0.55 0.28 0.84 0.61 -0.42 -0.06 0.18 0.16 0.21 -0.1 -0.14 0.25 0.69 1.41 0.2 0.72 -2.7 -3.58 -0.24 -0.78 -0.49 -0.44 -0.16 -0.76 -1.26
AT1G14660 (NHX8)
 -0.51 1.54 0.48 0.38 0.5 0.35 0.42 -2.37 -2.99 -4.93 -5.31 - -4.81 0.95 -0.09 0.34 -0.15 -0.91 -1.33 1.23 0.54 0.29 0.66 -0.29 0.77 -0.01 -0.28 0.18 -0.28 0.32 0.74 0.11 -0.52 -0.52 0.17 0.11 1.28 0.43 0.93 -0.9 -0.76 -0.32 -0.22 0.35 -0.77 -6.64 -8.07 -1.15
AT1G16460 (ST2)
 -0.31 0.84 0.13 0.14 -0.24 -1.48 0.07 -6.12 -5.77 -7.48 -5.97 -12.55 - 1.03 -0.32 0.33 -0.18 0.0 -2.19 0.24 -0.04 0.22 -0.06 1.24 -2.11 1.55 -0.28 1.42 1.13 -2.37 0.54 -0.93 -0.44 -0.44 0.08 1.06 1.88 0.76 0.62 -0.83 -3.59 -0.8 -0.49 -0.08 -0.7 -4.67 0.43 -0.67
-0.98 1.73 -0.2 -0.72 -0.74 -2.79 -0.84 -5.95 -5.35 -6.31 -5.79 - -6.58 0.76 0.81 0.56 0.21 -0.38 -1.15 1.63 0.19 0.46 0.89 0.22 -0.53 0.24 -0.64 0.69 0.38 -0.32 0.95 0.15 -0.11 -0.14 0.94 0.25 0.61 0.28 -0.02 -5.02 -3.25 -0.56 -0.19 1.01 -0.14 -0.55 0.33 -0.18
0.2 1.38 -0.88 -0.99 -1.67 -5.59 -1.31 - -9.02 - - - -3.42 0.42 0.54 0.55 0.71 0.72 -1.25 0.98 0.81 1.06 0.86 0.8 -1.23 0.91 -0.73 1.0 -0.26 -1.23 0.67 -0.56 0.57 -0.4 0.12 0.5 -1.68 0.47 -0.76 -1.79 0.34 -0.54 0.22 -0.48 -1.13 -3.36 2.11 -0.81
AT1G20560 (AAE1)
 -0.03 1.0 -1.86 -1.83 -1.74 -2.37 -1.44 -6.49 -6.63 -7.22 -7.34 -7.88 -8.26 0.3 0.53 0.59 0.69 0.37 -1.14 0.79 -0.16 0.24 0.55 0.2 -1.7 0.25 1.25 0.59 0.33 -3.14 0.66 0.34 0.17 0.22 0.53 0.44 1.19 0.6 0.4 -2.48 -2.75 0.6 1.36 0.57 0.86 -0.54 -6.95 0.47
AT1G20693 (NFD2)
 -0.95 0.81 -0.55 -1.93 -0.47 -0.94 -1.96 -4.69 -7.82 -7.29 -9.12 -9.19 -7.94 0.75 1.18 0.65 0.8 0.6 -0.77 1.21 0.88 0.48 0.5 0.64 -0.53 0.5 -0.2 -0.88 -2.78 -0.49 1.0 0.32 -0.76 0.15 0.75 0.64 1.52 0.72 2.02 -6.55 -3.69 0.13 -0.32 -1.1 -0.31 -1.21 -12.39 -1.01
AT1G20696 (NFD3)
 -0.54 1.23 -0.56 -0.47 -0.62 -1.13 -0.56 -3.09 -4.01 -6.23 -6.91 -3.66 -5.54 0.86 0.77 0.47 0.14 0.1 -0.64 1.24 0.67 0.48 0.7 0.32 -0.68 0.15 1.38 -0.1 -0.85 -1.15 1.2 -0.01 -1.04 -0.34 0.71 0.04 0.83 0.51 0.99 -6.82 -5.23 -0.12 0.24 0.32 0.23 -0.49 -2.35 0.45
0.59 0.28 1.04 1.35 0.82 0.15 1.34 -2.02 -2.8 -5.18 -4.72 -11.33 -4.44 -0.02 -0.07 -0.2 -0.21 -0.06 -0.13 0.39 0.32 -0.57 -0.49 -0.17 0.39 -0.4 0.75 -0.35 1.44 0.42 0.54 -0.07 -0.59 -0.28 -0.06 -0.66 0.93 -0.19 0.33 -4.62 -1.7 -0.31 -0.49 -0.32 -0.14 -0.27 0.21 -0.53
AT1G30490 (PHV)
 -3.27 1.57 -3.55 -3.85 -3.44 -5.67 -3.9 - -9.36 -9.74 -9.64 - - 0.8 -0.13 -0.26 -0.13 -1.27 -0.77 1.37 -0.95 0.01 1.15 1.3 -1.85 1.73 1.66 1.69 -0.8 -3.82 0.29 -0.63 -0.43 -0.68 1.57 0.94 2.13 1.09 1.14 -3.97 -6.28 -0.83 -0.82 -0.41 -1.2 -5.84 -2.46 -1.69
0.74 1.44 1.38 1.47 0.9 -0.04 1.29 -2.53 -3.63 -5.44 -4.41 -6.56 -8.35 0.5 0.13 -0.06 -0.42 -0.98 -1.96 1.15 -0.2 0.46 0.73 -0.71 -1.36 -0.42 -1.41 0.46 0.04 -1.68 0.27 -0.06 -0.48 -0.37 -0.23 -0.07 0.59 0.34 0.18 -1.19 -1.51 -0.39 0.08 1.09 -0.44 -4.22 -0.36 0.01
-0.43 1.46 -0.91 -1.41 -1.45 -0.86 -0.82 -1.5 -1.7 -1.86 -2.45 -5.24 -2.51 -0.39 -0.52 0.35 1.09 -0.2 -0.3 0.96 1.12 0.37 0.45 0.23 0.14 0.34 0.93 -0.57 -1.26 -0.32 1.42 0.73 0.03 0.24 0.49 1.05 0.62 -0.07 0.02 - -5.26 -0.04 0.14 0.94 0.86 - - -0.39
AT1G32370 (TTM1)
 -0.04 1.21 0.46 0.21 0.65 0.61 0.66 -2.66 -2.34 -3.14 -2.43 -2.9 -3.89 -0.12 -1.37 0.63 0.89 0.1 -0.29 0.97 1.04 0.32 0.2 0.31 -0.4 0.4 0.65 -0.59 -2.91 -0.79 1.04 0.41 -0.67 -0.4 -0.05 0.72 0.42 0.03 -0.02 -5.57 -4.46 0.49 0.22 0.52 0.21 -1.01 -3.07 -0.31
AT1G33400 (TPR9)
 1.2 1.32 0.51 0.31 0.27 -0.38 0.26 -3.72 -4.54 -5.36 -4.55 -5.24 - 0.62 0.54 0.33 0.15 -0.77 -1.58 1.24 0.08 0.51 0.99 0.01 -0.75 0.15 -0.91 0.51 -0.56 -0.75 0.61 0.08 -0.25 -0.22 0.41 0.3 1.08 0.4 -0.13 -3.65 -3.68 -0.59 -0.11 1.21 -0.46 - 0.36 -0.29
0.55 0.61 0.78 0.82 0.96 0.75 0.96 -1.32 -1.99 -4.27 -3.51 -4.35 - 0.2 0.78 0.53 -1.15 -1.59 -1.87 0.3 -0.58 0.73 0.28 0.36 -1.42 0.8 -1.45 1.23 0.56 -1.79 -0.26 -0.37 0.33 -0.23 -0.01 -0.04 0.82 0.43 -0.76 0.09 -3.11 1.64 -0.83 -0.49 -1.22 0.36 -4.5 -1.35
AT1G67440 (emb1688)
 0.67 0.78 -1.63 -0.87 -1.89 -4.07 -0.65 - -4.81 -10.14 -7.25 - - 0.12 1.1 0.76 0.21 -0.33 -1.21 1.01 0.33 0.92 0.72 0.69 -0.16 0.98 -1.1 1.19 1.64 0.04 1.0 0.64 0.56 0.13 0.6 -0.01 0.87 0.4 0.48 -3.01 -0.87 -1.09 -1.58 -0.62 -1.24 -4.37 0.29 -1.78
AT1G71990 (FUT13)
 0.3 1.24 1.11 1.69 0.37 -0.25 1.94 -4.28 -2.09 -4.39 -3.94 -2.0 -3.85 -0.58 -1.17 -1.15 -1.43 -0.96 -1.97 0.67 -1.13 -0.17 -0.0 -0.48 -1.43 -0.95 -4.22 0.73 0.99 -1.61 0.59 -0.6 -0.66 -0.39 0.43 0.35 -2.7 0.12 -0.38 -2.3 -0.61 -1.02 0.62 1.14 -0.27 2.18 -1.12 -0.1
-0.48 1.47 0.72 0.67 0.51 -0.33 0.77 -3.66 -4.17 -7.21 -6.34 -5.54 - 0.16 0.54 0.98 -0.36 -0.33 -0.96 1.46 0.27 1.15 0.75 0.52 -2.7 0.56 -3.43 1.33 -0.01 -2.04 1.21 0.2 0.13 0.13 1.17 -0.06 -0.49 0.32 -0.79 -4.45 - -1.21 -0.5 0.61 -0.67 -3.55 -4.16 -0.19
-0.46 1.42 0.86 1.29 0.89 -0.24 1.63 -3.03 -2.89 -1.83 -1.58 -6.25 -3.17 0.54 -0.25 -0.26 -0.19 -0.79 -0.68 1.07 -0.3 -0.05 0.44 -0.72 -1.08 -0.72 -0.73 -0.14 -0.59 -0.57 0.38 0.12 -0.0 -0.17 0.26 -0.31 0.48 0.28 0.76 -2.82 -1.64 -0.3 -0.25 1.56 -0.2 -1.53 -1.16 0.32
AT1G80650 (RTL1)
 -1.99 1.2 0.96 0.27 0.78 0.56 0.61 -1.24 -1.52 -2.93 -2.15 -1.06 -1.41 1.12 -0.36 0.7 0.05 -0.83 -0.85 1.02 1.12 0.84 0.44 0.55 -0.73 0.77 1.14 -0.92 -0.53 -1.44 0.55 1.14 0.09 -0.14 0.4 -0.15 0.42 0.45 0.53 -3.03 -3.21 -0.51 -1.96 -1.3 -1.79 - - -4.41
1.15 0.27 -0.66 0.36 0.08 -0.57 0.71 -3.72 -4.48 -4.97 -5.66 -2.55 -5.05 -0.07 -0.8 1.47 0.34 0.38 -1.11 0.69 0.58 1.26 0.7 0.83 0.78 1.36 0.71 -0.32 -2.02 0.58 0.49 -0.07 -1.65 -1.07 -0.06 0.59 0.82 0.13 1.06 -1.91 -2.33 -1.8 -1.72 -0.74 -0.97 0.3 -10.43 -1.68
-1.09 0.92 -5.79 -3.93 -4.28 -2.02 -2.83 -1.76 -2.17 -5.22 -5.27 -7.66 -3.29 0.34 -0.64 -0.24 0.22 0.37 -0.77 0.94 0.37 -0.06 0.66 0.08 -0.46 -0.07 0.69 1.47 0.43 -0.52 0.65 0.57 -0.31 0.56 1.19 0.0 0.7 0.49 0.58 -4.19 -4.03 -0.6 0.16 0.85 0.18 1.59 0.75 0.05
AT2G17640 (SAT-106)
 0.03 0.73 1.03 0.77 0.34 -0.23 0.83 -5.46 -3.72 -5.35 -3.89 -7.37 -2.32 0.82 0.27 0.85 -0.4 -0.37 -1.79 0.35 -0.48 0.18 -0.03 0.67 0.21 0.82 0.89 -0.46 1.11 0.6 0.14 0.39 -0.4 -0.13 -0.38 0.98 1.29 0.39 1.35 -3.3 -5.27 -0.06 -1.99 -1.67 -1.02 - -1.21 -3.3
AT2G22090 (UBA1A)
 -0.27 0.37 1.46 0.86 0.39 -0.82 0.61 -2.36 -1.85 -2.89 -2.8 - -2.93 0.38 -0.77 -0.02 0.26 0.03 -0.36 0.37 -0.2 -0.34 -0.18 -0.19 -0.38 -0.02 1.5 0.0 1.27 -0.4 0.17 0.09 -0.44 0.1 0.1 -0.33 0.45 -0.12 0.26 -1.36 -1.83 0.33 -0.23 0.05 0.03 1.44 -4.45 -0.41
-0.48 1.39 1.21 1.04 0.8 -0.02 0.95 -2.4 -3.92 -5.07 -5.85 -5.43 -2.69 0.42 0.55 0.0 0.14 -0.59 -1.12 1.4 0.51 -0.07 0.14 -0.08 -1.19 -0.08 0.23 0.35 -0.59 -0.8 0.33 -0.4 -0.36 -0.03 -0.1 -0.14 0.55 0.34 0.9 -2.38 -6.84 0.52 -0.22 0.56 -0.34 -0.75 -0.72 -0.23
-0.35 0.63 -3.02 -2.58 -2.42 -5.34 -2.62 -7.78 -7.03 -7.35 -7.48 -5.82 - 0.52 0.74 0.58 1.76 1.56 -1.54 0.7 0.19 0.61 0.97 0.43 -0.42 0.36 0.76 0.18 0.21 -0.71 0.7 0.86 -0.66 -0.05 0.45 0.58 0.65 0.12 -0.21 -5.4 -7.6 -0.76 0.68 0.55 0.78 0.5 - 0.31
AT2G35780 (scpl26)
 -0.83 1.25 -2.7 -0.85 -2.95 -4.81 -1.22 - -8.58 -10.55 -7.81 - - 0.88 0.12 0.85 0.06 0.96 -0.73 1.0 1.4 1.15 0.91 0.81 -3.65 0.72 -2.78 1.13 0.14 -4.05 1.34 0.96 0.65 1.13 0.2 0.33 -0.48 0.83 0.33 -1.6 -3.99 -0.55 0.4 0.11 -0.13 - - -0.12
0.09 0.0 0.53 0.86 0.6 0.11 1.14 -2.41 -3.13 -4.03 -3.43 -3.11 -5.18 -0.23 -2.02 0.15 0.42 0.1 -0.58 0.78 0.26 -0.04 0.1 0.12 1.16 -0.26 -0.23 -0.28 -0.51 0.73 0.48 0.85 -1.37 -0.4 0.63 0.04 1.07 0.08 -0.23 -3.21 -1.37 -0.24 -0.43 0.7 -0.15 0.44 0.09 -0.21
0.01 0.5 0.36 -0.02 0.53 0.77 0.34 0.57 -0.02 -1.11 -0.62 -7.95 -7.02 -0.1 -2.11 0.58 0.18 -0.36 -0.61 0.74 0.55 0.44 0.46 0.48 -1.62 0.61 0.21 -0.44 -0.02 -1.98 0.36 0.69 -0.22 0.21 0.1 0.16 0.5 0.3 0.13 -2.91 -8.36 -0.38 -0.32 0.44 -0.09 0.81 -0.53 -0.88
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AT3G06110 (MKP2)
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AT3G24010 (ING1)
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AT3G48330 (PIMT1)
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AT3G50240 (KICP-02)
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AT4G01840 (KCO5)
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AT4G32570 (TIFY8)
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AT5G01560 (LECRKA4.3)
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1.01 1.42 0.42 0.73 0.2 -0.5 0.63 -3.04 -2.94 -4.63 -3.16 -1.78 -3.74 0.66 0.37 0.37 0.5 -0.13 -1.36 1.13 0.25 0.67 0.78 0.09 -1.72 0.19 0.07 0.12 0.35 -2.39 0.78 -0.08 -0.49 -0.85 0.19 0.52 0.01 0.1 -0.01 -2.23 -1.65 -0.61 0.24 0.9 0.22 - -0.81 -0.12
AT5G13690 (CYL1)
 -0.2 1.28 -0.15 0.29 -0.41 -1.27 0.28 -3.59 -3.47 -4.3 -3.9 -1.81 -7.33 0.65 0.74 0.84 0.2 -0.02 -1.23 1.2 0.49 0.95 1.0 0.7 -2.06 0.76 -0.89 1.34 0.92 -2.96 0.98 0.54 -0.01 -0.1 0.37 0.5 0.32 0.49 -1.34 -1.1 -3.68 -0.7 -1.0 -0.47 -1.02 - 0.55 -1.74
0.12 0.65 1.06 0.59 0.88 0.66 0.93 -0.65 -0.47 -1.24 -0.39 -8.25 -4.54 -0.05 -1.04 -0.04 -0.08 -0.3 -0.82 0.32 0.39 -0.09 -0.0 0.01 -1.27 0.05 0.27 -0.23 -0.24 -1.66 0.37 -0.27 -0.71 0.07 -0.0 -0.34 0.39 0.22 -0.43 -1.02 0.56 0.08 0.16 0.44 -0.04 0.68 0.24 -0.2
0.59 0.94 0.48 -1.4 -0.26 -4.59 -1.04 - - -7.57 -6.27 - - 0.38 -0.48 0.45 0.03 -0.16 -1.7 0.61 -0.07 0.11 0.19 0.57 -0.98 0.56 -0.81 0.04 -0.05 -0.83 0.74 -0.31 0.19 0.5 0.87 1.22 2.04 1.17 0.95 -3.27 - -0.32 -0.15 0.94 -0.03 -0.25 -0.53 -0.37
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0.52 1.55 -2.48 -2.28 -2.81 -3.25 -2.42 -7.92 - -7.97 -8.02 -4.04 -8.09 0.52 1.14 0.57 1.24 0.99 0.11 1.41 0.86 0.57 0.57 0.43 -2.79 0.5 -0.45 1.21 0.34 -3.51 1.12 0.72 0.42 1.34 0.54 0.64 -0.27 0.49 -0.2 -5.35 - -0.32 -0.27 -0.2 -0.39 - -4.65 -1.54
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AT5G42240 (scpl42)
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-2.08 0.68 -0.04 -0.07 -0.07 -0.46 0.04 -1.58 -1.54 -2.77 -2.03 -10.29 -2.94 0.27 -0.08 0.89 -0.05 0.03 -0.74 1.03 0.86 0.52 0.68 0.75 -0.04 0.57 0.66 1.03 0.37 -0.39 0.93 0.57 -0.36 -0.22 0.55 0.07 0.69 0.85 0.27 -4.33 -2.79 -1.02 -0.78 0.78 -0.32 - -7.48 0.03
1.03 1.33 1.09 1.07 0.94 -1.08 0.92 -5.13 - -6.08 -6.23 -9.04 -5.19 0.38 -0.11 0.14 0.06 -0.59 -2.02 0.81 0.4 0.64 0.91 -0.01 -2.38 0.13 -1.32 0.89 -0.48 -2.21 0.33 0.12 -0.14 -0.43 0.34 0.32 0.18 0.45 -1.11 -1.49 -5.6 -0.48 0.1 1.22 -0.37 -1.76 0.36 0.32
0.8 0.38 0.36 0.28 0.23 -0.13 0.46 -2.49 -2.33 -3.48 -2.63 -0.32 -1.49 0.03 -0.79 -0.02 0.35 -0.28 -1.28 0.52 0.87 0.02 0.41 0.08 -0.31 0.05 0.55 -0.34 -1.78 -0.46 0.38 0.72 -1.1 -0.11 0.05 0.01 0.28 0.05 -0.07 -0.49 -0.14 0.4 0.57 0.74 0.56 0.51 -0.31 -0.07
AT5G63860 (UVR8)
 -2.07 0.31 -3.01 -4.57 -4.02 -5.28 -4.52 -5.42 -6.11 -6.86 -7.09 -3.07 -4.12 0.52 1.41 0.79 1.22 2.07 -0.06 1.12 0.43 0.95 0.84 0.12 0.43 0.28 -0.52 -0.1 0.11 0.44 0.41 0.31 0.01 -0.04 1.31 0.66 0.59 0.47 0.97 -1.41 -2.06 -0.56 -0.63 -1.01 -0.73 -2.26 -0.59 -1.48
AT5G65940 (CHY1)
 -0.66 0.64 0.33 0.65 0.54 0.39 0.71 -3.06 -3.22 -5.21 -5.13 -7.73 -6.85 0.49 -0.78 0.69 0.33 0.1 -1.56 0.64 0.52 0.56 0.56 0.76 -1.43 0.6 -0.13 0.58 0.59 -1.58 0.67 0.47 -0.37 -0.03 -0.34 0.55 0.91 0.5 0.56 -2.43 -5.19 -0.38 0.29 0.99 -0.08 -2.73 -3.84 0.23
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.