Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.45 0.25 0.24 0.38 0.5 0.34 0.15 -0.02 -0.03 0.23 -0.01 -0.17 0.04 0.21 1.23 0.51 -0.68 -0.78 0.22 -0.37 -0.13 -0.11 -0.2 -0.18 -1.45 -0.4 -0.43 -0.2 -0.58 -0.37 -0.59 -0.68
0.12 0.44 0.48 0.42 0.46 0.58 0.81 0.23 0.59 0.56 0.38 0.03 -0.25 1.54 1.59 0.04 -0.57 -0.98 -1.18 0.07 -1.73 -0.79 -1.27 -1.38 -1.41 -2.11 -1.13 -0.93 -0.95 -0.78 -1.01 -1.28
-1.05 -0.83 -0.93 -0.46 -0.63 -0.57 -0.66 -0.9 -0.67 -0.89 -0.91 -1.04 0.56 1.99 1.43 0.32 -0.69 -0.57 0.06 1.24 -0.08 1.45 0.03 0.17 -1.1 -0.43 -0.17 0.11 -0.76 -0.6 -1.58 -1.55
-0.05 0.09 0.08 0.01 0.01 0.03 0.2 0.16 0.29 0.47 0.32 0.31 0.22 1.15 1.29 0.28 -0.35 -0.42 -0.27 -0.12 -0.33 -1.34 -0.13 -0.1 -1.49 -0.83 -1.35 -1.41 -0.3 -0.26 -0.23 -0.02
-0.69 -0.67 -0.15 -0.22 -0.01 -0.27 0.14 -0.1 0.1 -0.17 0.2 -0.35 0.03 -0.31 2.06 0.38 -0.95 -2.17 -0.39 0.86 -1.7 0.22 -1.67 -0.75 -3.52 1.83 0.43 0.59 -1.17 -0.68 -1.48 -1.62
-0.38 -0.4 -0.9 -0.65 -0.81 -0.63 -0.73 -0.7 -0.46 -0.34 -0.27 -0.46 -0.25 1.22 1.68 -0.32 -0.88 -0.83 -0.47 1.49 0.53 2.0 -0.89 -0.88 -0.07 -2.11 -1.07 -1.44 -0.99 -0.89 0.41 0.08
-0.18 -0.47 -0.41 -0.45 -0.05 -0.25 0.03 0.18 0.31 0.27 0.15 0.05 -0.31 -0.19 0.14 -0.21 -0.69 -0.55 -0.27 2.02 0.63 -0.13 -0.44 -0.28 -0.34 0.35 -0.28 -0.54 -0.56 -0.55 -0.44 -0.26
-0.14 0.16 0.03 0.28 0.27 0.17 0.08 -0.26 -0.29 -0.48 -0.36 -0.55 -0.25 0.61 1.65 0.08 0.15 0.07 0.19 -0.66 -1.99 -1.36 0.05 0.16 0.06 -1.18 0.48 0.41 -0.25 -0.11 -0.66 -0.66
-1.19 -1.45 -1.01 -0.56 0.0 0.25 0.58 0.94 0.56 0.13 -0.35 -0.79 -1.22 -1.48 1.14 -0.99 -0.89 -1.48 -0.34 1.76 -1.11 0.96 -1.18 -0.66 -0.2 0.5 1.07 0.71 -0.8 -0.46 -0.88 -0.74
-0.12 0.06 0.25 0.14 0.27 0.27 0.15 0.26 0.3 0.35 0.23 -0.02 0.17 0.18 0.71 0.34 -0.42 -0.96 -0.14 0.77 -2.57 -0.91 0.12 0.08 -0.74 -0.2 -0.21 -0.04 -0.21 -0.01 -0.68 -0.57
-0.9 -0.73 -0.43 -0.41 -0.25 -0.07 -0.24 -0.6 0.07 -0.62 -0.4 -0.67 -0.44 0.62 1.81 -0.39 -0.28 -0.07 -0.42 2.13 0.64 1.31 -0.67 -0.84 -0.53 -1.64 -0.78 -0.57 -0.72 -0.52 -1.55 -1.46
-0.66 -0.16 0.14 0.04 0.11 0.13 0.53 -0.01 -0.41 -0.12 -0.22 -0.54 0.6 -0.44 1.17 -0.01 -0.45 -0.26 0.77 2.16 -1.62 -0.88 -0.81 -0.98 -4.74 -0.17 0.08 0.54 -0.92 -0.51 -1.59 -1.54
-0.7 -0.6 -0.58 -0.28 -0.37 0.18 -0.24 -0.03 -0.45 -0.74 -0.61 -0.72 -0.19 1.29 2.26 -0.32 -0.61 -0.48 -0.63 0.92 -0.73 1.46 -0.45 -0.37 -1.03 -0.94 -0.08 -0.25 -1.08 -0.53 -0.93 -0.46
0.13 0.45 0.37 0.39 0.18 0.05 0.2 -0.18 0.18 0.04 -0.15 0.09 -0.67 -1.09 2.14 -0.52 0.08 -0.1 -0.16 1.61 -2.44 -0.13 -1.54 -1.8 -1.01 -1.16 -0.11 -0.0 -0.72 -0.67 -1.52 -1.87
-0.26 -0.27 -0.1 0.0 0.38 0.33 0.25 -0.01 -0.0 -0.07 -0.11 -0.39 -0.14 0.39 0.89 0.37 -0.33 -0.17 0.36 -0.08 -1.79 -1.46 -0.18 -0.01 0.13 -0.28 0.32 0.35 -0.16 -0.03 -0.38 0.16
-0.69 -0.38 -0.31 0.1 0.11 0.35 -0.05 -0.08 -0.32 -0.36 0.03 -0.85 -1.11 -0.23 2.15 -0.71 -0.28 0.0 -0.37 1.75 -2.6 2.11 -1.56 -1.86 -1.69 -3.54 -1.16 -0.7 -0.96 -0.75 -0.75 -0.51
-0.92 -0.69 -0.75 -0.34 0.01 0.16 0.12 0.08 0.17 -0.07 -0.33 -0.65 -0.69 -0.21 1.21 -0.88 -0.52 -0.81 -0.39 1.78 -0.02 1.13 -0.73 -0.63 1.19 -0.21 0.01 0.15 -0.82 -0.66 -1.2 -0.85
-0.3 -0.48 0.05 0.25 -0.02 0.28 0.28 0.01 0.67 0.38 0.29 0.26 -0.17 -0.38 1.26 0.85 -0.52 -2.49 -0.32 1.83 -4.93 -0.74 -1.77 -1.33 -2.41 0.63 -0.82 -0.22 -0.59 -0.18 -0.8 -0.27
-0.92 -1.14 -1.39 -1.12 -0.79 -1.03 -1.27 -1.28 -1.21 -0.97 -1.11 -1.39 3.24 -0.39 -1.3 0.84 -1.72 -1.11 -1.18 2.04 0.52 -0.43 -0.83 -0.89 1.6 -1.64 -0.84 -1.19 -1.6 -1.64 -2.02 -2.16
0.39 0.47 0.28 0.13 0.2 0.25 -0.01 -0.01 -0.18 -0.1 0.04 -0.18 -0.01 0.57 0.65 0.31 -0.33 -0.41 0.21 -0.36 -5.0 -1.02 0.05 0.22 -0.27 0.51 0.36 0.44 -0.43 -0.32 -0.79 -1.18
-0.54 0.32 -1.03 -0.05 0.1 0.09 0.2 -0.16 -0.48 -0.7 0.32 -0.58 -1.97 -1.33 2.29 -0.5 -0.24 -0.57 1.0 1.46 1.06 0.41 -1.86 -2.48 -2.09 -1.18 0.5 0.41 -1.07 -0.71 -2.33 -3.62
0.09 0.26 0.31 0.2 0.09 0.13 -0.06 -0.17 0.18 0.12 0.14 -0.02 0.89 1.24 1.84 0.83 -0.74 -0.73 -0.86 -0.02 -2.48 -1.45 -0.31 0.07 -2.52 -0.08 -1.05 -0.61 -0.98 -0.68 -1.24 -0.93
-0.38 -0.42 -0.34 -0.24 -0.16 -0.17 -0.2 -0.66 -0.4 -0.48 -0.42 -0.46 0.57 1.27 1.86 1.03 -0.12 -0.55 -1.5 1.04 -0.39 1.24 0.01 -0.34 -0.86 -2.0 -1.15 -0.7 -0.82 -0.51 -1.17 -0.91
-0.09 0.27 0.09 0.3 0.1 0.15 0.28 0.36 0.58 0.53 0.46 0.36 -0.07 0.35 0.91 0.05 -0.3 -0.46 -0.43 0.09 -1.94 -0.79 -0.25 -0.25 0.05 -0.27 -0.48 -0.38 -0.51 -0.3 -0.51 -0.47
-0.73 -0.81 -0.62 -0.81 -0.82 -0.55 -0.85 -0.94 -0.83 -0.69 -0.78 -0.89 0.46 0.96 1.44 0.42 -0.47 -0.11 0.13 1.93 0.75 1.82 -0.4 -0.18 -0.44 -1.59 -1.99 -1.91 -0.61 -0.55 -0.87 -0.48
-0.2 -0.28 -0.14 -0.1 -0.11 -0.31 -0.25 -0.19 0.28 0.32 0.25 0.01 0.08 0.73 0.85 0.19 -0.4 -0.98 0.15 0.05 -1.83 -1.52 0.44 0.44 -0.31 0.16 -0.1 -0.1 -0.25 -0.19 0.17 0.41
0.07 0.03 0.04 0.12 0.04 0.07 -0.12 -0.07 0.04 0.05 -0.19 -0.08 0.56 0.46 0.8 0.36 -0.28 -0.56 0.39 -0.45 -1.0 -0.05 0.1 0.29 -1.16 0.01 -0.3 -0.51 -0.26 -0.35 0.02 0.25
-0.32 -0.27 -0.33 -0.25 -0.23 -0.3 -0.12 -0.1 -0.04 -0.07 -0.03 -0.11 0.22 1.19 1.36 0.17 -0.65 -0.59 -0.12 0.31 -0.49 0.28 -0.45 -0.24 -0.39 0.36 0.27 -0.04 -0.68 -0.63 -0.24 -0.08
-0.84 -0.93 -0.81 -0.89 -0.78 -0.77 -0.9 -0.86 -0.66 -0.96 -0.8 -1.04 0.58 1.01 1.65 0.41 -0.62 -0.5 -0.08 2.06 0.16 1.41 -0.32 -0.16 0.05 -0.14 -0.74 -0.9 -0.78 -0.68 -0.83 -0.78
-0.3 -0.32 -0.4 -0.2 -0.15 -0.12 -0.04 0.03 0.26 0.11 0.08 -0.03 -0.02 0.88 1.08 0.15 -0.64 -0.89 -0.14 1.72 -0.08 -0.85 -0.36 -0.19 0.48 -0.25 -0.52 -0.55 -0.72 -0.63 -0.82 -0.75
-0.56 -0.73 -0.6 -0.43 -0.43 -0.51 -0.36 -0.11 -0.1 0.01 -0.12 -0.26 0.11 0.56 1.07 0.25 -0.59 -0.94 0.05 1.31 0.55 0.99 -0.6 -0.35 -0.19 0.66 -0.34 -0.31 -0.31 -0.26 -0.53 -0.59
-0.01 0.05 -0.25 0.08 -0.17 0.06 -0.35 -0.15 -0.03 0.07 -0.05 -0.05 0.49 0.69 0.35 0.76 -0.51 -0.77 0.67 0.4 -1.04 -1.5 0.12 0.28 0.37 -0.15 -0.41 -0.39 -0.26 -0.19 -0.28 -0.12
-0.71 -0.44 -0.35 -0.04 0.44 0.51 0.3 0.16 -0.07 -0.4 -0.44 -0.82 -0.35 -0.69 1.75 -0.09 -0.36 -0.25 0.06 1.38 -0.63 1.55 -0.55 -0.31 -2.0 -0.59 -0.58 -0.62 -0.55 -0.27 -1.18 -0.87
-0.39 -0.52 -0.62 -0.08 -0.17 0.15 0.3 0.47 0.5 0.58 0.4 0.08 -0.38 0.5 0.9 -0.15 -1.34 -1.3 0.27 1.39 -1.09 -0.54 -1.04 -0.89 0.06 -0.6 0.27 0.14 -0.45 -0.31 -0.44 -0.03
-0.41 -0.41 -0.38 -0.15 -0.13 -0.08 -0.01 -0.04 0.03 -0.09 -0.14 -0.16 0.2 0.78 0.98 0.3 -0.26 -0.49 0.19 0.49 -0.34 -0.23 -0.26 -0.13 -0.33 0.69 -0.07 0.02 -0.06 -0.17 -0.42 -0.48
-0.04 0.18 0.32 0.3 0.21 0.18 0.26 -0.05 0.08 0.04 -0.03 -0.16 0.14 0.89 1.36 0.3 0.12 -0.37 -0.06 -0.01 -1.96 -2.0 -0.05 -0.02 -1.76 -0.41 -0.39 -0.04 -0.27 -0.07 -0.48 -0.51
-0.86 -0.53 -0.36 -0.5 -0.42 -0.36 -0.6 -0.59 -0.66 -0.86 -0.8 -1.06 0.16 1.29 1.65 0.23 0.01 -0.16 -0.24 1.28 0.09 0.97 -0.08 -0.1 0.12 -0.38 -0.24 -0.01 -0.42 -0.29 -0.99 -1.09
-0.26 -0.55 -0.6 -0.35 -0.31 -0.49 -0.63 -0.29 -0.01 -0.08 -0.02 -0.11 0.47 1.27 0.68 0.19 -0.91 -0.63 0.1 0.11 0.94 -0.47 -0.05 0.05 1.39 -0.43 -0.49 -0.49 -0.51 -0.48 -0.54 -0.36
-0.09 -0.21 -0.26 -0.13 -0.09 0.03 -0.21 0.07 -0.03 0.0 0.24 0.01 0.14 0.63 0.72 0.24 -0.65 -0.06 -0.17 1.14 -0.23 0.51 -0.26 -0.01 -1.34 -0.14 -0.28 -0.43 -0.53 -0.47 -0.2 -0.04
-0.88 -0.82 -0.42 -0.28 -0.28 -0.16 -0.4 -0.34 -0.24 -0.44 -0.62 -0.67 0.56 1.11 1.75 0.51 -0.56 -0.94 -0.33 1.31 -0.68 0.96 -0.21 0.12 0.06 -0.13 -0.51 -0.35 -0.64 -0.48 -1.05 -1.05
-0.57 -0.59 -0.54 -0.34 -0.34 -0.13 -0.12 0.1 -0.2 -0.03 -0.1 -0.24 -0.18 0.26 1.83 0.09 -0.8 -0.79 0.15 1.3 -0.0 0.42 -0.75 -0.42 -0.07 0.57 0.13 0.03 -0.56 -0.66 -1.05 -1.33
0.13 -0.07 -0.04 -0.1 0.12 0.18 0.1 0.12 -0.0 -0.03 -0.05 -0.21 -0.32 -0.07 1.09 -0.32 -0.25 -0.25 -0.07 1.33 -0.54 -0.8 -0.27 -0.27 0.67 -0.44 0.18 0.05 -0.27 -0.19 -1.03 -1.22
-0.12 -0.09 -0.1 -0.09 0.08 -0.05 -0.13 -0.16 -0.15 -0.19 -0.1 -0.24 -0.21 0.75 1.31 0.1 -0.42 0.1 0.03 0.92 0.05 0.54 -0.31 -0.35 -1.19 -0.54 -0.14 -0.43 -0.33 -0.56 -0.25 -0.17
-0.05 0.18 0.24 0.19 0.52 0.37 0.19 0.26 0.19 -0.03 -0.1 -0.16 1.13 1.06 0.14 1.26 -0.45 -0.53 -0.45 -0.37 -1.43 -0.49 -0.24 -0.22 -2.73 -0.18 -0.25 -0.41 -0.56 -0.49 -0.86 -1.01
-0.59 -0.5 -0.35 -0.31 -0.18 -0.12 -0.23 -0.66 -0.43 -0.54 -0.29 -0.53 -1.13 0.53 1.61 -0.7 0.24 -0.31 -0.81 2.1 0.64 1.49 -0.09 -0.58 -1.36 -1.7 -1.4 -0.81 -0.21 -0.08 -1.17 -0.99
-0.88 -0.82 -0.42 -0.28 -0.28 -0.16 -0.4 -0.34 -0.24 -0.44 -0.62 -0.67 0.56 1.11 1.75 0.51 -0.56 -0.94 -0.33 1.31 -0.68 0.96 -0.21 0.12 0.06 -0.13 -0.51 -0.35 -0.64 -0.48 -1.05 -1.05
-0.04 0.0 0.01 0.19 0.16 0.2 0.15 0.26 0.24 0.02 0.03 -0.15 -0.03 0.71 1.04 -0.07 -0.51 -0.71 -0.08 0.28 -0.17 -0.71 -0.25 -0.07 0.35 -0.1 -0.08 -0.29 -0.57 -0.46 -0.57 -0.37
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- - - - - - - - - - - - 2.1 - - 2.18 - - - 4.53 - - - - - - - - - - - -
-0.08 -2.34 -2.54 0.4 -2.43 0.76 -2.3 -0.02 -2.21 - -0.46 -1.35 -1.99 0.52 2.3 0.49 -1.14 0.78 1.19 2.46 0.21 - -1.09 -1.07 - - -0.71 0.11 0.16 0.69 -2.16 -2.23
0.12 -0.08 -0.14 -0.05 -0.09 0.37 0.23 0.41 0.1 0.42 0.12 0.18 -0.94 -0.17 0.73 -0.72 -1.18 -2.68 -0.24 2.14 0.59 -0.12 -1.29 -1.05 -0.24 -0.15 0.2 -0.16 -1.11 -0.92 -0.83 -0.85
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.