Heatmap: Cluster_122 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.4 0.49 0.66 0.78 0.53 0.27 0.31 0.34 0.11 0.2 0.26 0.3 0.71 0.23 0.29 0.19 1.0 0.16 0.11 0.11 0.08 0.46 0.22 0.19 0.56 0.39
0.77 0.51 0.45 0.93 0.51 0.22 0.27 0.36 0.12 0.23 0.3 0.31 1.0 0.03 0.04 0.04 0.46 0.07 0.08 0.05 0.01 0.06 0.12 0.07 0.1 0.08
0.41 0.66 0.76 1.0 0.69 0.43 0.43 0.62 0.47 0.29 0.3 0.28 0.43 0.07 0.11 0.05 0.11 0.14 0.15 0.3 0.0 0.1 0.02 0.02 0.23 0.21
0.88 0.76 0.97 1.0 0.56 0.17 0.18 0.4 0.1 0.03 0.06 0.1 0.73 0.02 0.04 0.02 0.08 0.05 0.05 0.18 0.01 0.03 0.01 0.03 0.46 0.72
0.66 0.38 0.27 0.6 0.46 0.27 0.24 0.34 0.3 0.25 0.51 0.51 1.0 0.09 0.07 0.13 0.25 0.09 0.09 0.08 0.0 0.06 0.26 0.16 0.42 0.16
0.75 0.43 0.55 0.52 0.16 0.06 0.15 0.29 0.03 0.05 0.07 0.11 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.05 0.05 0.11 0.03 0.0 0.01 0.02 0.26 0.25
0.53 0.49 0.61 0.75 0.31 0.44 0.3 0.36 0.39 0.49 0.81 0.82 0.77 0.25 0.25 0.29 1.0 0.27 0.26 0.2 0.22 0.1 0.39 0.36 0.23 0.38
0.54 0.44 0.42 0.8 0.59 0.23 0.16 0.17 0.04 0.1 0.11 0.13 1.0 0.02 0.01 0.13 0.58 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02
0.32 0.34 0.46 0.43 0.32 0.24 0.15 0.15 0.08 0.08 0.11 0.14 0.39 0.09 0.07 0.09 1.0 0.06 0.07 0.06 0.01 0.09 0.02 0.02 0.16 0.1
0.59 0.42 0.42 0.74 0.42 0.15 0.22 0.25 0.16 0.2 0.27 0.27 1.0 0.05 0.05 0.06 0.33 0.1 0.06 0.04 0.02 0.07 0.08 0.06 0.1 0.09
0.65 0.77 0.93 1.0 1.0 0.68 0.39 0.36 0.25 0.35 0.52 0.66 0.66 0.14 0.22 0.26 0.44 0.42 0.37 0.66 0.12 0.35 0.12 0.41 0.31 0.54
0.55 0.64 0.96 1.0 0.64 0.29 0.25 0.46 0.23 0.06 0.09 0.11 0.45 0.02 0.03 0.02 0.03 0.08 0.07 0.33 0.02 0.21 0.01 0.06 0.53 0.75
0.78 0.89 1.0 0.92 0.72 0.51 0.56 0.7 0.67 0.41 0.44 0.48 0.67 0.36 0.38 0.37 0.45 0.42 0.38 0.62 0.2 0.53 0.23 0.29 0.63 0.59
0.39 0.41 0.42 0.48 0.31 0.19 0.29 0.27 0.26 0.36 0.4 0.34 0.67 0.27 0.4 0.23 1.0 0.23 0.12 0.14 0.07 0.65 0.12 0.23 0.55 0.33
0.66 0.94 0.93 0.86 0.91 0.73 0.44 0.4 0.4 0.45 0.54 0.62 0.76 0.2 0.37 0.25 0.53 0.38 0.44 0.73 0.18 1.0 0.23 0.57 0.49 0.37
0.88 0.87 0.83 0.83 0.37 0.11 0.19 0.37 0.07 0.15 0.19 0.26 1.0 0.02 0.03 0.02 0.05 0.12 0.09 0.28 0.02 0.09 0.02 0.05 0.32 0.33
0.26 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.23 0.43 0.03 0.01 0.01 0.0 0.72 0.78 0.23 0.24 0.82 0.32 0.27 0.26 0.0 0.01 0.31 0.0 1.0 0.62
0.56 0.77 0.95 1.0 0.86 0.69 0.64 0.58 0.3 0.42 0.44 0.53 0.81 0.16 0.14 0.15 0.96 0.3 0.21 0.18 0.03 0.2 0.21 0.14 0.43 0.28
0.64 0.69 0.82 1.0 0.41 0.1 0.2 0.49 0.04 0.02 0.03 0.05 0.63 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.18 0.08 0.04 0.0 0.03 0.51 0.61
0.61 0.86 0.99 1.0 0.78 0.57 0.66 0.82 0.86 0.56 0.48 0.44 0.48 0.23 0.41 0.24 0.44 0.63 0.52 0.92 0.13 0.61 0.26 0.34 0.77 0.81
0.44 0.18 0.19 0.17 0.13 0.12 0.31 0.36 0.16 0.23 0.19 0.2 0.65 0.43 0.28 0.39 1.0 0.26 0.25 0.24 0.03 0.16 0.07 0.09 0.66 0.24
0.68 0.77 0.9 1.0 0.69 0.44 0.51 0.6 0.15 0.18 0.17 0.17 0.76 0.13 0.17 0.13 0.18 0.3 0.25 0.39 0.06 0.7 0.09 0.15 0.8 0.82
0.56 0.91 1.0 0.92 0.61 0.37 0.31 0.45 0.43 0.28 0.29 0.3 0.43 0.21 0.19 0.19 0.22 0.25 0.28 0.49 0.13 0.58 0.22 0.26 0.55 0.8
0.89 0.71 0.61 0.7 0.37 0.14 0.21 0.34 0.08 0.15 0.21 0.24 1.0 0.05 0.04 0.04 0.07 0.13 0.09 0.25 0.08 0.17 0.04 0.1 0.33 0.32
0.85 0.92 1.0 0.91 0.64 0.36 0.32 0.56 0.53 0.38 0.51 0.65 0.83 0.08 0.32 0.13 0.23 0.29 0.23 0.57 0.09 0.44 0.18 0.3 0.49 0.56
0.74 0.74 1.0 0.88 0.5 0.25 0.26 0.53 0.35 0.17 0.19 0.19 0.7 0.17 0.3 0.18 0.19 0.33 0.3 0.48 0.06 0.28 0.08 0.15 0.74 0.81
0.54 0.9 1.0 0.99 0.61 0.38 0.41 0.59 0.28 0.17 0.17 0.17 0.5 0.06 0.14 0.06 0.13 0.35 0.27 0.5 0.08 0.17 0.04 0.11 0.6 0.7
0.59 0.71 1.0 0.96 0.53 0.22 0.31 0.57 0.25 0.11 0.17 0.18 0.55 0.03 0.1 0.04 0.14 0.22 0.16 0.46 0.01 0.06 0.01 0.06 0.42 0.53
0.9 1.0 1.0 0.81 0.36 0.13 0.18 0.42 0.23 0.17 0.24 0.33 0.9 0.12 0.18 0.12 0.21 0.26 0.22 0.41 0.06 0.11 0.07 0.15 0.42 0.53
0.26 0.42 0.56 1.0 0.31 0.21 0.24 0.09 0.2 0.1 0.3 0.36 0.66 0.03 0.01 0.04 0.17 0.0 0.02 0.0 0.13 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03
0.95 0.68 0.78 0.64 0.2 0.06 0.14 0.31 0.02 0.02 0.03 0.06 1.0 0.01 0.03 0.01 0.02 0.04 0.04 0.17 0.02 0.01 0.0 0.02 0.33 0.46
0.64 0.72 0.93 1.0 1.0 0.72 0.48 0.42 0.4 0.48 0.68 0.8 0.73 0.07 0.2 0.09 0.54 0.4 0.31 0.59 0.04 0.52 0.21 0.44 0.19 0.46
0.52 0.44 0.47 0.57 0.37 0.13 0.17 0.2 0.13 0.27 0.4 0.47 1.0 0.04 0.03 0.04 0.67 0.05 0.04 0.03 0.04 0.17 0.11 0.09 0.16 0.12
0.44 0.29 0.35 0.37 0.34 0.28 0.28 0.29 0.08 0.15 0.17 0.19 1.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.74 0.6 0.61 0.83 0.65 0.38 0.35 0.32 0.15 0.22 0.36 0.5 1.0 0.04 0.08 0.07 0.96 0.12 0.07 0.06 0.09 0.09 0.31 0.28 0.15 0.14
0.67 0.5 0.56 0.65 0.46 0.27 0.22 0.22 0.06 0.13 0.16 0.19 1.0 0.01 0.0 0.01 0.4 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.57 0.4 0.5 0.58 0.33 0.18 0.16 0.17 0.05 0.09 0.13 0.15 1.0 0.01 0.01 0.03 0.48 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.06 0.03
0.76 0.7 0.74 1.0 0.48 0.15 0.21 0.41 0.02 0.04 0.06 0.11 0.78 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.04 0.15 0.15 0.19 0.04 0.13 0.6 0.65
0.29 0.69 0.94 1.0 0.8 0.54 0.52 0.58 0.45 0.4 0.42 0.38 0.21 0.33 0.22 0.27 0.18 0.19 0.22 0.35 0.01 0.2 0.13 0.2 0.45 0.75
0.57 0.55 0.85 1.0 0.57 0.27 0.34 0.45 0.04 0.07 0.09 0.13 0.65 0.09 0.05 0.07 0.06 0.07 0.09 0.24 0.16 0.42 0.05 0.1 0.63 0.67
0.43 0.68 0.92 1.0 0.98 0.82 0.53 0.49 0.33 0.37 0.42 0.46 0.45 0.11 0.19 0.14 0.51 0.39 0.32 0.44 0.05 0.35 0.07 0.31 0.23 0.35
0.55 0.55 0.74 0.77 0.77 0.68 0.5 0.47 0.51 0.6 0.67 0.75 0.57 0.26 0.42 0.45 1.0 0.78 0.73 0.64 0.36 0.5 0.7 0.82 0.33 0.46
0.75 0.94 1.0 0.89 0.51 0.24 0.21 0.45 0.29 0.13 0.18 0.22 0.61 0.06 0.13 0.06 0.17 0.29 0.28 0.61 0.05 0.22 0.02 0.08 0.46 0.61
0.7 0.88 1.0 0.87 0.49 0.16 0.21 0.45 0.28 0.13 0.19 0.22 0.6 0.06 0.13 0.06 0.18 0.3 0.18 0.6 0.05 0.21 0.02 0.07 0.4 0.54
0.62 0.83 1.0 0.92 0.45 0.32 0.59 0.65 0.1 0.07 0.05 0.03 0.93 0.18 0.24 0.2 0.32 0.32 0.31 0.3 0.11 0.19 0.06 0.03 0.6 0.51
0.67 0.61 0.71 0.73 0.76 0.5 0.67 0.72 0.56 0.56 0.55 0.56 0.9 0.36 0.32 0.41 0.87 0.58 0.35 0.42 0.11 0.49 0.35 0.56 1.0 0.36
0.38 0.55 0.64 0.97 1.0 0.54 0.17 0.12 0.13 0.24 0.39 0.55 0.39 0.05 0.05 0.05 0.11 0.18 0.1 0.28 0.04 0.22 0.21 0.31 0.22 0.32
0.37 0.48 0.55 0.64 0.52 0.45 0.42 0.46 0.41 0.34 0.35 0.38 0.46 0.34 0.4 0.36 1.0 0.51 0.53 0.45 0.11 0.41 0.51 0.29 0.38 0.38
0.95 0.64 0.59 0.63 0.17 0.06 0.12 0.33 0.08 0.04 0.08 0.14 1.0 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.12 0.03 0.06 0.01 0.04 0.31 0.4
0.63 1.0 0.99 0.83 0.5 0.23 0.28 0.47 0.42 0.26 0.28 0.33 0.64 0.1 0.22 0.1 0.21 0.32 0.3 0.66 0.08 0.34 0.04 0.16 0.7 0.83
0.64 0.88 1.0 0.92 0.69 0.37 0.36 0.51 0.58 0.44 0.47 0.51 0.6 0.08 0.23 0.13 0.28 0.4 0.3 0.65 0.14 0.79 0.11 0.29 0.51 0.64
0.29 0.75 1.0 1.0 0.65 0.38 0.43 0.44 0.39 0.35 0.37 0.54 0.31 0.33 0.29 0.39 0.25 0.32 0.32 0.33 0.01 0.23 0.14 0.16 0.55 0.41
0.08 0.57 0.81 1.0 0.8 0.53 0.27 0.2 0.16 0.1 0.1 0.12 0.05 0.04 0.12 0.08 0.2 0.28 0.25 0.28 0.0 0.21 0.0 0.02 0.05 0.05
0.51 0.76 0.8 1.0 0.76 0.36 0.23 0.36 0.32 0.3 0.42 0.48 0.48 0.05 0.16 0.06 0.36 0.28 0.27 0.42 0.01 0.43 0.07 0.21 0.29 0.34
0.33 0.23 0.29 0.23 0.16 0.17 0.2 0.21 0.16 0.19 0.23 0.24 0.72 0.04 1.0 0.04 0.65 0.07 0.07 0.06 0.07 0.52 0.21 0.11 0.48 0.28
0.58 0.99 1.0 0.99 0.79 0.39 0.22 0.32 0.19 0.1 0.16 0.22 0.55 0.05 0.16 0.06 0.22 0.33 0.22 0.54 0.0 0.07 0.04 0.04 0.21 0.24
0.65 0.77 0.82 1.0 0.83 0.42 0.16 0.21 0.15 0.17 0.3 0.45 0.57 0.03 0.05 0.02 0.1 0.17 0.11 0.28 0.12 0.87 0.18 0.59 0.48 0.42
0.47 0.51 0.77 1.0 0.67 0.39 0.3 0.41 0.12 0.13 0.14 0.19 0.51 0.04 0.04 0.05 0.06 0.07 0.05 0.18 0.09 0.25 0.06 0.13 0.55 0.74
0.27 0.54 0.65 0.85 0.48 0.19 0.37 0.42 0.4 0.59 0.61 0.52 0.82 0.5 0.33 0.41 1.0 0.47 0.33 0.3 0.15 0.15 0.07 0.08 0.29 0.27
0.78 1.0 1.0 0.92 0.5 0.28 0.37 0.6 0.37 0.35 0.38 0.43 0.79 0.11 0.14 0.09 0.21 0.45 0.3 0.58 0.01 0.14 0.03 0.15 0.57 0.83
0.58 0.92 1.0 0.86 0.54 0.3 0.29 0.42 0.34 0.18 0.19 0.23 0.53 0.08 0.13 0.26 0.19 0.23 0.23 0.53 0.04 0.16 0.07 0.09 0.26 0.32
0.92 0.6 0.67 0.86 0.36 0.13 0.25 0.54 0.04 0.03 0.04 0.07 1.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.17 0.02 0.03 0.0 0.02 0.31 0.33
0.8 0.68 0.8 1.0 0.41 0.14 0.25 0.56 0.08 0.02 0.04 0.06 0.74 0.01 0.02 0.02 0.02 0.06 0.04 0.22 0.04 0.04 0.01 0.04 0.56 0.62
0.42 0.63 0.89 1.0 0.89 0.5 0.23 0.26 0.2 0.19 0.28 0.39 0.39 0.12 0.25 0.1 0.27 0.2 0.21 0.46 0.04 0.84 0.11 0.31 0.35 0.43
0.23 0.52 0.6 0.65 0.45 0.23 0.23 0.28 0.16 0.19 0.21 0.26 0.28 0.12 0.16 0.19 1.0 0.3 0.3 0.21 0.01 0.1 0.09 0.09 0.64 0.18
0.83 0.64 0.79 0.67 0.22 0.08 0.14 0.25 0.04 0.06 0.1 0.19 1.0 0.03 0.03 0.03 0.04 0.07 0.06 0.2 0.09 0.09 0.04 0.08 0.32 0.45
0.82 0.99 1.0 0.84 0.45 0.25 0.31 0.5 0.24 0.25 0.35 0.48 0.87 0.04 0.06 0.05 0.11 0.23 0.16 0.44 0.08 0.28 0.08 0.25 0.5 0.64
0.36 0.77 0.83 1.0 0.88 0.71 0.6 0.6 0.39 0.65 0.69 0.75 0.47 0.11 0.15 0.13 0.43 0.55 0.36 0.68 0.03 0.46 0.1 0.36 0.37 0.38
0.3 0.39 0.72 1.0 0.6 0.19 0.18 0.38 0.11 0.01 0.02 0.02 0.23 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.29 0.03 0.06 0.01 0.03 0.32 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)