Heatmap: Cluster_113 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.1 0.0 0.02 0.01 1.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.11 0.05 0.05 0.02 0.04 0.04 0.31 0.0 0.04 0.03 0.04 0.04 0.08 0.0 0.16 0.08 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.05
Zm00001d006144 (GRMZM2G170253)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d007236 (GRMZM2G399598)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.13 0.01 0.16 0.03 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d007729 (GRMZM2G140665)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.03 0.01 0.22 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.44 0.0 1.0 0.0 0.0 0.83 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d008697 (GRMZM2G143278)
0.0 0.0 0.0 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.06 0.0 0.0 0.01 0.11 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.11 0.01 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.53 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.08 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.0 0.48 0.07 0.0 0.0 0.12 0.1 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0 0.1 0.0 0.13 0.65 0.0 0.05 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.26 0.06 0.01 0.04 0.13 0.0
Zm00001d014393 (GRMZM2G370357)
0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.18 0.01 0.0 0.02 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
Zm00001d016288 (GRMZM5G852073)
0.0 0.0 0.24 1.0 0.06 0.15 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.06 0.43 0.0 0.0 0.03 0.07 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.11 0.51 0.01 0.02 0.02
Zm00001d020113 (GRMZM2G054048)
0.04 0.04 0.03 0.0 0.57 0.34 0.03 0.02 0.0 0.0 0.86 0.2 0.09 0.54 0.02 1.0 0.37 0.01 0.07 0.04 0.08 0.8 0.25 0.0 0.05 0.17 0.11 0.77 0.0 0.0 0.1 0.05 0.58 0.19 0.37 0.42 0.07
0.02 0.0 0.0 0.0 0.23 1.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.08 0.29 0.0 0.06 0.1 0.55 0.0 0.07 0.07 0.03 0.01 0.83 0.0 0.0 0.22 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.02 0.03
Zm00001d022036 (GRMZM2G049882)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.13 0.07 0.02 0.22 0.0 1.0 0.2 0.55 0.0 0.85 0.0 0.02 0.0 0.01 0.21 0.0 0.22 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.07 0.02
0.06 0.14 0.16 0.0 0.1 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.02 0.38 0.37 0.05 0.23 0.01 0.36 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.14 0.59 0.05 0.07 1.0 0.04 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
Zm00001d026006 (GRMZM2G018464)
0.0 0.0 0.24 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 1.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.83 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.51 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.03
Zm00001d028060 (GRMZM2G307084)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.26 0.02 0.51 0.46 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Zm00001d029384 (GRMZM2G370519)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.17 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 1.0
0.0 0.0 0.12 0.0 0.36 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.27
Zm00001d030419 (GRMZM2G126913)
0.04 0.19 0.24 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.95 0.1 0.0 0.36 0.02 0.33 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.0 0.0 0.4 0.21 1.0 0.23 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.06 0.21 0.15 0.05
0.0 0.01 0.0 0.12 0.71 0.38 0.0 0.15 0.0 0.0 0.74 0.58 0.0 0.09 0.01 1.0 0.12 0.03 0.08 0.01 0.0 0.0 0.58 0.47 0.11 0.58 0.0 0.74 0.0 0.0 0.03 0.0 0.18 0.0 0.94 0.23 0.32
Zm00001d031685 (GRMZM2G053117)
0.0 0.0 0.31 0.0 0.32 0.02 0.16 0.02 0.0 0.0 0.04 0.27 0.0 0.0 0.0 0.82 0.07 0.01 0.08 0.01 0.26 0.06 0.01 0.04 0.0 0.21 1.0 0.38 0.0 0.0 0.02 0.16 0.22 0.12 0.2 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.0 0.0
Zm00001d032052 (GRMZM2G088980)
0.0 0.0 0.09 0.67 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.33 0.02 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.91 0.09 0.0 0.01 0.27 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.01 0.95 0.0 0.0
Zm00001d033685 (GRMZM2G386856)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.88 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d037851 (GRMZM2G046286)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03
0.0 0.0 1.0 0.93 0.42 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.03 0.07 0.2 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.19 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.38 0.02 1.0 0.2 0.14 0.0 0.08 0.2 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
Zm00001d042594 (GRMZM2G007053)
0.0 0.0 0.0 0.65 0.15 0.36 0.45 0.12 0.0 0.0 0.12 0.24 0.0 1.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.02 0.0 0.0 0.01 0.3 0.0 0.04 0.25 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.1 0.0 0.0 0.02 0.13 0.2 0.0 0.17 0.0 0.08 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.0 0.18 0.0
Zm00001d048782 (GRMZM2G089830)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.29 0.0 1.0 0.18 0.0 0.36 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d050635 (GRMZM2G162388)
0.0 0.0 0.05 0.09 0.21 0.26 0.29 0.0 0.0 0.0 0.39 0.11 0.0 0.21 0.0 0.98 0.01 0.01 1.0 0.04 0.04 0.27 0.2 0.0 0.11 0.0 0.2 0.03 0.0 0.01 0.06 0.0 0.12 0.0 0.0 0.06 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 1.0
0.04 0.01 0.1 0.02 0.22 0.12 0.11 0.08 0.1 0.07 0.03 0.06 0.24 0.01 0.14 0.38 0.11 0.21 0.27 0.04 0.35 0.21 1.0 0.2 0.21 0.1 0.02 0.23 0.0 0.48 0.04 0.15 0.14 0.12 0.19 0.11 0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)