Heatmap: Cluster_113 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.0 0.3 0.0 0.06 0.03 2.87 0.22 0.05 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.31 0.16 0.13 0.05 0.13 0.11 0.9 0.0 0.1 0.07 0.11 0.11 0.24 0.0 0.45 0.23 0.0 0.06 0.09 0.0 0.07 0.15
Zm00001d006144 (GRMZM2G170253)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d007236 (GRMZM2G399598)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.13 0.01 0.15 0.03 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.11 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.73 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d007729 (GRMZM2G140665)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.11 0.0 0.12 16.32 0.56 0.14 3.58 0.0 0.11 0.01 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.81 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d008697 (GRMZM2G143278)
0.0 0.0 0.0 0.48 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.09 0.0 0.0 0.02 0.15 0.06 0.0 1.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.16 0.01 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.6 0.0 0.01 1.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.09 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.22 0.03 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.46 0.04 0.0 0.06 0.3 0.0 0.02 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.12 0.03 0.0 0.02 0.06 0.0
Zm00001d014393 (GRMZM2G370357)
0.01 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.03 0.05 0.39 0.02 0.0 0.05 0.01 2.24 0.01 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.06 0.0 0.01 0.01
Zm00001d016288 (GRMZM5G852073)
0.0 0.0 0.12 0.49 0.03 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.21 0.0 0.0 0.01 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.25 0.0 0.01 0.01
Zm00001d020113 (GRMZM2G054048)
0.09 0.09 0.08 0.0 1.36 0.8 0.06 0.06 0.0 0.0 2.07 0.47 0.23 1.29 0.05 2.39 0.9 0.01 0.18 0.09 0.2 1.92 0.6 0.0 0.11 0.4 0.26 1.84 0.0 0.0 0.24 0.12 1.38 0.46 0.88 1.01 0.16
0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.87 0.02 0.0 0.0 0.04 0.07 0.26 0.0 0.05 0.09 0.48 0.0 0.06 0.06 0.03 0.01 0.72 0.0 0.0 0.19 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.02
Zm00001d022036 (GRMZM2G049882)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.36 0.28 0.0 1.58 0.84 0.26 2.61 0.0 11.73 2.36 6.47 0.0 10.01 0.01 0.25 0.0 0.11 2.41 0.0 2.56 0.0 0.0 3.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 2.17 0.04 0.8 0.29
0.04 0.09 0.1 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.24 0.24 0.03 0.14 0.01 0.23 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.09 0.38 0.03 0.05 0.64 0.03 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d026006 (GRMZM2G018464)
0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.38 0.0 0.12 0.0 0.0 0.32 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.2 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
Zm00001d028060 (GRMZM2G307084)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d029384 (GRMZM2G370519)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.4 0.05 0.0 0.0 0.01 0.24 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.05 1.4
0.0 0.0 0.12 0.0 0.38 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 1.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.29
Zm00001d030419 (GRMZM2G126913)
0.01 0.06 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.32 0.03 0.0 0.12 0.01 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.13 0.07 0.34 0.08 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.07 0.05 0.02
0.0 0.01 0.0 0.12 0.73 0.39 0.0 0.15 0.0 0.0 0.76 0.59 0.0 0.1 0.01 1.03 0.13 0.03 0.08 0.01 0.0 0.0 0.6 0.48 0.11 0.59 0.0 0.76 0.0 0.0 0.03 0.0 0.19 0.0 0.96 0.24 0.33
Zm00001d031685 (GRMZM2G053117)
0.03 0.01 2.04 0.0 2.1 0.13 1.06 0.13 0.02 0.0 0.23 1.78 0.0 0.03 0.02 5.38 0.49 0.07 0.55 0.04 1.67 0.37 0.03 0.26 0.03 1.39 6.54 2.5 0.0 0.0 0.15 1.06 1.42 0.78 1.32 0.49 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Zm00001d032052 (GRMZM2G088980)
0.0 0.0 0.17 1.21 0.04 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.59 0.03 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.79 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.5 0.05 0.0 0.0 0.15 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.52 0.0 0.0
Zm00001d033685 (GRMZM2G386856)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d037851 (GRMZM2G046286)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03
0.01 0.0 5.02 4.65 2.13 0.1 0.05 0.0 0.03 0.04 0.14 0.35 1.02 0.0 0.01 1.69 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.11 0.17 0.0 0.13 0.06 0.08 0.14 0.0 0.0 0.04 0.95 0.0 0.02 0.06 0.19 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.31 0.02 0.0 0.0 0.01 0.16 0.12 0.99 0.05 2.6 0.51 0.35 0.0 0.21 0.53 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.15 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0
0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 1.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.19 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Zm00001d042594 (GRMZM2G007053)
0.0 0.0 0.04 5.28 1.27 2.96 3.65 0.96 0.0 0.0 1.02 1.97 0.0 8.18 0.01 5.77 0.01 0.02 0.0 0.24 0.78 0.16 0.0 0.0 0.1 2.47 0.0 0.32 2.05 0.0 0.33 0.0 0.25 0.0 0.02 0.96 1.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.03 0.0
Zm00001d048782 (GRMZM2G089830)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.17 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.08 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d050635 (GRMZM2G162388)
0.08 0.04 12.36 21.75 51.88 63.58 72.31 1.22 0.02 0.0 96.86 27.22 0.17 53.01 0.08 243.42 2.26 1.61 249.09 10.86 9.95 67.6 50.84 0.46 28.52 0.11 50.91 8.04 0.0 2.05 16.19 0.35 28.85 0.05 0.05 15.31 145.88
0.03 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.29 0.0 0.0 0.01 4.35 0.04 0.08 1.91 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 1.11 1.5 0.03 0.06 20.32
0.22 0.04 0.51 0.12 1.09 0.58 0.53 0.42 0.49 0.34 0.14 0.31 1.19 0.03 0.7 1.9 0.55 1.06 1.33 0.18 1.74 1.04 4.95 1.0 1.03 0.5 0.08 1.15 0.0 2.39 0.2 0.76 0.71 0.59 0.93 0.54 3.28

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)